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Epsilonproteobacteria dominate bacterial diversity at a natural tar seep

Authors :
Phil M. Oger
Florence Lormières
Microbiologie, adaptation et pathogénie (MAP)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon
Adaptation aux milieux extrêmes (AME)
Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon)
Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement [Lyon] (LGL-TPE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)
Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon)
Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement (LGL-TPE)
École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Source :
Comptes Rendus Biologies, Comptes Rendus Biologies, Elsevier, 2017, 340 (4), pp.238-243. ⟨10.1016/j.crvi.2016.10.001⟩, Comptes Rendus Biologies, 2017, 340 (4), pp.238-243. ⟨10.1016/j.crvi.2016.10.001⟩
Publication Year :
2017
Publisher :
HAL CCSD, 2017.

Abstract

International audience; The bacterial diversity of a naturally seeping bitumen source was investigated by 16S rRNA gene cloning and sequencing. Epsilonproteobacteria were shown to dominate the bacterial diversity in the underground water and within the bitumen, representing ca. 75% of the total bacterial diversity. These Epsilonproteobacteria were dominated by Sulfurimonas OTUs, while Sulfurovum and Arcobacter OTUs completed the remaining diversity. Epsilonproteobacteria are sulfur-oxidizer, nitrate-reducing chemo-lithoautotrophic bacteria, unable to use most organics for growth but capable of CO2 fixation. Thus, reduced sulfur species, but not the complex organic matter of the tar, are utilized for growth by bacterial communities at the Puy-de-la-Poix. The large prevalence of populations of Epsilonproteobacteria is a clear indication that crude oil offers a competitive ecological niche for these organisms.

Details

Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
Comptes Rendus Biologies, Comptes Rendus Biologies, Elsevier, 2017, 340 (4), pp.238-243. ⟨10.1016/j.crvi.2016.10.001⟩, Comptes Rendus Biologies, 2017, 340 (4), pp.238-243. ⟨10.1016/j.crvi.2016.10.001⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....01c8b5413518b3f49c16f5d2fdb4244a