Dinámica de la microbiota en niños, adolescentes y adultos

La microbiota intestinal se implanta a lo largo del desarrollo del individuo y su composición y funciones difieren según la edad. Conocer los cambios que se producen en la microbiota intestinal a lo largo de la vida puede ayudar al diagnóstico, tratamiento y prevención de enfermedades relacionadas con alteraciones metabólicas e inmunitarias. Con este trabajo pretendemos contribuir a la comprensión del proceso de desarrollo de la microbiota intestinal, centrándonos en dos períodos que han recibido poca atención: los primeros años y la adolescencia. Hemos determinado la composición y la función de la microbiota a través de enfoques metagenómicos de genoma completo y basados ​​en ARN ribosómico 16S. Hemos observado que las diferencias entre la microbiota intestinal de los niños y la de los adultos disminuyen progresivamente durante la infancia y la adolescencia. La microbiota de los niños se estabiliza al principio de la infancia en términos de cambios rápidos y a gran escala en la diversidad, la composición y el perfil funcional, pero se siguen produciendo cambios tanto antes como después de la adolescencia. Por lo tanto, la adolescencia puede considerarse un período de transición, en el que algunos taxones y funciones aún no alcanzan las abundancias observadas en los adultos. Knowing about the changes that occur in the gut microbiota throughout life can help the diagnosis, treatment and prevention of metabolic and immune diseases. Here, we focus on the changes occurring during two under-studied periods: early childhood and adolescence. We analyze diversity, taxonomic composition, functional profile and temporal stability in 12 children, 13 adolescents and 35 adults over a three-year period, with 16S rRNA and shotgun metagenomic sequencing. Children entered the study as toddlers and had undergone a long period of breastfeeding, most of them being weaned during the study. Breastfeeding cessation contributed importantly to the convergence of the microbiota towards adult-like properties. The microbiota of the toddlers stabilized at around two years of age in terms of large-scale, rapid changes in diversity, composition, and functional profile, but further changes did occur both before and after adolescence. Therefore, adolescence remains a transitional period, in which some taxa and functions still differ from adult levels. These include, among others, Bifidobacterium, Streptococcus, Bacteroides fragilis and several Lachnospiraceae, as well as various functions related to energy metabolism. This suggests that changes occurring during adolescence may still affect the establishment of a healthy adult microbiota.