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Figure S1. Origin of the 107 German carbapenemase-producing K. pneumoniae isolates. Regions are shown, where isolates originated from. Isolates from Saxony could not be elucidated further due to the lack of additional geographic information. Number of isolates is given by the size of the circle (see legend). Image is from: © Bundesamt für Kartographie und Geodäsie, Frankfurt am Main, Germany. Figure S2. Virulence gene content in 107 carbapenemase-producing K. pneumonaie isolates from Germany. Data are given in % of isolates showing possession of the corresponding gene cluster. The graph shows four most frequent virulence genes identified in more than one single isolate. Figure S3. Detailed view of the ML tree concerning ST258/ST512 – carbapenemase-producing K. pneumoniae isolates from Germany, 2008-2014. The image shows a subtree of Fig. 3 containing 52 isolates of ST258 (light violett) and ST512 (grey). Colour codes of the inner ring designate the corresponding carbapenemase type, the outer designates the wzi allele (see legend). Figure S4. ML tree of NGS-based analysis of German K. pneumoniae isolates and isolates from an international collection - detailed view of the cluster ST258/ST512 isolates. The image shows a subtree of Fig. 4 containing 66 isolates of ST258 and ST512. Colour codes of the inner ring correspond to the origin of strains, the middle ring to the carbapenemase KPC-2 or KPC-3, and the outer ring demonstrates the wzi allele type. (PPTX 1367 kb)

Table S2. Names and sequences of used primers for MLST and PCR amplification of virulence genes and β-lactamase genes. Table S3. Identified virulence genes in K. pneumoniae isolate no. 316/15 (ST23, OXA-48). Table S4. Identified wzi alleles from NGS data of 107 carbapenemase-producing K. pneumoniae from Germany. (DOCX 35 kb)

Im Juni 2022 fand die Kieler Woche ohne pandemiebedingte einschränkende Maßnahmen statt. Im Anschluss daran verdreifachte sich binnen weniger Tage die lokale Sieben-Tage-Inzidenz der SARS-CoV-2-Infektionen. Im selben Zeitraum war bei den COVID-19-bedingten Hospitalisierungen, schweren Erkrankungen und Todesfällen allenfalls ein schwacher Anstieg zu verzeichnen. Dagegen kam es aufgrund der Absonderungsmaßnahmen zu umfangreichen Personalausfällen unter anderem in Krankenhäusern sowie damit auch zu einem starken Rückgang der Anzahl der belegbaren Krankenhausbetten auf Normalstationen. Der Erfahrungsbericht fasst die verfügbaren, quantifizierbaren epidemiologischen Auswirkungen der Kieler Woche 2022 zusammen.

Additional file 3. Hospitals and university hospitals in Germany per district, 2017. Dots are randomly placed within one district. * According to the directory of hospitals, there were 1,776 general hospitals and 35 university hospitals in Germany in 2017 with a total of 479,893 general hospital beds and 45,156 university hospital beds. A total of 19,442,810 patients were treated in hospitals what accounted for 141,152*1,000 patient-days and patients stayed in hospital for a mean of 7.3 days (range: 6.9-7.9 days by federal state).

Additional file 1. Completeness of CRA (n = 2,278) and CRE (n = 12,282) notifications, Germany, 2017-2019.

Additional file 2. Most common reported bacteria in notified CRA (n = 2,278) and CRE (n = 12,282) cases, Germany, 2017-2019.

BACKGROUND: During the 2015/16 influenza season in Europe, the cocirculating influenza viruses were A(H1N1)pdm09 and B/Victoria, which was antigenically distinct from the B/Yamagata component in the trivalent influenza vaccine. METHODS: We used the test-negative design in a multicentre case-control study in twelve European countries to measure 2015/16 influenza vaccine effectiveness (VE) against medically attended influenza-like illness (ILI) laboratory-confirmed as influenza. General practitioners swabbed a systematic sample of consulting ILI patients and a random sample of influenza-positive swabs was sequenced. We calculated adjusted VE against influenza A(H1N1)pdm09, A(H1N1)pdm09 genetic group 6B.1 and influenza B overall and by age group. RESULTS: We included 11 430 ILI patients, of which 2272 were influenza A(H1N1)pdm09 and 2901 were influenza B cases. Overall VE against influenza A(H1N1)pdm09 was 32.9% (95% CI: 15.5-46.7). Among those aged 0-14, 15-64 and ≥65 years, VE against A(H1N1)pdm09 was 31.9% (95% CI: -32.3 to 65.0), 41.4% (95% CI: 20.5-56.7) and 13.2% (95% CI: -38.0 to 45.3), respectively. Overall VE against influenza A(H1N1)pdm09 genetic group 6B.1 was 32.8% (95% CI: -4.1 to 56.7). Among those aged 0-14, 15-64 and ≥65 years, VE against influenza B was -47.6% (95% CI: -124.9 to 3.1), 27.3% (95% CI: -4.6 to 49.4) and 9.3% (95% CI: -44.1 to 42.9), respectively. CONCLUSIONS: Vaccine effectiveness (VE) against influenza A(H1N1)pdm09 and its genetic group 6B.1 was moderate in children and adults, and low among individuals ≥65 years. Vaccine effectiveness (VE) against influenza B was low and heterogeneous among age groups. More information on effects of previous vaccination and previous infection is needed to understand the VE results against influenza B in the context of a mismatched vaccine. ECDC has contributed fund for the coordination and some study sites under the Framework contract no. ECDC/2014/026 for the individuals aged less than 65 years. The I‐MOVE/I‐MOVE+ study team is very grateful to all patients, general practitioners, paediatricians, hospital teams, laboratory teams and regional epidemiologists who have contributed to the study. We acknowledge the authors, originating and submitting laboratories of the sequences from GISAID's EpiFlu Database used for this study. All submitters of data may be contacted directly via the GISAID website http://www.gisaid.org. Sí

Für die Evaluation der Qualität von Tuberkulose-Meldesystemen ist die Bewertung der Vollständigkeit der Meldedaten von zentraler Bedeutung, da diese die Basis für eine aussagekräftige Tuberkulose-Surveillance und daraus abgeleitete Maßnahmen sind. Wie das Epidemiologische Bulletin 11/2021 beschreibt, wurde am Robert-Koch-Institut für den Zeitraum 2013-17 eine Inventarstudie zur Schätzung der Tuberkulose-Untererfassung in Deutschland durchgeführt. Das Ergebnis: mit einer Erfassungsquote von über 90% ist die Tuberkulose-Melderate trotz eines leichten Rückgangs innerhalb des untersuchten Zeitraums ein guter Näherungswert für die tatsächliche Tuberkulose-Inzidenz.

Die vorgestellte Analyse untersucht, inwiefern sich die Meldungen von Erregern mit Antibiotikaresistenzen und C. difficile-Infektionen gemäß IfSG seit Inkrafttreten der Maßnahmen zur Eindämmung der COVID-19-Pandemie verändert haben. Beobachtet wurde ein Rückgang der übermittelten Fallzahlen von Methicillin-resistenten Staphylococcus Aureus (MRSA), C. difficile, Acinetobacter spp. (CRA) und Enterobacterales (CRE). Welche Faktoren genau für diesen Rückgang verantwortlich sind und ob die COVID-19-Pandemie langfristig die Antibiotikaresistenz eher steigert oder verringert bleibt zu untersuchen.

Die 2008 etablierte Antibiotika-Resistenz-Surveillance (ARS) wurde für die Surveillance von SARS-CoV-2 erweitert. Über ARS werden Daten zu jedem einzelnen durchgeführten Test an das RKI übermittelt. Es werden Daten zur virologischen Diagnostik zu SARS-CoV-2 tagesaktuell elektronisch übermittelt. Die besondere Wertigkeit der laborbasierten Surveillance zu SARS-CoV-2 besteht darin, dass über ein etabliertes Surveillancesystem alle in der Routine durchgeführten Testungen erfasst werden, d. h. auch negative Befunde, und damit eine Aussage zum Umfang der in den teilnehmenden Laboren durchgeführten Diagnostik gemacht werden kann.

Vancomycin-resistente Enterokokken gehören zu den in Deutschland gemäß § 23 Abs. 4 zu erfassenden Erregern und werden mittlerweile in vielen Kliniken in Deutschland häufig beobachtet. Weiterhin weniger klar ist Umfang und Art des klinischen Problems, das sich hinter dieser Beobachtung verbirgt. Der vermehrte Nachweis in den Einrichtungen ist auch am Nationalen Referenzzentrum für Staphylokokken und Enterokokken zu bemerken, wie z. B. an (i) steigenden Einsendezahlen seit 2015 und (ii) einem hohen Bedarf an Typisierungen; letzteres ist nahezu gleichbedeutend mit einem Verdacht auf Transmissionen/Cluster von Infektionen und Besiedlungen in betroffenen Einrichtungen („Ausbrüche“). In den Einsendungen an das NRZ wird zudem, wie im Epidemiologischen Bulletin 35/2019 ausgeführt wird, ein Anstieg an Isolaten mit Resistenzen gegen Reserveantibiotika, dabei vor allem Isolate mit Linezolid-Resistenz, z. T. auch aus lokalen Häufungen, beobachtet.

Results of previous influenza vaccination effects on current season influenza vaccine effectiveness (VE) are inconsistent.

Table S2. Names and sequences of used primers for MLST and PCR amplification of virulence genes and β-lactamase genes. Table S3. Identified virulence genes in K. pneumoniae isolate no. 316/15 (ST23, OXA-48). Table S4. Identified wzi alleles from NGS data of 107 carbapenemase-producing K. pneumoniae from Germany. (DOCX 35 kb)

Figure S1. Origin of the 107 German carbapenemase-producing K. pneumoniae isolates. Regions are shown, where isolates originated from. Isolates from Saxony could not be elucidated further due to the lack of additional geographic information. Number of isolates is given by the size of the circle (see legend). Image is from: © Bundesamt für Kartographie und Geodäsie, Frankfurt am Main, Germany. Figure S2. Virulence gene content in 107 carbapenemase-producing K. pneumonaie isolates from Germany. Data are given in % of isolates showing possession of the corresponding gene cluster. The graph shows four most frequent virulence genes identified in more than one single isolate. Figure S3. Detailed view of the ML tree concerning ST258/ST512 – carbapenemase-producing K. pneumoniae isolates from Germany, 2008-2014. The image shows a subtree of Fig. 3 containing 52 isolates of ST258 (light violett) and ST512 (grey). Colour codes of the inner ring designate the corresponding carbapenemase type, the outer designates the wzi allele (see legend). Figure S4. ML tree of NGS-based analysis of German K. pneumoniae isolates and isolates from an international collection - detailed view of the cluster ST258/ST512 isolates. The image shows a subtree of Fig. 4 containing 66 isolates of ST258 and ST512. Colour codes of the inner ring correspond to the origin of strains, the middle ring to the carbapenemase KPC-2 or KPC-3, and the outer ring demonstrates the wzi allele type. (PPTX 1367 kb)

Hintergrund: Die Surveillance (Überwachung) von impfpräventablen Erkrankungen in Deutschland beruht im Wesentlichen auf der Meldepflicht gemäß Infektionsschutzgesetz. Eine kontinuierliche Erhebung von bundesweiten Impfquoten findet hauptsächlich im Rahmen der Schuleingangsuntersuchungen statt. Daher sind Kenntnisse über bundesweite Inzidenzen (Neuerkrankungsraten) von nicht-meldepflichtigen Erkrankungen und Impfquoten der Zielgruppen von Impfprogrammen für verschiedene Altersgruppen lückenhaft. Das Ziel der Promotionsarbeit besteht darin, zu untersuchen, inwieweit die Daten der Kassenärztlichen Vereinigungen (KVen) genutzt werden können, um repräsentativ für Deutschland Impfquoten und Inzidenzen impfpräventabler Erkrankungen zu bestimmen. Methodik. Die Kassenärztlichen Vereinigungen übermitteln im Rahmen des Projekts „KVSentinel“ pseudonymisierte Daten zu Masern, Mumps, Keuchhusten, Windpocken (Varizellen) und Herpes zoster sowie zu den von der Ständigen Impfkommission empfohlenen Standardimpfungen an das Robert Koch-Institut. Studienpopulation sind die gesetzlich krankenversicherten Personen (ca. 85,5% der Bevölkerung). Ergebnisse: Es wurde ein methodisches Konzept entwickelt, das die Qualitätssicherung der KVDaten sowie die Etablierung von geeigneten Bezugsgrößen für die Berechnung von Impfquoten und Inzidenzen umfasst. Die Analysen zu Varizellenimpfungen, Influenzaimpfungen und Maserndiagnosen zeigen, dass anhand der KV-Daten Impfquoten und Inzidenzen für jedes Alter berechnet werden können. Weiterhin erlauben die Daten die Untersuchung, ob Impfungen zeitgerecht erfolgen, ob sich Personen regelmäßig impfen lassen und ob das Meldesystem die Zahl der Erkrankungen unterschätzt. Schlussfolgerungen: Die Daten der KVen erlauben Aussagen über die Umsetzung von Impfempfehlungen und schließen damit eine Wissenslücke. Die in der vorliegenden Promotionsarbeit etablierte Methodik zur Nutzung der Daten ist die Grundlage für ein kontinuierliches Monitoring von bundesweiten altersspezifischen Impfquoten und Inzidenzen impfpräventabler Erkrankungen.

Hintergrund: Aus verschiedenen Industrienationen wird über eine Zunahme von Erkrankungen durch nichttuberkulöse Mykobakterien (NTM) bei Kindern berichtet. Gemäß internationalen und nationalen Empfehlungen ist die Therapie der Wahl bei einer nichttuberkulösen Lymphadenitis cervicalis,[for full text, please go to the a.m. URL], 20. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Pädiatrische Infektiologie (DGPI)

Hintergrund. Die Surveillance (Überwachung) von impfpräventablen Erkrankungen in Deutschland beruht im Wesentlichen auf der Meldepflicht gemäß Infektionsschutzgesetz. Eine kontinuierliche Erhebung von bundesweiten Impfquoten findet hauptsächlich im Rahmen der Schuleingangsuntersuchungen statt. Daher sind Kenntnisse über bundesweite Inzidenzen (Neuerkrankungsraten) von nicht-meldepflichtigen Erkrankungen und Impfquoten der Zielgruppen von Impfprogrammen für verschiedene Altersgruppen lückenhaft. Das Ziel der Promotionsarbeit besteht darin, zu untersuchen, inwieweit die Daten der Kassenärztlichen Vereinigungen (KVen) genutzt werden können, um repräsentativ für Deutschland Impfquoten und Inzidenzen impfpräventabler Erkrankungen zu bestimmen. Methodik. Die Kassenärztlichen Vereinigungen übermitteln im Rahmen des Projekts „KV-Sentinel“ pseudonymisierte Daten zu Masern, Mumps, Keuchhusten, Windpocken (Varizellen) und Herpes zoster sowie zu den von der Ständigen Impfkommission empfohlenen Standardimpfungen an das Robert Koch- Institut. Studienpopulation sind die gesetzlich krankenversicherten Personen (ca. 85,5% der Bevölkerung). Ergebnisse. Es wurde ein methodisches Konzept entwickelt, das die Qualitätssicherung der KV-Daten sowie die Etablierung von geeigneten Bezugsgrößen für die Berechnung von Impfquoten und Inzidenzen umfasst. Die Analysen zu Varizellenimpfungen, Influenzaimpfungen und Maserndiagnosen zeigen, dass anhand der KV-Daten Impfquoten und Inzidenzen für jedes Alter berechnet werden können. Weiterhin erlauben die Daten die Untersuchung, ob Impfungen zeitgerecht erfolgen, ob sich Personen regelmäßig impfen lassen und ob das Meldesystem die Zahl der Erkrankungen unterschätzt. Schlussfolgerungen. Die Daten der KVen erlauben Aussagen über die Umsetzung von Impfempfehlungen und schließen damit eine Wissenslücke. Die in der vorliegenden Promotionsarbeit etablierte Methodik zur Nutzung der Daten ist die Grundlage für ein kontinuierliches Monitoring von bundesweiten altersspezifischen Impfquoten und Inzidenzen impfpräventabler Erkrankungen., Background. The surveillance of vaccine preventable diseases in Germany is based upon the mandatory notification according to the Protection Against Infection Act. A continuous collection of nationwide vaccination coverage is primarily performed at school entry examinations. Hence, knowledge on nationwide incidences of non-notifiable diseases and vaccination coverage of target groups of vaccination programmes is scarce. The aim of this thesis is to investigate if data from associations of statutory health insurance physicians (ASHIPs) can be used to determine vaccination coverage and incidences of vaccine preventable diseases representative for Germany. Methods. The ASHIPs provide pseudonymous physicians billing data including data on vaccinations, measles diagnoses, mumps diagnoses, pertussis diagnoses, varicella diagnoses and herpes zoster diagnoses to the Robert Koch Institute. Study population is the statutory health insured population (85.5% of the German population). Results. We developed a methodological concept that ensures quality of ASHIP data and established adequate denominators to calculate vaccination coverage and incidences. Analyses of varicella vaccinations, influenza vaccinations and measles diagnoses showed that using ASHIP data, age specific vaccination coverage and incidences can be determined. Furthermore, these data are suitable to investigate if vaccinations are given at the recommended age, if persons are regularly vaccinated and if there is underreporting within the mandatory notification system. Conclusions. The ASHIP data provide information of the implementation of vaccination recommendations and therefore, close a gap in knowledge. The established methodological concept for the use of ASHIP data forms a basis for a continuous monitoring of nationwide age specific vaccination coverage and incidences of vaccine preventable diseases.

Eliminating measles in Europe by 2015 is a WHO health goal. In Germany, physicians are legally required to report measles cases, yet it seems likely that reporting is less than universal. The goal of this study is to compare the number of measles cases that are reflected by data from the statutory health insurance (SHI) carriers with the number of physician-reported cases during and after a recent outbreak in the German state of North Rhine-Westphalia (NRW).We analyzed the billing data of SHI carriers relating to measles in 2006 and 2007, as well as the measles cases that were reported in NRW over this period as required by law. We calculated the incidence of measles as the number of measles cases per 100 000 insurees (SHI carrier data) or per 100 000 persons in the overall population (reporting data).The measles outbreak in the first half of 2006 comprised 1713 measles cases according to the SHI data and 1665 cases that were reported as required by law (ratio, 1.02:1). From mid-2006 to the end of 2007, the SHI data reflected 821 cases, but only 349 cases were reported (ratio, 2.35:1). Younger patients were more commonly found among the cases reflected in the SHI data than among the reported cases.Our study confirms that the system of legally mandated reporting underestimates the true number of measles cases, particularly in times when most cases are sporadic, and particularly in children who are less than 5 years old.

Background During the 2015/16 influenza season in Europe, the cocirculating influenza viruses were A(H1N1)pdm09 and B/Victoria, which was antigenically distinct from the B/Yamagata component in the trivalent influenza vaccine. Methods We used the test‐negative design in a multicentre case‐control study in twelve European countries to measure 2015/16 influenza vaccine effectiveness (VE) against medically attended influenza‐like illness (ILI) laboratory‐confirmed as influenza. General practitioners swabbed a systematic sample of consulting ILI patients and a random sample of influenza‐positive swabs was sequenced. We calculated adjusted VE against influenza A(H1N1)pdm09, A(H1N1)pdm09 genetic group 6B.1 and influenza B overall and by age group. Results We included 11 430 ILI patients, of which 2272 were influenza A(H1N1)pdm09 and 2901 were influenza B cases. Overall VE against influenza A(H1N1)pdm09 was 32.9% (95% CI: 15.5‐46.7). Among those aged 0‐14, 15‐64 and ≥65 years, VE against A(H1N1)pdm09 was 31.9% (95% CI: −32.3 to 65.0), 41.4% (95% CI: 20.5‐56.7) and 13.2% (95% CI: −38.0 to 45.3), respectively. Overall VE against influenza A(H1N1)pdm09 genetic group 6B.1 was 32.8% (95% CI: −4.1 to 56.7). Among those aged 0‐14, 15‐64 and ≥65 years, VE against influenza B was −47.6% (95% CI: −124.9 to 3.1), 27.3% (95% CI: −4.6 to 49.4) and 9.3% (95% CI: −44.1 to 42.9), respectively. Conclusions Vaccine effectiveness (VE) against influenza A(H1N1)pdm09 and its genetic group 6B.1 was moderate in children and adults, and low among individuals ≥65 years. Vaccine effectiveness (VE) against influenza B was low and heterogeneous among age groups. More information on effects of previous vaccination and previous infection is needed to understand the VE results against influenza B in the context of a mismatched vaccine.