145 results on '"melhoramento animal"'
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2. Parâmetros genéticos de características de crescimento em bovinos da raça Tabapuã
- Author
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Amauri Felipe Evangelista, Laylson da Silva Borges, Weverton José Lima Fonseca, and Diego Helcias Cavalcante
- Subjects
avaliação genética ,bovino de corte ,melhoramento animal ,Veterinary medicine ,SF600-1100 - Abstract
O objetivo desta revisão de literatura é compilar informações e reunir resultados de estimativas de parâmetros genéticos para características de crescimento de bovinos da raça Tabapuã, as características foram: peso ao nascimento (PN), peso a desmame (PD), peso ao ano (PA) e peso ao sobreano (PS). As características de crescimento são de grande importância para a produção animal e tem despertado interesse de pesquisadores da área de melhoramento genético animal. Na literatura, diferentes estimativas de parâmetros genéticos foram encontradas, onde a grande maioria é de média a alta magnitude, mostrando grande variabilidade genética, indicando que é um bom indicador de resposta à seleção. Dessa forma é relevante o conhecimento dos parâmetros genéticos para estas características em bovinos da raça Tabapuã, visto que esta raça nos últimos tempos vem contribuindo para o incremento na pecuária de corte brasileira.
- Published
- 2020
3. Stopping criteria for genetic improvement software for beef-cattle mating selection
- Author
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Vidal, Ezequiel Luís, Camargo, Sandro da Silva, and Cardoso, Fernando Flores
- Subjects
decisão ,sistemas de acasalamento ,algorithm ,decision support ,suporte à ,algoritmo ,animal breeding ,melhoramento animal ,mating systems - Abstract
The objective of this work was to propose a new stopping criterion to shorten the computing time of the PampaPlus genetic improvement software, while maximizing the genetic qualification index (GQI) of the progeny, controlling inbreeding, and avoiding unintended culling. Data from two beef-cattle herds integrating PampaPlus were used. Five mating scenarios were built using different numbers of sires (9 to 37) and dams (142 to 568). The analyzed algorithm inputs were: expected progeny differences, pedigree information, maximum inbreeding, maximum and minimum number of matches for each sire, and penalty weights for poor performance. The analyzed response variables were computing time and the GQI of the progenies. Three stopping criteria were used: original stopping criterion fixed at 1,000 iterations; saturation stopping criterion (SSC), based on GQI variance; and Bhandari’s stopping criterion (BSC), which includes the generation interval parameter. SSC and BSC reduced processing time in 24.43-53.64% and in 14.32-50.87%, respectively. BSC reaches solution in less time, without losses in GQI quality. BSC is generalizable and effective to reduce the processing time of mating recommendations. Resumo O objetivo deste trabalho foi propor um novo critério de parada para diminuir o tempo de processamento do programa de melhoramento genético PampaPlus, além de maximizar o índice de qualificação genética (GQI) da progênie, controlar a endogamia e evitar o descarte não intencional. Foram utilizados dados de dois rebanhos integrantes do PampaPlus. Cinco cenários de acasalamento foram elaborados com diferentes números de touros (9 a 37) e vacas (142 a 568). Os dados analisados foram: diferenças esperadas na progênie, informações de pedigree, máxima endogamia, número máximo e mínimo de acasalamentos por touro, e penalidades para desempenho inferior. As variáveis analisadas foram tempo de processamento e o GQI das progênies. Foram utilizados três critérios de parada: critério de parada original, fixado em 1.000 iterações; critério de parada por saturação (SSC), baseado na variância do GQI; e critério de parada de Bhandari (BSC), que inclui o parâmetro de intervalo de gerações. O SSC e o BSC reduziram o tempo de processamento em 24,43-53,64% e em 14,32-50,87%, respectivamente. O BSC atinge solução em menos tempo, sem perda da qualidade do GQI. O BSC é generalizável e efetivo em reduzir o tempo de processamento das recomendações de acasalamento.
- Published
- 2023
4. Normas de reação para peso aos 365 e 550 dias de idade em bovinos Guzerá no Nordeste do Brasil.
- Author
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Santos, J. C., Malhado, C. H. M., Ambrosini, D. P., Martins Filho, R., Araujo, A. C., and Carneiro, P. L. S.
- Subjects
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GENOTYPE-environment interaction , *GENETIC correlations , *RANK correlation (Statistics) , *HERITABILITY , *ZEBUS , *CATTLE genetics - Abstract
The aim was to evaluate the effect of genotype environment interaction (IGA) on the weights adjusted to 365 (P365) and 550 (P550) days of age of Guzerat cattle by Bayesian hierarchical models of reaction norm. The database used was provided by the Associação Brasileira de Criadores de Zebu (ABCZ) and contained 15169 and 11183 records for P365 and P550, respectively. An animal model (MA) and hierarchical models of reaction norm with homogenous and heterogeneous variances in one step (MHNRHO1P and MHNRHE1P, respectively) and two steps (MHNRHO2P and MHNRHE2P, respectively) were fitted to assess the existence and effect of IGA. The MHNRHO1P was the best fit model. Estimates of heritability in MA were 0,37 and 0,29 for P365 and P550, respectively. Heritability ranged from 0,21 to 0,71 for P365 and 0,06 to 0,93 for P550 on MHNRHO1P along the environmental gradient. Spearman correlations between the sires for P365 and P550 ranged from 0,26 to 0,99 and from -0,99 to 0,99, respectively, and genetic correlations ranged from 0,70 to 1,00 and 0,40 to 1,00 for P365 and P550, respectively. There is IGA in Guzerá cattle in Northeast Brazil for P365 and P550, and it is necessary to consider the possibility of including this effect in genetic evaluations. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2019
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5. Guaiaca – a software tool for supporting the use of scientific applications designed for data analysis – part I: execution assistant
- Author
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Gil Carlos Rodrigues Medeiros, Willian Silva Barros, and Nelson José Laurino Dionello
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Palavras-chave: Análise de dados ,Histórico de análises ,Melhoramento animal ,Modelos mistos ,Software científico ,Usabilidade. ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
The aim of this work is to develop a software tool that provides a user-friendly graphical interface of generic and configurable design in order to ease the researcher’s tasks in data manipulation and analysis. Two primary targets have influenced the design: data preparation for analysis in animal breeding programs and usability increase for those applications that perform important analysis methods, but interact with users only through text files and command lines. The Guaiaca tool was designed as a “utility belt” in the form of two integrated assistants, and it can be combined with multiple analysis applications. This tool offers facilities to: (a) collect, manipulate, and reorganize data; (b) organize, register, and retrieve analyses through descriptors; and (c) prepare and activate analysis processes. Guaiaca’s Execution Assistant module is described in this paper, where is also emphasized the parameters to configure, the main data structures to maintain, and the form of the relationship between its generic interface and combined analysis applications. The generic interface has been customized and validated for the peculiarities of two applications, WOMBAT (mixed models) and INTERGEN (Bayesian models). Several data analyses were performed with the interface support to prove its generality and ease of installation, configuration and operation. Data sets from 5,726 quails in a breeding program were used with these applications. Use of the integrated Guaiaca-WOMBAT application is illustrated with an analysis example, prepared and visualized on the Guaiaca tool and executed by WOMBAT. The Beta version of the Guaiaca tool for Windows is available free of charge to the scientific community and can be obtained at http://www.ufpel.edu.br/~gil.medeiros/guaiaca.
- Published
- 2016
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6. Classificação de características produtivas fenotípicas de diferentes raças de poedeiras através da mineração de dados Phenotypic production characteristics from different breeds of laying hens through data mining
- Author
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Priscila Becker Ferreira, Marcos Martinez do Vale, Andre Macedo, Lenise Shroder Boemo, Paulo Roberto Nogara Rorato, and Tamiris Barbosa Beck
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bioclimatologia ,ovos marrons ,melhoramento animal ,ambiência ,bioclimatology ,brown eggs ,animal breeding ,environment ,Agriculture ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
O estudo foi realizado com o banco de dados do Programa de Melhoramento Genético de Poedeiras de Ovos Marrons do Laboratório de Avicultura (LAVIC) do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), onde são utilizadas aves das raças Plymouth Rock White (PRW), Plymouth Rock Barred (PRB) e Rhode Island Red (RIR). Os dados utilizados foram referentes a duas gerações das três raças durante o primeiro ciclo de produção, dos anos de 2009 e 2010. Os parâmetros avaliados foram: taxa de postura semanal, peso dos ovos e peso corporal. O estudo foi dividido em duas abordagens de análise, a primeira análise foi realizada com os dados produtivos com o objetivo de identificar pontos críticos de seleção fenotípica, relacionados à caracterização zootécnica, e a segunda abordagem consistiu na associação dos mesmos parâmetros produtivos, com os dados climáticos de Santa Maria - RS. Os dados foram analisados pela técnica de Mineração de Dados, sendo utilizada a tarefa de classificação com a construção de árvore de decisão pelo algoritmo J48. A mineração dos dados indicou a taxa de postura média na 25ª semana de idade e posteriormente o peso médio dos ovos na 33ª semana de idade como as principais variáveis relacionadas com a diferenciação das raças estudadas, (precisão de 0,833). Na segunda abordagem, as árvores de classificação obtidas apresentaram precisão entre 0,88 e 0,91, sugerindo uma forte associação entre as variáveis ambientais e o desempenho produtivo das aves. Poedeiras PRW são mais sensíveis ao calor que as RIR e PRB e apresentam, na fase de pré-pico, uma maior taxa de postura. A Mineração de Dados permite classificar a produtividade das raças de poedeiras de ovos marrons, podendo indicar as influências ambientais sobre o fenótipo das diferentes raças estudadas.The study was conducted with the database obtained from the Breeding Program of Brown Egg Laying Hens of the Poultry Laboratory (LAVIC) of the Department of Animal Science of the Federal University of Santa Maria (UFSM), where it is used poultry breeds such as White Plymouth Rock (PRW), Barred Plymouth Rock (PRB) e Red Rhode Island (RIR). The data used referred to two generations of these three breeds during the first production cycle of 2009 and 2010. The parameters evaluated were: weekly rate of egg laying, egg weight and body weight. The research was divided into two approaches of analysis, the first being performed with the production data, aiming to identify critical points of phenotypic selections related to zootechnical characterization, and the second approach consisted in the association of the same production parameters together with the weather data of Santa Maria - RS. The data was analyzed using the Data Mining technique, using the classification task by building the decision tree with the J48 algorithm. The data mining indicated the average rate of egg laying at 25 weeks of age and the average weight of eggs at 33 weeks of age, and pointed these as the main variables related to the differentiation of breeds studied, (accuracy of 83.3%). On the second approach, the decision trees obtained showed accuracy between 88% and 91%, suggesting a strong association between the environmental variables and the production performance of the birds. The PRW breed is more sensitive to heat than the RIR and the PRB breed and they showed a higher rate of production during the pre-peak phase. The data mining allowed to classify the productivity of the brown egg laying hens, which may indicate environmental influences on the phenotype of the different breeds studied.
- Published
- 2013
7. Degree of multicollinearity and variables involved in linear dependence in additive-dominant models Grau de multicolinearidade e variáveis envolvidas na dependência linear em modelos aditivo-dominantes
- Author
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Juliana Petrini, Raphael Antonio Prado Dias, Simone Fernanda Nedel Pertile, Joanir Pereira Eler, José Bento Sterman Ferraz, and Gerson Barreto Mourão
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Bos taurus x Bos indicus ,melhoramento animal ,bovino de corte ,matriz de correlação ,cruzamento ,fator de inflação da variância ,animal breeding ,beef cattle ,correlation matrix ,crossbreeding ,variance inflation factor ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
The objective of this work was to assess the degree of multicollinearity and to identify the variables involved in linear dependence relations in additive-dominant models. Data of birth weight (n=141,567), yearling weight (n=58,124), and scrotal circumference (n=20,371) of Montana Tropical composite cattle were used. Diagnosis of multicollinearity was based on the variance inflation factor (VIF) and on the evaluation of the condition indexes and eigenvalues from the correlation matrix among explanatory variables. The first model studied (RM) included the fixed effect of dam age class at calving and the covariates associated to the direct and maternal additive and non-additive effects. The second model (R) included all the effects of the RM model except the maternal additive effects. Multicollinearity was detected in both models for all traits considered, with VIF values of 1.03 - 70.20 for RM and 1.03 - 60.70 for R. Collinearity increased with the increase of variables in the model and the decrease in the number of observations, and it was classified as weak, with condition index values between 10.00 and 26.77. In general, the variables associated with additive and non-additive effects were involved in multicollinearity, partially due to the natural connection between these covariables as fractions of the biological types in breed composition.O objetivo deste trabalho foi avaliar o grau de multicolinearidade e identificar as variáveis envolvidas na dependência linear em modelos aditivo-dominantes. Foram utilizados dados de peso ao nascimento (n=141.567), peso ao ano (n=58.124) e perímetro escrotal (n=20.371) de bovinos de corte compostos Montana Tropical. O diagnóstico de multicolinearidade foi baseado no fator de inflação de variância (VIF) e no exame dos índices de condição e dos autovalores da matriz de correlações entre as variáveis explanatórias. O primeiro modelo estudado (RM) incluiu o efeito fixo de classe de idade da mãe ao parto e as covariáveis associadas aos efeitos aditivos e não aditivos diretos e maternos. O segundo modelo (R) incluiu todos os efeitos do RM, exceto os efeitos aditivos maternos. Detectou-se multicolinearidade em ambos os modelos para todas as características consideradas, com valores de VIF de 1,03 - 70,20, para RM, e de 1,03 - 60,70, para R. As colinearidades aumentaram com o aumento de variáveis no modelo e com a redução no volume de observações, e foram classificadas como fracas, com valores de índice de condição entre 10,00 e 26,77. Em geral, as variáveis associadas aos efeitos aditivos e não aditivos estiveram envolvidas em multicolinearidade, parcialmente em razão da ligação natural entre essas covariáveis como frações dos tipos biológicos na composição racial.
- Published
- 2012
8. Canonical correlation analysis applied to production and reproduction traits of meat type quails
- Author
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Jeferson Corrêa Ribeiro, Luciano Pinheiro da Silva, Giovani da Costa Caetano, Aline Camporez Crispim, Rodrigo de Oliveira Pacheco, and Robledo de Almeida Torres
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análise multivariada ,Coturnix coturnix ,melhoramento animal ,pares canônicos ,produção de ovos ,Agriculture ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
ABSTRACT: Data from 629 meat type quails were used to study association between two different sets of traits: egg production and reproduction. Traits related to reproduction were: body weight at 42 days (W42), average egg weight (AEW), age at sexual maturity (ASM); and production traits: number of eggs produced from 42 until 182th day considering intervals of 35 days each period (P1, P2, P3 and P4). Canonical correlations were used to describe the association between these two sets of traits. The canonical coefficients indicated that egg production and reproductive traits were moderately related (0.3475). The first partial period of production (P1) and age at sexual maturity were the most relevant traits among the analyzed variables. Results show that selecting animals with lower age at sexual maturity might lead to an increase on number of eggs produced until 77 days, although it might also lead to a decrease on egg weight. Breeding programs aiming to improve quails production should consider selection strategies to decrease age at sexual maturity and then, as correlated response, increased egg production might be observed.
- Published
- 2016
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9. Production and body composition traits of broilers in relation to breast weight evaluated by path analysis Características de produção e de composição corporal de frangos em relação ao peso de peito avaliada por análise de trilha
- Author
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Leandro Homrich Lorentz, Leila de Genova Gaya, Raquel Lunedo, José Bento Sterman Ferraz, Fernanda Marcondes de Rezende, and Tércio Michelan Filho
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melhoramento animal ,análise multivariada ,correlação fenotípica ,aves ,pré-seleção ,animal breeding ,multivariate analysis ,phenotypic correlation ,poultry ,pre-selection ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
Breast weight has great economic importance in poultry industry, and may be associated with other variables. This work aimed to estimate phenotypic correlations between performance (live body weight at 7 and 28 days, and at slaughter, and depth of the breast muscle measured by ultrasonography), carcass (eviscerated body weight and leg weight) and body composition (heart, liver and abdominal fat weight) traits in a broiler line, and quantify the direct and indirect influence of these traits on breast weight. Path analysis was used by expanding the matrix of partial correlation in coefficients which give the direct influence of one trait on another, regardless the effect of the other traits. The simultaneous maintenance of live body weight at slaughter and eviscerated body weight in the matrix of correlations might be harmful for statistical analysis involving systems of normal equations, like path analysis, due to the observed multicollinearity. The live body weight at slaughter and the depth of the breast muscle as measured by ultrasonography directly affected breast weight and were identified as the most responsible factors for the magnitude of the correlation coefficients obtained between the studied traits and breast weight. Individual pre-selection for these traits could favor an increased breast weight in the future reproducer candidates of this line if the broilers' environmental conditions and housing are maintained, since the live body weight at slaughter and the depth of breast muscle measured by ultrasonography were directly related to breast weight.O peso do peito possui grande importância econômica na indústria de frangos, podendo estar associado a outras variáveis passíveis de seleção. Estimaram-se correlações fenotípicas entre características de desempenho (peso vivo aos 7, 28 dias e ao abate e profundidade de músculo peitoral por ultra-sonografia), carcaça (peso eviscerado e de pernas) e composição corporal (peso do coração, do fígado e da gordura abdominal), em uma linhagem de frangos, e quantificou-se a influência direta e indireta destas variáveis sobre o peso do peito. Para tanto, utilizou-se a análise de trilha, desdobrando-se a matriz de correlações parciais em coeficientes que forneceram a influência direta de uma variável sobre a outra, independentemente das demais. A manutenção das variáveis peso vivo ao abate e peso eviscerado na matriz de correlações pode ser prejudicial à análise estatística que envolve os sistemas de equações normais, como a análise de trilha, devido à multicolinearidade observada. O peso vivo ao abate e a profundidade do músculo peitoral por ultra-sonografia apresentaram efeitos diretos importantes sobre o peso de peito e foram identificadas como as principais responsáveis pela magnitude dos coeficientes de correlação obtidos. Assim, uma pré-seleção individual para estas características pode favorecer um aumento no peso de peito nesta linhagem, se mantidas as condições ambientais de criação dos frangos, uma vez que o peso vivo ao abate e a profundidade de músculo peitoral por ultra-sonografia afetam fenotipicamente e diretamente o peso de peito.
- Published
- 2011
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10. Biotecnologia animal
- Author
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Luiz Lehmann Coutinho, Millor Fernandes do Rosário, and Erika Cristina Jorge
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Avicultura ,Bovino ,Genômica ,Marcador molecular ,Melhoramento animal ,Suíno ,Poultry ,Bovine ,Genomics ,Molecular marker ,Animal breeding ,Swine ,Social sciences (General) ,H1-99 - Abstract
A biotecnologia animal tem fornecido novas ferramentas para os programas de melhoramento e, dessa forma, contribuído para melhorar a eficiência da produção dos produtos de origem animal. No entanto, os avanços têm sido mais lentos do que antecipados, especialmente em razão da dificuldade na identificação dos genes responsáveis pelas características fenotípicas de interesse zootécnico. Três estratégias principais têm sido utilizadas para identificar esses genes - mapeamento de QTL, genes candidatos e sequenciamento de DNA e mRNA - e cada uma tem suas vantagens e limitações. O mapeamento de QTL permite determinar as regiões genômicas que contêm genes, mas o intervalo de confiança do QTL pode ser grande e conter muitos genes. A estratégia de genes candidatos é limitada por causa do conhecimento ainda restrito das funções de todos os genes. Os sequenciamentos de genomas e de sequências expressas podem auxiliar na identificação da posição de genes e de vias metabólicas associadas à característica de interesse. A integração dessas estratégias por meio do desenvolvimento de programas de bioinformática permitirá a identificação de novos genes de interesse zootécnico. Assim, os programas de melhoramento genético se beneficiarão pela inclusão da informação obtida diretamente do DNA na avaliação do mérito genético dos plantéis disponíveis.Animal biotechnology is providing new tools for animal breeding and genetics and thus contributing to advances in production efficiency and quality of animal products. However, the progress is slower than anticipated, mainly because of the difficulty involved in identifying genes that control phenotypic characteristics of importance to the animal industry. Three main strategies: QTL mapping, candidate genes and DNA and mRNA sequencing have been used to identify genes of economic interest to animal breeding and each has advantages and disadvantages. QTL mapping allows identification of the genomic region that contains the genes, but the confidence interval of the regions is usually large and may contain several genes. Candidate gene approach is limited to our restricted knowledge of the biological function of the genes. Sequencing of genomes and expressed sequences tags can provide identifying gene position and metabolic pathways associated with phenotypic trait. Integrating these strategies using bioinformatics software will allow identifying of novel genes for animal production. Then, animal breeding programs will include the information from DNA directly on evaluation of genetic value of livestock production.
- Published
- 2010
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11. Mapeamento de locos de características quantitativas para desempenho no cromossomo 4 de suínos Mapping of quantitative trait loci for performance on chromosome 4 in pigs
- Author
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Kleibe de Moraes Silva, Simone Eliza Facioni Guimarães, Paulo Sávio Lopes, Carlos Souza do Nascimento, Marcos Soares Lopes, and Mayara Morena Del Cambre Amaral
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cruzamento divergente ,marcadores microssatélite ,melhoramento animal ,animal breeding ,divergent cross ,microsatellite markers ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Uma população F2 de suínos obtida a partir do intercruzamento da geração F1, proveniente do acasalamento divergente de dois machos da raça naturalizada brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace × Large White × Piétrain) e genotipada para cinco marcadores tipo microssatélite foi utilizada com o objetivo de mapear locos de características quantitativas associados a características de desempenho no cromossomo 4. As características avaliadas foram: número de tetas, peso ao nascimento, peso aos 21, 42, 63, 77 e 105 dias de idade, peso ao abate, consumo de ração, conversão alimentar e ganho de peso médio diário dos 77 aos 105 dias de idade e idade ao abate. Utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento com análises realizadas por meio do programa QTL EXPRESS. Verificou-se a presença de apenas um QTL significativo (para peso aos 77 dias). A utilização deste QTL na Seleção Assistida por Marcadores deve ser feita depois que a posição desse QTL for refinada, com possível identificação da mutação causal e estimação de seus efeitos.The objective of this work was to map QTL on porcine chromosome 4 and associate them to performance traits. For this, a F2 pig population was established from a cross from the F1 generation, produced by crossing two naturalized Brazilian Piau sires and 18 commercial dams (Landrace × Large White × Piétrain). The population was genotyped for five microsatellite markers. The performance of traits evaluated in the population were: teat number, birth weight, weight at 21, 42, 63, 77 and 105 days of age, slaughter age, feed intake, feed gain ratio, average daily gain from 77 to 105 days of age, and slaughter age. Data were analyzed through multiple regressions developed for analysis of interval mapping using QTL EXPRESS software. Significant evidence for QTL was verified for weight at 77 days of age. The use of this information for marker assisted selection can be done after fine mapping, identification of the causative mutation and estimation of its effects.
- Published
- 2009
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12. TESTICULAR BIOMETRIC CHARACTERISTICS IN SANTA INÊS SHEEP SUBMITTED TO PROTEIN SUPPLEMENTATION AND ANTI-HELMINTH TREATMENTS CARACTERÍSTICAS BIOMÉTRICAS TESTICULARES EM CARNEIROS SANTA INÊS SUBMETIDOS A DIFERENTES REGIMES DE SUPLEMENTAÇÃO PROTÉICA E TRATAMENTOS ANTI-HELMÍNTICOS
- Author
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Helder Louvandini, Concepta McManus, Rodrigo Duarte Martins, Carolina Madeira Lucci, and Patrícia Spoto Corrêa
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Melhoramento Animal ,Agriculture ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Biometric testicular traits were evaluated on 24 entire male Santa Inês lambs, with mean initial weight of 24.5 kg ± 2.88. These were distributed in four treatments (n=6): HPv (animals drenched + high protein concentrate), HPn: (animals not drenched + high protein concentrate), LPv: (animals drenched + low protein concentrate), LPn: (animals not drenched + low protein concentrate) for eight and a half months. Before slaughter testicular measurements were taken in situ. Scrotal perimeter (SC) was measured using tape as well as length (LENG) and width (WID) using calipers. Testicular shape and volume (using prolate and cylinder equation) were calculated. After slaughter the measurements were taken in vitro. Real testicle volume (VOLR) was measured using water displacement. Length (LENGV) and width (WIDV) were measured with calipers after skin removal. The testicles were symmetrical and calipers were an accurate means of in situ measurement of the testicle size. The form of the testicles affected the volume. The average of the prolate sphere and cylinder equations gave the best estimate for real testicle volume. High protein levels in the diet accompanied by antihelminth treatment led to higher body weight in the sheep, this being the main factor for variation in testicle biometric traits. KEY WORDS: Shape, sheep, testicle biometry, volume. Para avaliar as características biométricas testiculares de carneiros da raça Santa Inês, 24 cordeiros machos, inteiros, com peso médio inicial de 24,5 kg ± 2,88, aos quatro meses de idade, foram distribuídos em quatro tratamentos: APv (animais vermifugados + concentrado com alta proteína), APn (animais não-vermifugados + concentrado com alta proteína), BPv (animais vermifugados + concentrado com baixa proteína), BPn (animais não vermifugados + concentrado com baixa proteína) durante 8 meses e meio. Antes do abate, realizaram-se as medições testiculares in situ: perímetro escrotal (PE), comprimento (COMP), largura testicular (LARG) e a forma dos testículos, bem como o volume testicular (cilindro e prolato esferóide). Após o abate, determinaram-se o volume testicular real (VOLR), o comprimento (COMPV) e a largura testicular (LARGV). Observou-se que os testículos dos animais eram simétricos e que o uso do paquímetro é uma forma altamente confiável para se realizar as medições testiculares in situ. O formato dos testículos afetou diretamente seu volume. O valor médio das equações do prolato esferóide e cilíndrica é a forma mais acurada para se estimar o volume testicular real em ovinos Santa Inês. O alto teor de proteína da dieta e o tratamento antiparasitário possibilitaram uma melhoria do peso corporal dos ovinos, sendo o principal fator de variação para as características biométricas testiculares.PALAVRAS-CHAVES: Biometria testicular, dieta, forma testicular, ovino, volume testicular.
- Published
- 2008
13. EFFECTS OF THE INTERACTION GENOTYPE X NUTRITIONAL SYSTEM ON LIVEWEIGHT AND CARCASS COMPONENT EFEITO DA INTERAÇÃO GENÓTIPO X SISTEMA NUTRICIONAL SOBRE A COMPOSIÇÃO REGIONAL E TECIDUAL
- Author
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Roberta Rollemberg Cabral Martins, Nelson Manzoni de Oliveira, José Carlos da Silveira Osório, and Maria Teresa Moreira Osório
- Subjects
Melhoramento animal ,Agriculture ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
With the objective of evaluating the isolated effects of genotype and of nutritional system, as well as the effect of the interaction between genotype and nutrition on quantitative and qualitative aspects of the meat production, sixty Polwarth male lambs and 51 Corriedale male lamb, born at August and September, raised in three different nutritional systems (native pasture, improved pasture e confinement) and slaughtered with 122 days of age, were examined. The animals were weighed before slaughtering and, after slaughtering, the following traits were measured: cold carcass weights, shoulder, hindquarter, rib and neck weights and the weight of bone, muscle and fat of the shoulder and the hindquarter. The percentages were obtained by calculation. The experimental design was a totally randomized in a 3x2 factors (nutritional systems and genotypes). There was interaction genotype-nutrition (P KEY WORDS: Interaction genotype-nutritional system, lambs, regional composition, tissue composition. Com o objetivo de avaliar os efeitos isolados de genótipo e de sistema nutricional, bem como o da interação genótipo x sistema nutricional sobre aspectos quantitativos e qualitativos da produção de carne ovina, utilizaram-se 60 cordeiros da raça Ideal e 51 da raça Corriedale, nascidos no mês de agosto e setembro, criados em três sistemas diferentes de alimentação (campo natural, pastagem cultivada e confinamento) e abatidos com 122 dias de idade. Os animais foram pesados antes do abate e de suas carcaças obteve-se o peso da carcaça fria, da paleta, da perna, do costilhar e do pescoço e, por cálculo, percentagem de paleta, da perna, do costilhar e do pescoço. A paleta e a perna foram desossadas e destes cortes obtiveram-se o peso de osso, músculo e gordura e, por cálculo, a percentagem desses tecidos. Desenvolveu-se o experimento em um delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3x2 (sistemas nutricionais e genótipos). Houve interação genótipo-nutrição (PPALAVRAS-CHAVES: Composição regional, composição tecidual, interação genótipo-sistema nutricional, ovinos.
- Published
- 2008
14. Genetic linkage maps of chicken chromosomes 6, 7, 8, 11 and 13 from a Brazilian resource population Mapas de ligação dos cromossomos 6, 7, 8, 11 e 13 de uma população brasileira de galinha
- Author
-
Marcel Ambo, Raquel de Lello Rocha Campos, Ana Sílvia Meira Tavares Moura, Clarissa Boschiero, Millor Fernandes do Rosário, Mônica Corrêa Ledur, Kátia Nones, and Luiz Lehmann Coutinho
- Subjects
Gallus gallus ,locos de características quantitativas (QTLs) ,mapas genéticos ,marcadores microssatélites ,melhoramento animal ,quantitative trait loci (QTL) ,genetic maps ,microsatellite markers ,animal breeding ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
A linkage map is essential not only for quantitative trait loci (QTL) mapping, but also for the organization and location of genes along the chromosomes. The present study is part of a project whose major objective is, besides from construction the linkage maps, the whole genome scan for mapping QTL for performance traits in the Brazilian experimental chicken population. Linkage maps of chicken chromosomes 6 to 8, 11 and 13 were constructed based on this population. The population was developed from two generations of crossbreeding between a broiler and a layer line. Fifty-one microsatellite markers were tested, from which 28 were informative: 4, 8, 7, 4 and 5 for chromosomes 6, 7, 8, 11 and 13, respectively. A SNP located in the leptin receptor gene was included for chromosome 8. Ten parental, 8 F1 and 459 F2 chickens from five full-sib families were genotyped with these markers. The number of total informative meioses per locus varied from 232 to 862, and the number of phase-known informative meioses from 0 to 764. Marker orders in the chromosomes coincided with those of the chicken consensus map, except for markers ADL0147 and MCW0213, on chromosome 13, which were inverted. The reduced number of phase-known informative meioses for ADL0147 (150) may be pointed out as a possible cause for this inversion, apart from the relative short distance between the two markers involved in the inversion (10.5 cM).O mapa de ligação além de ser fundamental no mapeamento de locos de características quantitativas (QTLs) é importante na organização e localização de genes distribuídos ao longo dos cromossomos. O presente estudo é parte de um trabalho cujo objetivo maior, é a análise de mapeamento de QTLs para características de desempenho no genoma de uma população experimental desenvolvida no Brasil. Com base nesta população foram construídos os mapas de ligação dos cromossomos 6 a 8, 11 e 13 da galinha. A população foi desenvolvida a partir de duas gerações de cruzamentos entre uma linhagem de corte e uma de postura. Foram testados 51 marcadores microssatélites, dos quais 28 foram informativos: 4, 8, 7, 4 e 5 dos cromossomos 6, 7, 8, 11 e 13, respectivamente. Um SNP localizado no gene do receptor da leptina foi incluído no cromossomo 8. Os 10 parentais, 8 F1 e um total de 459 aves F2 de cinco famílias de irmãos completos foram genotipados com estes marcadores. O número de meioses informativas totais por loco variou de 232 a 862 e o de meioses informativas de fase conhecida de 0 a 764. A ordem dos marcadores nos cromossomos coincidiu com a do mapa consenso da galinha, com exceção dos marcadores ADL0147 e MCW0213 do cromossomo 13 que tiveram sua ordem invertida. O número reduzido de meioses informativas de fase conhecida para o marcador ADL0147 (150) pode ser apontado como uma possível causa para a inversão, além da relativa proximidade entre os dois marcadores envolvidos na inversão (10,5 cM).
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- 2008
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15. Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e freqüentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias Estimation of variance components using Bayesian and frequentist inferences considering simulated data under heterogeneity of variance
- Author
-
José Marques Carneiro Júnior, Giselle Mariano Lessa de Assis, Ricardo Frederico Euclydes, Robledo de Almeida Torres, and Paulo Sávio Lopes
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amostragem de Gibbs ,heterocedasticidade ,informação a priori ,melhoramento animal ,parâmetros genéticos ,simulação ,animal breeding ,a priori information ,genetic parameters ,Gibbs sampling ,heterocedasticity ,simulation ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade desejada: alta, média ou baixa. Os componentes de variância foram estimados por meio da metodologia Bayesiana via Amostragem de Gibbs e pelo método REML. Para a metodologia Bayesiana, foram utilizados três níveis de informação a priori: não-informativo, pouco informativo e informativo. Os métodos comparados apresentaram resultados semelhantes quando priors não-informativos foram utilizados e as populações de tamanho grande, de modo geral, apresentaram melhores estimativas. Para as populações pequenas, as análises realizadas considerando os níveis de variabilidade separadamente apresentaram maiores problemas, em virtude do pequeno tamanho das subpopulações formadas. Observou-se, para a metodologia Bayesiana, que o aumento no nível de informação a priori influenciou positivamente as estimativas dos componentes de variância, principalmente para as populações pequenas. Portanto, na presença de heterogeneidade de variâncias, as metodologias se comportam de forma semelhante. Entretanto, para populações pequenas a metodologia Bayesiana conduz a melhores estimativas quando informações adicionais estão disponíveis.A genome of 3.000 centimorgans was simulated for a single quantitative trait governed by 800 loci with two alleles per locus. According to the genomic structure proposed, 1,500 males and 1,500 females constituted the base population which was used to form two (small and large) initial populations. Two types (only additive genetic variance and both additive genetic and environmental variances) and three variability levels (high, medium and low) of heterogeneity of variances were inserted in the initial populations. Variance components were estimated by Bayesian inference via Gibbs Sampling using three different levels of priors (non-informative, slightly informative and informative) and by REML. The best estimates of variance components were obtained with large populations. In small populations, the individual analyses for different variability levels presented problems related to variance components estimation due the small size of subpopulations. Both methods presented similar results for variance components when non-informative priors were used in Bayesian inference. Increasing the level of a priori information improved the estimates of variance components by Bayesian inference, especially in small populations.
- Published
- 2007
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16. Mapeamento de locos de características quantitativas no cromossomo 6, associados às características de carcaça e de órgãos internos de suínos Mapping of quantitative trait loci for carcass traits and internal organs in swine chromosome 6
- Author
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Aldrin Vieira Pires, Paulo Sávio Lopes, and Simone Eliza Facioni Guimarães
- Subjects
QTL ,cruzamento divergente ,genética molecular ,melhoramento animal ,animal breeding ,divergent cross ,molecular genetic ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Com o objetivo de mapear locos de características quantitativas (QTLs) associados às características de carcaça e de órgão internos, uma população composta de 550 animais F2 foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites distribuídos no cromossomo 6. As características avaliadas foram: comprimento de carcaça pelos métodos brasileiro e americano, peso e rendimento de carcaça, espessura de toucinho na região da copa, espessura de toucinho imediatamente após a última costela, espessura de toucinho entre a última e a penúltima vértebra lombar, menor espessura de toucinho na região acima da última vértebra lombar, espessura de toucinho imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorso-lombar, espessura de toucinho média (geral = estimada a partir da média de todas as espessuras de toucinho citadas anteriormente; e dorso-lombar = estimada a partir das espessuras de toucinho tomadas na linha dorso-lombar do animal), espessura de bacon, profundidade de lombo, área de olho-de-lombo, pesos de órgãos internos (coração, pulmões, fígado, baço e rim) e comprimento de intestino. Utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento por meio do programa QTL Express. Foram encontrados QTLs sugestivos para as características de comprimento de carcaça pelo método brasileiro e espessura de bacon e QTL significativo para peso do rim. Nos intervalos dos picos da estatística F em que se encontraram QTLs sugestivos, devem ser incluídos mais marcadores para se confirmar a real presença de QTL.A total of the 550 F2 animals produced by divergent cross using two sires of the native Brazilian breed named Piau and 18 commercial dams were genotyped for 13 microsatellite markers in swine chromosome 6. The traits evaluated were: carcass length by the Brazilian carcass classification method, carcass length by the American carcass classification method, carcass weight, carcass yield, higher backfat thickness at last 2nd-3rd thoracic vertebrae, backfat thickness after last rib, backfat thickness between last 1st-2nd lumbar vertebrae, lower backfat thickness after last lumbar vertebrae, backfat thickness after last rib, at 6,5 cm from the midline, average backfat thickness (global = estimated by average of all backfat thickness; and midline = estimated by average of midline backfat thickness), bacon depth, loin depth and loin eye area; internal organs weight (heart, lungs, liver, kidney and spleen), and intestine length. Data were analyzed by multiple regression using the interval mapping method from the QTL Express software. Suggestive QTL were found for carcass length by the Brazilian method and bacon depth and a significant one for kidney weight. Additional markers should be included in the peak intervals of the suggestive F-values to confirm the presence of QTL.
- Published
- 2006
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17. Canonical correlation analysis applied to production and reproduction traits of meat type quails.
- Author
-
Corrêa Ribeiro, Jeferson, Pinheiro da Silva, Luciano, da Costa Caetano, Giovani, Camporez Crispim, Aline, de Oliveira Pacheco, Rodrigo, and de Almeida Torres, Robledo
- Subjects
- *
ANIMAL breeding research , *COTURNIX , *AGRICULTURAL egg production , *MULTIVARIATE analysis , *QUAILS - Abstract
Data from 629 meat type quails were used to study association between two different sets of traits: egg production and reproduction. Traits related to reproduction were: body weight at 42 days (W42), average egg weight (AEW), age at sexual maturity (ASM); and production traits: number of eggs produced from 42 until 182th day considering intervals of 35 days each period (P1, P2, P3 and P4). Canonical correlations were used to describe the association between these two sets of traits. The canonical coefficients indicated that egg production and reproductive traits were moderately related (0.3475). The first partial period of production (P1) and age at sexual maturity were the most relevant traits among the analyzed variables. Results show that selecting animals with lower age at sexual maturity might lead to an increase on number of eggs produced until 77 days, although it might also lead to a decrease on egg weight. Breeding programs aiming to improve quails production should consider selection strategies to decrease age at sexual maturity and then, as correlated response, increased egg production might be observed. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2016
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18. Efeito da endogamia sobre pesos pré-desmame em bovinos da raça Nelore mocho criados a pasto no bioma Cerrado.
- Author
-
Lopes, F. B., Magnabosco, C. U., de Souza, F. M., de Assis, A. S., and Brunes, L. C.
- Abstract
This study was carried out to estimate the genetic direct and maternal genetic trends and to study the inbreeding effect on the standardized weight at 120 (W120) and 210 (W210) days of age in polled Nellore cattle from Embrapa Cerrado herd. The records were collected between 1990 and 2010. Both breeding values and inbreeding coefficients were estimated using MTDFREML software. 23.513 animals were included in the relationship matrix. The mean and the maximum estimative of inbreeding coefficient were 2.17 % and 14.10 %, respectively. Over the year there was genetic progress for genetic direct effect as well as for maternal effect. The average inbreeding of the herd can be considered low when compared with other studies. The results indicated direct inbreeding caused reduction in individual genetic merit for standardized weights at 120 and 210 days of age, possibly due to the reduction in additive genetic variance. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2016
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19. Bayesian estimates of genetic parameters for reproductive traits in Nellore cows raised on pasture in tropical regions.
- Author
-
Magnabosco, Cláudio Ulhôa, Lopes, Fernando Brito, de Magalhaes Rosa, Guilherme Jordão, and Sainz, Roberto Daniel
- Subjects
- *
COWS , *PARTURITION grounds , *COVARIANCE matrices , *BAYESIAN analysis , *PREGNANCY in animals - Abstract
Background: Nellore cows are well adapted to tropical conditions, and they have good maternal ability as well as long and prolific reproductive life. Objective: to estimate (co)variances and genetic parameters for calving interval (CI), age at first calving (AFC), gestation length (GL), and days open (DO) in Nellore cows. Methods: covariance components and genetic parameters were estimated using multi-trait Bayesian procedures. Results: three traits had low but statistically significant heritabilities, averaging 0.05, 0.10, and 0.04 for CI, GL, and DO, respectively, whereas age at first calving had a higher heritability (0.36). The permanent environmental effects for CI, GL, and DO were also low, averaging 0.08, 0.07, and 0.15, respectively. The genetic correlations between AFC and CI, AFC and GL, AFC and DO, GL and CI, CI and DO, GL and DO were 0.20, 0.12, 0.11, 0.02, 0.92, and -0.21, respectively. Selection for shorter CI would contribute towards decreasing DO. However, selection for decreased GL could result in a greater number of DO. Despite the favorable genetic correlations, the direct selection responses for these traits would be low. Conclusion: reproductive traits are strongly influenced by environmental effects. Changes in management and environmental factors could rapidly improve reproductive performance of Polled Nellore herds. Genetic selection for these traits should produce a much slower but permanent response. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2016
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20. Morphological growth curves for locally adapted swine in Brazil.
- Author
-
Dall Cortivo, P. R., Bretas, A. A., Silva, I. M., Braccini, J., and McManus, C.
- Subjects
- *
SWINE , *DEVELOPMENTAL biology - Abstract
Growth curves were determined for four breeds of Brazilian locally adapted swine (Moura, Piau, Nilo and Monteiro) using nonlinear models. Data was collected on 13 morphological measurements of 220 animals of both sexes from 30 days of age to adult stages. Curves were fitted using nonlinear regression equations (Gompertz, Weibull, Logistic, Brody, Von Bertalanffy and Richards). The best curve was selected by the highest R² and lowest root mean squared error. The Weibull function was the most suitable for all breeds and genders. In general, females reached their adult size earlier, but males were larger. On the one hand, the Moura breed is the most similar to industrial breeds one, possibly because it is reared in fattening systems. On the other hand, the Monteiro breed was a later-developing one. Brazilian pig breeds have different growth patterns, associated with the genetic origin of the breed and its adaptations to environment. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2015
21. Genetic parameters for ultrasound-evaluated carcass and body traits in Anglo-Nubian goats
- Author
-
Figueiredo Filho, L.A.S., Sarmento, J.L.R., Campelo, José E. G., Santos, N.P.S., Sena, Luciano Silva, Torres, T.S., Figueiredo Filho, L.A.S., Sarmento, J.L.R., Campelo, José E. G., Santos, N.P.S., Sena, Luciano Silva, and Torres, T.S.
- Abstract
Background: Meat goat breeding programs should prioritize the identification and selection of genetically superior animals for traits related to meat quality and carcass yield in order to increase the value of the final product. Objective: To estimate (co)variance components and genetic parameters for ultrasound-measured carcass traits, body size and body weight in AngloNubian breed goats raised in the Mid-North region of Brazil. Methods: (Co)variance components and genetic parameters were estimated using the single and two-trait animal model analyses via Bayesian inference for loin eye dimensions (area, length, and depth), sternal fat thickness, rump height, chest circumference and depth, leg perimeter, and body weight. Results: Heritability estimates were higher when two-trait analyses were used. This finding implies that it is possible to recover part of the additive genetic variance included in the residual variance due to the correlation between traits. Genetic correlations between carcass and body size traits showed different magnitudes. On the other hand, genetic correlations between the traits related to muscularity showed high magnitudes. Conclusions: Body weight was not a good indicator of muscularity; therefore, it is not recommended as a criterion for indirect selection to improve carcass traits of Anglo-Nubian goats. Leg perimeter and chest circumference may be important to construct selection indexes in meat goat breeding programs., Antecedentes: programas de melhoramento de caprinos de corte devem priorizar a identificação e seleção de animais geneticamente superiores para características relacionadas à qualidade da carne e rendimento de carcaça, para aumentar o valor ao produto final. Objetivo: estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia, características de tamanho e peso corporal em caprinos da raça Anglo-Nubiana criados na região Meio-Norte do Brasil. Métodos: os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram estimados usando análises uni e bicaracterísticas de um modelo animal via metodologia Bayesiana para área, profundidade e comprimento de olho de lombo, espessura da gordura esternal, altura da garupa, circunferência e profundidade torácica, perímetro da perna e peso corporal. Resultados: as estimativas de herdabilidade obtidas a partir das análises bicaracterísticas foram maiores que as obtidas a partir das análises unicaracterísticas. Esse resultado implica que é possível recuperar parte da variância genética aditiva incluída na variância residual devido à correlação entre as características. As correlações genéticas entre as características de carcaça e as medidas corporais apresentaram magnitudes variáveis. Por outro lado, as correlações genéticas entre as características relacionadas à musculosidade apresentaram altas magnitudes. Conclusões: o peso corporal não se mostrou um bom indicador de muscularidade, de modo que não é recomendado como critério de seleção indireta para melhorar a carcaça de caprinos Anglo-Nubiano. O perímetro de perna e a circunferência torácica podem ser importantes para a construção de índices de seleção em programas de melhoramento de carne caprina., Antecedentes: los programas de mejoramiento de caprinos de carne deben priorizar la identificación y selección de animales genéticamente superiores para características relacionadas con la calidad de la carne y rendimiento de la canal, con el fin de agregar valor al producto final. Objetivo: estimar los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para características de canal obtenidas por ultrasonografía, características de tamaño y peso corporal en caprinos de la raza Anglonubiana, criados en la región medio-norte de Brasil. Métodos: los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos fueron estimados mediante un modelo animal usando análisis uni y bi-carácter vía metodología Bayesiana para las dimensiones del ojo de lomo (área, profundidad y longitud), grosor de la grasa esternal, altura de la grupa, circunferencia y profundidad torácica, perímetro de la pierna y peso corporal. Resultados: las estimativas de heredabilidad obtenidas a partir del análisis bi-carácteristico fueron mayores que las obtenidas a partir del análisis uni-carácteristico. Este supuesto implica que es posible recuperar parte de la variancia genética aditiva incluida en la variancia residual, debido a la correlación entre las características. Las correlaciones genéticas entre las características de canal y las medidas corporales presentaron diferentes magnitudes. Por otro lado, las correlaciones genéticas entre las características relacionadas con musculatura presentaron alta magnitud. Conclusiones: el peso corporal no fue un buen indicador de musculatura; por eso no es recomendado como criterio de selección indirecta para mejorar la canal de caprinos Anglonubianos. El perímetro de la pierna y la circunferencia del pecho pueden ser importantes para la construcción de índices de selección en programas de mejoramiento de carne caprina.
- Published
- 2021
22. Quantitative trait loci mapping for meat quality traits in swine chromosome 6 Mapeamento de locos de características quantitativas no cromossomo 6 de suínos, associados à qualidade da carne
- Author
-
A.V. Pires, P.S. Lopes, S.E.F. Guimarães, C.T. Guimarães, L.A.M. Gomide, A.A. Benevenuto Júnior, and F.M.S. Carmo
- Subjects
QTL ,cruzamento divergente ,genética ,marcador molecular ,melhoramento animal ,outbreed cross ,genetic ,molecular marker ,animal breeding ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
The current study was carried out to perform QTL mapping on swine chromosome 6 (SSC6) associated to meat quality traits. The F2 population was produced by outbreed crossing using two native Brazilian breed Piau boars and 18 commercial sows. A total of 557 F2 animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The traits evaluated on the F2 population were: pH measured 45 minutes and 24 hours post mortem (pH 45, pH24, respectively), drip loss (DL), cooking loss (CL), total loss (TL), intramuscular fat content (IMF), objective tenderness (OT), lightness (L), redness (A), yellowness (B), hue angle (h) and chrome (c). Data were analyzed by multiple regression developed for analysis of outbreed line crosses, using the QTL Express Software. Significant QTL were detected for pH45 and DL traits, and suggestive QTL for DL. QTL were not found for other traits. The pH45 and DL traits may be under the influence of one gene or a gene group located at about 76, 88 and 97cM. More markers should be included in the regions where F-value peaks and suggestive QTL for the DL trait were detected to ascertain whether they are real QTL.Realizou-se o mapeamento de QTL no cromossomo 6 suíno (SSC6), associado às características de qualidade da carne. Um total de 557 animais de uma população F2 foi obtido do cruzamento entre dois machos da raça nativa brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais, cujos genótipos foram obtidos para 13 marcadores microssatélites. As características avaliadas na F2 foram pH, medido 45 minutos e 24 horas post-mortem (pH45 e pH24, respectivamente); perda por gotejamento (DL); perda por cozimento (CL); perda total (TL); gordura intramuscular (IMF); maciez objetiva (OT); luminosidade (L); índice de vermelho (A); índice de amarelo (B); tonalidade de cor (h); e índice de saturação (c). Utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento, por meio do programa QTL Express. Foram detectados QTLs significativos para pH45 e DL, sugestivos para DL, e não foram encontrados QTLs para as demais características. Constatou-se que grupos gênicos, localizados em torno de 76, 88 e 97cM, podem atuar no pH45 e no DL. Nas regiões dos picos da estatística F, onde se verificaram QTLs sugestivos para DL, devem ser incluídos mais marcadores, para confirmar a presença de QTLs.
- Published
- 2005
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23. Pedigree analysis of the racing line Quarter Horse: Genetic diversity and most influential ancestors
- Author
-
Josineudson Augusto Ii de Vasconcelos Silva, António Vicente, Alejandra Maria Toro Ospina, Ricardo Faria, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Escola Profissional Agrícola Quinta da Lageosa, Escola Superior Agrária do Instituto Politécnico de Santarém, and Universidade de Lisboa
- Subjects
0301 basic medicine ,Animal breeding ,biology.animal_breed ,Population ,Cavalo Quarto de Milha ,03 medical and health sciences ,Effective population size ,Inbreeding ,Pedigree chart ,education ,Selection (genetic algorithm) ,Genetic diversity ,education.field_of_study ,General Veterinary ,biology ,0402 animal and dairy science ,04 agricultural and veterinary sciences ,040201 dairy & animal science ,Breed ,Melhoramento animal ,030104 developmental biology ,Quarter horse ,Animal Science and Zoology ,Generation interval ,Demography - Abstract
Made available in DSpace on 2021-06-25T11:14:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2021-05-01 The aims of this study were to evaluate the genetic diversity of the racing line Quarter Horse breed in Brazil and to provide data on the most influential ancestors by pedigree analysis. All horses that had participated in sprint races in Brazil between 1978 and 2016 were evaluated. There were 5,861 athletes horses (2,474 males and 3,387 females) born between 1971 and 2014. These animals were referred to as the racing population (Pr), which was divided into three subpopulations to evaluate three complete decades (84.5% of Pr). These subpopulations consisted of 1,712, 1,604 and 1,461 animals born in the 1980s (sP80), 1990s (sP90) and 2000s (sP00), respectively. The quality of the pedigree was assessed based on the number of complete equivalent generation traced. There were 5.4 (Pr), 4.7 (sP80), 5.7 (sP90) and 6.3 (sP00) generations, which permitted accuracy of the conclusions reported. The generation intervals were long, with 13.2 (sire-son/daughter) and 10.6 (dams-son/daughter) years (Pr). The coefficients of inbreeding and average relatedness were 0.95% and 1.84% for Pr and 1.60% and 2.56% for sP00, respectively. In Pr and sP00, the effective population size (Ne) based on ΔFi was 215 and 144, respectively, with 68 and 41 animals per generation. The probability of gene origin given by the effective number of founders (fe), ancestors (fa) and founder genome equivalents (fge) was 192, 61 and 34, respectively, for Pr, with considerable losses of genetic diversity over the last decades evaluated. The number of ancestors (founders or not) that explained the total genetic diversity was 1,587. This number is considered high; however, only 32 and 9 ancestors explained 50% of the genetic diversity of Pr and sP00, respectively. The 10 most influential ancestors of sP00 explained 52.2% of the total genetic diversity. The loss of genetic diversity and concentration in a reduced number of breeding animals indicate failures in the breeding and conservation programs of the racing line. Mating designs in conjunction with the selection of breeding animals should be promoted and goals should be defined for racing line of the Quarter Horse breed in Brazil. Universidade Estadual Paulista (Unesp) Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Escola Profissional Agrícola Quinta da Lageosa, Apartado 32 Escola Superior Agrária do Instituto Politécnico de Santarém, Apartado 310 CIISA - Faculdade de Medicina Veterinária Universidade de Lisboa Universidade Estadual Paulista (Unesp) Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia Universidade Estadual Paulista (Unesp) Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Universidade Estadual Paulista (Unesp) Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia
- Published
- 2021
24. Avaliação de métodos de estimação de componentes de variância utilizando dados simulados Evaluation of the variance component estimation methods using simulate data
- Author
-
José Marques Carneiro Júnior, Ricardo Frederico Euclydes, Paulo Sávio Lopes, and Robledo de Almeida Torres
- Subjects
componentes de variância ,estimação ,melhoramento animal ,simulação ,variance components ,methods ,animal breeding ,simulation ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de realizar análise comparativa entre os métodos de estimação de componentes de variância: método da máxima verossimilhança restrita (REML), método da máxima verossimilhança (ML) e método III de Henderson. Todos os três métodos foram utilizados com modelo reprodutor, e o método REML foi utilizado também com modelo animal. Objetivou-se verificar, principalmente, o efeito do desbalanceamento na estimação dos componentes de variância. Foi simulado um genoma, constituído de uma única característica quantitativa governada por 200 locos. O genoma foi utilizado na construção de três populações-base com herdabilidades de 0,60, 0,30 e 0,10, constituídas de 1000 animais (500 machos e 500 fêmeas). A partir de cada população-base, foram produzidas as populações iniciais. Cada população inicial foi submetida a acasalamento ao acaso, que deu origem a quatro populações para cada herdabilidade estudada. Para o estudo comparativo entre os métodos, foram introduzidos nas populações diferentes tipos e níveis de desbalanceamento. Para população com alta herdabilidade e dados totalmente balanceados, os três métodos, empregados como modelos reprodutores, apresentaram resultados semelhantes entre si, e para populações com baixa herdabilidade, o método REML, utilizado como modelo animal, mostrou resultados mais próximos do valor verdadeiro para a variância genética aditiva. Os desbalanceamentos provocados não afetaram a estimação dos componentes de variância pelos métodos; as diferenças observadas foram conseqüências dos níveis de herdabilidade. O método REML, como modelo animal, pode ser considerado o mais apropriado para estimar componentes de variância para características de baixa herdabilidade.Studies on simulation were carried out aiming to achieve a comparative analysis between the following variance component estimation methods: Restrict Maximum Likelihood (REML), Maximum Likelihood (ML) and Method III of Henderson. All of them were used as a reproducer model, and the REML method was also used as a animal model. The main objective was to verify the effect of the unbalanced data on the estimation of the variance components. A genomic, made of a single quantitative characteristic, ruled by 200 loci was simulated. The genomic was used in the construction of three base-populations with heritability of 0.60, 0.30 and 0.10, constituted by 1000 animals (500 males and 500 females). From each base-population, it was constructed the initial populations. Each initial population was submitted to the mating at random, that producing four populations for each heritabilities studied. For a comparative study of the methods, different kinds and levels of unbalanced were introduced in the populations. For the population with high heritability and fully balanced data, the three methods, used as a reproducer models, presented similar results among themselves. For populations with low heritability, the REML method, used as an animal model, presented results closer to the real value for the additive genetic variance. The induced unbalanced data did not affect the estimation of the variance components by the methods. The differences observed were a consequence of the heritability levels. The REML method, as an animal model, could be considered the most appropriate to estimate the variance components for traits of low heritability.
- Published
- 2004
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25. Estimativas de Parâmetros fenotípicos e ambientes das Produções de Leite no Dia do Controle e em 305 Dias de Lactação em vacas da Raça Gir Estimates of phenotypic and environmental parameters of milk production at the control day and 305 days of lactation in gir breed cows
- Author
-
Ivan Luz Ledic, Rui da Silva Verneque, and Mário Luiz Martinez
- Subjects
Bovino de leite ,controle leiteiro ,melhoramento animal ,Animal breeding ,dairy cattle ,milking control ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
Dados de 32.779 controles mensais, de 3.605 lactações em 305 dias (PL305), de 2.082 vacas Gir, filhas de 281 touros, com partos ocorridos de 1987 a 1999, em 11 rebanhos, foram usados com o objetivo de verificar os fatores que afetam a produção de leite no dia do controle (PLDC) em avaliações na raça Gir. Foram realizadas análises univariadas das PLDC1 a PLDC10 e da PL305 pelo método de máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal, incluindo as três primeiras lactações como medidas repetidas de um mesmo animal, diferenciado conforme o rebanho, o ano e a estação do parto (PL305) ou do controle (PLDC1 a PLDC10), a idade da vaca ao parto, a ordem do parto e do intervalo parto-primeiro controle (ipc) na PLDC1. As médias observadas e os respectivos desvios-padrão (kg) para PLDC1 a PLDC10 e PL305 foram: 11,97±4,64; 11,93±4,68; 10,98±4,40; 10,18±4,12; 9,66±3,88; 9,20±3,69; 8,63±3,51; 8,08±3,33; 7,59±3,27; 7,22±3,15 e 2.746,17±1.299,90. A produção máxima ocorreu no 23° dia, conforme o ipc. Ocorreu grande variação em relação ao ano e estação, conforme a característica considerada, sem haver tendência definida. As diferenças entre as produções dos rebanhos foram acima de 50%. Nos primeiros quatro controles, as produções foram muito afetadas pela idade da vaca e as vacas com idade entre 70 a 100 meses apresentaram produções mais elevadas; na PL305, a produção aumentou até 88 meses de idade. As produções de leite das terceiras ordens foram mais altas em relação aos do segundo e primeiro partos, com diferenças acima de 11%.Data of 32,779 monthly milk production, of 3,605 lactations in 305 days (PL305), of 2,082 Gir breed cows, daughters of 281 sires, calving from 1987 to 1999, in 11 herds, were utilized to verify the factors that affect the milk production in the control day (PLDC) in evaluations of the Gir breed. Univariates analysis on PLDC1 to PLDC10 and Pl305 were performed utilizing the restricted maximum likelihood method within an animal model, which included the three first lactations as replicate measures of the same dams unit. Animals were grouped according to the criterion of herd, year, season, calving-age, calving-order and to the interval calving-first control (ipc) in PLDC1. The observed averages (kg) and the respective standard deviations for PLDC1 at PLDC10 and PL305 were: 11.97±4.64; 11.93±4.68; 10.98±4.40; 10.18±4.12; 9.66±3.88; 9.20±3.69; 8.63±3,51; 8.08±3.33; 7.59±3.27; 7.22±3.15 and 2,746.17±1,299.90. The maximum production happened on 23° day, according to the ipc. There was greater variation in relation to the year and season, according to the considered trait, without defined trend. The differences among the herds productions were above 50%. In the first four controls the productions were extremely affected by calving-age and the cows with age between 70 to 100 months presented higher productions; in the PL305 the production increased up to 88 months of age. The milk productions of the third calving-order were higher them the second and first calving, with difference above 11%.
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- 2003
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26. Avaliação genética de touros da raça Gir para produção de leite no dia do controle e em 305 dias de lactação
- Author
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Ivan Luz Ledic, Rui da Silva Verneque, Lenira El Faro, Humberto Tonhati, Mário Luiz Martinez, Mauro Dal Secco de Oliveira, Cláudio Nápolis Costa, Roberto Luiz Teodoro, and Leonardo de Oliveira Fernandes
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bovino de leite ,controle leiteiro ,melhoramento animal ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Dados de 32.779 controles mensais, de 3.605 lactações em 305 dias (PL305), de 2.082 vacas Gir, filhas de 281 touros, com partos ocorridos de 1987 a 1999 em 11 rebanhos, foram usados com o objetivo de verificar a viabilidade de utilização da produção de leite no dia do controle (PLDC) em avaliações genéticas de touros da raça Gir. Foram realizadas análises univariadas das PLDC1 a PLDC10 e da PL305 pelo método de máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal, incluindo as três primeiras lactações como medidas repetidas de um mesmo animal, diferenciados conforme o grupo contemporâneo de rebanho-ano-estação, de acordo com a idade da vaca ao parto e, do intervalo parto-primeiro controle na PLDC1. As médias observadas e os respectivos desvios-padrão (kg) para PLDC1 a PLDC10 e PL305 foram: 11,97±4,64; 11,93±4,68; 10,98±4,40; 10,18±4,12; 9,66±3,88; 9,20±3,69; 8,63±3,51; 8,08±3,33; 7,59±3,27; 7,22±3,15 e 2.746,17±1.299,90. As estimativas de herdabilidade para as PLDC1 a PLDC10 foram de 0,26; 0,19; 0,18; 0,20; 0,15; 0,13; 0,14; 0,10; 0,11 e 0,10, respectivamente; para a PL305 foi de 0,18. As correlações de ordem dos valores genéticos preditos de 281 touros, obtidos entre as PLDC e a PL305, foram altas, oscilando de 0,85 a 0,94. O percentual de coincidência de touros que seriam selecionados pelos valores genéticos preditos das PLDC2 a PLDC5 foram acima de 80%, a partir de 5% dos melhores classificados pela PL305. Em algumas PLDC o nível de coincidência de classificação dos touros com a PL305 foi muito baixo.
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- 2002
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27. Uso da Técnica do Micro-Hematócrito para Predição do Peso Corporal e de Características Reprodutivas em Frangos de Corte
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Millor Fernandes do Rosário, Vicente José Maria Savino, Antonio Augusto Domingos Coelho, Marco Aurélio Neves da Silva, and Edmilson Martins
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ascite ,eritrócito ,genótipo ,melhoramento animal ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
O hematócrito é uma metodologia indireta utilizada no monitoramento da síndrome ascítica que poderia ser utilizada também para avaliar o peso corporal e características reprodutivas em frangos de corte. Objetivou-se com este trabalho avaliar a técnica do micro-hematócrito em relação ao peso corporal e características reprodutivas (fertilidade, eclodibilidade e nascimento) visando sua utilização pelos programas de melhoramento genético. Dois grupos contrastantes foram constituídos, baseados na seleção fenotípica de 630 reprodutores de 18 genótipos para a característica hematócrito. Progênies das aves selecionadas, 74 pintos não sexados (40 do grupo de hematócrito alto e 34 do grupo baixo) foram criados com manejo convencional. Os pesos corporais e os valores de hematócrito foram mensurados aos 14 e 42 dias de idade. Para avaliar as características reprodutivas, ovos de 42 matrizes (22 do grupo alto e 20 do baixo) foram incubados. As médias foram estimadas utilizando-se um modelo linear com o efeito fixo do grupo genético. Os pintos do grupo baixo apresentaram as maiores médias de peso corporal (305,59 e 1387,06 g), diferindo dos pintos do grupo alto os quais apresentaram médias de peso de 243,56 e 1128,11 g aos 14 e 42 dias de idade, respectivamente. Também para o valor do hematócrito os grupos diferiram significativamente. Para as características reprodutivas, não se verificou diferenças significativas entre os grupos, sendo as médias gerais para fertilidade de 93,8 e 94,9%, para eclodibilidade de 98,2 e 93,9% e para nascimento de 89,3 e 82,4%, respectivamente, para alto e baixo hematócrito. Concluiu-se que a técnica do micro-hematócrito pode ser empregada para avaliação do peso corporal, mas não para características reprodutivas.
- Published
- 2002
28. Análise da eficiência dos acasalamentos otimizados na obtenção de progresso genético em um rebanho bovino da raça nelore
- Author
-
Cássio Vinícius Vieira, Willian Bruno Fernandes de Andrade, Carina Ubirajara de Faria, Natascha Almeida Marques da Silva, and Raysildo Barbosa Lôbo
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Melhoramento Animal ,Agriculture ,Biology (General) ,QH301-705.5 - Abstract
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência dos acasalamentos otimizados na obtenção de progresso genético em um rebanho bovino da raça Nelore. Foram avaliados valores genéticos de 7.664 animais, filhos de 179 touros e 2.977 vacas, provenientes de um criatório participante do Programa Nelore Brasil da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). Para a análise da eficiência dos acasalamentos otimizados considerou-se as predições das DEPs (Diferença Esperada na Progênie) de características de reprodução e crescimento, de animais nascidos no período de 2000 a 2009, distribuídos em três cenários reais: (I) animais oriundos de acasalamentos baseados em aspectos morfológicos e raciais (safras 2000 a 2002); (II) animais oriundos de acasalamentos baseados em aspectos morfológicos e raciais, mas com a seleção prévia dos reprodutores orientada pelas DEPs e ascendência genealógica (safras 2003 a 2007); (III) animais oriundos de acasalamentos otimizados, utilizando o software PAG Gestão Genética®, pelo qual se relacionam os reprodutores melhores indicados para cada reprodutriz, priorizando as DEPs (safras 2008 e 2009). Foi constatado maior ganho genético para a maioria das características analisadas, quando utilizado o software PAG Gestão Genética®, confirmando a estratégia de acasalamento otimizado como eficiente ferramenta para aumentar o número de animais geneticamente superiores, acelerando o progresso genético dentro do rebanho.
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- 2014
29. A raça Crioula Lageana: por que preservá-la?
- Author
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Veiga, Thiago Filipe, de Quadros, Sérgio Augusto Ferreira, Martins, Edison, and Improta, Clóvis Thadeu Rabello
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melhoramento animal - Published
- 2021
30. EFEITO DE DIFERENTES MODELOS SOBRE AS ESTIMATIVAS DE (CO)VARIÂNCIAS E PARÂMETROS GENÉTICOS PARA PESOS ATÉ A DESMAMA EM GADO NELORE
- Author
-
Lillian Pascoa, Arcadio de los Reyes, Mauricio A. Elzo, Jorge Luiz Ferreira, Luiz A.F. Bezerra, and Raysildo Barbosa Lobo
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Melhoramento animal ,Agriculture ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Com o objetivo de se comparar o ajustamento de modelos com diferentes definições de grupos contemporâneos sobre as estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos para pesos padronizados e reais aos 120 e 210 dias de idade, analisaram-se dados de 72.731 bezerros Nelore, machos e fêmeas, nascidos de 1985 a 2005 em 40 rebanhos integrantes do PMGRN - Nelore Brasil. Foram comparados quatro modelos incluindo diferentes estruturas de grupos contemporâneos (CG), julgados pelos critérios de informação de Akaike, Bayesiano e modificado de Akaike. As estimativas foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas. As estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos foram similares entre os modelos, porém os critérios de informação (BIC, CAIC) indicaram que o modelo mais adequado é o que considera o grupo contemporâneo como efeito aleatório, sendo este constituído pela concatenação dos efeitos de rebanho, ano de nascimento, grupo de manejo e efeito sazonal de trimestre de nascimento, e com efeito do sexo do bezerro independente do CG. PALAVRAS-CHAVE: critérios de informação; gado de corte; grupos contemporâneos.
- Published
- 2013
31. CARACTERÍSTICAS BIOMÉTRICAS TESTICULARES EM CARNEIROS SANTA INÊS SUBMETIDOS A DIFERENTES REGIMES DE SUPLEMENTAÇÃO PROTÉICA E TRATAMENTOS ANTI-HELMÍNTICOS
- Author
-
Helder Louvandini, Concepta McManus, Rodrigo Duarte Martins, Carolina Madeira Lucci, and Patrícia Spoto Corrêa
- Subjects
Melhoramento Animal ,Agriculture ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Para avaliar as características biométricas testiculares de carneiros da raça Santa Inês, 24 cordeiros machos, inteiros, com peso médio inicial de 24,5 kg ± 2,88, aos quatro meses de idade, foram distribuídos em quatro tratamentos: APv (animais vermifugados + concentrado com alta proteína), APn (animais não-vermifugados + concentrado com alta proteína), BPv (animais vermifugados + concentrado com baixa proteína), BPn (animais não vermifugados + concentrado com baixa proteína) durante 8 meses e meio. Antes do abate, realizaram-se as medições testiculares in situ: perímetro escrotal (PE), comprimento (COMP), largura testicular (LARG) e a forma dos testículos, bem como o volume testicular (cilindro e prolato esferóide). Após o abate, determinaram-se o volume testicular real (VOLR), o comprimento (COMPV) e a largura testicular (LARGV). Observou-se que os testículos dos animais eram simétricos e que o uso do paquímetro é uma forma altamente confiável para se realizar as medições testiculares in situ. O formato dos testículos afetou diretamente seu volume. O valor médio das equações do prolato esferóide e cilíndrica é a forma mais acurada para se estimar o volume testicular real em ovinos Santa Inês. O alto teor de proteína da dieta e o tratamento antiparasitário possibilitaram uma melhoria do peso corporal dos ovinos, sendo o principal fator de variação para as características biométricas testiculares. PALAVRAS-CHAVES: Biometria testicular, dieta, forma testicular, ovino, volume testicular.
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- 2008
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32. EFEITO DA INTERAÇÃO GENÓTIPO X SISTEMA NUTRICIONAL SOBRE A COMPOSIÇÃO REGIONAL E TECIDUAL
- Author
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Roberta Rollemberg Cabral Martins, Nelson Manzoni de Oliveira, José Carlos da Silveira Osório, and Maria Teresa Moreira Osório
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Melhoramento animal ,Agriculture ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Com o objetivo de avaliar os efeitos isolados de genótipo e de sistema nutricional, bem como o da interação genótipo x sistema nutricional sobre aspectos quantitativos e qualitativos da produção de carne ovina, utilizaram-se 60 cordeiros da raça Ideal e 51 da raça Corriedale, nascidos no mês de agosto e setembro, criados em três sistemas diferentes de alimentação (campo natural, pastagem cultivada e confinamento) e abatidos com 122 dias de idade. Os animais foram pesados antes do abate e de suas carcaças obteve-se o peso da carcaça fria, da paleta, da perna, do costilhar e do pescoço e, por cálculo, percentagem de paleta, da perna, do costilhar e do pescoço. A paleta e a perna foram desossadas e destes cortes obtiveram-se o peso de osso, músculo e gordura e, por cálculo, a percentagem desses tecidos. Desenvolveu-se o experimento em um delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3x2 (sistemas nutricionais e genótipos). Houve interação genótipo-nutrição (P
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- 2008
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33. Classificação de características produtivas fenotípicas de diferentes raças de poedeiras através da mineração de dados.
- Author
-
Becker Ferreira, Priscila, Martinez do Vale, Marcos, Macedo, Andre, Shroder Boemo, Lenise, Nogara Rorato, Paulo Roberto, and Barbosa Beck, Tamiris
- Subjects
- *
ZOOLOGY , *PLYMOUTH Rock chicken , *PHENOTYPES , *DATA mining , *POULTRY breeds - Abstract
The study was conducted with the database obtained from the Breeding Program of Brown Egg Laying Hens of the Poultry Laboratory (LAVIC) of the Department of Animal Science of the Federal University of Santa Maria (UFSM), where it is used poultry breeds such as White Plymouth Rock (PRW), Barred Plymouth Rock (PRB) e Red Rhode Island (RIR). The data used referred to two generations of these three breeds during the first production cycle of 2009 and 2010. The parameters evaluated were: weekly rate of egg laying, egg weight and body weight. The research was divided into two approaches of analysis, the first being performed with the production data, aiming to identify critical points of phenotypic selections related to zootechnical characterization, and the second approach consisted in the association of the same production parameters together with the weather data of Santa Maria - RS. The data was analyzed using the Data Mining technique, using the classification task by building the decision tree with the J48 algorithm. The data mining indicated the average rate of egg laying at 25 weeks of age and the average weight of eggs at 33 weeks of age, and pointed these as the main variables related to the differentiation of breeds studied, (accuracy of 83.3%). On the second approach, the decision trees obtained showed accuracy between 88% and 91%, suggesting a strong association between the environmental variables and the production performance of the birds. The PRW breed is more sensitive to heat than the RIR and the PRB breed and they showed a higher rate of production during the pre-peak phase. The data mining allowed to classify the productivity of the brown egg laying hens, which may indicate environmental influences on the phenotype of the different breeds studied. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2013
34. Biotecnologia animal.
- Author
-
COUTINHO, LUIZ LEHMANN and ROSÁRIO, MILLOR FERNANDES DO
- Published
- 2010
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35. Importância das provas de avaliação a campo e de eficiência alimentar para o melhoramento dos rebanhos
- Author
-
COLLARES, R. S., SUÑÉ, R. W., YOKOO, M. J. I., LEAL, J. J. B., CARDOSO, F. F., ROBERTO SILVEIRA COLLARES, CPPSUL, RENATA WOLF SUNE MARTINS DA SILVA, CPPSUL, MARCOS JUN ITI YOKOO, CPPSUL, JOAL JOSE BRAZZALE LEAL, CPPSUL, and FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL.
- Subjects
Melhoramento Animal ,Performance ,Progênie ,Seleção ,Análise - Abstract
A Embrapa Pecuária Sul em parceria com a Associação Brasileira de Hereford e Braford ? ABHB vem, há vários anos, desenvolvendo ferramentas tecnológicas, para que criadores de gado de corte do Sul do Brasil tomem decisões mais precisas no melhoramento genético dos seus rebanhos...
- Published
- 2019
36. Fatores que influenciaram o sucesso da inseminação artificial, com sémen refrigerado, numa população ovina constituída por Merinas Pretas e Merinas Brancas
- Author
-
Dias, João Guilherme Marchezim de Oliveira and Bettencourt, Carlos Manuel Varela, orient.
- Subjects
ANIMAL BREEDING ,MELHORAMENTO ANIMAL ,REPRODUCTIVE MANAGEMENT ,VETERINÁRIA ,REPRODUÇÃO ANIMAL ,SÉMEN REFRIGERADO ,MESTRADO INTEGRADO EM MEDICINA VETERINÁRIA ,COOLED SEMEN ,SHEEP ,ARTIFICIAL INSEMINATION ,INSEMINAÇÃO ARTIFICIAL ,VETERINARY MEDICINE ,ANIMAL GENETIC IMPROVEMENT ,MANEIO REPRODUTIVO ,OVINOS - Published
- 2019
37. Canonical correlation analysis applied to production and reproduction traits of meat type quails
- Author
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Aline Camporez Crispim, Jeferson Corrêa Ribeiro, Giovani da Costa Caetano, Robledo de Almeida Torres, Luciano Pinheiro da Silva, and Rodrigo de Oliveira Pacheco
- Subjects
0301 basic medicine ,Animal breeding ,media_common.quotation_subject ,Biology ,Body weight ,Canonical analysis ,lcsh:Agriculture ,Produção de ovos ,03 medical and health sciences ,Animal science ,Pares canônicos ,Production (economics) ,Sexual maturity ,Análise multivariada ,lcsh:Agriculture (General) ,melhoramento animal ,media_common ,análise multivariada ,lcsh:S ,0402 animal and dairy science ,animal breeding ,egg production ,04 agricultural and veterinary sciences ,Anatomy ,pares canônicos ,canonical pairs ,lcsh:S1-972 ,040201 dairy & animal science ,Melhoramento animal ,multivariate analysis ,030104 developmental biology ,Coturnix coturnix ,embryonic structures ,Reproduction ,produção de ovos ,Canonical correlation - Abstract
Data from 629 meat type quails were used to study association between two different sets of traits: egg production and reproduction. Traits related to reproduction were: body weight at 42 days (W42), average egg weight (AEW), age at sexual maturity (ASM); and production traits: number of eggs produced from 42 until 182th day considering intervals of 35 days each period (P1, P2, P3 and P4). Canonical correlations were used to describe the association between these two sets of traits. The canonical coefficients indicated that egg production and reproductive traits were moderately related (0.3475). The first partial period of production (P1) and age at sexual maturity were the most relevant traits among the analyzed variables. Results show that selecting animals with lower age at sexual maturity might lead to an increase on number of eggs produced until 77 days, although it might also lead to a decrease on egg weight. Breeding programs aiming to improve quails production should consider selection strategies to decrease age at sexual maturity and then, as correlated response, increased egg production might be observed. Dados de 629 matrizes de codornas de corte foram utilizados para estudar a associação entre características de reprodução e produção de ovos. As características analisadas foram: peso corporal aos 42 dias (W42), peso médio de ovos (AEW) e idade à maturidade sexual (ASM), que compôs as características reprodutivas; e números de ovos produzidos a partir do 42o dia, divididos em intervalos de 35 dias cada (P1, P2, P3 e P4), que integrou o grupo de características de produção. Para análise de associação, foi utilizada a análise de correlação canônica entre os dois conjuntos de características. Os coeficientes canônicos indicaram que os conjuntos de características de produção de ovos e reprodutivas são dependentes, correlacionando-se moderadamente (0,3475). Entre as variáveis avaliadas, o primeiro período parcial de produção de ovos e a idade à maturidade sexual foram as mais importantes. Os resultados indicam que a seleção para menor idade à maturidade sexual resultaria em aumento no número de ovos produzidos até 77 dias de idade, embora essa seleção possa resultar em diminuição do peso de ovo. Conclui-se que a seleção de aves deve ser efetuada para menor maturidade sexual, pois, assim, estará selecionando também aves para maior produção de ovos.
- Published
- 2016
38. Estudo de características morfométricas em equinos Mangalarga Marchador por meio de modelo animal e componentes principais
- Author
-
Suzana Maruch, Adalgiza Souza Carneiro de Rezende, Fabio Luiz Buranelo Toral, and Maria Dulcinéia da Costa
- Subjects
Mangalarga ,Analise multivariada ,Ciência Animal ,Melhoramento animal - Abstract
Nesta tese, foram desenvolvidos dois trabalhos com os objetivos de avaliar a evolução genética para características morfométricas, determinar quais destas medidas mais explicam a variabilidade fenotípica e verificar como a utilização dessas pode afetar a resposta esperada a seleção em equinos Mangalarga Marchador. Foram utilizados dados de 38.341 animais, nascidos entre os anos de 1987 a 2012, e uma matriz de parentesco com 77.719 animais. No primeiro trabalho, para estimação dos parâmetros e valores genéticos foram avaliadas 12 características morfométricas sendo, altura na cernelha (AC); altura na garupa (AG); comprimento de cabeça (CCA); comprimento de corpo (CCO); comprimento de espádua (CE); comprimento de garupa (CG); comprimento de pescoço (CP); comprimento de dorso lombo (DL); largura de cabeça (LC); largura de garupa (LG); perímetro de canela (PC); perímetro de tórax (PT). Foram estimadas tendências genéticas para cada característica onde o valor genético foi regredido em função do ano de nascimento. As herdabilidades foram altas e variaram de 0,48 a 0,65. Os coeficientes de variação aditivos foram baixos e variaram de 1,61% a 5,23%. As tendências genéticas de 11 das 12 características avaliadas foram significativas, evidenciando pequenos ganhos para as características ao longo do período avaliado. As herdabilidades para as características morfométricas para a raça Mangalarga Marchador foram altas, em contrapartida a variabilidade e as tendências genéticas foram baixas, indicando que a seleção pode ser praticada para essas características, mas os ganhos efetivos serão baixos. Uma vez que os dados morfométricos são amplamente utilizados na seleção fenotípica de equinos, torna-se importante avaliar geneticamente tais características, que indicam possibilidade de obter-se ganhos genéticos selecionando para as mesmas. No segundo trabalho as características fenotípicas foram submetidas à análise de componentes principais e posteriormente a eliminação das variáveis com autovalor abaixo de 0,70 foi realizada a avaliação genética por meio de um modelo multicaracterístico com seis 5 características que mantidas por apresentar maior capacidade em explicar a variância total observada, sendo estas AG, CG, CP, DL, LC e LG. Uma segunda análise multicaracterística em que as 12 características foram agrupadas duas a duas e analisadas por meio do modelo foi realizada afim de validar os resultados da análise multivariada em selecionar variáveis que, de fato, devem ser utilizadas como critérios de seleção em delineamentos de programas de melhoramento de equinos Mangalarga Marchador. Por meio da análise multivariada verificou-se que seis autovalores foram inferiores a 0,70, indicando que este é o número de variáveis a serem descartadas no modelo. Após a exclusão das variáveis, as características que permaneceram no modelo foram capazes de explicar 80,04% da variabilidade total observada. As médias à posteriori das herdabilidades obtidas por meio do modelo multicaracterístico com seis características foram iguais a AG (0,48), CG (0,32), CP (0,29), DL (0,38), LC (0,36) e LG (0,30). As correlações genéticas estimadas por este mesmo modelo variaram de baixas a moderadas e de modo geral, as correlações residuais e fenotípicas variaram de baixas a moderadas. As herdabilidades obtidas por meio do modelo multicaracterístico com duas características foram de baixas a moderadas. As correlações genéticas foram altas entre AC e AG, entre CCO e AC e entre CCO e AG. Verificou-se que, por meio da análise de componentes principais é possível selecionar as medidas morfométricas mais representativas para a raça Mangalarga Marchador. Dessa maneira a avaliação genética dos animais não necessita de ser realizada com todas as características e tornando a seleção mais eficiente. In this thesis, two studies were developed to evaluate the genetic evolution for morphometric traits, to determine which of these measures most explain the phenotypic variability and to verify how the use of these can affect the expected response to selection in Mangalarga Marchador equines. Data from 38,341 animals, born between 1987 and 2012, and a relationship matrix with 77,719 animals were used. In the first work, for the estimation of genetic parameters and values, 12 morphometric traits were evaluated, being height at withers (AC); height at croup (AG); head length (CCA); body length (CCO); shoulder length (CE); croup length (CG); neck length (CP); back and loin length (DL); head width (LC); croup width (LG); perimeter of cannon bone (PC); perimeter of thorax (PT). Genetic trends were estimated for each trait where the genetic value was regressed according to the year of birth. The heritabilities were high and ranged from 0.48 to 0.65. The additive coefficients of variation were low and ranged from 1.61% to 5.23%. The genetic trends of 11 of the 12 traits evaluated were significant, evidencing small gains for the traits during the evaluated period. The heritabilities for the morphometric traits for the Mangalarga Marchador breed were high, in contrast the variability and the genetic tendencies were low, indicating that the selection can be practiced for these traits, but the effective gains will be low. Since morphometric data are widely used in the phenotypic selection of equines, it is important to genetically evaluate these traits, which indicate the possibility of obtaining genetic gains by selecting them. In the second study the phenotypic traits were submitted to the analysis of main components and later the elimination of the variables with eigenvalues below 0.70, the genetic evaluation was performed by means of a multi-character model with six traits that were maintained due to their greater capacity to explain the variance being AG, CG, CP, DL, LC and LG. A second multivariate analysis in which the 12 traits were grouped two by two and analyzed through the 7 model was performed in order to validate the results of the multivariate analysis in selecting variables that, in fact, should be used as selection criteria in program designs improvement of equine Mangalarga Marchador. Through the multivariate analysis it was verified that six eigenvalues were less than 0.70, indicating that this is the number of variables to be discarded in the model. After excluding the variables, the traits that remained in the model were able to explain 80.04% of the total variability observed. The averages a posteriori of the heritabilities obtained through the multi-character model with six traits were equal to AG (0.48), CG (0.32), CP (0.29), DL (0.38), LC (0, 36) and LG (0.30). Genetic correlations estimated by this same model ranged from low to moderate and, in general, residual and phenotypic correlations ranged from low to moderate. The heritabilities obtained through the multi character model with two traits were low to moderate. Genetic correlations were high between AC and AG, between CCO and AC and between CCO and AG. It was verified that, through the analysis of main components, it is possible to select the most representative morphometric measurements for the Mangalarga Marchador breed. In this way the genetic evaluation of the animals does not need to be performed with all the traits and making the selection more efficient.
- Published
- 2018
39. Polimorfismos nos genes MYOD1, MYF5, MYF6, MIOG E MIOST e seus efeitos sobre qualidade de carne em ovinos Santa Inês
- Author
-
Sousa Júnior, Luis Paulo Batista, Pinto, Luis Fernando Batista, Mourão, Gerson Barreto, Costa, Raphael Bermal, and Camargo, Gregório Miguel Ferreira de
- Subjects
Medicina Veterinária ,Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos ,Zootecnia ,Biotecnologia ,Genética ,Marcadores moleculares ,Sequenciamento genético ,Melhoramento animal - Abstract
Submitted by Emanoel Martins Filho (emanoelfilho@ufba.br) on 2020-04-07T10:54:54Z No. of bitstreams: 1 S725p.pdf: 1212544 bytes, checksum: 592e01b6929cae259111d591e8bfdcff (MD5) Approved for entry into archive by Setor de Periódicos (per_macedocosta@ufba.br) on 2020-04-07T22:54:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 S725p.pdf: 1212544 bytes, checksum: 592e01b6929cae259111d591e8bfdcff (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-07T22:54:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 S725p.pdf: 1212544 bytes, checksum: 592e01b6929cae259111d591e8bfdcff (MD5) CONS NAC DE DESENVOLVIMENTO CIENTIFICO E TECNOLOGICO - CAPES O objetivo desta pesquisa foi identificar, em até 192 ovinos Santa Inês, polimorfismos nos genes MyoD1 (Diferenciador Miogênico 1), MyoG (Miogenina), MyF5 (Fator Miogênico 5), MyF6 (Fator Miogênico 6) e MSTN (Miostatina) e verificar se estão associados a características que evidenciam qualidade de carne. Amostras de longissumos dorsi de cada animal foram avaliadas para pH pós-abate (pH0) e 24 horas pós-abate (pH24), intensidades de luminosidade (L*), vermelho (a*) e amarelo (b*), capacidade de retenção de água (CRA) e força de cisalhamento da carne. Amostras de DNA foram extraídas e procedeu-se o sequenciamento de fragmentos contendo 2.428, 1.836, 2.813, 1,150, and 2.575 pares de base nos genes MyoD1, MyoG, MyF5, MyF6 e MSTN, respectivamente. Nas regiões sequenciadas foram identificados 59, 24, 51, 4 e 10 polimorfismos, respectivamente. Os SNPs g.34302419T>G e g.34303049G>T do gene MyoD1, g.197088C>T, g.197660G>A, g.197710A>G e g.197845C>G do gene MyoG, g.116445837T>G do gene MyF6 e g.118141035G>A do gene MSTN apresentaram ao menos efeito aditivo sugestivo (P < 0,05) para as características aqui analisadas. Os SNPs g.34302419T>G no gene MyoD1 e g.197088C>T no gene MyoG apresentaram efeito significativo ao nível da correção de Bonferroni para força de cisalhamento e a*, respectivamente. Portanto, SNPs na família MyoD e no gene MSTN podem fornecer informações úteis para seleção de ovinos da raça Santa Inês, visando a melhoria da qualidade de carne. This study aimed to identify polymorphisms in the MyoD1 (myogenic differentiation 1), MyoG (myogenin), MyF5 (myogenic factor 5), MyF6 (myogenic factor 6) and MSTN (myostatin) genes and testing association with meat quality traits in 192 Santa Ines sheep. Longissumos muscle samples of each animal were evaluated for pH post-slaughter (pH0) and pH 24 hours post-slaughter (pH24), luminosity (L*), red (a*) and yellow (b*) Minolta parameters, water holding capacity (WHC) and meat shear force. We sequenced a target area containing 2,428, 1,836, 2,813, 1,150, and 2,575 base pairs in the MyoD1, MyoG, MyF5, MyF6 and MSTN genes, respectively, and 59, 24, 51, 4 and 10 polymorphisms were identified, respectively. The SNPs g.34302419T>G and g.34303049G>T (MyoD1), g.197088C>T, g.197660G>A, g.197710A>G and g.197845C>G (MyoG), g.116445837T>G (MyF6), and g.118141035G>A (MSTN) had at least suggestive additive effect (P < 0.05) for the meat traits analyzed. The SNPs g.34302419T>G (MyoD1) and g.197088C>T (MyoG) had significant effect at the Bonferroni level for shear force and a*, respectively. Therefore, SNPs in the MyoD family genes and in the MSTN gene might provide useful information in the marker-assisted selection of Santa Ines sheep for the improving meat quality traits. Keyword: biotechnology;genetics;molecular markers;animal breeding;sequencing
- Published
- 2017
40. Heterose em suínos na fase de aleitamento
- Author
-
José Bento Sterman Ferraz and Francisco Alberto de Moura Duarte
- Subjects
Cruzamentos (suínos) ,Melhoramento animal ,Genética (heterose) ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Visando avaliar o ganho de produtividade, advindo da heterose, no peso de suínos em fase de aleitamento, analisaram-se os pesos ao nascimento(PO), 21 dias de idade (P21) e desmama (PD) de 746leitões, sendo 201 da raça Landrace, 136 Wessex-Saddleback e 409 mestiços, pelo método dos quadrados mínimos, considerando-se, ainda, os efeitos fixos de época e ano de nascimento, ordem do parto, sexo do leitão e tamanho da leitegada, além de raças paterna e materna e suas interações. Os efeitos não genéticos tiveram influência significativa em quase todas as características. Os mestiços mostraram, em geral, pesos superiores aos puros, com estimativas de heterose de 2,6% para PO, 9,7% para P21 e 13,9% para PD, indicando a importância da herança não aditiva à medida que os leitões ficam menos dependentes de suas mães. Os efeitos de interação entre as raças paterna e materna foram cada vez maiores com o avançar da idade. Os resultados indicam haver ganho de produtividade coma utilização deste tipo de cruzamento.
- Published
- 1991
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41. Modelos estatísticos para análise de características longitudinais em bovinos de corte sob coleta seletiva de dados
- Author
-
Fernanda Albuquerque Merlo, Fabio Luiz Buranelo Toral, and Henrique Torres Ventura
- Subjects
Unicaracterístico ,Multicaracterístico ,Análise de variância ,Bovino de corte Pesos e medidas ,Regressão aleatória ,Seleção ,Herdabilidade ,Variância ,Bovino de corte Genética ,Modelos estatísticos ,Melhoramento animal - Abstract
O objetivo deste trabalho foi verificar qual modelo estatístico é o mais adequado para análise de características longitudinais em rebanhos que realizam coleta seletiva de dados. Foram utilizados os pesos aos 330, 385, 440, 495 e 550 dias de idade de machos Nelore. Os modelos unicaracterístico (STM), multicaracterístico (MTM) e de regressão aleatória com polinômios lineares do tipo spline (RRM) foram comparados. O processo de coleta seletiva foi simulado por meio de amostragens sequenciais dos 85 e 70% animais mais pesados ao longo do tempo. As distribuições a posteriori dos parâmetros genéticos foram obtidas por meio do amostrador de Gibbs, com os três modelos mencionados anteriormente. As variâncias para peso obtidas por análise dos bancos de dados com coleta seletiva foram menores que aquelas obtidas para o banco de dados completo quando o modelo STM foi utilizado. Por outro lado, não houve diferença significativa nas variâncias, herdabilidades e correlações para a característica peso em análises do banco de dados com coleta seletiva e com registros completos, quando os modelos MTM e RRM foram utilizados. Os modelos multicaracterístico e de regressão aleatória são adequados para análise de características longitudinais em rebanhos que realizam coleta seletiva de dados The aim of the current study was to verify which statistical model is the most suitable for analysis of longitudinal traits in herds that use selective data collection. Weights at 330, 385, 440, 495 and 550 days of age of Nellore males were used. The single-trait (STM), multi-trait (MTM) and random regression models with linear polynomial spline (RRM) models were compared. The selective collection was simulated through sequential samplings of the 85 and 70% heavier animals over time. The posteriori distributions of the genetic parameters were obtained by the Gibbs sampler, with the three models mentioned above. The variances for weights obtained for the selective collection file analysis were smaller than those obtained for the complete file when the STM model was used. On the other hand, there was no significative difference between variances, heritabilities and correlations for weight in all files evaluated, when the MTM and RRM models were used. Multi-trait and random regression models are suitable for the analysis of longitudinal traits in herds that perform selective data collection
- Published
- 2017
42. Genetic improvement of local goat
- Author
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Nuno Carolino, Vicente, António, and Carolino, I.
- Subjects
Portugal ,Raça autóctone ,Selecção ,Caprino ,Melhoramento animal - Abstract
Genetic improvement of domestic animals through selection of the breeding stock, including small ruminants like goats, has been acknowledged as a powerful tool. It has been used by mankind for the supply of the most varied products, and for increasing productivity and global yields. During the next decades, genetic improvement of goat populations can be a key factor for livestock in extreme conditions, being resistant to conditions resulting from climate change, and diseases, and providing good quality products in many regions of the globe. In a general program of genetic improvement and selection of goats, it will be fundamental to monitor the genetic progress and make the right choices of future breeders defined improvement objectives, which will obviously differ according to whether the systems are for producing goat meat, dairy, dual purpose, or other more specific products (e.g., wool). Techniques and methodologies of selection have evolved at a remarkable rate, from individual selection to best linear unbiased prediction remarkable rate, from individual selection to best linear unbiased prediction (BLUP) and genomics, allowing us to obtain ever more efficient and precise results when we combine different methodologies and information sources. The aim of this chapter is to present and discuss the breeding goals and selection strategies used in genetic improvement programs of goat populations and local breeds. info:eu-repo/semantics/publishedVersion
- Published
- 2017
43. MONITORAMENTO TECNOLÓGICO PARA GENES DE INTERESSE PARA A COMPOSIÇÃO DA CARCAÇA EM FRANGO DE CORTE
- Author
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Sluszz, Thaisy, Saatkamp, Marcio Gilberto, Antunes Arrieche, Claudia, Guaratini Ibelli, Adriana Mercia, and Morimoto Figueiredo, Luciana Harumi
- Subjects
avicultura ,prospecção tecnológica ,General Medicine ,estratégia ,melhoramento animal - Abstract
O melhoramento avícola apresenta constantes desenvolvimentos científicos e tecnológicos, integração de mercados e acirrada competição econômica. Em segmentos desta natureza, as informações tornam-se cada vez mais necessárias para auxiliar as estratégias de PD&I. Assim, este estudo utiliza informações tecnológicas (patentárias, científicas e de mercado) para o monitoramento da área biotecnológica aplicada ao melhoramento de frangos de corte, especificamente genes para composição de carcaça. De acordo com os resultados, a utilização de genômica para seleção de frangos de corte via genes de composição para carcaça é um tema ainda incipiente e recente, sendo a China e os Estados Unidos os países com maior contribuição. Universidades e institutos de P&D são as organizações que apresentam mais trabalhos na área e as empresas privadas tem programas de melhoramento não divulgados. As técnicas de biotecnologia têm sido incorporadas aos programas de melhoramento lentamente e possivelmente nos próximos anos seja utilizada em larga escala.
- Published
- 2013
44. Phenotypic production characteristics from different breeds of laying hens through data mining
- Author
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Lenise Shroder Boemo, Marcos Martinez do Vale, André Macedo, Paulo Roberto Nogara Rorato, Priscila Becker Ferreira, and Tamiris Barbosa Beck
- Subjects
brown eggs ,Veterinary medicine ,Animal breeding ,Breeding program ,Production cycle ,animal breeding ,Biology ,Body weight ,Egg laying ,Breed ,bioclimatologia ,Weather data ,ovos marrons ,melhoramento animal ,bioclimatology ,ambiência ,environment - Abstract
O estudo foi realizado com o banco de dados do Programa de Melhoramento Genético de Poedeiras de Ovos Marrons do Laboratório de Avicultura (LAVIC) do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), onde são utilizadas aves das raças Plymouth Rock White (PRW), Plymouth Rock Barred (PRB) e Rhode Island Red (RIR). Os dados utilizados foram referentes a duas gerações das três raças durante o primeiro ciclo de produção, dos anos de 2009 e 2010. Os parâmetros avaliados foram: taxa de postura semanal, peso dos ovos e peso corporal. O estudo foi dividido em duas abordagens de análise, a primeira análise foi realizada com os dados produtivos com o objetivo de identificar pontos críticos de seleção fenotípica, relacionados à caracterização zootécnica, e a segunda abordagem consistiu na associação dos mesmos parâmetros produtivos, com os dados climáticos de Santa Maria - RS. Os dados foram analisados pela técnica de Mineração de Dados, sendo utilizada a tarefa de classificação com a construção de árvore de decisão pelo algoritmo J48. A mineração dos dados indicou a taxa de postura média na 25ª semana de idade e posteriormente o peso médio dos ovos na 33ª semana de idade como as principais variáveis relacionadas com a diferenciação das raças estudadas, (precisão de 0,833). Na segunda abordagem, as árvores de classificação obtidas apresentaram precisão entre 0,88 e 0,91, sugerindo uma forte associação entre as variáveis ambientais e o desempenho produtivo das aves. Poedeiras PRW são mais sensíveis ao calor que as RIR e PRB e apresentam, na fase de pré-pico, uma maior taxa de postura. A Mineração de Dados permite classificar a produtividade das raças de poedeiras de ovos marrons, podendo indicar as influências ambientais sobre o fenótipo das diferentes raças estudadas. The study was conducted with the database obtained from the Breeding Program of Brown Egg Laying Hens of the Poultry Laboratory (LAVIC) of the Department of Animal Science of the Federal University of Santa Maria (UFSM), where it is used poultry breeds such as White Plymouth Rock (PRW), Barred Plymouth Rock (PRB) e Red Rhode Island (RIR). The data used referred to two generations of these three breeds during the first production cycle of 2009 and 2010. The parameters evaluated were: weekly rate of egg laying, egg weight and body weight. The research was divided into two approaches of analysis, the first being performed with the production data, aiming to identify critical points of phenotypic selections related to zootechnical characterization, and the second approach consisted in the association of the same production parameters together with the weather data of Santa Maria - RS. The data was analyzed using the Data Mining technique, using the classification task by building the decision tree with the J48 algorithm. The data mining indicated the average rate of egg laying at 25 weeks of age and the average weight of eggs at 33 weeks of age, and pointed these as the main variables related to the differentiation of breeds studied, (accuracy of 83.3%). On the second approach, the decision trees obtained showed accuracy between 88% and 91%, suggesting a strong association between the environmental variables and the production performance of the birds. The PRW breed is more sensitive to heat than the RIR and the PRB breed and they showed a higher rate of production during the pre-peak phase. The data mining allowed to classify the productivity of the brown egg laying hens, which may indicate environmental influences on the phenotype of the different breeds studied.
- Published
- 2012
45. Canonical correlation analysis applied to production and reproduction traits of meat type quails
- Author
-
Ribeiro, Jeferson Corrêa, Silva, Luciano Pinheiro da, Caetano, Giovani da Costa, Crispim, Aline Camporez, Pacheco, Rodrigo de Oliveira, and Torres, Robledo de Almeida
- Subjects
multivariate analysis ,análise multivariada ,Coturnix coturnix ,animal breeding ,egg production ,pares canônicos ,canonical pairs ,melhoramento animal ,produção de ovos - Abstract
Data from 629 meat type quails were used to study association between two different sets of traits: egg production and reproduction. Traits related to reproduction were: body weight at 42 days (W42), average egg weight (AEW), age at sexual maturity (ASM); and production traits: number of eggs produced from 42 until 182th day considering intervals of 35 days each period (P1, P2, P3 and P4). Canonical correlations were used to describe the association between these two sets of traits. The canonical coefficients indicated that egg production and reproductive traits were moderately related (0.3475). The first partial period of production (P1) and age at sexual maturity were the most relevant traits among the analyzed variables. Results show that selecting animals with lower age at sexual maturity might lead to an increase on number of eggs produced until 77 days, although it might also lead to a decrease on egg weight. Breeding programs aiming to improve quails production should consider selection strategies to decrease age at sexual maturity and then, as correlated response, increased egg production might be observed. RESUMO: Dados de 629 matrizes de codornas de corte foram utilizados para estudar a associação entre características de reprodução e produção de ovos. As características analisadas foram: peso corporal aos 42 dias (W42), peso médio de ovos (AEW) e idade à maturidade sexual (ASM), que compôs as características reprodutivas; e números de ovos produzidos a partir do 42o dia, divididos em intervalos de 35 dias cada (P1, P2, P3 e P4), que integrou o grupo de características de produção. Para análise de associação, foi utilizada a análise de correlação canônica entre os dois conjuntos de características. Os coeficientes canônicos indicaram que os conjuntos de características de produção de ovos e reprodutivas são dependentes, correlacionando-se moderadamente (0,3475). Entre as variáveis avaliadas, o primeiro período parcial de produção de ovos e a idade à maturidade sexual foram as mais importantes. Os resultados indicam que a seleção para menor idade à maturidade sexual resultaria em aumento no número de ovos produzidos até 77 dias de idade, embora essa seleção possa resultar em diminuição do peso de ovo. Conclui-se que a seleção de aves deve ser efetuada para menor maturidade sexual, pois, assim, estará selecionando também aves para maior produção de ovos.
- Published
- 2016
46. Estimativas bayesianas de parâmetros genéticos para características reprodutivas em vacas da raça Nelore pastando em condições tropicais
- Author
-
Ulhôa Magnabosco, Cláudio, Brito Lopes, Fernando, de Magalhaes Rosa, Guilherme Jordão, and Sainz, Roberto Daniel
- Subjects
fertility ,cebú ,reproductive efficiency ,mejoramiento animal ,animal breeding ,ganado de carne ,fertilidad ,zebu ,eficiencia reproductiva ,bovinos de corte ,beef cattle ,eficiência reprodutiva ,fertilidade ,melhoramento animal - Abstract
Summary Background: Nellore cows are well adapted to tropical conditions, and they have good maternal ability as well as long and prolific reproductive life. Objective: to estimate (co)variances and genetic parameters for calving interval (CI), age at first calving (AFC), gestation length (GL), and days open (DO) in Nellore cows. Methods: covariance components and genetic parameters were estimated using multi-trait Bayesian procedures. Results: three traits had low but statistically significant heritabilities, averaging 0.05, 0.10, and 0.04 for CI, GL, and DO, respectively, whereas age at first calving had a higher heritability (0.36). The permanent environmental effects for CI, GL, and DO were also low, averaging 0.08, 0.07, and 0.15, respectively. The genetic correlations between AFC and CI, AFC and GL, AFC and DO, GL and CI, CI and DO, GL and DO were 0.20, 0.12, 0.11, 0.02, 0.92, and -0.21, respectively. Selection for shorter CI would contribute towards decreasing DO. However, selection for decreased GL could result in a greater number of DO. Despite the favorable genetic correlations, the direct selection responses for these traits would be low. Conclusion: reproductive traits are strongly influenced by environmental effects. Changes in management and environmental factors could rapidly improve reproductive performance of Polled Nellore herds. Genetic selection for these traits should produce a much slower but permanent response. Resumen Antecedentes: las vacas Nelore se adaptan bien a las condiciones tropicales, y tienen buena habilidad materna, así como larga y prolífica vida reproductiva. Objetivo: evaluar la estimación de las (co)varianzas y los parámetros genéticos para el intervalo entre partos (CI), la edad al primer parto (AFC), duración de la gestación (GL) y el período de servicio (DO) en vacas Nelore. Métodos: los componentes de covarianza y los parámetros genéticos fueron estimados por procedimientos multivariados Bayesianos. Resultados: tres características, CI, GL y DO presentaron bajos promedios de heredabilidad, promediando 0,05, 0,10 y 0,04, respectivamente, mientras que la edad al primer parto presentó una heredabilidad más alta (0,36). Los efectos ambientales permanentes del CI, GL y DO también resultaron con estimaciones bajas, con promedios de 0,08, 0,07 y 0,15, respectivamente. Las estimaciones de las correlaciones genéticas entre AFC y CI, AFC y GL, AFC y DO, GL y CI, CI y DO, GL y DO fueron 0,20, 0,12, 0,11, 0,02, 0,92 y 0,21, respectivamente. La selección para un CI reducido puede contribuir a una reducción de los DO. Sin embargo, la reducción de la GL puede dar lugar a un mayor DO. A pesar de las favorables estimaciones de la correlación genética, la respuesta a la selección directa de estos rasgos sería baja. Conclusión: las características reproductivas se ven fuertemente afectadas por efectos ambientales. Así, los cambios en la gestión y las condiciones ambientales dan lugar a una mejora rápida de estas características, mientras que la selección genética produce cambios más lentos pero permanentes. Resumo Antecedentes: vacas da raça Nelore são bem adaptadas às condições tropicais e apresentam boa habilidade materna, bem como elevada longevidade e prolificidade. Objetivos: avaliar a estimativa de (co)variâncias e parâmetros genéticos para o intervalo de partos (IEP), idade ao primeiro parto (IPP), duração da gestação (DG) e período de serviço (PS) em vacas da raça Nelore. Métodos: componentes de covariância e parâmetros genéticos foram estimados por meio de procedimentos bayesianos multicaracterísticos. Resultados: três características apresentaram baixa herdabilidade, com média de 0,05, 0,10 e 0,04 para IEP, DG e PS, respectivamente, já a idade ao primeiro parto apresentou maior herdabilidade (0,36). Os efeitos de permanentes associados á IEP, DG e PS também apresentaram baixas estimativas, 0,08, 0,07 e 0,15, respectivamente. As estimativas de correlação genética entre IPP e IEP, IPP e DG, IPP e PS, IEP e DG, IEP e PS, e DG e PS foram de 0,20, 0,12, 0,11, 0,02, 0,92 e -0,21, respectivamente. A seleção para redução do IEP poderá contribuir para uma significativa redução PS. No entanto, a seleção para redução do DG poderá resultar em aumento do PS. Apesar das favoráveis estimativas de correlações genéticas, a resposta de seleção direta para essas características seria baixa. Conclusão: as características reprodutivas são fortemente afetadas por efeitos ambientais. Assim, as mudanças nas condições de manejo e ambientais resultariam em uma melhora expressiva dessas características, enquanto que a seleção genética produziria melhorias mais lentas, porém permanentes.
- Published
- 2016
47. ESTIMATIVAS GENÉTICO-QUANTATIVAS DA QUALIDADE DO LEITE EM REBANHOS DA RAÇA HOLANDESA
- Author
-
Romano, Gabrieli de Souza, Pedrosa, Victor Breno, Pinto, Luis Fernando Batista, and Barbosa, Severino Benone Paes
- Subjects
Escore de células somáticas ,GENÉTICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMÉSTICOS ,Herdabilidade ,Correlação genética ,Melhoramento animal - Abstract
Submitted by Kleber Morbeck Alves (klebermorbeck@gmail.com) on 2019-11-04T02:16:44Z No. of bitstreams: 1 Gabrieli de Souza Romano.pdf: 685984 bytes, checksum: d39181505e380b5a330b570a6d125a10 (MD5) Approved for entry into archive by Setor de Periódicos (per_macedocosta@ufba.br) on 2019-11-11T17:30:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Gabrieli de Souza Romano.pdf: 685984 bytes, checksum: d39181505e380b5a330b570a6d125a10 (MD5) Made available in DSpace on 2019-11-11T17:30:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gabrieli de Souza Romano.pdf: 685984 bytes, checksum: d39181505e380b5a330b570a6d125a10 (MD5) Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado da Bahia (FAPESB) A intensiva pressão de seleção objetivando o aumento da produção de leite tem sido eficaz, no entanto, é importante considerar outras características que possam tornar o sistema economicamente viável, como a produção de gordura e proteína, bem como suas porcentagens, além de outras características como as de saúde. Destaca-se a mastite como uma doença do úbere, frequente e custosa, e que, eventualmente, ocasiona o descarte involuntário e prematuro de vacas, além da diminuição da produção e qualidade de leite. Com isso, objetivou-se avaliar as estimativas de (co) variância e parâmetros genéticos para as características de escore de células somáticas (ECS), produção de leite (PL), produção de gordura (PG), produção de proteína (PP), porcentagem de gordura (%G) e porcentagem de proteína (%P) na raça Holandesa. Foram utilizadas 56.718 vacas primíparas pertencentes ao banco de dados da Associação Paranaense dos Criadores de Bovinos da Raça Holandesa – APCBRH, entre os períodos de 2005 a 2014. Os efeitos incluídos no modelo de análise foram os efeitos fixos de grupo contemporâneo (rebanho, ano e estação do parto), como covariável a idade da vaca ao parto, sendo testados os efeitos linear e quadrático e o efeito aleatório genético aditivo. Para a estimativa dos componentes de variância foi considerado o modelo animal multivariado e os parâmetros genéticos foram estimados pelo método REML utilizando o programa VCE 6.0. Foram encontradas estimativas de herdabilidade de 0,22 para PL, 0,26 para PG, 0,18 para PP, 0,61 para %G, 0,65 para %P e 0,19 para ECS. As estimativas de correlação genética entre as características variaram de -0,50 a 0,82. A baixa herdabilidade encontrada para contagem de células somáticas sugere que a seleção para esta característica irá resultar em benefícios relacionados à saúde animal e qualidade do leite, todavia em longo prazo. A baixa correlação genética entre características produtivas e SCS permite concluir que a sua inclusão em programas de melhoramento genético permite avanços genéticos para essa característica sem interferir negativamente na seleção genética para produção de leite ou as demais características de qualidade. The intense selection pressure aiming to increase of the milk yield has been effective, however, it is important to consider other features that can become the system economically viable, as the production of fat and protein as well as their percentages, besides other characteristics like those of health. It stands out mastitis like a disease of the udder, frequent and costly, and that eventually causes involuntary and premature cull cows, beyond the reduction of production and quality of milk. Thereby, aimed to evaluate the estimates of (co) variance and genetic parameters for the characteristics somatic cell score (SCS), milk yield (MY), fat yield (FY), protein yield (PY), fat percentage (%F) and protein percentage (%P) in the Holstein breed. It was used 56718 information of primiparous cows belonging to the database of the Paraná Holstein Breeders Association- APCBRH, between the periods 2005-2014. The effects included in the analysis model were the fixed effects of contemporary group (herd, year and calving season) as a covariate age of cow at calving, linear and quadratic effects and additive genetic random effect being tested. For the estimation of the variance components was considered the animal model multivariate and genetic parameters were estimated by REML using the VCE 6.0 program. It was estimated variance components and genetic parameters considering the multivariate animal model by REML method. The estimates of the heritability were 0.22 for MY, 0.26 for FY, 0.18 for PY, 0.61 for %F, 0.65 for %P, and 0.19 for SCS and the estimates of genetic correlations among analyzed traits ranged between -0.50 to 0.82. The low heritability found for score of somatic cell represent that the selection for this trait will result in benefits related to animal health and milk quality, but, in the long run. The low genetic correlation between productive traits and SCS permits to conclude that its inclusion in animal breeding programs allow genetic advances for this characteristic without interfering negatively in genetic selection for milk yield or quality traits.
- Published
- 2016
48. Identificação de polimorfismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 e CAST e associação com características de qualidade de carne e carcaça em ovinos Santa Inês
- Author
-
Meira, Ariana Nascimento, Pinto, Luís Fernando Batista, Coutinho, Luiz Lehmann, Pinto, Luís Fernando Barista, Mourão, Gerson Barreto, Costa, Raphael Bermal, and Pedrosa, Victor Breno
- Subjects
Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos ,Sequenciamento ,Biotecnologia ,Genética ,Marcadores moleculares ,Melhoramento animal ,Ovinos - Abstract
Submitted by Kleber Morbeck Alves (klebermorbeck@gmail.com) on 2020-03-02T19:03:14Z No. of bitstreams: 1 ARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf: 2234049 bytes, checksum: c5fd325c3992657d51ed70c873f10dbc (MD5) Approved for entry into archive by Setor de Periódicos (per_macedocosta@ufba.br) on 2020-03-03T16:30:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf: 2234049 bytes, checksum: c5fd325c3992657d51ed70c873f10dbc (MD5) Made available in DSpace on 2020-03-03T16:30:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ARIANA NASCIMENTO MEIRA - 27-04-2016.pdf: 2234049 bytes, checksum: c5fd325c3992657d51ed70c873f10dbc (MD5) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia (FAPESB) O objetivo desta pesquisa foi identificar, em ovinos Santa Inês, polimorfismos do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphis) nos genes IGF1 (Insulin Like Growth Factor 1), GH (Growth Hormone), LEP (Leptin), CAPN1 (Calpain 1) e CAST (calpastatin) e verificar se estão associados a características que evidenciam qualidade de carne ou de carcaça. Para tanto, foram sequenciados fragmentos destes genes em até 191 animais. Na região estudada do IGF1, cerca de 4.550 pb (pares de base), foram detectados 18 SNPs em região de intron. Nos 2.045 pb estudados do gene da leptina foram identificados 21 SNPs, sendo um em região de exon. No gene GH, onde 1.194 pb foram sequenciados, 21 polimorfismos foram identificados, sendo 3 localizados em exon. Nos 3.927 pb estudados do gene CAPN1, foram identificados 45 SNPs, um deles localizado em exon. No gene CAST, 4.108 pb foram sequenciados e 58 polimorfismos identificados, sendo um em exon. Deste total de polimorfismos, 115 SPN apresentaram distribuição de frequência que permitiu utilizá-los para estimar efeitos aditivo e de dominância, sendo 6 no IGF1, 16 no LEP, 52 no CAST, 5 no GH e 36 no CAPN1. Para alguns marcadores as frequências genotípicas e alélicas diferiram de forma expressiva entres os dois grupos de animais estudados (Embrapa e UFBA). Isso indica que há variação nas frequências de alguns marcadores dentro dos rebanhos da raça Santa Inês e a resposta ao processo de seleção dependerá muito da frequência do alelo favorável no rebanho sob seleção. Vários marcadores tiveram efeito aditivo significativo sobre atributos de carne e de carcaça e podem ser boa fonte de informação para a seleção de ovinos da raça Santa Inês. Muitos desses efeitos ainda não haviam sido reportados em ovinos, o que torna o presente estudo uma fonte de referência para outros trabalhos com esta espécie.
- Published
- 2016
49. Genes diferencialmente expressos em músculo de novilhos Nelore divergentes para eficiência parcial de crescimento
- Author
-
SILVA, J. V. da, TIZIOTO, P. C., OLIVEIRA, P. S. N., AFONSO. J., COUTINHO, L. L., REGITANO, L. C. de A., Juliana Virginio da Silva, UFSCAR, Polyana Cristiane Tizioto, EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, Priscila Silva Neubern Oliveira, EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, Juliana Afonso, UFSCAR, Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP, and LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
- Subjects
Eficiência parcial de crescimento ,Melhoramento Animal ,Genética Animal ,Animal genetics ,Animal breeding - Abstract
Made available in DSpace on 2019-04-10T00:39:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GENESDIFERENCIALMENTEEXPRESSOSEMMUSCULODENOVILHOSNELOREDIVERGENTESPARAEFICIENCIAPARCIALDECRESCIMENTO.pdf: 392032 bytes, checksum: 040cb26c1f45b894cb4a670fc93a7ece (MD5) Previous issue date: 2016
- Published
- 2016
50. Avaliação genética para a funcionalidade no cavalo Lusitano: a equitação de trabalho
- Author
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Vicente, António, Carolino, Nuno, and Gama, Luis
- Subjects
Desporto ,Selecção ,Valor genético ,Cavalo ,Raça Lusitana ,Melhoramento animal - Abstract
Submitted by Ana Jorge (ana.jorge@esa.ipsantarem.pt) on 2016-05-10T11:20:15Z No. of bitstreams: 1 AVicente_Revista_Equitação_N118a.pdf: 1563717 bytes, checksum: 72fb4e985ead4e93b4e886e6c161e976 (MD5) Made available in DSpace on 2016-05-10T11:21:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AVicente_Revista_Equitação_N118a.pdf: 1563717 bytes, checksum: 72fb4e985ead4e93b4e886e6c161e976 (MD5) Previous issue date: 2016
- Published
- 2016
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