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1. Economic Consequences of Investing in Anti-HCV Antiviral Treatment from the Italian NHS Perspective: A Real-World-Based Analysis of PITER Data

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Marcellusi, A, Viti, R, Kondili, L, Rosato, S, Vella, S, Mennini, F, Quaranta, M, Tosti, M, Weimer, L, Ferrigno, L, D'Angelo, F, Falzano, L, Benedetti, A, Schiada, L, Cucco, M, Giacometti, A, Brescini, L, Castelletti, S, Drenaggi, D, Mazzaro, C, Angarano, G, Milella, M, Dileo, A, Rendina, M, Contaldo, A, Iannone, A, La Fortezza, F, Rizzi, M, Cologni, G, Bolondi, L, Benevento, F, Serio, I, Andreone, P, Caraceni, P, Guarneri, V, Margotti, M, Simonetti, G, Mazzella, G, Verucchi, G, Donati, V, Mian, P, Rimenti, G, Rossini, A, Contessi, G, Castelli, F, Zaltron, S, Spinetti, A, Odolini, S, Leandro, G, Cozzolongo, R, Zappimbulso, M, Russello, M, Benigno, R, Coco, C, Torti, C, Costa, C, Greco, G, Mazzitelli, M, Pisani, V, Cosco, L, Quintieri, F, Desiena, M, Giancotti, F, Vecchiet, J, Falasca, K, Mastroianni, A, Apuzzo, G, Chidichimo, L, Foschi, F, Dall'Aglio, A, Libanore, M, Segala, D, Sighinolfi, L, Bartolozzi, D, Salomoni, E, Blanc, P, Baragli, F, Delpin, B, Mariabelli, E, Mazzotta, F, Poggi, A, Zignego, A, Monti, M, Madia, F, Xheka, A, Cela, E, Santantonio, T, Bruno, S, Viscoli, C, Alessandrini, A, Curti, C, Dibiagio, A, Nicolini, L, Balletto, E, Mastroianni, C, Blerta, K, Prati, D, Raffaele, L, Andreoletti, M, Perboni, G, Costa, P, Manzini, L, Raimondo, G, Filomia, R, Lazzarin, A, Morsica, G, Salpietro, S, Puoti, M, Baiguera, C, Vassalli, S, Rumi, M, Labanca, S, Zuin, M, Giorgini, A, Orellana, D, D'Arminiomonforte, A, Debona, A, Solaro, S, Fargion, S, Valenti, L, Periti, G, Pelusi, S, Galli, M, Calvi, E, Milazzo, L, Peri, A, Lampertico, P, Borghi, M, D'Ambrosio, R, Degasperi, E, Vinci, M, Villa, E, Bernabucci, V, Bristot, L, Pereira, F, Chessa, L, Pasetto, M, Loi, M, Gori, A, Beretta, I, Pastore, V, Soria, A, Strazzabosco, M, Ciaccio, A, Gemma, M, Borgia, G, Foggia, A, Zappulo, E, Gentile, I, Buonomo, A, Abrescia, N, Maddaloni, A, Caporaso, N, Morisco, F, Camera, S, Donnarumma, L, Coppola, C, Amoruso, D, Staiano, L, Saturnino, M, Coppola, N, Martini, S, Monari, C, Federico, A, Dallio, M, Loguercio, C, Gaeta, G, Brancaccio, G, Nardone, G, Sgamato, C, D'Adamo, G, Alberti, A, Gonzo, M, Piovesan, S, Chemello, L, Buggio, A, Cavalletto, L, Barbaro, F, Castelli, E, Floreani, A, Cazzagon, N, Franceschet, I, Russo, F, Zanetto, A, Franceschet, E, Madonia, S, Cannizzaro, M, Montalto, G, Licata, A, Capitano, A, Craxi, A, Petta, S, Calvaruso, V, Rini, F, Ferrari, C, Negri, E, Orlandini, A, Pesci, M, Bruno, R, Lombardi, A, Zuccaro, V, Gulminetti, R, Asti, A, Villaraggia, M, Mondelli, M, Ludovisi, S, Baldelli, F, Di Candilo, F, Parruti, G, Di Stefano, P, Sozio, F, Gizzi, M, Brunetto, M, Colombatto, P, Coco, B, Surace, L, Foti, G, Pellicano, S, Fornaciari, G, Schianchi, S, Vignoli, P, Massari, M, Corsini, R, Garlassi, E, Ballardini, G, Andreoni, M, Cerva, C, Angelico, M, Gasbarrini, A, Siciliano, M, De Siena, M, Nosotti, L, Taliani, G, Biliotti, E, Santori, M, Spaziante, M, Tamburini, F, Vullo, V, D'Ettorre, G, Cavallari, E, Gebremeskel, T, Pavone, P, Cauda, R, Cingolani, A, Lamonica, S, D'Offizi, G, Lionetti, R, Visco Comandini, U, Grieco, A, D'Aversa, F, Picardi, A, De Vincentis, A, Galati, G, Gallo, P, Dell'Unto, C, Aghemo, A, Gatti Comini, A, Persico, M, Masarone, M, Anselmo, M, De Leo, P, Marturano, M, Brunelli, E, Ridolfi, F, Schimizzi, A, Ayoubi Khajekini, M, Framarin, L, Di Perri, G, Cariti, G, Boglione, L, Cardellino, C, Marinaro, L, Saracco, G, Ciancio, A, Toniutto, P, Alterini, G, Capra, F, Ieluzzi, D, Marcellusi A., Viti R., Kondili L. A., Rosato S., Vella S., Mennini F. S., Quaranta M. G., Tosti M. E., Weimer L. E., Ferrigno L., D'Angelo F., Falzano L., Benedetti A., Schiada L., Cucco M., Giacometti A., Brescini L., Castelletti S., Drenaggi D., Mazzaro C., Angarano G., Milella M., DiLeo A., Rendina M., Contaldo A., Iannone A., La Fortezza F., Rizzi M., Cologni G., Bolondi L., Benevento F., Serio I., Andreone P., Caraceni P., Guarneri V., Margotti M., Simonetti G., Mazzella G., Verucchi G., Donati V., Mian P., Rimenti G., Rossini A., Contessi G. B., Castelli F., Zaltron S., Spinetti A., Odolini S., Leandro G., Cozzolongo R., Zappimbulso M., Russello M., Benigno R., Coco C., Torti C., Costa C., Greco G., Mazzitelli M., Pisani V., Cosco L., Quintieri F., DeSiena M., Giancotti F., Vecchiet J., Falasca K., Mastroianni A., Apuzzo G., Chidichimo L., Foschi F. G., Dall'Aglio A. C., Libanore M., Segala D., Sighinolfi L., Bartolozzi D., Salomoni E., Blanc P., Baragli F., DelPin B., Mariabelli E., Mazzotta F., Poggi A., Zignego A. L., Monti M., Madia F., Xheka A., Cela E. M., Santantonio T. A., Bruno S. R., Viscoli C., Alessandrini A. I., Curti C., DiBiagio A., Nicolini L. A., Balletto E., Mastroianni C., Blerta K., Prati D., Raffaele L., Andreoletti M., Perboni G., Costa P., Manzini L., Raimondo G., Filomia R., Lazzarin A., Morsica G., Salpietro S., Puoti M., Baiguera C., Vassalli S., Rumi M. G., Labanca S., Zuin M., Giorgini A., Orellana D., D'ArminioMonforte A., Debona A., Solaro S., Fargion S., Valenti L., Periti G., Pelusi S., Galli M., Calvi E., Milazzo L., Peri A., Lampertico P., Borghi M., D'Ambrosio R., Degasperi E., Vinci M., Villa E., Bernabucci V., Bristot L., Pereira F., Chessa L., Pasetto M. C., Loi M., Gori A., Beretta I., Pastore V., Soria A., Strazzabosco M., Ciaccio A., Gemma M., Borgia G., Foggia A., Zappulo E., Gentile I., Buonomo A. R., Abrescia N., Maddaloni A., Caporaso N., Morisco F., Camera S., Donnarumma L., Coppola C., Amoruso D. C., Staiano L., Saturnino M. R., Coppola N., Martini S., Monari C., Federico A., Dallio M., Loguercio C., Gaeta G. B., Brancaccio G., Nardone G., Sgamato C., D'Adamo G., Alberti A., Gonzo M., Piovesan S., Chemello L., Buggio A., Cavalletto L., Barbaro F., Castelli E., Floreani A., Cazzagon N., Franceschet I., Russo F. P., Zanetto A., Franceschet E., Madonia S., Cannizzaro M., Montalto G., Licata A., Capitano A. R., Craxi A., Petta S., Calvaruso V., Rini F., Ferrari C., Negri E., Orlandini A., Pesci M., Bruno R., Lombardi A., Zuccaro V., Gulminetti R., Asti A., Villaraggia M., Mondelli M., Ludovisi S., Baldelli F., Di Candilo F., Parruti G., Di Stefano P., Sozio F., Gizzi M. C., Brunetto M. R., Colombatto P., Coco B., Surace L., Foti G., Pellicano S., Fornaciari G., Schianchi S., Vignoli P., Massari M., Corsini R., Garlassi E., Ballardini G., Andreoni M., Cerva C., Angelico M., Gasbarrini A., Siciliano M., De Siena M., Nosotti L., Taliani G., Biliotti E., Santori M., Spaziante M., Tamburini F., Vullo V., D'Ettorre G., Cavallari E. N., Gebremeskel T. S., Pavone P., Cauda R., Cingolani A., Lamonica S., D'Offizi G., Lionetti R., Visco Comandini U., Grieco A., D'Aversa F., Picardi A., De Vincentis A., Galati G., Gallo P., Dell'Unto C., Aghemo A., Gatti Comini A., Persico M., Masarone M., Anselmo M., De Leo P., Marturano M., Brunelli E., Ridolfi F., Schimizzi A. M., Ayoubi Khajekini M., Framarin L., Di Perri G., Cariti G., Boglione L., Cardellino C., Marinaro L., Saracco G. M., Ciancio A., Toniutto P., Alterini G., Capra F., Ieluzzi D., Marcellusi, A, Viti, R, Kondili, L, Rosato, S, Vella, S, Mennini, F, Quaranta, M, Tosti, M, Weimer, L, Ferrigno, L, D'Angelo, F, Falzano, L, Benedetti, A, Schiada, L, Cucco, M, Giacometti, A, Brescini, L, Castelletti, S, Drenaggi, D, Mazzaro, C, Angarano, G, Milella, M, Dileo, A, Rendina, M, Contaldo, A, Iannone, A, La Fortezza, F, Rizzi, M, Cologni, G, Bolondi, L, Benevento, F, Serio, I, Andreone, P, Caraceni, P, Guarneri, V, Margotti, M, Simonetti, G, Mazzella, G, Verucchi, G, Donati, V, Mian, P, Rimenti, G, Rossini, A, Contessi, G, Castelli, F, Zaltron, S, Spinetti, A, Odolini, S, Leandro, G, Cozzolongo, R, Zappimbulso, M, Russello, M, Benigno, R, Coco, C, Torti, C, Costa, C, Greco, G, Mazzitelli, M, Pisani, V, Cosco, L, Quintieri, F, Desiena, M, Giancotti, F, Vecchiet, J, Falasca, K, Mastroianni, A, Apuzzo, G, Chidichimo, L, Foschi, F, Dall'Aglio, A, Libanore, M, Segala, D, Sighinolfi, L, Bartolozzi, D, Salomoni, E, Blanc, P, Baragli, F, Delpin, B, Mariabelli, E, Mazzotta, F, Poggi, A, Zignego, A, Monti, M, Madia, F, Xheka, A, Cela, E, Santantonio, T, Bruno, S, Viscoli, C, Alessandrini, A, Curti, C, Dibiagio, A, Nicolini, L, Balletto, E, Mastroianni, C, Blerta, K, Prati, D, Raffaele, L, Andreoletti, M, Perboni, G, Costa, P, Manzini, L, Raimondo, G, Filomia, R, Lazzarin, A, Morsica, G, Salpietro, S, Puoti, M, Baiguera, C, Vassalli, S, Rumi, M, Labanca, S, Zuin, M, Giorgini, A, Orellana, D, D'Arminiomonforte, A, Debona, A, Solaro, S, Fargion, S, Valenti, L, Periti, G, Pelusi, S, Galli, M, Calvi, E, Milazzo, L, Peri, A, Lampertico, P, Borghi, M, D'Ambrosio, R, Degasperi, E, Vinci, M, Villa, E, Bernabucci, V, Bristot, L, Pereira, F, Chessa, L, Pasetto, M, Loi, M, Gori, A, Beretta, I, Pastore, V, Soria, A, Strazzabosco, M, Ciaccio, A, Gemma, M, Borgia, G, Foggia, A, Zappulo, E, Gentile, I, Buonomo, A, Abrescia, N, Maddaloni, A, Caporaso, N, Morisco, F, Camera, S, Donnarumma, L, Coppola, C, Amoruso, D, Staiano, L, Saturnino, M, Coppola, N, Martini, S, Monari, C, Federico, A, Dallio, M, Loguercio, C, Gaeta, G, Brancaccio, G, Nardone, G, Sgamato, C, D'Adamo, G, Alberti, A, Gonzo, M, Piovesan, S, Chemello, L, Buggio, A, Cavalletto, L, Barbaro, F, Castelli, E, Floreani, A, Cazzagon, N, Franceschet, I, Russo, F, Zanetto, A, Franceschet, E, Madonia, S, Cannizzaro, M, Montalto, G, Licata, A, Capitano, A, Craxi, A, Petta, S, Calvaruso, V, Rini, F, Ferrari, C, Negri, E, Orlandini, A, Pesci, M, Bruno, R, Lombardi, A, Zuccaro, V, Gulminetti, R, Asti, A, Villaraggia, M, Mondelli, M, Ludovisi, S, Baldelli, F, Di Candilo, F, Parruti, G, Di Stefano, P, Sozio, F, Gizzi, M, Brunetto, M, Colombatto, P, Coco, B, Surace, L, Foti, G, Pellicano, S, Fornaciari, G, Schianchi, S, Vignoli, P, Massari, M, Corsini, R, Garlassi, E, Ballardini, G, Andreoni, M, Cerva, C, Angelico, M, Gasbarrini, A, Siciliano, M, De Siena, M, Nosotti, L, Taliani, G, Biliotti, E, Santori, M, Spaziante, M, Tamburini, F, Vullo, V, D'Ettorre, G, Cavallari, E, Gebremeskel, T, Pavone, P, Cauda, R, Cingolani, A, Lamonica, S, D'Offizi, G, Lionetti, R, Visco Comandini, U, Grieco, A, D'Aversa, F, Picardi, A, De Vincentis, A, Galati, G, Gallo, P, Dell'Unto, C, Aghemo, A, Gatti Comini, A, Persico, M, Masarone, M, Anselmo, M, De Leo, P, Marturano, M, Brunelli, E, Ridolfi, F, Schimizzi, A, Ayoubi Khajekini, M, Framarin, L, Di Perri, G, Cariti, G, Boglione, L, Cardellino, C, Marinaro, L, Saracco, G, Ciancio, A, Toniutto, P, Alterini, G, Capra, F, Ieluzzi, D, Marcellusi A., Viti R., Kondili L. A., Rosato S., Vella S., Mennini F. S., Quaranta M. G., Tosti M. E., Weimer L. E., Ferrigno L., D'Angelo F., Falzano L., Benedetti A., Schiada L., Cucco M., Giacometti A., Brescini L., Castelletti S., Drenaggi D., Mazzaro C., Angarano G., Milella M., DiLeo A., Rendina M., Contaldo A., Iannone A., La Fortezza F., Rizzi M., Cologni G., Bolondi L., Benevento F., Serio I., Andreone P., Caraceni P., Guarneri V., Margotti M., Simonetti G., Mazzella G., Verucchi G., Donati V., Mian P., Rimenti G., Rossini A., Contessi G. B., Castelli F., Zaltron S., Spinetti A., Odolini S., Leandro G., Cozzolongo R., Zappimbulso M., Russello M., Benigno R., Coco C., Torti C., Costa C., Greco G., Mazzitelli M., Pisani V., Cosco L., Quintieri F., DeSiena M., Giancotti F., Vecchiet J., Falasca K., Mastroianni A., Apuzzo G., Chidichimo L., Foschi F. G., Dall'Aglio A. C., Libanore M., Segala D., Sighinolfi L., Bartolozzi D., Salomoni E., Blanc P., Baragli F., DelPin B., Mariabelli E., Mazzotta F., Poggi A., Zignego A. L., Monti M., Madia F., Xheka A., Cela E. M., Santantonio T. A., Bruno S. R., Viscoli C., Alessandrini A. I., Curti C., DiBiagio A., Nicolini L. A., Balletto E., Mastroianni C., Blerta K., Prati D., Raffaele L., Andreoletti M., Perboni G., Costa P., Manzini L., Raimondo G., Filomia R., Lazzarin A., Morsica G., Salpietro S., Puoti M., Baiguera C., Vassalli S., Rumi M. G., Labanca S., Zuin M., Giorgini A., Orellana D., D'ArminioMonforte A., Debona A., Solaro S., Fargion S., Valenti L., Periti G., Pelusi S., Galli M., Calvi E., Milazzo L., Peri A., Lampertico P., Borghi M., D'Ambrosio R., Degasperi E., Vinci M., Villa E., Bernabucci V., Bristot L., Pereira F., Chessa L., Pasetto M. C., Loi M., Gori A., Beretta I., Pastore V., Soria A., Strazzabosco M., Ciaccio A., Gemma M., Borgia G., Foggia A., Zappulo E., Gentile I., Buonomo A. R., Abrescia N., Maddaloni A., Caporaso N., Morisco F., Camera S., Donnarumma L., Coppola C., Amoruso D. C., Staiano L., Saturnino M. R., Coppola N., Martini S., Monari C., Federico A., Dallio M., Loguercio C., Gaeta G. B., Brancaccio G., Nardone G., Sgamato C., D'Adamo G., Alberti A., Gonzo M., Piovesan S., Chemello L., Buggio A., Cavalletto L., Barbaro F., Castelli E., Floreani A., Cazzagon N., Franceschet I., Russo F. P., Zanetto A., Franceschet E., Madonia S., Cannizzaro M., Montalto G., Licata A., Capitano A. R., Craxi A., Petta S., Calvaruso V., Rini F., Ferrari C., Negri E., Orlandini A., Pesci M., Bruno R., Lombardi A., Zuccaro V., Gulminetti R., Asti A., Villaraggia M., Mondelli M., Ludovisi S., Baldelli F., Di Candilo F., Parruti G., Di Stefano P., Sozio F., Gizzi M. C., Brunetto M. R., Colombatto P., Coco B., Surace L., Foti G., Pellicano S., Fornaciari G., Schianchi S., Vignoli P., Massari M., Corsini R., Garlassi E., Ballardini G., Andreoni M., Cerva C., Angelico M., Gasbarrini A., Siciliano M., De Siena M., Nosotti L., Taliani G., Biliotti E., Santori M., Spaziante M., Tamburini F., Vullo V., D'Ettorre G., Cavallari E. N., Gebremeskel T. S., Pavone P., Cauda R., Cingolani A., Lamonica S., D'Offizi G., Lionetti R., Visco Comandini U., Grieco A., D'Aversa F., Picardi A., De Vincentis A., Galati G., Gallo P., Dell'Unto C., Aghemo A., Gatti Comini A., Persico M., Masarone M., Anselmo M., De Leo P., Marturano M., Brunelli E., Ridolfi F., Schimizzi A. M., Ayoubi Khajekini M., Framarin L., Di Perri G., Cariti G., Boglione L., Cardellino C., Marinaro L., Saracco G. M., Ciancio A., Toniutto P., Alterini G., Capra F., and Ieluzzi D.

Abstract

Objective: We estimated the cost consequence of Italian National Health System (NHS) investment in direct-acting antiviral (DAA) therapy according to hepatitis C virus (HCV) treatment access policies in Italy. Methods: A multistate, 20-year time horizon Markov model of HCV liver disease progression was developed. Fibrosis stage, age and genotype distributions were derived from the Italian Platform for the Study of Viral Hepatitis Therapies (PITER) cohort. The treatment efficacy, disease progression probabilities and direct costs in each health state were obtained from the literature. The break-even point in time (BPT) was defined as the period of time required for the cumulative costs saved to recover the Italian NHS investment in DAA treatment. Three different PITER enrolment periods, which covered the full DAA access evolution in Italy, were considered. Results: The disease stages of 2657 patients who consecutively underwent DAA therapy from January 2015 to December 2017 at 30 PITER clinical centres were standardized for 1000 patients. The investment in DAAs was considered to equal €25 million, €15 million, and €9 million in 2015, 2016, and 2017, respectively. For patients treated in 2015, the BPT was not achieved, because of the disease severity of the treated patients and high DAA prices. For 2016 and 2017, the estimated BPTs were 6.6 and 6.2 years, respectively. The total cost savings after 20 years were €50.13 and €55.50 million for 1000 patients treated in 2016 and 2017, respectively. Conclusions: This study may be a useful tool for public decision makers to understand how HCV clinical and epidemiological profiles influence the economic burden of HCV.

Published
2019

2. Economic Consequences of Investing in Anti-HCV Antiviral Treatment from the Italian NHS Perspective: A Real-World-Based Analysis of PITER Data

Author

Marcellusi, Andrea, Viti, Raffaella, Kondili, Loreta A., Rosato, Stefano, Vella, Stefano, Mennini, Francesco Saverio, Kondili, L. A., Vella, S., Quaranta, M. G., Rosato, S., Tosti, M. E., Weimer, L. E., Ferrigno, L., D’Angelo, F., Falzano, L., Benedetti, A., Schiadà, L., Cucco, M., Giacometti, A., Brescini, L., Castelletti, S., Drenaggi, D., Mazzaro, C., Angarano, G., Milella, M., Di Leo, A., Rendina, M., Contaldo, A., Iannone, A., La Fortezza, F., Rizzi, M., Cologni, G., Bolondi, L., Benevento, F., Serio, I., Andreone, P., Caraceni, P., Guarneri, V., Margotti, M., Simonetti, G., Mazzella, G., Verucchi, G., Donati, V., Mian, Peter, Rimenti, G., Rossini, A., Contessi, G. B., Castelli, Fulvio, Zaltron, S., Spinetti, A., Odolini, S., Leandro, G., Cozzolongo, R., Zappimbulso, M., Russello, M., Benigno, R., Coco, C., Torti, C., Costa, C., Greco, G., Mazzitelli, M., Pisani, V., Cosco, Lucia, Quintieri, F., De Siena, Martina, Giancotti, F., Vecchiet, J., Falasca, K., Mastroianni, A., Apuzzo, G., Chidichimo, L., Foschi, F. G., Dall’Aglio, A. C., Libanore, M., Segala, D., Sighinolfi, L., Bartolozzi, D., Salomoni, E., Blanc, P., Baragli, F., DelundefinedPin, B., Mariabelli, E., Mazzotta, F., Poggi, A., Zignego, A. L., Monti, M., Madia, Francesca, Xheka, A., Cela, E. M., Santantonio, T. A., Bruno, S. R., Viscoli, C., Alessandrini, A. I., Curti, C., DiundefinedBiagio, A., Nicolini, L. A., Balletto, E., Mastroianni, Chiara, Blerta, K., Prati, D., Raffaele, L., Andreoletti, M., Perboni, G., Costa, P., Manzini, L., Raimondo, G., Filomia, R., Lazzarin, A., Morsica, G., Salpietro, S., Puoti, M., Baiguera, C., Vassalli, S., Rumi, M. G., Labanca, S., Zuin, M., Giorgini, A., Orellana, D., D’ArminioundefinedMonforte, A., Debona, A., Solaro, S., Fargion, S., Valenti, L., Periti, G., Pelusi, S., Galli, M., Calvi, E., Milazzo, L., Peri, A., Lampertico, P., Borghi, Margherita, D’Ambrosio, R., Degasperi, E., Vinci, Maria Rosaria, Villa, E., Bernabucci, V., Bristot, Luca, Pereira, F., Chessa, L., Pasetto, M. C., Loi, M., Gori, A., Beretta, I., Pastore, V., Soria, A., Strazzabosco, M., Ciaccio, A., Gemma, M., Borgia, G., Foggia, A., Zappulo, E., Gentile, I., Buonomo, A. R., Abrescia, N., Maddaloni, A., Caporaso, N., Morisco, F., Camera, S., Donnarumma, L., Coppola, C., Amoruso, D. C., Staiano, L., Saturnino, M. R., Coppola, N., Martini, S., Monari, C., Federico, Alex, Dallio, M., Loguercio, C., Gaeta, G. B., Brancaccio, G., Nardone, G., Sgamato, C., D’Adamo, G., Alberti, A., Gonzo, M., Piovesan, S., Chemello, L., Buggio, A., Cavalletto, L., Barbaro, F., Castelli, Enrico, Floreani, A., Cazzagon, N., Franceschet, I., Russo, F. P., Zanetto, A., Franceschet, E., Madonia, S., Cannizzaro, Maria Chiara, Montalto, G., Licata, A., Capitano, A. R., Craxì, A., Petta, S., Calvaruso, V., Rini, F., Ferrari, C., Negri, E., Orlandini, A., Pesci, M., Bruno, R., Lombardi, A., Zuccaro, V., Gulminetti, R., Asti, A., Villaraggia, M., Mondelli, M., Ludovisi, S., Baldelli, F., Di Candilo, F., Parruti, G., Di Stefano, Paolo, Sozio, F., Gizzi, M. C., Brunetto, M. R., Colombatto, P., Coco, B., Surace, L., Foti, G., Pellicano, S., Fornaciari, G., Schianchi, S., Vignoli, P., Massari, M., Corsini, R., Garlassi, E., Ballardini, G., Andreoni, M., Cerva, C., Angelico, M., Gasbarrini, Antonio, Siciliano, M., Nosotti, L., Taliani, G., Biliotti, E., Santori, M., Spaziante, M., Tamburini, F., Vullo, V., D’Ettorre, G., Cavallari, E. N., Gebremeskel, T. S., Pavone, P., Cauda, Roberto, Cingolani, Antonella, Lamonica, S., D’Offizi, G., Lionetti, R., Visco Comandini, U., Grieco, Antonio, D’Aversa, F., Picardi, A., De Vincentis, A., Galati, G., Gallo, Patrizia, Dell’Unto, C., Aghemo, A., Gatti Comini, A., Persico, M., Masarone, M., Anselmo, M., De Leo, P., Marturano, Monia, Brunelli, E., Ridolfi, F., Schimizzi, A. M., Ayoubi Khajekini, M., Framarin, L., Di Perri, G., Cariti, G., Boglione, L., Cardellino, C., Marinaro, L., Saracco, G. M., Ciancio, A., Toniutto, P., Alterini, G., Capra, F., Ieluzzi, D., Marcellusi, A, Viti, R, Kondili, L, Rosato, S, Vella, S, Mennini, F, Quaranta, M, Tosti, M, Weimer, L, Ferrigno, L, D'Angelo, F, Falzano, L, Benedetti, A, Schiada, L, Cucco, M, Giacometti, A, Brescini, L, Castelletti, S, Drenaggi, D, Mazzaro, C, Angarano, G, Milella, M, Dileo, A, Rendina, M, Contaldo, A, Iannone, A, La Fortezza, F, Rizzi, M, Cologni, G, Bolondi, L, Benevento, F, Serio, I, Andreone, P, Caraceni, P, Guarneri, V, Margotti, M, Simonetti, G, Mazzella, G, Verucchi, G, Donati, V, Mian, P, Rimenti, G, Rossini, A, Contessi, G, Castelli, F, Zaltron, S, Spinetti, A, Odolini, S, Leandro, G, Cozzolongo, R, Zappimbulso, M, Russello, M, Benigno, R, Coco, C, Torti, C, Costa, C, Greco, G, Mazzitelli, M, Pisani, V, Cosco, L, Quintieri, F, Desiena, M, Giancotti, F, Vecchiet, J, Falasca, K, Mastroianni, A, Apuzzo, G, Chidichimo, L, Foschi, F, Dall'Aglio, A, Libanore, M, Segala, D, Sighinolfi, L, Bartolozzi, D, Salomoni, E, Blanc, P, Baragli, F, Delpin, B, Mariabelli, E, Mazzotta, F, Poggi, A, Zignego, A, Monti, M, Madia, F, Xheka, A, Cela, E, Santantonio, T, Bruno, S, Viscoli, C, Alessandrini, A, Curti, C, Dibiagio, A, Nicolini, L, Balletto, E, Mastroianni, C, Blerta, K, Prati, D, Raffaele, L, Andreoletti, M, Perboni, G, Costa, P, Manzini, L, Raimondo, G, Filomia, R, Lazzarin, A, Morsica, G, Salpietro, S, Puoti, M, Baiguera, C, Vassalli, S, Rumi, M, Labanca, S, Zuin, M, Giorgini, A, Orellana, D, D'Arminiomonforte, A, Debona, A, Solaro, S, Fargion, S, Valenti, L, Periti, G, Pelusi, S, Galli, M, Calvi, E, Milazzo, L, Peri, A, Lampertico, P, Borghi, M, D'Ambrosio, R, Degasperi, E, Vinci, M, Villa, E, Bernabucci, V, Bristot, L, Pereira, F, Chessa, L, Pasetto, M, Loi, M, Gori, A, Beretta, I, Pastore, V, Soria, A, Strazzabosco, M, Ciaccio, A, Gemma, M, Borgia, G, Foggia, A, Zappulo, E, Gentile, I, Buonomo, A, Abrescia, N, Maddaloni, A, Caporaso, N, Morisco, F, Camera, S, Donnarumma, L, Coppola, C, Amoruso, D, Staiano, L, Saturnino, M, Coppola, N, Martini, S, Monari, C, Federico, A, Dallio, M, Loguercio, C, Gaeta, G, Brancaccio, G, Nardone, G, Sgamato, C, D'Adamo, G, Alberti, A, Gonzo, M, Piovesan, S, Chemello, L, Buggio, A, Cavalletto, L, Barbaro, F, Castelli, E, Floreani, A, Cazzagon, N, Franceschet, I, Russo, F, Zanetto, A, Franceschet, E, Madonia, S, Cannizzaro, M, Montalto, G, Licata, A, Capitano, A, Craxi, A, Petta, S, Calvaruso, V, Rini, F, Ferrari, C, Negri, E, Orlandini, A, Pesci, M, Bruno, R, Lombardi, A, Zuccaro, V, Gulminetti, R, Asti, A, Villaraggia, M, Mondelli, M, Ludovisi, S, Baldelli, F, Di Candilo, F, Parruti, G, Di Stefano, P, Sozio, F, Gizzi, M, Brunetto, M, Colombatto, P, Coco, B, Surace, L, Foti, G, Pellicano, S, Fornaciari, G, Schianchi, S, Vignoli, P, Massari, M, Corsini, R, Garlassi, E, Ballardini, G, Andreoni, M, Cerva, C, Angelico, M, Gasbarrini, A, Siciliano, M, De Siena, M, Nosotti, L, Taliani, G, Biliotti, E, Santori, M, Spaziante, M, Tamburini, F, Vullo, V, D'Ettorre, G, Cavallari, E, Gebremeskel, T, Pavone, P, Cauda, R, Cingolani, A, Lamonica, S, D'Offizi, G, Lionetti, R, Visco Comandini, U, Grieco, A, D'Aversa, F, Picardi, A, De Vincentis, A, Galati, G, Gallo, P, Dell'Unto, C, Aghemo, A, Gatti Comini, A, Persico, M, Masarone, M, Anselmo, M, De Leo, P, Marturano, M, Brunelli, E, Ridolfi, F, Schimizzi, A, Ayoubi Khajekini, M, Framarin, L, Di Perri, G, Cariti, G, Boglione, L, Cardellino, C, Marinaro, L, Saracco, G, Ciancio, A, Toniutto, P, Alterini, G, Capra, F, Ieluzzi, D, Kondili LA, Vella S, Quaranta MG, Rosato S, Tosti ME, Weimer LE, Ferrigno L, D'Angelo F, Falzano L, Benedetti A, Schiadà L, Cucco M, Giacometti A, Brescini L, Castelletti S, Drenaggi D, Mazzaro C, Angarano G, Milella M, Di Leo A, Rendina M, Contaldo A, Iannone A, La Fortezza F, Rizzi M, Cologni G, Bolondi L, Benevento F, Serio I, Andreone P, Caraceni P, Guarneri V, Margotti M, Simonetti G, Mazzella G, Verucchi G, Donati V, Mian P, Rimenti G, Rossini A, Contessi GB, Castelli F, Zaltron S, Spinetti A, Odolini S, Leandro G, Cozzolongo R, Zappimbulso M, Russello M, Benigno R, Coco C, Torti C, Costa C, Greco G, Mazzitelli M, Pisani V, Cosco L, Quintieri F, De Siena M, Giancotti F, Vecchiet J, Falasca K, Mastroianni A, Apuzzo G, Chidichimo L, Foschi FG, Dall'Aglio AC, Libanore M, Segala D, Sighinolfi L, Bartolozzi D, Salomoni E, Blanc P, Baragli F, Del Pin B, Mariabelli E, Mazzotta F, Poggi A, Zignego AL, Monti M, Madia F, Xheka A, Cela EM, Santantonio TA, Bruno SR, Viscoli C, Alessandrini AI, Curti C, Di Biagio A, Nicolini LA, Balletto E, Mastroianni C, Blerta K, Prati D, Raffaele L, Andreoletti M, Perboni G, Costa P, Manzini L, Raimondo G, Filomia R, Lazzarin A, Morsica G, Salpietro S, Puoti M, Baiguera C, Vassalli S, Rumi MG, Labanca S, Zuin M, Giorgini A, Orellana D, D'Arminio Monforte A, Debona A, Solaro S, Fargion S, Valenti L, Periti G, Pelusi S, Galli M, Calvi E, Milazzo L, Peri A, Lampertico P, Borghi M, D'Ambrosio R, Degasperi E, Vinci M, Villa E, Bernabucci V, Bristot L, Pereira F, Chessa L, Pasetto MC, Loi M, Gori A, Beretta I, Pastore V, Soria A, Strazzabosco M, Ciaccio A, Gemma M, Borgia G, Foggia A, Zappulo E, Gentile I, Buonomo AR, Abrescia N, Maddaloni A, Caporaso N, Morisco F, Camera S, Donnarumma L, Coppola C, Amoruso DC, Staiano L, Saturnino MR, Coppola N, Martini S, Monari C, Federico A, Dallio M, Loguercio C, Gaeta GB, Brancaccio G, Nardone G, Sgamato C, D'Adamo G, Alberti A, Gonzo M, Piovesan S, Chemello L, Buggio A, Cavalletto L, Barbaro F, Castelli E, Floreani A, Cazzagon N, Franceschet I, Russo FP, Zanetto A, Franceschet E, Madonia S, Cannizzaro M, Montalto G, Licata A, Capitano AR, Craxì A, Petta S, Calvaruso V, Rini F, Ferrari C, Negri E, Orlandini A, Pesci M, Bruno R, Lombardi A, Zuccaro V, Gulminetti R, Asti A, Villaraggia M, Mondelli M, Ludovisi S, Baldelli F, Di Candilo F, Parruti G, Di Stefano P, Sozio F, Gizzi MC, Brunetto MR, Colombatto P, Coco B, Surace L, Foti G, Pellicano S, Fornaciari G, Schianchi S, Vignoli P, Massari M, Corsini R, Garlassi E, Ballardini G, Andreoni M, Cerva C, Angelico M, Gasbarrini A, Siciliano M, De Siena M, Nosotti L, Taliani G, Biliotti E, Santori M, Spaziante M, Tamburini F, Vullo V, D'Ettorre G, Cavallari EN, Gebremeskel TS, Pavone P, Cauda R, Cingolani A, Lamonica S, D'Offizi G, Lionetti R, Visco Comandini U, Grieco A, D'Aversa F, Picardi A, De Vincentis A, Galati G, Gallo P, Dell'Unto C, Aghemo A, Gatti Comini A, Persico M, Masarone M, Anselmo M, De Leo P, Marturano M, Brunelli E, Ridolfi F, Schimizzi AM, Ayoubi Khajekini M, Framarin L, Di Perri G, Cariti G, Boglione L, Cardellino C, Marinaro L, Saracco GM, Ciancio A, Toniutto P, Alterini G, Capra F, Ieluzzi D., Marcellusi, A., Viti, R., Kondili, L. A., Rosato, S., Vella, S., Mennini, F. S., Quaranta, M. G., Tosti, M. E., Weimer, L. E., Ferrigno, L., D'Angelo, F., Falzano, L., Benedetti, A., Schiada, L., Cucco, M., Giacometti, A., Brescini, L., Castelletti, S., Drenaggi, D., Mazzaro, C., Angarano, G., Milella, M., Dileo, A., Rendina, M., Contaldo, A., Iannone, A., La Fortezza, F., Rizzi, M., Cologni, G., Bolondi, L., Benevento, F., Serio, I., Andreone, P., Caraceni, P., Guarneri, V., Margotti, M., Simonetti, G., Mazzella, G., Verucchi, G., Donati, V., Mian, P., Rimenti, G., Rossini, A., Contessi, G. B., Castelli, F., Zaltron, S., Spinetti, A., Odolini, S., Leandro, G., Cozzolongo, R., Zappimbulso, M., Russello, M., Benigno, R., Coco, C., Torti, C., Costa, C., Greco, G., Mazzitelli, M., Pisani, V., Cosco, L., Quintieri, F., Desiena, M., Giancotti, F., Vecchiet, J., Falasca, K., Mastroianni, A., Apuzzo, G., Chidichimo, L., Foschi, F. G., Dall'Aglio, A. C., Libanore, M., Segala, D., Sighinolfi, L., Bartolozzi, D., Salomoni, E., Blanc, P., Baragli, F., Delpin, B., Mariabelli, E., Mazzotta, F., Poggi, A., Zignego, A. L., Monti, M., Madia, F., Xheka, A., Cela, E. M., Santantonio, T. A., Bruno, S. R., Viscoli, C., Alessandrini, A. I., Curti, C., Dibiagio, A., Nicolini, L. A., Balletto, E., Mastroianni, C., Blerta, K., Prati, D., Raffaele, L., Andreoletti, M., Perboni, G., Costa, P., Manzini, L., Raimondo, G., Filomia, R., Lazzarin, A., Morsica, G., Salpietro, S., Puoti, M., Baiguera, C., Vassalli, S., Rumi, M. G., Labanca, S., Zuin, M., Giorgini, A., Orellana, D., D'Arminiomonforte, A., Debona, A., Solaro, S., Fargion, S., Valenti, L., Periti, G., Pelusi, S., Galli, M., Calvi, E., Milazzo, L., Peri, A., Lampertico, P., Borghi, M., D'Ambrosio, R., Degasperi, E., Vinci, M., Villa, E., Bernabucci, V., Bristot, L., Pereira, F., Chessa, L., Pasetto, M. C., Loi, M., Gori, A., Beretta, I., Pastore, V., Soria, A., Strazzabosco, M., Ciaccio, A., Gemma, M., Borgia, G., Foggia, A., Zappulo, E., Gentile, I., Buonomo, A. R., Abrescia, N., Maddaloni, A., Caporaso, N., Morisco, F., Camera, S., Donnarumma, L., Coppola, C., Amoruso, D. C., Staiano, L., Saturnino, M. R., Coppola, N., Martini, S., Monari, C., Federico, A., Dallio, M., Loguercio, C., Gaeta, G. B., Brancaccio, G., Nardone, G., Sgamato, C., D'Adamo, G., Alberti, A., Gonzo, M., Piovesan, S., Chemello, L., Buggio, A., Cavalletto, L., Barbaro, F., Castelli, E., Floreani, A., Cazzagon, N., Franceschet, I., Russo, F. P., Zanetto, A., Franceschet, E., Madonia, S., Cannizzaro, M., Montalto, G., Licata, A., Capitano, A. R., Craxi, A., Petta, S., Calvaruso, V., Rini, F., Ferrari, C., Negri, E., Orlandini, A., Pesci, M., Bruno, R., Lombardi, A., Zuccaro, V., Gulminetti, R., Asti, A., Villaraggia, M., Mondelli, M., Ludovisi, S., Baldelli, F., Di Candilo, F., Parruti, G., Di Stefano, P., Sozio, F., Gizzi, M. C., Brunetto, M. R., Colombatto, P., Coco, B., Surace, L., Foti, G., Pellicano, S., Fornaciari, G., Schianchi, S., Vignoli, P., Massari, M., Corsini, R., Garlassi, E., Ballardini, G., Andreoni, M., Cerva, C., Angelico, M., Gasbarrini, A., Siciliano, M., De Siena, M., Nosotti, L., Taliani, G., Biliotti, E., Santori, M., Spaziante, M., Tamburini, F., Vullo, V., D'Ettorre, G., Cavallari, E. N., Gebremeskel, T. S., Pavone, P., Cauda, R., Cingolani, A., Lamonica, S., D'Offizi, G., Lionetti, R., Visco Comandini, U., Grieco, A., D'Aversa, F., Picardi, A., De Vincentis, A., Galati, G., Gallo, P., Dell'Unto, C., Aghemo, A., Gatti Comini, A., Persico, M., Masarone, M., Anselmo, M., De Leo, P., Marturano, M., Brunelli, E., Ridolfi, F., Schimizzi, A. M., Ayoubi Khajekini, M., Framarin, L., Di Perri, G., Cariti, G., Boglione, L., Cardellino, C., Marinaro, L., Saracco, G. M., Ciancio, A., Toniutto, P., Alterini, G., Capra, F., Ieluzzi, D., Marcellusi, Andrea, Viti, Raffaella, Kondili, Loreta A., Rosato, Stefano, Vella, Stefano, Mennini, Francesco Saverio, Kondili, L.A., Quaranta, M.G., Tosti, M.E., Weimer, L.E., D’Angelo, F., Schiadà, L., Di&nbsp, Leo, A., Contessi, G.B., De&nbsp, Siena, M., Foschi, F.G., Dall’Aglio, A.C., Del&nbsp, Pin, B., Zignego, A.L., Cela, E.M., Santantonio, T.A., Bruno, S.R., Alessandrini, A.I., Biagio, A., Nicolini, L.A., Rumi, M.G., D’Arminio&nbsp, Monforte, A., D’Ambrosio, R., Pasetto, M.C., Buonomo, A.R., Amoruso, D.C., Saturnino, M.R., Gaeta, G.B., D’Adamo, G., Russo, F.P., Capitano, A.R., Craxì, A., Gizzi, M.C., Brunetto, M.R., D’Ettorre, G., Cavallari, E.N., Gebremeskel, T.S., D’Offizi, G., D’Aversa, F., Dell’Unto, C., Schimizzi, A.M., Saracco, G.M., Cosco, Alfredo, Dall’Aglio, A. C., Salomoni, Valentina, Nicolini, Elvira, Calvi, Marta, Soria, Giovanni, D'Adamo, Danilo, ALONSO ALBERTI, MARIA PALOMA CARMEN, Orlandini, Giovanni, DE ASTIS, Fabio, Sozio, Concetta, Terzini, Angelico, DE SIENA, ANDREA URIEL, Taliani, Sabrina, Spaziante, Agata, Lamonica, Emilia, and Capra, Carlo

Subjects
Liver Cirrhosis, Pediatrics, Time Factors, Settore MED/09 - Medicina Interna, National Health Programs, ERADICATION, OUTBREAK, antiviral treatment, anti HCV, economic consequences, Hepacivirus, LIVER FIBROSIS, Severity of Illness Index, Health Services Accessibility, COST-EFFECTIVENESS, Indirect costs, 0302 clinical medicine, Epidemiology, virus infection, 030212 general & internal medicine, health care economics and organizations, cost effectiveness, 030503 health policy & services, Health Policy, Health services research, health, Hepatitis C, Markov Chains, chronic hepatitis C, virus infection, fibrosis progression, cost effectiveness, liver fibrosis, Italy, Pharmacology, Public Health, Environmental and Occupational Health, Cohort, Settore SECS-P/03 - Scienza delle Finanze, Disease Progression, Public Health, 0305 other medical science, Viral hepatitis, Anti-HCV antiviral treatment, CHRONIC HEPATITIS-C, medicine.medical_specialty, Genotype, Settore MED/12 - GASTROENTEROLOGIA, VIRUS-INFECTION, Antiviral Agents, NO, 03 medical and health sciences, Cost Savings, Humans, medicine, MANAGEMENT, chronic hepatitis C, INDUCED DISEASES, METAANALYSIS, Health economics, business.industry, Public health, Environmental and Occupational Health, medicine.disease, FIBROSIS PROGRESSION, business
Abstract

OBJECTIVE:\ud We estimated the cost consequence of Italian National Health System (NHS) investment in direct-acting antiviral (DAA) therapy according to hepatitis C virus (HCV) treatment access policies in Italy.\ud \ud METHODS:\ud A multistate, 20-year time horizon Markov model of HCV liver disease progression was developed. Fibrosis stage, age and genotype distributions were derived from the Italian Platform for the Study of Viral Hepatitis Therapies (PITER) cohort. The treatment efficacy, disease progression probabilities and direct costs in each health state were obtained from the literature. The break-even point in time (BPT) was defined as the period of time required for the cumulative costs saved to recover the Italian NHS investment in DAA treatment. Three different PITER enrolment periods, which covered the full DAA access evolution in Italy, were considered.\ud \ud RESULTS:\ud The disease stages of 2657 patients who consecutively underwent DAA therapy from January 2015 to December 2017 at 30 PITER clinical centres were standardized for 1000 patients. The investment in DAAs was considered to equal €25 million, €15 million, and €9 million in 2015, 2016, and 2017, respectively. For patients treated in 2015, the BPT was not achieved, because of the disease severity of the treated patients and high DAA prices. For 2016 and 2017, the estimated BPTs were 6.6 and 6.2 years, respectively. The total cost savings after 20 years were €50.13 and €55.50 million for 1000 patients treated in 2016 and 2017, respectively.\ud \ud CONCLUSIONS:\ud This study may be a useful tool for public decision makers to understand how HCV clinical and epidemiological profiles influence the economic burden of HCV.

Published
2019

3. L'Italia come modello per l'Europa e per il mondo nelle politiche sanitarie per il trattamento dell'epatite cronica da HCV

Author

Kondili, L. A., Vella, S., Quaranta, M. G., Rosato, S., Tosti, M. E., Weimer, L. E., Ferrigno, L., D'Angelo, F., Falzano, L., Mattei, A., Olivieri, E., Terlizzi, R., Benedetti, A., Faraci, M. G., Giacometti, A., Brescini, L., Castelli, P., Castelletti, S., Drenaggi (Ancona), D., C. Mazzaro (Aviano, P N), Angarano, G., Milella, M., Di Leo, A., Rendina, M., Contaldo, A., Iannone, A., La Fortezza (Bari), F., M. Rizzi, G. Cologni (Bergamo), Bolondi, L., Benevento, F., Gianstefani, A., Serio, I., Vaccà, A., Andreone, P., Caraceni, P., Guarneri, V., Margotti, M., Simonetti, G., Mazzella, G., Verucchi, G., Donati (Bologna), V., P. Mian, G. Rimenti (Bolzano), Rossini, A., Contessi, G. B., Castelli, F., Zaltron, S., Spinetti, A., Odolini (Brescia), S., Leandr o, G., Cozzolongo, R., Zappimbulso (Castellana Grotte, M., BA), Russello, M., Benigno, R., Coco (Catania), C., Torti, C., Costa, C., Greco, G., Mazzitelli, M., Pisani, V., Cosco, L., Quintieri, F., De Siena, M., Giancotti (Catanzaro), F., Vecchiet, J., Pizzigallo, E., Falasca (Chieti), K., Mastroianni, A., Apuzzo, G., Luciani (Cosenza), F., F. G. Foschi, A. C. Dall’Aglio (Faenza), Libanore, M., Segala, D., Sighinolfi (Ferrara), L., Bartolozzi, D., Salomoni, E., Blanc, P., Baragli, F., Del Pin, B., Mariabelli, E., Mazzotta, F., Poggi, A., Zignego, L., Monti, M., Madia, F., Xheka (Firenze), A., Cela, E. M., Santantonio, T. A., Bruno, S., Giammario (Foggia), A., Viscoli, C., Alessandrini, A. I., Curti, C., Di Biagio, A., Nicolini, L. A., Balletto (Genova), E., C. Mastroian ni, K. Blerta (Latina), Prati, D., Raffaele, L., Andreoletti (Lecco), M., Perboni, G., Costa, P., Manzini (Mantova), L., G. Raimondo, R. Filomia (Messina), Lazzarin, A., Morsica, G., Salpietro, S., Puoti, M., Baiguera, C., Rumi, M. R., Labanca, S., Zuin, M., Giorgini, A., Orellana, D., D'Arminio Monfort e, A., Debona, A., Solaro, S., Fargion, S., Borroni, V., Valenti, L., Galli, M., Calvi, E., Milazzo, L., Peri, A., Lampertico, P., Borghi, M., D’Ambrosio, R., Degasperi, E., Vinci (Milano), M., Villa, E., Bernabucci, V., Bristot, L., Pereira (Modena), F., Chessa, L., Pasetto, M. C., Loi (Monserrato, M., CA), Gori, A., Beretta, I., Pastore, V., Soria, A., Strazzabosco, M., Ciaccio, A., Gemma (Monza), M., Borgia, G., Foggia, A., Zappulo, E., Gentile, I., Buonomo, A. R., Abresci a, N., Maddaloni, A., Caporaso, N., Morisco, F., Camera, S., Donnarumma, L., Coppola, C., Amoruso, D. C., Staiano, L., Coppola, N., Martini, S., Federico, A., Dallio, M., Loguercio, C., Gaeta, G. B., Brancaccio, G., Rizzo, V., Nardone, G., Sgamato (Napoli), C., G. D'Adamo (Nocera Inferiore, SA), Alberti, A., Gonzo, M., Piovesan, S., Chemello, L., Angeli, P., Cavalletto, L., Pontisso, P., Gatta, A., Erne, E. M., Castelli, E., Flo reani, A., Cazzagon, N., Franceschet, I., Russo, F. P., Zanetto, A., Franceschet (Padova), E., Madonia, S., Cannizzaro, M., Montalto, G., Licata, A., Capita no, A. R., Craxì, A., Petta, S., Calvaruso (Palermo), V., Ferrari, C., Negri, E., Orlandini, A., Pesci (Parma), M., Bruno, R., Zuccaro, V., Gulminetti, R., Asti, A., Villaraggia, M., Mondelli, M., Ludovisi (Pavia), S., F. Baldelli, F. Di Candilo (Perugia), Parruti, G., Di Stefano, P., Sozio (Pescara), F., Bru netto, M. R., Colombatto, P., Coco, B., Surace (Pisa), L., G. Foti, S. Pellicano (Reggio Calabria), Fornaciari, G., Schianchi, S., Vignoli, P., Massari, M., Cor sini, R., Garlassi (Reggio Emilia), E., Ballardini (Rimini), G., Andreoni, M., Cerva, C., Angelico, M., Gasbarrini, A., Siciliano, M., Nosotti, L., Taliani, G., Bi liotti, E., Santori, M., Spaziante, M., Tamburini, F., Vullo, V., D’Ettorre, G., Cavallari, E. N., Gebremeskel, T. S., Pavone, P., Cauda, R., Cingolani, A., Lam onica, S., D'Offizi, G., Lionetti, R., Visco Comandini, U., Grieco, A., D’Aversa, F., Picardi, A., De Vincentis, A., Galati, G., Gallo, P., Dell’Unto (Roma), C., Aghemo, A., Gatti C omini (Rozzano, A., MI), M. Persico, M. Masarone (Salerno), Anselmo, M., De Leo, P., Marturano (Savona), M., Brunelli, E., Ridolfi, F., Schimizzi (Senigallia, A. M., AN), Ayoubi Khajekini, M., Framarin, L., Di Perri, G., Cariti, G., Boglione, L., Cardellino, C., Marinaro, L., Saracco, G. M., Ciancio (Torino), A., P. Toniutto, G. Alterini (U dine), and F. Capra, D. Ieluzzi (Verona).

Subjects
Hepatitis C, antiviral therapy, cost-effectiveness, NO
Published
2018

4. Analysis of amplicon-based NGS data from neurological disease gene panels: a new method for allele drop-out management.

Author

Zucca S, Villaraggia M, Gagliardi S, Grieco GS, Valente M, Cereda C, and Magni P

Subjects
Alleles, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Humans, Mutation, Sensitivity and Specificity, Statistics as Topic, Cerebral Hemorrhage genetics, Genomics methods, Migraine with Aura genetics, Parkinson Disease genetics
Abstract

Background: Amplicon-based targeted resequencing is a commonly adopted solution for next-generation sequencing applications focused on specific genomic regions. The reliability of such approaches rests on the high specificity and deep coverage, although sequencing artifacts attributable to PCR-like amplification can be encountered. Between these artifacts, allele drop-out, which is the preferential amplification of one allele, causes an artificial increase in homozygosity when heterozygous mutations fall on a primer pairing region. Here, a procedure to manage such artifacts, based on a pipeline composed of two steps of alignment and variant calling, is proposed. This methodology has been compared to the Illumina Custom Amplicon workflow, available on Illumina MiSeq, on the analysis of data obtained with four newly designed TruSeq Custom Amplicon gene panels., Results: Four gene panels, specific for Parkinson disease, for Intracerebral Hemorrhage Diseases (COL4A1 and COL4A2 genes) and for Familial Hemiplegic Migraine (CACNA1A and ATP1A2 genes) were designed. A total of 119 samples were re-sequenced with Illumina MiSeq sequencer and panel characterization in terms of coverage, number of variants found and allele drop-out potential impact has been carried out. Results show that 14 % of identified variants is potentially affected by allele drop-out artifacts and that both the Custom Amplicon workflow and the procedure proposed here could correctly identify them. Furthermore, a more complex configuration in presence of two mutations was simulated in silico. In this configuration, our proposed methodology outperforms Custom Amplicon workflow, being able to correctly identify two mutations in all the studied configurations., Conclusions: Allele drop-out plays a crucial role in amplicon-based targeted re-sequencing and specific procedures in data analysis of amplicon data should be adopted. Although a consensus has been established in the elimination of primer sequences from aligned data (e.g., via primer sequence trimming or soft clipping), more complex configurations need to be managed in order to increase the retrieved information from available data. Our method shows how to manage one of these complex configurations, when two mutations occur.

Published
2016
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