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Resumen Introducción: Staphylococcus aureus es uno de los patógenos con mayor prevalencia en el mundo, asociado a una alta tasa de mortalidad y un rápido desarrollo de resistencia a los antimicrobianos. A pesar de su patogenicidad, su seguimiento epidemiológico en México es escaso. Objetivo: Analizar la epidemiología molecular local y determinar el origen clonal de cepas resistentes a meticilina (RM) aisladas de pacientes internados en el Hospital Central “Dr. Ignacio Morones Prieto”. Métodos: Se llevó a cabo un estudio prospectivo de corte transversal, de julio a diciembre de 2016. La caracterización de las cepas se realizó mediante genotipificación Spa, la determinación por RPC punto final de la frecuencia de genes de virulencia específicos y su antibiograma. Resultados: A partir de estos datos, se obtuvo que la prevalencia de S. aureus RM fue de 25,7%, destacando la presencia del tipo Spa t895 en 76% de las cepas resistentes y un patrón similar de susceptibilidad a antimicrobianos. Conclusión: Los resultados de este estudio indican que la prevalencia regional de SARM no se ha modificado en los últimos 10 años y proporcionan información valiosa del origen clonal y los factores de virulencia de las cepas de S. aureus aisladas en la región.

ilustraciones, gráficas, tablas Staphylococcus aureus es una bacteria de gran importancia clínica, caracterizada por ser la especie más virulenta dentro de su género y causante de infecciones muy diversas que pueden amenazar la vida de quienes las padecen. Sin embargo, su importancia no radica únicamente en las enfermedades que causa, sino en la alta capacidad que ha evidenciado para presentar resistencia a múltiples antibióticos dentro de los que se encuentran los βlactámicos, ejemplificada por la resistencia a meticilina. Los aislamientos resistentes a meticilina son un problema de salud pública mundial, que inicialmente se atribuían a ambientes hospitalarios, pero que con el paso del tiempo han comenzado a reportarse cada vez con más frecuencia en la comunidad. Adicional a esto, se ha observado resistencia a otros antibióticos con blancos terapéuticos diferentes. Lo anterior hace necesario la búsqueda de nuevas alternativas que permitan controlar el crecimiento bacteriano de aislamientos que no pueden tratarse mediante los antimicrobianos existentes actualmente. Este trabajo tiene como objetivo determinar el efecto de péptidos derivados de catelicidina en el crecimiento y la morfología de aislamientos clínicos de S. aureus procedentes de la ciudad de Bogotá D.C. Para ello, realizaremos la caracterización molecular respecto al gen de resistencia a meticilina mecA, la proteína A (spa) y pvl , causante de la presencia de leucocidina Panton-Valentine, e identificaremos los perfiles de sensibilidad a compuestos antibióticos de 57 aislamientos clínicos de S. aureus. Adicionalmente, evaluaremos la actividad de péptidos de catelicidina, LL-37 y ATRA-1, y daptomicina sobre los aislamientos clínicos caracterizados. Finalmente, identificaremos los cambios en la morfología bacteriana de S. aureus, por acción de los péptidos de catelicidina, mediante microscopía electrónica de barrido. Determinamos que existe una importante prevalencia de aislamientos resistentes a meticilina, y que además, existen aislamientos con discordancias en el perfil de sensibilidad a estos antibióticos en S. aureus, por otra parte se evidencia una tasa alta de sensibilidad a antibióticos con mecanismos de acciones diferentes a meticilina. Comprobamos que los péptidos LL-37 y ATRA-1 presentan capacidad antimicrobiana frente a este patógeno y que existen diferencias entre la actividad de estos compuestos y el perfil de sensibilidad a meticiilina. Finalmente, comprobamos que estos péptidos generan cambios en la morfología superficial como uno de sus mecanismos de acción, sin embargo, no se descarta que presenten efectos intracelulares que potencien su actividad antimicrobiana. Con este trabajo, buscamos contribuir a la vigilancia de la resistencia bacteriana en la ciudad de Bogotá, promover el desarrollo de nuevas alternativas terapéuticas que permitan controlar la resistencia bacteriana en nuestra región, así como aportar en la caracterización de la actividad de péptidos antimicrobianos sintéticos en S. aureus. (Texto tomado de la fuente) Staphylococcus aureus is a bacterium of great clinical importance. It is the most virulent species within its genus and the cause of very diverse infections that can threaten the lives of those who suffer from them. More importantly, it has shown resistance to multiple antibiotics, including β-lactam antibiotics, like Methicillin resistance. Methicillin-resistant isolates are a worldwide public health problem, attributed initially to hospital environments, but it has begun to be reported more and more frequently in the community. In addition to this, resistance to other antibiotics with different therapeutic targets has been observed. That makes it necessary to search for new alternatives to control the bacterial growth of isolates that cannot be treated with existing antibiotics. This work aims to determine the effect of cathelicidin-derived peptides on the growth and morphology of S. aureus clinical isolates from Bogotá D.C. city. We performed molecular characterization of the methicillin resistance mecA gene, protein A (spa), and pvl genes, and we identified the sensitivity profiles to the antibiotics of 57 S. aureus clinical isolates. Additionally, we evaluated the antimicrobial activity of LL-37, ATRA-1, and daptomycin on the characterized clinical isolates. Finally, we identified the changes in S. aureus bacterial morphology by peptides’ action using scanning electron microscopy (SEM). We determined that there is an important prevalence of resistant isolates to Methicillin. Some of them with discordances in the methicillin sensitivity in S. aureus. However, a high sensitivity rate to antibiotics with mechanisms of action different from methicillin is evidenced. We found that LL-37 and ATRA-1 peptides have antimicrobial capacity against this pathogen and are differences between the activity of these compounds and the sensitivity of the Methicillin profile. Finally, we proved that these peptides generate Surface changes in morphology as one of their mechanisms; however, it is not excluded that they present intracellular effects that potentiate its antimicrobial action. With this work, we are looking to contribute to the surveillance of bacterial resistance in Bogotá city, promote the development of new therapeutic strategies to control bacterial resistance in our region, and contribute to the characterization of the activity of synthetic antimicrobial peptides against S. aureus. Maestría Magíster en Ciencias - Microbiología Caracterización de aislamientos de S. aureus Perfil de sensibilidad antibiótica En este estudio se incluyeron 57 aislamientos proporcionados por el Grupo para el Control de la resistencia bacteriana en Bogotá (GREBO) y el laboratorio de Biofísica de la Universidad de los Andes (ver Anexo A). A partir de estos aislamientos se realizaron cultivos iniciales de 24 h a 37°C en medio solido tripticasa de soya (TSA) (Scharlau Chemie, España). La sensibilidad oxacilina se evalúo empleando el método microdilución en caldo conforme a lo descrito en la norma CLSI M07 (Clinical and Laboratory Standards Institute, 2018) y a cefoxitina, gentamicina, eritromicina, clindamicina, ciprofloxacina y trimetoprima-sulfametoxazol empleando el método difusión en agar conforme a lo descrito en la normar CLSI M02 (Clinical and Laboratory Standards Institute, 2018). Como controles se emplearon las cepas Staphylococcus aureus subsp. aureus (ATCC® 25923™), Staphylococcus aureus subsp. aureus (ATCC® 29213™) y Staphylococcus aureus subsp. aureus (ATCC® 33591™) (American Type Culture Collection, Virginia, USA) y los aislamientos clínicos 1631 sensible a daptomicina y 1634 resistente a daptomicina, proporcionados por el laboratorio de Biofísica de la Universidad de los Andes (ver anexo A). Todos los ensayos se realizaron por triplicado. Microbiología médica Biología molecular de agentes infecciosos

Resumen Introducción: Staphylococcus aureus es uno de los patógenos con mayor prevalencia en el mundo, asociado a una alta tasa de mortalidad y un rápido desarrollo de resistencia a los antimicrobianos. A pesar de su patogenicidad, su seguimiento epidemiológico en México es escaso. Objetivo: Analizar la epidemiología molecular local y determinar el origen clonal de cepas resistentes a meticilina (RM) aisladas de pacientes internados en el Hospital Central “Dr. Ignacio Morones Prieto”. Métodos: Se llevó a cabo un estudio prospectivo de corte transversal, de julio a diciembre de 2016. La caracterización de las cepas se realizó mediante genotipificación Spa, la determinación por RPC punto final de la frecuencia de genes de virulencia específicos y su antibiograma. Resultados: A partir de estos datos, se obtuvo que la prevalencia de S. aureus RM fue de 25,7%, destacando la presencia del tipo Spa t895 en 76% de las cepas resistentes y un patrón similar de susceptibilidad a antimicrobianos. Conclusión: Los resultados de este estudio indican que la prevalencia regional de SARM no se ha modificado en los últimos 10 años y proporcionan información valiosa del origen clonal y los factores de virulencia de las cepas de S. aureus aisladas en la región. Abstract Background: Staphylococcus aureus is one of most prevalent pathogens in the world associated with a high mortality rate and a rapid development of resistance to antibiotics. Despite its pathogenicity, epidemiological monitoring in Mexico is scarce. Aim: To analyze the local molecular epidemiology and determine the clonal origin of methicillin-resistant (MR) strains isolated from patients admitted to Hospital “Dr. Ignacio Morones Prieto”. Methods: A cross-sectional prospective study was carried out from July to December 2016. The characterization of the strains was carried out by Spa genotyping, frequency of specific virulence genes by PCR and antibiogram. Results: The prevalence of MRSA was 25.7%, highlighting the presence of the Spa type t895 in 76% of the resistant strains and a similar pattern of susceptibility to antibiotics. Conclusion: The results of this study indicate that the regional prevalence of MRSA has not changed in the last 10 years and provide valuable information on the clonal origin and the virulence factors of the strains of S. aureus isolated in the region.

Objetivos: Epidermólise Bolhosa Congênita (EBC) é um grupo heterogêneo de genodermatoses caracterizado por fragilidade da pele e mucosas que leva à formação de bolhas e erosões. Infecção é uma das principais complicações associadas à doença, e a sepse permanece como importante causa de mortalidade entre os pacientes. Nosso objetivo neste estudo foi investigar e analisar aspectos bacteriológicos de colonização dos pacientes com EBC. Métodos: Realizamos um estudo transversal no Departamento de Dermatologia da UFCSPA, que recrutou pacientes com EBC provenientes de diferentes regiões do país, durante um período de dois anos. Dados clínicos foram coletados através de anamnese e exame físico/dermatológico. A investigação bacteriológica foi realizada em espécimes clínicos coletados de cinco sítios corporais através de swabs. Presença de Staphylococcus aureus e Pseudomonas aeruginosa foi confirmada por testes bioquímicos. Isolados de S. aureus foram adicionalmente investigados quanto à presença dos genes nuc e mecA, através da técnica de PCR, e quanto ao perfil de suscetibilidade antimicrobiana, através do método disco difusão. Resultados: Oitenta e nove pacientes com EBC foram incluídos no estudo. S. aureus foi o agente mais frequentemente encontrado colonizando todos os sítios investigados, com uma prevalência geral de 51,7%. Pacientes colonizados por S. aureus nas narinas e no umbigo apresentaram um risco 3,4 vezes superior de também apresentar o agente nas lesões de pele. O gene mecA, que codifica resistência à meticilina, foi verificado em 24,7% de todos os isolados de S. aureus (MRSA). A frequência de colonização por MRSA entre nossos pacientes foi 15,7%. Pseudomonas aeruginosa foi identificada em 9% da nossa amostra. Conclusões: Este foi o primeiro estudo brasileiro sobre colonização microbiana em pacientes com EBC. As altas taxas de colonização pelo S. aureus e, em especial, pela sua variante MRSA, reforçam a necessidade de se conhecer o perfil bacteriológico dessa população específica, para a instituição de tratamentos mais eficazes, com menor risco de cronificação de feridas e de complicações infecciosas graves. Objective: Epidermolysis bullosa (EB) is a large heterogeneous group of genodermatosis characterized by skin and mucosal fragility that leads to blister and erosion formation. One of the most common complications of the disease is infection and sepsis still figures as an important cause of death among this patients. Our aim was to investigate and analyze bacteriological aspects of colonization of patients with EB in our country. Methods: We conducted a cross-sectional study at the Department of Dermatology from UFCSPA, recruiting patients with EB from different regions of Brazil, during a 2-year period. Clinical data was obtained through anamnesis and physical/dermatological examination. Bacteriological investigation was performed in clinical specimens collected through swabs from 5 body sites. Presence of Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa was confirmed by biochemical tests. S. aureus isolates were further submitted to nuc and mecA genes investigation by PCR assay and also to antimicrobial susceptibility analysis by disk diffusion method. Results: Eighty-nine patients with EB were included in our study. S. aureus was the most frequent agent founded colonizing all body sites, with an overall prevalence of 51.7%. Patients with S. aureus colonization of the anterior nares and bellly button had a 3.4 times higher risk of also having skin lesions colonized by the same agent. The mecA gene was seen in 24.7% of all S. aureus isolates. Frequency of colonization by MRSA among our patients was 15.7%. Pseudomonas aeruginosa was identified in 9% of our sample. Conclusions: This was the first study on microbiological aspects of colonization of EB patients in Brazil. The high colonization rates by S. aureus in this population, especially by its MRSA variant, emphasize the importance of new medical approaches in order to minimize risks of wound healing delay and life-threatening infections.

Objective: to estimate the prevalence of oxacillin/methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from saliva and nasal secretion of the nursing staff. Methods: cross-sectional study carried out in specialized units of a university hospital. In total, 600 samples of saliva and nasal secretions were obtained from nursing professionals. Results: of the 100 participants, the growth of Staphylococcus aureus was identified in 43.0% of professionals, 7.0% were resistant to methicillin. Of these Staphylococcus aureus resistant to methicillin, 100.0% were nasal carriers; two professionals were nasal and saliva carriers. All professionals colonized by methicillin-resistant Staphylococcus aureus were indicated to perform the decolonization protocol in force at the institution of the study; six accepted to follow the protocol and only two presented negative cultures for Staphylococcus aureus after decolonization. Conclusion: the results evidenced the colonization of the nursing staff by Staphylococcus aureus, and the nasal cavity was identified as an important colonization site. Objetivo: estimar a prevalência de Staphylococcus aureus resistente à oxacilina isolado na saliva e em secreção nasal dos profissionais de enfermagem. Métodos: estudo transversal realizado em unidades especializadas de um hospital universitário. No total, 600 amostras de saliva e secreções nasais foram obtidas de profissionais de enfermagem. Resultados: dos 100 participantes, identificou-se o crescimento de Staphylococcus aureus em 43,0% dos profissionais, 7,0% eram resistentes à oxacilina. Desses Staphylococcus aureus resistentes à oxacilina, 100,0% foram carreadores nasais; dois profissionais foram carreadores nasais e na saliva. Todos os profissionais colonizados por Staphylococcus aureus resistente à oxacilina tiveram indicação para realizar o protocolo de descolonização vigente na instituição do estudo, seis aceitaram seguir o protocolo e apenas dois apresentaram culturas negativas para Staphylococcus aureus após a descolonização. Conclusão: os resultados demonstraram a colonização do profissional de enfermagem por Staphylococcus aureus, sendo a cavidade nasal apontada como um importante sítio de colonização.

Submitted by Alison Souza (alisonsouza@ufgd.edu.br) on 2019-06-17T17:13:52Z No. of bitstreams: 1 CarolinaRangeldeLimaSantos.pdf: 1446909 bytes, checksum: b65bf6899e9d981c6a7d541e77dd3ad3 (MD5) Made available in DSpace on 2019-06-17T17:13:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarolinaRangeldeLimaSantos.pdf: 1446909 bytes, checksum: b65bf6899e9d981c6a7d541e77dd3ad3 (MD5) Previous issue date: 2018-10-30 Introdução: Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) estáconstantemente associado a perfis de multiresistenciae constituem uma das principais preocupações em infecções relacionadas aos serviços de saúde. Foi realizado um estudo transversal entre agosto/2016 e agosto/2017 para descrever as características clínicas e moleculares associadas às cepas de MRSA isoladas de um hospital terciário localizado no centro-oeste do Brasil. Métodos: As características clínicas associadas a infecções de corrente sanguínea por MRSA em neonatos foram investigadas com uma análise de caso-controle envolvendo 51 pacientes. A identificação bacteriana foi realizada pelo sistema PhoenixTM. A susceptibilidade antimicrobiana foi determinada pela microdiluição em caldo. A presença de genes de resistencia a meticilina (mecA, femA), a leucocidina de Panton-Valentine (pvl) codificada pelo genepvl e a tipagem de SCCmec foi avaliada por PCR e sequenciamento de DNA. Resultados: Um total de 30 cepas de S. aureus resistentes à meticilina foram idoladas de 30 pacientes, sendo 23 delas MRSA adquiridas no ambiente hospitalar (76,6%) e 7MRSA adquiridas na comunidade (23,4%). A maioria dos pacientes incluídos no estudo eram neonatos (57%). A síndrome da membrana hialina, a displasia broncopulmonar, a síndrome de aspiração de mecônio, a prematuridade, a hospitalização prolongada e o uso de dispositivos invasivos foram associados a infecções de corrente sanguínea por MRSA em recém-nascidos. A amplificação por PCR e o sequenciamento mostraram que os genes mecA e femA foram responsáveis ​​pela resistência à meticilina. A análise molecular do SCCmec revelou que o SCCmec tipo IV foi o mais prevalente. A maioria das cepas positivas para pvlforam identificadas como Staphylococcus aureus adquirida no ambiente hospitalar (HA-MRSA), indicando a diversificação bacteriana das cepas HA-MRSA e Staphylococcus aureus adquirida na comunidade CA-MRSA. Conclusão: este estudo mostrou que pacientes infectados / colonizados representam reservatórios para transmissão horizontal, assim, medidas de controle de infecção são necessárias para prevenir a disseminação de cepas resistentes a multi drogas (MDR) em instituições de saúde. Background: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) are frequently associated with multidrug-resistance profiles and a major concern in infections health services. A cross-sectional study was conducted between August/2016 and August/2017, to describe the clinical and molecular characteristics associated MRSA strains isolated from a tertiary hospital located in mid-western Brazil. Methods: Clinical characteristics associated with MRSA bloodstream infections in neonates were investigate with a case control analysis involving 51 patients. Bacterial identification was performed by PhoenixTM system. Antimicrobial susceptibility was determined by broth microdilution. The presence of methicilin-resistance genes (mecA, femA), Panton-Valentine leukocidin encoding gene (pvl) and SCCmec typing was evaluated by PCR and DNA sequencing. Results: A total of 30 methicilin-resistant S. aureus strains were recovered from 30 patients, of which were identified as hospital acquired-MRSA (76,6%) and community-acquired-MRSA (23,4%). The majority of the patients included in the study were neonates (57%). Hyaline membrane syndrome, bronchopulmonary dysplasia, meconium aspiration syndrome, prematurity, long-term hospitalization and use of invasive devices were associated with MRSA bloodstream infections in neonates. PCR amplification and sequencing showed that mecA and femA genes were responsible for resistance to methicllin. Molecular analysis of SCCmec revealed that SCCmectype IV was the most prevalent. Most pvl-positive strains were identified as hospital-acquired Staphylococcus aureus (HA-MRSA), indicating bacterial diversification between HA-MRSA and acquired in the community (CA-MRSA) lineages. Conclusion: this study showed that infected/colonized patients represent reservoirs for horizontal transmission, thus infection control measures are needed to prevent the spread of multidrug resistant strains (MDR) strains in healthcare institutions.

Submitted by Anelvira de Oliveira Florentino (anelvira.florentino@unesp.br) on 2018-08-23T13:19:26Z No. of bitstreams: 1 Anelvira-final.pdf: 3329250 bytes, checksum: 0f2bb9b8ef3e84b8de4ac453a7e8b28a (MD5) Approved for entry into archive by Sulamita Selma C Colnago null (sulamita@btu.unesp.br) on 2018-08-23T17:13:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 florentino_ao_me_bot.pdf: 3329250 bytes, checksum: 0f2bb9b8ef3e84b8de4ac453a7e8b28a (MD5) Made available in DSpace on 2018-08-23T17:13:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 florentino_ao_me_bot.pdf: 3329250 bytes, checksum: 0f2bb9b8ef3e84b8de4ac453a7e8b28a (MD5) Previous issue date: 2018-07-31 INTRODUÇÃO: O Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) é um importante patógeno envolvido nas infecções hospitalares, apresentando elevados índices de morbimortalidade. O aumento e a gravidade dos casos, tem gerado diversos estudos abordando sua epidemiologia em instituições de longa permanência para idoso (ILPI). Diante disso, torna-se necessário conhecer a realidade do perfil de sensibilidade antimicrobiana das cepas de S.aureus. OBJETIVO: Analisar a colonização nasal por MRSA; identificar os principais fatores associados para o desenvolvimento de MRSA; enfatizar a importância de ações de educação em saúde que resultem em minimização de infecções. MATERIAIS E MÉTODOS: Foi realizada uma pesquisa descritiva, transversal e de campo com abordagem quantitativa. O estudo foi desenvolvido em uma instituição de longa permanência, localizada na cidade de Botucatu no interior de São Paulo. A coleta de swab nasal foi realizada em dois períodos: março e junho/17 e enviada para o laboratório de microbiologia. A coleta ocorreu em dois períodos, avaliando se os casos positivos permaneceriam ou diminuiriam, devido alteração no período sazonal. RESULTADOS: Os resultados mostraram que dos 55 coletados, cinco deram positivo para MRSA. Desses cinco, quatro ficaram internados com uso de sondas e antibióticos. Portanto, 80% que adquiriu a bactéria, estiveram internados; 20% passou por atendimento hospitalar e internação. A chance de não ter bactéria entre os coletados foi de 9,989, e a chance de ter a bactéria é de 0,098. Assim, a chance de quem foi internado é de 16 vezes maior de adquirir a bactéria. CONCLUSÃO: Concluiu-se que alguns fatores de risco contribuíram para carreamento do MRSA, como: idade mais avançada, hospitalizações, residência em ILPI e a variável de infecção trato urinário. INTRODUCTION: Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is an important pathogen involved in hospital infections, presenting high morbidity and mortality rates. The increase and severity of the cases has generated several studies addressing its epidemiology in long-term institutions (ILL). Therefore, it is necessary to know the reality of the antimicrobial susceptibility profile of MRSA strains. OBJECTIVE: To analyze MRSA colonization by its resistance to methicillin; identify the key factors associated with the development of MRSA; emphasize the importance of health education actions that result in the minimization of infections. MATERIALS AND METHODS: A descriptive, cross - sectional and field research with a quantitative approach was carried out. The study was developed in a long-term institution, located in the city of Botucatu in the interior of São Paulo. Nasal swab collection was performed in two periods: March and June / 17 and sent to the microbiology laboratory. The collection took place in two periods, evaluating if the positive cases would remain or would decrease, due to alteration in the seasonal period. RESULTS: The results showed that of the 55 collected, five tested positive for MRSA. Of these five, four were hospitalized with probes and antibiotics. Therefore, 80% who acquired the bacterium were hospitalized; 20% went through hospital care and hospitalization. The chance of not having bacteria among those collected was 9,989, and the chance of having the bacterium is 0.098. Thus, the chance of the hospitalized is 16 times greater to acquire the bacterium. CONCLUSION: It was concluded that some risk factors contributed to the onset of MRSA, such as: older age, hospitalizations, residence in ILPI and the urinary tract infection variable.

Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-07T15:13:20Z No. of bitstreams: 1 Leonardo Ribeiro Bastos Tese completa.pdf: 3423898 bytes, checksum: 605589863e206fcd0020c6655bab8fac (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-07T15:13:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leonardo Ribeiro Bastos Tese completa.pdf: 3423898 bytes, checksum: 605589863e206fcd0020c6655bab8fac (MD5) Previous issue date: 2018-07-11 Surgical site infection is the most common cause of health-care-associated infections, and preoperative bacterial colonization can increase its incidence. We evaluated preoperative nasal, cutaneous and intestinal colonization by Staphylococcus aureus and cephalosporin non-susceptible bacteria, in 63 patients with proximal femoral fracture. All patients were followed up for 12 months, looking for signs of surgical site infections. The median time of pre-treatment hospitalization was 12 days. Screening samples were collected on the nostrils, groin skin and anal mucosa. The antibiotic susceptibility profile was obtained by the disc-diffusion technique, and in a methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) infection, the sample obtained from the surgical wound was subjected to whole genome sequencing. The incidence of hospital colonization and the prevalence of positive results were 14.3% and 44.4% for S. aureus; 3.2% and 6.4% for MRSA; 28.6% and 85.7% for methicillin-resistant coagulase-negative Staphylococcus (MRCoNS); 28.6% and 61.9% for cefazolin non-susceptible Enterobacteriaceae (KFNSE); and 20.6% and 28.6% for cefuroxime non-susceptible Enterobacteriaceae (CXNSE). All MRSA strains were positive for Staphylococcal cassete chromosome mec (SCCmec) type IV and negative for the Panton-Valentine leukocidin (PVL) gene. In addition to the duration of the pre-treatment hospitalization period, the main risk factor related to hospital colonization by S. aureus was to be non-walker ; whereas by MRCoNS it was the surgical risk classified as ASA 4; for CXNSE were surgical risk classified as ASA 4 and prior hospitalization history; and by extended-spectrum beta-lactamase-producing enterobacteria (ESBL) it was pre-treatment hospitalization in an intensive care unit. At the time of fracture treatment, the risk of S. aureus colonization was higher in non-walkers patients; whereas by MRCoNS and CXNSE it was higher in those who had previously used antimicrobial and surgical risk classified as ASA 4. The prevalence of patients colonized by KFNSE was three times higher than that colonized by CXMNSE in the admission, and twice as high at the time of fracture treatment. Three patients had surgical wound infection, one by MRSA, one by MRCoNS and one caused by Enterobacter cloacae. The MRSA sample had previously been isolated in the preoperative screening and belongs to ST2594. The observed low virulence can be attributed to the absence of the enterotoxins tst, seC and seL genes, associated with a deletion on the clfA gene. These data can help to indicate prophylactic measures such as decolonization, elevated risk groups identification and choice of the antibiotics used in surgical prophylaxis; as well as contribute to the genetic knowledge of a MRSA strain. As infecções do sítio cirúrgico são as principais infecções associadas ao tratamento de saúde e a colonização bacteriana pré-operatória pode aumentar a sua incidência. Neste trabalho foram analisadas as colonizações pré-operatórias, nasal, cutânea e retal, por Staphylococcus aureus e bactérias não-sensíveis às cefalosporinas, em 63 pacientes internados para o tratamento de fratura do terço proximal do fêmur, ao longo de um ano. Os pacientes foram acompanhados por 12 meses buscando-se a ocorrência de infecção do sítio cirúrgico (ISC). O tratamento da fratura do fêmur ocorreu em até 12 dias em metade dos pacientes. O perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi obtido utilizando-se a técnica de disco-difusão em ágar, e em um caso de ISC por S. aureus resistente à meticilina (MRSA), a amostra obtida da ferida operatória foi submetida a sequenciamento e análise do genoma total. A incidência de colonização hospitalar e a prevalência de resultados positivos foi de 14,3% e 44,4% para S. aureus, 3,2% e 6,4% para MRSA, 28,6% e 85,7% para Staphylococcus spp. coagulase negativos resistentes à meticilina (MRCoNS), 28,6% e 61,9% para Enterobacteriaceae não-sensível à cefazolina (KFNSE) e 20,6% e 28,6% para Enterobacteriaceae não-sensível à cefuroxima (CXNSE). Todas as amostras de MRSA apresentaram produto de amplificação da PCR compatível com o Staphylococcal cassete chromosome mec (SCCmec) do tipo IV e foram negativas para o gene relacionado à produção de leucocidina Panton-Valentine (PVL). Maior tempo de internação prévio ao tratamento da fratura e não-deambular previamente foram os principais fatores relacionados à colonização hospitalar por S. aureus; enquanto por MRCoNS foi ter o risco cirúrgico classificado de acordo com o American Society of Anesthesiologists physical status score (ASA) como ASA 4; por CXNSE foram risco cirúrgico ASA 4 e histórico de internação nos últimos 12 meses prévios à ocorrência da fratura; e por enterobactéria produtora de beta-lactamase de espectro estendido (ESBL) foi a internação prévia em unidade de terapia intensiva. No momento do tratamento da fratura, o risco de estar colonizado por S. aureus foi maior nos pacientes que não deambulavam previamente à ocorrência da fratura; enquanto por MRCoNS e CXNSE foi maior nos que fizeram uso prévio de antimicrobianos e com risco cirúrgico ASA 4. A prevalência de pacientes colonizados por KFNSE foi três vezes maior que a de colonizados por CXNSE na admissão e duas vezes no momento do tratamento da fratura. Três pacientes apresentaram ISC, um por MRSA, um por MRCoNS e um por Enterobacter cloacae. A amostra de MRSA isolada do caso de ISC havia sido previamente isolada no rastreamento pré-operatório, e pertence ao ST2594. A baixa virulência observada pode ser atribuída a ausência dos genes produtores de enterotoxinas, tst, seC e seL, associados a uma deleção do gene clfA. Os dados observados podem auxiliar na indicação de medidas profiláticas como descolonização, identificação de grupos de risco e escolha dos antimicrobianos utilizados na profilaxia operatória, além de auxiliarem no conhecimento genético de uma cepa de MRSA.

Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-05T19:37:38Z No. of bitstreams: 1 TESE_FINAL_PUBLICADA_Julio_Cesar_Delgado_Correal.pdf: 12723636 bytes, checksum: fe778caea2c6789c63048fdd26df5d89 (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-05T19:37:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_FINAL_PUBLICADA_Julio_Cesar_Delgado_Correal.pdf: 12723636 bytes, checksum: fe778caea2c6789c63048fdd26df5d89 (MD5) Previous issue date: 2018-01-15 Severe infections due to methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) significantly increase morbidity and mortality in patients, with an impact on healthcare-associated costs. Knowing the prevalence and expression of virulence factors such as Panton-Valentine leukocidin (PVL) of these microorganisms may allow for future interventions that reduce mortality and sequelae of patients with potentially lethal infections; To evaluate the prevalence and virulence of PVL in samples of S. aureus isolated from severely ill patient attended in hospitals in the city of Rio de Janeiro and to verify the association of these factors with clinical characteristics, therapeutic responses, and clinical outcomes. Using a database of the microbiology laboratory, pharmacy and hospital infection control commissions of hospitals of Rio de Janeiro city, were done a prospective study of infections caused by MRSA strains. In the evaluation of susceptibility to antimicrobials used in severe MRSA infections (vancomycin, teicoplanin, daptomycin and linezolid), the minimum inhibitory concentrations (MIC) of the samples were determined by different methodologies (agar diffusion, microdilution and concentration gradient). In addition, genotypic analyzes were performed to determine clonal complexes and latex agglutination tests to quantify the production of the PVL toxin. In total, we selected 51 MRSA samples with profiles susceptible to non-beta-lactam antibiotics. Approximately half of the patients with MRSA infection were young (0-14 years, 47%) and male predominated (58.8%). Infectious diseases were mostly skin and soft tissue infections (33.9%). No resistance to linezolid, daptomycin or teicoplanin was detected, and none of the samples showed vancomycin heteroresistance (MIC less than 1 μg / dL). Most of the strains corresponded to SCCmec types IV (80.3%) and the prevalence of the PVL toxin was high among these samples (68.8%). PVL(-) strains were most frequently associated with SCCmec type II (40%). PVL(+) samples showed high toxin production in almost half of these samples (52.7%) and 36.1% of the isolates expressed very high titers in latex agglutination. MRSA with profiles susceptible to non-beta-lactam antibiotics circulating in Rio de Janeiro have high production of PVL toxin. Approximately half of the analyzed samples presented overproduction of this toxin and one third of them with characteristic of hyperproduction of the same one. As infecções graves por Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) aumentam de forma importante a morbidade e a mortalidade dos pacientes, com impacto também nos custos associados ao atendimento. Conhecer a prevalência e expressão de fatores de virulência tais como a leucocidina de Panton-Valentine (PVL) destes microrganismos pode permitir intervenções futuras que diminuam a mortalidade e as sequelas dos pacientes que apresentam infecções potencialmente letais. Avaliar a prevalência e a virulência da PVL em amostras de S. aureus isolados nos pacientes graves assistidos em hospitais da cidade de Rio de Janeiro e verificar a associação desses fatores com as características clínicas, as respostas terapêuticas, e os desfechos clínicos dos pacientes. Usando informações das bases de dados do laboratório de microbiologia, da farmácia e das comissões de controle da infecção hospitalar de hospitais da cidade de Rio de Janeiro foi realizado um estudo prospectivo das infecções causadas por cepas de MRSA. Na avaliacão da susceptibilidade aos antimicrobianos usados em infecções graves por MRSA (vancomicina, teicoplanina, daptomicina e linezolida), foram determinadas as concentrações inibitórias mínimas (CIM) das amostras por diferentes metodologias (testes de difusão em agar, microdiluicao e fita de gradiente de concentração). Adicionalmente foram realizadas análises genotípicas para determinar complexos clonais e testes de aglutinação em látex para avaliar a expressão da toxina PVL. No total, selecionamos 51 amostras de MRSA com perfis suscetíveis a antimicrobianos não betalactâmicos. Aproximadamente metade dos pacientes com infecção por MRSA eram jovens (0-14 anos, 47%) e sexo masculino predominava (58,8%). As doenças infecciosas foram na maioria infecções de pele e partes moles (33,9%). Não foi detectada resistência a linezolida, daptomicina ou teicoplanina e nenhuma das amostras apresentou heterorresistência à vancomicina (MIC menor a 1 μg/dL). A maioria das cepas foram correspondentes aos SCCmec tipos IV (80,3%) e a prevalência da toxina de PVL foi alta entre estas amostras (68,8%). As cepas PVL(-) eram mais frequentemente associadas ao SCCmec tipo II (40%). Amostras PVL(+) mostraram uma produção inesperadamente alta de toxina em quase metade dessas amostras (52,7%) e 36,1% dos isolados expressaram títulos muito altos na aglutinação em látex. MRSA com perfis suscetíveis a antimicrobianos não beta-lactâmicos circulando no Rio de Janeiro, apresentam alta produção de toxina PVL. Aproximadamente metade das amostras analisadas apresentou alta produção desta toxina e um terço delas com característica de hiperprodução da mesma.

Resumen Desde el inicio de la era antimicrobiana se han ido seleccionando gradualmente cepas de Staphylococcus aureus resistentes a antimicrobianos de amplio uso clínico. Es así como en 1960 se describen en Inglaterra las primeras cepas resistentes a meticilina, y algunos años después son informadas en hospitales de Chile. Actualmente, S. aureus resistente a penicilinas antiestafilocóccicas es endémico en los hospitales de nuestro país y del mundo, siendo responsable de una alta morbimortalidad. La resistencia es mediada habitualmente por la síntesis de una nueva transpeptidasa, denominada PBP2a o PBP2’ que posee menos afinidad por el β-lactámico, y es la que mantiene la síntesis de peptidoglicano en presencia del antimicrobiano. Esta nueva enzima se encuentra codificada en el gen mecA, a su vez inserto en un cassette cromosomal con estructura de isla genómica, de los cuales existen varios tipos y subtipos. La resistencia a meticilina se encuentra regulada, principalmente, por un mecanismo de inducción de la expresión del gen en presencia del β-lactámico, a través de un receptor de membrana y un represor de la expresión. Si bien se han descrito mecanismos generadores de resistencia a meticilina mec independientes, son categóricamente menos frecuentes.

Resumen Desde el inicio de la era antimicrobiana se han ido seleccionando gradualmente cepas de Staphylococcus aureus resistentes a antimicrobianos de amplio uso clínico. Es así como en 1960 se describen en Inglaterra las primeras cepas resistentes a meticilina, y algunos años después son informadas en hospitales de Chile. Actualmente, S. aureus resistente a penicilinas antiestafilocóccicas es endémico en los hospitales de nuestro país y del mundo, siendo responsable de una alta morbimortalidad. La resistencia es mediada habitualmente por la síntesis de una nueva transpeptidasa, denominada PBP2a o PBP2’ que posee menos afinidad por el β-lactámico, y es la que mantiene la síntesis de peptidoglicano en presencia del antimicrobiano. Esta nueva enzima se encuentra codificada en el gen mecA, a su vez inserto en un cassette cromosomal con estructura de isla genómica, de los cuales existen varios tipos y subtipos. La resistencia a meticilina se encuentra regulada, principalmente, por un mecanismo de inducción de la expresión del gen en presencia del β-lactámico, a través de un receptor de membrana y un represor de la expresión. Si bien se han descrito mecanismos generadores de resistencia a meticilina mec independientes, son categóricamente menos frecuentes. Staphylococcus aureus isolates resistant to several antimicrobials have been gradually emerged since the beginning of the antibiotic era. Consequently, the first isolation of methicillin-resistant S. aureus occurred in 1960, which was described a few years later in Chile. Currently, S. aureus resistant to antistaphylococcal penicillins is endemic in Chilean hospitals and worldwide, being responsible for a high burden of morbidity and mortality. This resistance is mediated by the expression of a new transpeptidase, named PBP2a or PBP2’, which possesses lower affinity for the β-lactam antibiotics, allowing the synthesis of peptidoglycan even in presence of these antimicrobial agents. This new enzyme is encoded by the mecA gene, itself embedded in a chromosomal cassette displaying a genomic island structure, of which there are several types and subtypes. Methicillin resistance is mainly regulated by an induction mechanism activated in the presence of β-lactams, through a membrane receptor and a repressor of the gene expression. Although mec-independent methicillin resistance mechanisms have been described, they are clearly infrequent.

Objective: to identify the carrier’s state and the susceptibility profile of Staphylococcus aureus isolated from saliva and nasal secretion of nursing professionals to antibiotics. Method: cross-sectional study that used saliva and nasal secretion samples of 100 nursing professionals who provide care for patients with HIV/Aids. Results: forty-three percent of the participants presented positive saliva or nasal secretion samples for Staphylococcus aureus. Of the 74 nasal secretion samples with Staphylococcus aureus, 14.9% presented oxacillin resistance; 91.9% presented penicillin resistance; 44.6% presented erythromycin resistance, and 41.9% presented clindamycin resistance. Of the 12 positive saliva samples, 16.7% presented oxacillin resistance; 100.0% presented penicillin resistance; 33.4% presented erythromycin resistance, and 25.0% presented clindamycin resistance. Conclusion: nursing professionals, once aware of their carrier state of multi-resistant microorganisms, will supervise their care practices and more efficiently adopt measures for prevention and control of the epidemiological chain of these bacteria in their work environment. RESUMEN Objetivo: identificar el estado del cargador y el perfil de susceptibilidad a los antibióticos de los Staphylococcus aureus aislados de la saliva y de la secreción nasal de los profesionales de enfermería. Método: estudio transversal, que utilizó muestras de saliva y secreción nasal, obtenidas de 100 profesionales de enfermería que asisten a personas con VIH/SIDA. Resultados: se identificó que 43,0% de los participantes presentaron muestras de saliva y/o secreción nasal positiva por Staphylococcus aureus. De las 74 muestras de secreción nasal con Staphylococcus aureus, 14,9% presentaron resistencia a la oxacilina; 91,9% a la penicilina; 44,6% a la eritromicina y 41,9% a la clindamicina. De las 12 muestras de saliva positivas, 16,7% fueron resistentes a la oxacilina; 100% a la penicilina; 33,4% a la eritromicina y 25,0% a la clindamicina. Conclusión: se cree que el profesional al obtener conocimiento de su estado de portador del microorganismos multi-resistentes, pasará a supervisar sus prácticas asistenciales y adoptar con mayor eficacia las medidas para la prevención y el control de la cadena epidemiológica de estas bacterias en el ambiente laboral. RESUMO Objetivo: identificar o estado de carreador e o perfil de suscetibilidade aos antibióticos dos Staphylococcus aureus isolados da saliva e da secreção nasal dos profissionais de enfermagem. Método: estudo transversal, que utilizou amostras de saliva e secreção nasal, obtidas de 100 profissionais de enfermagem que assistem pessoas com HIV/aids. Resultados: identificou-se que 43,0% dos participantes apresentaram amostras de saliva e/ou de secreção nasal positivas para Staphylococcus aureus. Das 74 amostras de secreção nasal com Staphylococcus aureus, 14,9% apresentaram resistência à oxacilina; 91,9% à penicilina; 44,6% à eritromicina e 41,9% à clindamicina. Das 12 amostras de saliva positivas, 16,7% foram resistentes à oxacilina; 100,0% à penicilina; 33,4% à eritromicina e 25,0% à clindamicina. Conclusão: o profissional ao obter conhecimento de seu estado de carreador de microrganismos multirresistentes, passará a supervisionar suas práticas assistenciais e adotar com mais eficiência as medidas para a prevenção e o controle da cadeia epidemiológica dessas bactérias no ambiente laboral.

A pesquisa de Staphylococcus spp. coagulase negativa (CNS) em alimentos não é prevista na legislação, entretanto, estas bactérias têm emergido como patógenos oportunistas e sua capacidade enterotoxigênica já foi documentada. O queijo destaca-se entre os principais derivados lácteos associados a intoxicações alimentares e a presença de cepas enterotoxigênicas do gênero Staphylococcus neste alimento representa um risco ao consumidor. O queijo colonial, tradicionalmente consumido pelos gaúchos, não possui regulamento técnico específico e poucos são os estudos relacionados ao risco do consumo desse alimento, bem como, à identificação de micro-organismos presentes nessa matriz. Sendo assim, os objetivos do presente estudo foram: (i) identificar as espécies de Staphylococcus spp. coagulase negativa, presentes em queijo colonial inspecionado; (ii) pesquisar a presença de genes codificadores de enterotoxinas clássicas (SE), bem como de resistência à penicilina e à meticilina nas cepas isoladas desta matriz. Para tanto, no período de novembro de 2014 a maio de 2015, foram analisadas 205 amostras de queijos coloniais inspecionados, sendo 121 adquiridas em Feiras Modelo e 84 em bancas do Mercado Público de Porto Alegre, compreendendo 17 marcas distintas. O isolamento inicial de Staphylococcus spp. foi realizado de acordo com o protocolo ISO 6888-1:1999, adicionado da triagem fenotípica para CNS. A identificação genotípica dos isolados foi realizada pela amplificação da região V1-V2 do gene 16S rRNA, seguida de sequenciamento e comparação das sequências obtidas no GenBank. A pesquisa de genes de enterotoxinas clássicas foi realizada por amplificação dos genes sea, seb, sec, sed e see. A determinação de resistência à penicilina foi avaliada a partir da amplificação do gene blaZ. Para resistência à meticilina, foi realizado teste de triagem frente à cefoxitina, e confirmação pela pesquisa do gene mecA. O armazenamento sob refrigeração foi observado em quase 90% das amostras coletadas. Entre as 179 colônias retiradas do ágar Baird-Parker, 59 apresentaram-se fenotipicamente compatíveis com CNS e foram identificadas genotipicamente. Treze espécies foram identificadas, sendo Macrococcus caseolyticus (40%) a mais frequente. Das 35 cepas confirmadas como CNS, S. equorum e S. vitulinus foram as espécies predominantes seguidas de S. hyicus, S. saprophyticus e S. epidermidis. O gene blaZ foi detectado em cinco cepas de CNS e em uma cepa de M. caseolyticus, sendo relativamente mais frequente em S. hyicus e S. epidermidis. O gene mecA não foi detectado. Oito cepas de CNS amplificaram algum gene para SE, sendo seb o mais frequente, seguido por sed, sea e see. O gene para enterotoxina C não foi detectado. Onze cepas apresentaram pelo menos um dos genes investigados, das quais, seis cepas apresentaram genes para SE e blaZ, concomitantemente. Os perfis seb/blaZ (n=4) e blaZ (n=3) foram os mais frequentes. Foi possível confirmar a diversidade de Staphylococcus spp. coagulase negativa em queijos coloniais inspecionados, além da baixa frequência de cepas carreadoras de genes para enterotoxinas clássicas e resistência à penicilina e à meticilina. The investigation of coagulase-negative Staphylococcus spp. (CNS) is not included in food monitoring; although these bacteria have emerged as significant opportunistic pathogens and their toxigenic capacity has been documented. Among the dairy products, cheese features as one of the most involved in food poisoning outbreaks. The presence of enterotoxigenic strains of Staphylococcus in this food therefore represents a hazard for the consumers. Colonial cheese, which is a traditionally consumed cheese type in Rio Grande do Sul, does not have a specific technical regulation, and there are few studies targeting the risk for consumers, or aiming to identify its typical microbiota. Thus, the objectives of this study were: (i) to identify coagulase-negative Staphylococcus spp. species in inspected colonial cheese (ii) to investigate the presence of genes encoding classical enterotoxins (SE), and resistance to penicillin and methicillin in strains obtained from this food. For this purpose, from November 2014 to May 2015, 205 cheese samples were analyzed, 121 of which were acquired in street fairs and 84 in Central Market. The samples belonged to 17 different brands. The isolation of Staphylococcus spp. was performed according to the ISO 6888-1: 1999 protocol, followed by the phenotypic screening of CNS. The genotype identification of the isolates was performed by amplification of the V1-V2 region of the 16S rRNA gene, followed by sequencing and the sequences comparison with the GenBank database. Classical enterotoxin genes were investigated by amplification of sea, seb, sec, sed and see genes. The determination of penicillin resistance was evaluated by the amplification of blaZ gene. For methicillin resistance, a screening test with cefoxitin was conducted followed by confirmation through the mecA amplification. The majority (89,7%) of the collected samples were stored under refrigeration. Among the 179 atypical colonies obtained from Baird-Parker agar, 59 were phenotypically compatible with CNS and were further subjected to genotyping. Thirteen bacterial species were identified, being Macrococcus caseolyticus the most frequent (40%). Thirty-five strains were confirmed as CNS, being S. equorum and S. vitulinus the most prevalent followed by S. hyicus, S. saprophyticus and S. epidermidis. The gene blaZ was detected in five strains of CNS and in one strain of M. caseolyticus, being relatively more frequent in S. hyicus and S. warneri. The mecA gene was not detected. Eight CNS strains amplified SE gene: SEB was the most frequent, followed by SED, SEA and SEE. There was no enterotoxin C gene detected. Eleven strains carried at least one of the genes investigated; six strains presented genes for SE and blaZ, concomitantly. The profiles SEB/blaZ (n = 4) and blaZ (n = 3) were the most frequent. The diversity of CNS in inspected colonial cheeses was confirmed. In addition, the low frequency of strains carrying genes for enterotoxins and resistance to penicillin and methicillin was observed.

Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-07T15:13:21Z No. of bitstreams: 1 TESE_FINAL_PUBLICADA_Danielle_Ferreira_Lima.pdf: 2647159 bytes, checksum: 1a058429b3a8b232fa912eb690716e78 (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-07T15:13:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_FINAL_PUBLICADA_Danielle_Ferreira_Lima.pdf: 2647159 bytes, checksum: 1a058429b3a8b232fa912eb690716e78 (MD5) Previous issue date: 2016-12-15 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is an important pulmonary pathogen in cystic fibrosis (CF) patients and it has been highlighted for its prevalence and capacity to affect pulmonary functions which is known to be the main cause of death in these patients. The presence of the mobile genetic element SCCmec, harboring the mecA gene leads to a greater problem compromising treatment in these patients. The clonal profiles of isolates isolated from chronic MRSA patients have been poorly studied. This study aimed to evaluate the clonal relationship between MRSA isolated from pediatric patients with CF showing pulmonary chronic infection. A total of 116 MRSA isolates from 12 patients were submitted to the disk diffusion test for ten antibiotic discs and the inducible MLSB phenotype was also evaluated. Genotypic tests included: Pulsed Field Gel Electrophoresis, to assess clonality; Polymerase Chain Reaction to evaluate the type of SCCmec and detection lukS gene, to verify the presence of the Panton-Valentine Leukocidin toxin, in which the latter two assays would aid in the characterization of the clones. Bacterial Isolates had resistance rates below 50%, with the exception for erythromycin (78.4%) and ciprofloxacin (50%). Resistance rates were, as follows, clindamycin (33.6%), rifampicin (25%), gentamicin (19%), chloramphenicol (19%), tetracycline (12.9%), sulfamethoxazole - trimethoprim (12%) and there was no resistance to linezolid. The iMLSB phenotype was observed in 15 isolates in three patients. Multiresistant strains were identified in 37.1% (n=43) of the isolates, however, this profile was predominant in only three patients (1, 5 and 8) with the following representations 16/16 (100%), 15/20 (75%) and 8/9 (88.9%), respectively. Genotypic heterogeneity among patients and in isolates from the same patient were and the most prevalent clonal groups were A and FF, with 9.5% (n=11) each; EE with 7.8% (n=9); X with 6.9% (n=8) and CC with 6% (n=7). The SCCmec: II, III and IV shown 15.5% (n=18), 12.1% (n=14) and 71.5% (n=83), respectively. The lukS gene was present in 8.6% (n=10) of the isolates distributed in only four patients and were all correlated with SCCmec type IV. An association analysis between PFGE, resistance profile, SCCmec and lukS gene allowed us to observe that those clones, although heterogeneous, they had the same SCCmec, lukS gene (presence or absence) and resistance profiles (very similar and when different by only one or two antimicrobial drugs). A large clonal heterogeneity was observed between MRSA strains isolated from CF patients presenting chronic infection altough other molecular tests may help to elucidate the evolutionary clonal relationship between these strains. Staphylococcus aureus resistentes à meticilina (MRSA) é um importante patógeno pulmonar em pacientes com fibrose cística (FC), e vem se destacando pela prevalência e capacidade de comprometer a função pulmonar, sendo esta última uma das principais causas de óbitos nesses pacientes. A presença do elemento genético móvel SCCmec, que alberga o gene mecA, o torna um problema, dificultando o tratamento entre os pacientes. O perfil clonal das amostras de pacientes crônicos para MRSA tem sido pouco estudado. Esse trabalho teve como objetivo avaliar a relação clonal entre MRSA isolados de pacientes pediátricos com FC apresentando infecção crônica. Um total de 116 amostras, de 12 pacientes, no período de 2013 a 2016, foi submetido ao teste do disco de difusão para dez antimicrobianos e o fenótipo de resistência induzida (iMLSB) também foi avaliado. Os testes genotípicos incluíram a Eletroforese em Gel de Campo Pulsado para avaliar a clonalidade, Reação em Cadeia da Polimerase para avaliar o tipo de SCCmec e a detecção do gene lukS para verificar a presença da toxina Panton-Valentine Leukocidin, que auxiliariam na caracterização dos clones. Com exceção de eritromicina (78,4%) e ciprofloxacina (50%), os antimicrobianos apresentaram um percentual de resistência abaixo de 50%, como por exemplo, clindamicina (33,6%), rifampicina (25%), gentamicina (19%), cloranfenicol (19%), tetraciclina (12,9%), sulfametoxazol-trimetoprim (12%) e nenhuma amostra foi resistente a linezolida. O fenótipo iMLSB foi observado em 15 amostras em três pacientes. Cepas multirresistentes foram identificadas em 37,1% (n=43) da amostragem, entretanto, este perfil foi predominante em apenas três pacientes (1, 5 e 8) com as seguintes representações 16/16 (100%), 15/20 (75%) e 8/9 (88,9%), respectivamente. Heterogeneidades genotípicas entre os pacientes e nas amostras do mesmo paciente foram notadas e os grupos clonais prevalentes foram A e FF com 9,5% (n=11) cada um, EE 7,8% (n=9), X 6,9% (n=8) e CC 6% (n=7). Os SCCmec: II, III e IV foram encontrados com as respectivas porcentagens 15,5% (n=18), 12,1% (n=14) e 71,5% (n=83). O gene lukS estava presente em 8,6% (n=10) das amostras distribuído em apenas quatro pacientes e todos estavam correlacionados ao SCCmec tipo IV. A partir de uma análise associativa entre o PFGE, perfil de resistência, SCCmec e gene lukS foi possível observar que os clones apesar de heterogêneos apresentavam o mesmos SCCmec, gene lukS (presença ou ausência) e perfil de resistência (muito semelhante e quando diferia era por um ou dois antimicrobianos). Concluímos que uma grande heterogeneidade clonal foi observada entre MRSA isoladas de pacientes com FC apresentando infecção crônica e que outros testes moleculares podem ajudar a elucidar a relação clonal evolutiva entre essas cepas.

Introducción: La resistencia bacteriana constituye un tema de preocupación para la salud pública mundial. Últimamente han aumentado los reportes de resistencia a antimicrobianos, incluida meticilina, en cepas de Staphylococcus coagulasa positiva (SCP) aisladas desde mascotas. Sin embargo, en Chile esta información es escasa. Objetivos: Determinar el perfil de susceptibilidad antimicrobiana y detectar el gen mecA en cepas de SCP aisladas desde gatos en Chile. Materiales y Métodos: Se obtuvieron 134 muestras desde gatos sanos y con lesiones dermatológicas. Las cepas fueron caracterizadas en su producción de coagulasa e identificadas mediante kit BBL Crystal. La susceptibilidad antimicrobiana se determinó mediante el método de Kirby Bauer ante 12 antimicrobianos, incluida oxacilina. Todas las cepas fueron sometidas a RPC para la detección del gen mecA. Resultados: 72 cepas de SCP fueron aisladas, incluyendo S. aureus y S. intermedius. Se detectó resistencia antimicrobiana a al menos un antimicrobiano en cepas de gatos sanos (75%) y de gatos con lesiones cutáneas (87,5%). El gen mecA fue detectado en ocho cepas resistentes a meticilina y en tres cepas sensibles, siendo en general multi-resistentes. Discusión: Estos resultados destacan el rol de las mascotas como reservorios de resistencia bacteriana y su potencial impacto en la salud pública.

Introducción: La resistencia bacteriana constituye un tema de preocupación para la salud pública mundial. Últimamente han aumentado los reportes de resistencia a antimicrobianos, incluida meticilina, en cepas de Staphylococcus coagulasa positiva (SCP) aisladas desde mascotas. Sin embargo, en Chile esta información es escasa. Objetivos: Determinar el perfil de susceptibilidad antimicrobiana y detectar el gen mecA en cepas de SCP aisladas desde gatos en Chile. Materiales y Métodos: Se obtuvieron 134 muestras desde gatos sanos y con lesiones dermatológicas. Las cepas fueron caracterizadas en su producción de coagulasa e identificadas mediante kit BBL Crystal. La susceptibilidad antimicrobiana se determinó mediante el método de Kirby Bauer ante 12 antimicrobianos, incluida oxacilina. Todas las cepas fueron sometidas a RPC para la detección del gen mecA. Resultados: 72 cepas de SCP fueron aisladas, incluyendo S. aureus y S. intermedius. Se detectó resistencia antimicrobiana a al menos un antimicrobiano en cepas de gatos sanos (75%) y de gatos con lesiones cutáneas (87,5%). El gen mecA fue detectado en ocho cepas resistentes a meticilina y en tres cepas sensibles, siendo en general multi-resistentes. Discusión: Estos resultados destacan el rol de las mascotas como reservorios de resistencia bacteriana y su potencial impacto en la salud pública. Introduction: Bacterial resistance is a global concern for public health. Reports of antimicrobial resistance, including that against methicillin, have increased in strains of coagulase positive Staphylococcus (CPS) isolated from pets, however in Chile this information is limited. Objectives: To determine the antimicrobial susceptibility profiles and to detect the mecA gene in CPS strains isolated from cats in Chile. Materials and Methods : 134 samples were obtained from healthy cats and cats with skin lesions. These strains were characterized in their coagulase production and identified by BBL Crystal kit. The antimicrobial susceptibility was determined by Kirby Bauer method against 12 antimicrobials, including oxacillin. All strains were subjected to PCR to detect the mecA gene. Results: 72 CPS strains were isolated, including S. aureus and S. intermedius. Antimicrobial resistance against at least one drug was detected in strains from both healthy cats (75%) and from cats with skin lesions (87.5%). The mecA gene was detected in eight methicillin-resistant strains and also in three sensitive strains, being in general multi-resistant. Discussion: These results highlight the role of pets as reservoirs of bacterial resistance, and their potential impact on national public health.

The objectives were to determine the prevalence of workers colonized by Staphylococcus sp., to identify colonization predictors and, to assess their susceptibility to antimicrobials. A questionnaire was applied and saliva was collected in 130 workers from support areas of an oncology institution. Microbiological analysis was conducted following standard procedures. The prevalence of workers colonized by Staphylococcus sp. was 37.7%, and the isolated majority was Staphylococcus coagulase-negative. Resistance to methicillin was detected in 35.1% of Staphylococcus coagulase-negative, being 12 epidermidis and one S. haemolyticus. From those. 92.3% had the mecA. gene. All S. aureus were sensitive to methicillin. Working shift and sector were identified as predictors for colonization. The colonization in workers from support areas assisting oncology patients indicates that workers should be target of occupational health policies, and it should include pre- and post-colonization measures in investigations/discussions of future studies aiming at worker and patient safety. Objetivou-se determinar a prevalência de trabalhadores colonizados por Staphylococcus sp., identificar preditores à colonização e avaliar a suscetibilidade aos antimicrobianos dos isolados. Realizou-se aplicação de questionário e coleta de saliva de 130 trabalhadores de áreas de apoio de uma instituição oncológica. Análise microbiológica foi realizada segundo procedimentos padronizados. A prevalência de trabalhadores colonizados por Staphylococcus sp. foi 37,7%, sendo a maioria dos isolados Staphylococcus coagulase-negative. Resistência à meticilina foi detectada em 35,1% dos Staphylococcus coagulase-negative, sendo 12 S. epidermidis e um S. haemolyticus, destes 92,3% possuíam gene mecA. Todos S. aureus foram sensíveis à meticilina. Turno e setor de trabalho foram identificados como preditores para colonização. A colonização de trabalhadores de áreas de apoio que assistem pacientes oncológicos indica que também sejam alvos de políticas de saúde ocupacional que deveriam incluir medidas pré e pós-colonização a serem investigadas/discutidas em estudos futuros com vistas à segurança do trabalhador e do paciente.

Estudo quantitativo, exploratório e analítico realizado no período de março a junho de 2010, na Unidade de Terapia Intensiva de um hospital paranaense com o objetivo de identificar o perfil genético das amostras de Staphylococcus aureus isoladas de pacientes e membros da equipe de enfermagem. A suscetibilidade à oxacilina foi avaliada pelo teste de determinação da concentração inibitória mínima e a técnica da reação em cadeia da polimerase foi empregada para a realização da genotipagem. Algumas associações de interesse foram verificadas utilizando teste qui-quadrado, adotando-se p ≤0,05. Dentre as 61 amostras de 46 pacientes, 44,26% tiveram grau de similaridade superior a 80%; seis amostras, pareadas duas a duas, tiveram 100% de similaridade. Dentre as 20 amostras dos 13 profissionais, 65% apresentaram similaridade superior a 80%. Observou-se a existência de cepas com perfis genéticos idênticos, ou semelhantes, contudo não é possível afirmar que houve disseminação clonal nesta unidade. This quantitative, exploratory and analytical study was undertaken in the period March-June 2010, in the Intensive Care Unit of a hospital in the state of Paraná, with the objective of identifying the genetic profile of samples of Staphylococcus aureus isolated from patients and members of the nursing team. The susceptibility to oxacillin was evaluated by the test for determining the minimum inhibitory concentration, and the polymerase chain reaction technique was used for carrying out the genotyping. Some associations of interest were verified using the Chi-square test, adopting p= ≤0.05. Among the 61 samples from 46 patients, 44.26% had a degree of similarity over 80%; six samples, paired two-by-two, had 100% similarity. Among the 20 samples from the 13 health care professionals, 65% had a similarity of over 80%. The existence of strains with identical, or similar, genetic profiles was observed. However, it was not possible to state that clonal dissemination occurred in this unit. Estudio cuantitativo, exploratorio y analítico realizado en el periodo de marzo a junio de 2010, en la Unidad de Terapia Intensiva de un hospital de Paraná con el objetivo de identificar el perfil genético de muestras de Staphylococcus aureus aisladas de pacientes y miembros del equipo de Enfermería. La susceptibilidad a la oxacilina fue evaluada por el test de determinación de la concentración inhibitoria mínima y la técnica de reacción en cadena de la polimerasa fue utilizada para realizar el genotipaje. Algunas asociaciones de interés fueron verificadas utilizando test “qui-quadrado”, adoptándose p ≤0,05. De las 61 muestras de 46 pacientes, 44,26% tuvieron grado de similitud superior a 80%; seis muestras, de parejas dos a dos, tuvieron 100% de similitud. De las 20 muestras de los 13 profesionales, 65% presentaron similitud superior a 80%. Se observó la existencia de cepas con perfiles genéticos idénticos, o semejantes, pero no es posible afirmar que hubo diseminación clonal en esta unidad.

O Programa de Doutorado no Brasil com Estágio no Exterior, conhecido como Doutorado Sanduíche, visa a contribuir para intercâmbios dos cursos de Pós-Graduação no País com seus congêneres no exterior. O objetivo deste artigo foi relatar a experiência vivida durante o estágio realizado na Noruega, em unidades hospitalares, laboratórios de microbiologia, órgãos federais e serviços de saúde de Oslo e Região Metropolitana. Foram desenvolvidas atividades de vigilância epidemiológica, técnicas laboratoriais de identificação e tipagem molecular de Staphylococcus aureus e políticas públicas e institucionais de prevenção e controle dessas bactérias, quando multirresistentes. O estágio, além de subsidiar e fortalecer a análise dos dados do projeto da tese, permitiu refletir sobre a importância de políticas públicas e diretrizes definidas, e fornecer condições para ações de prevenção e controle de agravos, tendo a saúde e o bem-estar da pessoa como valores de Estado.El Programa de Doctorado en el Brasil con Prácticas en el Exterior, conocido como Doctorado Sandwich, visa contribuir a los intercambios de los cursos de Postgrado en el País con sus congéneres en el exterior. El objetivo de este artículo fue relatar la experiencia vivida durante las prácticas realizadas en Noruega, en unidades hospitalarias, laboratorios de microbiologia, órganos federales y servicios de salud de Oslo y Región Metropolitana. Se desarrollaron actividades de vigilancia epidemiológica, técnicas de laboratorio de identificación y tipaje molecular de Staphylococcus aureus y políticas públicas e institucionales de prevención y control de esas bacterias, multiresistentes. La práctica, además de ofrecer subsídios y fortalecer al análisis de los datos del proyecto de la tesis, permitió reflexionar sobre la importancia de las políticas públicas y directivas definidas, y dar las condiciones para acciones de prevención y control de agravios, teniendo a la salud y al bienestar de la persona como valores de Estado.The Doctoral Program in Brazil, with the Internship Abroad known as the Sandwich Ph.D., aims to contribute to exchanges of graduate courses in the country with counterparts abroad. The objective of this article was to report the lived experience during an internship in Norway, in hospital units, microbiology laboratories, federal agencies and health services in Oslo and the metropolitan region. Activities were developed for epidemiological surveillance, laboratory techniques for identification and molecular typing of Staphylococcus aureus, and public and institutional policies for prevention and control of these bacteria, when multiresistant. The Sandwich stage in addition to supporting and strengthening the analysis of project data of the thesis, permitted the reflection on the importance of established public policies and guidelines, and conditions provided for prevention and control of diseases, and health and welfare of the person as values of the state.