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Brainhack: Developing a culture of open, inclusive, community-driven neuroscience
Authors :
Selim Melvin Atay Iska Moxon-Emre Anders Eklund Paula P. Brooks Nandita Vijayakumar Anibal Sólon Heinsfeld Jean-Baptiste Poline Yaroslav O. Halchenko David Meunier Daniela M. Hohmann Martin Szinte Arshitha Basavaraj Andrija Štajduhar Link Tejavibulya Michael Dayan Anisha Keshavan Chao Jiang Felix Hoffstaedter Michael P. Milham Davide Momi Hua Xie Ai Wern Chung Georg Langs Hao-Ting Wang Xenia Kobeleva Robert Oostenveld Thomas G. Close Lena Dorfschmidt Jesse A. Brown Serge Koudoro J.P. Manzano-Patron Isil P. Bilgin Shreyas Fadnavis Sylvain Takerkart R. Cameron Craddock Stephan Heunis Scott Peltier Kathryn Berluti Hayli Spence Pablo F. Damasceno David H. O’Connor Eleftherios Garyfallidis Eugene P. Duff Rudolph Pienaar Nicolas Traut AmanPreet Badhwar Ali R. Khan Marissa Laws Abigail S. Greene Richard A. I. Bethlehem Angela R. Laird Krista DeStasio Ina Thome Camille Maumet Alexandru D. Iordan P. Christiaan Klink Damion V. Demeter John A. Onofrey Cassandra D. Gould van Praag Jakub Vohryzek Suzanne T. Witt Aysha Motala Valerie Hayot-Sasson Geetika Gupta Alexandre Rosa Franco John W. VanMeter Michel Thiebaut de Schotten James M. Shine Lucina Q. Uddin Thomas S. Hartmann Guillaume Flandin Clara Moreau Tomislav Lipic Claire Bradley Fernando A. Barrios Daniel S. Margulies R. Austin Benn Sofie Van Den Bossche Lydia Riedl Xihe Xie Christopher R. Madan Roberto Toro Viviana Siless Fabrizio De Vico Fallani Nikoloz Sirmpilatze Emily Olafson Anqi Qiu Theresa W. Cheng Valentina Borghesani Sidhant Chopra Claire Cury Giorgio Marinato Horea-Ioan Ioanas Giorgia Cona Michael Joseph Angela Tam Mathias Scharinger Daniel A. Handwerker Katherine L. Bottenhorn Sina Mansour L Kathryn L. Mills Christopher J. Markiewicz Elizabeth Levitis Cyril Pernet Stephanie J. Forkel Agah Karakuzu Edwina R Orchard Sarah L. Dziura Saige Rutherford Kamalaker Dadi Enrico Glerean Desiree Lussier Davide Poggiali Molly Simmonite Jason Kai Jessica Flannery Ting Xu Jon Haitz Legarreta Nasim Anousheh Marco Bedini Tristan Glatard Thomas E. Nichols Joscelin Rocha-Hidalgo Erin W. Dickie Dipankar Bachar Malin Sandström Xi-Nian Zuo Pedro Pinheiro-Chagas Laura C. Rice Jakša Vukojević Javier Gonzalez-Castillo José C. García Alanis Lorenzo Pasquini Yu-Fang Yang Matteo Mancini Deena Shariq Chao-Gan Yan Laura Tomaz da Silva César Caballero-Gaudes Yasmine Bassil Aurina Arnatkeviciute Dustin Scheinost Satrajit S. Ghosh Gaël Varoquaux Etienne Combrisson Bramsh Qamar Chandio Kelly Garner Tiago Quendera Patrick Friedrich Shawn A. Rhoads Roxane Licandro Elizabeth DuPre Aki Nikolaidis Simon Schwab Stephanie Noble Guillaume Auzias Daniel J. Lurie Mahboobeh Parsapoor Eneko Uruñuela Andrew Doyle Peer Herholz Saampras Ganesan Vincent Koppelmans Corey Horien Samir Das Junaid S. Merchant Siyuan Gao Matheus Marcon Nathalia Bianchini Esper B.T. Thomas Yeo Katja Heuer Caroline O’Brien Micaela Y. Chan Sook-Lei Liew Lindsay D. Oliver Kirstie Whitaker Christoph Vogelbacher Dylan M. Nielson Krisanne Litinas Dorien C. Huijser Pierre Bellec R. Todd Constable David N. Kennedy Julia Sprenger Lea-Theresa Mais Oscar Esteban Patrick J. Park Patrick Callahan Christopher R. Nolan Johanna Bayer Guillaume Dumas Elise Bannier Elizabeth A. McDevitt Ariel Rokem Samuel A. Nastase Olivia W. Stanley Ruggero Basanisi Daniele Marinazzo Gregory Kiar Lisa Novello Samuel Guay John C. Flournoy Stefano Moia Kendra Oudyk Fang-Cheng Yeh Gustav Nilsonne Thomas B. Shaw Steve Wideman Saskia Bollmann Steffen Bollmann Julia M. Huntenburg Augusto Buchweitz Matteo Visconti di Oleggio Castello Dimitra Maoutsa Lucy B. Whitmore Catherine Alice Hahn Antonino Vallesi Remi Gau Felipe Meneguzzi Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL) Yale University [New Haven] Max Planck Institute for Human Cognitive and Brain Sciences [Leipzig] (IMPNSC) Max-Planck-Gesellschaft Florida International University [Miami] (FIU) University of Reading (UOR) University of Würzburg Champalimaud Centre for the Unknown [Lisbon] University of Melbourne University of Cambridge [UK] (CAM) Georgetown University [Washington] (GU) Philipps Universität Marburg = Philipps University of Marburg Université de Montréal (UdeM) University College of London [London] (UCL) University of Sussex Universiteit Gent = Ghent University (UGENT) German Research Center for Neurodegenerative Diseases - Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE) Université de Sherbrooke (UdeS) Middle East Technical University [Ankara] (METU) McGill University = Université McGill [Montréal, Canada] Modelling brain structure, function and variability based on high-field MRI data (PARIETAL) Service NEUROSPIN (NEUROSPIN) Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Inria Saclay - Ile de France Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria) Universiteit Leiden Karolinska Institutet [Stockholm] Princeton University Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH) University of the Basque Country/Euskal Herriko Unibertsitatea (UPV/EHU) University medical center and campus biotech Geneva Emory University [Atlanta, GA] Cardiff University's Brain Research Imaging Centre [Cardiff] (CUBRIC) School of Psychology [Cardiff University] Cardiff University-Cardiff University The University of Sydney Weill Cornell Medicine [Cornell University] Cornell University [New York] Università degli Studi di Padova = University of Padua (Unipd) Jülich Research Centre University of Texas at Austin [Austin] Institut Pasteur [Paris] (IP) Centre de Recherche Interdisciplinaire / Center for Research and Interdisciplinarity [Paris, France] (CRI) Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité) Basque Center on Cognition Brain and Language [Gipuzkoa, Espagne] (BCBL) Linköping University (LIU) University of Queensland [Brisbane] University of New South Wales [Sydney] (UNSW) Universidad Nacional Autónoma de México = National Autonomous University of Mexico (UNAM) University of Maryland [College Park] University of Maryland System University of Washington [Seattle] Harvard Medical School [Boston] (HMS) Child Mind Institute University of Western Ontario (UWO) Indiana University [Bloomington] Indiana University System Monash university Institut de Neurosciences de la Timone (INT) Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Neuroimagerie: méthodes et applications (Empenn) Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5) Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA) Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes) Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique) Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes) Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA) Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique) Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT) National Institute of Mental Health (NIMH) Università degli Studi di Trento (UNITN) Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III [Madrid, Spain] (CNIC) Instituto de Salud Carlos III [Madrid] (ISC) Queensland University of Technology [Brisbane] (QUT) University of California [San Francisco] (UC San Francisco) University of California (UC) Universidade Federal do Rio Grande do Sul [Porto Alegre] (UFRGS) University of Texas at Dallas [Richardson] (UT Dallas) University of Oregon [Eugene] Monash University [Melbourne] Boston Children's Hospital Algorithms, models and methods for images and signals of the human brain (ARAMIS) Sorbonne Université (SU)-Inria de Paris Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM) Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM) Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Institut des Maladies Neurodégénératives [Bordeaux] (IMN) Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Neuroimagerie: méthodes et applications (EMPENN) Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAL, IMAGE ET LANGAGE (IRISA-D6) Chinese Academy of Sciences [Beijing] (CAS) Beijing Normal University (BNU) This project has received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement no. 867458 awarded to Julia M. Huntenburg from ANR-19-DATA-0025 NeuroWebLab for Katja Heuer, Roberto Toro, and Nicholas Traut and from NIH K00MH122372 for Stephanie Noble. Brainhack Community: Nasim Anousheh, Aurina Arnatkeviciute, Guillaume Auzias, Dipankar Bachar, Elise Bannier, Ruggero Basanisi, Arshitha Basavaraj, Marco Bedini, Pierre Bellec, R Austin Benn, Kathryn Berluti, Steffen Bollmann, Saskia Bollmann, Claire Bradley, Jesse Brown, Augusto Buchweitz, Patrick Callahan, Micaela Y Chan, Bramsh Q Chandio, Theresa Cheng, Sidhant Chopra, Ai Wern Chung, Thomas G Close, Etienne Combrisson, Giorgia Cona, R Todd Constable, Claire Cury, Kamalaker Dadi, Pablo F Damasceno, Samir Das, Fabrizio De Vico Fallani, Krista DeStasio, Erin W Dickie, Lena Dorfschmidt, Eugene P Duff, Elizabeth DuPre, Sarah Dziura, Nathalia B Esper, Oscar Esteban, Shreyas Fadnavis, Guillaume Flandin, Jessica E Flannery, John Flournoy, Stephanie J Forkel, Alexandre R Franco, Saampras Ganesan, Siyuan Gao, José C García Alanis, Eleftherios Garyfallidis, Tristan Glatard, Enrico Glerean, Javier Gonzalez-Castillo, Cassandra D Gould van Praag, Abigail S Greene, Geetika Gupta, Catherine Alice Hahn, Yaroslav O Halchenko, Daniel Handwerker, Thomas S Hartmann, Valérie Hayot-Sasson, Stephan Heunis, Felix Hoffstaedter, Daniela M Hohmann, Corey Horien, Horea-Ioan Ioanas, Alexandru Iordan, Chao Jiang, Michael Joseph, Jason Kai, Agah Karakuzu, David N Kennedy, Anisha Keshavan, Ali R Khan, Gregory Kiar, P Christiaan Klink, Vincent Koppelmans, Serge Koudoro, Angela R Laird, Georg Langs, Marissa Laws, Roxane Licandro, Sook-Lei Liew, Tomislav Lipic, Krisanne Litinas, Daniel J Lurie, Désirée Lussier, Christopher R Madan, Lea-Theresa Mais, Sina Mansour L, J P Manzano-Patron, Dimitra Maoutsa, Matheus Marcon, Daniel S Margulies, Giorgio Marinato, Daniele Marinazzo, Christopher J Markiewicz, Camille Maumet, Felipe Meneguzzi, David Meunier, Michael P Milham, Kathryn L Mills, Davide Momi, Clara A Moreau, Aysha Motala, Iska Moxon-Emre, Thomas E Nichols, Dylan M Nielson, Gustav Nilsonne, Lisa Novello, Caroline O'Brien, Emily Olafson, Lindsay D Oliver, John A Onofrey, Edwina R Orchard, Kendra Oudyk, Patrick J Park, Mahboobeh Parsapoor, Lorenzo Pasquini, Scott Peltier, Cyril R Pernet, Rudolph Pienaar, Pedro Pinheiro-Chagas, Jean-Baptiste Poline, Anqi Qiu, Tiago Quendera, Laura C Rice, Joscelin Rocha-Hidalgo, Saige Rutherford, Mathias Scharinger, Dustin Scheinost, Deena Shariq, Thomas B Shaw, Viviana Siless, Molly Simmonite, Nikoloz Sirmpilatze, Hayli Spence, Julia Sprenger, Andrija Stajduhar, Martin Szinte, Sylvain Takerkart, Angela Tam, Link Tejavibulya, Michel Thiebaut de Schotten, Ina Thome, Laura Tomaz da Silva, Nicolas Traut, Lucina Q Uddin, Antonino Vallesi, John W VanMeter, Nandita Vijayakumar, Matteo Visconti di Oleggio Castello, Jakub Vohryzek, Jakša Vukojević, Kirstie Jane Whitaker, Lucy Whitmore, Steve Wideman, Suzanne T Witt, Hua Xie, Ting Xu, Chao-Gan Yan, Fang-Cheng Yeh, B T Thomas Yeo, Xi-Nian Zuo ANR-19-DATA-0025,NeuroWebLab,Un laboratoire de neuroscience collectif: Au delà de FAIR(2019) European Project: 867458,LC-FMR Maumet, Camille Un laboratoire de neuroscience collectif: Au delà de FAIR - - NeuroWebLab2019 - ANR-19-DATA-0025 - DONNEES - VALID Brainhack: Developing a culture of open, inclusive, community-driven neuroscience - LC-FMR - 867458 - INCOMING Leiden University Weill Cornell Medicine [New York] Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC) Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT) University Hospital Bonn Sherbrooke Connectivity Imaging Lab [Sherbrooke] (SCIL) Département d'informatique [Sherbrooke] (UdeS) Faculté des sciences [Sherbrooke] (UdeS) Université de Sherbrooke (UdeS)-Université de Sherbrooke (UdeS)-Faculté des sciences [Sherbrooke] (UdeS) Université de Sherbrooke (UdeS)-Université de Sherbrooke (UdeS) Videos and Images Theory and Analytics Laboratory (VITAL) Inria Saclay - Ile de France Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Service NEUROSPIN (NEUROSPIN) Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) Erasmus University Rotterdam Origami (Origami) Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information (LIRIS) Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon) Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) Université de Lyon-École Centrale de Lyon (ECL) Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon) Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2) Princeton Neuroscience Institute [Princeton] Human Neuroscience Platform Brighton and Sussex Medical School (BSMS) Azienda Ospedale Università di Padova = Hospital-University of Padua (AOUP) Institute of Neuroscience and Medicine [Jülich] (INM-1) Département de Neuroscience - Department of Neuroscience Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPC) Queensland Brain Institute Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) Radboud university [Nijmegen] McGovern Institute for Brain Research [Cambridge] Massachusetts Institute of Technology (MIT) The Brainhack Community - https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33932337 Philipps University of Marburg University of the Basque Country [Bizkaia] (UPV/EHU) Universita degli Studi di Padova Philipps Universität Marburg Institut Pasteur [Paris] Empenn Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes) Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1) Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique) Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes) Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1) University of California [San Francisco] (UCSF) University of California Geochemistry University of Padova [Padova, Italy]
Source :
Neuron, Neuron, 2021, 109 (11), pp.1769-1775. ⟨10.1016/j.neuron.2021.04.001⟩, Neuron, 109(11), 1769. Cell Press, Addi. Archivo Digital para la Docencia y la Investigación, instname, Neuron 109(11), 1769-1775 (2021). doi:10.1016/j.neuron.2021.04.001, Neuron, vol 109, iss 11, Addi: Archivo Digital para la Docencia y la Investigación, Universidad del País Vasco, Neuron, Elsevier, 2021, 109 (11), pp.1769-1775. ⟨10.1016/j.neuron.2021.04.001⟩, Neuron, Elsevier, 2021, pp.S0896-6273(21)00231-2. ⟨10.1016/j.neuron.2021.04.001⟩
Publication Year :
2021
Abstract
Available online 30 April 2021. Brainhack is an innovative meeting format that promotes scientific collaboration and education in an open, inclusive environment. This NeuroView describes the myriad benefits for participants and the research community and how Brainhacks complement conventional formats to augment scientific progress. The present manuscript is part of a growing community effort to collate Brainhack-related insights and expertise into a Jupyter Book (http://brainhack.org/brainhack_jupyter_book/) that will serve as a centralized set of resources for the community; we acknowledge all the individuals who contributed and will make ongoing contributions to these resources. A pre-print version of the present manuscript is available as part of the Jupyter Book. Moreover, we would like to acknowledge all Brainhack organizers, supporters, presenters, and participants for their contribution to growing and maintaining this community. The benefits described in this manuscript would not be possible without them. We also thank all institutions, labs, and organizations who have helped this community grow, meet in stimulating environments, and add an excellent educational resource pool and agenda. With an expanding community, Brainhack’s support network keeps growing, and we thank all labs and individual researchers for their dedication and expertise offered to this community (see http://brainhack.org/brainhack_jupyter_book/acknowledgments.html for a full list of individual acknowledgments; an updated list will be maintained in the Jupyter Book). Grants and funding bodies: This project has received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement no. 867458 awarded to Julia M. Huntenburg; from ANR-19-DATA-0025 NeuroWebLab for Katja Heuer, Roberto Toro, and Nicholas Traut; and from NIH K00MH122372 for Stephanie Noble. The Brainhack Community member list and contributions of the different authors are detailed at http://brainhack.org/brainhack_jupyter_book/contributors.html. Our crediting system is described here: http://brainhack.org/brainhack_jupyter_book/neuroview_authorship-agreement.html.
Details
Language :
English
ISSN :
08966273
Volume :
109
Issue :
11
Database :
OpenAIRE
Journal :
Neuron
Accession number :
edsair.doi.dedup.....1a00f1c55be35988569886dbca00dd69
Full Text :
https://doi.org/10.1016/j.neuron.2021.04.001