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EasyBioM™ : une application web R-shiny pour la visualisation et l’analyse de données métagénomiques

Authors :
Fournier, M.-C.
Vaissié, P.
Camus, C.
Amouzou, Y.
Adrouji, Y.
Carton, T.
Le Fresne-Languille, S.
Leuillet, S.
Source :
Revue d Epidemiologie et de Sante Publique; September 2020, Vol. 68 Issue: 1, Number 1 Supplement 3 pS123-S124, 2p
Publication Year :
2020

Abstract

L’exploration de la biodiversité du microbiote est une ère de recherche en plein essor. Les approches dites métagénomiques (16S, Shotgun), basées sur des techniques de séquençage d’ADN nouvelle génération, permettent d’étudier directement la composition microbienne de divers types de prélèvements (fécaux, cutanés, oraux ou encore vaginaux). Les données délivrées après traitements bioinformatiques sont complexes et de grandes dimensions. Face à la quantité de données générées, des outils de visualisation et des approches statistiques adaptées sont requis.

Details

Language :
English
ISSN :
03987620
Volume :
68
Issue :
1, Number 1 Supplement 3
Database :
Supplemental Index
Journal :
Revue d Epidemiologie et de Sante Publique
Publication Type :
Periodical
Accession number :
ejs54239471
Full Text :
https://doi.org/10.1016/j.respe.2020.03.048