Identification des gènes candidats de la tolérance au zinc chez la pseudométallophyte Arabidopsis halleri par l'intégration des données de génomique comparative et de transcriptomique disponibles chez Arabidopsis

SCL; Les espèces tolérantes et hyperaccumulatices de métaux représentent une ressource génétique importante dans le développement des stratégies de phytoremédiation. En particulier elles représentent un outil de choix pour l'identification et la caractérisation des gènes de l'homéostasie des métaux. Dans cette étude nous avons complété par 20 nouveaux marqueurs la carte génétique d'Arabidopsis halleri composée aujourd'hui de 81 marqueurs ancrés chez A. thaliana. Grâce à ces marqueurs, la colinéarité entre génomes a été vérifiée, les intervalles de confiance des 3 régions associées au caractère quantitatif (QTR) de tolérance au zinc ont été recalculés et transférés sur la carte physique d'A. thaliana en tenant compte des zones de synthénie. Ce transfert a permis de vérifier la correspondance de position de 25 gènes connus pour leur rôle dans l'homéostasie des métaux et de détecter parmi eux trois gènes localisés dans les QTR : HMA4, MTP1-a et MTP1-b. Ces gènes peuvent être considérés comme candidats de la tolérance au zinc. Les clones BAC construits à partir du génome d'A. halleri portant trois de ces gènes candidats ont été identifiés pour en réaliser la séquence. Le séquençage du BAC contenant HMA4 confirme l'absence d'autre gène de l'homéostasie des métaux à proximité.