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INPUT OF DEEP PHENOTYPING IN THE METABOLIC SYNDROME STRATIFICATION

Authors :
Monnerie, Stéphanie
Pétéra, Mélanie
Canlet, Cécile
Castelli, Florence
Colsch, Benoit
Fenaille, Francois
Joly, Charlotte
Jourdan, Fabien
Lenuzza, Natacha
Lyan, Bernard
Martin, Jean-Francois
Migné, Carole
Morais, José A
Poupin, Nathalie
Vinson, Florence
Thevenot, Etienne
Junot, Christophe
Gaudreau, Pierrette
Comte, Blandine
Pujos-Guillot, Estelle
Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA)
Plateforme d’Exploration du Métabolisme
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
ToxAlim (ToxAlim)
Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
MetaboHUB
Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI)
Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments (LEMM)
Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA)
Institut National de Recherche en Agriculture, Alimentation et Environnement (INRAE)
Université Paris Saclay (COMUE)
Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST)
Division de Gériatrie
Centre de recherche du Centre universitaire de santé McGill
McGill University
Département de médecine
Centre de Recherche du Centre hospitalier de l’Université de Montréal
Université de Montréal (UdeM)
Unité de Nutrition Humaine (UNH)
Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM)
MetaboHUB-Clermont
MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-MetaboHUB-Clermont
MetaboHUB-MetaboHUB
MetaToul AXIOM (E20)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul
MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS)
Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Laboratoire Sciences des Données et de la Décision (LS2D)
Département Métrologie Instrumentation & Information (DM2I)
Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST (CEA))
Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l’Université de Montréal (CR CHUM)
Centre Hospitalier de l'Université de Montréal (CHUM)
Université de Montréal (UdeM)-Université de Montréal (UdeM)-Centre Hospitalier de l'Université de Montréal (CHUM)
Université de Montréal (UdeM)-Université de Montréal (UdeM)
Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB
Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST)
Plateforme d'Exploration du Métabolisme PFEM
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Source :
European RFMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France., 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020
Publication Year :
2020
Publisher :
HAL CCSD, 2020.

Abstract

IntroductionMetabolic syndrome (MetS), defined as a cluster of cardiometabolic factors, is a public health challenge because of its growing prevalence. In the context of personalized medicine, new tools are necessary to bring additional knowledge about MetS etiology, better stratify populations and customise strategies for prevention. The objective of this study was to characterize the MetS phenotypic spectrum using complementary untargeted metabolomics platforms (HRMS, RMN).Technological and methodological innovationA case-control study was designed within the Quebec NuAge cohort1. Six complementary untargetedmetabolomic/lipidomic approaches were performed on serum samples collected at recruitment and 3 years later. Procedures were set up to guaranty the inter-laboratory standardisation from sample preparation to data processing, performed using reproducible online Galaxy workflows. A full feature selection strategy was developed to build a comprehensive molecular MetS signature, stable over time.Results and impactA wide range of metabolites (lipids, carbohydrates, amino-acids, peptides…) reflecting subject stability and providing new insights about underlying mechanisms, were found to be modulated. An optimized reduced signature was proposed, allowing good prediction performances (12% misclassification, AUC=0.95, CI:[0.92-0.98]). These results demonstrated the interest of a multidimensional molecular phenotyping as part of the next generation of medicine tools in the frame of noncommunicable diseases.References[1] Gaudreau P et al., 2007. Rejuvenation Res.10(3):377-386.

Details

Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
European RFMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France., 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..eb51d6d628945fc1c03f1b5665bda926