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Estructura y variabilidad genética del bisonte americano (Bison bison) en México

Authors :
Joel Domínguez-Viveros
Guadalupe Nelson Aguilar-Palma
Rafael Villa-Angulo
Nancy Hernández-Rodríguez
José Manuel Pérez-Cantú
Flora Moir
Pedro Calderón-Domínguez
Source :
Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias. 14:339-348
Publication Year :
2023
Publisher :
Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias, 2023.

Abstract

Los objetivos fueron analizar la estructura y variabilidad genética del bisonte americano con marcadores genéticos de tipo SNP. Se muestrearon 174 bisontes y se analizaron 42,366 SNP distribuidos en los 29 cromosomas. Se estimó la heterocigosis esperada (He) y observada (Ho), contenido de información polimórfica (CIP), índice de fijación (FIS), índice de Shannon (IS), desequilibrio de ligamiento y relación de parentesco (Rij; %), así como el tamaño efectivo de población (Ne). Se realizó un análisis de estructura genética para inferir cuántas líneas o genomas (k) definen la población. Se identificó y seleccionó un panel con 2,135 SNP polimórficos, con un promedio de 74 SNP por cromosoma. En el proceso de exclusión, 84.5 % fueron monomórficos, 8.5 % con porcentaje de usables menor a 90 %, 6.3 % con frecuencia del alelo menor inferior a 0.01 y 0.70 % por desequilibrio Hardy-Weinberg (P

Details

ISSN :
24486698 and 20071124
Volume :
14
Database :
OpenAIRE
Journal :
Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias
Accession number :
edsair.doi...........08b1a5b33e1820315cd251cc5abc48ca
Full Text :
https://doi.org/10.22319/rmcp.v14i2.6250