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Functional analysis via standardized whole-blood stimulation systems defines the boundaries of a healthy immune response to complex stimuli
Authors :
Ivo Gomperts-Boneca Ludovic Deriano Spencer L. Shorte Annick Dubois Anavaj Sakuntabhai Claude Leclerc Caroline Demangel Ana Cumano Lluis Quintana-Murci Matthew L. Albert Antonio A. Freitas Antoine Toubert Lars Rogge Manfred Schmolz Gérard Eberl Vincent Rouilly Valentina Libri Alejandra Urrutia James P. Di Santo Eric Tartour Marie-Noëlle Ungeheuer Françoise Dromer Hugo Mouquet Olivier Schwartz Benoit Beitz Mikael David Olivier Lantz Stéphanie Thomas Ivo G. Boneca Philippe Bousso Laurent Abel Vassili Soumelis Cécile Delval Darragh Duffy Benno Schwikowski Frédéric Tangy Serge Hercberg Jost Enninga Milena Hasan Samuel S.T. LaBrie Sandra Pellegrini Aurélie Bisiaux Stanislas Pol Marc Daëron Andrés Alcover Immunobiologie des Cellules dendritiques Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Centre de Recherche Translationnelle - Center for Translational Science (CRT) Institut Pasteur [Paris] (IP) Centre d'Immunologie Humaine (CIH) Substances Lichéniques et Photoprotection Université de Rennes (UR) Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI) Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Immunobiologie des Cellules Dendritiques Myriad rules based medicine Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire Biologie et Génétique de la Paroi bactérienne - Biology and Genetics of Bacterial Cell Wall (BGPB) Laboratoire de géographie physique : Environnements Quaternaires et Actuels (LGP) Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Département d'Immunologie - Department of Immunology Immunorégulation Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Génétique Evolutive Humaine - Human Evolutionary Genetics Laboratory of Cellular Physiology and Immunology and Chris Browne Center Rockefeller University [New York] St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163) Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Biologie Cellulaire des Lymphocytes - Lymphocyte Cell Biology Dynamiques des Réponses Immunes Lymphopoïèse (Lymphopoïèse (UMR_1223 / U1223 / U-Pasteur_4)) Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Cellule Pasteur Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-PRES Sorbonne Paris Cité Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy (CIML) Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Immunobiologie de l'Infection - Immunobiology of Infection Département de Génomes et Génétique - Department of Genomes and Genetics Mycologie moléculaire Centre National de Référence Mycologie et Antifongiques-Mycologie Moléculaire (CNRMA) Microenvironnement et Immunité - Microenvironment and Immunity Dynamique des Interactions Hôte-Pathogène - Dynamics of Host-Pathogen Interactions Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153) Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM) HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Institut de formation en masso-kinésithérapie (IFMK Brest) Université de Brest (UBO)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest) Réponse humorale aux pathogènes Signalisation des Cytokines - Cytokine Signaling Service d'hépatologie médicale [CHU Cochin] Hôpital Cochin [AP-HP] Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP) Génétique fonctionnelle des Maladies infectieuses - Functional Genetics of Infectious Diseases Centre de recherche sur les liens sociaux (CERLIS - UMR 8070) Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Biologie systémique - Systems Biology Imagopole (CITECH) Laboratoire d'Immunologie Clinique Institut Curie [Paris] Génomique virale et vaccination Cytokines et Immunologie des Tumeurs Humaines (U753) Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Hôpital Saint-Louis Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) Investigation Clinique et d’Accès aux Ressources Biologiques (Plate-forme) - Clinical Investigation and Access to BioResources (ICAReB) This work benefited from support of the French government’s Invest in the Future Program, managed by the Agence Nationale de la Recherche (ANR, reference 10-LABX-69-01). We also acknowledge A. Pugsley for his support in obtaining funding and the logistical aspects of initiating the project Milieu Intérieur Consortium (32 collaborateurs) : Abel L, Alcover A, Bousso P, Cumano A, Daëron M, Delval C, Demangel C, Deriano L, Di Santo J, Dromer F, Eberl G, Enninga J, Freitas A, Gomperts-Boneca I, Hercberg S, Lantz O, Leclerc C, Mouquet H, Pellegrini S, Pol S, Rogge L, Sakuntabhai A, Schwartz O, Schwikowski B, Shorte S, Soumelis V, Tangy F, Tartour E, Toubert A, Ungeheuer MN, Quintana-Murci L, Albert ML. ANR-10-LABX-0069,MILIEU INTERIEUR,GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE(2010) Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Institut Pasteur [Paris] Université de Rennes 1 (UR1) Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES) Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris] Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Paris 13 (UP13)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)) Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-Université de Brest (UBO) Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) Centre de Recherche Translationnelle ( CRT ) Centre d'Immunologie Humaine ( CIH ) Université de Rennes 1 ( UR1 ) Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses ( CIMI ) Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) Biologie et Génétique de la Paroi bactérienne Laboratoire de géographie physique ( LGP ) Université Panthéon-Sorbonne ( UP1 ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) Département d'Immunologie Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) rockefeller university St. Giles Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Rockefeller Branch Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ) Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) Biologie Cellulaire des Lymphocytes Lymphopoïèse Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -PRES Sorbonne Paris Cité Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy ( CIML ) Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) Immunobiologie de l'Infection Département de Génomes et Génétique Centre National de Référence Mycologie et Antifongiques-Mycologie Moléculaire ( CNRMA ) Microenvironnement et Immunité Dynamique des Interactions Hôte-Pathogène Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle ( CRESS - 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Paris 5 ( UPD5 ) -Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3 Biologie systémique Imagopole ( CITECH ) Institut Curie Institut Curie-Institut Curie Cytokines et Immunologie des Tumeurs Humaines ( U753 ) Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) Investigation Clinique et d’Accès aux Ressources Biologiques (Plate-forme) - Clinical Investigation and Access to BioResources ( ICAReB ) ANR : 10-LABX-0069,MILIEU INTERIEUR,GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE ( 2010 ) Centre de Recherche Translationnelle (CRT) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Panthéon-Sorbonne (UP1) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)) CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP) Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP) ANR: 10-LABX-0069,MILIEU INTERIEUR,GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE(2010)
Source :
Immunity, Immunity, 2014, 40 (3), pp.436-50. ⟨10.1016/j.immuni.2014.03.002⟩, Immunity, Elsevier, 2014, 40 (3), pp.436-50. ⟨10.1016/j.immuni.2014.03.002⟩, Immunity, Elsevier, 2014, 40 (3), pp.436-50. 〈10.1016/j.immuni.2014.03.002〉
Publication Year :
2014
Publisher :
HAL CCSD, 2014.
Abstract
International audience; Standardization of immunophenotyping procedures has become a high priority. We have developed a suite of whole-blood, syringe-based assay systems that can be used to reproducibly assess induced innate or adaptive immune responses. By eliminating preanalytical errors associated with immune monitoring, we have defined the protein signatures induced by (1) medically relevant bacteria, fungi, and viruses; (2) agonists specific for defined host sensors; (3) clinically employed cytokines; and (4) activators of T cell immunity. Our results provide an initial assessment of healthy donor reference values for induced cytokines and chemokines and we report the failure to release interleukin-1α as a common immunological phenotype. The observed naturally occurring variation of the immune response may help to explain differential susceptibility to disease or response to therapeutic intervention. The implementation of a general solution for assessment of functional immune responses will help support harmonization of clinical studies and data sharing.
Details
Language :
English
ISSN :
10747613
Database :
OpenAIRE
Journal :
Immunity, Immunity, 2014, 40 (3), pp.436-50. ⟨10.1016/j.immuni.2014.03.002⟩, Immunity, Elsevier, 2014, 40 (3), pp.436-50. ⟨10.1016/j.immuni.2014.03.002⟩, Immunity, Elsevier, 2014, 40 (3), pp.436-50. 〈10.1016/j.immuni.2014.03.002〉
Accession number :
edsair.doi.dedup.....0c9c32a1b940cf9c0d80beab85bfaab8
Full Text :
https://doi.org/10.1016/j.immuni.2014.03.002⟩