14 results on '"Souza, Ueric José Borges de"'
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2. The complete chloroplast genome of Stryphnodendron adstringens (Leguminosae - Caesalpinioideae): comparative analysis with related Mimosoid species
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Souza, Ueric José Borges de, Nunes, Rhewter, Targueta, Cíntia Pelegrineti, Diniz-Filho, José Alexandre Felizola, and Telles, Mariana Pires de Campos
- Published
- 2019
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3. The Omicron Lineages BA.1 and BA.2 (Betacoronavirus SARS-CoV-2) Have Repeatedly Entered Brazil through a Single Dispersal Hub
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Lamarca, Alessandra P., primary, Souza, Ueric José Borges de, additional, Moreira, Filipe Romero Rebello, additional, Almeida, Luiz G. P. de, additional, Menezes, Mariane Talon de, additional, Souza, Adrieli Barboza de, additional, Ferreira, Alessandro Clayton de Souza, additional, Gerber, Alexandra L., additional, Lima, Aline B. de, additional, Guimarães, Ana Paula de C., additional, Cavalcanti, Andréa Cony, additional, Silva, Aryel B. Paz e, additional, Lima, Bruna Israel, additional, Lobato, Cirley, additional, Silva, Cristiane Gomes Da, additional, Mendonça, Cristiane P. T. B., additional, Queiroz, Daniel Costa, additional, Zauli, Danielle Alves Gomes, additional, Menezes, Diego, additional, Possebon, Fábio Sossai, additional, Cardoso, Franciano Dias Pereira, additional, Malta, Frederico Scott Varella, additional, Braga-Paz, Isabela, additional, Silva, Joice do Prado, additional, Ferreira, Jorge Gomes Goulart, additional, Galvão, Jucimária Dantas, additional, Souza, Leandro Magalhães de, additional, Ferreira, Leonardo, additional, Possuelo, Lia Gonçalves, additional, Cavalcante, Liliane Tavares de Faria, additional, Alvim, Luige B., additional, Souza, Luiz Fellype Alves de, additional, Santos, Luiza C. G. de Araújo E, additional, Dias, Rillery Calixto, additional, Souza, Rutilene Barbosa, additional, Castro, Thaís Regina y, additional, Valim, Andréia Rosane de Moura, additional, Campos, Fabrício Souza, additional, Araujo, João Pessoa, additional, Trindade, Priscila de Arruda, additional, Aguiar, Renato S., additional, Michael Delai, Robson, additional, and Vasconcelos, Ana Tereza R de, additional
- Published
- 2023
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4. Genomic Epidemiology Reveals the Circulation of the Chikungunya Virus East/Central/South African Lineage in Tocantins State, North Brazil
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Souza, Ueric José Borges de, primary, Santos, Raíssa Nunes dos, additional, Giovanetti, Marta, additional, Alcantara, Luiz Carlos Junior, additional, Galvão, Jucimária Dantas, additional, Cardoso, Franciano Dias Pereira, additional, Brito, Feliph Cássio Sobrinho, additional, Franco, Ana Cláudia, additional, Roehe, Paulo Michel, additional, Ribeiro, Bergmann Morais, additional, Spilki, Fernando Rosado, additional, and Campos, Fabrício Souza, additional
- Published
- 2022
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5. Atitudes e saúde mental durante a pandemia da COVID-19: Uma pesquisa transversal online no estado de Goiás, Brasil
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Souza, Ueric José Borges de, Vitorino, Luciana Cristina, and Bessa, Layara Alexandre
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Ansiedad ,Knowledge ,Salud mental ,Attitude ,Conocimiento ,Saúde mental ,Conhecimento ,COVID-19 ,Actitud ,Atitude ,Mental healthcare ,Anxiety ,Ansiedade - Abstract
The novel Corona Virus Disease (COVID-19) has been spreading through all the world fastly leading to a massive public reaction. The knowledge and attitude toward measures for prevention are essential in the control of pandemic infection. Pandemics may contribute to intensified levels of stress, and anxiety is a natural reaction to any stressful situation. This study aimed to assess the knowledge, attitudes towards, anxiety and perceive mental health care among Brazilian Population from Goiás State during COVID-19 pandemic. An online survey was conducted, and a total of 251 responses were received. The participants were older than 18 years, with an average of 33.95. The participants demonstrated a moderate level of knowledge about the COVID-19 infection and its preventive aspects with more than 92% believing that social distance is essential to stop the virus spread and 93.2% agreeing to quarantine or isolate themselves if they present symptoms. Sleep difficulties and distress related to social media were reported in 20.8% and 48.6% of participants, respectively. Most agreed on the need for mental healthcare and assistance from professionals during the pandemic. Our results reflect the need to raise awareness and discuss people's mental health concerns and highlights the urgent need for the government and professional associations be prepared to deal with the psychological effects of the pandemic. La COVID-19 es la enfermedad infecciosa causada por el coronavirus (SARS-CoV-2) que se ha estado extendiendo por todo el mundo y ha llevado a una reacción pública masiva. El conocimiento y la actitud hacia las medidas de prevención son esenciales para el control de la infección pandémica. Las pandemias pueden contribuir a aumentar los niveles de estrés, y la ansiedad es una reacción natural a cualquier situación estresante. Este estudio tenía por objeto evaluar los conocimientos, actitudes, ansiedad y percepción de la atención de salud mental entre la población brasileña del estado de Goiás durante la pandemia COVID-19. Se realizó una encuesta en línea y se recibió un total de 251 respuestas. Los participantes eran mayores de 18 años, con un promedio de 33,95. Los participantes demostraron un nivel moderado de conocimiento sobre la infección por COVID-19 y sus aspectos preventivos, con más del 92% de la convicción de que la distancia social es esencial para detener la propagación del virus y el 93,2% de la misma aceptó someterse a cuarentena o aislarse si presentaban síntomas. Las dificultades de sueño y la angustia relacionada con las medias sociales fueron reportadas en 20,8% y el 48,6% de los participantes, respectivamente. La mayoría estuvo de acuerdo en la necesidad de atención de la salud mental y de la asistencia de los profesionales durante la pandemia. Nuestros resultados reflejan la necesidad de crear conciencia y debatir los problemas de salud mental de las personas y resaltan la urgente necesidad de que el gobierno y las asociaciones profesionales estén preparados para enfrentar a los efectos psicológicos de la pandemia. O novo coronavírus (SARS-CoV-2), causador da doença COVID-19, tem se propagado mundialmente de forma devastadora, causando diversos impactos na sociedade. O conhecimento e atitudes em relação às medidas de prevenção são essenciais para o controle da doença. Além disso, com a pandemia os sintomas de stress e ansiedade tem sido intensificado. Este estudo buscou avaliar o conhecimento, as atitudes e questões relacionadas com nível de ansiedade e percepção dos cuidados com a saúde mental durante a pandemia entre a população do estado de Goiás, Brasil. Para isso, foi realizada uma pesquisa online, e um total de 251 respostas foram recebidas e analisadas. Os participantes demonstraram um nível moderado de conhecimento sobre a doença e seus aspectos preventivos. Mais de 92% dos participantes responderam que o distanciamento social é essencial para impedir a propagação do vírus e 93,2% concordaram em isolar-se caso apresentem sintomas. Dificuldades para dormir e sentimentos de angústia foram relatados em 20,8% e 48,6% dos participantes, respectivamente. A maioria dos participantes concordaram com a necessidade de cuidados em saúde mental e assistência profissional durante a pandemia. Nossos resultados refletem a necessidade de ações de sensibilização sobre saúde mental durante a pandemia e reforça a necessidade urgente do governo na efetivação de políticas públicas direcionadas à esta questão.
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- 2020
6. The Complete Plastid Genome of Artocarpus camansi: A High Degree of Conservation of the Plastome Structure in the Family Moraceae
- Author
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Souza, Ueric José Borges de, primary, Vitorino, Luciana Cristina, additional, Bessa, Layara Alexandre, additional, and Silva, Fabiano Guimarães, additional
- Published
- 2020
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7. Landscape and Climate Influence the Patterns of Genetic Diversity and Inbreeding in Cerrado Plant Species
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Vitorino, Luciana Cristina, primary, Reis, Mateus Neri Oliveira, additional, Bessa, Layara Alexandre, additional, Souza, Ueric José Borges de, additional, and Silva, Fabiano Guimarães, additional
- Published
- 2020
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8. Attitudes towards and mental health during COVID-19 pandemic: An online cross-sectional survey in the State of Goiás, Brazil
- Author
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Souza, Ueric José Borges de, primary, Vitorino, Luciana Cristina, additional, and Bessa, Layara Alexandre, additional
- Published
- 2020
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9. QDD
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Souza, Ueric José Borges de, primary
- Published
- 2020
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10. Trends in the scientific literature on Stryphnodendron adstringens (Leguminosae): an important Brazilian medicinal tree
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Souza, Ueric José Borges de, primary, Vitorino, Luciana Cristina, additional, and Bessa, Layara Alexandre, additional
- Published
- 2020
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11. Complete chloroplast genome sequence of Caryocar brasiliense Camb. (Caryocaraceae) and comparative analysis brings new insights into the plastome evolution of Malpighiales
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Nunes, Rhewter, primary, Souza, Ueric José Borges de, additional, Targueta, Cintia Pelegrineti, additional, Pinto, Rafael Barbosa, additional, Soares, Thannya Nascimento, additional, Diniz-Filho, José Alexandre Felizola, additional, and Telles, Mariana Pires de Campos, additional
- Published
- 2020
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12. Partial characterization and genome size of Stryphnodendron adstringens (Leguminosae)
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Souza, Ueric José Borges de, Telles, Mariana Pires de Campos, Borba, Tereza Cristina de Oliveira, Rodrigues, Flávia Melo, Taquary, Adriana Maria Antunes, and Pinto, Rafael Barbosa
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Barbatimão ,Genes ,Mimosoide ,Chloroplast genome ,Genoma nuclear ,Nuclear genome ,GENETICA [CIENCIAS BIOLOGICAS] ,Repetitive elements ,Elementos repetitivos ,Genoma cloroplastidial - Abstract
A partir da análise dos dados de sequenciamento paralelo massivo do genoma de dois indivíduos de Stryphnodendron adstringens foi possível estruturar a tese em dois capítulos. O primeiro descreve a montagem e anotação do genoma cloroplastidial da espécie S. adstringens e sua comparação com o genoma de espécies pertencentes ao clado mimosoide da subfamília Caesalpinoideae-Leguminosae. O segundo capítulo estimou o tamanho do genoma, a montagem e a anotação de elementos repetitivos e genes no genoma nuclear da espécie S. adstringens. As bibliotecas genômicas foram sequenciadas usando a plataforma de sequenciamento de nova geração Illumina Hiseq2500. Na montagem do genoma cloroplastidial, aproximadamente 10 milhões de pares de base foram filtrados e usados para a montagem por estratégias de novo e reference-guided. O genoma cloroplastidial de S. adstringens foi montado em uma única sequência contendo 162.169 bp, sendo identificados 77 genes codificadores de proteínas, 30 genes de tRNA e 4 genes de rRNA. Um total de 137 microssatélites e 42 estruturas de repetição foram identificadas, com a maior proporção na região LSC (Large Single Copy). A diversidade nucleotídica média estimada do genoma S. adstringens entre cinco espécies do clado mimosoide, foi de 0,0177. A razão Ka/Ks indicou seleção positiva em três genes rps16, psbH and clpP. A comparação da estrutura genoma cloroplastidial de S. adstringens com outras espécies do clado mimosoide demonstrou que regiões gênicas são altamente conservadas. A reconstrução filogenética usando 73 genes codificantes de proteínas sugere que a família Leguminosae-Caesalpinoideae é parafilética. Para a montagem do genoma nuclear os reads de sequenciamento foram trimados, produzindo um conjunto de dados contendo total de aproximadamente 100 bilhões de pares de base. O tamanho do genoma de S. adstringens foi estimado em 1C = 0.684 pg, o que corresponde a aproximadamente 669 Mpb. O genoma nuclear foi montado usando estratégias de novo em 63.320 contigs com um tamanho total de aproximadamente 495 Mbp. Um total de 20.124 regiões microssatélites foi identificado no genoma nuclear, sendo a repetição AT/TA mais frequente (44,16%). Foi possível identificar que 44,58% do genoma nuclear de S. adstringens é composto de elementos transponíveis. Os retroelementos foram a classe mais comum, dentre estes, as repetições terminais longas (LTR) a família mais abundante. Foram preditos 31.636 genes e 95.811 transcritos com um média de 3,03 por gene. Do total de transcritos preditos, 60.798 foram classificados funcionalmente, nos termos do Gene Ontology. Cerca de 1.521 transcritos (1,58%) foram similares com sequências de proteínas envolvidas nas vias de biossíntese de taninos. Este trabalho representa um grande avanço nos conhecimentos sobre a estrutura e a organização dos genomas nuclear e cloroplastidial de S. adstringens. Além disso, os resultados obtidos fornecem recursos genômicos para novas investigações genéticas e biotecnológicas para a espécie. Using the massively parallel sequencing data generate from two individuals of the Stryphnodendron adstringens, it was possible to structure this thesis in two chapters. The first describes the assembly and annotation of the S. adstringens chloroplast genome and their comparison between species belonging to the mimosoid clade from Caesalpinoideae-Leguminosae subfamily. The second chapter describes the estimate genome size, assembly and annotation of repetitive elements and genes in the nuclear genome of the S. adstringens. Genomic libraries were sequenced using the Illumina HiSeq 2500 platform. Approximately 10 million reads were filtered and used to assemble the chloroplast genome using a combination of de novo and reference-guided strategies. The complete chloroplast genome of S. adstringens was assembled in a single circular molecule containing 162,169 base pairs, contained 111 different genes, with 77 protein-coding genes, 30 transfer tRNA and 4 ribosomal rRNA. A total of 137 microsatellites and 42 repeats structures were identified, with the highest proportion in the LSC (Large Single Copy) region. The average nucleotide variability among the five chloroplast genomes of Mimosoid species was estimated to be 0.01771. The Ka/Ks ratio indicated positive selection for three genes analyzed, rps16, psbH and clpP. The comparison of the structural characteristics in chloroplast genome among Mimosoid species demonstrated that gene coding regions are highly conserved. The phylogenetic reconstruction based on 73 protein-coding genes indicated that the Leguminosae- Caesalpinoideae subfamily was paraphyletic. The size of the nuclear genome of S. adstringens was estimated as 1C = 0.684 pg, which corresponds to a haploid genome of 669 Mpb. The nuclear genome was made of 63.320 contigs with a total size of approximately 495 Mbp. A total of 20.124 microsatellite regions were identified in the nuclear genome, with AT/TA repeats being the most frequent (44.16%). It was possible to identify that 44.58% of the nuclear genome of S. adstringens is composed of transposable elements. The most common class were retroelements, among these, the long terminal repeats (LTR) the most abundant family. 31,636 genes and 95,811 transcripts were predicted with an average of 3.03 per gene. From the total number of predicted transcripts, 60,798 were classified functionally, according to Gene Ontology. Around 1,521 transcripts (1.58%) were similar with protein sequences involved in the tannin biosynthesis pathways. This work represents a great advance in the knowledge on the structure and organization of the nuclear and chloroplast genomes of S. adstringens. In addition, the results obtained provide genomic resources for future genetic and biotechnological investigations on the species. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
- Published
- 2019
13. Genetic variability in cerrado plant species populations. scientometric and meta-analytic evaluation
- Author
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Souza, Ueric José Borges de, Diniz Filho, Jose Alexandre Felizola, Telles, Mariana Pires de Campos, Nabout, João Carlos, and Rodrigues, Flávia Melo
- Subjects
Diversidade genética ,Meta-analysis ,Cienciometria ,Divergência genética ,Meta-análise ,Molecular markers ,Cerrado ,Scientometric ,Genetic divergence ,GENETICA [CIENCIAS BIOLOGICAS] ,Marcadores moleculares ,Genetic diversity - Abstract
O bioma Cerrado ocupa aproximadamente 2 milhões km2 do Brasil. É formado por um mosaico heterogêneo de tipos de vegetação e tem a mais rica flora entre as savanas do mundo, com alta diversidade em nível de gêneros e famílias. Atualmente tem sido classificado como prioridade em programas de conservação devido à sua rica biodiversidade e perda de habitats naturais resultantes das atividades antropogênicas. Com o advento de técnicas moleculares, tornou-se possível o acesso direto da variabilidade genética das espécies e do modo como essa variabilidade genética se encontra distribuida dentro e entre populações, aumentando assim o interesse em estudar a diversidade genética e estrutura populacional de espécies de plantas do bioma Cerrado. Foi conduzida uma busca usando as bases de dados “Web of Science”, “Scopus”, “Scielo” e “Google Scholar” com o objetivo de realizar uma análise dos artigos publicados que avaliaram a variabilidade genética dentro e entre populações de espécies de plantas do bioma Cerrado, de modo a quantificar e descrever aspectos da produção científica na área de genética de populacões para espécies de plantas do Cerrado utilizando uma abordagem cienciométrica, e utilizando uma abordagem meta-analítica foi coletado alguns dos parâmetros genéticos estimados nos estudos (heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO) e as estatísticas F de Wright (FIS (coeficiente de endogamia); FST ou análogos)) para testar o efeito destes parâmetros genéticos em caracteristicas ecológicas e de história de vida das espécies, bem como para características metodológicas extraídas dos artigos. A busca na base de dados resultou em um total de 176 publicações de 45 periódicos durante o período de 1999-2012 e o número de estudos publicados tem aumentado significativamente durante este período. A revista Genetics and Molecular Research apresentou o maior número de artigos publicados. Noventa e seis espécies, envolvendo 32 famílias botânicas foram estudadas, sendo Fabaceae representada pelo maior número de espécies. Diferentes características entre as espécies estudadas foi observado, sendo árvores, arbusto e ervas as principais forma de vida e mata de galeria, cerrado e cerradão os principais tipos fitofisionômicos das espécies. Diferentes tipos de marcadores moleculares, incluindo microssatélites, cpDNA, isoenzimas, RAPDs, AFLPs e ISSRs foram utilizados, sendo os microssatélites o marcador mais frequentemente usado, e também o com o maior valor médio para os parâmetros de variabilidade genética dentro de populações quando comparados entre os estudos. Foi observado que os parâmetros estimados nos estudos de genética de populações obtidos via marcadores moleculares estão relacionados com características ecológicas e de história de vida das espécies e com características metodologicas das publicações. A análise permitiu uma melhor compreensão atual sobre a genética de populações de plantas do bioma Cerrado e a associação encontrada entre parâmetros genético-populacionais e diferentes características das espécies tem importância no sentido de orientar pesquisas futuras, com potencial para produzir informações com implicações importantes para ecologia, biologia evolutiva e biologia da conservação. The Cerrado biome of Brazil originally occupied approximately 2 million km2 of the country. It is formed by a heterogeneous mosaic of distinct habitats and has the richest flora of the savanas of the world, with high diversity at level of genera and families. It is also currently classified as a priority for conservation because of its rich biodiversity and simultaneous high level on threat due to the destruction of natural habitats resulting from anthropogenic activities. The advent of molecular biology techniques has allowed direct access to the genetic variability of species and populations and made it possible to infer the genetic variability within and among populations, increasing the interest in studying genetic diversity and structure in plant species population of the Cerrado biome. It was conducted here an exhaustive survey of scientific platforms such as the Web of Science, Scopus, Scielo and Google Scholar, to carry out an analysis of published papers evaluating the genetic variability within and among populations in plant species from the Cerrado biome, and to quantify and describe aspects of scientific production in the field of population genetics to plant species from the Cerrado using a scientometric approach, and using a meta-analytic approach to evaluate genetic variability, it was collected some of the genetic parameters estimated in the studies (observed (HO) and expected (HE) heterozygosities and the F statistics of Wright (FIS; FST or analogs)) to test the effect of this genetic parameters in some life history and ecological traits of the species and in methodological characteristics of the article. It was obtained 176 publications from 45 journals through the period of 1999-2012 and the number of studies published has increased significantly through this period. The journal “Genetics and Molecular Research” published the highest number of papers. Ninety-six species from 32 plant families were studied, with highest numbers from the family Fabaceae. Although the species comprised a wide sample of plants with different characteristics, trees, shrubs and herbs were the main life forms and “Mata de galeria”, “cerrado” and “cerradão” were the main fitofisionomies studied. The molecular markers used included microsatellites, cpDNA, isoenzymes, RAPDs, AFLPs and ISSRs and the Microsatellites were the most popular marker used and also show the highest mean value from the genetic variability within populations when compared across studies. It was observed that population genetics parameters molecular derived from molecular markers are closely associated with some life history traits and ecological traits of the species and with methodological characteristics of the article. The analyses allows a better understanding of the current knowledge on plant population genetics in Cerrado biome and the association with the population genetics parameters and some ecological, life history and methodological traits has considerable importance and may be useful to guide future research programs in this system with potential to produce information with important implications in evolutionary biology and ecology as well as in conservation biology Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
- Published
- 2014
14. Tendências da literatura científica sobre genética de populações de plantas do Cerrado
- Author
-
Souza, Ueric José Borges de, primary, Telles, Mariana Pires de Campos, additional, and Diniz-Filho, José Alexandre Felizola, additional
- Published
- 2016
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