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1. Refining understanding of working memory buffers through the construct of binding: Evidence from a single case informs theory and clinical practise

Author: Jonin, Pierre-Yves, Calia, Clara, Muratot, Sophie, Belliard, Serge, Duché, Quentin, Barbeau, Emmanuel J, Parra, Mario A., Service de Neurologie [CHU Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de recherche cerveau et cognition (CERCO), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Department of Psychology [Edinburgh], Heriot-Watt University [Edinburgh] (HWU), Facultad de Psicologia [Barranquilla], Universidad Autonoma del Caribe [Barranquilla], This work has received funding from the European Research Council under the European Union's Seventh's Framework Program (FP/2007-2013) / ERC Grant Agreement n.323711 (M4 Project). CC and MAP were supported by the Alzheimer's Society Grant AS-SF-14-008., European Project: 323711,EC:FP7:ERC,ERC-2012-ADG_20120411,M4(2013), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Jonin, Pierre-Yves, Memory Mechanisms in Man and Machine - M4 - - EC:FP7:ERC2013-05-01 - 2018-04-30 - 323711 - VALID, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Service de Neurologie [CHU Pontchaillou], Centre de recherche cerveau et cognition ( CERCO ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Heriot-Watt University [Edinburgh] ( HWU ), European Project : 323711,EC:FP7:ERC,ERC-2012-ADG_20120411,M4 ( 2013 ), SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Male, binding, episodic buffer, BF, Neuropsychological Tests, Alzheimer's disease, Hippocampus, Magnetic Resonance Imaging, Article, working memory, Memory, Short-Term, amnesia, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Humans, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Atrophy, Alzheimer disease, Alzheimer's disease *Manuscript-with changes highlighted
Abstract: International audience; Binding operations carried out in working memory enable the integration of information from different sources during online performance. While available evidence suggests that working memory may involve distinct binding functions, whether or not they all involve the episodic buffer as a cognitive substrate remains unclear. Similarly, knowledge about the neural underpinnings of working memory buffers is limited, more specifically regarding the involvement of medial temporal lobe structures. In the present study, we report on the case of patient KA, with developmental amnesia and selective damage to the whole hippocampal system. We found that KA was unable to hold shape-colours associations (relational binding) in working memory. In contrast, he could hold integrated coloured shapes (conjunctive binding) in two different tasks. Otherwise, and as expected, KA was impaired on three relational memory tasks thought to depend on the hippocampus that are widely used in the early detection of Alzheimer's disease. Our results emphasize a dissociation between two binding processes within working memory, suggesting that the visuo-spatial sketchpad could support conjunctive binding, and may rely upon a large cortical network including sub-hippocampal structures. By contrast, we found evidence for a selective impairment of relational binding in working memory when the hippocampal system is compromised, suggesting that the long-term memory deficit observed in amnesic patients may be related to impaired short-term relational binding at encoding. Finally, these findings may inform research on the early detection of Alzheimer's disease as the preservation of conjunctive binding in KA is in sharp contrast with the impaired performance demonstrated very early in this disease.
Published: 2019
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2. Epidemiology of multiple sclerosis

Author: Thibault Moreau, Emmanuelle Leray, Gilles Edan, Agnès Fromont, Comportement et noyaux gris centraux = Behavior and Basal Ganglia [Rennes], Université de Rennes (UR)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes = Institute of Clinical Neurosciences of Rennes (INCR), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Centre d'épidémiologie des populations (CEP), Université de Bourgogne (UB)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Comportement et noyaux gris centraux [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université européenne de Bretagne ( UEB ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ), Centre d'épidémiologie des populations ( CEP ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre Régional de Lutte contre le cancer - Centre Georges-François Leclerc ( CRLCC - CGFL ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, Pathology, Multiple Sclerosis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Natural history, Disease, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Epidemiology, Prevalence, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Mortality, education, education.field_of_study, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Incidence, Multiple sclerosis, Incidence (epidemiology), medicine.disease, 3. Good health, Neurology, Cohort, Disease Progression, Life expectancy, Female, Neurology (clinical), business, 030217 neurology & neurosurgery, Demography
Abstract: International audience; Multiple sclerosis (MS) is the most frequently seen demyelinating disease, with a prevalence that varies considerably, from high levels in North America and Europe (> 100/100,000 inhabitants) to low rates in Eastern Asia and sub-Saharan Africa (2/100,000 population). Knowledge of the geographical distribution of the disease and its survival data, and a better understanding of the natural history of the disease, have improved our understanding of the respective roles of endogenous and exogenous causes of MS. Concerning mortality, in a large French cohort of 27,603 patients, there was no difference between MS patients and controls in the first 20 years of the disease, although life expectancy was reduced by 6–7 years in MS patients. In 2004, the prevalence of MS in France was 94.7/100,000 population, according to data from the French National Health Insurance Agency for Salaried Workers (Caisse nationale d’assurance maladie des travailleurs Salariés [CNAM-TS]), which insures 87% of the French population. This prevalence was higher in the North and East of France. In several countries, including France, the gender ratio for MS incidence (women/men) went from 2/1 to 3/1 from the 1950s to the 2000s, but only for the relapsing–remitting form. As for risk factors of MS, the most pertinent environmental factors are infection with Epstein-Barr virus (EBV), especially if it arises after childhood and is symptomatic. The role of smoking in MS risk has been confirmed, but is modest. In contrast, vaccines, stress, traumatic events and allergies have not been identified as risk factors, while the involvement of vitamin D has yet to be confirmed. From a genetic point of view, the association between HLA-DRB1*15:01 and a high risk of MS has been known for decades. More recently, immunogenetic markers have been identified (IL2RA, IL7RA) and, in particular thanks to studies of genome-wide associations, more than 100 genetic variants have been reported. Most of these are involved in the immune response and often associated with other autoimmune diseases. Studies of the natural history of MS suggest it is a two-phase disease: in the first phase, inflammation is focal with flares; and in the second phase, disability progresses independently of focal inflammation. This has clear implications for therapy. Age may also be a key factor in the phenotype of the disease. In conclusion, France is a high-risk country for MS, but it only slightly reduces life expectancy. MS is a multifactorial disease and the implications of immunogenetics are major. Preventative approaches might be derived from knowledge of the risk factors and natural history of the disease (smoking, vitamin D)
Published: 2016
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3. Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure

Author: Franca Wagner, Sorina Camarasu-Pop, Hélène Urien, Isabelle Bloch, Xavier Tomas-Fernandez, Jeremy Beaumont, John Muschelli, Chunliang Wang, Baptiste Laurent, Charles R.G. Guttmann, Tristan Glatard, Michael Kain, Mathieu Simon, Michel Dojat, April Khademi, Martin Styner, Pascal Girard, Thomas Tourdias, Michel M. dos Santos, Wellington Pinheiro dos Santos, Sergi Valverde, Richard McKinley, Abel G. Silva-Filho, Jesse Knight, Eloy Roura, Sandra Vukusic, Francisco Javier Vera-Olmos, François Cotton, Xavier Lladó, Elizabeth M. Sweeney, Senan Doyle, Anne Kerbrat, Olivier Commowick, Mariano Cabezas, Florent Leray, Amirreza Mahbod, Norberto Malpica, Gilles Edan, Roxana Ameli, Christian Barillot, Frederic Cervenansky, Florence Forbes, Simon K. Warfield, Audrey Istace, Jean-Christophe Ferré, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] ( CHLS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale ( LaTIM ), Université européenne de Bretagne ( UEB ) -Télécom Bretagne-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ) -Université de Brest ( UBO ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Mines-Télécom [Paris], Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de neurochirurgie [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Service de neurologie [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Neuroinflammation: imagerie et thérapie de la sclérose en plaques, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Concordia University [Montreal], Pixyl Medical [Grenoble], Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems ( MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Laboratoire Jean Kuntzmann ( LJK ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ), University of Guelph, Department of Electrical and Computer Engineering [TORONTO] ( ECE ), University of Toronto, Royal Institute of Technology [Stockholm] ( KTH ), University of Bern, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health [Baltimore, MD, USA], Visio per computador I robotica ( VICOROB ), Universitat de Girona ( UdG ), Universidade Federal de Pernambuco [Recife] ( UFPE ), Computational Radiology Laboratory [Boston] ( CRL ), Brigham and Women's Hospital [Boston]-Children's Hospital, Laboratoire Traitement et Communication de l'Information ( LTCI ), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris]-Université Paris-Saclay, Universidad Rey Juan Carlos [Madrid] ( URJC ), Brigham and Women's Hospital [Boston], Service de Neurologie, CHU Pontchaillou, Rennes, Grenoble Institut des Neurosciences ( GIN ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Computer Science ( North Carolina State University ), North Carolina State University [Raleigh] ( NCSU ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale (LaTIM), Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Université de Brest (UBO)-Télécom Bretagne-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Radiologie [CHU de Rennes], Université de Rennes (UR), CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Bordeaux [Bordeaux], Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Ryerson University [Toronto], Royal Institute of Technology [Stockholm] (KTH ), Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health [Baltimore], Johns Hopkins University (JHU), Research institute of Computer Vision and Robotics [Girona] (VICOROB), Universitat de Girona (UdG), Universidade Federal de Pernambuco [Recife] (UFPE), Computational Radiology Laboratory [Boston] (CRL), Brigham and Women's Hospital [Boston]-Boston Children's Hospital, Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad Rey Juan Carlos [Madrid] (URJC), Service de Neurologie [Lyon], CHU Lyon, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), University of North Carolina [Chapel Hill] (UNC), University of North Carolina System (UNC), This work was partly funded by France Life Imaging (grant ANR-11-INBS-0006 from the French 'Investissements d’Avenir' program) for funding and sponsoring the challenge. This work has also been partly supported by a grant (OFSEP) provided by the French State and handled by the 'Agence nationale de la recherche', within the framework of the 'Investissements d’Avenir' program, under the reference ANR-10-COHO-002. We also thank the French national cohort OFSEP (a French 'Investissements d’Avenir' program), and particularly the imaging group inside this cohort consortium for their constant support, fruitful discussions on the challenge and providing the MR images., ANR-11-INBS-0006,FLI,France Life Imaging(2011), ANR-10-COHO-0002,OFSEP,Observatoire Français de la Sclérose en Plaques(2010), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Télécom Bretagne-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG), Boston Children's Hospital-Brigham and Women's Hospital [Boston], Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-11-INBS-0006/11-INBS-0006,FLI,France In vivo Imaging(2011), ANR-10-COHO-002-01/10-COHO-0002,OFSEP,Observatoire Français de la Sclérose en Plaques(2010), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service Informatique et développements, Department of Electrical and Computer Engineering [University of Toronto] (ECE), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Service de Neurologie [CHU Rennes], Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Computer Science (North Carolina State University), North Carolina State University [Raleigh] (NC State), University of North Carolina System (UNC)-University of North Carolina System (UNC), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Edan, Gilles, Infrastructures - France Life Imaging - - FLI2011 - ANR-11-INBS-0006 - INBS - VALID, Cohortes - Observatoire Français de la Sclérose en Plaques - - OFSEP2010 - ANR-10-COHO-0002 - COHO - VALID, and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, Computer science, Data management, MESH: Parenchymal Tissue, lcsh:Medicine, Esclerosi múltiple, computer.software_genre, 030218 nuclear medicine & medical imaging, MESH: Magnetic Resonance Imaging, Machine Learning, 0302 clinical medicine, open science, Image Processing, Computer-Assisted, Segmentation, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Image processing -- Digital techniques, lcsh:Science, 610 Medicine & health, Multiple sclerosis lesion, image segmentation, MESH: Machine Learning, Magnetic Resonance Imaging, MESH: Image Processing, Computer-Assisted, Random forest, performance evaluation, MESH: Neural Networks, Computer, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Female, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Objective evaluation, Algorithms, MESH: Algorithms, Machine learning, Article, Multiple sclerosis, 03 medical and health sciences, Imatges -- Processament -- Tècniques digitals, distributed computing, Image Interpretation, Computer-Assisted, Humans, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Parenchymal Tissue, Retrospective Studies, MESH: Humans, business.industry, Deep learning, Imatge -- Segmentació, lcsh:R, MESH: Retrospective Studies, MESH: Multiple Sclerosis, MESH: Male, Imaging segmentation, computing infrastructure, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], lcsh:Q, Neural Networks, Computer, Artificial intelligence, business, computer, MESH: Female, MESH: Image Interpretation, Computer-Assisted, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: We present a study of multiple sclerosis segmentation algorithms conducted at the international MICCAI 2016 challenge. This challenge was operated using a new open-science computing infrastructure. This allowed for the automatic and independent evaluation of a large range of algorithms in a fair and completely automatic manner. This computing infrastructure was used to evaluate thirteen methods of MS lesions segmentation, exploring a broad range of state-of-theart algorithms, against a high-quality database of 53 MS cases coming from four centers following a common definition of the acquisition protocol. Each case was annotated manually by an unprecedented number of seven different experts. Results of the challenge highlighted that automatic algorithms, including the recent machine learning methods (random forests, deep learning, …), are still trailing human expertise on both detection and delineation criteria. In addition, we demonstrate that computing a statistically robust consensus of the algorithms performs closer to human expertise on one score (segmentation) although still trailing on detection scores This work was partly funded by France Life Imaging (grant ANR-11-INBS-0006 from the French “Investissements d’Avenir” program) for funding and sponsoring the challenge. This work has also been partly supported by a grant (OFSEP) provided by the French State and handled by the “Agence nationale de la recherche”, within the framework of the “Investissements d’Avenir” program, under the reference ANR-10-COHO-002. We also thank the French national cohort OFSEP (a French “Investissements d’Avenir” program), and particularly the imaging group inside this cohort consortium for their constant support, fruitful discussions on the challenge and providing the MR images
Published: 2018
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4. Diffusion MRI as an imaging marker of depression from a large and homogenous population study

Author: Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Dominique Drapier, Christian Barillot, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Comportement et noyaux gris centraux = Behavior and Basal Ganglia [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes]-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), CHU Rennes (Department of Neuroradiology), Service de Psychiatrie de l'adulte [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Centre Hospitalier Guillaume Régnier, Comportement et noyaux gris centraux [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université européenne de Bretagne ( UEB ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université européenne de Bretagne ( UEB ) -Centre Hospitalier Guillaume Régnier, Coloigner, Julie, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes = Institute of Clinical Neurosciences of Rennes (INCR), and Université de Rennes (UR)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Centre Hospitalier Guillaume Régnier
Subjects: [ INFO.INFO-TS ] Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [INFO.INFO-TS]Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [INFO.INFO-TS] Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

5. Diffusion MRI as a descriptive imaging marker of the pathogenesis of treatment-resistant depression

Author: Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Dominique Drapier, Christian Barillot, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Comportement et noyaux gris centraux = Behavior and Basal Ganglia [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes]-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), Service de Psychiatrie de l'adulte [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Centre Hospitalier Guillaume Régnier, CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Univ Rennes, Inria, CNRS, Inserm, IRISA UMR 6074, VISAGES ERL U-1228, F-35000 Rennes, France, Comportement et noyaux gris centraux [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université européenne de Bretagne ( UEB ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université européenne de Bretagne ( UEB ) -Centre Hospitalier Guillaume Régnier, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Université de Rennes (UR)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes = Institute of Clinical Neurosciences of Rennes (INCR), Université de Rennes (UR)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Centre Hospitalier Guillaume Régnier, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Coloigner, Julie
Subjects: [ INFO.INFO-TS ] Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [INFO.INFO-TS]Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [INFO.INFO-TS] Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; no abstract
Published: 2018

6. Measurement of pediatric regional cerebral blood flow from 6 months to 15 years of age in a clinical population

Author: Aline Carsin-Vu, Maïa Proisy, Guillaume Bouzillé, Jean-Christophe Ferré, Isabelle Corouge, Christian Barillot, Olivier Commowick, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Université de Rennes 1 - Faculté de Médecine (UR1 Médecine), Université de Rennes (UR), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Radiologie [CHU de Rennes], Société Française de Radiologie, Jonchère, Laurent, Université de Rennes - Faculté de Médecine (UR Médecine), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), CHU Reims, Université de Rennes 1 - Faculté de Médecine ( Rennes ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image ( LTSI ), Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU Reims ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), and Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: Male, Cerebral blood flow (CBF), [ SDV.MHEP.PED ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, Pediatric brain imaging, Perfusion scanning, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 0302 clinical medicine, Medicine, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Gray Matter, Child, education.field_of_study, Brain, Regression analysis, General Medicine, White Matter, medicine.anatomical_structure, Cerebral blood flow, Cerebrovascular Circulation, Child, Preschool, Cardiology, Female, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Perfusion, Algorithms, Arterial spin labeling (ASL), medicine.medical_specialty, Adolescent, Population, White matter, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.PED] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, Internal medicine, Linear regression, Humans, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], education, Retrospective Studies, [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.MHEP.PED]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, Models, Statistical, business.industry, Infant, Cerebral Arteries, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Spin Labels, Akaike information criterion, business, 030217 neurology & neurosurgery, Magnetic Resonance Angiography
Abstract: International audience; Objectives - To investigate changes in cerebral blood flow (CBF) in gray matter (GM) between 6 months and 15 years of age and to provide CBF values for the brain, GM, white matter (WM), hemispheres and lobes.Methods - Between 2013 and 2016, we retrospectively included all clinical MRI examinations with arterial spin labeling (ASL). We excluded subjects with a condition potentially affecting brain perfusion. For each subject, mean values of CBF in the brain, GM, WM, hemispheres and lobes were calculated. GM CBF was fitted using linear, quadratic and cubic polynomial regression against age. Regression models were compared with Akaike's information criterion (AIC), and Likelihood Ratio tests.Results - 84 children were included (44 females/40 males). Mean CBF values were 64.2 ± 13.8 mL/100 g/min in GM, and 29.3 ± 10.0 mL/100 g/min in WM. The best-fit model of brain perfusion was the cubic polynomial function (AIC = 672.7, versus respectively AIC = 673.9 and AIC = 674.1 with the linear negative function and the quadratic polynomial function). A statistically significant difference between the tested models demonstrating the superiority of the quadratic (p = 0.18) or cubic polynomial model (p = 0.06), over the negative linear regression model was not found. No effect of general anesthesia (p = 0.34) or of gender (p = 0.16) was found.Conclusion - we provided values for ASL CBF in the brain, GM, WM, hemispheres, and lobes over a wide pediatric age range, approximately showing inverted U-shaped changes in GM perfusion over the course of childhood.
Published: 2018
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7. Superior explicit memory despite severe developmental amnesia: In-depth case study and neural correlates

Author: Pierre-Yves Jonin, Christian Barillot, Serge Belliard, Gabriel Besson, Emmanuel J. Barbeau, Jérémie Pariente, Renaud La Joie, Jonin, Pierre-Yves, Service de Neurologie [CHU Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de recherche cerveau et cognition (CERCO), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Neuropsychologie et imagerie de la mémoire humaine (NIMH), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Toulouse Neuro Imaging Center (ToNIC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service de Neurologie [CHU Pontchaillou], Centre de recherche cerveau et cognition ( CERCO ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Neuropsychologie et imagerie de la mémoire humaine ( NIMH ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Toulouse Neuro Imaging Center ( ToNIC ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Purpan [Toulouse], and CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]
Subjects: Adult, Male, Memory, Episodic, Cognitive Neuroscience, Intelligence, Amnesia, Hippocampus, single case study, Neuropsychological Tests, recognition memory, 050105 experimental psychology, Temporal lobe, new learning, 03 medical and health sciences, Spatial Processing, 0302 clinical medicine, amnesia, Explicit memory, medicine, Humans, Semantic memory, 0501 psychology and cognitive sciences, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Hypoxia, Episodic memory, Spatial Memory, Recognition memory, Cerebral Cortex, Neural correlates of consciousness, 05 social sciences, Recognition, Psychology, Magnetic Resonance Imaging, Temporal Lobe, RRID: SCR_009567, Semantics, Knowledge, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Mental Recall, Intensive Care, Neonatal, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Atrophy, medicine.symptom, Psychology, Neuroscience, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; The acquisition of new semantic memories is sometimes preserved in patients with hippocampal amnesia. Robust evidence for this comes from case reports of developmental amnesia suggesting that low-to-normal levels of semantic knowledge can be achieved despite compromised epi-sodic learning. However, it is unclear whether this relative preservation of semantic memory results from normal acquisition and retrieval or from residual episodic memory, combined with effortful repetition. Furthermore, lesion studies have mainly focused on the hippocampus itself, and have seldom reported the state of structures in the extended hippocampal system. Preserved components of this system may therefore mediate residual episodic abilities, contributing to the apparent semantic preservation. We report an in-depth study of Patient KA, a 27-year-old man who had severe hypoxia at birth, in which we carefully explored his residual episodic learning abilities. We used novel speeded recognition paradigms to assess whether KA could explicitly acquire and retrieve new context-free memories. Despite a pattern of very severe amnesia, with a 44-point discrepancy between his intelligence and memory quotients, KA exhibited normal-to-superior levels of knowledge, even under strict time constraints. He also exhibited normal-to-superior recognition memory for new material, again under strict time constraints. Mul-timodal neuroimaging revealed an unusual pattern of selective atrophy within each component of the extended hippocampal system, contrasting with the preservation of anterior subhippocampal cortices. A cortical thickness analysis yielded a pattern of thinner but also thicker regional cortices, pointing toward specific temporal lobe reorganization following early injury. We thus report the first case of superior explicit learning and memory in a severe case of amnesia, raising important questions about how such knowledge can be acquired.
Published: 2018
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8. One-year efficacy and safety of the Trufill DCS Orbit and Orbit Galaxy detachable coils in the endovascular treatment of intracranial aneurysms: Results from the TRULINE study

Author: Roberto Riva, A. Nicolas, Benjamin Gory, Paul Emile Labeyrie, Emmanuel Chabert, Ariel Pablo Lebedinsky, Raphaël Blanc, Francis Turjman, Hubert Desal, Laurent Derex, Laure Huot, Hervé Brunel, Evelyne Emery, Georges Rodesch, O. Levrier, Jean-Yves Gauvrit, Institut des sciences cognitives Marc Jeannerod - Centre de neuroscience cognitive - UMR5229 (CNC), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Interventional Neuroradiology, Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Physiopathologie et imagerie des troubles neurologiques (PhIND), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Winogradsky Institute of Microbiology, Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), Department of Neuroradiology, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes] = Radiology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Fondation Rothschild, Département Recherches Subatomiques (DRS-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Health Service and Performance Research (HESPER), Université de Lyon-Université de Lyon, Service de Neurochirurgie [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), DePuy Synthes [Zuchwil], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Foch [Suresnes], Barillot, Christian, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Radiologie [Hôpital Clairval - Marseille], Hôpital Privé Clairval [Marseille], Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rotschild, Hôpital Guillaume-et-René-Laennec [Saint-Herblain], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Institut des sciences cognitives Marc Jeannerod - Centre de neuroscience cognitive - UMR5229 ( CNC ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d’Infection et d’Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 8204 ( CIIL ), Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR142-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Physiopathologie et imagerie des troubles neurologiques ( PhIND ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Russian Academy of Sciences [Moscow] ( RAS ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Département Recherches Subatomiques ( DRS-IPHC ), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien ( IPHC ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Health Service and Performance Research ( HESPER ), Neurosurgery Department, Caen University Hospital, Avenue de la Côte de Nacre, 14000, Caen, France., Lipides - Nutrition - Cancer (U866) ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon ( ENSBANA ), Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Institut des sciences cognitives Marc Jeannerod - Centre de neuroscience cognitive - UMR5229 (ISC-MJ), Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [Paris], and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: endovascular treatment, Male, medicine.medical_specialty, medicine.medical_treatment, Population, Aneurysm, Ruptured, recanalization, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Aneurysm, Recurrence, medicine, Clinical endpoint, Humans, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Prospective Studies, Endovascular treatment, education, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, education.field_of_study, Endovascular coiling, business.industry, Incidence (epidemiology), Intracranial Aneurysm, Middle Aged, medicine.disease, Embolization, Therapeutic, Confidence interval, 3. Good health, Surgery, Cerebral Angiography, Treatment Outcome, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], coiling, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Female, Radiology, France, Orbit (control theory), business, Intracranial aneurysms, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Background and purpose No series reported the mid-term results of Trufill DCS Orbit and Orbit Galaxy detachable coils with independent evaluation. We present the one-year safety and efficacy of these coils in real-life routine clinical practice. Methods A total of 167 patients with 167 aneurysms (39.1% ruptured) were enrolled in the prospective TRULINE study. The primary endpoint was the safety, assessed by the combined morbidity-mortality rate observed since the time of the procedure and up to one-year follow-up. For safety, primary analyses were performed on intent-to-treat population (attempted coils procedure) and all adverse events have been reviewed by an independent Data Safety Monitoring Board. For efficacy, primary analyses were performed on the per-protocol population (patients treated with more than 70% of Trufill coils and not retreated during the follow-up period) and an independent core laboratory evaluated angiographic results. Results At one-year post-procedure, neurologic impairment was observed in 6.5% (95% confidence interval: 3.5–11.8) of the patients, and 2.6% (95% confidence interval: 1.0–6.8) had a permanent neurological deterioration. Three deaths were observed, unrelated to the procedure or coils. At one year, complete occlusion was seen in 52 aneurysms (54.2%), neck remnant in 28 aneurysms (29.2%), and aneurysm remnant in 16 aneurysms (16.7%). During the one-year follow-up, the overall incidence of recurrence was 30.2% with a mean interval of 13.8 ± 4.5 months and the retreatment for major recanalization was needed in nine patients (6.3%). Conclusions The TRULINE study confirms that endovascular coiling with Trufill DCS Orbit and Orbit Galaxy detachable coils is safe and effective.
Published: 2017
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9. Manifestations neuropsychiatriques dans la sclérose en plaques : et si des symptômes psychotiques annonçaient le début de la maladie ?

Author: Nathalie Guernion, Emeline Le Cadet, Anne Tirel, Michel Walter, Gilles Edan, Mickaël Le Galudec, Commowick, Olivier, CHRU Brest - Psychiatrie Adulte (CHU - Brest- Psychiatrie), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Université de Brest (UBO), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie, centre hospitalier universitaire de Rennes, 2, rue Henri-le-Guilloux, 35000 Rennes, France., CHU Pontchaillou [Rennes], CHRU Brest - Psychiatrie Adulte ( CHU - Brest- Psychiatrie ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Université de Brest ( UBO ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Pediatrics, medicine.medical_specialty, Psychosis, Population, Neurological examination, Disease, Grey matter, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Medicine, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Family history, Medical diagnosis, Psychiatry, education, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, education.field_of_study, medicine.diagnostic_test, business.industry, Multiple sclerosis, General Medicine, medicine.disease, 030227 psychiatry, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, business, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Key points Patients suffering from multiple sclerosis (MS) can often dysplay psychiatric symptoms throughout the disease. The frequency of those symptoms could be two or three times greater in MS patients compared to the general population. Psychotic symptoms could be an early sign of MS. At first, neurological symptoms can either be mild or altogether absent. MRI brain scans show cerebral lesions in frontal and temporal regions. New MRI sequencing techniques support the hypothesis that disseminated defects in the grey matter occur in MS. These defects could in turn be responsible for cognitive disorders. Patients presenting a first-episode psychosis must have a neurological examination. MS should be considered as an alternative diagnosis of psychosis, particularly in atypical cases where family history of psychosis is absent and where there is bad response to standard psychotropic treatment. Collaboration between neurologists and psychiatrists whilst caring for patients displaying neuropsychiatric manifestations of MS is crucial to enable more accurate diagnoses and try to improve treatment and overall prognosis.
Published: 2013
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10. Geographical Heterogeneity of Multiple Sclerosis Prevalence in France

Author: Guy Hédelin, Sandra Vukusic, Emmanuelle Leray, David Brassat, Christian Confavreux, Michel Clanet, Thibault Moreau, Michel Grzebyk, Gilles Edan, Diane Pivot, Marc Debouverie, Francis Guillemin, Pierre Clavelou, Service d'Evaluation et Information Médicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de neurologie [CHRU Nancy], Maladies chroniques, santé perçue, et processus d'adaptation (APEMAC), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université de Lorraine (UL), Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) (INRS ( Vandoeuvre lès Nancy)), Neurologie vasculaire, pathologie neuro-dégénérative et explorations fonctionnelles du système nerveux [Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service de Neurologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Service de Neurologie [Hospices civils de Lyon - Hôpital Pierre Wertheimer], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Neurologie [Rennes] = Neurology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Recherche en Pharmaco-épidémiologie et Recours aux Soins (REPERES), Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Service de Neurologie générale, vasculaire et dégénérative (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre d'investigation clinique [Nancy] (CIC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), This work has been realized with the help of the Observatoire FrancËais de la ScleÂrose en Plaques (OFSEP), which is supported by a grant provided by the French State and handled by the 'Agence Nationale de la Recherche,' within the framework of the 'Investments for the Future' programme, under the reference ANR-10-COHO-002, and the Eugène Devic EDMUS Foundation against multiple sclerosis., ANR-10-COHO-0002,OFSEP,Observatoire Français de la Sclérose en Plaques(2010), Commowick, Olivier, Cohortes - Observatoire Français de la Sclérose en Plaques - - OFSEP2010 - ANR-10-COHO-0002 - COHO - VALID, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Maladies chroniques, santé perçue, et processus d'adaptation ( APEMAC ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) ( INRS ( Vandoeuvre lès Nancy) ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Neurologie [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Département Méthodes quantitatives en santé publique ( METIS ), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), CIC-Nancy, Institut Lorrain du Coeur et des Vaisseaux Louis Mathieu [Nancy]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), ANR-10-COHO-002-01/10-COHO-0002,OFSEP,Observatoire Français de la Sclérose en Plaques ( 2010 ), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), and Université de Lorraine (UL)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, Pediatrics, Cross-sectional study, Economics, Social Sciences, lcsh:Medicine, Geographical Locations, 0302 clinical medicine, Geoinformatics, Credible interval, Medicine and Health Sciences, Prevalence, 030212 general & internal medicine, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, lcsh:Science, education.field_of_study, Multidisciplinary, Latitude, Geography, Age Factors, Neurodegenerative Diseases, Spatial Autocorrelation, humanities, 3. Good health, Hospitalization, Europe, Political Geography, Neurology, Female, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, France, Research Article, Cartography, medicine.medical_specialty, Computer and Information Sciences, Multiple Sclerosis, Neural Networks, Political Science, Population, Immunology, MEDLINE, Autoimmune Diseases, 03 medical and health sciences, Sex Factors, Health Economics, Health insurance, medicine, Humans, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], education, Socioeconomic status, [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, business.industry, Multiple sclerosis, lcsh:R, Biology and Life Sciences, Bayes Theorem, medicine.disease, Metropolitan area, Demyelinating Disorders, Health Care, Cross-Sectional Studies, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], People and Places, Earth Sciences, Clinical Immunology, lcsh:Q, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Clinical Medicine, business, 030217 neurology & neurosurgery, Demography, Health Insurance, Neuroscience
Abstract: International audience; INTRODUCTION:Geographical variation in the prevalence of multiple sclerosis (MS) is controversial. Heterogeneity is important to acknowledge to adapt the provision of care within the healthcare system. We aimed to investigate differences in prevalence of MS in departments in the French territory.METHODS:We estimated MS prevalence on October 31, 2004 in 21 administrative departments in France (22% of the metropolitan departments) by using multiple data sources: the main French health insurance systems, neurologist networks devoted to MS and the Technical Information Agency of Hospitalization. We used a spatial Bayesian approach based on estimating the number of MS cases from 2005 and 2008 capture-recapture studies to analyze differences in prevalence.RESULTS:The age- and sex-standardized prevalence of MS per 100,000 inhabitants ranged from 68.1 (95% credible interval 54.6, 84.4) in Hautes-Pyrénées (southwest France) to 296.5 (258.8, 338.9) in Moselle (northeast France). The greatest prevalence was in the northeast departments, and the other departments showed great variability.DISCUSSION:By combining multiple data sources into a spatial Bayesian model, we found heterogeneity in MS prevalence among the 21 departments of France, some with higher prevalence than anticipated from previous publications. No clear explanation related to health insurance coverage and hospital facilities can be advanced. Population migration, socioeconomic status of the population studied and environmental effects are suspected.
Published: 2016
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11. Cortical activity and egocentric representation: An fMRI study

Author: Lucie Chochina, Isabelle Bonan, Elise Bannier, Annelise Raillon Moulinet, Jean-Christophe Ferré, Stéphanie Leplaideur, CHU Pontchaillou [Rennes], Médecine physique et de réadaptation [Rennes] (MPR), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Radiologie [CHU de Rennes], Université de Rennes (UR), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes] = Radiology [Rennes], Cognition and Action Group (COGNAC-G - UMR 8257), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Mouvement Sport Santé (M2S), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes (UR)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Médecine physique et de réadaptation, CHU Rennes, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Cognition and Action Group ( COGNAC-G - UMR 8257 ), École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Mouvement Sport Santé ( M2S ), École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Brest ( UBO ) -Université de Rennes 2 ( UR2 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Médecine physique et de réadaptation [CHU Rennes] (MPR), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Subjects: media_common.quotation_subject, 05 social sciences, Rehabilitation, Representation (systemics), Healthy subjects, Spatial cognition, Trunk, Spatial memory, 050105 experimental psychology, Task (project management), 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Perception, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], 0501 psychology and cognitive sciences, Orthopedics and Sports Medicine, Spatial localization, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], 10. No inequality, Psychology, 030217 neurology & neurosurgery, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, media_common, Cognitive psychology
Abstract: Objective Subjects use different referentials for spatial localization, and the egocentric references are very often impaired especially during stroke. The objective is to find the difference between activations induced by 2 egocentric tasks Material/Patients and methods Seventeen right-handed healthy subjects (50.4 ± 14.9 years) were tested using fMRI during the realization of 2 egocentric spatial tasks: the perception of the straight ahead (retinocentric) and the longitudinal axis of the body (centered by the trunk). Results For both tasks, cerebral activations dominated largely in the right hemisphere and interest essentially the right frontoparietal network. However, the straight ahead task showed more specific activations in insular and thalamic areas. Discussion - Conclusion The activations areas found for the 2 egocentric tasks are superimposed with a predominance in right frontotemporal-parietal network, however, the straight ahead task activates quite specifically regions that are closed to the areas usually activated for allocentric tasks, which suggests a continuum between spatial perception in personal trunk centered egocentric referential, retinotopic extrapersonal retinocentric egocentric referential and allocentric referential.
Published: 2016
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12. Classification of surgical processes using dynamic time warping

Author: Pierre Jannin, Germain Forestier, Brivael Trelhu, Laurent Riffaud, Florent Lalys, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Service de neurochirurgie [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Forestier, Germain, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)
Subjects: Models, Anatomic, Dynamic time warping, Process modeling, [SDV.MHEP.CHI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, Computer science, education, ComputingMethodologies_IMAGEPROCESSINGANDCOMPUTERVISION, Context (language use), Surgery evaluation, Health Informatics, [SDV.MHEP.CHI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, Similarity measure, Surgical process models, Machine learning, computer.software_genre, Clustering, 030218 nuclear medicine & medical imaging, Terminology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Humans, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [ SDV.MHEP.CHI ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, Set (psychology), Cluster analysis, [ STAT.ML ] Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML], business.industry, Specific-information, Classification, Computer Science Applications, Surgery, Computer-Assisted, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Clinical Competence, Artificial intelligence, business, computer, Algorithms, Intervertebral Disc Displacement, Medical Informatics, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; In the creation of new computer-assisted intervention systems, Surgical Process Models (SPMs) are an emerging concept used for analyzing and assessing surgical interventions. SPMs represent Surgical Processes (SPs) which are formalized as symbolic structured descriptions of surgical interventions using a pre-defined level of granularity and a dedicated terminology. In this context, one major challenge is the creation of new metrics for the comparison and the evaluation of SPs. Thus, correlations between these metrics and pre-operative data are used to classify surgeries and highlight specific information on the surgery itself and on the surgeon, such as his/her level of expertise. In this paper, we explore the automatic classification of a set of SPs based on the Dynamic Time Warping (DTW) algorithm. DTW is used to compute a similarity measure between two SPs that focuses on the different types of activities performed during surgery and their sequencing, by minimizing time differences. Indeed, it turns out to be a complementary approach to the classical methods that only focus on differences in the time and the number of activities. Experiments were carried out on 24 lumbar disk herniation surgeries to discriminate the surgeons level of expertise according to a prior classification of SPs. Supervised and unsupervised classification experiments have shown that this approach was able to automatically identify groups of surgeons according to their level of expertise (senior and junior), and opens many perspectives for the creation of new metrics for comparing and evaluating surgeries.
Published: 2012
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13. Early post-stroke period: A privileged time for sensory re-weighting?

Author: Sophie Tasseel Ponche, Pierre P Vidal, A. Marquer, Florence Gaillard, Isabelle Bonan, Alain Yelnik, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire Mouvement Sport Santé (M2S), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Cognition and Action Group (COGNAC-G - UMR 8257), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes (UR)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Mouvement Sport Santé ( M2S ), École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Brest ( UBO ) -Université de Rennes 2 ( UR2 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Cognition and Action Group ( COGNAC-G - UMR 8257 ), and École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: Male, Vestibule, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], Physical Therapy, Sports Therapy and Rehabilitation, Sensory system, Hemiplegia, Timed Up and Go test, Audiology, medicine, Humans, Stroke, Labyrinth, Balance (ability), Vestibular system, Proprioception, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Rehabilitation, General Medicine, Optokinetic reflex, Middle Aged, medicine.disease, Berg Balance Scale, Case-Control Studies, Visual Perception, Female, Vestibule, Labyrinth, Psychology
Abstract: International audience; BACKGROUND: Shortly after stroke, patients exhibit excessive sensitivity to visual, proprioceptive and vestibular perturbations regarding balance control. OBJECTIVE: To evaluate the stability of this perceptual behaviour after stroke and test the relationships between sensory sensitivity and balance. METHODS: Thirty subjects following a hemispheric stroke (mean age 54.7 (standard deviation (SD) 10.6 years), 21 men, right hemisphere lesion = 13) and 30 control subjects (mean age 52.0 (SD 12.0), 14 men). Sensitivity to sensory perturbations was evaluated using the displacement of the centre of pressure during tendon vibration (proprioception score), optokinetic (visual score) and galvanic perturbations (vestibular score) while standing on a force-platform a mean of 2 months after stroke, and 1 month later. Balance and independence were evaluated using the Berg Balance Scale (BBS), Timed Up and Go test (TUG) and Barthel Index (BI). RESULTS: Global sensitivity to perturbations decreased (p = 0.001). Patients remained more sensitive to visual perturbation than did controls (p = 0.033). The Vestibular Score was correlated with BBS (Rs = -0.576, p = 0.006), TUG (Rs = 0.408, p = 0.045), BI (Rs = -0.481, p = 0.016); the Visual Score was correlated with BBS (Rs = -0.500, p = 0.019), TUG (Rs = 0.401, p = 0.049). CONCLUSION: The initial months following stroke appear to be a period of individual perceptual motor adaptation. Sensory re-weighting is likely to be a major component of that process.
Published: 2015
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14. Motor strategies of postural control after hemispheric stroke [Stratégies motrices du contrôle postural après AVC hémisphérique]

Author: Tasseel-Ponche , S., Yelnik , A. P., Bonan , I. V, CHU Amiens-Picardie, Cognition and Action Group (COGNAC-G - UMR 8257), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Médecine physique et de réadaptation [Rennes] (MPR), CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire Mouvement Sport Santé (M2S), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes (UR)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre hospitalier universitaire d'Amiens (CHU Amiens-Picardie), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec, Médecine physique et de réadaptation [CHU Rennes] (MPR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre hospitalier universitaire d'Amiens ( CHU Amiens-Picardie ), Cognition and Action Group ( COGNAC-G - UMR 8257 ), École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Médecine physique et de réadaptation, CHU Rennes, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Laboratoire Mouvement Sport Santé ( M2S ), École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Brest ( UBO ) -Université de Rennes 2 ( UR2 ), and Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Subjects: Balance, AVC, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], Posture, Rehabilitation, Debout, Rééducation, Équilibre, Stroke, Adaptation, Stratégies, Adaptationés, Standing
Abstract: International audience; After stroke, the causes of balance disorders include motor disorders, sensory loss, perceptual deficits and altered spatial cognition. This review focuses on motor strategies for postural control after stroke. Weight-bearing asymmetry, smaller surface of stability, increased sway, body tilting and sometimes pushing syndrome are observed. Weakness and sensory impairments account only for some of these disturbances; altered postural reactions and anticipated postural adjustments as well as abnormal synergistic muscular activation play an important part. These disorders are often linked to cognitive impairments (visuospatial analysis, perception of verticality, use of sensory information, attention, etc.), which explain the preeminent disorders of postural control seen with right rather than left-hemisphere lesions. Most of the motor changes are due to an impaired central nervous system but some could be considered adaptive behaviors. These changes have consequences for rehabilitation and need further studies for building customized programs based on the motor comportment of a given patient
Published: 2015
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15. Adult-onset genetic leukoencephalopathies: a MRI pattern-based approach in a comprehensive study of 154 patients

Author: Gilles Edan, Nicolas Collongues, Frédéric Blanc, Eloi Magnin, Marc Bataillard, Mickael Cohen, Thierry Levade, David Brassat, Jean-Philippe Neau, Patrizia Amati-Bonneau, Xavier Ayrignac, Maurice Giroud, Patrick Vermersch, Eric Berger, Cyril Goizet, Celine Bellesme, Clarisse Carra-Dalliere, Jean Louis Devoize, Christophe Verny, Anne Marie Guennoc, Pierre Labauge, Marc Debouverie, Pierre Clavelou, Thibault Moreau, Jean Pelletier, Laurent Magy, Bruno Brochet, Christian Denier, Jean-Philippe Camdessanché, Sandrine Wiertlewski, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Christophe Ouallet, Gilles Defer, Frédérique Taithe, Elsa Kaphan, Nathalie Derache, Françoise Durand-Dubief, Michel Clanet, Sandra Vukusic, Christine Lebrun-Frenay, Stéphane Mathis, Olivier Outteryck, Bertrand Audoin, Lucie Guyant-Maréchal, Odile Boespflug Tanguy, Elisabeth Tournier-Lasserve, Didier Hannequin, Hélène Zéphir, Jean-Baptiste Chanson, Emmanuelle Le Page, Patrick Aubourg, Sophie Pittion, Jérôme De Seze, Imen Dorboz, Véronique Deburghgraeve, Giovanni Castelnovo, Dominique Bonneau, Julien Masliah-Planchon, David-Axel Laplaud, CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Université Montpellier 1 (UM1), Institut des Neurosciences de Montpellier - Déficits sensoriels et moteurs (INM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Department of Neuroradiology, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Bicêtre, AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), CHU Marseille, Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [Strasbourg], CHU Strasbourg, Laboratoire d'imagerie et de neurosciences cognitives (Strasbourg), Laboratoire d'Imagerie et de Neurosciences Cognitives (LINC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Etienne, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Pôle neurosciences [Hôpital de Purpan - Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Laboratoire d'Immunologie (EA 2686), Université de Lille, Droit et Santé, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre d'investigation clinique [Nancy] (CIC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service de neurologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Service de Neurologie [Rennes] = Neurology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Gérontologie (BICETRE - Géronto), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Biologie Neurovasculaire et Mitochondriale Intégrée (BNMI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université d'Angers (UA), Mitochondrie : Régulations et Pathologie, Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique médicale et fonctionnelle du cancer et des maladies neuropsychiatriques, Service de Neurologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Clermont-Ferrand, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de Neurologie [CHU Limoges], CHU Limoges, Centre Hospitalier d'Angoulême (CH Angoulême), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuroprotection du Cerveau en Développement / Promoting Research Oriented Towards Early Cns Therapies (PROTECT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université de Montpellier (UM), Institut des Neurosciences de Montpellier (INM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Pôle Neurosciences [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Université Montpellier 1 ( UM1 ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Hôpital Bicêtre, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes ( CHRU Nîmes ), Centre de résonance magnétique biologique et médicale ( CRMBM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Imagerie et de Neurosciences Cognitives ( LINC ), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CHU Nice, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Laboratoire d'Immunologie ( EA 2686 ), Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, CIC-Nancy, Institut Lorrain du Coeur et des Vaisseaux Louis Mathieu [Nancy]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - 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Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), CHRU Tours, Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ), Centre Hospitalier d'Angoulême, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Promoting Research Oriented Towards Early Cns Therapies ( PROTECT ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - 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Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Adult, Male, Pediatrics, medicine.medical_specialty, Pathology, leukodystrophy, Adolescent, [SDV]Life Sciences [q-bio], White matter, Leukoencephalopathy, Young Adult, metabolic, Leukoencephalopathies, medicine, Humans, Age of Onset, 10. No inequality, CADASIL, Aged, Retrospective Studies, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], medicine.diagnostic_test, business.industry, Leukodystrophy, Retrospective cohort study, Magnetic resonance imaging, Middle Aged, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, White Matter, 3. Good health, Cerebrovascular Disorders, medicine.anatomical_structure, Cohort, Female, Neurology (clinical), France, Age of onset, genetic, business, MRI
Abstract: International audience; Inherited white matter diseases are rare and heterogeneous disorders usually encountered in infancy. Adult-onset forms are increasingly recognized. Our objectives were to determine relative frequencies of genetic leukoencephalopathies in a cohort of adult-onset patients and to evaluate the effectiveness of a systematic diagnostic approach. Inclusion criteria of this retrospective study were: (i) symmetrical involvement of white matter on the first available brain MRI; (ii) age of onset above 16 years. Patients with acquired diseases were excluded. Magnetic resonance imaging analysis identified three groups (vascular, cavitary and non-vascular/non-cavitary) in which distinct genetic and/or biochemical testing were realized. One hundred and fifty-four patients (male/female = 60/94) with adult-onset leukoencephalopathies were identified. Mean age of onset was 38.6 years. In the vascular group, 41/55 patients (75%) finally had a diagnosis [including CADASIL (cerebral autosomal-dominant arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy, n = 32) and COL4A1 mutation, n = 7]. In the cavitary group, 13/17 (76%) patients had a diagnosis of EIF2B-related disorder. In the third group (n = 82), a systematic biological screening allowed a diagnosis in 23 patients (28%) and oriented direct genetic screening identified 21 additional diseases (25.6%). Adult-onset genetic leukoencephalopathies are a rare but probably underestimated entity. Our study confirms the use of a magnetic resonance imaging-based classification with a final diagnosis rate of 64% (98/154) cases.
Published: 2014
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16. Incidence of nephrogenic systemic fibrosis in patients undergoing dialysis after contrast-enhanced magnetic resonance imaging with gadolinium-based contrast agents: the Prospective Fibrose Nephrogénique Systémique study

Author: Sabine Amet, Geneviève Reinhardt, Gabriel Choukroun, Olivier Clément, Camille Frances, Nicolas Janus, Jean-Yves Gauvrit, Aurore Tricotel, Maurice Laville, Vincent Launay-Vacher, Nicolas Grenier, Gilbert Deray, Bénédicte Stengel, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC - UMR-S U970), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Tenon [AP-HP], Agence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de Santé (AFSSAPS), AFSSAPS, Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes] = Radiology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie moléculaire et fonctionnelle: de la physiologie à la thérapie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-IFR8-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hospital Haguenau · Radiodiagnostic, Mécanismes physiologiques et conséquences des calcifications cardiovasculaires: rôle des remodelages cardiovasculaires et osseux, Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Identités, Territoires, Expressions, Mobilités (ITEM), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Pharmacie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire ( PARCC - U970 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] ( HEGP ), Service de Dermatologie [CHU Tenon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Tenon [APHP], Agence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de Santé ( AFSSAPS ), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations ( CESP ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-IFR8-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Identités, Territoires, Expressions, Mobilités ( ITEM ), Université de Pau et des Pays de l'Adour ( UPPA ), Service de dermatologie et allergologie [CHU Tenon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Gauvrit, Jean-Yves, Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)
Subjects: Nephrology, Nephrogenic Fibrosing Dermopathy, Adult, Male, medicine.medical_specialty, medicine.medical_treatment, Gadolinium, [SDV]Life Sciences [q-bio], chemistry.chemical_element, Contrast Media, Gastroenterology, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Humans, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Renal Insufficiency, Chronic, Prospective cohort study, Dialysis, Aged, [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Aged, 80 and over, medicine.diagnostic_test, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Incidence, Magnetic resonance imaging, General Medicine, Middle Aged, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, 3. Good health, Clinical trial, [SDV] Life Sciences [q-bio], chemistry, Nephrogenic systemic fibrosis, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Female, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Radiology, France, business
Abstract: Nephrogenic systemic fibrosis (NSF) has been related to the use of gadolinium-based contrast agents (GBCAs) in patients undergoing dialysis. The Prospective Fibrose Nephrogénique Systémique study, a French prospective study supported by the French drug regulatory agency (Agence Nationale de Sécurité du Médicament) and the French Societies of Nephrology, Dermatology, and Radiology, aimed at determining the incidence of NSF in patients undergoing long-term dialysis.Adult patients undergoing long-term dialysis receiving a magnetic resonance imaging (MRI) examination prescribed between January 15, 2009 and May 31, 2011, with or without GBCA were included. The methodology was based on a patient form intended to detect any dermatological event (DE) that may occur within 4 months after the examination. Further investigations were planned with their physicians if a DE was reported.A total of 571 patients were included. A total of 50.3% received GBCA. Among them, 93.4% received a macrocyclic GBCA, usually gadoteric acid (88.9%). All in all, 22 patients (3.9%) reported a DE. Dermatological diagnoses did not reveal any evidence of NSF.The incidence of NSF after a single dose of a macrocyclic GBCA is null in our sample of 268 patients undergoing dialysis (hemodialysis and peritoneal dialysis). This incidence is just lower than 0.5%. When contrast-enhanced MRI can be essential, or even decisive, to the diagnosis, these results are important and reassuring if physicians need to perform contrast-enhanced MRI in patients undergoing dialysis.
Published: 2014
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17. Semi-Automatic Classification of Lesion Patterns in Patients with Clinically Isolated Syndrome

Author: Gilles Edan, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Adil Maarouf, Olivier Commowick, Alessandro Crimi, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes] = Radiology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [Reims], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de résonance magnétique biologique et médicale ( CRMBM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU Reims ), and Commowick, Olivier
Subjects: Pathology, medicine.medical_specialty, Central nervous system, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, Disease, 030218 nuclear medicine & medical imaging, Lesion, 03 medical and health sciences, Myelin, 0302 clinical medicine, medicine, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Clinically isolated syndrome, [ INFO.INFO-IM ] Computer Science [cs]/Medical Imaging, business.industry, Multiple sclerosis, Subtraction, Neurophysiology, medicine.disease, medicine.anatomical_structure, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, medicine.symptom, business, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; Multiple sclerosis (MS) is neuro-degenerative disease of the Central Nervous System characterized by the loss of myelin. A Clinically Isolated Syndrome (CIS) is a first neurological episode caused by inflammation/demyelination in the central nervous system which may lead to MS. Better understanding of the disease at its onset will lead to a better discovery of pathogenic mechanisms, allowing suitable therapies at an early stage. We propose an automatic segmentation algorithm for two different contrast agents, used within a framework for early characterization of CIS patients according to lesion patterns, and more specifically according to the nature of the inflammatory patterns of these lesions. We expect that the proposed framework can infer new prospective figures from the earliest imaging signs of MS since it can provide a classification of different types of lesions across patients. The lesion detection algorithm based on intensity normalization and subtraction of the used MRI data is a pivotal step, since it avoids the time-demanding task of manual delineation.
Published: 2013
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18. Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project

Author: Michel, Franck, Gaignard, Alban, Ahmad, Farooq, Barillot, Christian, Batrancourt, Bénédicte, Dojat, Michel, Gibaud, Bernard, Girard, Pascal, Godard, David, Kassel, Gilles, Lingrand, Diane, Malandain, Grégoire, Montagnat, Johan, Pélégrini-Issac, Mélanie, Pennec, Xavier, Rojas Balderrama, Javier, Wali, Bacem, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe MODALIS, Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems (Laboratoire I3S - SPARKS), Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (CRICM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut d'imagerie neurofonctionnelle (IIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure des Télécommunications (ENST)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Analysis and Simulation of Biomedical Images (ASCLEPIOS), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Visioscopie, Modélisation, Information et Systèmes - UR UPJV 4290 (MIS), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Laboratoire d'Imagerie Fonctionnelle (LIF), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR14-IFR49-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Tony Solomonides, Ignacio Blanquer, Vincent Breton, Tristan Glatard, Yannick Legré, ANR-06-TLOG-0024,NeuroLOG,NeuroLOG: technologies logicielles pour l'intégration de traitements, de données et de connaissances en imagerie médicale(2006), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Ecole Nationale Supérieure des Télécommunications (ENST)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems ( SPARKS ), Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis ( I3S ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis ( I3S ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière ( CRICM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Institut d'imagerie neurofonctionnelle ( IIN ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -École des hautes études en sciences sociales ( EHESS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-ENST-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Grenoble Institut des Neurosciences ( GIN ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Analysis and Simulation of Biomedical Images ( ASCLEPIOS ), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée ( CRISAM ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ), Modélisation, Information & Systèmes ( MIS ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), Laboratoire d'Imagerie Fonctionnelle ( LIF ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IFR14-IFR49-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), ANR-06-TLOG-0024,NeuroLOG,NeuroLOG: technologies logicielles pour l'intégration de traitements, de données et de connaissances en imagerie médicale ( 2006 ), CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Grosset, Aline, and Programme Technologies Logicielles - NeuroLOG: technologies logicielles pour l'intégration de traitements, de données et de connaissances en imagerie médicale - - NeuroLOG2006 - ANR-06-TLOG-0024 - TLOG - VALID
Subjects: [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, ComputingMilieux_GENERAL, Computer Communication Networks, User-Computer Interface, Software Design, Image Processing, Computer-Assisted, Neurosciences, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Medical Informatics Applications, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Article
Abstract: International audience; Grid technologies are appealing to deal with the challenges raised by computational neurosciences and support multi-centric brain studies. However, core grids middleware hardly cope with the complex neuroimaging data representation and multi-layer data federation needs. Moreover, legacy neuroscience environments need to be preserved and cannot be simply superseded by grid services. This paper describes the NeuroLOG platform design and implementation, shedding light on its Data Management Layer. It addresses the integration of brain image files, associated relational metadata and neuroscience semantic data in a heterogeneous distributed environment, integrating legacy data managers through a mediation layer.
Published: 2010
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19. The impact of processing workflow in performance of automatic white matter lesion segmentation in Multiple Sclerosis

Author: García-Lorenzo, Daniel, Prima, Sylvain, Parkes, Laura, Ferré, Jean-Christophe, Morrissey, Sean Patrick, Barillot, Christian, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Magnetic Resonance and Image Analysis Research Centre ( MARIARC ), University of Liverpool, Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], García-Lorenzo, Daniel, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Magnetic Resonance and Image Analysis Research Centre (MARIARC), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes] = Radiology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)
Subjects: [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, ComputingMethodologies_IMAGEPROCESSINGANDCOMPUTERVISION, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering
Abstract: International audience; The design of a robust automatic segmentation workflow is crucial to deal with the shortcomings of images that impacts on their analysis. In this paper, different workflows, using state-of-the-art tools, are compared in order to evaluate the role of the different preprocessing tasks.We propose some methods in order to improve the computing time, robustness and accuracy of the segmentation method. We compare with manual segmentation as ground truth the workflows and improvements in the segmentation method. Finally, we present a new automatic workflow for white matter lesions segmentation in Multiple Sclerosis.
Published: 2008

20. Imagerie cardiaque avant resynchronisation biventriculaire

Author: Pierre-Axel Lentz, Elena Galli, Christophe Leclercq, Erwan Donal, Mathieu Lederlin, Nicolas Courtial, Thibaut Lapotre, Elise Bannier, Charlélie Erhart, CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuroimagerie: méthodes et applications (EMPENN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAL, IMAGE ET LANGAGE (IRISA-D6), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), and CCSD, Accord Elsevier
Subjects: Gynecology, medicine.medical_specialty, medicine.diagnostic_test, business.industry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Heart failure, Resynchronisation cardiaque échocardiographie, Computed tomography, Magnetic Resonance Imaging, Tomodensitométrie, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 3. Good health, Cardiac Resynchronization Therapy, Insuffisance cardiaque, [SDV] Life Sciences [q-bio], 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, 030220 oncology & carcinogenesis, Imagerie par résonance magnétique, medicine, Ultrasonography, business
Abstract: Cardiac Resynchronization Therapy (CRT) is part of the therapeutic armamentarium in end-stage heart failure. It consists in implanting two leads that synchronously stimulate the right and left ventricles and thus improve cardiac hemodynamics. To date, CRT is reserved for patients in sinus rhythm with LVEF < 35% and electrical ventricular dyssynchrony defined by a QRS > 150 ms and a left bundle branch block. However, 30 to 40% of the patients are non-responders to CRT, which suggests that the selection criteria can be improved. Currently, radiologists are requested in a pre-CRT work-up mainly to perform cardiac MRI and to quantify LVEF. However, the development of ultrasound, MRI and CT cardiac techniques, has made it possible to study new parameters that could improve the selection of patients and to hope for a better response rate to CRT. These parameters may be mechanical dyssynchrony, myocardial scar and interstitial fibrosis, or coronary venous anatomy. These data can be combined or even merged in order to stratify patients more precisely and/or to serve as a guide for CRT implantation. In this article, we propose to review the various imaging techniques, which, beyond the current guidelines, could help to refine patient selection and improve their response to CRT in the future., La resynchronisation cardiaque (CRT — Cardiac Resynchronization Therapy) fait partie de l’arsenal thérapeutique dans l’insuffisance cardiaque terminale. Cette technique consiste à implanter deux sondes stimulant de façon synchrone les ventricules droit et gauche et ainsi améliorer l’hémodynamique cardiaque. À ce jour, la CRT est réservée aux patients en rythme sinusal avec une FEVG < 35 % et un asynchronisme électrique défini par un QRS > 150 ms et un aspect de bloc de branche gauche. Cependant, 30 à 40 % des patients ainsi sélectionnés sont non répondeurs, preuve de la perfectibilité des critères de sélection. Actuellement, les radiologues sont sollicités dans un bilan pré-CRT essentiellement pour faire une IRM cardiaque et déterminer précisément la FEVG. Cependant, l’évolution des techniques d’imagerie, aussi bien échocardiographiques que IRM et TDM, a permis l’émergence de nouveaux paramètres susceptibles d’améliorer la sélection des patients et d’espérer à terme un meilleur taux de réponse à la CRT. Ces paramètres sont par exemple l’étude de l’asynchronisme mécanique, l’analyse des cicatrices macroscopiques et de la fibrose interstitielle myocardique, ou encore l’étude de l’anatomie veineuse coronaire. Ces informations peuvent être combinées, voire fusionnées afin de stratifier plus précisément les patients et/ou de proposer une assistance per-procédure aux cardiologues lors de l’implantation. Nous nous proposons dans cet article de passer en revue les différentes techniques et méthodes d’imagerie qui, au-delà des critères de sélection actuellement recommandés, pourraient permettre d’affiner la sélection des patients et d’améliorer leur réponse à la CRT dans le futur.
Published: 2021
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21. Les relations paysage-hôtes dans les processus épidémiologiques du parasite Echinococcus multilocularis

Author: Tolle, Florian, Combès, Benoît, Cliquet, Florence, Giraudoux, P., Tourneux, François-Pierre, Théoriser et modéliser pour aménager (UMR 6049) (ThéMA), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Universitaire de France (IUF), Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.), Maison des Sciences de l'Homme et de l'Environnement Claude Nicolas Ledoux (MSHE), Théoriser et modéliser pour aménager ( ThéMA ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -CentraleSupélec-Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Télécom Bretagne-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), French Agency for Food, Environmental and Occupational Health Safety [Maisons-Alfort] ( ANSES ), ANSES, Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut Universitaire de France ( IUF ), Ministère de l'Éducation nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche ( M.E.N.E.S.R. ), Maison des Sciences de l'Homme et de l'Environnement Claude Nicolas Ledoux ( MSHE ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Université de Bourgogne Franche-Comté, Théoriser et modéliser pour aménager (UMR 6049), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Maison des Sciences de l'Homme et de l'Environnement Claude Nicolas Ledoux (UAR 3124) (MSHE), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Université de Franche-Comté (UFC)
Subjects: [SHS.GEO] Humanities and Social Sciences/Geography, processus épidémiologiques, Echinococcus multilocularis, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, relations paysages-hôtes
Abstract: National audience
Published: 2005

22. MSSEG-2: Un challenge d'imagerie médicale sur VIP

Author: Camarasu-Pop, Sorina, Bonnet, Axel, Masson, Arthur, Kain, Michael, Dojat, Michel, Commowick, Olivier, Cervenansky, Frédéric, Service Informatique et développements, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Images et Modèles, Université de Rennes (UR), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), France Life Imaging - Information Analysis and Management [IRISA, Rennes] (FLI-IAM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and POP, Sorina
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [INFO] Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2021

23. MSSEG-2: A medical imaging challenge on VIP

Author: Camarasu-Pop, Sorina, Bonnet, Axel, Masson, Arthur, Kain, Michael, Dojat, Michel, Commowick, Olivier, Cervenansky, Frédéric, Service Informatique et développements, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Images et Modèles, Université de Rennes (UR), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), France Life Imaging - Information Analysis and Management [IRISA, Rennes] (FLI-IAM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), POP, Sorina, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [INFO] Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2021

24. Multidomain spectral method for the Gauss hypergeometric function

Author: Marco Fasondini, Nikola Stoilov, Christian Klein, Siegfried Crespo, Corentin Vallée, Institut de Mathématiques de Bourgogne [Dijon] (IMB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB), University of Kent [Canterbury], Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), université de Bourgogne, IMB, Approches analytiques, numériques et des systèmes intégrables pour les équations aux dérivées partielles dispersives nonlinéaires - - ANuI2017 - ANR-17-CE40-0035 - AAPG2017 - VALID, Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Mathematics (University of Kent), Neuroimagerie: méthodes et applications (Empenn), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), This work was partially supported by the PARI and FEDER programs in 2016 and 2017, by the ANR-FWF project ANuI by the isite BFC via the project NAANoD and by the Marie-Curie RISE network IPaDEGAN. M. Fasondini acknowledges financial support from the EPSRC grant EP/P026532/1., ANR-17-CE40-0035,ANuI,Approches analytiques, numériques et des systèmes intégrables pour les équations aux dérivées partielles dispersives nonlinéaires(2017), Vallée, Corentin, Empenn, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
Subjects: Singular differential equations, Mathematics::Classical Analysis and ODEs, Riemann sphere, [MATH] Mathematics [math], 010103 numerical & computational mathematics, 01 natural sciences, symbols.namesake, FOS: Mathematics, Hypergeometric function, Mathematics - Numerical Analysis, [MATH]Mathematics [math], 0101 mathematics, QA, Mathematics, Laplace's equation, Applied Mathematics, Riemann surface, Mathematical analysis, Numerical Analysis (math.NA), [MATH.MATH-NA] Mathematics [math]/Numerical Analysis [math.NA], Hypergeometric distribution, 010101 applied mathematics, Spectral methods, Harmonic function, Ordinary differential equation, symbols, Spectral method, [MATH.MATH-NA]Mathematics [math]/Numerical Analysis [math.NA]
Abstract: International audience; We present a multidomain spectral approach for Fuchsian ordinary differential equations in the particular case of the hypergeometric equation. Our hybrid approach uses Frobenius’ method and Moebius transformations in the vicinity of each of the singular points of the hypergeometric equation, which leads to a natural decomposition of the real axis into domains. In each domain, solutions to the hypergeometric equation are constructed via the well-conditioned ultraspherical spectral method. The solutions are matched at the domain boundaries to lead to a solution which is analytic on the whole compactified real line R∪∞, except for the singular points and cuts of the Riemann surface on which the solution is defined. The solution is further extended to the whole Riemann sphere by using the same approach for ellipses enclosing the singularities. The hypergeometric equation is solved on the ellipses with the boundary data from the real axis. This solution is continued as a harmonic function to the interior of the disk by solving the Laplace equation in polar coordinates with an optimal complexity Fourier–ultraspherical spectral method. In cases where logarithms appear in the solution, a hybrid approach involving an analytical treatment of the logarithmic terms is applied. We show for several examples that machine precision can be reached for a wide class of parameters, but also discuss almost degenerate cases where this is not possible.
Published: 2019
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25. SANDI-AMICO: an open-source toolbox for fast Soma And Neurite Density Imaging (SANDI) with AMICO

Author: Schiavi, Simona, Ocampo-Pineda, Mario, Truffet, Raphaël, Caruyer, Emmanuel, Daducci, Alessandro, Palombo, Marco, Department of Computer Science [Verona] (UNIVR | DI), Università degli studi di Verona = University of Verona (UNIVR), Università degli studi di Genova = University of Genoa (UniGe), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Neuroimagerie: méthodes et applications (EMPENN), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAL, IMAGE ET LANGAGE (IRISA-D6), University College of London [London] (UCL), Cardiff University's Brain Research Imaging Centre [Cardiff] (CUBRIC), School of Psychology [Cardiff University], Cardiff University-Cardiff University, Cardiff University, and Caruyer, Emmanuel
Subjects: [SCCO.COMP] Cognitive science/Computer science, [SCCO.COMP]Cognitive science/Computer science
Abstract: International audience; The soma and neurite density imaging (SANDI) model has been recently introduced to estimate diffusion MRI indices of apparent neurite and soma density noninvasively in the brain. Here, we introduce SANDIAMICO a fast (10 seconds for whole brain images) and robust implementation for estimating SANDI parameters using the Accelerated Microstructure Imaging via Convex Optimization (AMICO) framework. Using numerical simulations and in vivo human data, we show excellent performances of SANDIAMICO in terms of accuracy, precision, robustness to noise and intra-subject reproducibility.
Published: 2021

26. Imagerie cardiaque avant resynchronisation biventriculaire

Author: Erhart, Charlélie, Lapotre, Thibaut, Courtial, Nicolas, Lentz, Pierre-Axel, Bannier, Elise, Galli, Elena, Leclercq, Christophe, Donal, Erwan, Lederlin, Mathieu, CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuroimagerie: méthodes et applications (EMPENN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAL, IMAGE ET LANGAGE (IRISA-D6), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Empenn, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
Subjects: Cardiac Resynchronization Therapy, Insuffisance cardiaque, [SDV]Life Sciences [q-bio], Imagerie par résonance magnétique, Heart failure, Resynchronisation cardiaque échocardiographie, Magnetic Resonance Imaging, Computed tomography, Ultrasonography, Tomodensitométrie
Abstract: National audience; Cardiac Resynchronization Therapy (CRT) is part of the therapeutic armamentarium in end-stage heart failure. It consists in implanting two leads that synchronously stimulate the right and left ventricles and thus improve cardiac hemodynamics. To date, CRT is reserved for patients in sinus rhythm with LVEF < 35% and electrical ventricular dyssynchrony defined by a QRS > 150 ms and a left bundle branch block. However, 30 to 40% of the patients are non-responders to CRT, which suggests that the selection criteria can be improved. Currently, radiologists are requested in a pre-CRT work-up mainly to perform cardiac MRI and to quantify LVEF. However, the development of ultrasound, MRI and CT cardiac techniques, has made it possible to study new parameters that could improve the selection of patients and to hope for a better response rate to CRT. These parameters may be mechanical dyssynchrony, myocardial scar and interstitial fibrosis, or coronary venous anatomy. These data can be combined or even merged in order to stratify patients more precisely and/or to serve as a guide for CRT implantation. In this article, we propose to review the various imaging techniques, which, beyond the current guidelines, could help to refine patient selection and improve their response to CRT in the future.; La resynchronisation cardiaque (CRT — Cardiac Resynchronization Therapy) fait partie de l’arsenal thérapeutique dans l’insuffisance cardiaque terminale. Cette technique consiste à implanter deux sondes stimulant de façon synchrone les ventricules droit et gauche et ainsi améliorer l’hémodynamique cardiaque. À ce jour, la CRT est réservée aux patients en rythme sinusal avec une FEVG < 35 % et un asynchronisme électrique défini par un QRS > 150 ms et un aspect de bloc de branche gauche. Cependant, 30 à 40 % des patients ainsi sélectionnés sont non répondeurs, preuve de la perfectibilité des critères de sélection. Actuellement, les radiologues sont sollicités dans un bilan pré-CRT essentiellement pour faire une IRM cardiaque et déterminer précisément la FEVG. Cependant, l’évolution des techniques d’imagerie, aussi bien échocardiographiques que IRM et TDM, a permis l’émergence de nouveaux paramètres susceptibles d’améliorer la sélection des patients et d’espérer à terme un meilleur taux de réponse à la CRT. Ces paramètres sont par exemple l’étude de l’asynchronisme mécanique, l’analyse des cicatrices macroscopiques et de la fibrose interstitielle myocardique, ou encore l’étude de l’anatomie veineuse coronaire. Ces informations peuvent être combinées, voire fusionnées afin de stratifier plus précisément les patients et/ou de proposer une assistance per-procédure aux cardiologues lors de l’implantation. Nous nous proposons dans cet article de passer en revue les différentes techniques et méthodes d’imagerie qui, au-delà des critères de sélection actuellement recommandés, pourraient permettre d’affiner la sélection des patients et d’améliorer leur réponse à la CRT dans le futur.
Published: 2021
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27. Unsupervised Domain Adaptation With Optimal Transport in Multi-Site Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions From MRI Data

Author: Ackaouy, Antoine, Courty, Nicolas, Vallée, Emmanuel, Commowick, Olivier, Barillot, Christian, Galassi, Francesca, Empenn, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Parcimonie et Nouveaux Algorithmes pour le Signal et la Modélisation Audio (PANAMA), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Environment observation with complex imagery (OBELIX), Université de Bretagne Sud (UBS)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec, Orange Labs [Lannion], France Télécom, SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Observation de l’environnement par imagerie complexe (OBELIX), Neuroimagerie: méthodes et applications (Empenn), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), France Télécom Recherche & Développement (FT R&D), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), and Galassi, Francesca
Subjects: [INFO.INFO-AI] Computer Science [cs]/Artificial Intelligence [cs.AI], Unsupervised domain adaptation, [INFO.INFO-TS] Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, ComputingMethodologies_IMAGEPROCESSINGANDCOMPUTERVISION, Deep learning, [INFO] Computer Science [cs], [INFO.INFO-GR]Computer Science [cs]/Graphics [cs.GR], lcsh:RC321-571, [INFO.INFO-AI]Computer Science [cs]/Artificial Intelligence [cs.AI], [STAT.ML]Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML], [INFO.INFO-TS]Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, convolutional neural networks, Convolutional neural netword, Optimal transport, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, [INFO]Computer Science [cs], MS lesion segmentation, lcsh:Neurosciences. Biological psychiatry. Neuropsychiatry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Neuroscience, Original Research
Abstract: International audience; Automatic segmentation of Multiple Sclerosis (MS) lesions from Magnetic Resonance Imaging (MRI) images is essential for clinical assessment and treatment planning of MS. Recent years have seen an increasing use of Convolutional Neural Networks (CNNs) for this task. Although these methods provide accurate segmentation, their applicability in clinical settings remains limited due to a reproducibility issue across different image domains. MS images can have highly variable characteristics across patients, MRI scanners and imaging protocols; retraining a supervised model with data from each new domain is not a feasible solution because it requires manual annotation from expert radiologists. In this work, we explore an unsupervised solution to the problem of domain shift. We present a framework, Seg-JDOT, which adapts a deep model so that samples from a source domain and samples from a target domain sharing similar representations will be similarly segmented. We evaluated the framework on a multi-site dataset, MICCAI 2016, and showed that the adaptation towards a target site can bring remarkable improvements in a model performance over standard training.
Published: 2020
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28. Atelier MoDaL (Multi-Scale Data Links)

Author: Cornet, Aurélien, Gaignard, Alban, Siegel, Anne, Maumet, Camille, Barillot, Christian, Dameron, Olivier, Redon, Richard, Cornet, Aurélien, Neuroimagerie: méthodes et applications (Empenn), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Dynamics, Logics and Inference for biological Systems and Sequences (Dyliss), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Unité de recherche de l'institut du thorax (ITX-lab), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), IRISA, Inria Rennes, Empenn, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), unité de recherche de l'institut du thorax UMR1087 UMR6291 (ITX), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec, Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, [SCCO.COMP] Cognitive science/Computer science, [SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SCCO.NEUR] Cognitive science/Neuroscience, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SCCO.COMP]Cognitive science/Computer science, [SDV.GEN.GH] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics
Published: 2020

29. Survey of diagnostic and treatment practices for multiple sclerosis in Europe

Author: G. Comi, Patrick Vermersch, Carlo Pozzilli, B. Tackenberg, P. S. Soerensen, Gilles Edan, H.-P. Hartung, M. Delvecchio, Ludwig Kappos, Oscar Fernández, G. Gionvannoni, Sten Fredrikson, Eva Havrdova, SDA Bocconi Scuola di Direzione Aziendale, Service de Neurologie [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Department of Clinical Neurosciences, Neurology Division, Karolinska Institutet, Queen Mary's School of Medicine and Dentistry, Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Neurological Sciences, University of Roma 'La Sapienza', Danish Multiple Sclerosis Research Centre, Rigshospitalet [Copenhagen], Copenhagen University Hospital-Copenhagen University Hospital, Department of Neurology, Philipps Universität Marburg, Hospital Regional Universitario Carlos Haya, Service de Neurologie [Rennes] = Neurology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), departmet of Neurology, Heinrich Heine Universität Düsseldorf = Heinrich Heine University [Düsseldorf], Department of neurology, Charles University [Prague] (CU), Department of Neurology [Suisse], University Hospital Basel [Basel], Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA), Philipps Universität Marburg = Philipps University of Marburg, CHU Lille, Inflammation: mécanismes et régulation et interactions avec la nutrition et les candidoses, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Institute of Experimental Neurology, Division of Neuroscience, San Raffaele Scientific Institute, European Charcot Foundation, Barillot, Christian, Fernã¡ndez, O., Delvecchio, M., Edan, G., Fredrikson, S., Gionvannoni, G., Hartung, H. . P., Havrdova, E., Kappos, L., Pozzilli, C., Soerensen, P. S., Tackenberg, B., Vermersch, P., Comi, Giancarlo, Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], Université de Lille, Université de Lille, Droit et Santé-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-CentraleSupélec-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)
Subjects: Male, MESH: Multiple Sclerosis, Relapsing-Remitting, Delphi Technique, Modified delphi, Disease, MESH: Health Care Surveys, Relapsing-Remitting, Spinal Puncture, MESH: Delphi Technique, MESH: Magnetic Resonance Imaging, 0302 clinical medicine, Surveys and Questionnaires, relapsingâ remitting, 030212 general & internal medicine, clinically isolated syndrome, radiologically isolated syndrome, relapsingâremitting, Adult, Disease Progression, Europe, Female, Humans, Magnetic Resonance Imaging, Multiple Sclerosis, Multiple Sclerosis, Relapsing-Remitting, Neurologists, Health Care Surveys, Neurology, Neurology (clinical), Clinically isolated syndrome, 3. Good health, Clinical Practice, MESH: Disease Progression, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], medicine.medical_specialty, Steering committee, MESH: Spinal Puncture, relapsing−remitting, Disease activity, 03 medical and health sciences, medicine, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Mild form, MESH: Neurologists, MESH: Surveys and Questionnaires, MESH: Humans, business.industry, Multiple sclerosis, MESH: Adult, MESH: Multiple Sclerosis, medicine.disease, MESH: Male, Family medicine, Physical therapy, MESH: Europe, business, MESH: Female, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; Background and purpose - Up-to-date information is needed on the extent to which neurologists treating multiple sclerosis (MS) in Europe are integrating rapidly evolving diagnostic criteria, disease-modifying therapies and recommendations for monitoring disease activity into their clinical practice. Methods - A steering committee of MS neurologists used a modified Delphi process to develop case- and practice-based questions for two sequential surveys distributed to MS neurologists throughout Europe. Case-based questions were developed for radiologically isolated syndrome (RIS), clinically isolated syndrome (CIS), relapsing-remitting MS (RRMS) and RRMS with breakthrough disease. Results - Multiple sclerosis neurologists from 11 European countries responded to survey 1 (n = 233) and survey 2 (n = 171). Respondents agreed that they would not treat the patients in the RIS or CIS cases but would treat a patient with a relatively mild form of RRMS. Choice of treatment was evenly distributed among first-line injectables and oral treatments for mild RRMS, and moved to second-line treatment as the RRMS case increased in severity. Additional results on RRMS with breakthrough disease are presented. Conclusions - Although there was general agreement on some aspects of treatment, responses to other management and clinical practice questions varied considerably. These results, which reflect current clinical practice patterns, highlight the need for additional MS treatment education and awareness and may help inform the development of MS practice guidelines in Europe.
Published: 2017
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30. Learning What You Know: How Prior Knowledge Impairs New Associative Learning in Early AD

Author: Pierre-Yves Jonin, Quentin Duché, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Serge Belliard, Christian Barillot, Emmanuel Barbeau, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), CHU Pontchaillou [Rennes], Neuroimagerie: méthodes et applications (Empenn), Service de Neurologie [CHU Rennes], Centre de recherche cerveau et cognition (CERCO), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Empenn, Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Jonin, Pierre-Yves, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Recognition memory, Associative memory, [SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience, [SCCO.NEUR] Cognitive science/Neuroscience, [SCCO.PSYC] Cognitive science/Psychology, fMRI, [SCCO.PSYC]Cognitive science/Psychology, Alzheimer's disease, Prior Knowledge, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2019

31. Measurement of magnetization transfer ratio (MTR) from cervical spinal cord: Multicenter reproducibility and variability

Author: Benoît Combès, Jean-Christophe Ferré, Laureline Monteau, Christian Barillot, Adil Maarouf, Elise Bannier, Virginie Callot, Jean Pelletier, Gilles Edan, Nicolas Collongues, Xavier Ayrignac, Anne Kerbrat, Pierre Labauge, Jérôme De Seze, Clarisse Carra Dallière, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Radiologie [CHU de Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre d'Exploration Métabolique par Résonance Magnétique [Hôpital de la Timone - AP-HM] (CEMEREM), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Maison Blanche, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de Neuroimagerie in Vivo (LNV), CHU Strasbourg-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Hospital Program of Clinical Research (PHRC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Université de Rennes (UR), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Edan, Gilles, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), AP-HM, Pôle d'imagerie médicale, Hôpital de la Timone, CEMEREM, Marseille, France, CHU Montpellier, Département de Neurologie, AP-HM, CHU Timone, Pole de Neurosciences Cliniques, Department of Neurology, Marseille, France., Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille (AP-HM), Strasbourg University Hospital, France, CIC Strasbourg INSERM 1434, Strasbourg, France, Département de Neurologie [CHU Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], and Centre d'Exploration Métabolique par Résonance Magnétique [Hôpital de la Timone - APHM] (CEMEREM)
Subjects: Adult, Male, Cord, Coefficient of variation, Population, MTR, multicenter, quantitative MRI, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 03 medical and health sciences, Imaging, Three-Dimensional, 0302 clinical medicine, Reference Values, Image Processing, Computer-Assisted, Humans, Medicine, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, Longitudinal Studies, Prospective Studies, Magnetization transfer, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Gray Matter, education, reproducibility, Reproducibility, education.field_of_study, business.industry, Reproducibility of Results, spinal cord, Spinal cord, Magnetic Resonance Imaging, White Matter, Healthy Volunteers, Confidence interval, 3. Good health, Pooled variance, medicine.anatomical_structure, Cervical Vertebrae, Female, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], business, Nuclear medicine, Algorithms
Abstract: International audience; Background - Assessing the multicenter variability of magnetization transfer ratio (MTR) measurements in the spinal cord of healthy controls is the first step toward investigating its clinical use as a biomarker. Purpose - To analyze the between-session, between-participant, and between-scanner variability of MTR measurements in automatically extracted regions of interest in the cervical cord of healthy controls. Study type - Control study. Population - Forty-four participants, distributed across five MRI scanners (all from the same manufacturer). Ten participants were scanned twice in the same scanner, and 10 others were scanned twice in two different scanners. Field strength/sequence - 3D-gradient echo images, centered on C5, without and with magnetization transfer prepulse at 3T. Assessment - We calculated the mean MTR for different vertebral levels in the whole cord (WC), as well as in the white matter and gray matter, and determined the between-session, between-participant, and between-scanner variabilities. Statistical tests - Coefficients of variation and intraclass correlations (ICCs) for the different variabilities and their associated confidence intervals. Results - The MTR measurements for Levels C4-C6 (near the slab center) exhibited a mean value in WC of 34.6 pu and a pooled standard deviation of 0.9 pu. The between-session coefficient of variation was estimated as 2.3% (ICC = 0.63), the between-participant coefficient as 1.6% (ICC = 0.32), and the between-scanner coefficient as 0.7% (ICC = 0.05). The resulting aggregate coefficient of variation was 2.9%, which was sufficiently low to detect an MTR reduction of 1 pu between groups of about 45 participants (Type-I error rate: 0.05; Type-II error rate: 0.10). Data conclusion - The good between-scanner reproducibility and low overall variability in cervical spinal cord MTR measurements in a control population might pave the way for multicenter analyses in various neurological diseases with moderate cohort sizes. Level of evidence - 2 Technical Efficacy: Stage 2 J. Magn. Reson. Imaging 2019;49:1777-1785.
Published: 2019
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32. Arterial spin labelling : quality control and super-resolution

Author: Meurée, Cédric, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Empenn, Université Rennes 1, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Neuroimagerie: méthodes et applications (Empenn), Université de Rennes, and STAR, ABES
Subjects: Quality Control, Magnetic resonance imaging, Super-Resolution, Super-Résolution, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, Imagerie par résonance magnétique, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, Contrôle de la qualité, Artefacts
Abstract: Arterial spin labelling (ASL) is a brain perfusion magnetic resonance imaging technique. The objective of this thesis was first to standardize ASL acquisitions in the context of multicenter neuroimaging studies. A quality control procedure has then been proposed. The capacity of existing algorithms to correct for distortions in ASL images has then been evaluated. Super-resolution methods, developed and adapted to single and multi-TI ASL data in the context of this thesis, are then described, and validated on simulated data, images acquired on healthy subjects, and on patients imaged for brain tumors., L'arterial spin labelling (ASL) est une technique d'imagerie par résonance magnétique de la perfusion cérébrale. Les travaux présentés dans cette thèse ont d'abord consisté à standardiser les acquisitions ASL dans le contexte d'études de neuro-imagerie multicentriques. Un processus de contrôle de la qualité des images a par la suite été proposé. Les travaux se sont ensuite orientés vers le post-traitement de données ASL, en évaluant la capacité d'algorithmes existants à y corriger les distorsions. Des méthodes de super-résolution adaptées aux acquisitions ASL mono et multi-TI ont finalement été proposées et validées sur des données simulées, de sujets sains, ou de patients imagés pour suspicion de tumeurs cérébrales.
Published: 2019

33. Focal and diffuse cervical spinal cord damage in patients with early relapsing–remitting MS: A multicentre magnetisation transfer ratio study

Author: Clarisse Carra Dallière, Anne Kerbrat, Gilles Edan, Virginie Callot, Nicolas Collongues, Jean Pelletier, Jérôme De Seze, Emmanuelle Le Page, Josefina Maranzano, David Brassat, Jean-Christophe Ferré, Pierre Labauge, Benoît Combès, C. Barillot, Adil Maarouf, Nicolas Menjot de Champfleur, Elise Bannier, Xavier Ayrignac, Atef Badji, Françoise Durand-Dubief, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Service de Neurologie [CHU Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Département de Radiologie [CHU de Rennes], Université de Rennes (UR), Centre d'Exploration Métabolique par Résonance Magnétique [Hôpital de la Timone - APHM] (CEMEREM), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Montreal Neurological Institute and Hospital, McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Unité de Neuroimagerie Fonctionnelle [Montréal] (UNF-CRIUGM), Université de Montréal (UdeM)-Centre de Recherche de l'Institut Universitaire de Gériatrie de Montréal (CRIUGM), École Polytechnique de Montréal (EPM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Neurologie, maladies neuro-musculaires [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CIC Strasbourg (Centre d’Investigation Clinique Plurithématique (CIC - P) ), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Université de Toulouse (UT), CIC CHU Lyon (inserm), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), PHRC/12-07, Programme Hospitalier de Recherche Clinique, Edan, Gilles, Centre d'Exploration Métabolique par Résonance Magnétique [Hôpital de la Timone - AP-HM] (CEMEREM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Empenn, Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Institut des Neurosciences de Montpellier - Déficits sensoriels et moteurs (INM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Maison Blanche, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de Neuroimagerie in Vivo (LNV), CHU Strasbourg-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Neurologie vasculaire, pathologie neuro-dégénérative et explorations fonctionnelles du système nerveux [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), and Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Male, MESH: Cervical Cord / diagnostic imaging, MESH: Multiple Sclerosis, Relapsing-Remitting / diagnostic imaging, Neuroimaging, Inversion recovery, quantitative MRI, Lesion, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Multiple Sclerosis, Relapsing-Remitting, medicine, Humans, In patient, 030212 general & internal medicine, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], MESH: Neuroimaging, Spinal cord, MESH: Humans, Magnetisation transfer, business.industry, Multiple sclerosis, magnetisation transfer imaging, MESH: Magnetic Resonance Imaging / methods, Cervical Cord, relapsing–remitting multiple sclerosis, MESH: Adult, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, Sagittal plane, MESH: Male, medicine.anatomical_structure, Neurology, Relapsing remitting, Female, MESH: Cervical Cord / pathology, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Neurology (clinical), medicine.symptom, Nuclear medicine, business, MESH: Female, MESH: Multiple Sclerosis, Relapsing-Remitting / pathology, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Background: Studies including patients with well-established multiple sclerosis (MS) have shown a significant and disability-related reduction in the cervical spinal cord (SC) magnetisation transfer ratio (MTR). Objectives: The objectives are to (1) assess whether MTR reduction is already measurable in the SC of patients with early relapsing–remitting multiple sclerosis (RRMS) and (2) describe its spatial distribution. Methods: We included 60 patients with RRMS Results: Mean whole SC MTR was significantly lower in patients than controls (33.7 vs 34.9 pu, p = 0.00005), even after excluding lesions (33.9 pu, p = 0.0003). We observed a greater mean reduction in MTR for vertebral levels displaying the highest lesion loads (C2–C4). In the axial plane, we observed a greater mean MTR reduction at the SC periphery and barycentre. Conclusion: Cervical SC tissue damage measured using MTR is not restricted to macroscopic lesions in patients with early RRMS and is not homogeneously distributed.
Published: 2019
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34. Virtual Reality Simulation in Nontechnical Skills Training for Healthcare Professionals

Author: Bracq, Marie-Stéphanie, Michinov, Estelle, Jannin, Pierre, Laboratoire de Psychologie : Cognition, Comportement, Communication (LP3C - EA1285), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Brestois des Sciences de l'Homme et de la Société (IBSHS), Université de Brest (UBO), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA_D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Institut Brestois des Sciences de l'Homme et de la Société (IBSHS), Université de Brest (UBO)-Université de Bretagne Sud (UBS), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Institut Brestois des Sciences de l'Homme et de la Société (IBSHS), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Jonchère, Laurent
Subjects: [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SHS.PSY] Humanities and Social Sciences/Psychology, [SCCO.PSYC] Cognitive science/Psychology, [SCCO.PSYC]Cognitive science/Psychology, [SHS.PSY]Humanities and Social Sciences/Psychology, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; This systematic review, conducted in accordance with the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses guidelines, is aimed to review current research in virtual reality (VR) for healthcare training, specifically pertaining to nontechnical skills. PsycInfo and Medline databases were queried for relevant articles published through December 2017. Of the 1377 publications identified, 80 were assessed for eligibility and 26 were finally included in the qualitative synthesis. Overall, the use of virtual training for nontechnical skills is recent in healthcare education and has increased since 2010. Screen-based VR simulators or virtual worlds are the most frequently used systems. The nontechnical skills addressed in VR simulation include mainly teamwork, communication, and situation awareness. Most studies evaluate the usability and acceptability of VR simulation, and few studies have measured the effects of VR simulation on nontechnical skills development.
Published: 2019
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35. Automatic segmentation of the spinal cord and intramedullary multiple sclerosis lesions with convolutional neural networks

Author: Vincent Auclair, Ferran Prados, Jean-Christophe Brisset, Josefina Maranzano, Sridar Narayanan, Kouhei Kamiya, Constantina A. Treaba, Atef Badji, Hugh Kearney, Jean Pelletier, Pierre Labauge, Elise Bannier, Paola Valsasina, Erik Charlson, Daniel S. Reich, Olga Ciccarelli, Dominique Eden, Ren Zhuoquiong, Henitsoa Rasoanandrianina, Virginie Callot, Gilles Edan, Seth A. Smith, Marios C. Yiannakas, Jennifer Lefeuvre, Govind Nair, Allan R. Martin, Julien Cohen-Adad, Timothy M. Shepherd, Jason F. Talbott, Donald G. McLaren, Charley Gros, Masaaki Hori, Shahabeddin Vahdat, Julien Doyon, Yasuhiko Tachibana, Leszek Stawiarz, Shahamat Tauhid, Jan Hillert, Massimo Filippi, Lydia Chougar, Anne Kerbrat, Russell Ouellette, Caterina Mainero, Sara M. Dupont, Tobias Granberg, Bertrand Audoin, Ali Khatibi, Rohit Bakshi, Maria A. Rocca, Michael G. Fehlings, Benjamin De Leener, Yaou Liu, École Polytechnique de Montréal (EPM), Montreal Neurological Institute and Hospital, McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Department of Radiology and Biomedical Imaging [San Francisco], University of California [San Francisco] (UC San Francisco), University of California (UC)-University of California (UC), Xuanwu Hospital of Capital, Deutsche Telekom Group, Department of Computer Science [Liverpool], University of Liverpool, National Institute of Radiological Sciences (NIRS), Juntendo University Hospital [Tokyo], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Karolinska Institutet [Stockholm], CHU Pontchaillou [Rennes], Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de neurologie [Montpellier], Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Gui de Chauliac [CHU Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Exploration Métabolique par Résonance Magnétique [Hôpital de la Timone - AP-HM] (CEMEREM), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire Français de la Sclérose En Plaques [Lyon] (OFSEP), Vita-Salute San Raffaele University and Center for Translational Genomics and Bioinformatics, Brigham and Women's Hospital [Boston], Harvard Medical School [Boston] (HMS), NMR Research Unit [London], Institute of Neurology [London], University College of London [London] (UCL)-University College of London [London] (UCL), University College of London [London] (UCL), Vanderbilt University [Nashville], Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging, Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Massachusetts General Hospital [Boston], National Institutes of Health [Bethesda] (NIH), Biospective [Montréal], University of Toronto, Unité de Neuroimagerie Fonctionnelle [Montréal] (UNF-CRIUGM), Université de Montréal (UdeM)-Centre de Recherche de l'Institut Universitaire de Gériatrie de Montréal (CRIUGM), Stanford University, McConnell Brain Imaging Centre (MNI), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]-McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], New York University Langone Medical Center (NYU Langone Medical Center), NYU System (NYU), CIHR FDN-143263, Canadian Institutes of Health Research, International Society of Regulatory Toxicology and Pharmacology, Svenska Sällskapet för Medicinsk Forskning, IVADO, EDMUS Foundation, TransMedTech, R01 EY023240 (SAS), NIH/NEI, RG-1501-02840 (SAS), National Multiple Sclerosis Society, Intramural Research Program, Hospital Programme of Clinical Research (PHRC), NCT02117375, EMISEP project, Fondation A*midex-Investissements d'Avenir, 435897-2013, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada, Observatoire Français de la Sclérose en plaques (OFSEP), 13034, MOP, Canada Research Chairs, National Institute for Health Research (NIHR) University College London Hospitals (UCLH) Biomedical Research Centre (BRC), 2015-PR-182754, Fonds de Recherche du Québec - Nature et Technologies, W81XWH-13-0073 (SAS), U.S. Department of Defense, ANR-10-COHO-002, Agence Nationale de la Recherche, R21 NS087465-01 (SAS), National Institute of Neurological Disorders and Stroke, Fondation Aix-Marseille Universite, SensoriMotor Rehabilitation Research Team (SMRRT), Wings for Life, 20150166, Stockholms Läns Landsting, Centre National de la Recherche Scientifique, 28826, Fonds de Recherche du Québec - Santé, 32454, Canada Foundation for Innovation, Centre d'Exploration Métabolique par Résonance Magnétique [Hôpital de la Timone - APHM] (CEMEREM), University of California [San Francisco] (UCSF), University of California-University of California, SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Gui de Chauliac [Montpellier]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Massachusetts General Hospital [Boston]-Harvard Medical School [Boston] (HMS), Gros, Charley, De Leener, Benjamin, Badji, Atef, Maranzano, Josefina, Eden, Dominique, Dupont, Sara M., Talbott, Jason, Zhuoquiong, Ren, Liu, Yaou, Granberg, Tobia, Ouellette, Russell, Tachibana, Yasuhiko, Hori, Masaaki, Kamiya, Kouhei, Chougar, Lydia, Stawiarz, Leszek, Hillert, Jan, Bannier, Elise, Kerbrat, Anne, Edan, Gille, Labauge, Pierre, Callot, Virginie, Pelletier, Jean, Audoin, Bertrand, Rasoanandrianina, Henitsoa, Brisset, Jean-Christophe, Valsasina, Paola, Rocca, Maria A., Filippi, Massimo, Bakshi, Rohit, Tauhid, Shahamat, Prados, Ferran, Yiannakas, Mario, Kearney, Hugh, Ciccarelli, Olga, Smith, Seth, Treaba, Constantina Andrada, Mainero, Caterina, Lefeuvre, Jennifer, Reich, Daniel S., Nair, Govind, Auclair, Vincent, Mclaren, Donald G., Martin, Allan R., Fehlings, Michael G., Vahdat, Shahabeddin, Khatibi, Ali, Doyon, Julien, Shepherd, Timothy, Charlson, Erik, Narayanan, Sridar, and Cohen-Adad, Julien
Subjects: FOS: Computer and information sciences, Image Processing, Computer Vision and Pattern Recognition (cs.CV), Computer Science - Computer Vision and Pattern Recognition, Neurodegenerative, computer.software_genre, Convolutional neural network, Medical and Health Sciences, Pattern Recognition, Automated, 0302 clinical medicine, Computer-Assisted, Segmentation, Voxel, Image Processing, Computer-Assisted, Medicine, Spinal Cord Injury, Observer Variation, Spinal cord, medicine.diagnostic_test, 05 social sciences, Magnetic Resonance Imaging, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Neurology, Neurological, Biomedical Imaging, Convolutional neural networks, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Radiology, medicine.symptom, MRI, Automated, medicine.medical_specialty, Cord, Multiple Sclerosis, Physical Injury - Accidents and Adverse Effects, Neural Networks, Cognitive Neuroscience, Bioengineering, Pattern Recognition, Sensitivity and Specificity, Autoimmune Disease, 050105 experimental psychology, Article, Lesion, Multiple sclerosis, 03 medical and health sciences, Computer, Humans, 0501 psychology and cognitive sciences, Multiple sclerosi, Traumatic Head and Spine Injury, Neurology & Neurosurgery, business.industry, Psychology and Cognitive Sciences, Neurosciences, Reproducibility of Results, Magnetic resonance imaging, medicine.disease, Brain Disorders, Neural Networks, Computer, business, computer, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: The spinal cord is frequently affected by atrophy and/or lesions in multiple sclerosis (MS) patients. Segmentation of the spinal cord and lesions from MRI data provides measures of damage, which are key criteria for the diagnosis, prognosis, and longitudinal monitoring in MS. Automating this operation eliminates inter-rater variability and increases the efficiency of large-throughput analysis pipelines. Robust and reliable segmentation across multi-site spinal cord data is challenging because of the large variability related to acquisition parameters and image artifacts. The goal of this study was to develop a fully-automatic framework, robust to variability in both image parameters and clinical condition, for segmentation of the spinal cord and intramedullary MS lesions from conventional MRI data. Scans of 1,042 subjects (459 healthy controls, 471 MS patients, and 112 with other spinal pathologies) were included in this multi-site study (n=30). Data spanned three contrasts (T1-, T2-, and T2*-weighted) for a total of 1,943 volumes. The proposed cord and lesion automatic segmentation approach is based on a sequence of two Convolutional Neural Networks (CNNs). To deal with the very small proportion of spinal cord and/or lesion voxels compared to the rest of the volume, a first CNN with 2D dilated convolutions detects the spinal cord centerline, followed by a second CNN with 3D convolutions that segments the spinal cord and/or lesions. When compared against manual segmentation, our CNN-based approach showed a median Dice of 95% vs. 88% for PropSeg, a state-of-the-art spinal cord segmentation method. Regarding lesion segmentation on MS data, our framework provided a Dice of 60%, a relative volume difference of -15%, and a lesion-wise detection sensitivity and precision of 83% and 77%, respectively. The proposed framework is open-source and readily available in the Spinal Cord Toolbox., Comment: 38 pages, 7 figures, 2 tables
Published: 2019
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36. Automated Electrodes Detection During Simultaneous EEG/fMRI

Author: Pierre Maurel, Christian Barillot, Marsel Mano, Mathis Fleury, Elise Bannier, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), CHU Pontchaillou [Rennes], 3D interaction with virtual environments using body and mind (Hybrid), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-MEDIA ET INTERACTIONS (IRISA-D6), SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
Subjects: Computer Networks and Communications, Brain activity and meditation, Computer science, 0206 medical engineering, 02 engineering and technology, Electroencephalography, EEG-fMRI, lcsh:QA75.5-76.95, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Artificial Intelligence, Position (vector), [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, medicine, Position error, Computer vision, electrode localization, EEG, medicine.diagnostic_test, business.industry, fMRI, [INFO.INFO-CV]Computer Science [cs]/Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV], 020601 biomedical engineering, Hardware and Architecture, Electrode, UTE, Artificial intelligence, lcsh:Electronic computers. Computer science, business, Software, 030217 neurology & neurosurgery, Information Systems, simultaneous EEG/fMRI
Abstract: 1AbstractThe coupling of Electroencephalography (EEG) and functional magnetic resonance imaging (fMRI) enables the measure of brain activity at high spatial and temporal resolution. The localisation of EEG sources depends on several parameters including the knowledge of the position of the electrodes on the scalp. An accurate knowledge about this information is important for source reconstruction. Currently, when acquiring EEG and fMRI together, the position of the electrodes is generally estimated according to fiducial points by using a template. In the context of simultaneous EEG/fMRI acquisition, a natural idea is to use magnetic resonance (MR) images to localise EEG electrodes. However, most MR compatible electrodes are built to be almost invisible on MR Images. Taking advantage of a recently proposed Ultra short Echo Time (UTE) sequence, we introduce a fully automatic method to detect and label those electrodes in MR images. Our method was tested on 8 subjects wearing a 64-channel EEG cap. This automated method showed an average detection accuracy of 94% and the average position error was 3.1 mm. These results suggest that the proposed method has potential for determining the position of the electrodes during simultaneous EEG/fMRI acquisition with a very light cost procedure.
Published: 2019
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37. Exploring the Impact of Analysis Software on Task fMRI Results

Author: Camille Maumet, Alexander Bowring, Thomas E. Nichols, Nuffield Department of Population Health [Oxford], University of Oxford [Oxford], Empenn, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Department of Statistics [Coventry], University of Warwick [Coventry], Nuffield Department of Clinical Neurosciences [Oxford], This work was supported by the Wellcome Trust, grant 100309/Z/12/Z., University of Oxford, Neuroimagerie: méthodes et applications (Empenn), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Vision, Action et Gestion d'informations en Sant?? ( VisAGeS ), Institut National de la Sant?? et de la Recherche M??dicale ( INSERM ) -Inria Rennes ??? Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUM??RIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Syst??mes Al??atoires ( IRISA ), Universit?? de Rennes 1 ( UR1 ), Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliqu??es - Rennes ( INSA Rennes ) -Universit?? de Bretagne Sud ( UBS ) -??cole normale sup??rieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSup??lec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Universit?? de Rennes 1 ( UR1 ), Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliqu??es - Rennes ( INSA Rennes ) -Universit?? de Bretagne Sud ( UBS ) -??cole normale sup??rieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSup??lec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Syst??mes Al??atoires ( IRISA ), Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliqu??es - Rennes ( INSA Rennes ) -Universit?? de Bretagne Sud ( UBS ) -??cole normale sup??rieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSup??lec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), and Maumet, Camille
Subjects: SPM, Computer science, Process (engineering), MESH: AFNI, analytic flexibility, analytic variability, fMRI, FSL, reproducibility, software comparison, SPM, task-fMRI, task-fMRI, 050105 experimental psychology, Field (computer science), Task (project management), 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Software, FSL, software comparison, Similarity (psychology), 0501 psychology and cognitive sciences, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, AFNI, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], analytic flexibility, Implementation, reproducibility, Research Articles, Reproducibility, Radiological and Ultrasound Technology, business.industry, Scale (chemistry), 05 social sciences, fMRI, task‐fMRI, Data science, Data sharing, analytic variability, Neurology, [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Neurology (clinical), Anatomy, business, 030217 neurology & neurosurgery, Software versioning, Research Article
Abstract: This project links resources associated with paper of the same title: Bowring, A., Maumet, C., & Nichols, T. E. (2019). Exploring the impact of analysis software on task fMRI results. Human Brain Mapping, (April), hbm.24603. https://doi.org/10.1002/hbm.24603 Abstract: A wealth of analysis tools are available to fMRI researchers in order to extract patterns of task variation and, ultimately, understand cognitive function. However, this "methodological plurality" comes with a drawback. While conceptually similar, two different analysis pipelines applied on the same dataset may not produce the same scientific results. Differences in methods, implementations across software packages, and even operating systems or software versions all contribute to this variability. Consequently, attention in the field has recently been directed to reproducibility and data sharing. Neuroimaging is currently experiencing a surge in initiatives to improve research practices and ensure that all conclusions inferred from an fMRI study are replicable. In this work, our goal is to understand how choice of software package impacts on analysis results. We use publicly shared data from three published task fMRI neuroimaging studies, reanalyzing each study using the three main neuroimaging software packages, AFNI, FSL and SPM, using parametric and nonparametric inference. We obtain all information on how to process, analyze, and model each dataset from the publications. We make quantitative and qualitative comparisons between our replications to gauge the scale of variability in our results and assess the fundamental differences between each software package. While qualitatively we find broad similarities between packages, we also discover marked differences, such as Dice similarity coefficients ranging from 0.000 - 0.743 in comparisons of thresholded statistic maps between software. We discuss the challenges involved in trying to reanalyse the published studies, and highlight our own efforts to make this research reproducible.
Published: 2019
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38. Moments-Based Ultrasound Visual Servoing: From a Mono- to Multiplane Approach

Author: Alexandre Krupa, Christian Barillot, Jan Petr, Caroline Nadeau, Visual servoing in robotics, computer vision, and augmented reality (Lagadic), SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), and Marchand, Eric
Subjects: 0209 industrial biotechnology, Engineering, ComputingMethodologies_IMAGEPROCESSINGANDCOMPUTERVISION, 02 engineering and technology, Visual servoing, Imaging phantom, Image (mathematics), 020901 industrial engineering & automation, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, [INFO.INFO-RB]Computer Science [cs]/Robotics [cs.RO], moment features, Segmentation, Computer vision, ultrasound images, Electrical and Electronic Engineering, business.industry, [INFO.INFO-RB] Computer Science [cs]/Robotics [cs.RO], Ultrasound, Image plane, Object (computer science), Computer Science Applications, graph cut segmentation, Control and Systems Engineering, graph cut segmen- tation, 020201 artificial intelligence & image processing, Artificial intelligence, business, Servo
Abstract: International audience; This paper presents a new image-based visual servoing approach to control a robotic system equipped with an ultrasound imaging device. The presented method allows an automatic positioning of the probe with respect to an object of interest. Moments-based image features are computed from three orthogonal ultrasound images to servo in-plane and out-of-plane motions of the system. An efficient segmentation method, based on graph cut strategy, is proposed to extract the object contour in each image plane. Simulation results demonstrate that this approach improves upon techniques based on a single 2D US image in terms of probe positioning. Our method was also validated from robotic experiments performed on an ultrasound phantom with the use of a motorized 3D probe that provides the three US images.
Published: 2016
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39. Brain Training with Neurofeedback

Author: Lorraine Perronnet, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Anatole Lécuyer, Christian Barillot, 3D interaction with virtual environments using body and mind (Hybrid), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-MEDIA ET INTERACTIONS (IRISA-D6), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Popular interaction with 3d content (Potioc), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Inria Bordeaux - Sud-Ouest, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Computational Imaging of the Central Nervous System (ATHENA), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), IPL BCI-LIFT, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Bordeaux - Sud-Ouest, and Clerc, Maureen
Subjects: medicine.diagnostic_test, Hemoencephalography, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, 05 social sciences, Central nervous system, Magnetoencephalography, Electroencephalography, medicine.disease, 050105 experimental psychology, 03 medical and health sciences, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, 0302 clinical medicine, medicine.anatomical_structure, Cerebral activity, medicine, Attention deficit hyperactivity disorder, 0501 psychology and cognitive sciences, Neurofeedback, Functional magnetic resonance imaging, Psychology, Neuroscience, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience
Published: 2016
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40. A 10-year follow-up of the European multicenter trial of interferon beta-1b in secondary-progressive multiple sclerosis

Author: Antonios Bayas, Kp Wandinger, Sten Fredrikson, Cyrille B. Confavreux, B. C. Kieseier, Ludwig Kappos, Mathias Buttmann, Jordi Río, J. De Keyser, David Brassat, Jens Kuhle, Giulio Disanto, Chris H. Polman, M Ecsedi, M. Frontoni, M Hardmeier, Michael Hutchinson, Markus Färkkilä, M. P. Amato, K Baum, T. Kümpfel, Claude Stolz, K Gugleta, M D’hooghe, E Roullet, Bruno Brochet, Karl Vass, Carmen Lienert, Gilles Edan, University Hospital Basel [Basel], Queen Mary University of London (QMUL), Neurocenter of Southern Switzerland, Ospedale Regionale di Lugano, Kantonsspital Baselland [Bruderholz] (KSBL), NASA Goddard Space Flight Center (GSFC), Klinik Hennigsdorf, Julius-Maximilians-Universität Würzburg (JMU), Klinikum Augsburg, Service de neurologie [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Université de Bordeaux (UB), Service de Neurologie [Hospices civils de Lyon - Hôpital Pierre Wertheimer], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Neurologie [Rennes] = Neurology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki, Department of Clinical Neurosciences, Neurology Division, Karolinska Institutet, Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA), Vrije Universiteit Brussel (VUB), Department of Microbiology and Immunology, Drexel University College of Medicine, University Medical Center Groningen [Groningen] (UMCG), Heinrich Heine Universität Düsseldorf = Heinrich Heine University [Düsseldorf], Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU), Institut du Fer à Moulin, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Vrije Universiteit Amsterdam [Amsterdam] (VU), CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), PAREXEL International [Berlin], Medizinische Universität Wien = Medical University of Vienna, University Hospital of Schleswig-Holstein, Department of Neurology [Suisse], Julius-Maximilians-Universität Würzburg [Wurtzbourg, Allemagne] (JMU), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), University of Helsinki, Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Neurology, Amsterdam Neuroscience - Neuroinfection & -inflammation, Neuroprotection & Neuromodulation, Clinical sciences, Neurologian yksikkö, Department of Neurosciences, and Clinicum
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Time Factors, Multivariate analysis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Disability, interferon beta, long-term outcome, magnetic resonance imaging, multiple sclerosis, neutralizing antibodies, prognosis, randomized controlled trial, secondary progressive multiple sclerosis, THERAPY, 3124 Neurology and psychiatry, MESH: Magnetic Resonance Imaging, MESH: Linear Models, law.invention, Disability Evaluation, 0302 clinical medicine, Randomized controlled trial, law, MESH: Double-Blind Method, 10. No inequality, PREDICTORS, MESH: Treatment Outcome, MESH: Immunologic Factors, MESH: Disability Evaluation, MESH: Follow-Up Studies, Multiple Sclerosis, Chronic Progressive, 3. Good health, Europe, Treatment Outcome, Neurology, Cohort, Disease Progression, SURVIVAL, Female, MESH: Disease Progression, Interferon beta-1b, Adult, medicine.medical_specialty, PHASE, MESH: Interferon beta-1b, Placebo, MESH: Multivariate Analysis, 03 medical and health sciences, Double-Blind Method, Multicenter trial, Internal medicine, medicine, Humans, Immunologic Factors, COHORT, MESH: Multiple Sclerosis, Chronic Progressive, MESH: Humans, Expanded Disability Status Scale, business.industry, Multiple sclerosis, MESH: Time Factors, MESH: Adult, NATURAL-HISTORY, MS, medicine.disease, MESH: Male, 030104 developmental biology, MOTOR EVOKED-POTENTIALS, Multivariate Analysis, Linear Models, Physical therapy, MESH: Europe, Neurology (clinical), business, MESH: Female, 030217 neurology & neurosurgery, Follow-Up Studies, LONG-TERM DISABILITY
Abstract: Objectives: To explore long-term effects of treatment and prognostic relevance of variables assessed at baseline and during the European secondary progressive multiple sclerosis (SPMS) trial of interferon beta 1b (IFNB-1b). Methods: We assessed 362 patients (60% female; median age 41 years; Expanded Disability Status Scale (EDSS): 5.5; 51% randomized to IFNB-1b) for their EDSS and treatment history after 10 years. Non-parametric analysis of covariance (ANCOVA) and multivariate linear regression models were applied. Results: Median EDSS was 6.0 at the end of the randomized controlled trial (RCT), in the IFNB-1b and placebo groups, and 7.0 in long-term follow-up patients (those receiving IFNB-1b in the RCT were 6.5 and those receiving placebo in the RCT were 7.0; p = 0.086). 24 patients (6.6%) were deceased. The EDSS at baseline and the EDSS change during the RCT were the most important predictors of the EDSS 10 years later (partial R2: 0.47). The ability to predict changes in EDSS 10 years after the RCT was limited ( R2: 0.12). Magnetic resonance imaging (MRI) measures remained in the predictive models, but explained < 5% of the variability. Conclusions: The results from this analysis did not provide convincing evidence to support a favorable long-term outcome in those patients allocated IFNB-1b during the RCT, in our SPMS cohort. The progressive stage of the disease remains largely unpredictable by clinical and conventional MRI measures, so better prognostic markers are needed.
Published: 2016
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41. Arterial spin labeling in clinical pediatric imaging

Author: K. Chouklati, Laurent Riffaud, Jean-Christophe Ferré, Bertrand Bruneau, Catherine Tréguier, P. Darnault, Céline Rozel, Maïa Proisy, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes] = Radiology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Service de neurochirurgie [Rennes] = Neurosurgery [Rennes], Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Societe francaise de radiologie (Research Grant), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: sickle-cell-disease, Pathology, medicine.medical_specialty, Arterial spin labeling, cerebral-blood-flow, Perfusion scanning, Magnetic resonance angiography, 030218 nuclear medicine & medical imaging, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Brain perfusion, children, medicine, otorhinolaryngologic diseases, Humans, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, angiography, Moyamoya disease, perfusion mri, Cerebral perfusion pressure, brain arteriovenous-malformations, Child, childhood, Radiological and Ultrasound Technology, medicine.diagnostic_test, business.industry, Functional Neuroimaging, Magnetic resonance imaging, General Medicine, medicine.disease, Cerebral Angiography, 3. Good health, Cerebral blood flow, age, Cerebrovascular Circulation, Angiography, moyamoya-disease, Spin Labels, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Nuclear medicine, business, hydrocephalus, Magnetic Resonance Angiography, 030217 neurology & neurosurgery, Cerebral angiography, MRI
Abstract: International audience; Arterial spin labeling (ASL) perfusion- weighted magnetic resonance imaging is the only approach that enables direct and non-invasive quantitative measurement of cerebral blood flow in the brain regions without administration of contrast material and without radiation. ASL is thus a promising perfusion imaging method for assessing cerebral blood flow in the pediatric population. Concerning newborns, there are current limitations because of their smaller brain size and lower brain perfusion. This article reviews and illustrates the use of ASL in pediatric clinical practice and discusses emerging cerebral perfusion imaging applications for children due to the highly convenient implementation of the ASL sequence. (C) 2015 Editions francaises de radiologie. Published by Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
Published: 2016
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42. The effect of optokinetic and galvanic vestibular stimulations in reducing post-stroke postural asymmetry

Author: B. Laviolle, Stéphanie Leplaideur, S. Tassel Ponche, Isabelle Bonan, E. Leblong, Alain Yelnik, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Mouvement Sport Santé (M2S), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes (UR)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Médecine physique et de réadaptation [Rennes] (MPR), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Amiens-Picardie, Département de Médecine physique et de Réadaptation, Hôpitaux Universitaire Saint-Louis, Lariboisière, Fernand-Widal, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Brest (UBO)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Jonchère, Laurent
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], Stimulation, Audiology, 050105 experimental psychology, Lesion, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Physiology (medical), medicine, Humans, 0501 psychology and cognitive sciences, Force platform, Nystagmus, Optokinetic, Postural Balance, Aged, Vestibular system, Sensory stimulation therapy, Rehabilitation, 05 social sciences, Postural control, Postural asymmetry, Galvanic Skin Response, Optokinetic reflex, Middle Aged, Sensory Systems, Sensory stimulation, Surgery, [SDV] Life Sciences [q-bio], Paresis, Stroke, Treatment Outcome, Neurology, Post stroke, Female, Vestibule, Labyrinth, Neurology (clinical), medicine.symptom, Psychology, Photic Stimulation, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; Objective: To investigate the postural effect of 2 types of sensory stimulation in patients with a left hemispheric lesion (LHL) or right hemispheric lesion (RHL) compared with controls. Methods: 35 patients (18 LHL, 17 RHL) and 27 controls (Mean age 54.1 years), with a mean delay post-stroke of 3.0 months were enrolled. Subjects stood on a force platform and were stimulated on the left and right side by optokinetic (Okn) and galvanic vestibular (Gv) stimulation. Lateral displacement following stimulation towards the right and left directions was calculated as the mean position of the centre of pressure (CP) during the stimulation period minus the mean position at rest. Results Postural asymmetry was reduced in LHL and RHL patients. CP displacement was higher in cases of left-sided stimulation in the RHL group compared with control subjects and LHL patients (respectively 2.8 and 2.4 times higher, group effect, p
Published: 2016
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43. Rapport de Prospective du Conseil Scientifique de l’Institut des Sciences de l’Information et leurs Interactions (INS2I)

Author: Christian Barillot, Inbar Fijalkow, Isabelle Queinnec, Fabrice Theoleyre, Hélène Touzet, Michel Beaudouin-Lafon, Marie-Paule Cani, François Chaumette, Gérald Conreur, Véronique Cortier, Cyril Gavoille, Guy Gogniat, Julien Gossa, Andreas Herzig, Jean Krivine, Philippe Lamarre, Françoise Lamnabhi-Lagarrigue, Anne-Catherine Letournel, Lionel Seinturier, Isabelle Tellier, Serge Torres, Charlotte Truchet, Alexandros Tsoukias, Michel Verleysen, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Equipes Traitement de l'Information et Systèmes (ETIS - UMR 8051), Ecole Nationale Supérieure de l'Electronique et de ses Applications (ENSEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY), Équipe Méthodes et Algorithmes en Commande (LAAS-MAC), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - 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Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Harvard Medical School [Boston] (HMS), Base de Données (BD), Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information (LIRIS), Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des signaux et systèmes (L2S), Université Paris-Sud - 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Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (LORIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bretagne Loire (UBL)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bretagne Loire (UBL), Université de Lille-Centrale Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille-Centrale Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lille-Centrale Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Littératures et langage - ENS Paris (LILA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
Subjects: [INFO.INFO-AI] Computer Science [cs]/Artificial Intelligence [cs.AI], [INFO.INFO-CC]Computer Science [cs]/Computational Complexity [cs.CC], [INFO.INFO-AR]Computer Science [cs]/Hardware Architecture [cs.AR], [INFO.INFO-AR] Computer Science [cs]/Hardware Architecture [cs.AR], [INFO] Computer Science [cs], [INFO.INFO-CL]Computer Science [cs]/Computation and Language [cs.CL], [INFO.INFO-AI]Computer Science [cs]/Artificial Intelligence [cs.AI], [INFO.INFO-CR]Computer Science [cs]/Cryptography and Security [cs.CR], [INFO.INFO-CV] Computer Science [cs]/Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV], [STAT.ML]Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML], [INFO.INFO-AU]Computer Science [cs]/Automatic Control Engineering, [INFO.INFO-DB] Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], [INFO.INFO-RB]Computer Science [cs]/Robotics [cs.RO], [INFO]Computer Science [cs], [INFO.INFO-HC]Computer Science [cs]/Human-Computer Interaction [cs.HC], [INFO.INFO-CR] Computer Science [cs]/Cryptography and Security [cs.CR], [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SPI.SIGNAL] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [INFO.INFO-DB]Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], [INFO.INFO-AO]Computer Science [cs]/Computer Arithmetic, [INFO.INFO-RB] Computer Science [cs]/Robotics [cs.RO], [INFO.INFO-CE]Computer Science [cs]/Computational Engineering, Finance, and Science [cs.CE], [INFO.INFO-CE] Computer Science [cs]/Computational Engineering, Finance, and Science [cs.CE], [INFO.INFO-CV]Computer Science [cs]/Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV], [STAT.ML] Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML], [STAT] Statistics [stat], [STAT]Statistics [stat], [INFO.INFO-CL] Computer Science [cs]/Computation and Language [cs.CL], [INFO.INFO-CC] Computer Science [cs]/Computational Complexity [cs.CC], [INFO.INFO-AO] Computer Science [cs]/Computer Arithmetic, [INFO.INFO-HC] Computer Science [cs]/Human-Computer Interaction [cs.HC], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [INFO.INFO-AU] Computer Science [cs]/Automatic Control Engineering, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing
Abstract: The production of a scientific prospective report corresponds to one of the missions of the Institutes Scientific Councils (CSI) of CNRS. Such a report is both for internal use by the CNRS (the head of the institution, institutes, national review committees) and for the scientific community at large. In this context the Scientific Council of the INS2I Institute of CNRS has decided to direct this prospective report around the positioning of information sciences and their interactions in the global scientific landscape. In this way, we wish to highlight the importance and role of our discipline in a period when our field is undergoing deep technological, societal and scientific evolutions.To bring this reflection to life, we have chosen to rely, among other things, on hearings of leading personalities from our domains. These hearings, conducted in small group sessions, gave rise to extremely rich discussions that fed the Board's thinking in preparing this report. They were conducted on the basis of a common framework structured around five themes:1.How to define our discipline? What are the major achievements?2.What are the possible evolutions in the next 10 to 20 years?3.What are the biggest challenges and risks?4.How will our discipline impact on other sciences? How to manage thematic mobility in research at the interfaces with other disciplines?5.How will our discipline impact society at large, particularly in terms of education and popular instruction?Finally, the forward-thinking carried out in this work is also informed by the work of the Board over the past four years, in particular with regard to the organization of thematic seminars. These seminars allowed us to reflect more specifically on about ten transversal or disciplinary themes. Many of the issues discussed during these seminars were also discussed through the preparatory stages for the preparation of this report, in particular around the place of women in our disciplines or even around ethical issues. The summaries of these seminars are given in the appendix to this document and the working documents are available for free access on the Council's website (https://csins2i.irisa.fr/)., La rédaction d’un rapport de prospective scientifique correspond à une des missions des conseils scientifiques d’instituts (CSI) au CNRS. Un tel rapport est à la fois à usage interne au CNRS (directions d'établissement, d’instituts, comité national), et à destination de la communauté scientifique. Dans ce cadre et en concertation avec la direction de l’institut, le conseil scientifique de l’institut INS2I du CNRS a souhaité orienter ce rapport de prospective autour du positionnement des sciences de l’information et leurs interactions dans le paysage scientifique global. Nous souhaitons ainsi pointer l’importance et le rôle de notre discipline dans une période où notre domaine est traversé par de profondes évolutions technologiques, sociétales et scientifiques.Pour porter cette réflexion, nous avons fait le choix de nous appuyer, entre autres, sur des auditions de personnalités de nos domaines. Ces auditions, menées en petits groupes de discussion, ont donné lieu à des échanges extrêmement riches qui ont nourri la réflexion du conseil dans l'élaboration de ce rapport. Elles ont été conduites sur la base d’une trame commune articulée autour de cinq thèmes :1.Comment définir notre discipline ? Quelles en sont les grandes réalisations ?2.Quelles sont les évolutions envisageables dans les 10 à 20 prochaines années ?3.Quels sont les plus grands enjeux et risques ?4.Comment notre discipline va-t-elle impacter les autres sciences ? Comment gérer la mobilité thématique dans la recherche aux interfaces avec les autres disciplines ?5.Comment notre discipline va-t-elle impacter la société au sens large, concernant notamment l'enseignement et l'éducation populaire ?.Enfin, la prospective réalisée dans ce document se nourrit également du travail du conseil lors de ces quatre dernières années, en particulier autour de l’organisation de séminaires thématiques. Ces séminaires nous ont permis de porter une réflexion plus spécifique sur une dizaine de thèmes transversaux ou disciplinaires. Beaucoup des enjeux abordés lors de ces séminaires ont également été discutés à travers les ateliers préparatoires à l'élaboration de ce rapport, notamment autour de la place des femmes dans nos disciplines ou bien encore autour des enjeux d’éthique. Les synthèses de ces séminaires sont données en annexe de ce document et les documents de travail sont disponibles en accès libre sur le site internet du conseil (https://csins2i.irisa.fr/).
Published: 2018

44. Étude de la perfusion cérébrale par Arterial Spin Labeling en IRM à 1.5T chez le nouveau-né et l’enfant

Author: Proisy, Maïa, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Université Rennes 1, Jean-Christophe Ferré, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), and Université de Rennes
Subjects: Pediatric, Magnetic resonance imaging, Brain perfusion, Pédiatrie, Neonatal asphyxia, Imagerie par résonance magnétique, Circulation cérébrale, Asphyxie périnatale, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Physiological changes in overall and regional cerebral perfusion are related to age and neurocognitive development. Brain perfusion in the pediatric population can be assessed using a number of imaging techniques. Two literature reviews were undertaken and published on this topic: one based on brain perfusion imaging techniques in neonates, and the other based on the ASL technique in the pediatric population and its clinical applications. The Arterial Spin Labeling (ASL) MRI perfusion sequence is one of the most suitable imaging techniques for children given that the procedure is non-irradiating and non-invasive (without exogenous contrast agent injection). There are many emerging cerebral perfusion imaging applications for children due to the highly convenient implementation of the ASL sequence, which can be easily incorporated into standard brain MRI protocols following acquisition of morphological images. Certain technical adjustments to the imaging parameters are required to account for the fundamental differences between the pediatric and adult populations. Measuring cerebral blood flow (CBF) in neonates and children using ASL therefore requires a number of adaptations to acquisition and related parameters.The processing of ASL data also requires specific adaptations, in particular regarding the automated segmentation of brain tissues, and the parameters used for CBF quantification models. The processing pipeline for both anatomical and perfusion images that had been previously developed by our team for adult data was adapted firstly for children and secondly for neonates. These two populations notably have specific age-related concerns; in particular the signal-to-noise ratio of ASL is very good in children, but much less so in neonates, and the morphological images have inverted contrast due to incomplete myelination at birth. Following adaptation of the processing pipeline, several studies were completed (2 original articles published and 1 under review), showing the clinical benefits of studying cerebral perfusion in three situations: first physiological changes in cerebral perfusion in children between 6 months and 15 years; secondly changes in cerebral perfusion in children with a first attack of migraine with aura; and lastly changes in brain perfusion between day of life 3 and day of life 10 in asphyxiated neonates. Following adaptation of the processing pipeline, several studies were completed (2 original articles published and 1 under review), showing the clinical benefits of studying cerebral perfusion in three situations: first physiological changes in cerebral perfusion in children between 6 months and 15 years; secondly changes in cerebral perfusion in children with a first attack of migraine with aura; and lastly changes in brain perfusion between day of life 3 and day of life 10 in asphyxiated neonates. Several studies are still in progress, and these present new image processing challenges, involving, for example, children with neurosurgical conditions and morphological changes in the brain, or premature babies, in line with the work undertaken for this thesis.; L’imagerie IRM de perfusion par Arterial Spin Labeling (ASL) ou marquage des spin artériels a pour principal avantage d’être une méthode d’imagerie non invasive (non irradiante et sans injection de produit de contraste exogène), particulièrement adaptée à l'imagerie cérébrale pédiatrique. Sa facilité de mise en œuvre explique l’engouement pour cette séquence et de nombreuses applications cliniques émergentes. Cette technique initialement développée chez l’adulte nécessite une adaptation à la population pédiatrique, aussi bien des paramètres d’acquisition et de quantification que des algorithmes de traitement d’images. La perfusion cérébrale globale et régionale évolue physiologiquement, parallèlement à l’âge et au développement neurocognitif. Il existe plusieurs méthodes d’étude de la perfusion cérébrale pédiatrique. Dans ce contexte, deux revues de littérature ont été réalisées et publiées : l’une portant sur les différentes techniques d’imagerie de la perfusion cérébrale chez les nouveau-nés, l’autre se focalisant sur la technique d’ASL en pédiatrie et ses applications cliniques. Puis la chaîne de traitement des images morphologiques et de perfusion ASL, développée chez l’adulte au sein de notre unité, a été adaptée aux enfants puis aux nouveau-nés. Ces deux populations ont effectivement des problématiques différentes, en particulier le rapport signal sur bruit de l’ASL est très bon chez les enfants, mais nettement moins bon chez les nouveau-nés, et les images morphologiques ont un contraste différent en raison d’une myélinisation incomplète à la naissance. Grace à l’adaptation de la chaîne de traitement, des travaux de recherche clinique ont pu être finalisés (2 publiés, 1 soumis) illustrant l’intérêt de l’étude de la perfusion cérébrale dans 3 situations : l’étude de l’évolution de la perfusion cérébrale normale chez l’enfant entre 6 mois et 15 ans ; l’étude de la perfusion cérébrale chez les enfants souffrant d’une première crise de migraine avec aura ; et enfin l’étude de l’évolution de la perfusion cérébrale entre le 3ieme et le 10ieme jour de vie chez les enfants souffrant d’asphyxie périnatale et traités par hypothermie. Plusieurs projets restent en cours sur le sujet, avec d’autres challenges de traitement et d’analyse d’image (enfants de neurochirurgie avec modifications morphologiques du cerveau, ou enfants prématurés par exemple), dans la continuité ce qui a été fait au cours de cette thèse.
Published: 2018

45. Analyse quantitative des tissus cérébraux à l'aide de modèles multi-compartiments en IRM de relaxométrie T2

Author: Chatterjee, Sudhanya, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Universite Rennes 1, Christian Barillot, Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), and Chatterjee, Sudhanya
Subjects: T2 relaxometry, microstructure, microstructures, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, sclérose en plaques, multiple sclerosis, relaxométrie T2, MRI, IRM
Abstract: Magnetic resonance imaging (MRI) is one of the most widely used in-vivo imaging method for obtaining information on brain health. However, MRI voxels have limited resolution due to physical constraints. The objective of this thesis is to obtain quantitative estimates of brain tissue microstructures (such as myelin, intra/extracellular matters and free water) from T2 relaxometry MRI data. Two parametric multi-compartment T2 relaxometry (MCT2) models are proposed in this thesis. The approach and estimation framework for both models were justified using cost function simulation studies. A range of simulation and in-vivo MRI data experiments were performed to evaluate the accuracy and robustness of these models. The model found to be more robust of the two was then used for two studies on multiple sclerosis (MS) lesions. In the first study the evolution of the MCT2 biomarkers was studied in gadolinium (Gd) enhancing and non-enhancing regions of MS lesions in 10 patients with clinically isolated syndrome over a period of three years. In the second study we demonstrated the potential of combined use of the proposed MCT2 biomarkers with those obtained from existing multi-compartment diffusion MRI models to address a clinically relevant and challenging task of identifying regions of MS lesions undergoing active blood brain barrier breakdown without use of Gd injection., L'imagerie par résonance magnétique (IRM) est l'une des méthodes d'imagerie in-vivo les plus utilisées pour obtenir de l'information sur la santé du cerveau. Cependant, les voxels d'IRM ont une résolution limitée en raison de contraintes physiques. L'objectif de cette thèse est d'obtenir des estimations quantitatives des microstructures tissulaires cérébrales (comme la myéline, les matières intra/extra-cellulaires et l'eau libre) à partir des données d'IRM T2 relaxométrie. Deux modèles paramétriques multi-compartiments (MCT2) sont proposés dans cette thèse. L'approche et le cadre d'estimation pour les deux modèles sont justifiés en utilisant des études de simulation. Une série de simulations et d'expériences sur des données IRM in vivo ont été réalisées pour évaluer l'exactitude et la robustesse de ces modèles. Le modèle jugé plus robuste a ensuite été utilisé pour deux études sur de patients atteints de sclérose en plaques (SEP). Dans la première étude, l’évolution des biomarqueurs de MCT2 a été étudiée dans les lésions de SEP présentant une prise de contraste gadolinium (Gd) ou non chez 10 patients sur une période de trois ans. Dans la deuxième étude, nous avons démontré le potentiel de l'utilisation combinée des biomarqueurs MCT2 proposés avec ceux obtenus à partir de modèles existants de diffusion multi-compartiment IRM pour répondre à une tâche cliniquement pertinente et difficile : identifier les régions de lésions SEP en cours de dégradation de la barrière hémato-encéphalique sans utilisation de produit de contraste.
Published: 2018

46. Statistical Shape Analysis of Large Datasets Based on Diffeomorphic Iterative Centroids

Author: Joan Alexis Glaunès, Vincent Frouin, Roberto Toro, Gunter Shumann, Marie Chupin, Jean-Baptiste Poline, Claire Cury, Olivier Colliot, Algorithms, models and methods for images and signals of the human brain (ARAMIS), Sorbonne Université (SU)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Mathématiques Appliquées Paris 5 (MAP5 - UMR 8145), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions (INSMI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Génétique humaine et fonctions cognitives - Human Genetics and Cognitive Functions (GHFC (UMR_3571 / U-Pasteur_1)), Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Psychiatry, Psychology & Neuroscience, King's College London, King‘s College London, Service NEUROSPIN (NEUROSPIN), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Lawrence Berkeley National Laboratory [Berkeley] (LBNL), The research leading to these results has received funding from ANR (project HM-TC, grant number ANR-09-EMER-006, and project KaraMetria, grant number ANR-09-BLAN-0332), from the CATI Project (Fondation Plan Alzheimer) and from the program Investissements d'avenir ANR-10-IAIHU-06.IMAGEN was supported by the European Union-funded FP6 (LSHM-CT-2007-037286), the FP7 projects IMAGEMEND (602450) and MATRICS (603016), and the Innovative Medicine Initiative Project EU-AIMS (115300-2), Medical Research Council Programme Grant Developmental pathways into adolescent substance abuse (93558), the NIHR Biomedical Research Centre Mental Health as well as the Swedish funding agency FORMAS. Further support was provided by the Bundesministerium für Bildung und Forschung (eMED SysAlc, AERIAL, 1EV0711)., ANR-09-EMER-0006,HM-TC,Modélisation des interactions entre l'hippocampe et le cortex dans ' la conscience temporelle', établie à partir de l'imagerie cérébrale multimodale anatomique et fonctionnelle(2009), ANR-09-BLAN-0332,KaraMetria,Karametria (Analyse statistique des structures cérébrales)(2009), ANR-10-IAHU-0006,IHU-A-ICM,Institut de Neurosciences Translationnelles de Paris(2010), European Project: 602450,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2013-INNOVATION-1,IMAGEMEND(2013), European Project: 603016,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2013-INNOVATION-1,MATRICS(2014), European Project: 115300,EC:FP7:SP1-JTI,IMI-JU-03-2010,EU-AIMS(2012), Cury, Claire, Domaines émergents - Modélisation des interactions entre l'hippocampe et le cortex dans ' la conscience temporelle', établie à partir de l'imagerie cérébrale multimodale anatomique et fonctionnelle - - HM-TC2009 - ANR-09-EMER-0006 - EMER - VALID, Blanc - Karametria (Analyse statistique des structures cérébrales) - - KaraMetria2009 - ANR-09-BLAN-0332 - Blanc - VALID, Institut de Neurosciences Translationnelles de Paris - - IHU-A-ICM2010 - ANR-10-IAHU-0006 - IAHU - VALID, IMAging GEnetics for MENtal Disorders - IMAGEMEND - - EC:FP7:HEALTH2013-10-01 - 2017-09-30 - 602450 - VALID, Multidisciplinary Approaches to Translational Research In Conduct Syndromes - MATRICS - - EC:FP7:HEALTH2014-03-01 - 2019-02-28 - 603016 - VALID, European Autism Interventions - A Multicentre Study for Developing New Medications - EU-AIMS - - EC:FP7:SP1-JTI2012-04-01 - 2017-03-31 - 115300 - VALID, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), CATI Multicenter Neuroimaging Platform (CATI), Laboratoire de Neuroimagerie Assistée par Ordinateur (LNAO), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Université de Rennes (UNIV-RENNES), ANR-10-IAHU-0006,IHU-A-ICM(2010), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Large deformation diffeomorphic metric mapping, Computer science, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, IHI, [INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging, 02 engineering and technology, Imagen, Statistical shape analysis, Hippocampus, Kernel principal component analysis, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Diffeomorphisms, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, [INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging, Riemannian barycentres, Original Research, business.industry, Atlas (topology), General Neuroscience, Template, Morphometry, [SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience, [SCCO.NEUR] Cognitive science/Neuroscience, Centroids, Centroid, Pattern recognition, Shape analysis, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Computational anatomy, [MATH.MATH-DG]Mathematics [math]/Differential Geometry [math.DG], 020201 artificial intelligence & image processing, Artificial intelligence, Diffeomorphism, Atlas, business, [MATH.MATH-DG] Mathematics [math]/Differential Geometry [math.DG], 030217 neurology & neurosurgery, LDDMM, Neuroscience, Shape analysis (digital geometry), MRI
Abstract: International audience; In this paper, we propose an approach for template-based shape analysis of large datasets, using diffeomorphic centroids as atlas shapes. Diffeomorphic centroid methods fit in the Large Deformation Diffeomorphic Metric Mapping (LDDMM) framework and use kernel metrics on currents to quantify surface dissimilarities. The statistical analysis is based on a Kernel Principal Component Analysis (Kernel PCA) performed on the set of initial momentum vectors which parametrize the deformations. We tested the approach on different datasets of hippocampal shapes extracted from brain magnetic resonance imaging (MRI), compared three different centroid methods and a variational template estimation. The largest dataset is composed of 1,000 surfaces, and we are able to analyse this dataset in 26 h using a diffeomorphic centroid. Our experiments demonstrate that computing diffeomorphic centroids in place of standard variational templates leads to similar shape analysis results and saves around 70% of computation time. Furthermore, the approach is able to adequately capture the variability of hippocampal shapes with a reasonable number of dimensions, and to predict anatomical features of the hippocampus, only present in 17% of the population, in healthy subjects.
Published: 2018
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47. Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure

Author: Olivier Commowick, Christian Barillot, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), FLI / OFSEP, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), and Barillot, Christian
Subjects: [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

48. France Life Imaging and the transversal node for Information Analysis and Management (IAM)

Author: Barillot, Christian, Dojat, Michel, Kain, Michael, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), France Life Imaging - Information Analysis and Management [IRISA, Rennes] (FLI-IAM), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), France Life Imaging - Information Analysis and Management [GIN Inserm, Grenoble] (FLI-IAM), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Barillot, Christian
Subjects: [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

49. Solutions de gestion des données d’imagerie:exemples avec Shanoir, Archimed et Cati-DB

Author: Kain, Michael, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Barillot, Christian, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Subjects: [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

50. Open Science for the Neuroinformatics community

Author: Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Camille Maumet, Michael Kain, Christian Barillot, Tristan Glatard, Service Informatique et développements, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Images et Modèles, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Department of Computer-Science and Software Engineering [Montreal], Concordia University [Montreal], Service Informatique et d??veloppements, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Sant?? ( CREATIS ), Universit?? Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Universit?? de Lyon-Universit?? de Lyon-Institut National des Sciences Appliqu??es de Lyon ( INSA Lyon ), Universit?? de Lyon-Institut National des Sciences Appliqu??es ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliqu??es ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Universit?? Jean Monnet [Saint-??tienne] ( UJM ) -Institut National de la Sant?? et de la Recherche M??dicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Universit?? Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Universit?? de Lyon-Institut National des Sciences Appliqu??es ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliqu??es ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Universit?? Jean Monnet [Saint-??tienne] ( UJM ) -Institut National de la Sant?? et de la Recherche M??dicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Vision, Action et Gestion d'informations en Sant?? ( VisAGeS ), Institut National de la Sant?? et de la Recherche M??dicale ( INSERM ) -Inria Rennes ??? Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUM??RIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Syst??mes Al??atoires ( IRISA ), Universit?? de Rennes 1 ( UR1 ), Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliqu??es - Rennes ( INSA Rennes ) -Universit?? de Bretagne Sud ( UBS ) -??cole normale sup??rieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSup??lec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Universit?? de Rennes 1 ( UR1 ), Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliqu??es - Rennes ( INSA Rennes ) -Universit?? de Bretagne Sud ( UBS ) -??cole normale sup??rieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSup??lec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Syst??mes Al??atoires ( IRISA ), Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Universit?? de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliqu??es - Rennes ( INSA Rennes ) -Universit?? de Bretagne Sud ( UBS ) -??cole normale sup??rieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSup??lec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Department of Computer-Science and Software Engineering, Maumet, Camille, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1)
Subjects: [ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]
Abstract: International audience; The Neuroinformatics community in OpenAire-Connect is represented by members of the France Life Imaging (FLI) collaboration. In this context, we aim at leveraging OpenAire-Connect services and give our community members the possibility to easily publish and exchange research artefacts from FLI platforms, such as VIP and Shanoir. This will enable open and reproducible science, since literature, data, and methods can be linked, retrieved, and replayed by all the members of the community.
Published: 2018

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