33 results on '"Pratta, Guillermo Raúl"'
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2. Comparative and integrative omic analysis focused on chaperones and interactors in a cultivated and an exotic tomato at different fruit ripening stages
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Goytia Bertero, Valentina, Cacchiarelli, Paolo, Pratta, Guillermo Raúl, and Arce, Débora Pamela
- Published
- 2024
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3. IDENTIFICATION AND INHERITANCE OF THE FIRST GENE (Rdc1) OF RESISTANCE TO SOYBEAN STEM CANKER (Diaporthe phaseolorum var. caulivora)
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Peruzzo, Alejandra María, primary, Pioli, Rosanna Nora, additional, Hernández, Facundo Ezequiel, additional, Ploper, Leonardo Daniel, additional, and Pratta, Guillermo Raúl, additional
- Published
- 2021
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4. A segregating population from a tomato second cycle hybrid allows the identification of novel QTL for fruit quality traits
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Cabodevila, Victoria Guadalupe, Cambiaso, Vladimir, Rodríguez, Gustavo Rubén, Picardi, Liliana Amelia, Pratta, Guillermo Raúl, Capel, Carmen, Lozano, Rafael, and Capel, Juan
- Published
- 2021
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5. Estimation of Genetic Variance Components for Corn Ear Rot in RIL Populations Derived from Three Biparental Crosses
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Belich, Yanel Emilce, primary and Pratta, Guillermo Raúl, additional
- Published
- 2023
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6. Single and joint effect of the basal region of chromosome 2 and centromeric region of chromosome 8 on morphological and fruit quality traits in tomato
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Green, Gisela Yael, Pereira da Costa, Javier Hernán, Cambiaso, Vladimir, Pratta, Guillermo Raúl, Zorzoli, Roxana, and Rodríguez, Gustavo Rubén
- Published
- 2016
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7. Rasgos relacionados con la semilla en dos cultivares de la especie forrajera megatérmica Panicum coloratum var. Makarikariense en un ambiente templado
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Moresco Lirusso, María Florencia, primary, Sacido, Mónica Benita, additional, Pratta, Guillermo Raúl, additional, and Felitti, Silvina Andrea, additional
- Published
- 2021
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8. Inheritance of shelf life and other quality traits of tomato fruit estimated from F1’s, F2’s and backcross generations derived from standard cultivar, nor homozygote and wild cherry tomato
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Rodríguez, Gustavo Rubén, Pratta, Guillermo Raúl, Liberatti, David Rodolfo, Zorzoli, Roxana, and Picardi, Liliana Amelia
- Published
- 2010
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9. Structural and functional analysis of two sHSP subfamilies in tomato ripening
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Tapia Elizabeth, Pratta Guillermo Raúl, Cacchiarelli Paolo, and Arce Débora Pamela
- Subjects
0106 biological sciences ,0301 basic medicine ,Genetics ,biology ,Functional analysis ,fungi ,food and beverages ,Plant Science ,biology.organism_classification ,01 natural sciences ,Biochemistry ,Genome ,Transcriptome ,03 medical and health sciences ,030104 developmental biology ,Polymorphism (computer science) ,Gene expression ,Gene family ,Solanum ,Gene ,010606 plant biology & botany ,Biotechnology - Abstract
The small Heat Shock Proteins (sHSP) gene family shows a high copy number of members, involved in stress and developmental processes in plants. We have studied the genomic structure and function of two sHSP subfamilies on chromosomes 6 and 9 in Solanum lycopersicum cv. Caimanta and S. pimpinellifolium accession LA0722, which are the parental lines of different breeding populations obtained by our research group. A similar tandem genomic arrangement between cv. Caimanta and accession LA0722, compared to the reference tomato genome cv Heinz 1706, has been observed, with 4 and 2 members, respectively. Gene variations having a copy number from 3 to 5 members for these sHSP, were identified in representative exotic tomato species (S. pennelli LA0716 and S. habrochaites LYC4) and the related crop potato. In order to obtain a better understanding of the regulation of both sHSP groups in fruit ripening, transcriptome analysis by RNA-Seq was performed. Differences in gene expression among cv. Caimanta and accession LA0722 were identified, and previously detected interactors were actively expressed for both sHSP clusters. Promoter regions of these sHSP and their interactors had molecular polymorphism with variation on HSE densities. Our results can be used in breeding programs for the design of sequence-based specific molecular markers, enabling a more efficient development of new commercial varieties with desired traits related to sHSP differential expression.
- Published
- 2021
10. Interactomic analysis of the sHSP family during tomato fruit ripening
- Author
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Arce, Débora Pamela, primary, De Las Rivas, Javier, additional, and Pratta, Guillermo Raúl, additional
- Published
- 2020
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11. Characterization of tomato generations according to a three-way data analysis
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Medico, Ana Paula Del, primary, Cabodevila, Victoria Guadalupe, additional, Vitelleschi, Maria Susana, additional, and Pratta, Guillermo Raúl, additional
- Published
- 2020
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12. A pipeline design for downloading and analyzing promoter sequences in solanum lycopersicum
- Author
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Pistilli, Alejandro D., Pratta, Guillermo Raúl, Angelone, Laura Monica, and Arce, Debora Pamela
- Subjects
PHYTON ,TOMTOM ,PLANT BIOLOGY SYSTEMS ,BIOINFORMATICS ,SQLITE ,purl.org/becyt/ford/1.2 [https] ,Horticultura, Viticultura ,GENE EXPRESSION ANALYSIS ,MEME ,purl.org/becyt/ford/1 [https] ,CIENCIAS AGRÍCOLAS ,Ciencias de la Computación e Información ,purl.org/becyt/ford/4.1 [https] ,Agricultura, Silvicultura y Pesca ,Ciencias de la Información y Bioinformática ,CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS ,THREADS ,purl.org/becyt/ford/4 [https] - Abstract
Se presenta el desarrollo de una arquitectura en pipeline que automatiza la descarga de promotores de Solanum lycopersicum desde la Sol Genomics Network y luego los analiza con los programas MEME y TOMTOM. El código está disponible en www.github.com/lalebot/pip-prom-tom y utiliza Git como software de control de versiones. Se combina el uso de threads en Python, expresiones regulares y base de datos SQLite para que conjuntamente disminuyan el tiempo de descarga de los promotores y optimicen la utilización de recursos informáticos. La metodología que presenta este trabajo es potencialmente aplicable a otras áreas biológicas. A pipeline architecture is implemented to automatize gene promoter sequence download from tomato genome Solanum lycopersicum annotated in Sol Genomics Network. Output gene promoters can be analyzed with MEME and TOMTOM programs. The code is available at www.github.com/lalebot/pip-prom-tom and Git is used as ontrol versions software. Combined Python threads, regular expressions, and SQLite databases are used to reduce time for downloading sequences and optimize informatic resources. The methodology presented in this work is potentially applicable to other biological fields. Fil: Pistilli, Alejandro D.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina Fil: Pratta, Guillermo Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina Fil: Angelone, Laura Monica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Centro Internacional Franco Argentino de Ciencias de la Información y de Sistemas. Universidad Nacional de Rosario. Centro Internacional Franco Argentino de Ciencias de la Información y de Sistemas; Argentina Fil: Arce, Debora Pamela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina
- Published
- 2018
13. Whole genome re-sequencing analysis of two tomato genotypes for polymorphism insight in cloned genes and a genetic map construction
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Cambiaso, Vladimir, primary, Pratta, Guillermo Raúl, additional, Pereira da Costa, Javier Hernán, additional, Zorzoli, Roxana, additional, Francis, David Merril, additional, and Rodríguez, Gustavo Rubén, additional
- Published
- 2019
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14. Selected genome regions for fruit weight and shelf life in tomato RILs discernible by markers based on genomic sequence information
- Author
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Cambiaso, Vladimir, primary, Gimenez, Magalí Diana, additional, da Costa, Javier Hernán Pereira, additional, Vazquez, Dana Valeria, additional, Picardi, Liliana Amelia, additional, Pratta, Guillermo Raúl, additional, and Rodríguez, Gustavo Rubén, additional
- Published
- 2019
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15. Multivariate estimate of heritability for quality traits in tomatoes by the multiple factor analysis
- Author
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Medico, Ana Paula Del, primary, Cabodevila, Victoria Guadalupe, additional, Vitelleschi, María Susana, additional, and Pratta, Guillermo Raúl, additional
- Published
- 2019
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16. Identificación de QTL en las generaciones segregantes de un híbrido de segundo ciclo de tomate
- Author
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Cabodevila, Victoria Guadalupe, Cacchiarelli, Paolo, and Pratta, Guillermo Raúl
- Subjects
Fitomejoramiento ,Quantitative trait loci ,Marcadores genéticos ,Loci de rasgos cuantitativos ,QTL ,Recursos fitogenéticos ,Plant breeding ,Post-harvest life ,mejoramiento genético vegetal ,Food processing and manufacture ,lcsh:Agriculture ,Tomate ,calidad de fruto ,vida poscosecha ,Lycopersicon esculentum ,Híbridos ,Fruit quality ,lcsh:TP368-456 ,lcsh:S ,Calidad de la fruta ,Agriculture ,TP368-456 ,recursos fitogenéticos ,Solanum sección Lycopersicon ,Biotecnología vegetal ,lcsh:Food processing and manufacture ,biotecnología vegetal ,Plant genetic resources ,Postcosecha ,Plant biotechnology - Abstract
El objetivo fue detectar QTL de interés agronómico en las generaciones segregantes (F2 y retrocruzas) de un híbrido de segundo ciclo (HSC) de tomate (Solanum lycopersicum L.), obtenido entre dos líneas endocriadas recombinantes derivadas del cruzamiento inter específico S. lycopersicum cv. Caimanta x S. pimpinellifolium LA 722. La caracterización molecular se hizo por marcadores AFLP mientras que los caracteres morfológicos analizados fueron peso, diámetro, altura, contenido en sólidos solubles, acidez, color, pH, forma, dureza y vida poscosecha de los frutos. Para identificar QTL, la asociación entre bandas polimórficas y caracteres cuantitativos con variancia genética significativa se realizó por el análisis de único punto. Con seis combinaciones de cebadores, seleccionadas por detectar elevado porcentaje de polimorfismo, se obtuvo 221 bandas de las cuales 135 (61,1%) fueron polimórficas. En la F2, 29 fragmentos polimórficos siguieron la distribución mendeliana esperada, identificándose un total de 28 QTL para todos los caracteres analizados. En las retrocruzas, 15 fragmentos polimórficos siguieron una segregación mendeliana 1:1 (detectándose en 12 de ellas un comportamiento de novo) y se identificó en total 13 QTL para los caracteres contenido en sólidos solubles, altura, peso y forma del fruto. Los AFLP permitieron identificar QTL de importancia agronómica en las generaciones segregantes del HSC de tomate. The objective was to detect QTL of agronomic interest in the segregating generations F2 and backcrosses of a tomato (Solanum lycopersicum L.) second cycle hybrid (SCH) obtained between two recombinant inbred lines derived from the interspecific cross S. lycopersicum cv. Caimanta x S. pimpinellifolium LA 722. Molecular characterization was achieved by AFLP markers and agronomic traits under study were fruit weight, diameter, height, soluble solids content, acidity, color, pH, shape, firmness and postharvest life. Single point analysis was applied to detect QTL, assessing the association of AFLP polymorphic bands and quantitative traits with significant genetic variance. Amplifications with six primers combinations, selected because of detecting high polymorphism percentage, 221 AFLP bands were obtained, and 135 (61.1%) of them were polymorphic in the tomato populations analyzed. In the F2 population, 29 polymorphic fragments adjusted to the expected mendelian segregation and a total of 28 QTL were detected for all evaluated traits. In the backcross population, 15 polymorphic fragments adjusted to the expected mendelian proportion 1:1 (12 of these fragments showed a de novo pattern) and a total of 13 QTL were identified for the traits soluble solids content, height, weight and diameter. AFLP allowed to identify QTL of agronomic interest in the segregating generations of a tomato SCH. Fil: Cabodevila, Victoria Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas Fil: Cacchiarelli, Paolo. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Genética y Mejoramiento Vegetal. Fil: Pratta, Guillermo Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- Published
- 2017
17. Genetic diversity, ancestry relationships and consensus among phenotype and genotype in banana (Musa acuminata) clones from Aormosa (Argentina) farmers
- Author
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Ermini, José Luis, Tenaglia, Gerardo Carlos, and Pratta, Guillermo Raúl
- Subjects
AFLP ,Otras Biotecnología Agropecuaria ,CIENCIAS AGRÍCOLAS ,Biotecnología Agropecuaria ,MUSA ,PROCRUSTES ,ANÁLISIS MULTIVARIADO - Abstract
Though banana is a tropical crop, the Argentinean Northeastern Province of Formosa has extensively promoted its production. Genetic variation was assessed by the Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) in a set of allotriploid and autotriploid clones from Formosa farms. Clones were also evaluated for perimeter and height of the pseudo-stem, number of leaves before flowering, number of flower clusters and length of fruits. Four international autotriploid varieties were used as samples. An AMOVA test widely discriminated among allotriploid clones, autotriploid clones and check varieties. The ancestry relationships between the autotriploids genotypes verified that clones were derived from the check varieties. Principal Coordinates Analysis was applied to assess the genetic diversity, demonstrating that 45% of the total molecular variation was explained by the three first principal coordinates. The first two principal components explained 77% of total phenotypic variability according to a Principal Components Analysis with the mean phenotypic values of clones and check varieties. Procrustes Analysis verified a high consensus (71.3%) among phenotypic and genotypic characterizations, suggesting that putative associations could be found among both sets of data. The 79.6% of the total variation was explained by the two principal components in this Procrustes Analysis. Fil: Ermini, José Luis. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina Fil: Tenaglia, Gerardo Carlos. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación y Desarrollo Tecnológico Para la Agricultura Familiar. Instituto de Investigación y Desarrollo Tecnológico Para la Agricultura Familiar Region Nea; Argentina Fil: Pratta, Guillermo Raúl. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Biología. Cátedra de Genética; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
- Published
- 2016
18. Molecular Diversity in Selected Banana Clones (Musa AAA “Cavendish”) Adapted to the Subtropical Environment of Formosa Province (Argentina)
- Author
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Ermini, José Luis, primary, Tenaglia, Gerardo Carlos, additional, and Pratta, Guillermo Raúl, additional
- Published
- 2018
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19. Tomato second cycle hybrids differ from parents at three levels of genetic variation
- Author
-
Liberatti, David Rodolfo, Rodríguez, Gustavo Rubén, Zorzoli, Roxana, and Pratta, Guillermo Raúl
- Subjects
PLANT BRREDING ,AFLP ,CIENCIAS AGRÍCOLAS ,purl.org/becyt/ford/4.1 [https] ,TOMATO ,PROFILE PROTEIN ,Agricultura, Silvicultura y Pesca ,purl.org/becyt/ford/4 [https] ,Horticultura, Viticultura - Abstract
Fil: Liberatti, David Rodolfo. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina Fil: Rodríguez, Gustavo Rubén. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina Fil: Zorzoli, Roxana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina Fil: Pratta, Guillermo Raúl. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
- Published
- 2013
20. Ligamiento genético entre variables asociadas a calidad del fruto de tomate y polipéptidos expresados en dos estados de madurez
- Author
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Gallo, Mariana, Rodríguez, Gustavo, Zorzoli, Roxana, and Pratta, Guillermo Raúl
- Subjects
Marcadores genéticos ,Loci de rasgos cuantitativos ,QTL ,Agricultura ,Rosario (Santa Fe, Argentina) ,QTLs ,Solanum ,Polipéptidos ,RECURSOS GENÉTICOS ,Solanum sección Lycopersicon ,Distancia genética ,Lycopersicon ,CIENCIAS AGRÍCOLAS ,purl.org/becyt/ford/4.1 [https] ,Agricultura, Silvicultura y Pesca ,Marcadores moleculares ,MEJORAMIENTO VEGETAL ,purl.org/becyt/ford/4 [https] - Abstract
Los perfiles de polipéptidos proveen información sobre la constitución genética de un individuo y su expresión, y son útiles como marcadores moleculares. El objetivo del trabajo fue detectar ligamiento entre los perfiles de polipéptidos del pericarpio en dos estados de madurez y caracteres cuantitativos y de calidad de los frutos, analizando 21 genotipos de tomate. Se obtuvieron los perfiles polipéptidos en los estados verde y rojo maduro de frutos de 18 líneas endocriadas recombinantes (RILs, recombinant inbred lines), derivadas de un cruzamiento interespecífico entre el cultivar Caimanta de S. lycopersicum y la entrada LA722 de S. pimpinellifolium, que se incluyeron como testigos experimentales junto a su F1. En estos 21 genotipos se evaluaron también vida poscosecha, peso, firmeza, porcentaje de reflectancia, índice cromático, forma, pH, acidez titulable, contenido de sólidos solubles, espesor de pericarpio y número de lóculos de los frutos. Los perfiles mostraron polimorfismo entre los estados de madurez dentro de un mismo genotipo y entre genotipos para un mismo estado de madurez. Algunos polipéptidos segregaron de forma mendeliana (1:1) y, por análisis de un único punto, mostraron ligamiento con caracteres de calidad del fruto. Se detectaron loci de caracteres cuantitativos (QTLs, quantitative trait loci) asociados a número de lóculos, peso, pH, firmeza y vida poscosecha de los frutos. Polypeptide profiles are informative about the individual gene constitution and expression, and become useful tools as molecular markers. The objective of this work was to detect genetic linkage among polypeptide profiles of the pericarp at two ripening stages and fruit quality traits in 21 tomato genotypes. Polypeptide profiles were obtained from mature green and red ripe fruits of 18 recombinant inbred lines (RILs) derived from an interspecific cross between the cultivar Caimanta of S. lycopersicum and the accession LA722 of S. pimpinellifolium, parents that were included with their hybrid as experimental testers. These 21 genotypes were also evaluated for fruit shelf life, weight, firmness, reflectance percentage, chroma index, shape index, pH, titratable acidity, soluble solids content, pericarp width, and number of locules. Polypeptide profiles were polymorphic among ripening stages within genotypes and among genotypes within the ripening stages. Some polypeptides segregated in the Mendelian expected proportion 1:1, and showed genetic linkeage by single point analysis with fruit quality traits. Hence, eight quantitative trait loci (QTLs) associated to number of locules, weight, pH, firmness and fruit shelf life, were detected in this report. Fil: Gallo, Mariana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Genética y Mejoramiento Vegetal. Fil: Rodríguez, Gustavo. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Genética y Mejoramiento Vegetal. Fil: Zorzoli, Roxana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Genética y Mejoramiento Vegetal. Fil: Pratta, Guillermo Raúl. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Genética y Mejoramiento Vegetal.
- Published
- 2011
21. Molecular markers detect stable genomic regions underlying tomato fruit shelf life and weight
- Author
-
Pratta, Guillermo Raúl, Rodriguez, Gustavo Rubén, Zorzoli, Roxana, Valle, Estela Marta, and Picardi, Liliana Amelia
- Subjects
quantitative genetics ,plant breeding ,plant genetic resources ,genética quantitativa ,Solanum section Lycopersicon ,melhoramento genético vegetal ,Solanum seção Lycopersicon ,recursos genéticos ,amplified fragment length polymorphism - Abstract
Incorporating wild germplasm such as S. pimpinellifolium is an alternative strategy to prolong tomato fruit shelf life (SL) without reducing fruit quality. A set of recombinant inbred lines with discrepant values of SL and weight (FW) were derived by antagonistic-divergent selection from an interspecific cross. The general objective of this research was to evaluate Genotype x Year (GY) and Marker x Year (MY) interaction in these new genetic materials for both traits. Genotype and year principal effects and GY interaction were statistically significant for SL. Genotype and year principal effects were significant for FW but GY interaction was not. The marker principal effect was significant for SL and FW but both year principal effect and MY interaction were not significant. Though SL was highly influenced by year conditions, some genome regions appeared to maintain a stable effect across years of evaluation. Fruit weight, instead, was more independent of year effect. A incorporação de germoplasma selvagem tal como S. pimpinellifolium é uma estratégia alternativa para prolongar a vida de prateleira de frutas do tomate (VP), sem reduzir a qualidade de frutas. Um conjunto de linhas puras recombinantes com valores discrepantes de VP e peso (PE) foi derivado por seleção antagônica divergente de um cruzamento interespecífico. O objectivo geral desta pesquisa foi avaliar a interação genótipo x ano (GA) e marcador x ano (MA) neste novo material para ambas as características. Os efeitos principais de genótipo e de ano e a interação GA foram estatisticamente significativas para VP. Os efeitos principais de genótipo e de ano foram significativos para PE, mas não a interação GA. O efeito principal marcador foi significativo para VP e PE, mas o efeito principal de ano e de interação não. Embora VP tenha sido muito influenciado pelas condições de ano, algumas regiões do genoma pareceram manter efeito estável em anos de avaliação. Peso de frutos, em vez disso, foi mais independente do efeito ano.
- Published
- 2011
22. Proteomics of the tomato ripening : identification of two fruit ripening stages by total pericarp protein profiles in tomato RILs
- Author
-
Gallo, Mariana, Rodríguez, Gustavo, Zorzoli, Roxana, Picardi, Liliana Amelia, and Pratta, Guillermo Raúl
- Subjects
Fitomejoramiento ,Solanum sección Lycopersicon ,Multivariate analysis ,Tomate ,Análisis multivariado ,Biodiversity ,Solanum ,Biodiversidad ,Plant breeding - Abstract
Durante la madurez del fruto se producen cambios morfológicos, fisiológicos y bioquímicos provocados por la expresión regulada de diferentes genes. El objetivo de este trabajo fue verificar si la presencia de polipéptidos totales del pericarpio en los estados verde maduro (VM) y rojo maduro (RM) permite caracterizar la madurez del tomate. Se analizaron 18 líneas endocriadas recombinantes obtenidas por selección antagónica-divergente de un cruzamiento entre la cv. Caimanta (Solanum lycopersicum) y la entrada LA722 (S. pimpinellifolium), que fueron incluidas junto a la F1 como testigos experimentales. Los extractos proteicos se obtuvieron de dos muestras independientes de cada estado según el protocolo estándar y se resolvieron en SDS-PAGE. Se analizó la presencia/ausencia de bandas por genotipos y por estado, detectándose 26 en VM y 29 en RM. Algunas bandas fueron comunes entre estados, mientras que otras resultaron propias de VM o RM, respectivamente. Se calcularon las distancias de Jaccard y se realizó un análisis de conglomerados según el método UPGMA. En el dendrograma (correlación cofenética = 0,43) se distinguieron dos grandes grupos definidos por el estado de madurez. Se concluye que los perfiles proteicos del pericarpio son una herramienta postgenómica apropiada para identificar dos estados de madurez del fruto de tomate. Several morphological, physiological, and biochemical changes are produced by the regulated expression of different genes during fruit ripening. The aim of this investigation was to check the ability of total polypeptides profiles of the pericarp tissue at the mature-green (VM) and red-ripe (RM) stages for characterizing tomato fruit ripening. Eighteen recombinant inbred lines obtained by antagonic-divergent selection from a cross between cv. Caimanta of Solanum lycopersicum and accession LA722 of S. pimpinellifolium (included with the F1 as experimental testers) were analyzed. Protein extracts were collected from two independent samples from each stage following the standard protocol and solved in SDS-PAGE. The presence/absence of polypeptides by genotypes and by stage was analyzed. Twenty-six polypeptides were detected in VM and 29 in RM. Some of them were common to both stages, while others were stage-specific (either in VM or in RM). Jaccard distances among stages were calculated and a conglomates analysis was carried by UPGMA method. In the dendrogram (cophenetic correlation = 0.43) two well defined groups were distinguished by the ripening stage. As a conclusion, protein profiles of the pericarp are a postgenomic tool appropriate for identifying two ripening stages of the tomato fruit. Fil: Gallo, Mariana. Universidad Nacional de Rosario Fil: Rodríguez, Gustavo. Universidad Nacional de Rosario Fil: Zorzoli, Roxana. Universidad Nacional de Rosario Fil: Picardi, Liliana Amelia. Universidad Nacional de Rosario Fil: Pratta, Guillermo Raúl. Universidad Nacional de Rosario
- Published
- 2010
23. Factores genéticos que afectan la calidad del fruto del tomate
- Author
-
Rodríguez, Gustavo Rubén, Pratta, Guillermo Raúl, Zorzoli, Roxana, and Picardi, Liliana Amelia
- Subjects
Ciencias Agrarias ,fruto ,Genotipo - Abstract
La calidad de los frutos en tomate juega un rol muy importante tanto en la elección de los cultivares por parte de los productores como en la demanda del producto obtenido por parte de los consumidores. Un carácter relacionado a la calidad de fundamental importancia y altamente apreciado para la comercialización del fruto fresco, es la prolongación de su vida poscosecha. La biotecnología ha hecho considerables progresos para modificar vías metabólicas involucradas en la madurez del fruto., Trabajo galardonado con el Premio Fundación Pérez Companc, versión 2010, Academia Nacional de Agronomía y Veterinaria
- Published
- 2010
24. Variabilidad genética para la vida postcosecha y el peso de los frutos en tomate para familias F3 de un híbrido interespecífico
- Author
-
ZORZOLI, ROXANA, PRATTA, GUILLERMO RAÚL, and PICARDI, LILIANA AMELIA
- Subjects
selección divergente ,métodos de mejoramiento ,segregación ,genetic variation ,divergent selection ,Lycopersicon pimpinellifolium ,Lycopersicon esculentum ,segregation ,breeding methods ,variación genética - Abstract
Se evaluó la variabilidad genética para la vida postcosecha y el peso de los frutos en veintiséis familias F3 de un híbrido interespecífico entre la cv. Caimanta de Lycopersicon esculentum Mill. y la línea LA722 de L. pimpinellifolium (Jusl.) Mill. con el objeto de obtener genotipos divergentes para ambos caracteres. Los promedios de días de vida postcosecha fueron 8, 15, 18 y 13 y de peso en gramos fueron 52,17, 0,94, 4,45 y 6,41 para cv. Caimanta, LA722, la F1 y la generación F3, respectivamente. Ninguna familia fue similar al progenitor `Caimanta' para el carácter días de vida postcosecha y sólo una familia tuvo una vida postcosecha como la F1. Para el peso de los frutos, cuatro familias fueron similares a la F1 y ninguna fue como los progenitores. La familia con peso de los frutos con 20,15 g y vida postcosecha de 21,5 días fue la que presentó mayores valores. El menor peso de los frutos fue en una familia con 2,81 g y el de menor vida postcosecha en una con 9,98 días. La amplia variabilidad genética encontrada para ambos caracteres entre las familias permitirá obtener genotipos divergentes. The genetic variability for the fruit's shelf-life and weight was evaluated in twenty-six F3 families derived from an interspecific hybrid between the cv. Caimanta of Lycopersicon esculentum Mill. and the line LA722 of L. pimpinellifolium (Jusl.) Mill. The means for fruit's shelf-life were 8, 15, 18 and 13 days and for fruit weight were 52.17 g; 0.94 g; 4.45 g and 6.41 g in 'Caimanta', LA722, the F1 and in the F3 generations, respectively. No family was similar to the progenitor 'Caimanta' for fruit's shelf-life and only one family showed a shelf-life similar to the F1 generation mean. For fruit weight, four families were similar to the F1 generation mean and the F3 families differed from both parent means. The F3 family with the greatest values for fruit weight and shelf-life showed a fruit weight mean of 20.15 g and shelf-life period of 21.55 days. The smaller fruit weight was 2.81 g and the smaller shelf-life period for another family was 9.98 days. The wide genetic variability found for both traits between the families will permit to select divergent genotypes.
- Published
- 2000
25. QTL detection for fruit shelf life and quality traits across segregating populations of tomato
- Author
-
Pereira da Costa, Javier Hernán, primary, Rodríguez, Gustavo Rubén, additional, Pratta, Guillermo Raúl, additional, Picardi, Liliana Amelia, additional, and Zorzoli, Roxana, additional
- Published
- 2013
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26. Molecular markers detect stable genomic regions underlying tomato fruit shelf life and weight
- Author
-
Pratta, Guillermo Raúl, primary, Rodriguez, Gustavo Rubén, additional, Zorzoli, Roxana, additional, Valle, Estela Marta, additional, and Picardi, Liliana Amelia, additional
- Published
- 2011
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27. Genética molecular de caracteres cuantitativos en cruzamientos dialélicos de tomate
- Author
-
Pratta, Guillermo Raúl, primary, Mahuad, Sabina Lara, additional, Díaz, Ariana, additional, Basté, Ezequiel Marchionni, additional, Liberatti, David Rodolfo, additional, Rodríguez, Gustavo Rubén, additional, and Zorzoli, Roxana, additional
- Published
- 2011
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28. Biodiversity in a Tomato Germplasm for Free Amino Acid and Pigment Content of Ripening Fruits
- Author
-
Pratta, Guillermo Raúl, primary, Rodríguez, Gustavo Rubén, additional, Zorzoli, Roxana, additional, Picardi, Liliana Amelia, additional, and Valle, Estela Marta, additional
- Published
- 2011
- Full Text
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29. Variabilidad genética para la vida postcosecha y el peso de los frutos en tomate para familias F3 de un híbrido interespecífico
- Author
-
ZORZOLI, ROXANA, primary, PRATTA, GUILLERMO RAÚL, additional, and PICARDI, LILIANA AMELIA, additional
- Published
- 2000
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30. Caracterización fenotípica y molecular de dos poblaciones de Panicum coloratum var. makarikariense
- Author
-
Moresco Lirusso, María Florencia, Felitti, Silvina Andrea, and Pratta, Guillermo Raúl
- Subjects
Marcadores ISSR ,Forraje ,Heredabilidad ,Caída de cariopses ,Germinación ,Diversidad molecular ,Morfología de panoja - Abstract
Panicum coloratum is a species of C4 type grass native to South Africa. In Argentina it is valued for its production of good quality forage in environments where resources are limiting, although it is scarcely diffused in current livestock systems. The purpose of this study was to evaluate the potential of two cultivars of Panicum coloratum var. makarikariense with respect to caryopses drop, germination and panicle morphology. Drop was evaluated weekly using caryopse traps. The results showed significant differences between cultivars in both years. The caryopses fall peak occurred on the same date for both cultivars, although that occurred in different weeks. The behavior was not influenced by environmental conditions and both cultivars produced seeds with high germination percentages in the different treatments. High variance and positive, high and significant correlations were found for various variables referring to panicle morphology, by means of the Principal Component Analysis for both years and for all the data as a whole. In all cases, the first two Principal Components were able to explain a high percentage of the total variability. Heritability estimates in the narrow sense were also made using the progeny-parent regression method for the trait "caryopsis drop" over two years. The estimates were made on the aforementioned morphological character, having previously selected 18.75% of the individuals of the Kapivera cultivar and 28.57% of the individuals of the Bambatsi cultivar. The only significant value obtained was in week 5, which gives an indication of the existence of additive genetic variance and also its stability. The results achieved with respect to h2 for the other weeks under study were statistically non-significant, indicating the absence of additive variance for the trait under study compared to the genetic context. The ISSR molecular markers allowed to confirm the existence of genetic variability between cultivars and within individuals of the same cultivar through bands and unique alleles per genotype. The individuals of the Kapivera cultivar have been able to genetically differentiate themselves from the individuals of the Bambatsi cultivar by detecting loci and alleles that differentiate both cultivars. These markers proved to be effective for the distinction of the cultivars analyzed and a wide variability has been observed in the species. The information provided in this work enriches the knowledge of the behavior of the main phenotypic characters associated with the performance of Panicum coloratum var. makarikariense, offering tools to assist genetic improvement in the search for an increase in crop yield. The characterization of the genetic diversity within the cultivars of P. coloratum var. makarikariense using ISSR markers widely used in grasses constitutes a fundamental step for its potential incorporation into breeding programs developed in the species. Panicum coloratum es una especie de gramínea de tipo C4 nativa de Sudáfrica. En Argentina es ampliamente valorada por su producción de forraje de buena calidad en ambientes donde los recursos son limitantes, aunque es escasamente difundida en los sistemas ganaderos actuales. El propósito de este estudio fue evaluar el potencial agronómico de dos cultivares de Panicum coloratum var. makarikariense respecto a la caída de sus cariopses, germinación y morfología de panoja. La caída fue evaluada semanalmente mediante la utilización de trampas de cariopses, los resultados demostraron la existencia de diferencias significativas entre cultivares en ambos años. El pico de caída se dio en la misma fecha para ambos cultivares, aunque eso significó semanas distintas. Ambos picos no estuvieron influenciados por condiciones ambientales y produjeron semilla con altos porcentajes de germinación en los diferentes tratamientos. Dentro del Análisis de Componentes Principales para los años 2017, 2019 y para la totalidad de los datos en conjunto se hallaron correlaciones positivas, altas y significativas para diversas variables referidas a la morfología de panoja. En todos los casos, las dos primeras Componentes Principales fueron capaces de explicar un alto porcentaje de la variabilidad total. También se realizaron estimaciones de heredabilidad en sentido estricto mediante el método de Regresión Progenie- Progenitor para el carácter “caída de cariopses” a lo largo de dos años. Las estimaciones se realizaron sobre el carácter morfológico mencionado habiendo seleccionado previamente el 18,75% de los individuos del cultivar Kapivera y el 28,57% de los individuos del cultivar Bambatsi. El único valor significativo obtenido fue en la semana 5, lo que da un indicio de la existencia de variancia genética aditiva y también de su estabilidad. Los resultados alcanzados respecto a la h2 para las demás semanas en estudio resultaron estadísticamente no significativos, indicando la ausencia de variancia aditiva para el carácter en estudio frente al contexto genético. Los marcadores moleculares ISSR permitieron confirmar la existencia de variabilidad genética entre cultivares y dentro de individuos del mismo cultivar a través de bandas y alelos únicos por genotipo. Los individuos del cultivar Kapivera han podido diferenciarse genéticamente de los individuos del cultivar Bambatsi al detectarse loci y alelos que diferencian a ambos cultivares. Estos marcadores demostraron ser eficaces para la distinción de los cultivares analizados y se ha observado una amplia variabilidad en la especie. La información brindada en este trabajo enriquece el conocimiento del comportamiento de los principales caracteres fenotípicos asociados al rendimiento de Panicum coloratum var. makarikariense, ofreciendo herramientas para asistir al mejoramiento genético en la búsqueda de un incremento en el rendimiento de cultivos. La caracterización de la diversidad genética dentro de los cultivares de P. coloratum var. makarikariense mediante marcadores ISSR ampliamente utilizados en gramíneas constituye un paso fundamental para su potencial incorporación a programas de mejoramiento desarrollados en la especie. Palabras Clave (mínimo 3, máximo 7): forraje, caída de cariopses, germinación, morfología de panoja, heredabilidad, diversidad molecular, marcadores ISSR. Moresco Lirusso, María Florencia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
- Published
- 2021
31. Proteómica de la madurez del tomate: Identificación de dos estados de madurez del fruto por perfiles proteicos totales del pericarpio en RILs de tomate.
- Author
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Gallo, Mariana, Rodríguez, Gustavo Rubén, Zorzoli, Roxana, Picardi, Liliana Amelia, and Pratta, Guillermo Raúl
- Subjects
- *
TOMATOES , *BIODIVERSITY , *METABOLISM , *PROTEINS , *PERICARP - Abstract
Several morphological, physiological, and biochemical changes are produced by the regulated expression of different genes during fruit ripening. The aim of this investigation was to check the ability of total polypeptides profiles of the pericarp tissue at the mature-green (VM) and red-ripe (RM) stages for characterizing tomato fruit ripening. Eighteen recombinant inbred lines obtained by antagonic-divergent selection from a cross between cv. Caimanta of Solanum lycopersicum and accession LA722 of S. pimpinellifofium (included with the F1 as experimental testers) were analyzed. Protein extracts were collected from two independent samples from each stage following the standard protocol and solved in SDS-PAGE. The presence/absence of polypeptides by genotypes and by stage was analyzed. Twenty-six polypeptides were detected in VM and 29 in RM. Some of them were common to both stages, while others were stage-specific (either in VM or in RM). Jaccard distances among stages were calculated and a conglomates analysis was carried by UPGMA method. In the dendrogram (cophenetic correlation = 0.43) two well defined groups were distinguished by the ripening stage. As a conclusion, protein profiles of the pericarp are a postgenomic tool appropriate for identifying two ripening stages of the tomato fruit. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2010
32. Caracterización fenotípica y molecular de las generaciones segregantes de tres híbridos de segundo ciclo en tomate: validación de QTLs asociados a la calidad de los frutos
- Author
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Cabodevila, Victoria Guadalupe, Pratta, Guillermo Raúl, and Picardi, Liliana Amelia
- Subjects
Mapa Genético ,Aflp ,Qtl ,Loci ,Snp ,QTLs ,Ssr ,Horticultura, Viticultura ,CIENCIAS AGRÍCOLAS ,Tomate ,purl.org/becyt/ford/4.1 [https] ,Calidad de Fruto ,Híbridos de Segundo Ciclo ,Agricultura, Silvicultura y Pesca ,purl.org/becyt/ford/4 [https] ,Variabilidad ,Calidad - Abstract
El tomate es una de las hortalizas de mayor importancia económica mundial. A través del cruzamiento entre el cultivar argentino Caimanta de Solanum lycopersicum y la accesión LA722 de la especie silvestre S. pimpinellifolium mediante un programa de selección divergente-antagónica para el peso y la vida poscosecha de los frutos, se desarrollaron 17 líneas endocriadas recombinantes (RIL). Como resultado del cruzamiento entre RIL es posible obtener los llamados híbridos de segundo ciclo (HSC). En estos HSC es viable encontrar nueva variabilidad genética por recombinación de los genes seleccionados durante la obtención de las RIL progenitoras. El objetivo de la Tesis fue caracterizar fenotípica y molecularmente tres generaciones F2 obtenidas de la autofecundación de tres HSC (RIL18xRIL1, RIL1xRIL8 y RIL1xRIL5), determinar la variabilidad existente en los dos niveles de caracterización, identificar regiones genómicas asociadas a caracteres de calidad de los frutos y seleccionar una generación segregante para iniciar un nuevo programa de mejoramiento. La caracterización molecular de las tres generaciones F2 utilizando seis combinaciones de cebadores de AFLP (Polimorfismo en la Longitud de los Fragmentos Amplificados) originó en todas las poblaciones un número de bandas superior a 100 y un porcentaje de bandas polimórficas superior al 57%, determinando la presencia de una alta variabilidad molecular en todas las poblaciones. En el nivel fenotípico se evaluaron los caracteres del fruto: diámetro, altura, índice de forma, peso, vida poscosecha, firmeza, cociente de absorbancias (a/b), porcentaje de reflectancia (L), pH, sólidos solubles y acidez titulable. La variabilidad generada fue evidenciada dado que, en la mayoría de los casos, se identificaron individuos F2 que tuvieron valores superiores o inferiores a los valores promedios de las RIL. Por otro lado, la aplicación de diferentes herramientas multivariadas permitió conocer, en una primera aproximación integral, las diferentes estructuras de las poblaciones. En el Análisis de Componentes Principales, en las tres generaciones, fueron necesarias las primeras cuatro componentes para explicar cerca del 80% de la variabilidad fenotípica. Analizando la variabilidad molecular con el Análisis de Coordenadas Principales, para obtener el mismo porcentaje de variabilidad, fueron necesarias 12 o más coordenadas. El consenso obtenido entre ambas clases de variabilidad por un Análisis de Procrustes Generalizado fue superior al 64% en todas las F2. La alta asociación entre la información en los niveles fenotípico y molecular encontrada en esta primera aproximación fue profundizada mediante la estimación de diferentes parámetros genéticos y la detección de QTLs (loci de caracteres cuantitativos) por métodos convencionales. Respecto al grado de dominancia, en general, predominó la dominancia completa, aunque también se observó dominancia parcial,sobredominancia y aditividad pura, pero en menor medida. Por otro lado, las tres generaciones presentaron los mayores valores de heredabilidad para los caracteres pH, sólidos solubles y acidez titulable. Se detectó un amplio número de QTLs para la mayoría de los caracteres en las tres generaciones, aunque ninguno de ellos se pudo validar ya que no fueron comunes. La generación F2 del HSC RIL18xRIL1 presentó el mayor número de QTLs detectados y asociados a todos los caracteres; en consecuencia, fue seleccionada para hacer una caracterización molecular más exhaustiva y derivación de familias F3. En relación a la caracterización molecular se llevó a cabo utilizando marcadores de tipo SSR (Repeticiones de Secuencia Simple) y SNP (Polimorfismo de Nucleótido Simple). Por un lado, se utilizaron 12 combinaciones de cebadores de SSR de los cuales el 92% resultaron ser polimórficos. Con estos SSR polimórficos se detectó un total de siete QTLs para peso, vida poscosecha, ambos atributos de color (L y a/b), sólidos solubles y acidez titulable. Dos de ellos (asociados a a/b y a vida poscosecha) pudieron ser validados ya que también fueron identificados en una población retrocruza relacionada. Por otro lado, al disponer de las secuencias de Caimanta y la accesión LA722, se desarrollaron marcadores altamente específicos del tipo SNP. Se utilizaron 130 SNP localizados en los 12 cromosomas de la especie cultivada. De ellos, sólo el 59% segregaron en los individuos de la generación F2, y con ellos se detectaron siete QTLs para diámetro, peso e índice de forma. Se elaboró un mapa físico y genético. Mediante el primero, se pudo estimar que las regiones no segregantes fueron levemente superiores al 50% mientras que el porcentaje de regiones segregantes fue de unos puntos por debajo del 50% (46%). En cuanto al mapa genético, se obtuvieron 23 grupos de ligamiento. En relación al avance a la siguiente generación de autofecundación, aplicando criterios fenotípicos y moleculares se seleccionaron 18 individuos F2 para obtener las familias F3., que fueron caracterizadas fenotípicamente para los mismos atributos que sus progenitores. Se detectaron heredabilidades en sentido estricto significativas para diámetro, altura, índice de forma, peso, pH y acidez titulable. Se concluye que a través de la caracterización fenotípica y molecular con los diferentes tipos de marcadores de ADN utilizados se pudo corroborar que los HSC presentan combinaciones genotípicas favorables entre los genes que fueron seleccionados en generaciones previas. Estas nuevas combinaciones originaron variabilidad genética en el nivel molecular y fenotípico. También fue posible identificar numerosos QTLs mediante los diferentes marcadores moleculares y validar algunos de ellos. Con la información obtenida en estas generaciones tempranas se seleccionaron individuos dentro de la población base seleccionada para obtener familias F3, para iniciar en base a estos resultados un nuevo programa de mejoramiento genético para los caracteres de calidad de fruto. F2 segregating progeny from the tomato second cycle hybrids (SCH) were obtained from crossing RIL (Recombinant Inbred Lines), which were derived from an interespecific cross between Solanum lycopersicum cv. Caimanta and the accesión LA722 from S. pimpinellifolium. The objectives of this Thesis wwere to characterize three F2 populations by molecular markers and morphological traits in order to evaluate the molecualr and morphological variability, to identify genetics regions associated to quality fruit traits and to select the best population to begin a new breeding program. The phenotypic fruit traits evaluated were: diameter, height, weight, shape index, post-hasrvest life, firmness, abosrbance index, reflectance percentage, pH, soluble solids and titratable acidity. A high molecular diversity was found through six AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism). Also a high level of morphological diversity was found using the phenotypic traits. Different multivariate analices were used to asses the degree of concordance among these two approaches. High consensus was found between these methods suggesting that it could be posible to detec QTLs (Quatitative Trait Loci) for these traits. Several QTLs were identified for mosto of the traits. Because of the promissory characteristics of the F2 derived from the SCH RIL18xRIL1, this population was selected to be caharacterized by another DNA markers and to obtain individuals to generate the F3 families. Using 12 primer combinations of SSR (Simple Sequence Repeats), seven QTLs were detected for weight, shelf life, absorbance index, reflectance percentage, soluble solids and titratable acidity. Sequences of both parental of these RIL allowed designing specific SNP (single Nucleotide Polymorphism) markers. Scattered over the 12 chromosomes, 130 SNP were used and seven QTLs were found for diameter, weight and shape index. The physic map obtained showed that the not segregating regions were slightly higher tna 50%, while the percentage of segregating regions was below 50% (45%). The genetic map exhibited 23 linkage groups. Besides, through the phenotypic and molecular data obtained, 18 F2 individuals were selected to generate F3 families. The phenotypic and molecular characterization here obtained has allowed detecting favourable genotypic combinations among the genes that were selected in previous generations. Also, several QTLs were identified. The information obtained in these early generations together with these F3 families indicates that it could be possible to initiate a new breeding program to improve fruit quality traits. Fil: Cabodevila, Victoria Guadalupe. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
- Published
- 2017
33. Functional studies of arabidopsis mitochondrial proteins related to defense mechanisms against biotic and abiotic stress
- Author
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Colombatti, Francisco, Welchen, Elina, Blanco, Flavio Antonio, Orellano, Graciela Elena, Pratta, Guillermo Raúl, and González, Daniel Héctor
- Subjects
Estrés biótico ,Phenotypic analysis ,Biotic stress ,Oxidative stress ,Arabidopsis ,Estrés oxidativo ,Mitocondria ,Mitochondria ,Transcriptional analysis ,Estudio fenotípico ,Análisis transcripcional - Abstract
Fil: Colombatti, Francisco. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas; Argentina. Los genes de la familia OXR (del inglés Oxidation Resistance) fueron descubiertos en una búsqueda de genes capaces de revertir el fenotipo de estrés oxidativo en bacterias. En este trabajo de Tesis nos propusimos estudiar la familia OXR en Arabidopsis thaliana, la cual está constituida por 5 miembros. Decidimos estudiar dos genes de esta familia, AtOXR2 y AtOXR4, que presentaron mayor identidad de secuencia con los reportados en humanos y levaduras. Observamos que las proteínas AtOXR2 y AtOXR4 tienen un efecto de protección en bacterias sensibles al estrés oxidativo. Además, cuando se complementaron levaduras mutantes observamos una reversión en el fenotipo de sensibilidad al estrés oxidativo. Estudios de localización subcelular demostraron que AtOXR2, y AtOXR4 se localizan en mitocondrias de células de raíz. Por otro lado, el estudio de las regiones promotoras reveló un perfil de expresión similar para ambas proteínas. Las plantas que sobreexpresan AtOXR2 tienen una estructura radicular más compleja, mientras que plantas deficientes en dicho gen mostraron el fenotipo opuesto. Las plantas que sobreexpresan AtOXR2 llegan a tener 3 veces mas biomasa, y los parámetros de fluorescencia de la clorofila indican que estas plantas son más eficientes en el uso de luz capturada, fijan más CO2, y producen mayor cantidad de semillas que sus pares salvajes. Determinamos que tienen un perfil transcripcional basal similar al de plantas sometidas a situaciones de estrés, y presentan un desbalance hormonal. La mejora en las propiedades agronómicas permiten pensar en el uso de genes AtOXR para el desarrollo de nuevas tecnologías. OXR (Oxidation Resistance) family genes were discovered during a search of genes capable of revert oxidative stress phenotype in bacteria. in this Thesis work we focused on Arabidopsis thaliana (Arabidopsis) OXR family. Arabidopsis OXR family is composed by 5 members, and we focused our study in AtOXR2 and AtOXR4, whose sequence identity was the higher when compared to human and yeast. AtOXR2 and AtOXR4 are able to exert a protective effect on sensitive bacteries. Moreover, when ScOXR1 mutant yeast were complemented with mitochondrion-targeted AtOXR2 and AtOXR4 we found a reversion on the oxidative stress sensitivity phenotype. By means of localization studies on Arabidopsis, we showed that AtOXR2 and AtOXR4 are localized to mitochondria of root cells. Moreover, studies on expression patterns conferred by promoter regions of both genes revealed a similar expression profile. Plants overexpressing AtOXR2 has a more complex root structure, while we detected that plants deficient in AtOXR2 has the opposite phenotype. When plants overexpressing AtOXR2 grows up they reach three fold more biomass than WT plants, are more efficient in the use of captured light, are able to fix more CO2, and are capable to produce more seeds than WT plants. Transcriptional analysis of plants overexpressing AtOXR2 allowed us to determine that these plants posses a transcriptional profile similar to Arabidopsis plants exposed to stress conditions, and showed unbalanced hormonal content. Due to improving in properties of agronomic interest that present AtOXR genes, is possible to think about using these as a tool to develop new technologies. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- Published
- 2016
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