1. Population structure and genetic diversity in males of the autochthonous Busha cattle in Croatia
- Author
-
Piplica, Aneta, Asti, Vittoria, Ekert Kabalin, Anamaria, Sušić, Velimir, Maurić Maljković, Maja, Vlahek, Ivan, Ostović, Mario, Čačić, Mato, Menčik, Sven, Piplica, Aneta, Asti, Vittoria, Ekert Kabalin, Anamaria, Sušić, Velimir, Maurić Maljković, Maja, Vlahek, Ivan, Ostović, Mario, Čačić, Mato, and Menčik, Sven
- Abstract
Busha is recognized as the most numerous autochthonous cattle breed in Croatia. In small populations, using the same sire repeatedly can increase inbreeding rates. This can lead to fewer high-quality, and high inbred breeding sires over time. Genealogical records of the Busha cattle breed registered from 1987 to 2022 were used to investigate the population structure and the genetic variability of the male individuals. The dataset included 10,411 animals, of which 3,962 were males. The average equivalent complete generation reached 2.92 in the total population and 3.05 in the reference population, when considering only living animals. The average inbreeding coefficient in the male population was 1.59%. Over the studied period, inbreeding rose to an average value of 2.07% in the last birth year cohort (2017-2022). The unequal contribution of the effective number of founders indicates the more frequent use of particular breeding sire lines. Nevertheless, despite the controlled inbreeding rate observed among breeding sires, and the absence of any evident population bottleneck, our study highlighted the need for breeding strategies to optimize the contribution of breeding animals in the next generations to ensure long-term conservation of the Busha cattle breed., Buša je prepoznata kao najbrojnija autohtona pasmina goveda u Hrvatskoj. U malim ugroženim populacijama učestalo korištenje istih bikova u rasplodu može utjecati na povećanje uzgoja u srodstvu, što s vremenom može rezultirati manjim brojem visokokvalitetnih rasplodnih bikova koji nisu u srodstvu. Za istraživanje strukture populacije i genetske varijabilnosti muških jedinki korišteni su genealoški zapisi pasmine goveda buša registriranih od 1987. do 2022. godine. Skup podataka uključivao je 10 411 životinja, od kojih su 3962 bila mužjaci. Prosječan ekvivalent potpunih generacija iznosio je 2,92 u ukupnoj populaciji i 3,05 u populaciji trenutačno živućih jedinki. Prosječan koeficijent uzgoja u srodstvu iznosio je 1,59 % u populaciji rasplodnih bikova. Tijekom promatranog razdoblja koeficijent uzgoja u srodstvu porastao je na prosječnu vrijednost od 2,07 % u kohorti posljednje godine rođenja (2017. - 2022.). Nejednak doprinos efektivnog broja osnivača upućuje na učestalije korištenje pojedinih uzgojnih linija bikova. Unatoč kontroliranoj stopi uzgoja u srodstvu uočenoj među rasplodnim bikovima i nepostojanju evidentnog uskoga grla u populaciji, provedeno istraživanje istaknulo je potrebu za uzgojnim strategijama koje bi optimizirale doprinos rasplodnih životinja u sljedećim generacijama kako bi se osiguralo dugoročno očuvanje pasmine goveda buša u Hrvatskoj.
- Published
- 2024