Niang, Cheikh Tidiane, Kane, Mamadou, Niang, Youssoupha, Sarr, Nathalie, March, Laura, Tatard, Caroline, Artige, Emma, Diagne, Christophe, Moron, Vincent, Mauffrey, Jean-François, Noûs, Camille, Bâ, Khalilou, Laffont-Schwob, Isabelle, Bal, Amadou B., Dalecky, Ambroise, Laboratoire Population-Environnement-Développement (LPED), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), BIOPASS, ISRA-UCAD, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Université Gaston Berger de Saint-Louis Sénégal (UGB), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire Cogitamus, The program leading to this publication received funding from the French National Institute of Research for Sustainable Development (IRD), and the Excellence Initiative of Aix-Marseille University - A*MIDEX, a French 'Investissements d'Avenir' programme, through the LabEx OT-Med ('Rice, Rodents & Parasites -R2P' project) and the OSU Institut Pytheas. C.T. Niang was supported by a PhD scholarship grant from IRD., ANR-11-IDEX-0001,Amidex,INITIATIVE D'EXCELLENCE AIX MARSEILLE UNIVERSITE(2011), ANR-11-LABX-0061,OTMed,Objectif Terre : Bassin Méditerranéen(2011), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Aix Marseille Université (AMU), IRD, LabEx OT-Med (projet 'Rice, Rodents & Parasites – R2P') & OSU Institut Pythéas, and ObsMiCE
International audience; In the context of food self-sufficiency, the River Senegal Valley has been undergoing profound environmental changes for several decades. Rice production has increased due to the development of vast irrigated perimeters, which has been accompanied by recurrent proliferations of rodent populations that are crop pests and reservoirs of zoonoses. The aim of our study was to determine the factors underlying these phases of increased rodent abundance over a ten-year (2008 to 2019) sampling period during the hot dry season (February-May). A total of 1,867 rodents of four species were captured, among which Arvicanthis niloticus and Mastomys huberti dominated. Our results showed that, during this season, rodent abundance (i) increases significantly with rainfall from the previous year, (ii) is higher in cultivated than in uncultivated plots, (iii) increases with plant cover, (iv) increases, for M. huberti, with the presence of open water. We showed that in an area that was first sparsely cultivated and then impacted by hydro-agricultural rehabilitation of irrigation and drainage infrastructure, the abundance of A. niloticus changed following this program, reaching the level of a nearby area that has been intensively cultivated for decades. Moreover, we showed that the proportion of adults among the captured individuals was lower in rice plots than in vegetable gardening fields and uncultivated plots. The breeding pattern of adult individuals was also affected by land use. Results suggest that uncultivated areas and vegetable gardening fields constitute refuge and breeding ground hotspots and would thus form a starting point for the invasion of rice fields. Following these results, we advocate for regular monitoring of rodent breeding and abundance patterns, with a special focus on these refuge areas, particularly during the hot dry season. We recommend implementing effective and sustainable science-based control strategies at national and community levels to keep rodent populations within tolerable limits.; Dans un contexte de recherche d'autosuffisance alimentaire, la vallée du fleuve Sénégal subit depuis plusieurs décennies de profondes modifications environnementales. La production rizicole a augmenté grâce au développement de vastes périmètres irrigués. Cette évolution s'est accompagnée de proliférations récurrentes de populations de rongeurs ravageurs des cultures et réservoirs de zoonoses. L'objectif de notre étude était de déterminer les facteurs sous-jacents à ces phases d'augmentation de l'abondance des rongeurs sur une période d'échantillonnage de dix ans (2008 à 2019) pendant la saison sèche chaude (février-mai). Au total, 1867 rongeurs de quatre espèces ont été capturés, parmi lesquels les espèces Arvicanthis niloticus et Mastomys huberti dominaient. Nos résultats ont montré que, pendant cette saison, l'abondance des rongeurs (i) augmente significativement avec les précipitations de l'année précédente, (ii) est plus élevée dans les parcelles cultivées que dans les parcelles non cultivées, (iii) augmente avec le couvert végétal, (iv) augmente, pour M. huberti, avec la présence d'eau libre. Nous avons montré que dans une zone d'abord faiblement cultivée puis impactée par une réhabilitation hydro-agricole des infrastructures d'irrigation et de drainage, l'abondance d'A. niloticus a changé suite à ce programme, atteignant le niveau d'une zone voisine intensivement cultivée depuis des décennies. De plus, nous avons montré que la proportion d'adultes parmi les individus capturés était plus faible dans les parcelles de riz que dans les cultures maraîchères et les parcelles non cultivées. L’état reproducteur des individus adultes était également affecté par l'usage des terres. Les résultats suggèrent que les zones non cultivées et les champs de cultures maraîchères constituent des points chauds de refuge et de reproduction et formeraient ainsi un point de départ pour l'invasion des rizières. Suite à ces résultats, nous préconisons un suivi régulier de l’activité de reproduction et de l'abondance des rongeurs, avec une attention particulière sur ces zones de refuge, notamment pendant la saison sèche chaude. Nous recommandons la mise en oeuvre de stratégies de contrôle efficaces et durables, basées sur des données scientifiques, aux niveaux national et communautaire, afin de maintenir les populations de rongeurs dans des limites tolérables.