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Orientadores: Marcio Martins, Otavio Augusto Vuolo Marques Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Doutorado

Apresentamos as 24 espécies de anfíbios anuros que ocorrem no Parque Estadual das Furnas do Bom Jesus (PEFBJ), Pedregulho, São Paulo, sudeste do Brasil. Barycholos ternetzi, Rhinella rubescens, Scinax canastrensis e Phyllomedusa ayeaye correspondem a novos registros para o estado de São Paulo, sendo a última espécie incluída na lista de espécies ameaçadas de extinção do Ibama e IUCN. Para caracterizar a taxocenose de anuros do PEFBJ, comparamos sua composição de espécies com a de outras 66 localidades em diversos biomas e fitofisionomias do Brasil. As 67 taxocenoses foram ordenadas e agrupadas por meio de uma Análise de Coordenadas Principais (ACOP) e uma Análise de Agrupamento (Cluster Analysis). As análises multivariadas permitiram a identificação de quatro grupos: um de taxocenoses amazônicas; dois de taxocenoses de Mata Atlântica, sendo um composto por floresta ombrófila densa dos estados da Bahia e Espírito Santo e sua transição com a floresta estacional semidecidual (Minas Gerais), e o outro por localidades de floresta ombrófila densa dos estados do Rio de Janeiro, São Paulo e Paraná e suas transições com a floresta ombrófila mista, floresta estacional semidecidual, além de taxocenoses do Bioma Pampa; no quarto grupo foram incluídas as taxocenoses de biomas que apresentam fitofisionomias mais abertas, como Caatinga, Cerrado, Pantanal e a Mata Atlântica (floresta estacional semidecidual). Os agrupamentos faunísticos obtidos indicam que as composições de espécies das 67 localidades analisadas estão fortemente relacionadas com o tipo de vegetação onde ocorrem. A grande diversidade observada entre as fisionomias vegetais pode ser relacionada às variações topográficas e climáticas encontradas nos diferentes biomas examinados (Amazônia, Caatinga, Cerrado, Mata Atlântica, Pampa e Pantanal). A taxocenose de anuros do PEFBJ foi agrupada àquelas presentes em biomas com fitofisionomias abertas (quarto grupo), apresentando grande similaridade com as faunas de Cerrado e da floresta estacional semidecidual presente no Bioma Mata Atlântica do estado de São Paulo. We present the 24 anuran species occuring in Parque Estadual das Furnas do Bom Jesus (PEFBJ), municipality of Pedregulho, São Paulo state, southeastern Brazil. Barycholos ternetzi, Rhinella rubescens, Scinax canastrensis, and Phyllomedusa ayeaye correspond to new records to the São Paulo state species list, the latter species considered as threatened in IBAMA and IUCN lists. In order to characterize the PEFBJ anuran assemblage we compare its species composition with 66 localities from different biomes in Brazil. The 67 assemblages were ordinated and grouped by Principal Coordinates Analysis (ACOP) and Cluster Analysis. The multivariate analysis allowed the identification of four groups: one from Amazonian forest assemblages; two from Atlantic forest assemblages, being one consisting of dense Atlantic rain forest of Bahia, Espírito Santo states and its transitions with seasonal semideciduous forests (Minas Gerais state), and the other one consisting of localities of dense Atlantic rain forest of Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná states and its transitions with araucaria rain forest (Atlantic rain forest with Araucaria angustifolia), seasonal semideciduous forests, and Pampas Biome assemblages; assemblages from more open physiognomies, as Caatinga (semiarid steppe of Northeast Brazil), Cerrado (Brazilian savanna), Pantanal (Brazilian wetlands), and the Atlantic forest (seasonal semideciduous forests) were included in the fourth group. The faunistic groups obtained indicate that species composition of the 67 localities are strongly related to the vegetation types where they occur. The great diversity observed among the physiognomic vegetation types could be related to the topographic and climatic variations found in the different biomes considered in our analysis (Amazon, Caatinga, Cerrado, Atlantic forest, Pampas and Pantanal). The anuran assemblage of PEFBJ was grouped among the biomes with open phytophysiognomies (fourth group), showing great similarity to the faunas of Cerrado and semideciduous forests in the Atlantic forest Biome of São Paulo state.

We provide a checklist of snake species from Ilha de São Sebastião (Ilhabela), the largest coastal island in Brazil located on the northern coast of São Paulo state. We also compare snake diversity (including richness and relative abundance of species) of Ilhabela and the nearest mainland municipality, São Sebastião. We obtained the data from the herpetological collections of the Instituto Butantan and Museu de Zoologia of Universidade de São Paulo, including records from 1939 to 2005. We recorded twenty snake species from Ilhabela (N = 376 individuals), and the dominant species was the viperid Bothrops jararaca with 55% of dominance. In São Sebastião we recorded 27 species (N = 625), and Bothrops jararaca was also the dominant species, but with 25% of dominance. Some common species seem to be more abundant in the mainland. Even considering the different number of individuals sampled between localities, rarefactions curves and richness estimations confirm that São Sebastião should present a higher number of species. The Chao 1 estimates 20 species (19 to 21 spp.) for Ilhabela, and 32 species (27 to 37 spp.) for São Sebastião. One of the most distinctive aspects of the snake fauna of Ilhabela is the occurrence of four species of the genus Dipsas (D. albifrons, D. alternans, D. neivai,and D. petersi). Throughout most of the coastal Atlantic Forest of São Paulo state only D. petersi is recorded. This is the first assessment of diversity of snakes in Ilha de São Sebastião and the municipality of São Sebastião. Thus, it is a contribution to the knowledge and conservation of the herpetofauna of the region and of the Atlantic Forest of southeastern Brazil. Apresentamos uma lista de espécies de serpentes da Ilha de São Sebastião (Ilhabela), maior ilha continental do Brasil localizada no litoral norte do estado de São Paulo. Comparamos a diversidade de serpentes (incluindo riqueza e abundância relativa de espécies) entre Ilhabela e São Sebastião, o município mais próximo no continente. Obtivemos os dados a partir das coleções herpetológicas do Instituto Butantan e Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, incluindo registros de 1939 a 2005. Registramos vinte espécies de serpentes em Ilhabela (N = 376 indivíduos), e a espécie dominante foi o viperídeo Bothrops jararaca com 55% de dominância. Em São Sebastião registramos 27 espécies (N = 625), e Bothrops jararaca também foi a espécie dominante, mas com 25% de dominância. Por outro lado, algumas espécies comuns parecem ser mais abundantes no continente. Mesmo considerando o número diferente de indivíduos amostrados entre as localidades, curvas de rarefação e estimativas de riqueza confirmam que São Sebastião deve apresentar um maior número de espécies. Chao 1 estimou 20 espécies (19 a 21 spp.) para Ilhabela e 32 espécies (27 a 37 spp.) para São Sebastião. Porém, um dos aspectos que mais diferenciam a fauna de serpentes de Ilhabela é a ocorrência de quatro espécies do gênero Dipsas (D. albifrons, D. alternans, D. neivai, e D. petersi). Ao longo da maior parte do litoral da Mata Atlântica costeira do estado de São Paulo apenas D. petersi é registrada. Esta é a primeira avaliação da diversidade da fauna de serpentes da Ilha de São Sebastião e do município de São Sebastião. Desta forma, este estudo contribui para o conhecimento e conservação da herpetofauna da região assim como da Mata Atlântica do sudeste do Brasil.

Neotropical snake assemblages present high species richness and complex structures. The Cerrado is the second largest biome in Brazil, and was included among the 25 World's biodiversity hotspots. In southeastern Brazil, the remnant Cerrado areas have suffered intense destruction, and presently less than 2% of Cerrado natural vegetation remain in São Paulo state. Virtually no detailed study on Cerrado snakes was carried out in this region. The Itirapina region has one of the last well preserved remnants of open cerrado in São Paulo state. Our purpose in this work was the study of natural history and composition of the Cerrado snakes of Itirapina region. We performed an extensive field sampling combining six sampling methods in Estação Ecológica de Itirapina and disturbed Cerrado areas in its surroundings (municipalities of Itirapina and Brotas), during 101 trips throughout 43 months, between September 1998 and March 2002, corresponding to 446 days of field sampling. We also collected additional data from museum specimens housed in scientific collections. We present data on size, general abundance, habitat and macrohabitat use, daily and seasonal activity, feeding, reproduction, and defense. We also compared the Itirapina snake assemblage with nine snake assemblages of Brazil, from Amazonia, Atlantic Forest, Cerrado, and other open habitats. We recorded a total of 36 snake species among 755 individuals found in the field and six records from scientific collections and literature, belonging to 25 genera and five families. The snake assemblage comparisons indicate that the Cerrado has its own identity regarding the snake composition. Although small (about 2,300 ha), the Estação Ecológica de Itirapina encompasses well preserved and representative Cerrado physiognomic forms, which harbors a rich and typical Cerrado snake fauna. The occurrence of some species only inside the reserve also indicates that the Estação Ecológica de Itirapina is of fundamental importance to the maintenance of Cerrado biodiversity. As taxocenoses de serpentes neotropicais apresenta m alta riqueza de espécies e estruturas complexas. O Cerrado é o segundo maior bioma do Brasil e foi incluído entre os 25 hotspots globais de biodiversidade. No sudeste do Brasil, as áreas remanescentes de Cerrado têm sofrido intensa destruição, e atualmente restam menos de 2% da vegetação natural de Cerrado no estado de São Paulo. Praticamente nenhum estudo detalhado sobre serpentes do Cerrado foi realizado nesta região. A região de Itirapina apresenta um dos últimos remanescentes bem preservados de cerrado aberto no estado de São Paulo. Nosso objetivo neste trabalho foi o estudo da história natural e composição das serpentes de Cerrado da região de Itirapina. Nós realizamos uma amostragem de campo extensiva combinando seis métodos de amostragem na Estação Ecológica de Itirapina e áreas alteradas de Cerrado nas proximidades (municípios de Itirapina e Brotas), em 101 viagens durante 43 meses, entre setembro de 1998 e março de 2002, o que correspondeu a 446 dias de amostragem de campo. Também coletamos dados adicionais a partir de espécimes de coleções científicas. Apresentamos dados sobre tamanho, abundância geral, uso do ambiente e substrato, atividade diária e sazonal, dieta, reprodução e defesa. Também comparamos a taxocenose de serpentes de Itirapina com nove taxocenoses de serpentes do Brasil, incluindo a Amazônia, Mata Atlântica, Cerrado e outras formações abertas. Registramos na região de Itirapina 36 espécies de serpentes entre 755 indivíduos encontrados no campo e seis registros de coleções científicas e literatura, pertencentes a 25 gêneros de cinco famílias. As comparações entre taxocenoses indicam que o Cerrado apresenta uma identidade própria em relação à composição de espécies de serpentes. Apesar de limitada a um pequeno fragmento (cerca de 2.300 ha), a Estação Ecológica de Itirapina apresenta fisionomias conservadas e representativas de Cerrado, que abrigam uma fauna de serpentes rica e típica do Cerrado. A ocorrência de algumas espécies apenas no interior da reserva também indica que a Estação Ecológica de Itirapina é de importância fundamental para a manutenção da biodiversidade do Cerrado.

Neotropical snake assemblages present high species richness and complex structures. The Cerrado is the second largest biome in Brazil, and was included among the 25 World's biodiversity hotspots. In southeastern Brazil, the remnant Cerrado areas have suffered intense destruction, and presently less than 2% of Cerrado natural vegetation remain in São Paulo state. Virtually no detailed study on Cerrado snakes was carried out in this region. The Itirapina region has one of the last well preserved remnants of open cerrado in São Paulo state. Our purpose in this work was the study of natural history and composition of the Cerrado snakes of Itirapina region. We performed an extensive field sampling combining six sampling methods in Estação Ecológica de Itirapina and disturbed Cerrado areas in its surroundings (municipalities of Itirapina and Brotas), during 101 trips throughout 43 months, between September 1998 and March 2002, corresponding to 446 days of field sampling. We also collected additional data from museum specimens housed in scientific collections. We present data on size, general abundance, habitat and macrohabitat use, daily and seasonal activity, feeding, reproduction, and defense. We also compared the Itirapina snake assemblage with nine snake assemblages of Brazil, from Amazonia, Atlantic Forest, Cerrado, and other open habitats. We recorded a total of 36 snake species among 755 individuals found in the field and six records from scientific collections and literature, belonging to 25 genera and five families. The snake assemblage comparisons indicate that the Cerrado has its own identity regarding the snake composition. Although small (about 2,300 ha), the Estação Ecológica de Itirapina encompasses well preserved and representative Cerrado physiognomic forms, which harbors a rich and typical Cerrado snake fauna. The occurrence of some species only inside the reserve also indicates that the Estação Ecológica de Itirapina is of fundamental importance to the maintenance of Cerrado biodiversity.

Elaboramos uma lista das espécies de répteis do Estado de São Paulo com base nos registros confirmados de exemplares depositados nas três maiores coleções científicas do estado, complementando esta informação com a bibliografia disponível. Registramos a presença de 212 espécies de répteis no Estado de São Paulo, distribuídas em 23 famílias, incluindo 12 quelônios, três crocodilianos e 197 Squamata (142 serpentes, 44 "lagartos" e 11 anfisbenas). Destas, onze são endêmicas do Estado de São Paulo (Mesoclemmys cf. vanderhaegei, Amphisbaena sanctaeritae, Mabuya caissara, Mabuya macrorhyncha, Liotyphlops caissara, Liotyphlops schubarti, Corallus cropanii, Atractus serranus, Phalotris lativittatus, Bothropoides alcatraz, Bothropoides insularis). Entre os Squamata, quatro lagartos e uma serpente correspondem a espécies ainda não descritas. Destas 212 espécies, 32 estão incluídas na Lista das Espécies Ameaçadas do Estado de São Paulo, enquanto que apenas nove constam na Lista das Espécies Ameaçadas do Brasil. A riqueza de répteis atualmente registrada no Estado de São Paulo representa cerca de 30% da riqueza conhecida para o grupo em todo o território brasileiro, que abrange 721 espécies. Entretanto, concluímos que estudos mais detalhados sobre a taxonomia e a distribuição de espécies bem como os esforços de coleta em áreas com lacunas de amostragem devem ainda aumentar o número de espécies de répteis no estado. The present study provides a list of species of reptiles known to occur in the State of São Paulo, based on specimens with confirmed localities, housed in the three largest scientific collections of the state, and published information. We registered the presence of 212 species of reptiles within the boundaries of the state that belong to 23 families and include 12 chelonians, three crocodilians, and 197 squamates (142 snakes, 44 "lizards," and 11 amphisbenians). Eleven species are endemic to the State of São Paulo (Mesoclemmys cf. vanderhaegei, Amphisbaena sanctaeritae, Mabuya caissara, Mabuya macrorhyncha, Liotyphlops caissara, Liotyphlops schubarti, Corallus cropanii, Atractus serranus, Phalotris lativittatus, Bothropoides alcatraz, Bothropoides insularis). Within Squamata, four lizards and one snake correspond to valid species that are still in need of formal description. Thirty-two species are included in the List of Threatened Species from the State of São Paulo, while only nine belong to the Brazilian List of Threatened Species. Reptile species richness for the state represents already approximately 30% of species richness known to occur in all the Brazilian territory, which includes 721 species. However, we conclude that more detailed taxonomic and distributional studies as well as more surveys targeting poorly known localities will have the effect of augmenting the number of species for the state.

Orientadora: Profa. Dra. Vanessa Kruth Verdade Coorientadora: Profa. Dra. Julia Klaczko Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, São Bernardo do Campo, 2022. A morfologia de estruturas tridimensionais de caráter complexo, como o crânio, pode ser mediada pela interação entre desenvolvimento e função dos subconjuntos que as compõem. Trata-se de uma importante consequência de efeitos genéticos que atuam sobre a variação fenotípica, sendo responsáveis por maior ou menor integração entre conjuntos específicos de ossos. Dentro dos conjuntos formados, o fenótipo tende a ser mais correlacionado do que quando comparado a ossos de conjuntos diferentes. Conhecido como modularidade morfológica, esse conceito pode agir como limitante para a evolução da forma da estrutura, implicando em tendências evolutivas para os organismos como um todo. Tais tendências e limitações evolutivas podem ter papel central na diversificação de grupos taxonômicos que apresentam ciclos de vida complexos e ecomorfologia marcante. Esse é o caso de Cycloramphidae, família de anfíbios anuros notória pelo variado grau de independência do ambiente aquático para reprodução e desenvolvimento larval. Além disso, a variação morfológica em adultos é coerente em relação à ocupação de ambientes, com hábitos que vão de saxícolas a semifossoriais. A posição filogenética da família também chama a atenção a respeito da diversidade ecomorfológica. Cycloramphidae vem sendo recuperada em Neoaustrorana, com famílias em que ocorre hábito torrencial (e.g. Hylodidae), terrestre (e.g. Batrachylidae) e endotrofia larval (e.g. Alsodidae); Neoaustrorana, por sua vez, vem sendo recuperado juntamente com famílias em que ocorre hábito aquático (e.g. Telmatobiidae), neomelia (e.g. Rhinodermatidae) e carnivoria larval (e.g. Ceratophryidae), em um clado recentemente denominado Ceratophryoidea. Este trabalho teve por objetivo discutir a evolução da forma e da modularidade em crânios de Cycloramphidae frente à diversidade ecomorfológica encontrada em Ceratophryoidea. Em razão da baixa representatividade taxonômica do clado em filogenias de Anura, foi necessário primeiramente elaborar uma filogenia (bayesiana com base em evidência total, 226 caracteres morfológicos e 6696 pares de bases contemplando genes mitocondriais e nucleares). A partir desse contexto, explorei a integração morfológica, o filomorfoespaço das famílias envolvidas e a disparidade dos grupos ecomorfológicos que as formam, tendo em conta conjuntamente o hábito em fase adulta e larval. The morphology of complex three-dimensional structures such as the skull can be mediated through the interaction between development and function of the subsets that compose them. It is an important consequence of genetic effects acting on phenotypic variation and responsible for greater or lesser integration between specific bone groups. Within the formed groups, the phenotype tends to be more strongly correlated as compared to bones from different groups. This concept, known as morphological modularity, can act as a limiting factor in the evolution of structural form and imply evolutionary trends for organisms as a whole. Such evolutionary trends and constraints can play a central role in the diversification of taxonomic groups that exhibit complex life cycles and remarkable ecomorphology. Such is the case with Cycloramphidae, a family of anuran amphibians notorious for their varying degrees of independence from the aquatic environment for reproduction and larval development. In addition, adult morphological variation is consistent to habitat occupation, ranging from saxicolous to semifossorial. The phylogenetic relationships of the family also draws attention to the ecomorphological diversity. Cycloramphidae have been recovered in Neoaustrorana, with families in which torrential (e.g. Hylodidae), terrestrial (e.g. Batrachylidae) and larval endotrophic (e.g. Alsodidae) habits occur; Neoaustrorana, in turn, was recovered in a clade recently named Ceratophryoidea, along with families in which aquatic habits occur (e.g., Telmatobiidae), neomelia (e.g., Rhinodermatidae), and larval carnivory (e.g., Ceratophryidae). This work aimed to discuss the evolution of shape and modularity in Cycloramphidae skulls in light of the ecomorphological diversity found in Ceratophryoidea. Due to the poor taxonomic representation of the clade in the Anuran phylogenies, it was first necessary to elaborate a phylogeny (Bayesian based on total evidence, 226 morphological characters and 6696 base pairs spanning mitochondrial and nuclear genes). In this context, I have studied the morphological integration, the phylomorphospace of the families involved and the differences of the ecomorphological groups they constitute, considering both adult and larval habits.

Orientador: Otavio Augusto Vuolo Marques Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Síndromes morfológicas relacionadas ao uso do ambiente têm sido observadas em diversas serpentes. Entretanto, a morfologia corporal pode estar associada à linhagem filogenética dos organismos. Portanto, estudos eco-morfológicos podem ser melhor realizados utilizando-se métodos comparativos. Utilizando-se espécimes depositados em coleções, os Boidae (subfamílias Boinae e Pythoninae) foram comparados quanto à morfologia corporal e sua relação com o uso do ambiente. Espécies arborícolas apresentam maior compressão lateral do corpo e cauda relativamente maior quando comparadas àquelas terrícolas e aquáticas, mesmo quando removido o efeito filogenético. O dimorfismo sexual ocorreu em relação ao comprimento rostro-cloacal (CRC), tamanho relativo da cabeça, da cauda, circunferência corporal, compressão lateral do corpo e tamanho do esporão. Entretanto, dentre os Boinae, o dimorfismo de CRC não foi observado na maioria das espécies que apresentam combate (Epicrates spp.) e o de cauda não foi observado nas arborícolas. Na maioria dos casos o dimorfismo resulta de crescimento diferencial entre os sexos já que não estão presentes em recém-nascidos. A otimização dos caracteres morfológicos e de uso do ambiente nas hipóteses filogenéticas disponíveis sugere que os Boidae sofreram poucas modificações ao longo da evolução, muitas das quais representam autapomorfias das espécies ou subespécies. Duas hipóteses filogenéticas concordam que o ancestral dos Boinae possuía cauda curta, circunferência corporal moderada, cabeça pequena, baixo índice de dimorfismo sexual de CRC (SSD) e era semi-arborícola. Mas, não concordam em como seria o ancestral quanto ao tamanho corporal e compressão lateral do corpo. Informações sobre a biologia reprodutiva dos Boinae Neotropicais são restritas e referem-se basicamente a espécimes em cativeiro. Este trabalho apresenta informações sobre a ecologia reprodutiva dessas serpentes, a partir de exemplares preservados em coleções, e compara com as informações disponíveis na literatura para os Erycinae e Pythoninae. Com exceção de Corallus hortulanus e Eunectes murinus, todas as espécies apresentaram vitelogênese concentrada no outono-inverno, gestação do final do inverno até a primavera e nascimentos no final da primavera até o verão. Cópula foi observada em poucas espécies (Boa constrictor ssp. e Epicrates cenchria crassus) e ocorreu do outono até início do inverno. As espécies do gênero Corallus apresentaram vitelogênese mais prolongada. A gestação em C. hortulanus ocorreu desde o final do verão até início do inverno e os nascimentos no outono-inverno. Eunectes murinus apresentou vitelogênese na primavera, a gestação durante o verão e os nascimentos no outono-inverno. O ciclo testicular foi sazonal em B. c. constrictor (pico de espermatogênese no verão) e em E. c. crassus (pico de espermatogênese no verão-outono) e contínuo nas demais espécies analisadas (C. hotulanus, E. c. assisi e E. c. cenchria). O tamanho da ninhada variou de acordo com o tamanho das espécies. O padrão reprodutivo da maioria dos Boinae analisados parece diferir dos Boinae de Madagascar e dos Erycinae, assemelhando-se ao padrão da maioria dos Pythoninae. O tamanho da ninhada e dos recém-nascidos é semelhante nas sub-famílias Boinae e Pythoninae Abstract: Morphological syndromes related to macrohabitat use have been detected in many snakes. However, body morphology can be also related to phylogenetic lineage and for this reason ecomorphological studies are better when using comparative methods. Body morphology and its relationship with macrohabitat use was compared among the Boidae snakes, using preserved specimens deposited in museum collections. Arboreal species are more flattened laterally and have relative longer tails, than terrestrial or aquatic species, even after removing phylogenetic effects. Sexual dimorphisms occurs in SVL, relative head size, tail length, body circumference, lateral flatness of the body and spur size. However, SVL dimorphism are absent in some species with ritual combat (Epicrates ssp.) and tail dimorphism is absent in arboreal species. In most cases sexual dimorphism results of diferential growth in sexes because it does not occur in newborn. Optimizations of morphological characters and microhabitat use on two phylogenetic hypotheses suggest that Boinae had little modifications during the evolution, and most of that represent autapomorphies in species or subspecies level. Both hypotheses agree that the ancestor of Boinae was a short-tailed snake, with medium-size body circumference, small head, low SSD and semi-arboreal, but they disagree how would be the ancestor in terms of body size and lateral flatness of the body. Data on the reproductive biology of Neotropical Boinae are mostly restricted to captive snakes. This work presents information on reproduction of these snakes, using preserved specimens from collections, and compares the results to those available in literature to the subfamilies Pythoninae and Erycinae. The Neotropical Boinae presented vitelogenesis mostly during the autumn and winter (except for Corallus hortulanus and Eunectes murinus), pregnancy from late winter to spring and birth from late spring to summer. Mating was only recorded to Boa constrictor spp. and Epicrates cenchria crassus, from autumn to early winter. Vitellogenis timing was more extended in Corallus hortulanus, the pregnancy was recorded from late summer to early winter, and birth from autumn to winter. In Eunectes murinus vitellogenesis occurred in the spring, pregnancy in the summer and birth from autumn to winter. Testicular cycles were seasonal in Boa c. constrictor (peak occurring in the summer) and in Epicrates c. crassus (peak occurring in the summer-autumn), but continuous in the other species (C. hotulanus, E. c. assisi e E. c. cenchria). Clutch size differs among species but it was related to SVL. The reproductive pattern in most Boinae species apparently differed from the Madagascan boas and Erycinae species but was very similar to the pattern recorded to most Pythoninae snakes. Clutch size and offspring size is similar among Boinae and Pythoninae snakes Doutorado Ecologia Doutor em Ecologia

Orientador: Prof. Dr. Ricardo Jannini Sawaya Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, São Bernardo do Campo, 2021.

Orientador: Prof. Dr. Ricardo Jannini Sawaya Coorientadora: Profa. Dra. Vanessa Kruth Verdade Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, Santo André, 2020. O tamanho corporal pode estar associado a variações ambientais, originando padrões ecogeográficos. Um padrão conhecido é a Regra de Bergmann, que propõe que vertebrados endotérmicos são maiores em latitudes mais altas, devido à menor relação entre a área de superfície e o volume corporal, o que diminuiria a perda de calor. Nos animais ectotérmicos, a baixa capacidade de gerar calor metabólico sugere que outras variáveis possam estar envolvidas. A disponibilidade água é uma possível restrição para os anuros. Foi proposto que esses animais sejam maiores em ambientes mais secos. Esse padrão é justificado pelo mecanismo de conservação da água, que propõe que a menor relação entre a área de superfície e o volume corporal diminua a perda de água por evaporação. Este trabalho tem como objetivo avaliar se o tamanho corporal de anfíbios anuros da Mata Atlântica pode ser explicado pelos mecanismos de conservação de calor ou de água. Foram selecionadas seis espécies de anuros endêmicos da Mata Atlântica, pertencentes a diferentes grupos filogenéticos. O tamanho corporal foi analisado a partir de duas dimensões: comprimento rostro-cloacal (CRC) e robustez. Para avaliar a variação geográfica, inicialmente correlacionamos essas duas dimensões corporais com latitude. Também implementamos modelos de regressão linear das dimensões corporais com variáveis climáticas que representam temperatura, precipitação e evapotranspiração (PET). O CRC foi associado à temperatura em três espécies, sendo que apenas uma apresentou variação de acordo com àquela prevista pelo mecanismo de conservação de calor. Três outras espécies apresentaram relações entre CRC e PET, com duas espécies variando de acordo com o mecanismo de conservação da água. Apenas uma espécie apresentou robustez como prevista pelo mecanismo de conservação da água. Os resultados mostram que não há padrão geral de variação do tamanho corporal em anfíbios anuros da Mata Atlântica. Assim, os mecanismos de conservação de calor e água não foram suficientes para explicar a variação no tamanho corporal desses organismos. É provável que uma variedade de características ecológicas, fisiológicas e comportamentais dos anuros interfiram no tamanho corporal. Mecanismos mais complexos, que incorporem essas características devem ser propostos para melhor compreender a variação no tamanho corporal desses animais. Body size may be associated with environmental variables, resulting in ecogeographical patterns. A notable pattern is Bergmann¿s Rule, which postulates that endothermic vertebrates are larger in higher latitudes, that have lower temperature. The pattern is justified by heat conservation mechanism, which proposes that a lower surface area to volume ratio would decrease heat loss. For ectothermic animals, a low capacity in generating metabolic heat could indicate that other variables might be of importance. For instance, because water is a possible environmental constraint for anuran amphibians, it has been proposed that these animals would be larger in drier environments. This pattern could be justified by the water conservation mechanism, which proposes that a lower surface area to volume ratio decreases water loss. We aimed herein to evaluate whether the body size of anuran amphibians might be explained by heat or water conservation mechanisms. We selected six species of endemic anurans of the Atlantic Rainforest, included in different phylogenetic groups. We used climatic variables representing temperature, precipitation, and evapotranspiration (PET). Body size was based on two dimensions: snout-vent length (SVL) and stoutness. To assess geographical variation, we correlated body dimensions to latitude. We also implemented linear models of body dimensions and climatic variables. Snout-vent length was associated with temperature in three species, with only one varying according to heat conservation mechanism. Three other species showed associations with SVL and PET, being that two of them in accordance to water conservation mechanism. A relationship between stoutness and climate was retrieved for only one species, in accordance to water conservation mechanism. Our results showed that there is no general pattern of body size variation in anuran amphibians of the Atlantic Rainforest. Thus, heat and water conservation mechanisms were not sufficient to explain variation in body size for those animals. Several ecological, physiological, and behavioral aspects might influence body size in anurans. We suggest that future models should be integrative and include such aspects to a better understanding of body size variation in these organisms.

Orientador: Prof. Dr. Ricardo J. Sawaya Coorientador: Prof. Dr. Diego Llusia Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, São Bernardo do Campo, 2020. Anfíbios anuros são um modelo ideal para estudos sobre comunicação acústica uma vez que vocalizam em conjunto, formando coros multiespecíficos durante períodos reprodutivos. Muitos aspectos parecem afetar os sinais acústicos nesse grupo, incluindo tamanho corporal, condições climáticas, estrutura da vegetação e interações bióticas. Entender como o canto de anúncio de espécies de anuros varia ao longo de comunidades é cada vez mais relevante, principalmente em ambientes fortemente ameaçados como a Mata Atlântica. Assim, o objetivo geral desse trabalho foi investigar a diversidade acústica em diferentes comunidades de anfíbios anuros ao longo da Mata Atlântica do sudeste do Brasil, a partir de cinco objetivos específicos separados em dois capítulos. A coleta de dados foi realizada em dez comunidades, entre setembro de 2018 e março de 2019, e compreendeu informações sobre a diversidade de espécies, filogenética, funcional e acústica em cada local, além de variáveis relacionadas a vegetação e condições climáticas. No primeiro capítulo descrevemos o canto de anúncio de 18 espécies de anuros e preenchemos lacunas de informações existentes na literatura. A partir de análises de regressão, fornecemos informações sobre a relação entre tamanho do corpo e frequência dominante, e temperatura do ar e duração do canto para todas as espécies. Não observamos qualquer padrão na relação entre esses parâmetros, com poucas espécies apresentando relações significativas, apesar de sempre negativas. No segundo capítulo investigamos os padrões no uso do espaço acústico a partir de uma abordagem de modelos nulos, incluindo a composição de espécies e a variação intraespecífica. Observamos que tanto indivíduos como espécies contribuem para padrões não-aleatórios de uso do espaço acústico. Também observamos que a diversidade acústica das comunidades de anuros é positivamente relacionada à diversidade funcional e à densidade da vegetação de entorno. De modo geral, fornecemos informações novas em nível de espécie e comunidades. Investigamos e escrevemos a variação intraespecífica do canto de anúncio, e exploramos os padrões de ocupação do espaço acústico em comunidades ecológicas. Por fim, nossos resultados reforçam o valor das paisagens acústicas como recursos ecossistêmicos, cuja assinatura sonora não seria encontrada em nenhum outro lugar com o mesmo padrão. Anuran amphibians are an ideal model for studies on acoustic communication since they vocalize together, forming multi-species choruses during reproductive periods. Many aspects seem to affect the acoustic signals in this group, including body size, climatic conditions, vegetation structure, and biotic interactions. Understanding how the advertisement calls for anurans varies across communities is relevant, especially in threatened environments as the Atlantic Forest. In this way, the general objective of this work was to investigate the acoustic diversity in different communities of anurans along the Atlantic Forest of southeastern Brazil, from five specific questions in two chapters. Data collection was carried out in ten communities, between September 2018 and March 2019, and comprised information about species, phylogenetic, functional and acoustic diversities in each location, besides variables related to vegetation and climatic conditions. In the first chapter, we described the advertisement calls of 18 anuran species and fill gaps of information in the literature. From regression analysis, we provide information on the relationship between body size and dominant frequency, and between air temperature and call duration for all species. We did not observe any pattern in relationships between such parameters, with a few species showing significant relationships, although always negative. In the second chapter, we investigated patterns in the use of acoustic space through a null models approach, including species composition and intraspecific variation. We observed that both individuals and species contribute to non-random patterns of acoustic space use. We also observed that the acoustic diversity of anuran communities seems to be positively related to the functional diversity and the surrounding vegetation density. In general, we provide new information at species and community levels. We investigated and described the intraspecific variation of the advertisement calls and explored the patterns of acoustic space use in ecological communities. Finally, our results reinforce the value of soundscapes as ecosystem resources, where sound signatures would not be found anywhere else with the same pattern.

Submitted by Bruna Espinosa Bolochio (bruna.bolochio@gmail.com) on 2019-06-12T02:00:02Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_BrunaBolochio(biblioteca).pdf: 2031840 bytes, checksum: bba56dda42a4d7ad4ad5e6cb29aa409b (MD5) Rejected by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 01) Solicitamos que corrija na FOLHA DE APROVAÇÃO a cidade de defesa, você deve colocar a cidade da Univ. Fed. ABC onde defendeu. Problema 02) Solicitamos que substitua o título RESUMO GERAL e coloque o correto RESUMO. Problema 03) Solicitamos que substitua o título GENERAL ABSTRACT e coloque o correto ABSTRACT. Problema 04) As Referências citadas na página 14 seriam as referências gerais da tese ? Nesse caso o correto seria colocar após a conclusão geral.(ABNT NBR 14724) Problema 05) Solicitamos corrigir no Sumário, pois algumas páginas não correspondem ao texto: a) A Conclusão geral que no sumário está como página 59 no texto está na página 66 b) No Sumário consta Figuras na página 66 e no texto está na página 59 Problema 06) Notamos que você colocou as tabelas e figuras fora do texto, seria exigências da revista onde você vai publicar o artigo ? Pois no caso artigo 2, o correto serias as figuras constarem como ANEXO. OBS:-Estamos encaminhando via e-mail o template/modelo das páginas pré-textuais para que você possa fazer as correções, sugerimos que siga este modelo pois ele contempla as normas da ABNT. Lembramos que o arquivo depositado no repositório deve ser igual ao impresso, o rigor com o padrão da Universidade se deve ao fato de que o seu trabalho passará a ser visível mundialmente. Agradecemos a compreensão. on 2019-06-12T15:50:14Z (GMT) Submitted by Bruna Espinosa Bolochio (bruna.bolochio@gmail.com) on 2019-06-13T01:28:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_BrunaBolochio(biblioteca).pdf: 2034361 bytes, checksum: a015ee7de223fc8acc1a6be879db9521 (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2019-06-13T13:59:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bolochio_be_me_sjrp_par.pdf: 818235 bytes, checksum: a3a5752ec0073c67f38203aaec1983fa (MD5) Made available in DSpace on 2019-06-13T13:59:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bolochio_be_me_sjrp_par.pdf: 818235 bytes, checksum: a3a5752ec0073c67f38203aaec1983fa (MD5) Previous issue date: 2019-05-28 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A biota global está distribuída de forma não aleatória no espaço, formando padrões de distribuição geográfica. Um dos processos que explica essas distribuições é a vicariância, que fragmenta a distribuição geográfica de uma população através de uma barreira geográfica. Assim, as duas populações ficarão isoladas, e com o tempo podem originar duas espécies irmãs. Espécies que coexistem em uma determinada área formam unidades biogeográficas. Exemplos de unidades biogeográficas amplamente distribuídas são os domínios morfoclimáticos, como a Mata Atlântica. É na Mata Atlântica onde se encontra a maior diversidade de anfíbios anuros do mundo. Porém este domínio é altamente explorado desde o início da colonização da América do Sul, com altas taxas de perda e fragmentação de habitat, contribuindo ainda mais para o declínio populacional de anfíbios e a possível extinção em massa do grupo. Identificar unidades biogeográficas internas da Mata Atlântica para anuros é essencial para estudos mais amplos abordando a história evolutiva do grupo e também para propor medidas mais eficientes de conservação. O objetivo desse estudo foi analisar o cenário atual de distribuição geográfica dos anfíbios anuros na Mata Atlântica, identificando unidades biogeográficas, testando o modelo vicariante, avaliando se padrões e processos da diversidade do grupo estão sendo conservados, e propor áreas prioritárias para conservação. Utilizamos como base de dados os polígonos corrigidos da União Internacional de Conservação da Natureza IUCN e a análise de Elementos Bióticos (EB) para identificar as unidades biogeográficas. O programa Zonation foi utilizado para propor as áreas prioritárias para conservação, utilizando como base as áreas de proteção (APs) disponibilizadas pela IUCN e o mapa de uso de solo disponibilizado pela ESA Climate Change Initiative. Recuperamos 21 elementos bióticos. As predições do modelo vicariante foram válidas, com espécies irmãs presentes em EBs diferentes. Em média, os EBs apresentam 33% de remanescentes florestais, mas apenas 12% de suas áreas totais estão protegidas por áreas de proteção. As áreas mais problemáticas em relação à proteção por APs e perda de habitat encontram-se nas porções mais afastadas do litoral, áreas noroeste e sudoeste da Mata Atlântica, locais que devem ser, portanto considerados como áreas prioritárias para conservação. The global biota is distributed non-randomly forming geographic distribution patterns. One of the processes explaining these distributions is vicariance, in which a geographic barrier is responsible for fragmenting the geographical distribution of a population. Thus, two populations would be isolated, and with time may originate two sister species. Species that coexist in a certain area form biogeographic units. Examples of widely distributed biogeographic units are the morpho-climatic domains, such as the Atlantic Forest. The highest diversity of anuran amphibians around the world is found in the Atlantic Forest. However, this domain is highly explored since the beginning of the South America colonization. The high rates of habitat loss and fragmentation in this domain has been contributing even more to the population decline of amphibians and the possible mass extinction of this group. Identifying internal biogeographic units for the Atlantic Forest for anurans is essential for further studies including the evolutionary history of the group and also for proposing efficient conservation plans. The aim of this study was to analyse the current scenario of anuran amphibians in the Atlantic Forest, identifying biogeographic units, to test the vicariance model predictions, to evaluate if diversity patterns and processes have been conserved, and to propose priority conservation areas. We use the revised polygons of the International Union for Conservation of Nature (IUCN) as a database. We used Biotic Element (BE) analysis to identify biogeographic units, and the Zonation software to propose priority areas for conservation, based on the protected areas (PAs) made available by IUCN and the land use map made available by ESA Climate Change Initiative. We recovered 21 biotic elements. The predictions of the vicariance model were valid, with sister species present in different EBs. On average, EBs had 33% of forest remnants, but only 12% of its total area was protected by PAs. The most problematic areas in relation to protection by PAs and habitat loss inland areas, in northwestern and southwestern regions of the Atlantic Forest, which should be considered priority areas for conservation.

Submitted by José Thales Da Motta Portillo (jthalesbio@yahoo.com.br) on 2019-04-19T17:28:35Z No. of bitstreams: 1 Tese_José Thales da Motta Portillo.pdf: 1810515 bytes, checksum: e5ac4dfb6051eb92b81526f64b2e1844 (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2019-04-22T13:00:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 portillo_jtm_dr_sjrp.pdf: 1810515 bytes, checksum: e5ac4dfb6051eb92b81526f64b2e1844 (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-22T13:00:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 portillo_jtm_dr_sjrp.pdf: 1810515 bytes, checksum: e5ac4dfb6051eb92b81526f64b2e1844 (MD5) Previous issue date: 2019-03-25 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A Mata Atlântica da América do sul é um mosaico de diferentes fitofisionomias, relacionadas a pressões seletivas correspondentes a fatores ecológicos e evolutivos distintos, os quais regulam a distribuição da biodiversidade entre os habitats. Exploramos, neste trabalho, como a diversidade de serpentes é distribuída ao longo do gradiente latitudinal da Mata Atlântica. Primeiro analisamos a associação entre a riqueza em espécies e a diversidade filogenética de serpentes com tempo para especiação e extensão geográfica ao longo do gradiente latitudinal. Nós também exploramos as amplitudes de nicho climático destas serpentes. E, finalmente, decompusemos a composição filogenética de ilhas costeiras do sudeste da Mata Atlântica no intuito de entender como área e distância com o continente poderia afetar diferentes componentes da diversidade de serpentes. Encontramos que área é o principal fator relacionado com riqueza em espécies, independentemente do tempo para especiação. Observamos a maior riqueza em espécies em linhagens mais recentes nas zonas serranas do sudeste. Amplitudes de nicho climático, associadas à precipitação, mostraram conservação filogenética, afetando a distribuição dos clados mais recentes. Em nosso exemplo de ilhas, mostramos que distintos fatores ecológicos podem afetar riqueza em espécies e diversidade filogenética diferentemente. Desta maneira, fatores idiossincráticos poderiam gerar diferentes respostas em diferentes linhagens ao longo do gradiente latitudinal. Esperamos trazer novas elucidações para fatores ecológicos e históricos relacionados com a distribuição da diversidade de serpentes na região Neotropical. Tal conhecimento é importante para proteger as espécies remanescentes deste tão ameaçado hotspot da biodiversidade, a Mata Atlântica megadiversa da América do Sul. The Atlantic Forest of South America is a mosaic of different vegetation physiognomies corresponding to distinct evolutionary and ecological factors that drive biodiversity distribution. One of these factors is climatic variation. We explored herein how snake diversity, (measured as species richness and phylogenetic diversity) is distributed along the Atlantic Forest latitudinal gradient, taking area and time-for-speciation into account. We first analyzed the association of species richness and phylogenetic diversity with time-forspeciation and geographical extent along the latitudinal gradient. We also explored climatic niche breadths. And finally, we decomposed the phylogenetic composition across coastal islands in southeastern Atlantic Forest, to understand how island area and distance from the mainland drive different components of snake diversity. We found that area is a major driver of species richness, regardless of time-for-speciation. We observed higher species richness of more recent lineages in southeastern mountain ranges. Climatic niche breadths associated to precipitation showed phylogenetic conservatism, affecting the distribution of more recent clades. In our island case study, we show that distinct ecological factors can drive species richness and phylogenetic diversity differently. In this way, idiosyncratic factors generate different responses in different lineages across environmental gradients. We hope to shed some light on ecological and historical factors related with snake diversity in the Neotropical Region. Such knowledge is important to conserve this threatened biodiversity hotspot, the megadiverse Atlantic Forest of South America.

Orientador: Prof. Dr. Fernando Zaniolo Gibran Coorientador: Prof. Dr. Guilherme Henrique Pereira-Filho Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, São Bernardo do Campo, 2019. A herbivoria é uma interação consumidor-recurso comum e importante na estruturação das comunidades, pois afeta a dinâmica das cadeias tróficas e o fluxo de energia. Portanto, nos recifes de corais os peixes herbívoros têm papeis relevantes na estruturação e manutenção das comunidades recifais devido ao forrageamento. Contudo, além de algas, muitos peixes herbívoros também ingerem organismos planctônicos e detritos associados à matriz algal. Visando contribuir à compreensão do papel funcional dos peixes herbívoros da família Acanthuridae em Abrolhos, através de uma abordagem ecomorfológica e evolutiva, analisamos as morfologias relacionadas à herbivoria das três espécies simpátricas comuns e abundantes: Acanthurus bahianus, A. chirurgus e A. coeruleus, que se alimentam através da poda ou raspagem de macroalgas, para responder as seguintes perguntas: (1) quais as diferenças encontradas nas morfologias e pesos das estruturas bucais e tubos digestórios dessas três espécies? (2) tais diferenças refletem diferenças ecológicas com relação ao uso de recursos alimentares e/ou proporção/tipos de itens ingeridos? Para tal realizamos medidas de 14-16 exemplares frescos para cada espécie e extraímos e pesamos as estruturas ósseas bucais de quatro exemplares adultos de cada espécie. Posteriormente removemos e analisamos os respectivos conteúdos estomacais e comparamos os resultados com dados da literatura, também considerando filogenias. As três espécies diferem morfologicamente e tais diferenças refletem diferenças nas composições das dietas. Apesar de os peixes cirurgiões serem geralmente classificados como herbívoros, os conteúdos estomacais sugerem que A. chirurgus e A. bahianus seriam melhores classificadas como onívoras-detritívoras, a depender da disponibilidade dos itens no ambiente, tendo ambas apresentado notáveis quantidades de salpas e esponjas em seus estômagos. Herbivory is a common consumer-resource interaction important for communities structuring as it affects the dynamics of the food chains and the energy flow. Therefore, herbivorous fish have key roles in structuring and maintaining coral reef communities due to foraging. However, in addition to algae, many herbivorous fish also ingest planktonic organisms and detritus associated with the algal matrix. Aiming to contribute to the understanding of the functional role of the herbivorous fish of the Acanthuridae family in Abrolhos reef, through an ecomorphological and evolutionary approach, we analyzed the morphologies related to feeding of three common and abundant sympatric species: Acanthurus bahianus, A. chirurgus and A. coeruleus, which feed by scraping or browsing macroalgae, to answer the following questions: (1) what are the differences in the morphologies and weights of jaw structures and digestive tubes of these three species? (2) do such differences reflect ecological differences in relation to food resources use and/or proportion/types of ingested items? So, we performed measurements in 14-16 fresh specimens for each species and extracted the jaw structures, that were weighed, of four adult specimens of each species. Subsequently we removed and analyzed the respective stomach contents and compared our results with data from the literature, also considering available phylogenies. The three species differ morphologically and such differences reflect differences in diet compositions. Although surgeonfishes are generally classified as herbivores, stomach contents suggest that A. chirurgus and A. bahianus would be better classified as omnivores-detritivorous, depending on the availability of the items in the environment, as both of them had remarkable amounts of salps and sponges in their stomachs.

Orientador: Prof. Dr. Otto Müller Patrão de Oliveira Co-orientador: Prof. Dr. Ricardo Jannini Sawaya Although abundant and ecologically important to the marine pelagial trophic chain, the Siphonophorae (Cnidaria, Hydrozoa) are still a poorly studied group. Better knowledge of geographic distribution patterns of their species in the oceans would provide potential support for a number of other studies about the group, such as ecological, environmental, biogeographical, faunistic and physiological. In this context, the objective of this study was to compile and provide the patterns of the Physonectae (one of the three suborders of Siphonophorae) global geographic distribution from a broad review of the data available in the bibliography and relate them to a proposal for regionalization of surface oceanic waters. The distribution data of the species were compiled from the scientific literature and synthesized in a table. After filtering too generalized data, specific maps were elaborated for each family, besides maps encompassing the distribution of the whole group, its abundance of records and species richness. Then, a table was created relating the distribution data of the different species and families to a zoning scheme of the oceanic waters. Finally, grouping and ordering analyzes were performed to test the data set analyzed in relation to the regionalization scheme of oceanic surface waters. The general Physonectae distribution patterns are related to the sampling effect and abiotic variables such as temperature, bathymetry and primary productivity. In the context of the specific distribution patterns of species and families, these were related to their biological specificities, sea currents and regionalization of oceanic waters. However, in general, the Physonectae geographical distribution patterns did not corroborate the current scheme of oceanic surface waters regionalization, based on the results obtained. The results presented here allow a better understanding of the group's distribution, which are the basis for studies with a variety of approaches to Physonectae. Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, São Bernardo do Campo, 2019. Apesar de abundantes e ecologicamente importantes na cadeia trófica do pelagial marinho, os Siphonophorae (Cnidaria, Hydrozoa) ainda são um grupo relativamente pouco estudado. Um maior conhecimento sobre os padrões de distribuição geográfica de suas espécies nos oceanos traria um potencial suporte para uma série de outros estudos acerca do grupo, tais como ecológicos, ambientais, biogeográficos, faunísticos e fisiológicos. Nesse contexto, este estudo teve como objetivo compilar e disponibilizar os padrões da distribuição geográfica global dos Physonectae (uma das três subordens de Siphonophorae) a partir de uma ampla revisão dos dados disponíveis na bibliografia e relacioná-los a uma proposta de regionalização das águas superficiais oceânicas. Os dados de distribuição das espécies foram compilados da literatura científica e sintetizados em uma tabela. Após filtragem de dados demasiadamente generalizados, foram elaborados mapas específicos para cada família, além de mapas englobando a distribuição de todo o grupo, sua abundância de registros e riqueza de espécies. Em seguida, foi criada uma tabela que relaciona os dados de distribuição das diferentes espécies e famílias, que foram relacionados com um esquema de zoneamento das águas oceânicas. Por fim, foram realizadas análises de agrupamento e ordenação para testar o conjunto de dados analisado em relação ao esquema de regionalização das águas superficiais oceânicas. Os padrões gerais de distribuição geográfica de Physonectae estão relacionados ao efeito de amostragem e a variáveis abióticas, como temperatura, batimetria e produtividade primária. Em relação aos padrões específicos de distribuição das espécies e famílias, os mesmos foram relacionados às especificidades biológicas das famílias e espécies, correntes marítimas e regionalização das águas oceânicas. Entretanto, de forma geral, os padrões de distribuição geográfica dos Physonectae não corroboraram com o esquema vigente de regionalização das águas superficiais oceânicas, a partir dos resultados obtidos. Os resultados aqui apresentados permitem um melhor entendimento da distribuição do grupo, que constituem a base para estudos com variadas abordagens sobre os Physonectae.

Orientadores: Ricardo Jannini Sawaya, Dan Rosauer, Leandro da Silva Duarte Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia e Australian National University Resumo: Geralmente, a biogeografia e a ecologia visam investigar a natureza da desigualdade da distribuição da diversidade em todo o mundo. Além disso, quantificar a diversidade alfa e o endemismo são críticos, por exemplo, para comparações básicas entre assembléias e, assim, para acessar o estabelecimento de comunidades locais. Para a diversidade alfa, uma abordagem usual concentra-se nos relacionamentos de tamanho de área e riqueza de espécies ou nas relações entre riqueza e condições ambientais. Por outro lado, a diversidade beta está frequentemente relacionada à variação ambiental entre as assembléias. A principal explicação seria que, a diferença de heterogeneidade biofísica entre as regiões afeta a disponibilidade do nicho ecológico local e, consequentemente, a ocorrência das espécies e em cada assembléia. Neste contexto, investigamos se existem padrões de diversidades alfa e beta anuros dentro de cada domínio da vegetação (biomas) e se os possíveis padrões mostram estruturas homogêneas ou divididas, congruentes com as ecorregiões. Constatamos que a Mata Atlântica possui a maior riqueza de espécies, espécies e endemismo filogenético, enquanto o Cerrado e a Caatinga apresentam a maior diversidade filogenética. Estes resultados foram principalmente congruentes com os estudos de diversidade alfa e endemismo de outros vertebrados (por exemplo, anuros, cobras, mamíferos), demonstrando a forte associação da composição de vertebrados com essas ecorregiões, apontando para processos ecológicos e históricos semelhantes influenciando a diversidade de vertebrados. Abstract: Geralmente, a biogeografia e a ecologia visam investigar a natureza da desigualdade da distribuição da diversidade em todo o mundo. Além disso, quantificar a diversidade alfa e o endemismo são críticos, por exemplo, para comparações básicas entre assembléias e, assim, para acessar o estabelecimento de comunidades locais. Para a diversidade alfa, uma abordagem usual concentra-se nos relacionamentos de tamanho de área e riqueza de espécies ou nas relações entre riqueza e condições ambientais. Por outro lado, a diversidade beta está frequentemente relacionada à variação ambiental entre as assembléias. A principal explicação seria que, a diferença de heterogeneidade biofísica entre as regiões afeta a disponibilidade do nicho ecológico local e, consequentemente, a ocorrência das espécies e em cada assembléia. Neste contexto, investigamos se existem padrões de diversidades alfa e beta anuros dentro de cada domínio da vegetação (biomas) e se os possíveis padrões mostram estruturas homogêneas ou divididas, congruentes com as ecorregiões. Constatamos que a Mata Atlântica possui a maior riqueza de espécies, espécies e endemismo filogenético, enquanto o Cerrado e a Caatinga apresentam a maior diversidade filogenética. Estes resultados foram principalmente congruentes com os estudos de diversidade alfa e endemismo de outros vertebrados (por exemplo, anuros, cobras, mamíferos), demonstrando a forte associação da composição de vertebrados com essas ecorregiões, apontando para processos ecológicos e históricos semelhantes influenciando a diversidade de vertebrados. Doutorado Ecologia Doutor em Ecologia CAPES 88881.133449/2016-01 FAPESP 2014/23677-9

Orientadora: Profa. Dra. Simone Rodrigues de Freitas Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, Santo André, 2019. O Cerrado é a maior savana das Américas, além de ser um hotspot devido ao seu alto grau de endemismo, sendo o habitat de um conjunto de plantas e animais particular, muitos deles ainda não descobertos. O Cerrado está sob ameaça de perder uma grande parte da sua biodiversidade devido a mudanças climáticas globais que podem afetar as taxas de precipitação e as temperaturas máximas e mínimas, tanto por mudanças graduais no clima, quanto pelo aumento de eventos extremos. Um dos grupos vegetais mais representativos do Cerrado é a família Asteraceae, comumente encontrada em campos abertos. Uma espécie dessa família em particular, Riencourtia oblongifolia, é uma das mais comuns desse domínio fitogeográfico, além de ser uma espécie herbácea e endêmica do Cerrado. O objetivo desse trabalho é estimar a distribuição potencial de Riencourtia oblongifolia, tanto no atual momento quanto em momentos futuros, levando em consideração, diferentes cenários climáticos para analisar o impacto das mudanças climáticas globais na distribuição da espécie. Pelo banco de dados do GBIF, foram obtidos 366 pontos de ocorrência georreferenciados que foram filtrados a fim de buscar a mitigação do viés de coleta, para então serem utilizados para modelar a distribuição da espécie. Para isso utilizamos quatro modelos estatísticos, sendo dois métodos de regressão (GLM e GAM) e dois de machine learning (MaxEnt e Random Forest). Esses quatro métodos foram os responsáveis por rodar simulações em nove cenários distintos: o clima atual, quatro cenários futuros em 2050 (sendo dois pessimistas e dois otimistas) e mais quatro cenários futuros em 2070 (também com dois pessimistas e dois otimistas). A distribuição potencial foi analisada utilizando parâmetros de sensibilidade e especificidade e reunidas em mapas de consenso. O consenso entre os modelos mostrou uma redução de 60 a 75% do habitat original para as próximas décadas. Visto que esta é uma espécie comum e de ampla distribuição, essa redução pode afetar funções e serviços ecossistêmicos e ter um efeito negativo na distribuição de outras espécies na região. Modelos de distribuição de espécies podem apoiar planos de estratégias de conservação a longo prazo para diferentes táxons animais e vegetais e iluminar a discussão de como melhorar a conservação de biomas ameaçados como o Cerrado. The Cerrado is the biggest savannah in the Americas and home to a diverse set of plants and animals, many of them yet unknown. It is also in danger of losing an important part of its undiscovered biodiversity due to global climate change, which can affect precipitation rates and annual temperature ranges by gradual change as well as increasingly common extreme weather events. One of the most representative plant families of the Cerrado¿s flora is Asteraceae, usually found in dry sunny fields. A particular species, Riencourtia oblongifolia, is one of the most common in this biome, and also an endemic herb. Our aim were to estimate Riencourtia oblongifolia¿s potential distribution in the present time and in future scenarios using two coupled climate models in order to analyze climate change¿s impact upon the species¿ distribution. From the GBIF database we obtained 366 occurrence points for this species, treated them to minimize collector¿s bias, then used this data to model the species¿ potential distribution area using four model methods, comprising two presence-absence methods (GLM and GAM) and two machine learning methods (Maxent and Random Forest). These four models were used to run simulations for nine possible climate scenarios: current climate, four future scenarios in 2050 (two pessimistic and two optimistic) and four future scenarios in 2070 (also two pessimistic and two optimistic). Finally, the potential distribution was analyzed using sensibility and specificity thresholds and summarized into a consensus map of potential future distribution. The consensus between the models shows us marked future habitat reduction for the species. Since it is a common and widespread species, this reduction can change ecosystemic functions and services and have a negative impact in the region¿s species distribution patterns. Species distribution models can help in planning long-term conservation strategies for different animal and plant taxa and shed some light into how to improve conservation of threatened biomes such as the Cerrado.

Submitted by ALBA NAVARRO LOZANO (alba.navarro.lozano@gmail.com) on 2018-04-23T10:34:28Z No. of bitstreams: 1 Tese Final_AlbaNavarro - RepositorioUNESP.pdf: 1311529 bytes, checksum: 514e514f43790a4e6592856a4bfe9bf1 (MD5) Rejected by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 01) Falta o resumo (Obrigatório pela ABNT NBR14724) Problema 02) Falta o sumário (Obrigatório pela ABNT NBR14724) Problema 03) É necessário que você submeta o arquivo integral no formato PDF (Portable Document Format) e não esteja protegido; na verificação a Biblioteca que processa a edição do parcial e integral. Problema 04) Falta a cidade na capa, folha de rosto, folha de aprovação. Problema 05) Há dua folhas em branco no seu arquivo, a segunda e a última folha; o arquivo não pode conter páginas em branco. Problema 06) As folhas de rosto, ficha catalográfica e folha de aprovação não devem ser numeradas. Na página da Seção de pós-graduação, em Instruções para Qualificação e Defesas de Dissertação e Tese, você pode acessar o modelo das páginas pré-textuais, as teses e dissertações do Ibilce/Unesp devem estar em acordo com a norma ABNT NBR 14724:2011 Lembramos que o arquivo depositado no repositório deve ser igual ao impresso. Agradecemos a compreensão on 2018-04-23T18:49:07Z (GMT) Submitted by ALBA NAVARRO LOZANO (alba.navarro.lozano@gmail.com) on 2018-04-24T08:26:44Z No. of bitstreams: 1 TeseAlbaNavarro_RepositorioUNESP.pdf: 3434754 bytes, checksum: 70f61309b4a5b53a8fad4708eb1f25ac (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2018-04-24T18:38:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lozano_an_dr_sjrp_par.pdf: 763709 bytes, checksum: 7f93d04a837a47e42798d61c46ca6952 (MD5) Made available in DSpace on 2018-04-24T18:38:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lozano_an_dr_sjrp_par.pdf: 763709 bytes, checksum: 7f93d04a837a47e42798d61c46ca6952 (MD5) Previous issue date: 2018-03-27 Asociación Universitaria Iberoamericana de Postgrado (AIUP) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) O fungo quitridio Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) é considerado uma das principais causas do declínio global dos anfíbios. Bd já foi encontrado em quase 700 espécies de anfíbios de todo o mundo. Embora muitos estudos tenham sido publicados desde a sua descrição em 1999, ainda há muito a ser conhecido, particularmente em relação à sua ecologia. Nossos objetivos neste estudo foram: (i) analisar os fatores bióticos e abióticos que regulam a prevalência e a intensidade de infecção de Bd em girinos que habitam poças e riachos no Núcleo Curucutu do Parque Estadual da Serra do Mar, sudeste da Mata Atlântica brasileira; (ii) compreender qual será o efeito das mudanças climáticas na distribuição potencial de Bd na Mata Atlântica brasileira; (iii) avaliar o uso de deformidades orais em girinos como indicadores confiáveis para a determinação de infecção por Bd; e (iv) criar uma ferramenta de divulgação para promover a transferência de conhecimento sobre Bd entre a universidade e a sociedade brasileira. Detectamos que a prevalência e a intensidade de Bd não diferiu entre poças e riachos, mas são regulados por diferentes fatores ambientais. Em riachos, a velocidade da água e a profundidade explicaram a variabilidade na prevalência de Bd, mas a intensidade permaneceu inexplicada. Por outro lado, a densidade do zooplâncton foi o fator chave para explicar a prevalência e a intensidade em poças. Estimamos que, hoje, cerca do 60% da área da Mata Atlântica brasileira apresenta condições climáticas adequadas para a ocorrência de Bd, porém diferentes cenários de aquecimento global para o ano de 2070 diminuiriam essas áreas entre um 27.5 e 42.6%. Também demonstramos que as deformidades orais em girinos não são um indicador confiável para o diagnóstico da quitridiomicose em girinos de anfíbios anuros, e que não devem ser utilizadas como ferramenta de diagnóstico isoladamente. Desenvolvimos uma página de internet (www.quitribrasil.com) para a divulgação de todos os casos de Bd relatados no Brasil. As informações geradas por estes trabalhos podem melhorar a compreensão da ecologia e distribuição de Batrachochytrium dendrobatidis em um dos biomas mais ricos e com as maiores taxas de endemismo de anfíbios no mundo. The chytrid fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) is considered one of the main cause of global amphibian declines. Bd has been reported in nearly 700 species of amphibian worldwide. Although many studies have been published since its description in 1999, there is still much to be known, particularly regarding to its ecology. In this study, we aim to: i) analize biotic and abiotic factors that regulate prevalence and intensity of Bd infection in tadpoles inhabiting lentic and lotic habitats, in Nucleo Curucutu of the Parque Estadual da Serra do Mar, southeastern Brazilian Atlantic Forest; ii) understand the effect of climate change in potential future distribution of Bd in the Brazilian Atlantic Forest; iii) evaluate the use of oral deformities in tadpoles as reliable proxies for the determination of infection by Bd; and iv) create an outreach tool to communicate the knowledge of Bd from university to Brazilian society. We detected that the prevalence and intensity of Bd did not differ between ponds and streams but were driven by different environmental factors in the two habitats. In streams, water velocity and depth explained variability in Bd prevalence, but Bd intensities remained unexplained. On the other hand, zooplankton density was the key factor in explaining Bd prevalence and intensity in ponds. We estimated that currently, about 60% of the Atlantic Forest area shows climatic suitability for Bd occurrence; but in global warming scenarios for 2070 those suitable areas will decrease by between 27.5 and 42.6%. We also showed that oral deformities in tadpoles are not a trustworthy indicator for chytridiomycosis diagnosis in tadpoles of anuran amphibians, and should not be used in isolation as a diagnosis tool. We developed and launched one internet webpage (www.quitribrasil.com) to communicate all Bd cases reported in Brazil. Information generated by our study could improve the knowledge of ecology and distribution of Batrachochytrium dendrobatidis in one of the richest biomes with greatest values of endemism of anuran amphibians in the world. FAPESP 2014/23677-9

Orientador: Ricardo Jannini Sawaya Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Anfíbios anuros que se reproduzem em poças são organismos de ciclo de vida complexo com distribuição discreta no espaço, o que os torna um grupo interessante para o estudo de ecologia de comunidades. Apesar de adultos escolherem poças com características adequadas para o desenvolvimento de girinos, adultos e larvas têm diferentes relações com o meio abiótico e interações com outras espécies. Esses processos bióticos e abióticos podem influenciar a co-ocorrência de espécies em comunidades biológicas, e evidências da atuação desses processos podem ser obtidas a partir da identificação de padrões funcionais e filogenéticos entre as espécies. Desta forma, nosso objetivo foi compreender como a co-ocorrência de espécies é influenciada por variáveis ambientais e distância funcional e filogenética de larvas e adultos numa metacomunidade de anfíbios anuros no sudeste do Brasil. Para isso, amostramos dez na Reserva Municipal da Serra do Japi por cinco meses entre novembro de 2014 e março de 2015. Neste período, coletamos dados referentes à qualidade da água e características externas das poças. Medimos atributos funcionais das espécies relacionados ao nicho ecológico, características reprodutivas de adultos (canto e utilização do espaço em atividade reprodutiva) e caracteres ecomorfológicos de girinos. Geramos filogenias para cada estágio a partir de hipóteses filogenéticas disponíveis para anuros. Medimos o sinal filogenético nos atributos para avaliar a congruência de diferenças ecológicas e evolutivas entre as espécies. Em seguida, testamos como diferentes padrões de ocorrência se relacionaram às distâncias ambientais entre poças, às distâncias filogenéticas e funcionais entre espécies e à correlação ambiente - distâncias funcionais e ambiente - filogenia. A co-ocorrência de espécies foi influenciada pela qualidade da água e área das poças, e apenas variáveis da água foram correlacionadas à distância funcional e filogenética em ambos os estágios. Para girinos, nitrato e pH se relacionaram à estrutura agregada e dispersa, respectivamente. Para adultos, a área influenciou a ocorrência das espécies independentemente de diferenças filogenéticas e funcionais, e apenas o pH se relacionou à co-ocorrência de espécies funcional e filogeneticamente próximas. Portanto, a qualidade da água é um importante fator determinando a co-ocorrência de espécies, influenciando ambos estágios de vida. O estudo da reprodução das espécies pode fornecer evidências de como ocorre a montagem de comunidades biológicas Abstract: Pond-breeding anuran amphibians are organisms with complex life cycle and discrete spatial distribution, which makes it an interesting group for the study of community ecology. Although adults choose suitable ponds for larval development, each life stage deals with different selective agents and species interactions. The use of functional traits and phylogenies in community ecology allows to infer possible processes involved in community organization, such as environmental filters and species interactions. Our objective was to understand how environmental variables and interactions among species are related to functional and phylogenetic structure in both life stages, tadpoles and adults, in an anuran metacommunity in the Japi Mountain Range, Jundiaí, São Paulo, Southeastern Brazil. We sampled ponds located both inside and adjacent to a municipal reserve. We sampled environmental variables related to water quality and external structure of the ponds, and used as species traits, a proxy for their ecological niches, adult reproductive features (related to call emission and space use) and ecomorphological traits in tadpoles. We used phylogenies for both life stages, and metrics of phylogenetic signal to infer ecological and evolutionary differences among species. We then test how different patterns of occurrence were associated with environmental differences between ponds, with functional and phylogenetic distances between species and with the envinronment ¿ functional distance and environment ¿ phylogenetic distance correlations. Species coococurrence was influenced by water quality and pond area, and only water variables were related to functional and phylogenetic structure in both stages. Among tadpoles, nitrate and pH were respectively associated to aggregated and overdispersed phylogenetic structure. Among adults, pond area influenced species coocurrence regardless functional and phylogenetic differences, and only pH was related to functional and phyogenetic structure in this stage. Therefore, water quality is an important factor in structuring species coocurrence in Japi Mountain range, by influencing both life stages. The study of species reproduction may provide evidence on how biological communities assemble Mestrado Ecologia Mestre em Ecologia CNPQ 131477/2015-3

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) A macroecologia enfoca as relações entre os organismos e seus ambientes em amplas escalas espaciais e temporais. Uma de suas abordagens é a análise de padrões de distribuição de caracteres no espaço. Nesse contexto, várias regras ecogeográficas foram propostas relacionando caracteres morfológicos com a distribuição das espécies, como é o caso das regras de Bergmann, Jordan e Foster. A regra de Bergmann propõe uma relação positiva entre o tamanho do corpo e a latitude. A regra de Jordan propõe uma relação negativa entre o número de vértebras e a temperatura, e a regra das ilhas de Foster sugere que espécies apresentem tamanho do corpo diferenciado quando isoladas em ilhas. Embora tais regras tenham sido demonstradas para diversos organismos, outros ainda são muito pouco estudados, como é o caso das serpentes. Este estudo testou a aplicação destas regras em espécies e populações continentais e insulares de serpentes do complexo Bothrops jararaca (Viperidae). As seguintes hipóteses foram testadas: 1) serpentes que habitam maiores latitudes possuem menor tamanho do corpo e menor número de escamas ventrais, seguindo o inverso das regras de Bergmann e Jordan; 2) entre as variáveis climáticas, a temperatura deve ser correlacionada com essas variações morfológicas; 3) as espécies e populações insulares apresentam tamanho do corpo diferenciado, conforme a regra de Foster; e 4) a alteração no tipo da dieta deve ser importante para as modificações no tamanho do corpo das serpentes insulares. A partir de análises de regressão espacial foi possível identificar os seguintes padrões: animais de maiores latitudes apresentaram menor comprimento rostro-cloacal, menor número de escamas ventrais e maior robustez. Em relação às variáveis climáticas testadas, a variância da robustez foi mais relacionada à precipitação do mês mais chuvoso, e a variância do comprimento do corpo e número de escamas à precipitação do mês mais seco. Conforme proposto, o comprimento e o número de escamas ventrais reverteram às regras de Bergmann e Jordan. Entretanto, a robustez seguiu a regra de Bergmann, aumentando em maiores latitudes. As populações e espécies insulares evoluíram ao nanismo em sete das oito ilhas estudadas, corroborando a regra de Foster. Adicionalmente, detectou-se que as populações insulares cuja dieta é restrita a presas ectotérmicas apresentaram menores tamanhos corporais, corroborando a hipótese da alteração de dieta, proposta como mecanismo responsável pela modificação do tamanho do corpo em espécies insulares. Assim, este estudo contribuiu para a detecção de padrões macroecológicos de serpentes neotropicais e discutiu os possíveis processos evolutivos relacionados a esses padrões. Macroecology focuses on the relationship between organisms and their environments in broad spatial and temporal scales. One of its approaches is the analysis of geographical patterns in the morphological traits. Several ecogeographical rules have been proposed by relating morphometric characters with geographic distribution, such as Bergmman, Jordan and Foster?s rules. The Bergmann?s rule has proposed a positive relationship between body size and latitude. The Jordan?s rule, a negative relationship between the vertebrae number and temperature, and Foster?s rule posits that insular species have different body size. Although these ecogeographical rules have been demonstrated for different taxa, others are still poorly investigated, such as snakes. This study tested the application of these rules in species and populations of snakes from Bothrops jararaca complex (Viperidae). The following hypotheses were tested: (1) snakes inhabiting higher latitudes have smaller body size and lower number of ventral scales, reversing Bergmann and Jordan?s rules; (2) among climatic variables, temperature should be correlated with these morphological changes; (3) insular species and populations have different body size, according to Foster?s rule; and (4) changes in diet type may be the main reason for body size shifts in insular snakes. By performing spatial regression analysis, the following patterns were identified: snakes inhabiting higher latitudes had lower snout-vent length, fewer numbers of ventral scales and were stouter. Variance in stoutness was associated with precipitation of wettest month, while other characters were explained by the precipitation of driest month. As proposed, both length and number of ventral scales reversed Bergmann and Jordan?s rules. Nevertheless, stoutness corroborated the Bergmann?s rule, increasing with latitude. Seven from eight insular populations have evolved to dwarfism, corroborating the Foster?s rule. Moreover, it was detected that smaller body size populations only feed on ectothermic preys, corroborating the diet alteration hypothesis, proposed as the main mechanism responsible for body size shifts in insular species. Hence, this study contributed by detecting macroecological patterns of neotropical snakes and discussed the possible evolutionary process related to these patterns. FAPESP: 2011/50206-9 Dados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016)

Orientador: Ricardo Jannini Sawaya Texto em português e inglês Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Indivíduos e espécies não são distribuídos aleatoriamente no espaço. Consequentemente, as metacomunidades formadas por tais organismos também apresentam uma organização espacial. Associado a isso, poucas espécies conseguem se distribuir na maioria dos ambientes possíveis. Portanto, as metacomunidades possuem uma variação em sua composição que pode ser espacialmente organizada, ou seja, existem locais que são mais similares em termos de composição de espécies do que outros. Robert Whittaker nomeou esse fenômeno como o componente beta da diversidade, ou simplesmente, diversidade beta. Entender quais processos geram e mantêm os padrões espaciais da diversidade beta é, portanto, uma questão central em ecologia de comunidades, além de auxiliar na proposição de formas apropriadas de manejo e conservação. O objetivo deste estudo foi descrever padrões de diversidade beta de anfíbios anuros das planícies costeiras do Sudeste do Brasil e investigar os possíveis processos que influenciam os padrões de diversidade detectados. A dissertação está dividida em dois capítulos. No primeiro capítulo, descrevo a diversidade beta de anuros da região de estudo e avalio como esses padrões estão protegidos atualmente, por unidades de conservação. No segundo capítulo, busco entender como múltiplos preditores poderiam estar relacionados com a variação na composição de espécies da região de estudo, dado o embasamento teórico e empírico da potencial influência de tais preditores sobre a diversidade de anuros. Os resultados do primeiro capítulo mostraram que existe um padrão claro de organização espacial na diversidade beta, estruturada em três áreas de forma congruente com a história geomorfológica da região. Os resultados evidenciam ainda, que a atual rede de unidades de conservação inclui padrões de diversidade beta semelhante às áreas não protegidas. No entanto, a representatividade dessas unidades em termos de área (~ 4000 km²) é pequena (11.3%). Os resultados do segundo capítulo demonstram a importância de diferentes preditores, incluindo clima, história geomorfológica e processos espaciais em diferentes escalas, para explicar a variação espacial da composição de espécies de anuros. Dentre esses preditores, as unidades geomorfológicas foram predominantemente importantes para explicar a diversidade beta. No entanto, outros processos que foram também importantes para a estruturação das comunidades, como o gradiente climático presente dentro das unidades geomorfológicas, possivelmente gerados pela estrutura geomorfológica da região e pela presença da Serra do Mar. Nossos resultados podem apresentar implicações práticas relacionadas à escolha de potenciais áreas para a conservação das planícies costeiras do Sudeste brasileiro. Tendo em vista a conservação dos padrões de diversidade beta e de seus processos subjacentes, associado à falta representatividade de em termos de tamanho de áreas protegidas na porção central do litoral paulista, sugerimos que tais áreas sejam priorizadas no planejamento e implementação de novas unidades de conservação Abstract: Individuals and species are not randomly distributed in space. Hence, the communities composed by these species also show a spatial organization. Moreover, only few species can occur in many of the available environments. Therefore, the communities present a variation in their composition which can be spatially structured, that is, there are sites more similar each other in terms of species composition than other ones. Robert Whittaker named this phenomenon as the beta component of diversity or, simply, the beta diversity. The understanding of which processes generate and maintain beta diversity is a central question of the community ecology, also helping in the proposing and applying proper ways to its conservation and management. The aims of this study were to describe the anuran beta diversity patterns of coastal plains from southeastern Brazil and assess potential processes which influence such patterns. This study comprises two chapters. In the first one, I described aspects of the anuran beta diversity in the study region and evaluated how these patterns are protected in conservation units. In the second one, I seek to understand how multiple predictors could be related with the variation in species composition, given the theoretical and empirical framework on the influence of such predictors upon anuran diversity. The results of the first chapter showed a clear spatial pattern in the variation of species composition divided in three main areas that are congruent with the geomorphological history of the region. Still, we showed that the actual network of protected areas include similar beta diversity patterns to unprotected areas. However, the representativeness of these conservation units defined as the covered area (~ 4000 km²) is very small (11.3%). The results of the second chapter demonstrated the relative importance of distinct predictors, including climate, geomorphological history and spatial scales, to explain the spatial variation of the anuran species composition. The beta diversity is mainly associated with spatial structure of geomorphological units. However, other processes are also important in structuring anuran communities, such as climatic gradients possibly related to the geomorphological structure and the presence of Serra do Mar range and also broad scale processes. Our results have practical implications related to the choice of potential areas to coastal plains conservation in southeastern Brazil. In order to conserve the beta diversity patterns and their related processes, associated to unequal representativeness defined by the size area of protected areas, mainly on the central portions of São Paulo state coast, we suggested these areas as priorities in the planning and implementing of new conservation units Mestrado Ecologia Mestre em Ecologia

Orientador: Ricardo Jannini Sawaya Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Em termos gerais, comunidades biológicas podem ser estruturadas por elementos que ocorrem em escalas espaciais diversas, que incluem fatores bióticos (e.g., competição e predação); fatores abióticos (e.g., heterogeneidade ambiental), históricos (e.g., eventos de extinção e colonização; e dinâmicas neutras (e.g., dispersões e extinções locais e aleatórias). Uma das formas mais interessantes de se estudar a estrutura de comunidades é a partir da investigação de como diferentes processos e mecanismos influenciam diferentes escalas ou componentes da biodiversidade. Por exemplo, o componente da diversidadebeta, uma medida de dissimilaridade entre comunidades, primariamente avaliada através da presença e ausência das espécies em cada comunidade. Outra forma utilizada por ecólogos para compreender a estrutura de comunidades é avaliar a estrutura filogenética das comunidades. Através da avaliação dessas propriedades e quais possíveis fatores a influenciam, se torna possível compreender as regras de montagem e manutenção de comunidades. Nesse contexto, nossos objetivos gerais nessa dissertação foram: estimar a diversidade beta de anuros das planícies costeiras paulistas em seus diferentes componentes: funcional, taxonômico e filogenético; examinar quais preditores espaciais e ambientais melhor explicam a variação nos três componentes da diversidade avaliadas; avaliar a estrutura filogenética e funcional das comunidades de anuros; testar a conservação filogenética de atributos nos girinos para melhor compreensão da estrutura filogenética e funcional; e analisar quais preditores ambientais explicam melhor a variação na estrutura filogenética e funcional dos anuros. Encontramos que os preditores que mais explicam a variação nas diferentes faces da diversidade beta estudadas aqui (i.e. taxonômica, funcional e filogenética) são as variáveis espaciais. Esse resultado demostra a existência de uma clara x estrutura espacial nas diferentes faces diversidade beta de anuros nas planícies costeiras da mata atlântica no estado de São Paulo. Embora bem menos importante, as variáveis ambientais selecionadas (e.g. condutividade da água, pH e estrutura vegetal) também explicam uma fração importante da variação dos diferentes componentes da diversidade beta de anuros. As variações da diversidade beta taxonômica, funcional e filogenética dos girinos apresentam uma estrutura semelhante espacial assim como ambiental. Esse resultado pode estar revelando que processos, espaciais ou ecológicos, semelhantes, podem estar estruturando a diversidade beta de anuros nas planícies costeiras. Outro resultado interessante é que encontramos foi que das 33 comunidades avaliadas, 17 apresentam uma clara estrutura filogenética (agrupamento filogenético) e 12 apresentaram uma estrutura funcional agregada. A diversidade de atributos dos girinos é significantemente concentrada em poucos nós e próximos da raiz da filogenia, demostrando que girinos apresentam conservação filogenética de atributos na região estudada. Uma significante parte da variação na estrutura filogenética das comunidades é explicada por seis variáveis ambientais selecionadas, tais como a presença de potenciais predadores, diversidade de vegetação externa, cobertura de dossel, variáveis importantes, dentre as cinco selecionadas, para a estrutura funcional. Todas essas variáveis são importantes para o desenvolvimento, sobrevivência e consequentemente a ocorrência de anuros. Assim, estes resultados demonstram o importante papel dos processos ecológicos (filtros ambientais) e evolutivos (conservação filogenética de atributos) na estrutura funcional, refletida até mesmo na estrutura filogenética de anuros em planícies costeiras Abstract: Generally, biological communities can be structured by elements that occurring in different spatial scales, which include biotic factors (e.g., competition and predation); abiotic factors (e.g., environmental heterogeneity); historical (e.g., colonization and extinction events); and neutral dynamics (e.g., local and random dispersal and extinctions). One of the most interesting approaches to study the structure of communities is based on the investigation of how different processes and mechanisms influence different scales or components of biodiversity. Such as the beta diversity component, a measure of dissimilarity between communities primarily assessed through the presence and absence of species in each community. Another method used by ecologists to understand the structure of communities is the evaluation of the phylogenetic and functional structure of the community. Through the assessment of these properties and the possible factors that may influencing it, is possible to comprehend the rules for assembly and maintenance of communities. In this context, our general objectives in this dissertation were: estimate the tadpoles¿ beta diversity from coastal plains of São Paulo states, in its different components: functional, taxonomic and phylogenetic; examine spatial and environmental predictors that best explain the variation in the three evaluated components of the beta diversity; assess the phylogenetic and functional structure of tadpoles¿ communities; test the traits phylogenetic conservation of tadpoles to better understand the phylogenetic and functional structure; and investigate the environmental predictors that better explain the variance in phylogenetic and functional structure of tadpoles¿ communities. We found that the spatial predictors explain more variation in the different faces of beta diversity studied here. This result demonstrates the existence of a clear spatial structure in different components of tadpoles¿ beta diversity in the coastal plains of the Atlantic Forest in the state of São Paulo. Although much less important, the selected environmental variables (e.g., water conductivity, pH and vegetation structure) also explain an important fraction of the variation in the different components of beta diversity. The variance of taxonomic, functional and phylogenetic tadpoles¿ beta diversity showed a similar spatial structure as well as environmental structure. This result could be revealing that processes similar (spatial or ecological) may be structuring beta diversity of anuran in the coastal plains. Another interesting result is that out of 33 communities assessed, 18 showed phylogenetic structure (phylogenetic clustering) and 12 displayed an aggregated functional structure. Furthermore, the diversity of tadpoles¿ traits is significantly concentrated in a few nodes and close to the root of the phylogeny, showing that tadpoles present traits phylogenetic conservation in the study area. A significant part of the variation in the phylogenetic structure of communities is explained by six environmental variables selected, such as presence of potential predators, external vegetation structure diversity and canopy cover, variables also significant to the functional structure, among the five selected. All variables are significant for development and survival of tadpoles. Thus, these results demonstrate the important role of ecological (environmental filters) and evolutionary processes (phylogenetic conservatism of traits) in functional structure, reflected even in phylogenetic structure of anurans in coastal plains Mestrado Ecologia Mestre em Ecologia

Orientadores: Ricardo Jannini Sawaya, Denise de Cerqueira Rossa Feres Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Anfíbios anuros possuem ciclo de vida complexo e as fases larvais e adultas podem ocupar ambientes totalmente distintos. Isso faz com que cada uma das fases esteja sujeita a diferentes pressões ambientais. Desta forma, girinos e adultos podem seguir caminhos evolutivos diferentes, ainda que apresentem as mesmas relações filogenéticas. O objetivo deste estudo foi investigar os aspectos ecológicos e evolutivos que atuam na estruturação de uma metacomunidade de anuros nas fases adulta e larval. Realizamos o estudo em uma região de Cerrado no sudeste do Brasil. O trabalho está dividido em dois capítulos. No primeiro, testamos se as comunidades de adultos e girinos são concordantes, e analisamos a influência das variáveis ambientais e espaciais na abundância e composição de espécies em cada fase ontogenética. No segundo capítulo, verificamos como a diversidade fenotípica se distribui ao longo da filogenia e como os corpos d'água influenciam a diversidade fenotípica e filogenética das espécies. Além disso, verificamos a evidência de filtros ambientais na montagem das comunidades estudadas a partir da associação entre atributos fenotípicos, relações filogenéticas e variáveis ambientais. Nossos resultados do primeiro capítulo indicam que as comunidades de adultos e girinos são concordantes, ou seja, são distribuídas de maneira similar entre os habitats. As variáveis ambientais foram mais importantes do que as espaciais, sendo a área da superfície e o hidroperíodo dos corpos d'água as características que melhor explicaram a distribuição dos adultos e girinos entre os corpos d'água. A maioria das espécies esteve associada aos habitats temporários de média a longa duração. Locais temporários não apresentam predadores importantes como peixes e retém água por tempo suficiente para a metamorfose dos girinos. No segundo capítulo, verificamos que os atributos fenotípicos nos adultos são mais conservados do que nos girinos. A diversidade fenotípica dos adultos é concentrada em poucos nós da filogenia, enquanto que nos girinos é dispersa pela filogenia. A metacomunidade de adultos é estruturada por filtros ambientais relacionados principalmente aos microhabitats de vocalização. Espécies da família Hylidae que vocalizam empoleiradas, por exemplo, são associadas aos locais com maior diversidade de vegetação na margem dos corpos d'água. Para os girinos não foi observada evidência de filtro ambiental. Além disso, não houve relação clara entre os atributos fenotípicos dos girinos e características ambientais como observado para os adultos. Entretanto, a maioria dos girinos esteve associada a locais que podem oferecer maior disponibilidade de recursos alimentares e menor risco de predação, como corpos d'agua temporários, de dossel aberto e com muita vegetação em seu interior. Concluímos que os adultos determinam a distribuição dos girinos nas comunidades. Entretanto, a escolha do habitat de reprodução é baseada em parte pelos atributos dos adultos, mas também ponderada por locais de melhor desenvolvimento e sobrevivência de sua larva. Nossos resultados ressaltam a complexidade da organização das comunidades de anuros, principalmente no que diz respeito às relações entre as fases ontogenéticas, e contribuem de forma inédita para melhor compreensão da organização de comunidades de animais de ciclo de vida complexo como os anuros Abstract: Anuran amphibians have complex life cycles, and the larval and adult stages can occupy completely different environments. Thus, each stage is subject to different environmental pressures. Tadpoles and adults can follow different evolutionary paths even though they show the same phylogenetic relationships. The aim of this study was to investigate the ecological and evolutionary aspects structuring an anuran metacommunity in both larval and adult stages. We conducted this study in a savanna region in southeastern Brazil. The study comprises two chapters. In the first, we tested if tadpole and adult communities show community concordance. Then we analyzed the influence of environmental and spatial variables on the abundance and composition of species in each ontogenetic stage. In the second chapter, we verified how the phenotypic diversity is distributed throughout the phylogeny, and how water bodies affect phenotypic and phylogenetic diversity of species. Additionally, we verified the evidence of environmental filters acting in the community assembly based on the association among phenotypic traits, phylogeny, and environmental variables. Our results in the first chapter indicated that communities of adults and tadpoles are concordant, because they have a similar distribution across the set of water bodies. Environmental variables were more important than space, because area and hydroperiod of the water bodies were the variables that best explained the distribution of species for both ontogenetic stages. Most species were associated with medium and long-term temporary habitats. Temporary habitats have no important predators like fish and could retain water long enough for tadpoles to achieve metamorphosis. In the second chapter, we find that adult traits are more conserved, which was not observed for tadpoles. The phenotypic diversity of adults is concentrated in a few nodes, while in tadpoles it is widespread throughout phylogeny. The adult metacommunity is regulated by environmental filters related to vocalization microhabitats. Hylidae species that vocalize perched on vegetation, for instance, are associated with greater vegetation diversity on the edge of the water body. Tadpoles were not affected by environmental filters. Furthermore, there was not clear relationship between tadpole traits and environmental characteristics as observed for adults. However, most of the tadpoles were associated with sites that may offer greater availability of food resources and low predation risk, such as open canopy and temporary water bodies with vegetation inside. We conclude that adults determine the distribution of tadpoles. However, even if environmental filters affect adults, the choice of the breeding habitat is based in part by adult traits and also weighted for habitats that promote better development and survival of their larvae. Our results underscore the complexity involved in frog community assembly, particularly regarding the relationship between ontogenetic stages, and thus, contribute to a better understanding of the assembly of complex life cycle communities Mestrado Ecologia Mestre em Ecologia

Orientador: Ricardo Jannini Sawaya Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: A ecologia de populações investiga os fatores que levam a variação das taxas vitais e, consequentemente, no número de indivíduos. Isso inclui testar hipóteses sobre aspectos da história de vida das espécies e entender os fatores que podem modular a dinâmica populacional. No entanto, a obtenção de dados para testar hipóteses pode ser difícil para populações que apresentam probabilidades de detecção < 1, como anfíbios e répteis. A marcação e recaptura é amplamente usada para estimar a detecção e inferir aspectos de dinâmica populacional e testar hipóteses ecológicas. Neste trabalho empregamos a teoria de marcação e recaptura para testar hipóteses relacionadas à ecologia e conservação de populações de anfíbios e répteis. Utilizamos o programa MARK para implementar modelos de populações abertas e fechadas incorporando a probabilidade de detecção dos indivíduos, para obter estimativas de sobrevivência, e outros parâmetros populacionais usando máxima verossimilhança. Organizamos esta tese em quatro capítulos. Iniciamos enfatizando a importância da probabilidade de detecção, além de simular cenários hipotéticos para demonstrar a relação entre esforço de campo, tamanho ótimo amostral e viés amostral. Em seguida comparamos o efeito de duas técnicas de marcação, o corte de artelhos e o implante de microchips, sobre a sobrevivência individual do sapo ferreiro, Hypsiboas faber. No terceiro capítulo estimamos a sobrevivência e o crescimento populacional da jararaca-ilhoa, Bothrops insularis incorporando emigração temporária aos modelos. Além do estudo de taxas vitais e de dinâmica nas populações, a alocação de energia e suas consequências na sobrevivência individual podem ser testadas com modelos de marcação e recaptura. Assim, no quarto e último capítulo consideramos dois caracteres sexuais presentes no sistema de acasalamento dos lagartos, o tamanho da mandíbula e a coloração chamativa, para comparar as estimativas de sobrevivência entre machos e fêmeas do lagarto cauda de chicote, Cnemidophorus cf. ocellifer. . De forma geral, observamos que a probabilidade de detecção individual nos sistemas estudados foi baixa e condizente com a detecção de vertebrados em ambientes tropicais. Além disso, a inclusão de covariáveis na investigação de parâmetros vitais e no processo de detecção é fundamental para o melhor entendimento dos fatores que explicam a dinâmica de uma população. Especificamente observamos que: (i) demonstramos que as taxas que não incorporam a detecção são enviesadas em relação às estimativas que consideram a detecção, (ii) as estimativas de sobrevivência foram similares em indivíduos de Hypsiboas faber marcados com ablação de artelhos e microchips , (iii) Bothrops insularis apresentou baixa probabilidade de sobrevivência anual e crescimento populacional anual negativo. Por fim, (iv) machos maiores do lagarto Cnemidophorus cf. ocellifer apresentaram sobrevivência mensal menor do que machos menores, mas o oposto foi observado para as fêmeas Abstract: Population ecology aims to search for factors that lead to variation in vital rates and consequently, in the number of individuals. This includes testing hypotheses about natural history traits and threats to populations. However, obtaining data to test hypotheses is challenging because following individuals in the field can be difficult, especially for amphibians and reptiles, where detection probabilities are often < 1. Mark-recapture methods are widely used to estimate detection probabilities and to test ecological hypothesis. Here we used mark-recapture methods to test hypotheses related to ecology and conservation of amphibian and reptile populations. We implemented open- and closed-population models in Program MARK, to account for detection probabilities and to calculate survival estimates and other population parameters. We organized this dissertation into four chapters. In the first chapter we emphasize the importance of considering detection probabilities besides simulating hypothetical scenarios to show the relationship between field effort, sample size and precision. In the second chapter we used a Cormack-Jolly-Seber model to compare the effect of two amphibian marking techniques, toeclipping and PIT tagging, on survival in the blacksmith tree frog, Hypsiboas faber. In the third chapter our goal was to estimate survival and population growth of the golden lancehead, Bothrops insularis accounting for temporary emigration using Pollock's Robust Design. Besides the study of vital rates and population dynamics, energy allocation and its consequences for survival are testable with mark-recapture models. Thus, in the last chapter we used two traits from the lizard mating system, namely jaw size and courtship coloration, to compare survival estimates between males and females of the whiptail lizard, Cnemidophorus cf. ocellifer. In summary we observed that detection probability on the studied populations were low and similar to other vertebrate populations from the tropics. However, including covariates in estimation models of vital rates and detection is important to obtain more accurate results to explain population dynamics. Specifically we conclude that (i) return rates were biased low in relation to survival estimates that account for detectability, (ii) the estimates of survival were similar between toe-clipped and PIT tagged individuals of Hypsiboas faber, (iii) Bothrops insularis showed low survival probability and negative annual population growth. And (iv) larger Cnemidophorus cf. ocellifer males showed lower monthly survival probability than smaller males but the opposite was found for females Doutorado Ecologia Doutor em Ecologia

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-31Bitstream added on 2014-06-13T19:28:29Z : No. of bitstreams: 1 serranofilho_s_me_sjrp.pdf: 875658 bytes, checksum: fbc9f9c196455e3df23d6e8822a45bf4 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Neste estudo investigamos a riqueza de espécies de répteis e a diversidade e distribuição dos lagartos que ocorrem na Estação Ecológica de Jataí (EEJ), município de Luiz Antônio, região nordeste do Estado de São Paulo, sudeste do Brasil. A unidade de conservação, de aproximadamente 9.000 ha., está localizada em uma área de ecótono entre o Cerrado e a Mata Atlântica. A coleta regular de dados foi realizada mensalmente durante viagens de cinco dias consecutivos, entre os meses de outubro de 2009 e setembro de 2010. Para a amostragem regular dos dados foram utilizadas armadilhas de interceptação e queda, procura visual limitada por tempo e encontros ocasionais. Para complementar os dados de riqueza de espécies foram incluídos registros prévios das espécies de serpentes encontradas na unidade e no município de Luiz Antônio. Foram registradas 46 espécies de répteis, distribuídos em 38 gêneros e 14 famílias. Entre os lagartos amostrados (N= 168), foram registradas nove espécies, distribuídas em nove gêneros e seis famílias. Entre as serpentes registradas durante amostragem de campo (19 espécies), Crotalus durissus foi a espécie mais abundante (N= 18, 30% do número total de indivíduos de serpentes; N total = 60) e entre os lagartos, a espécie dominante foi Cnemidophorus aff. ocellifer (N= 99; 58,9%) . A riqueza total de répteis Squamata registrada na EEJ se mostrou relativamente elevada para áreas de transição, podendo ser ainda maior se considerados dados referentes a áreas adjacentes. Já a riqueza de lagartos não foi maior do que a encontrada em outros estudos nesta porção dos biomas, podendo estar relacionada à localização periférica da unidade nos biomas estudados. A distribuição das espécies de lagartos na unidade parece estar... We investigated in the present study the Reptile richness and the diversity and distribution of lizards of the Estação Ecológica de Jataí (EEJ), municipality of Luiz Antônio, northeastern region of São Paulo state, southeastern Brazil. This conservation unit has about 9.000 ha. of total area, localized in an ecotone area between the Cerrado and the Atlantic Forest biomes. Regular sampling was carried out monthly during trips with five consecutive days of field sampling, between October 2009 and September 2010. We utilized pitfall traps with drift fence, visual time constrained search and occasional encounters for regular data sampling. We also used previous records of snakes found at EEJ and municipality of Luiz Antônio to complement data on richness. We recorded 46 species of reptiles, distributed in 38 genera and 14 families. We recorded nine species of lizards (N= 168), distributed in nine genera and six families. Crotalus durissus was the most abundant species among snakes (N= 18; 30% of the total number of snakes; N= 60) and Cnemidophorus aff. ocellifer was the dominant lizard species (N= 99; 58,9%). The total richness found at E.E.J seems to be relatively high for transitional areas, and may be even higher considering the fauna of adjacent areas. Lizard richness was similar to those found in this portion of the biomes, which could be related to the peripheral location of the area in these biomes. The distribution of lizards species of E.E.J seems to be structured according to the variation of environmental characteristic related to vegetation and soil structure, but not necessarily related to the different physiognomic forms sampled, with only two species typical of open formations, as campo sujo. The species richness and composition recorded in this study evidences the importance of preservation of fragments like E.E.J to the maintenance of local and regional biodiversity

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-27Bitstream added on 2014-06-13T18:08:53Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_tal_me_sjrp_parcial.pdf: 100660 bytes, checksum: e2d1bb977e1791460e01a462d0fa511f (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-03T16:24:36Z: oliveira_tal_me_sjrp_parcial.pdf,Bitstream added on 2014-10-03T16:27:34Z : No. of bitstreams: 2 oliveira_tal_me_sjrp_parcial.pdf.txt: 40789 bytes, checksum: 4be4ef0798f44f9285bf5eab4a281ade (MD5) 000698175.pdf: 421291 bytes, checksum: e63db4fb8c10673ad3f1ee9c9b5797d2 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-03T16:33:12Z: 000698175.pdf,Bitstream added on 2014-10-03T16:43:26Z : No. of bitstreams: 2 oliveira_tal_me_sjrp_parcial.pdf.txt: 40789 bytes, checksum: 4be4ef0798f44f9285bf5eab4a281ade (MD5) 000698175.pdf: 421291 bytes, checksum: e63db4fb8c10673ad3f1ee9c9b5797d2 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-03T16:48:52Z: 000698175.pdf,Bitstream added on 2014-10-03T16:49:45Z : No. of bitstreams: 1 000698175.pdf: 421291 bytes, checksum: e63db4fb8c10673ad3f1ee9c9b5797d2 (MD5) Bitstreams deleted on 2014-10-27T11:47:03Z: 000698175.pdf,Bitstream added on 2014-10-27T11:48:03Z : No. of bitstreams: 1 000698175.pdf: 421291 bytes, checksum: e63db4fb8c10673ad3f1ee9c9b5797d2 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Dois dos maiores desafios da ecologia de comunidades são encontrar padrões a respeito dos grupos de espécies que vivem em seus ambientes e entender os processos que produzem os padrões atuais. Nesse sentido, estudos que descrevam as comunidades biológicas, explorando os padrões de distribuição das espécies em diferentes escalas espaciais e temporais e que analisem o que poderia influenciar essa distribuição, são de grande interesse geral e nos fornecem importantes informações das espécies e habitats que conhecemos. Dessa forma, esse trabalho visa compreender a estrutura de uma comunidade de anfíbios anuros em uma área de ecótono entre cerrado e floresta estacional no nordeste do Estado de São Paulo (Estação Ecológica de Jataí – EEJ). Essas fisionomias no Estado de São Paulo sofreram intensamente a ação de fragmentação e perda de habitat, devido principalmente à urbanização, pecuária e cultivo de monoculturas como a cana-de-açúcar. A área de estudo é a maior unidade de conservação do bioma Cerrado no Estado de São Paulo e apresenta uma interessante área de estudo devido à configuração espacial da área, uma transição entre mosaico de fisionomias de Cerrado e Floresta Estacional. O objetivo do trabalho foi descrever a diversidade da anurofauna terrícola e entender os padrões de distribuição de abundâncias das espécies e de coocorrência. Além desses objetivos, e devido ao viés encontrado na maioria dos trabalhos de ecologia de comunidades que avaliam a influência de descritores dos habitats aquáticos sobre a riqueza e abundância de anfíbios anuros, nosso trabalho também visa compreender os efeitos das características dos habitats terrestres sobre a abundância da anurofauna avaliando quais características do meio físico, como cobertura do dossel, porcentagem... Two of the biggest challenges in community ecology are the capacity to find patterns in groups of species that live in their environment and to understand the processes that produce these patterns. Accordingly, studies describing the biological communities, exploring their species distribution patterns at different spatial and temporal scales and analyzing what factors influence the distribution of species, are of great interest and provide important information of the species and habitats that we know. Thus, this study aims to understand the structure of a community of frogs and toads in an area of ecotone between savanna and semideciduous forest in the northeastern of São Paulo state (Jataí Ecological Station - JEE). These physiognomies in the state of Sao Paulo suffered intense fragmentation and habitat loss, primarily due to urbanization, livestock and cultivation of monocultures as sugarcane. The study area are the largest protected area of Cerrado in São Paulo state, and presents an interesting area of study due to the spatial configuration of transition between a mosaic of Cerrado and a Floresta Estacional. The aim of this study was to describe the diversity of terrestrial frogs and toads and to understand the patterns of species abundance distributions and co-occurrence. Besides these goals, and due to the bias found in most studies of community ecology to assess the influence of descriptors of aquatic habitats on the richness and abundance of amphibians, our work also aims to understand the effects of the features of terrestrial habitats on the frog’s abundance examining which features of the physical environment, such as canopy cover, percent cover soil, distance from the nearest body of water, could better predict the abundance of anurans. For this purpose, we installed pitfall traps with drift fences... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-16Bitstream added on 2014-12-02T11:21:33Z : No. of bitstreams: 1 000796546_20143112.pdf: 151390 bytes, checksum: 2cdd9ceb849d403547bf35b62b3da23c (MD5) Bitstreams deleted on 2015-01-05T11:00:53Z: 000796546_20143112.pdf,Bitstream added on 2015-01-05T11:01:49Z : No. of bitstreams: 1 000796546.pdf: 3078084 bytes, checksum: b325495a392fcd35616c530d3155be45 (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) A biogeografia tem como objetivo principal identificar os padrões de distribuição das espécies e propor hipóteses sobre os processos que resultaram nesses padrões. Os padrões de distribuição de espécies não são aleatórios e resultam de eventos históricos. A congruência entre esses padrões de distribuição, ou seja, a sobreposição de distribuição entre dois ou mais táxons, delimitam uma área de endemismo, que é fundamental para a formulação de hipóteses de biogeografia histórica. Áreas de endemismo na Mata Atlântica já foram delimitadas em estudos anteriores, porém nenhum estudo foi desenvolvido com serpentes para essa finalidade. Nesse estudo, foram identificadas 83 espécies endêmicas de serpentes para a Mata Atlântica, e a partir da análise de parcimônia de Endemicidade (PAE) e de endemismo (NDM/VNDM), quatro áreas de endemismo foram propostas: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar e Araucária. A partir da sobreposição de distribuição de serpentes e outros táxons endêmicos, foram definidas outras quatro áreas de endemismo: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião e Brejos de Altitude do nordeste. Essas oito áreas de endemismo foram analisadas em relação aos remanescentes de vegetação e área protegida por unidades de conservação. As espécies que delimitam as áreas de endemismo foram avaliadas em relação a ameaças de extinção de acordo com critérios propostos pela IUCN. Quatro espécies foram consideradas como “Criticamente Ameaçadas”, cinco “Em Perigo”, nove “Vulneráveis”, e sete “quase ameaçadas” de extinção. Essas áreas de endemismo devem ser consideradas como prioritárias para conservação pois representam unidades evolutivas únicas e abrigam serpentes endêmicas e ameaçados de extinção Biogeography aims mainly to identify patterns of species distribution and to propose hypothesis about the process that have shaped those patterns. The distribution patterns are not random and are a result of historical events. The congruence among those distribution patterns, ie the distribution overlap of two or more endemic taxa, delimits an area of endemism, fundamental for formulation of hypothesis in historical biogeography. Areas of endemism in the Atlantic Forest have already been delimited in previous studies. However, there are no studies on snakes for this purpose. In the present study, 83 endemic snake species were identified in the Atlantic Forest. From Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) and Endemism analysis (NDM/VNDM), four areas of endemism were proposed: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar, and Araucária. From the distribution overlap of snakes and other endemic taxa, additional four areas of endemism were defined: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião, and Northestern Brejos de Altitude. These eight areas of endemism were analyzed in order to quantify the vegetation remnants and protected areas in conservation units. The species delimiting areas of endemism were evaluated in the threat of extinction, according to the IUCN criteria. Four species were considered as “Critically Endangered”, five were “Endangered”, nine “Vulnerable”, and seven as “Near Threatened”. Those areas of endemism must be considered as priorities for conservation as they correspond to unique evolutionary unities and harbor endemic and threatened taxa FAPESP: 08/50068-2

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior We study the richness and the spatial distribution of anuran amphibians recorded in Parque Estadual do Turvo (PET), the largest remnant of Mesophytic Semideciduous Forest in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. In this study we (1) describe the composition of community of amphibians in PET, (2) compare the composition of species with those recorded in other localities of Seasonal Forests, testing the hypothesis that localities nearest the Misiones Nucleus support the current proposal of a new phytogeographic unit, known as Seasonal Rain Forest Region , and (3) we tested if the occurrence of breeding pond anurans differed from a null model of random placement, as well as we hypothesized that the environmental heterogeneity and spatial distribution of ponds influences the structure of anuran communities in southern Brazil. The species inventory was carried out using complementary sampling techniques (surveys at breeding sites, casual encounters, pitfall traps and search at scientific collections). To check the spatial distribution, we monitored 14 ponds with variable heterogeneity. We recorded 32 species of amphibians in the Park area, belonging to two orders: Anura, 30 native and one exotic species, and Gymnophiona, one species. The analysis of similarity among the localities of seasonal forests evidenced three groups with similarity of 45%: the former group was composed by localities of southeast and central-western Brazil, the second group was composed by southern localities, and the third group was composed by localities of the transition area with the Atlantic Forest sensu stricto. The second group supports the proposal of a new phytogeographic unit, known as 'Tropical Seasonal Forests Region'. We recorded 15 anuran species at the monitored ponds, and the species occurrence was clearly not random, corroborating our hypothesis that the anuran composition of species is influenced by environmental heterogeneity. The main descriptors of pond heterogeneity correlated with abundance of anuran species were area, depth, hydroperiod, percentage of vegetation cover on water surface, and distance of pond in relation to the nearest Park edges. The community structure of anurans was not affected by the geographical distribution of ponds. The results of the present study demonstrate that the heterogeneity of water bodies is a strong regulator of community structure of breeding pond amphibians and this information has implications for conservation strategies of Neotropical Austral anurans. Estudamos a riqueza e a distribuição espacial da anurofauna registrada no Parque Estadual do Turvo (PET), maior remanescente de Floresta Estacional Semidecidual do estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Nesse trabalho, (1) descrevemos a composição da comunidade de anuros do PET, (2) comparamos a composição da anurofauna com a de outras localidades de Florestas Estacionais, testando a hipótese de que as localidades próximas ao Núcleo Misiones corroboram a nova unidade fitogeográfica, conhecida como Região das Florestas Tropicais Sazonais , e (3), testamos se a ocorrência de espécies de anuros em poças é diferente de um modelo nulo de distribuição randômica, hipotetizando que a heterogeneidade ambiental e a distribuição espacial das poças têm influência sobre a estrutura das comunidades de anuros no sul do Brasil. Para o inventariamento das espécies foram empregadas diferentes técnicas (amostragens em sítios de reprodução, encontros ocasionais, armadilhas de interceptação e queda e consulta a coleções científicas). Para verificar a distribuição espacial, monitoramos 14 poças com heterogeneidade ambiental variável. Foram registradas 32 espécies de anfíbios no Parque e arredores, pertencentes a duas ordens: Anura, 30 espécies nativas e uma exótica e Gymnophiona, uma espécie. A análise de similaridade entre as localidades de Florestas Estacionais apresentou a formação de três grupos com 45% de similaridade entre eles: o primeiro grupo composto pelas localidades do sudeste e centro-oeste, o segundo grupo composto pelas localidades do sul e o terceiro grupo pelas localidades da porção de transição com a Floresta Atlântica sensu stricto. A formação do segundo grupo corrobora a proposta de uma nova unidade fitogeográfica, conhecida como Região das Florestas Tropicais Sazonais . Foram registradas 15 espécies de anuros nas poças, e sua distribuição foi claramente não randômica, corroborando a nossa hipótese de que a composição das espécies é influenciada pela heterogeneidade ambiental. As principais variáveis que estão correlacionadas com a estruturação das poças são: a área, a profundidade, o hidroperíodo, a porcentagem de cobertura vegetal no espelho d água e a distância que se encontravam em relação à borda mais próxima do Parque. A estrutura das comunidades de anuros não foi influenciada pela distribuição espacial das poças. Esse resultado indica que as poças estudadas foram independentes quanto à composição da anurofauna. Os resultados do presente estudo demonstraram que a heterogeneidade dos corpos d água é uma forte reguladora da estrutura de comunidades de anfíbios anuros e essa informação tem implicações para estratégias de conservação da anurofauna Neotropical Austral.

Orientador: Carlos Frederico Duarte da Rocha Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Neste estudo investiguei a riqueza, composição e distribuição local da herpetofauna do Parque Nacional dos Lençóis Maranhenses (PNLM), Maranhão, Brasil. Realizei 47 expedições, totalizando 235 dias de amostragem utilizando o método de procura visual limitada por tempo. Adicionalmente, estudei a ocorrência de atropelamentos de vertebrados na rota de acesso ao parque. Assim, registrei 63 espécies da herpetofauna no PNLM, sendo 21 espécies de anuros, 12 de lagartos, 24 de serpentes, duas de anfisbenas, três de quelônios e uma de jacaré. Destas espécies, 52 (E 82,5%) ocorrem apenas na restinga. As demais espécies ocorrem no campo de dunas do parque. Em relação aos atropelamentos, realizei cerca de 10896 quilômetros de amostragem. Encontrei 206 carcaças de vertebrados atropelados, distribuídas por 55 espécies. O grupo de vertebrado mais atropelado, em número de espécies (23 espécies) e de indivíduos (69 indivíduos), foi a classe Reptilia. Apesar do PNLM ser enfatizado do ponto de vista paisagístico, este estudo mostra que seus ambientes possuem significativa riqueza de espécies da herpetofauna. Estas espécies ocorrem principalmente no ambiente de restinga, o qual corresponde a apenas 21% da área do parque. Devido a crescente visitação turística e do aumento de empreendimentos na área, é importante que ações para a conservação da restinga do PNLM sejam urgentemente implementadas Abstract: Herpetofauna richness, composition and local distribution (sand dunes or restinga habitats) were studied in Lençóis Maranhenses National Park (LMNP), Maranhão state, northeastern Brazil. I carried out 235 days of sampling using the method of visual search limited by time. In addition, I studied road killed vertebrates in the access route to the park (a road that crosses restinga habitats). Thus, I recorded 63 species of the herpetofauna (21 anurans, 12 lizards, 24 snakes, two amphisbaenians, three turtles and an alligator) in LMNP. Fifty-two species (E 82,5%) were found only in restinga habitats. Concerning to road killed animals, I carried out 10896 km of sampling and I found 206 carcasses of vertebrates, corresponding to 55 species. Reptilia was the vertebrate class with the largest number of species (23 species) and individuals (69 individuals) killed. Overall, the great number of species occurring in restinga habitats and high incidence of reptiles road killed in the route to the park, highlight the importance of actions to improve conservation in restinga habitats, which currently comprise only 21% of the total area protected by the park Doutorado Ecologia Doutor em Ecologia