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AgroLD: une base de connaissances pour l'étude du phénome des plantes cultivées

Authors :
Larmande, Pierre
Gildas, Tagny
Ruiz, Manuel
Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)
WEB-CUBE
Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)
Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)
ANR-19-DATA-0019,FooSIN,Participation française au GO FAIR Food Systems Implementation Network(2019)
ANR-18-CE23-0017,D2KAB,Des Données aux Connaissances en Agronomie et Biodiversité(2018)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
WEB Architecture x Semantic WEB x WEB of Data (WEB3)
Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Source :
21ème Conférence Internationale Francophone sur l’Extraction et Gestion des Connaissances, EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier (virtuel), France, EGC 2021-21ème Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, EGC 2021-21ème Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier (virtuel), France, EGC 2021-21e Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, EGC 2021-21e Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier (virtuel), France. pp.461-468
Publication Year :
2021
Publisher :
HAL CCSD, 2021.

Abstract

International audience; Recent advances in high-throughput technologies have resulted in tremendous increase in the amount of data in the agronomic domain. There is an urgent need to effectively integrate complementary information to understand the biological system in its entirety. We have devel- oped AgroLD, a knowledge graph that exploits the Semantic Web technology and some of the relevant standard domain ontologies, to integrate information on plant species and in this way facilitating the formulation of new scientific hypotheses. We present some integration results of the project, which initially focused on genomics, proteomics and phenomics.; Les récents progrès des technologies à haut débit ont entraîné une explosion de la quantité de données dans le domaine agronomique. Il est urgent d'intégrer efficacement des informations complémentaires pour comprendre le système biologique dans sa globalité. Nous avons développé AgroLD, une base de connaissances qui exploite la technologie du Web sémantique et des ontologies du domaine biologique pertinentes, pour intégrer les informations sur les espèces végétales et faciliter ainsi la formulation de nouvelles hypothèses scientifiques. Nous présentons des résultats sur le processus d'intégration et sur la plateforme visualisation des données, qui était initialement axé sur la génomique, la protéomique et la phénomique.

Details

Language :
French
Database :
OpenAIRE
Journal :
21ème Conférence Internationale Francophone sur l’Extraction et Gestion des Connaissances, EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier (virtuel), France, EGC 2021-21ème Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, EGC 2021-21ème Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier (virtuel), France, EGC 2021-21e Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, EGC 2021-21e Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier (virtuel), France. pp.461-468
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..264f6677bfefc2d6f43aef096aed2823