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International audience; Un logiciel de vision artificielle contenant des fonctions de traitement d'image et d'intelligence artificielle a été développé pour détecter des animaux sur des vidéos enregistrées par des pièges photographiques en milieux forestiers. Le suivi par pièges photographiques est utilisé sur le dispositif expérimental OPTMix en forêt d'Orléans pour estimer la fréquentation des placettes de mesure par les ongulés sauvages (chevreuil, cerf élaphe et sanglier). Les scientifiques et les naturalistes utilisent le suivi par pièges photographiques pour inventorier et suivre les populations animales et la biodiversité de la faune sauvage. De nombreuses vidéos obtenues ont été analysées manuellement par les agents de l'INRAE, qui sauvegardent des informations telles que la parcelle forestière sur laquelle la détection animale est effectuée, la date de la vidéo, les plages horaires de présence animale, l'espèce et la catégorie d'animal détecté, et leur comportement. Pour éviter cette tâche fastidieuse manuelle et rendre ce programme de surveillance de la biodiversité à grande échelle plus accessible aux gestionnaires et autres utilisateurs finaux, un logiciel de vision, qui comprend des opérations de traitement d'images et des méthodes d'intelligence artificielle (trois réseaux de neurones intégrés développés avec les outils Tensorflow, Pytorch et Caffe), a été développé pour détecter, compter et identifier les espèces animales et enregistrer d'autres données auxiliaires, sur les vidéos, en tenant compte des contraintes telles que les conditions d'éclairage très variables dans le sous-bois, les variations de couleur des objets naturels (arbres, herbes, animaux) et les mouvements d'herbe qui ajoutent du bruit aux images. Le logiciel développé permet également de détecter les animaux partiellement cachés par des objets naturels (arbres, herbes,…). Une méthode d’intelligence artificielle a été développée pour estimer la posture des truies, parmi quatre postures principales (debout, couché ventre, assis, allaitement) dans des fermes en milieu clos, dans le but de déterminer la durée de chaque posture, pour une truie donnée, au cours du temps, pour des opérations d’élevage de précision (qualité de l’élevage, réduction de la mortalité des porcelets,...) Un réseau de neurones a été créé, à partir d’une base d’apprentissage de 30000 images de postures de truie, en utilisant l’outil Tensorflow et un réseau de type Inception V3, pour obtenir un système de prédiction, en temps réel avec une fréquence de 10Hz.

Les chercheurs en écologie du paysage essaient de comprendre l’effet de la structure et de la composition des habitats sur les espèces. La technologie LiDAR est encore peu utilisée dans ce domaine mais fournit des données précises sur de grandes zones. Nous cherchons ici à évaluer l’apport des données LiDAR en milieu forestier. La but est de voir si des métriques LiDAR pertinentes peuvent être extraites afin d’expliquer et prédire des indicateurs de biodiversité. Les résultats obtenus à partir de modèles linéaires généralisés (GLM) permettent d’expliquer entre 14 et 63% des variables de biodiversité étudiées (Indice de Biodiversité Potentielle, taux de prédation des défoliateurs, indice de consommation du chevreuil, richesse de la strate herbacée, richesse de différentes catégories d’oiseaux) à partir d’une combinaison d’une quinzaine de variables LiDAR. Dans un second temps, nous explorons l’apport de données LiDAR pour extraire automatiquement les cimes et couronnes des arbres. L’analyse est effectuée par extraction des maximas locaux ou par l’utilisation de la méthode de ligne de partage des eaux, sur le modèle numérique de hauteur issu des données LiDAR. Les algorithmes ont été testés sur une zone d’étude simplifiée présentant des arbres alignés avec un écart assez fixe. Il en ressort que la détection des cimes d’arbres est, dans ce cas d’étude, précise après un filtrage gaussien 3*3 du raster analysé. Les résultats obtenus demandent à être confirmés en raison du faible nombre d’observations. Cette étude ouvre toutefois des perspectives intéressantes sur l’apport du LiDAR en écologie., Landscape ecology researchers are trying to understand the effect of habitat structure and composition on species. LiDAR technology is still not widely used in this domain but provides accurate data over large areas. In this report, we try to assess the contribution of LiDAR data in forest environments. The aim is to see if relevant LiDAR metrics can be extracted to explain and predict biodiversity indicators. The results obtained from generalized linear models (GLM) allow to explain between 14 and 63% of the biodiversity variables studied (Potential Biodiversity Index, defoliator predation rate, deer consumption index, richness of the herbaceous stratum, richness of different categories of birds) from a combination of about fifteen LiDAR variables. In a second step, we explore the contribution of LiDAR data to automatically extract treetops and crowns from trees. The analysis is carried out by extracting local maxima or by using the watershed method on the digital height model derived from LiDAR data. The algorithms were tested on a simplified study area with trees aligned with a rather fixed gap. It appears that the detection of tree tops is, in this case of study, accurate after a 3*3 Gaussian filtering of the raster analyzed. The results obtained need to be confirmed due to the low number of observations. However, this study opens interesting perspectives on LiDAR’s contribution to ecology.

Dans un contexte de changement climatique, l’observation de la phénologie présente le double intérêt d’être à la fois un indicateur puissant du changement en cours mais également un facteur majeur de l’adaptation. C’est pourquoi, aujourd’hui de nombreux praticiens observent l’apparition, dans le temps, des évènements biologiques chez les plantes ou les animaux. Cependant, force est de constater que l’observation réalisée à l’oeil nu, avec ou sans jumelle, limite l’exercice, à cause de son caractère chronophage, subjectif et ponctuel. C’est pourquoi, certains laboratoires se sont engagés dans une réflexion sur la prise de données de phénologie par caméra en situation isolée. L’objectif de cet article est de faire le point, à travers 3 retours d’expériences, sur l’utilisation de plusieurs types de matériels testés (Brinno, Wingscapes, Axis). Les principaux résultats de ces expériences montrent un gain incontestable dans la qualité des images obtenues et ce quelle que soit l’échelle de l’observation : organe, arbre ou peuplements. Toutefois, ces résultats restent tributaires de l’étanchéité des systèmes testés, de leur fixation ainsi que de la nécessité d’effectuer des essais préliminaires avant de lancer véritablement l’opération. Par ailleurs, pour pouvoir exploiter de manière automatique les images, il faut respecter un certain nombre de recommandations, notamment la pose d’un panneau de référence, la définition de la région d’intérêt ou le choix du logiciel de traitement des données. Enfin, ces essais réalisés en situation isolée des réseaux de communication et électriques, montrent également l’utilité de recourir à des équipements munis de fonctionnalités type Bluetooth et/ou raccordables à des panneaux solaires. Pour avancer sur ces 2 derniers points, des solutions techniques à moindre coût existent et pourraient être développées notamment dans le cadre du SOERE TEMPO.

The plateau of La Féclaz, in the massif des Bauges in Savoie (France) is a forest environment. The essence of the area is by a majority the spruce. This one is affected by a massive attack of devastating insects: Scolytidae, Ips Typographus. To check the increasing of these insects the town Les Déserts set about very important forest works: 40 ha of the forest will be cut between July 2015 and September 2016.This Nordic field of this plateau is directly impacted by these cuts of trees. So the cross country skiers are the first observers of the forest change.That’s why this report is concentrated in the landscape’s perception by the sportsmen of the plateau of La Féclaz during the winter period in 2016.Thanks to this study, these forest cuts is impact will be measured.; Le paysage de La Féclaz, situé dans le Massif des Bauges en Savoie, est un milieu forestier. L’essence implantée sur le site est majoritairement constituée d’épicéa. Celui-ci subit depuis quelques années une attaque massive d’insectes ravageurs : les scolytes. Pour enrayer la propagation de ces insectes, la commune Les Déserts a entrepris des travaux forestiers de grande envergure. Quarante hectares de forêt vont être coupés entre juillet 2015 et septembre 2016.Le domaine nordique étant situé sur ce plateau, il est directement impacté par ces coupes forestières. Les skieurs de fond sont donc les premiers observateurs du changement du milieu forestier.C’est pourquoi ce mémoire va se concentrer sur la perception du paysage par les pratiquants sportifs du plateau de La Féclaz pendant la période hivernale de 2016.Grâce à cette étude, l’impact de ces coupes forestières va pouvoir être mesuré.

Cette étude investigue le régime de reproduction de la hêtraie de la Massane grâce à une approche démogénétique. Pour cela, nous avons bénéficié du suivi cartographique de la forêt et procédé au génotypage des semis établis et des adultes reproducteurs sur deux placettes de la réserve intégrale. Le régime de reproduction est essentiellement allogame, avec un taux d’autofécondation négligeable, contrairement à ce qui est souvent observé pour des populations marginales. Les contributions des adultes à la reproduction ne sont pas équilibrées. Ces variations interindividuelles des fécondités mâles et femelles sont largement expliquées par le diamètre des reproducteurs. Nous avons identifié en outre un effet négatif du dépérissement foliaire (mesuré par la présence de branches mortes) sur la fécondité femelle, mais pas sur la fécondité mâle. La présence du champignon lignicole Oudemansiella mucida n’a en revanche pas d’effet systématique sur la fécondité, mâle ou femelle

Le chevreuil est un consommateur sélectif, mais opportuniste, qui adapte son régime alimentaire scion les variations saisonnières dc la disponibilité des ressources. Les variations saisonnières du régime alimentaire sont souvent difficiles à mettre en évidence par 1'examcn du contenu des panses, en raison du manque d'échantillons en dehors de la période de chasse. Dans cet article, nous décrivons les variations, lices a la saison et au sexe, du régime alimentaire du chevreuil forestier estimées par cette méthode, sur des panses récoltées à chacune des quatre saisons. Six plantes représentaient à elles seules SO a 90 % du poids sec du contenu des panses, dont deux, la ronce et le chèvrefeuille, étaient présentes dans pratiquement chaque échantillon toute l’année. Ceci mis ä part, le régime alimentaire variait fortement entre les saisons. Le chevreuil consomme des végétaux à feuillage persistant (bruyère, lierre) et quelques graminées en automne et hiver, mais préfère les herbacées non graminéennes telles que 1'anémone sylvie, et les bourgeons ct jeunes feuilles d'arbres et arbustes (charme, chêne, aubépine) au printemps et en été. Le chevreuil est particulièrement opportuniste en exploitant les ressources abondantes, mais éphémères, fournies par les fruits et les graines (les mûres en été, les glands en automne). Des différences entre les sexes sont apparues dans la façon d'exploiter les ressources saisonnières. II est possible que des différences de besoins énergétiques en soient la cause, mais plus vraisemblablement des patrons comportementaux différents entre les sexes. Nos résultats confirment l’observation que l'impact du chevreuil sur la végétation de la foret dc Dourdan concerne principalement la ronce et le chèvrefeuille., Roc deer arc selective but opportunistic feeders which are predicted to vary their diet in relation to seasonal variation in plant availability. Seasonal variation in diet is often difficult to assess because of a lack of samples outside the hunting season. Here we describe seasonal - and sex-related variations in forest roe deer diet estimated from the examination of rumen contents collected in each of the four seasons. Only six plant items comprised 80-90% dry weight of the rumen contents, with two, bramble and honeysuckle, virtually ubiquitous in the samples throughout the year. Otherwise, the roe deer's diet varied markedly between seasons, feeding on evergreen plants (such as heather and ivy) and some grasses in autumn and winter, but preferring herbs (anemone) and the young leaves and buds of trees (hawthorn, hornbeam, oak) in spring and summer. The roe deer was particularly opportunistic in exploiting the abundant, but cphemerally available, resources provided by fruits and nuts (e.g. blackberries in summer, acorns in autumn). There were some differences between the sexes in the way that they exploited these seasonal resources, possibly due to differences in energy requirements, but more likely due to differing behavioural patterns. Our results support the observation that the impact of roc deer on the vegetation in this forest mostly concerned bramble and honeysuckle.

- Too often, Man is denonced as main drying up factor of biological resources, a crusher of biosphere, responsible of forest's disappearance. Nevertheless, he can become, voluntarily or not, a main factor of diversity's enrichment and even creation, trough landscape planning and forestry management., Résumé. - Trop souvent l'homme est perçu comme un facteur d'appauvrissement de la richesse végétale, un dévastateur du monde vivant, seul responsable de la disparition des milieux forestiers. Cependant, celui-ci peut devenir, volontairement ou involontairement, par ses activités d'aménagement et d'exploitation sylvicoles un facteur d'enrichissement de la diversité, voire un créateur de diversité., Hotyat Micheline, Galochet Marc. L'homme, facteur de diversité en milieu forestier (Man, factor of diversity in forest environment). In: Bulletin de l'Association de géographes français, 78e année, 2001-2 ( juin). Les forêts entre nature et société, sous la direction de Paul Arnould. pp. 151-163.

Spirits, Tombs, Honey and Oxen : Perception and Use of the Forest in the Bara Imamono Region, South-Western Madagascar. In Ibaro Imamono, the thick dry forest is the domain of many spirits, mainly the helo and the omba. These manifest themselves when they are displeased, especially when the taboos that are intended to assure a harmonious coexistence between the tompontany villagers and the spirits are not respected. Traditionally, the forest is the site of graves, but it is also a place for ceremonial exchanges and an exploitation of natural resources that are subject to special rites. Herds are kept in it in the manner of a gigantic park for oxen, and it is also used as a pasture by them. The felling of trees and the settlement of migrants during the colonial period had the effect of desecrating a part of the forest. Today, due to the complex relationships between Bara and migrants, the forest has become a stake of basic importance. The natives of Bara consider themselves as the defenders of it, but, in view of their individual attitudes, they often encourage or protect those that destroy the forest., En Ibaro Imamono, la forêt dense sèche est le domaine de nombreux esprits, notamment les helo et les omba. Ceux-ci se manifestent lorsqu’ils sont mécontents, notamment lorsque les interdits qui visent à une coexistence harmonieuse entre villageois tompontany et esprits ne sont pas respectés. Traditionnellement la forêt est le site des sépultures mais c’est aussi un lieu d’échanges cérémoniels et de prélèvement de ressources naturelles soumis à des rites. Elle abrite les troupeaux à la manière d’un gigantesque parc à bœufs et leur sert de pâturage. L’exploitation du bois et l’établissement de migrants pendant la colonisation a contribué à désacraliser une partie de la forêt. Aujourd’hui dans les rapports complexes entre Bara et migrants, la forêt est devenue un enjeu fondamental. Les premiers se considèrent comme les défenseurs de celle-ci mais, au gré de leurs stratégies individuelles, encouragent ou protègent souvent ceux qui détruisent la forêt., Moizo Bernard. Des esprits, des tombeaux, du miel et des bœufs : perception et utilisation de la forêt en pays Bara Imamono. In: Milieux et sociétés dans le sud-ouest de Madagascar. Talence : Centre de Recherches sur les Espaces Tropicaux (Université Michel de Montaigne, Bordeaux 3), 1997. pp. 43-66. (Îles et Archipels, 23)

Cet article fait le point des informations d’ordre démographique recueillies au cours de trois cycles d’étude 1965-1966, 1967-1968 et 1969-1970, sur la processionnaire du pin dans la vallée du Niolo en Corse. L'utilisation simultanée de deux niveaux d’investigation et le recoupement de données acquises d’une part à l’échelle parcellaire, d’autre part au niveau du massif forestier permettent d’avoir sinon des preuves absolues, du moins des hypothèses largement étayées sur la façon dont s’est produite l’évolution de l’insecte au cours de ces six années. Les résultats permettent en effet de suivre les fluctuations de population de la vallée avec une bonne précision statistique (coefficient de variation de 5 p. 100 en moyenne) et de mettre en évidence les faits suivants : - le niveau de population correspondant à une culmination de gradation en 1966 (8 800 000 nids) s’est progressivement abaissé en 1968 (6 800 000 nids) et en 1970 (2 900 000 nids) ; - les zones les plus peuplées durant l’année 1966 furent celles où la réduction de population fut la plus importante au cours des années suivantes ; - les fortes populations de 1965-1966 furent accompagnées de la présence d’une virose à smithiavirus pityocampa Vago. Celles-ci, dont la manifestation épidémique fut limitée aux zones de basse altitude ou bien exposées, ne fut retrouvée qu’à l’état endémique par la suite ; - les expositions nord-ouest sont les moins peuplées, et les expositions sud-est les plus favorables à la processionnaire ;- durant les six années d’observation, il n’y eut jamais au cours des premiers stades de mortalité susceptible d’avoir une action significative sur l’évolution de la population ; - de même, les parasites de la phase aérienne de la processionnaire, en particulier les parasites des oeufs ne paraissent pas avoir eu une action déterminante sur la mortalité enregistrée ; - celle-ci au cours du cycle 1965-1966 fut essentiellement préhivernale, liée à la présence de virose dans un certain nombre de parcelles et d’autant plus importante que les parcelles étaient surpeuplées ; - au cours du cycle 1969-1970, elle fut au contraire hivernale et indépendance du niveau de population. La réduction de population fut d’autant plus marquée sur les parcelles qui étaient exposées au Nord et à une altitude élevée ;- le cycle 1968-1969 représente une situation intermédiaire. Les chenilles furent affectées par un hiver rigoureux mais dans un certain nombre de parcelles, on enregistra une mortalité préhivernale due à la surpopulation et du même type que celle de 1965 ; - les analyses effectuées montrent, en outre, les liaisons étroites qui existent entre les niveaux de population de l’insecte et les principales caractéristiques du milieu forestier. Ces relations méritent d’être approfondies pour constituer des forêts qui, par elles-mêmes, se défendent mieux contre les attaques de processionnaires., This article is an update of the demographic data collected during 3 study cycles (65-66, 67-68, 69-70) about the pine processionary in the Niolo Valley, Corsica. Simultaneous use of two investigation levels with the plot scale data on the one hand, with the forest scale data on the other hand allows to make strong assumptions, if not absolute certainties, about the evolution of this insect over those 6 years. The results show the statistically significant (5 p. 100 confidence intervals) variations of the population size and suggest that : - the population size which peaked in 1966 (8 800 000 nests) gradually decreased in 1968 (6 800 000 nests) and 1970 (2 900 000 nests) ; - the most populated areas in 1966 incurred the largest decrease in population size during the following years ; - the large population in 1965-1966 went along with a virus disease. The disease was only restricted in its epidemic nature to low altitude or well exposed areas and was only found in an endemic stade later on ; - North West facing areas are the least populated and South East ones are the most favorable to the processionary ; - for the 6 years studied, mortality during the first instars wasn’t ever likely the modify noticeably the evolution of the population ;- in the same way, the parasites of the processionary during its aerian phase (mostly egg parasites) do not seem to have significantly influenced the recorded mortality ; - in 1965-1966, deaths mostly occurred before winter, in several plots they were due to a virus. The larger mortality rates were in the most overpopulated plots ; - in 1969-1970, deaths were due to winter and were unrelated to the population size. The populations size decrease was larger in North West facing and high altitude plots ; - the 1968-1969 cycle shows an intermediary scheme. The caterpillars were affected by a tough winter but wa also recorded some prewinter deaths, in some plots, due to overpopulation , as in 1965 ; - the analysis also shows the links between the population size and the major forest characteristics. This relations have to be studied more thoroughly to make forests more resistante to Pine Processionnary.