Search

Source at https://www.fhi.no/ I november 2021 ble Folkehelseinstituttet varslet om at tre intensivpasienter hadde dødd av blodbaneinfeksjon med bakterien Pseudomonas aeruginosa ved Universitetssykehuset Nord-Norge i Tromsø i løpet av kort tid. De hadde identiske isolater forenlig med et klonalt utbrudd. Helgenomsekvensering viste at det var en ny sekvenstype, ST3875, som ikke har vært påvist i Norge eller andre land. Nye tilfeller uten epidemiologiske sammenhenger, ble etter hvert funnet i flere andre sykehus, noe som indikerte en felles smittekilde. Den 17. januar 2022 var det påvist utbruddstilfeller i tre av fire helseregioner, og det ble 19. januar erkjent som et nasjonalt utbrudd. FHI overtok da koordinering av utbruddsarbeidet, og 20. januar ble det etablert en Sentral utbruddsgruppe med fagpersoner fra alle helseregionene. Den 21. januar var det 23 tilfeller i 9 sykehus i 3 regioner. Kasusdefinisjonen var en person med laboratoriebekreftet P. aeruginosa ST3875 fra oktober 2021 i sykehus i Norge, uavhengig av avdeling. Etter systematiske laboratorieundersøkelser av over 300 produkter påviste Oslo Universitetssykehus 18. mars 2022 utbruddsbakterien i pre-fuktede engangs vaskekluter av merket Oasis BedBath Unperfumed produsert i Lancashire, England. Sykehusene sluttet umiddelbart å bruke produktene. Vaskeklutene er definert som et kosmetisk produkt, og Mattilsynet er tilsynsmyndighet. Mattilsynet avdekket at produsenten og importøren ikke hadde full oversikt over produksjonslinjene og hvilke produkter som var forurenset. Det ble også avdekket at P. aeruginosa var blitt påvist i produkter under den interne kvalitetskontrollen i september 2021, uten at produktene var blitt stanset. Den 14. april tilbakekalte den engelske produsenten Vernacare produktene fra markedet både i Norge og internasjonalt. Per 14. juni 2022 omfattet utbruddet 388 tilfeller i 40 sykehus. Gjennomsnittsalder var 68 år og median alder 70 år (interkvartilområde 59- 79 år). Flertallet (63 %) av tilfellene var menn, og seks sykehus rapporterte Pseudomonas som sterkt medvirkende årsak til død hos totalt 8 tilfeller. Til sammen hadde 15 % av tilfellene ST3875 i blodkultur, 21 % i luftveier, 38 % i urin, 19 % i sår og 7 % i andre prøvematerialer, noe som tydet på flere mulige inngangsporter for bakterien. Antall nye tilfeller falt raskt etter at kilden var identifisert, og bruk av produktet ble stoppet i sykehus.

In November 2021, a clonal outbreak of Pseudomonas aeruginosa of novel sequence type ST3875 was detected in three patients who died of bloodstream infections in one hospital. By 25 April 2022, the outbreak included 339 cases from 38 hospitals across Norway. Initial hospital reports indicate Pseudomonas infection as the main contributing cause in seven deaths. In March 2022, the outbreak strain was identified in non-sterile pre-moistened disposable washcloths, used to clean patients, from three lots from the same international manufacturer.

Jeg undersøker lipid- og ferritinnivåene blant ungdomsskoleelever, 13-14 år, i Kirkenes, Øst-Finnmark, og sammenlikner med tidligere funn i samme fylke, som har høy mortalitet av hjerte- og karsykdommer, samt høyt kolesterolnivå. Oppgaven tar sikte på å undersøke om nivået av disse variablene har endret seg over en periode på 15-20 år, i tråd med kolesterolnivået blant voksne i Finnmark. Det gjøres en enkel kostholds- og livsstilsundersøkelse for å prøve å relatere disse til funn i blod. Man fant at totalkolesterolet var minket, i tråd med nivået for voksne i Finnmark. Vedr ferritinnivået var det færre med lave/nesten tomme jernlagre enn tidligere. Videre fant man at det fortsatt er tradisjonelle risikofaktorer for hjerte- og karsykdommer, spesielt når det gjelder lavt inntak av fisk og lite fysisk aktivitet. Det var tidligere 12 % med BMI > 28, som indikerer overvekt/fedme, mens det ikke var noen deltakere i denne undersøkelsen med en så høy BMI. Antall med totalkolesterol>5,2 mmol/L, som anses som høyt i denne årsklassen, har minket, fra 25 % på begynnelsen av 1990- tallet til 6,9 % i denne undersøkelsen.

The aims of this study were to obtain a circular map of a pLG1 replicon type plasmid in E. faecium (TUH 56-32), derived from the trans-conjugation between E. faecium (K60-39), donor and (BM4105-RF) recipient strains and also to detect the presence of and describe the prevalence of selected open reading frames (ORF) from a clinical and non-clinical collection of E. faecium and E. faecalis strains. The DNA sequence of E. faecium (TUH56-32) plasmid was subjected to gaps closure. Gaps closure was performed by PCR to obtain a circular map of the plasmid sequence. To detect the presence of ORFs total DNA was extracted from a clinical and non-clinical collection of 150 isolates which consisted of 116 E. faecium and 34 E. faecalis. PCR was applied to detect the presence of ORFs. The gaps closing experiment was not accomplished and therefore did not give a circular DNA. However, the screening experiment was completed and the detection and description of ORFs among E. faecium showed that isolates from blood cultures harboured more ORFs than those of other clinical and non-clinical sources. Those of non-clinical cultures however lacked three of the tested ORFs. The prevalence was higher among clinical isolates of all sources compared to non-clinical isolates. Isolates of E. faecium detected more prevalently to all ORFs than E. faecalis. The isolates derived from blood cultures were highly enriched with all four ORFs compared to isolates from other clinical sources. Blood culture isolates harbouring all ORFs differed significantly to those of other clinical sources. In summary, the tested ORFs were overrepresented in blood culture isolates of E. faecium followed by other clinical isolates.

BACKGROUND: Integrons are bacterial genetic elements, working as assembly platforms, by incorporating gene cassettes (GCs) in the bacterial genome. 130 GCs providing antimicrobial resistance to most classes of antibiotics have been described, and most of them are associated with the class 1 integrons. Class 1 integrons are widespread among clinically important Gram-negatives, but are rare in gram positives. Recently, the first detection of integrons in clinical isolates of enterococci was described. Over the last two decades enterococci has emerged as one of the leading causes to nosocomial infections world over, as a result of development of hospital adapted lineages. These lineages tend to possess genes encoding antimicrobial resistance and have increased virulence. It is therefore of great interest to search for integrons in enterococci, as acquisition of integrons in enterococci could lead to an even more critical situation in the treatment of enterococcal infection. MATERIAL AND METHODS: A diverse collection of 274 enterococcal isolates was screened by IntI1 PCR which is a good marker for presence of class 1 integrons. Additionally, 24 of the isolates were further examined by colony blot hybridization and antibiotic susceptibility testing. RESULTS: All isolates were found to be PCR negative for the IntI1 integrase. Two possible positive results were detected by colony blot hybridization. CONCLUSION: Presence of Class 1 integrons was not detected in the enterococci-isolate collection investigated. However, further investigation of two possible positive isolates is required to verify the results. Moreover the whole isolate collection should additionally be investigated by hybridisation techniques before a conclusion of the findings can be made.

The papers of this thesis are not available in Munin: 1. Torill C. S. Rosvoll, Torunn Pedersen, Hege Sletvold, Pål J. Johnsen, Johanna E. Sollid, Gunnar S. Simonsen, Lars B. Jensen, Kåre M. Nielsen and Arnfinn Sundsfjord: 'PCR-based plasmid typing in Enterococcus faecium strains reveals widely distributed pRE25-, pRUM-, pIP501-, and pHTβ-related replicons associated with glycopeptide resistance and stabilizing toxin-antitoxin systems', FEMS immunology and medical microbiology (2010), 58(2):254-68. Available at http://dx.doi.org/10.1111/j.1574-695X.2009.00633.x 2. Torill C. S. Rosvoll, Belinda L. Lindstad, Tracy M. Lunde, Kristin Hegstad, Bettina Aasnæs, Anette M. Hammerum, Camilla H. Lester, Gunnar S. Simonsen, Arnfinn Sundsfjord and Torunn Pedersen: 'Increased high-level gentamicin resistance in invasive Enterococcus faecium is associated with aac(6’)Ie-aph(2”)Ia encoding transferable megaplasmids hosted by major hospital-adapted clineages', FEMS immunology and medical microbiology (2012) Epub ahead of print. Available at http://dx.doi.org/10.1111/j.1574-695X.2012.00997.x 3. Torill C. S. Rosvoll, Tracy M. Lunde, Kristin Hegstad, Anette M. Hammerum, Arnfinn Sundsfjord and Torunn Pedersen: 'High-level gentamicin resistance in E. faecalis is strongly associated with clonal complex 2 and encoded by the chromosomally located and transferable aac(6’)Ie-aph(2”)Ia gene' (manuscript) Sykehustilpassede bakterier er økende motstandsdyktig mot antibiotika Enterokokker (en type bakterier) er en viktig årsak til infeksjoner man kan få når man er innlagt på sykehus. Enterokokkene spesialiserer seg på å leve i sykehusmiljøet og er ofte er motstandsdyktige mot en rekke antibiotika. Disse bakteriene har en stor evne til å utveksle egenskaper seg i mellom, slik som antibiotika resistens. Dette gjør dem enda bedre tilpasset sykehusmiljøet og enda vanskeligere å behandle. Plasmids, resistance and hospital adaptation in enterococci – an epidemiological approach 21. juni 2012, Philosophiae Doctor De siste 10 årene har vi sett et økende antall sykehusinfeksjoner forårsaket av enterokokker. Det har samtidig vært en økning av antibiotika resistens i disse bakteriene, noe som gjør dem ekstra vanskelig å behandle. Enterokokker har en stor evne til å utveksle antibiotika resistens seg i mellom, dette skjer som oftest vha. et plasmid. Plasmider kan være bærere av resistens i en bakterie, og kan lage en kopi av seg selv som kan overføres til andre bakterier. Vi ønsket å se hvilke plasmider som finnes blant enterokokkene, og om det er bestemte typer som oftere overfører resistens enn andre. Vi har undersøkt utbredelsen av bestemte plasmidtyper i en internasjonal samling av enterokokker. Vi påviste at enkelte plasmidtyper er veldig vanlige og bærere av resistens. Samtidig så vi at enterokokker som forårsaket sykehusinfeksjoner hadde flere plasmider enn enterokokker fra dyr og friske mennesker. Vi undersøkte også norske enterokokker funnet i blod, hvor 57% var gentamicin resistent (gentamicin er et vanlig antibiotika brukt blant annet mot blodforgiftning) Vi fant en spesiell plasmidtype i over 90% av bakteriene, og det var alltid denne plasmidtypen som bar gentamicin resistensen. De bakteriene som var best sykehustilpasset hadde flere plasmider, mer resistens og flere gener som gir økt evne til infeksjon, enn de mindre sykehustilpassede bakteriene. Vår forskning tyder på at bakterier med stor evne til å tilegne seg nyttige egenskaper, slik som antibiotika resistens, bedre tilpasser seg sykehusmiljøet, og at antallet av denne typen enterokokker er økende. Torill Solvær Rosvoll (1980), utdannet ved universitetet i Tromsø, fikk min can. Med i 2009, og har siden vært ansatt ved institutt for medisinsk biologi hvor jeg har tatt min Ph.D. Jeg har jobbet innen feltet medisinsk mikrobiologi, med særlig fokus på antibiotika resistente enterokokker.

Infections caused by Enterococcus faecium have increased over the last few decades. In this thesis there has been an attempt to identify putative pili proteins in E. faecium. The putative genes were ligated into a pENTR vector; the insert was sequenced to check the orientation, sequence, length and ends. Then the putative genes were recombined into a pDEST vector for expression. The expression showed that the protein was in the insoluble fraction, and that it was a bit smaller than expected. The prevalence of pili genes was done by screening a selection of isolates by PCR and check for positive isolates on an E-gel. Pili 1:44 showed a correlation to isolates from hospital survey and hospital outbreaks. While pili 1:48 showed a correlation to isolates from blood and vancomycin resistant isolates. The pili genes were also correlated to each other. The results indicate that the pili genes are expressed under different temperature conditions.