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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-08-19Bitstream added on 2014-06-13T20:21:35Z : No. of bitstreams: 1 vicente_ef_dr_araiq_parcial.pdf: 165362 bytes, checksum: 96b2cf2b3ae74363a4b5898b957a3b6a (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-03T11:42:42Z: vicente_ef_dr_araiq_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-03T11:44:08Z : No. of bitstreams: 1 000721605_20150819.pdf: 147542 bytes, checksum: f5cc64495e4f5a562a1e11d2ae711ce3 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-08-20T11:58:40Z: 000721605_20150819.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T11:59:13Z : No. of bitstreams: 1 000721605.pdf: 4723399 bytes, checksum: 29bea79ab4fbb0c39fdce178c6b55872 (MD5) A diidroorotato desidrogenase é uma enzima que apresenta um papel central na biossíntese de pirimidinas e catalisa a oxidação do diidroorotato a orotato. A enzima atua durante a via “de novo” de síntese de pirimidinas e está presente em quase todos os organismos vivos. A diidroorotato desidrogenase humana (HsDHODH) pode representar um importante alvo para o tratamento de doenças hiperproliferativas e inflamatórias, já que sua inibição bloqueia a síntese de ácidos nucléicos, impedindo a sua proliferação. Esta enzima tem uma estrutura monomérica e está associada com a membrana interna das mitocôndrias pela sua extensão N-terminal. Assim, entender em detalhes como esta enzima interage com a membrana poderia elucidar um alvo seletivo para drogas antiproliferativas, antiparasíticas e imunossupressivas. Esta região está também envolvida com a catálise central da enzima, sequestrando moléculas de ubiquinona presentes na membrana, fundamentais para as reações de oxirredução feitas pela enzima. Deste modo, para um melhor entendimento destes aspectos, neste trabalho foram sintetizados, por meio da Síntese de Peptídeos em Fase Sólida (SPFS) o peptídeo Ac-GDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLG-NH2, que corresponde ao microdomínio existente na porção N-terminal da HsDHODH, entre os resíduos 33 e 66. Três análogos marcados com o aminoácido paramagnético TOAC nas posições 0, 12 ou 20, além de dois análogos duplamente marcados também foram obtidos. Ambos os peptídeos com dupla marcação possuem uma cisteína ligada ao spin MTSSL na posição 35 (C-terminal) se diferenciando pela posição do segundo marcador: um contendo outra cisteína ligada ao MTSSL na posição 12 e o segundo possuindo o TOAC na posição 0 (ou N-terminal). Estes peptídeos foram estudados por técnicas... The dihydroorotate dehydrogenase is an enzyme that has a central role on the pyrimidine biosynthesis and catalyses the oxidation of dihydrorotate to orotate. The enzyme acts on de novo pyrimidines nucleotides pathway and it is present in almost all the live organisms. The human dihydroorotate dehydrogenase (HsDHODH) can represent an important target for the treatment of hiperproliferative and inflammatory diseases, since its inhibition blocks the nucleic acid synthesis, which restrains the cell proliferation. This enzyme has a monomeric structure and it is associated into the inner mitochondrial membrane by the N-terminal extension. Thus, understanding in details how this enzyme interacts with the membrane could help to elucidate a selective target for antiproliferative, antineoplasic and immunosuppressive drugs. This region is also involved with the central enzyme catalysis, harboring quinones molecules that are in the membranes, which is essential for the oxidation-reduction reactions made by the HsDHODH. In this way, for a better evaluation of these aspects, in this work we synthesized through the Solid Phase Peptide Synthesis (SPPS) the peptide Ac-GDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLG-NH2, which corresponds to the HsDHODH N-terminal microdomain, between the residues 33 to 66. Three analogues labeled with the paramagnetic amino acid TOAC in the positions 0, 12 or 20 and two doubly labeled analogues were also synthesized. Both doubly labeled peptides contain a MTSSL-attached cysteine residue bounded to the position 35 (C-terminus), differing by the position of the second spin label: one possessing a cysteine with MTSSL at position 12 and the other contains TOAC at position 0 (N-terminus). These peptides were studied by spectroscopy techniques in order to obtain information about... (Complete abstract click electronic access below)

Despite the increase in peptide chain aggregation, which decreases the rate of coupling reactions, the synthesis and use of very highly substituted resins still remains as a controversial point in the SPPS, due to its clear economical advantages (lesser solvent consumption and higher amount of peptide per synthesis). In order to better investigate the synthesis and the use of very highly substituted resins, the FTIR, NMR and EPR were compared. By FTIR techniques it was possible to follow all the steps of resin synthesis and the factors affecting the aggregation of the chains inside the peptidil-BHAR and MBHAR.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-24Bitstream added on 2014-06-13T18:09:16Z : No. of bitstreams: 1 vicente_ef_me_araiq.pdf: 1240368 bytes, checksum: 4c158f3620376ae0b43bb4349588c93c (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Nas últimas décadas, um grande número de peptídeos antimicrobianos tem sido isolado de várias espécies de seres vivos, fazendo parte da sua imunidade inata. Estes peptídeos possuem algumas características em comum: 1) apresentam carga positiva (grande ocorrência de aminoácidos básicos); 2) possuem um porcentual considerável de aminoácidos hidrofóbicos e 3) apresentam grande tendência de adotarem estruturas secundárias anfipáticas. Devido à sua propriedade de permeabilizar e destruir membranas bacterianas, levando-as à morte, estes peptídeos são um foco de interesse no desenvolvimento de novos antibióticos. Um modo de estudo destas moléculas é por meio da adição de marcadores na seqüência peptídica, permitindo relacionar as propriedades conformacionais com a atividade biológica envolvida. Desta forma, este trabalho teve como objetivo sintetizar e avaliar 3 análogos de um novo peptídeo antimicrobiano extraído da pele da rã Hypsiboas albopunctatus de seqüência GWLDVAKKIGKAAFNVAKNF( I/L), denominado de hilina C (hyC), a fim de obter informações a respeito do seu mecanismo de ação e estruturação frente a miméticos de membrana. Os análogos possuem o composto paramagnético ácido 2,2,6,6-tetrametilpiperidina-N-oxil-4- amino-4-carboxílico (TOAC) substituindo os aminoácidos alanina na posição 13 e triptofano na posição 2, ou adicionado na extremidade N-terminal do peptídeo. Os peptídeos foram sintetizados por Síntese Peptídica em Fase Sólida (SPFS) utilizando a estratégia química Fmoc. As propriedades conformacionais dos peptídeos e as suas dinâmicas foram investigadas por dicroísmo circular (CD) e ressonância paramagnética eletrônica (RPE) em água, trifluoretanol (agente indutor de estrutura secundária), micelas zwitteriônicas (lisofosfatidilcolina - LPC) e em dois tipos de lipossomas de composições lipídicas diferentes:... In recent decades, a large number of antimicrobial peptides have been isolated from several species of microorganisms as part of their innate immunity. These peptides have some particular features: 1) positive charges (high occurrence of basic amino acids), 2) a considerable percentage of hydrophobic amino acids and 3) greater tendency to adopt amphipatic secondary structures. Due to the property of permeabilizing and destroying bacterial membranes, causing cell death, these peptides are interesting regarding the development of new antibiotics. To study these molecules, markers were added in the peptide sequence, allowing conformational properties to relate with the biological activity involved. Thus, this work aimed to synthesize and evaluate 3 analogues of a new antimicrobial peptide extracted from the skin secretion of the frog Hypsiboas albopunctatus, whose sequence is GWLDVAKKIGKAAFNVAKNFI/L, called Hilina C (hyC) in order to obtain information of the mechanism of action and structure of this peptide, using membrane mimetics. The analogues have the compound paramagnetic amino acid 2,2,6,6-tetramethylpiperidine-1-oxyl-4-amino-4-carboxylic acid (TOAC) replacing the alanine at position 13 and triptofan in position 2, or added to the end of the Nterminal peptide. The peptides were synthesized by Solid Phase Peptide Synthesis (SPPS) using the Fmoc chemistry strategy. The conformational properties of peptides and their dynamics were investigated by electronic paramagnetic resonance (EPR) and circular dichroism (CD) in water, trifluorethanol (TFE) (secondary structure inducer agent), zwitterionics micelles (lysophosphatidylcholine - LPC) and two types of liposomes in different lipid compositions: PE:PA:PC and SM:PA:PC. The biological activities were examined by determining the minimal inhibitory concentration (MIC) in bacteria (two Gram-positive and two Gram-negative) and the minimal... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by Rodrigo Fernando Marandola (rodrigo.marandola@unesp.br) on 2022-10-25T14:36:32Z No. of bitstreams: 1 rodrigofernandomarandola_PGAD_TUPA_092022.pdf: 3609630 bytes, checksum: 3c72c617b995f85f5f4bbc14ee17a0bf (MD5) Approved for entry into archive by Eliana Katia Pupim (katiapupim@tupa.unesp.br) on 2022-10-25T18:06:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marandola_rf_me_tupa.pdf: 3609630 bytes, checksum: 3c72c617b995f85f5f4bbc14ee17a0bf (MD5) Made available in DSpace on 2022-10-25T18:06:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marandola_rf_me_tupa.pdf: 3609630 bytes, checksum: 3c72c617b995f85f5f4bbc14ee17a0bf (MD5) Previous issue date: 2022-09-05 A produção agrícola brasileira ainda faz uso intensivo de agrotóxicos o que tem causado sérios problemas ao meio ambiente, afetando a saúde ambiental. Pesquisas realizadas em 2019 em amostras de água coletadas todos os municípios brasileiros indicaram a presença de 27 tipos de agrotóxico, dentre eles, no município de Tupã o Glifosato apresentou índice de concentração acima do limite considerado seguro pela União Europeia. O leite materno pelas suas propriedades se torna uma das formas mais eficientes para se aferir tal concentração. Neste sentido, esta pesquisa teve como objetivo geral mensurar o nível de contaminação por glifosato no leite materno de puérperas que residem no município de Tupã. Após a mensuração e a comparação das amostras, foram realizadas correlações demográficas e socioeconômicas com estreito vínculo à saúde pública, com enfoque aos parâmetros de saúde ambiental. O questionário objetivou ainda verificar elementos que indiquem se tais mulheres têm acesso à educação ou a conteúdo midiático que esclareçam acerca dos cuidados com a saúde. Para desenvolvimento desta dissertação utilizou-se a pesquisa de campo do tipo exploratória e descritiva e também a pesquisa laboratorial experimental, realizada junto ao banco de leite da maternidade da Santa Casa de Tupã, com abordagem quali-quantitativa. A pesquisa revelou contaminação por glifosato em todas as amostras analisadas, o que, consequentemente, indica índices de contaminação do meio ambiente no município de Tupã. Portanto, esta pesquisa poderá servir de referência para outros estudos com permeabilidade nacional e internacional, a fim de conhecer indicadores e buscar formas de mitigar esse problema de saúde pública, por meio de uma perpectiva interdisciplinar. Brazilian agricultural production still makes intensive use of pesticides, which has caused serious problems to the environment, affecting environmental health. Research carried out in 2019 on water samples collected from all Brazilian municipalities indicated the presence of 27 types of pesticides, among them, in the municipality of Tupã, Glyphosate presented a concentration index above the limit considered safe by the European Union. Breast milk, due to its properties, becomes one of the most efficient ways to measure such concentration. In this sense, this research had the general objective of measuring the level of contamination by glyphosate in the breast milk of puerperal women residing in the municipality of Tupã. After measuring and comparing the samples, demographic and socioeconomic correlations were performed with a close link to public health, with a focus on environmental health parameters. The questionnaire also aimed to verify elements that indicate whether such women have access to education or media content that shed light on health care. For the development of this dissertation, exploratory and descriptive field research was used, as well as experimental laboratory research, carried out at the milk bank of the Santa Casa de Tupã maternity hospital, with a qualitative-quantitative approach. The research revealed contamination by glyphosate in all analyzed samples, which, consequently, indicates environmental contamination indices in the municipality of Tupã. Therefore, this research can serve as a reference for other studies with national and international permeability, in order to know indicators and seek ways to mitigate this public health problem, through an interdisciplinary perspective.

Submitted by Hanyeny Raiely Leite Silva (hanyennyraiely@hotmail.com) on 2021-09-01T20:33:06Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Definitiva Hanyeny Raiely LS.pdf: 3458218 bytes, checksum: 1d23da9864386d3d22de1291992b8e56 (MD5) Approved for entry into archive by Alexandra Maria Donadon Lusser Segali null (alexmar@fcav.unesp.br) on 2021-09-02T12:26:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_hrl_me_jabo_par.pdf: 1018007 bytes, checksum: 4328f678cc4335da105052206a8692de (MD5) Made available in DSpace on 2021-09-02T12:26:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_hrl_me_jabo_par.pdf: 1018007 bytes, checksum: 4328f678cc4335da105052206a8692de (MD5) Previous issue date: 2021-06-11 Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) A suinocultura mundial vem crescendo e solidificando-se progressi-vamente nos últimos anos. Assim, diante da crescente exigência do consumidor em um produto de maior qualidade e saudável, a execução e aplicação de novas tecnologias tem se tornado cada vez mais interessantes. Neste contexto, os pep-tídeos antimicrobianos (PAMs) representam uma ótima alternativa para substituir os aditivos antimicrobianos comerciais. Diante disso, o objetivo deste trabalho sintetizar e aplicar o peptídeo antimicrobiano Ctx(Ile21)-Ha em formulações para atuação como aditivo nutricional oral em leitões na fase de maternidade, durante os primeiros 21 dias de vida. Para isto, a síntese, purificação e caracterização do peptídeo antimicrobiano Ctx(Ile21)-Ha foi realizada, obtendo a molécula com alto teor de pureza e massa suficiente para os estudos in vivo. A seguir, o peptí-deo foi formulado via microencapsulação por gelificação ionotrópica e revestido com ftalato de hidroxipropilmetilcelulose (HPMCP), resistente ao pH estomacal. As microencapsulações foram caraterizadas por métodos físico-químicos e de-monstraram que o peptídeo foi incorporado adequadamente na formulação. A avaliação do peptídeo in vivo foi dividida em dois experimentos: a “Remediação”, realizada em 10 animais como avaliação preliminar, onde foram aplicadas, em duas etapas, as micropartículas contendo o peptídeo em leitões já acometidos por diarreia e o “Profilático/Terapêutico”, no qual foram aplicadas duas doses diferentes em dois tratamentos (PEP1 e PEP2, este último recebendo o dobro da dose do primeiro), além do grupo controle (sem peptídeo). Todos os animais tiveram acesso a ração no creep feeding até o dia imediatamente anterior ao desmame (ntotal = 136). Os dados de escores fecais para os experimentos Re-mediação e Profilático/Terapêutico foram submetidos à análise de correspon-dência e foram calculados para cada animal, de ambos os experimentos, o nú-mero de dias para cessar a diarreia e o número de dias em cada classe de escore fecal. Ambas foram analisadas por meio de análise de variância (ANOVA) e, in-dependentemente da análise, Pvalor ≤ 0,05 foi considerado como significativo. Não foram constatados efeitos significativos nos experimentos de Remediação em nenhuma variável analisada. Entretanto, no experimento Profilático e Tera-pêutico, o ganho de peso médio diário do tratamento PEP1 (0,214 kg/dia) apre-sentou um aumento de 18 g/dia em relação ao tratamento CRTL (0,196 g/dia) e 9 g/dia a mais em relação ao tratamento PEP2 (0,205 kg/dia) durante os 21 dias da fase de maternidade (Pvalor < 0,0001). O peso a desmama no tratamento PEP1 (6,01 kg) (menor dose de peptídeo) foi significativo (Pvalor ≤ 0,05), apontando um aumento final médio de 0,30 g por animal em relação ao tratamento CRTL (5,71 kg) e um valor de massa de 0,19 g maior em relação ao tratamento PEP2 (5,82 kg). Porém, para a presença de diarreia, escore fecal e o número de dias para aparecimento e cessão da diarreia, para ambos os experimentos, não houve di-ferença significativa (Pvalor > 0,05), observado também para a variável de GPD do experimento de Remediação. Como conclusão, o peptídeo antimicrobiano Ctx(Ile21)-Ha pode ser considerado um interessante substituto dos antibióticos comerciais para a aplicação em suínos, pois apresentou um desempenho similar que os promotores de crescimento comerciais utilizados. The world's swine industry has been growing and solidifying pro-gressively in recent years. Thus, given the growing consumer demand for a higher quality and healthier product, the execution and application of new tech-nologies has become increasingly interesting. In this context, antimicrobial pep-tides (AMPs) represent an excellent alternative to replace commercial antimicro-bial additives. Therefore, the objective of this work is to synthesize and apply the antimicrobial peptide Ctx(Ile21)-Ha in formulations to act as an oral nutritional ad-ditive in piglets in the maternity phase, during the first 21 days of life. For this, the synthesis, purification and characterization of the antimicrobial peptide Ctx(Ile21)-Ha was performed, obtaining the molecule with high purity content and sufficient mass for in vivo studies. Then, the peptide was formulated via microencapsula-tion by ionotropic gelation and coated with hydroxypropylmethylcellulose phthalate (HPMCP), resistant to stomach pH. The microencapsulations were characterized by physicochemical methods and demonstrated that the peptide was adequately incorporated into the formulation. The evaluation of the peptide in vivo was divided into two experiments: the "Remediation", carried out in 10 animals as a preliminary evaluation, where the microparticles containing the pep-tide were applied in two stages to piglets already affected by diarrhea and the "Prophylactic /Therapeutic”, in which two different doses were applied in two treatments (PEP1 and PEP2, the latter receiving double the dose of the first), in addition to the control group (without pep-tide). All animals had access to ration in creep feeding until the day immediately before weaning (total = 136). The fecal score data for the Remediation and Prophylactic/Therapeutic experiments were submitted to correspondence analysis and the number of days to stop diarrhea and the number of days in each class of fecal score were calculated for each animal in both experiments . Both were analyzed using analysis of variance (ANOVA) and, regardless of the analysis, P-value ≤ 0.05 was considered signifi-cant. No significant effects were found in the Remediation experiments in any of the analyzed variables. However, in the Prophylactic and Therapeutic experi-ment, the average daily weight gain of the PEP1 treatment (0.214 kg/day) showed an increase of 18 g/day compared to the CRTL treatment (0.196 g/day) and 9 g/day a more in relation to the PEP2 treatment (0.205 kg/day) during the 21 days of the maternity phase (Pvalue < 0.0001). Weaning weight in the PEP1 treatment (6.01 kg) (lower dose of peptide) was significant (Pvalue ≤ 0.05), indicating a final mean increase of 0.30 g per animal in relation to the CRTL treatment (5.71 kg) and a mass value of 0.19 g higher in relation to the PEP2 treatment (5.82 kg). However, for the presence of diarrhea, fecal score and the number of days for diarrhea onset and cessation, for both experiments, there was no significant dif-ference (Pvalue > 0.05), also observed for the experiment's GPD variable of Re-mediation. In conclusion, the antimicrobial peptide Ctx(Ile21)-Ha can be consid-ered an interesting substitute for commercial antibiotics for application in swine, as it presented a similar performance as the commercial growth promoters used. FAPESP: 2018/25735-7