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Molecular phylogenetic study of Pinus in Korea based on chloroplast DNA psbA-trnH and atpF-H sequences data
- Source :
- Korean Journal of Plant Taxonomy. 44:111-118
- Publication Year :
- 2014
- Publisher :
- The Korean Society of Plant Taxonomists, 2014.
-
Abstract
- This study aims to define the phylogenetic relationship within Korean Pinus L. and to find themolecular markers which resolve the phylogenetic relationship in genus Pinus. cpDNA atpF-H and psbA-trnHregions were used as molecular markers. We performed the molecular phylogenetic study on 17 taxa of Pinus inKorea. The combined analyses of two gene loci showed that Korean Pinus was a monophyletic group supportedby 100% BP. According to the results of separate analyses, psbA-trnH region seems to work better resolvingpower to clarify the phylogenetic ambiguity in Korean Pinus than those of atpF-H region. Also, we tried tochecked the value and resolution of two chloroplast DNA loci on phylogenetic implications. Keywords: Pinus, subgenus Diploxylon & Haploxylon, atpF-H, psbA-trnH 적 DNA 요: 엽록체 atpF-H, psbA-trnH region을 마커로활용하여국내에분포하는 소나무속 식물들 중 17분류군에 대한 분자계통학적 연구를 수행하여 한국산 소나무속의 계통학적 유연관계를 규명하고, 소나무속의유연관계를 잘 나타낼 수 있는 분자마커를 찾아내고자 연구가 수행되었다. atpF-H, psbA-trnH region의 조합분석결과 한국산 소나무속은 100%의 BP로 지지되는 단계통군으로 확인되었으며, 소나무아속과 잣나무아속으로 명확히 구분되어졌다. 본 연구에서 이용된 두 개의 분자마커 중 psbA-trnH region이 atpF-H region보다한국산 소나무속의 계통 및 유연관계를 규명하는데 다소 높은 해상력을 나타내었다.
Details
- ISSN :
- 12258318
- Volume :
- 44
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Korean Journal of Plant Taxonomy
- Accession number :
- edsair.doi...........90eb6e2e1c254f115990bee8b912fa5b