The Role of Enzyme Dynamics in Understanding of Suicidal Inactivation of B12-dependent Diol Dehydratase

Authors :: Bilić, Luka
Barić , Danijela
Banhatti, Radha Dilip
Smith, David Matthew
Kovačević, Borislav
Publication Year :: 2019
Abstract: Računalne simulacije molekulske dinamike, QM i QM/MM računi upućuju da je inaktivacija djelomično posljedica velike pokretljivosti kofaktora unutar enzima. Upravo iz tog razloga kofaktor može započeti kemijsku pretvorbu substrata glicerola na dva kemijski ekvivalentna kraja. Kemijska pretvorba na jednom kraju glicerola vodi u katalizu, kemijska pretvorba na drugom kraju vodi u inaktivaciju.

Subjects :: B12-dependent diol dehydratase
Substrate binding
Glycerol inactivation
Molecular dynamics
QM/MM calculations

Tools