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INPUT OF DEEP PHENOTYPING IN THE METABOLIC SYNDROME STRATIFICATION
Authors :
Monnerie, Stéphanie Pétéra, Mélanie Canlet, Cécile Castelli, Florence Colsch, Benoit Fenaille, Francois Joly, Charlotte Jourdan, Fabien Lenuzza, Natacha Lyan, Bernard Martin, Jean-Francois Migné, Carole Morais, José A Poupin, Nathalie Vinson, Florence Thevenot, Etienne Junot, Christophe Gaudreau, Pierrette Comte, Blandine Pujos-Guillot, Estelle Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA) Plateforme d’Exploration du Métabolisme Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) ToxAlim (ToxAlim) Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - 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Source :
European RFMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France., 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020
Publication Year :
2020
Publisher :
HAL CCSD, 2020.
Abstract
IntroductionMetabolic syndrome (MetS), defined as a cluster of cardiometabolic factors, is a public health challenge because of its growing prevalence. In the context of personalized medicine, new tools are necessary to bring additional knowledge about MetS etiology, better stratify populations and customise strategies for prevention. The objective of this study was to characterize the MetS phenotypic spectrum using complementary untargeted metabolomics platforms (HRMS, RMN).Technological and methodological innovationA case-control study was designed within the Quebec NuAge cohort1. Six complementary untargetedmetabolomic/lipidomic approaches were performed on serum samples collected at recruitment and 3 years later. Procedures were set up to guaranty the inter-laboratory standardisation from sample preparation to data processing, performed using reproducible online Galaxy workflows. A full feature selection strategy was developed to build a comprehensive molecular MetS signature, stable over time.Results and impactA wide range of metabolites (lipids, carbohydrates, amino-acids, peptides…) reflecting subject stability and providing new insights about underlying mechanisms, were found to be modulated. An optimized reduced signature was proposed, allowing good prediction performances (12% misclassification, AUC=0.95, CI:[0.92-0.98]). These results demonstrated the interest of a multidimensional molecular phenotyping as part of the next generation of medicine tools in the frame of noncommunicable diseases.References[1] Gaudreau P et al., 2007. Rejuvenation Res.10(3):377-386.
Details
Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
European RFMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France., 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020, European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..eb51d6d628945fc1c03f1b5665bda926