Imputation de données manquantes pour l'inférence de réseau à partir de données RNA-seq

National audience; Dans cette proposition de communication, nous nous intéressons au problème de l'inférence de réseaux de gènes à partir de données d'expression mesurées par RNA-seq. Nous présentons une approche qui permet d'intégrer de l'information externe (autre type d'omic par exemple) obtenue sur les mêmes individus ainsi que sur d'autres individus. Notre approche est présentée comme un problème d'imputation que nous résolvons avec des approches de type "hot deck" multiple pour obtenir un réseau plus stable. Nous illustrerons nos résultats sur des données réelles issues d'un programme d'études sur l'obésité.