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La Convention sur la diversite biologique a enterine l’idee que la valorisation de la biodiversite peut etre au cœur d’une strategie alliant protection de la nature et developpement durable. Cet article s’interesse au mode d’organisation d’une filiere de commercialisation de substances naturelles, dans le cadre d’un projet en Bolivie. Le programme Biodesa-FFEM a pour objectif la conservation de la biodiversite a travers la valorisation de plantes aromatiques et medicinales. Biodesa constitue un exemple de la mise en œuvre des principes de la CDB, dans un pays ayant une legislation avancee quant a l’acces aux ressources genetiques.La realisation d’activites aussi diversifiees que l’exploration de nouvelles potentialites vegetales, l’acces legal aux ressources, la production de connaissances scientifiques et la valorisation de savoirs ethnobotaniques, debouche sur la creation de nouveaux partenariats autour d’un centre universitaire de Cochabamba. Nous etudions la construction de ces partenariats entre public et prive, entre marche et conservation, entre offre et demande de ressources vegetales, entre scientifiques et detenteurs de savoirs locaux. La question est de savoir si ces partenariats sont susceptibles de permettre l’emergence d’un marche de produits naturels.

La plupart des espèces végétales sont des polyploïdes récents ou anciens. L'allopolyploïdisation qui résulte d'une hybridation interspécifique couplée à une duplication génomique joue un rôle fondamental dans l'évolution des plantes. Elle provoquerait des changements de l'organisation du génome et de la régulation de l'expression des gènes qui seraient à l'origine de nouvelles aptitudes de ces plantes. Dans ce contexte, l'étude des mécanismes de conciliation des réseaux parentaux de régulation des gènes semble essentielle pour définir leur rôle dans la variation de l'expression des gènes. Le genre Coffea, composé d'espèces diploïdes pouvant s'hybrider et d'une espèce allotétraploïde C. arabica, constitue un modèle approprié pour cette étude. L'allopolyploïde présente deux sous-génomes homéologues peu différenciés, provenant de l'hybridation de C. eugenioides et C. canephora. A l'inverse de ses espèces parentales qui se caractérisent par des écosystèmes différents et d'amplitude thermique faible, C. arabica se développe en tolérant des variations de température plus importantes. Ce travail a consisté à étudier chez C. arabica les conséquences de l'hybridation sur la variation de l'expression et de la régulation des gènes et à analyser la variation de l'expression des gènes homéologues et son implication dans les capacités adaptatives. L'expression et la régulation des gènes au sein d'hybrides F1 entre C. canephora et C. eugenioides ont été analysées en utilisant la technologie RNA-seq. L'étude de ces hybrides a montré que les espèces parentales se distinguent par une proportion importante de divergences de trans-régulation. Pour 77% des gènes différemment exprimés entre les espèces parentales et les hybrides, le niveau d'expression de l'hybride est comparable à celui de l'une des espèces parentales, c'est le phénomène de «level expression dominance». L'analyse de l'expression allélique spécifique a permis de caractériser la régulation de l'expression des gènes ; les deux allèles sont exprimés, avec exceptionnellement un biais en faveur d'un génome. L'expression des gènes est déterminée par des combinaisons complexes de divergences de cis-régulation des espèces parentales et des effets entrecroisés de leurs facteurs de trans-régulation. Le niveau d'expression des gènes dépend de la sur ou sous-régulation simultanée des deux allèles et en particulier, de l'asymétrie des effets des facteurs de trans-régulation qui semble être à l'origine du phénomène de «level expression dominance». Pour l'allopolyploïde, l'étude de l'expression relative des gènes homéologues à l'échelle du génome a révélé que les gènes homéologues des deux sous-génomes s'inter-régulent et contribuent au transcriptome. Le transcriptome de jeunes feuilles de C. arabica cultivés à deux conditions de températures, chacune convenant à l'une des espèces parentales a été analysé pour étudier la variation de l'expression des gènes homéologues chez C. arabica et son implication dans les capacités adaptatives. La contribution des sous-génomes au transcriptome est faiblement modifiée par les conditions de culture et n'apparait pas directement impliquée dans la capacité de C. arabica à tolérer des amplitudes thermiques plus élevées que les espèces parentales. Ces études ont permis de caractériser la réponse transcriptionnelle à un évènement d'hybridation récent et ancien. Elles mettent en évidence les bases génétiques de la variation de l'expression allélique suite à la fusion des réseaux divergents de régulation des gènes d'espèces parentales. Elles ont permis de proposer un modèle de la régulation de l'expression des gènes homéologues pour C. arabica.

Pennisetum$ sect. #Brevivalvula$ is a species complex characterized by polyploidy and apoximis. Ploidy level was assessed by DAPI-flow cytometry for 304 plants of the section, originating from Burkina Faso, Benin and southern Niger. The results were confirmed for 54 plants based on chromosome counts. The samples show four euploidy levels (with x = 9) distributed among five species : #P. hordeoides$ (2n = 36, 54), #P. pedicellatum$ (2n = 36, 45, 54), #P. polystachion$ (2n = 18, 36, 45, 54), #P. setosum$ (2n = 54), and #P. subangustum$ (2n = 18, 36, 54). The geographical distribution of these ploidy levels seems related to major vegetation zones present in Africa. Diploid populations of #P. polystachion$ and #P. subangustum$ were found in the Banfora area, in Burkina Faso. (Résumé d'auteur)

Le massif de l’Aïr est une enclave montagneuse à l’intérieur du Sahara nigérien. Il abrite environ 80 000 habitants dépendants pour l'essentiel des ressources végétales locales. Notre objectif était de mettre en relation les variations récentes des activités humaines avec le niveau des ressources végétales afin d’anticiper un déficit dans une région aride régulièrement menacée par les sécheresses. Les résultats obtenus à travers des enquêtes auprès des acteurs locaux et des observations empiriques montrent une dégradation rapide des ressources végétales. Cette dégradation est liée à deux types d’impact de l’Homme sur l’environnement. Le premier, interne, se traduit par une pression plus forte sur la végétation autour des villages, et par l’expansion des cultures irriguées qui menace la pérennité des ressources en eaux souterraines. Le second impact, externe, concerne la pression croissante exercée par les centres urbains périphériques, en particulier sur les ressources en bois. On observe par ailleurs un processus d'invasion, encore limité, par un arbre introduit, Prosopis juliflora. Dans un contexte de sécheresses ces changements pourraient déclencher une altération rapide de la biodiversité et des ressources vivantes dans le massif. Un processus de cogestion des ressources naturelles de la réserve et de sa périphérie doit permettre d’enrayer cette dégradation. Il serait utile qu'il soit accompagné de recherches visant à mieux comprendre les processus écologiques liés à la dynamique de la végétation. En particulier, les processus de facilitation entre plantes peuvent être des outils de restauration écologique performants. The Aïr mountain range is nested inside the Saharan part of Niger. It is populated with approximately 80000 inhabitants depending mostly on local vegetation resources. We aimed to study the relationships between the recent changes in human activities and the level of vegetation resource so as to anticipate a possible lack of resources in an arid region confronted to recurrent droughts. Investigations with local populations and empirical observations showed a rapid degradation of the vegetation related to human activities. Two types of effects are distinguished. First, local people increase pressure on vegetation around the villages, while the intensification of irrigated agriculture threatens the level of belowground water resources. Second, the peripheral urban zones have a growing negative impact on vegetation, especially on wood. In addition, an introduced species, Prosopis juliflora is expanding fast and should be regarded as an invasion process. These changes, if associated with severe droughts, could lead to a quick loss of biodiversity and vegetation resources in the massif. Co-management plans on natural resources including local inhabitants as managers should break this degradation cycle. It would also be consistent to make a better use of ecological knowledge as a restoration/conservation tool. Especially, facilitation between plants, and related nurse effects, can be taken as a relevant tool to restore degraded ecosystems in arid environments.

International audience

Cette étude établit la composition de la végétation herbacée sous et hors couvert ligneux de jachères d'âges différents en Casamance, région subhumide située au Sud-Sénégal. Des relevés de végétation sous et à côté des arbres ont été effectués et soumis aux méthodes d'analyse multivariée (AFC, indices de végétation). L'AFC a permis de distinguer les relevés effectués sous le couvert des arbres de ceux de la zone découverte ; le degré de discrimination varie avec l'âge de la jachère. Il existe ainsi un "effect couvert" qui est associé à un cortège floristique caractéristique des différents biotopes. La richesse spécifique et les indices de diversité, également plus importants sous l'arbre, traduisent de meilleures conditions de milieu dans ce biotope que dans la zone découverte. L'évolution de la végétation herbacée des jachères est bi-directionnelle, en relation aux communautés sciaphile et héliophile. (Résumé d'auteur)

A partir de la notion classique de système d'élevage et des bases méthodologiques qui sous-tendent l'étude de son fonctionnement, deux systèmes d'élevage extensif andins d'altitude contrastés sont analysés : un système pastoral camélidés-ovins et un système agro-pastoral. Il est montré l'intérêt d'une évaluation des orientations globales des pratiques d'élevage afin d'avoir une représentation synthétique des projets qui sous-tendent ces pratiques et de mieux cerner les possibilités d'évolution du système en présence. Ainsi, il est apparu que dans le système pastoral étudié, les décisions et les pratiques d'élevage qui en découlent sont dirigées en premier lieu vers la recherche d'une optimisation de l'interface entre les animaux et les ressources pastorales natives disponibles, plutôt que vers des modifications des composants du système d'élevage. Dans le cas du système agro-pastoral, les produits attendus de l'élevage guident des pratiques plus directives concernant la nature des ressources fourragères à promouvoir et les types d'animaux à élever. Ceci a des implications importantes sur la nature des innovations techniques que peut être amené à proposer le zootechnicien pastoraliste pour renforcer la viabilité du système d'élevage. (Résumé d'auteur)

The trnL-trnF intergenic spacer of cpDNA has been sequenced from 38 tree samples representing 23 #Coffea$ taxa and the related genus #Psilanthus$. These sequences were used for phylogenetic reconstruction using parsimony analyses. The results suggest a radial model of speciation and a recent origin in Africa for the genus #Coffea$. Phylogenetic relationships inferred from the cpDNA analysis suggest several major clades, which present a strong geographical correspondence (i.e., west Africa, central Africa, east Africa, and Madagascar). The overall results agree well with the phylogeny previously inferred from nuclear genome data. However, several inconsistencies are observed among taxa endemic to west Africa, suggesting the occurrence of introgressive hybridization. Evidence is also obtained for the genetic origin of the allotetraploid species #C. arabica$. (Résumé d'auteur)

Some characteristics of the species complex #Pennisetum$ section #Brevivalvula$ are polyploidy and apomixis. Four euploidy levels (x = 9) were assessed by DAPI-flow cytometry for 304 plants of the section, distributed among five species : #P. hordeoides$ (2n = 36, 54), #P. pedicellatum$ (2n = 36, 45, 54), #P. polystachion$ (2n = 18, 36, 45, 54), #P. setosum$ (2n = 54), and #P. subangustum$ (2n = 18, 36, 54). The geographical distribution of the ploidy levels seems to be related to major ecological zones of West Africa. The hilly regions displayed a higher ploidy diversity than the others ; diploid populations of the annual species #P. polystachion$ and #P. subangustum$ were found. Genotypic variation expressed by isozyme polymorphism did not show any significant difference between the diploid, sexual populations and the diploid, apomitic populations of these species. (Résumé d'auteur)

Section #Brevivalvula$ is one of five sections in the large tropical grass genus #Pennisetum$. It belongs to the tertiary genepool of #P. glaucum$ (L.) R. Br., pearl millet, and consists of six morphological taxa : #P. atrichum$ Stapf and Hubb., #P. hordeoides$ (Lam.) Steud., #P. pedicellatum$ Trin., #P. polystachion$ (L.) Schult., #P. setosum$ (Swartz) L. Rich. and #P. subangustum$ (Schum.) Stapf and Hubb., which together form a polyploid and agamic complex. Four euploid (x = 9) and twelve aneuploid chromosome levels have been found till now ; the polyploids are apomictic, while diploid populations of #P. polystachion$ and #P. subangustum$ are considered sexual. (Résumé d'auteur)

Le niébé, #Vigna unguiculata$, principale légumineuse africaine, est une espèce bien isolée au sein du genre #Vigna$, mais très diversifiée. Au sein des formes spontanées, on distingue une dizaine de sous-espèces pérennes et souvent allogames et une sous-espèce annuelle, subsp. #unguiculata$. Cette dernière est partagée entre une variété spontanée, var. #spontanea$, et les formes cultivées, var. #unguiculata$. Les formes cultivées se distinguent des formes annuelles par un certain nombre de caractères morphologiques qui constituent le syndrome de domestication : taille plus importante des organes, réduction ou perte de la déhiscence des gousses et présence éventuelle de caractères des gousses et présence éventuelles de caractères récessifs utiles. Au sein des formes cultivées, s'opposent d'une part un groupe "primitif" morphologiquement plus proche des formes sauvages et un groupe "évolué", et d'autre part un groupe photoindépendant à nombre d'ovule élevé et un groupe photosensible à nombre d'ovules faible. La variabilité isoenzymatique des formes cultivées est remarquablement faible et s'avère plutôt indépendante des groupes morphologiques, ce qui plaide pour une domestication unique chez le niébé. L'étude isoenzymatique met toutefois en relief les cultivars éthiopiens et cv. gr. Textilis. L'étude du polymorphisme enzymatique et de l'ADN chloroplastique montre aussi les formes cultivées légèrement distinctes de var. #spontanea$, qui reste le progéniteur le plus probable, et le décalage est surtout notable en Afrique de l'Ouest et en Afrique australe. Le nord-est de l'Afrique pourrait avoir ainsi été une zone clé dans la domestication du niébé. Les données ethnobotaniques et linguistiques obtenues au Cameroun vont aussi dans ce sens... (D'après résumé d'auteur)

Le gombo est un légume-fruit tropical cultivé dans toute la zone intertropicale. Ce texte constitue une des monographies compilées dans la 2ème édition du livre "Evolution des plantes cultivées" de J. Smartt et N.W. Simmonds. Les auteurs S. Hamon (ORSTOM) et D.H. Van Sloten (IPGRI) ont contribué au cours des années 80 à développer des travaux sur cette plante. Dans cet article sont exposées les principales connaissances sur l'évolution de la systématique, les indications taxonomiques, les connaissances cytogénétiques, les données agronomiques et génétiques de base. (Résumé d'auteur)

Cette étude vise à déterminer comment la diversité d'une plante cultivée est gérée traditionnellement par les agriculteurs de façon à cerner les mécanismes responsables de la structure et de la dynamique de cette diversité. Ce travail, basé sur des enquêtes, des observations directes et des essais en milieu paysan, a concerné les variétés de maïs cultivées dans une communauté rurale à l'ouest du Mexique. Nous avons observé que cette communauté ne fonctionne pas en vase clos en ce qui concerne le matériel végétal cultivé. La reconduction des lots de semences à partir d'un faible échantillonnage conduit à une dérive génétique avec perte théorique d'allèles. Le semis des variétés sur des surfaces contiguës indépendamment de leur origine et le synchronisme de leur floraison favorisent les échanges génétiques entre tous types de cultivars. Néanmoins, l'intégrité phénotypique des variétés est conservée grâce à la physiologie du maïs qui explique en grande partie les caractéristiques végétatives des différentes variétés et à la sélection humaine qui permet de conserver les caractéristiques des épis

Histoire de l'évolution végétale, en particulier du mil et du sorgho, dans la région d'Aribinda et de Koudougou au Burkina Faso. Il ressort de cette analyse que les plantes fourragères sont celles qui apparaissent comme les plus affectées par les disparitions des 30 dernières années. Celles-ci sont liées à la fois aux aléas climatiques et au développement de l'élevage

Des prospections de caféiers spontanés ont été organisées depuis 1966 dans 10 pays d'Afrique par l'ORSTOM, en collaboration avec d'autres instituts. Un échantillon du matériel végétal collecté a été introduit dans deux centres de ressources génétiques caféières en Côte d'Ivoire (Divo, Man). Les collections en champ comprennent une trentaine d'espèces du genre #Coffea$ et de l'ordre de 8 000 génotypes originaux. Le coût des prospections puis d'établissement et la maintenance des collections a été évalué : le prix de revient d'une souche est de l'ordre de 500 FF. Ces caféiers spontanés n'ont qu'une valeur potentielle; leur valorisation sous forme de variétés nécessite un travail d'évaluation et de sélection d'une vingtaine d'années. Aussi, l'investissement pour mettre en place une collection de matériel génétique ne représente que le tiers du coût total d'un programme de sélection. Le prix de revient global d'un programme d'exploitation des ressources génétiques caféières peut être comparé à la production caféière. Pour des pays comme l'Ethiopie ou la Côte d'Ivoire, le coût du programme de recherche représente 1 pour mille des revenus de l'exploitation du café alors que l'accroissement annuel de leur production peut atteindre 1 à 2% grâce aux nouvelles variétés sélectionnées. (Résumé d'auteur)