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The Ectocarpus genome and the independent evolution of multicellularity in brown algae

Authors :
Jean-Marc Aury
Frithjof C. Küpper
Diego Miranda-Saavedra
John H. F. Bothwell
Claire Jubin
Chris Bowler
Bernhard Gschloessl
James W. Tregear
Andrés Ritter
Andrew E. Allen
Carolyn A. Napoli
Ludovic Delage
Bernard Kloareg
Takahiro Yamagishi
Pi Nyvall-Collén
Svenja Heesch
Julia Morales
Gaelle Samson
Kei Kimura
Ga Youn Cho
Grigoris D. Amoutzias
Yves Van de Peer
Simon M. Dittami
Kenny Billiau
Julie Poulain
François Artiguenave
Sylvie Doulbeau
Marek Eliáš
Bank Beszteri
Carl J. Carrano
Daniel Lang
Florian Maumus
Stefan A. Rensing
Jonathan H. Badger
Béatrice Segurens
Martina Strittmatter
Sylvie Rousvoal
Hervé Moreau
Patrice Lerouge
Colin Brownlee
Betsy Read
Akira F. Peters
J. Mark Cock
Corinne Da Silva
Declan C. Schroeder
Catherine Boyen
Pierre Rouzé
Eric Bonnet
Jonas Collén
Susana M. Coelho
Aude Le Bail
Kamel Jabbari
David R. Nelson
Thierry Tonon
Pascal J. Lopez
Véronique Anthouard
Hadi Quesneville
Manoj P. Samanta
Delphine Scornet
Klaus Valentin
Nicolas Delaroque
Bénédicte Charrier
Cindy Martens
Peter von Dassow
Martin Lohr
Garry Farnham
Chikako Nagasato
Claire M. M. Gachon
Gurvan Michel
Lieven Sterck
Philippe Potin
Erwan Corre
Catherine Leblanc
Taizo Motomura
Cyril Pommier
Patrick Wincker
Hiroshi Kawai
Publica
Végétaux marins et biomolécules
Station biologique de Roscoff [Roscoff] (SBR)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-GOEMAR-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Department of Plant Systems Biology
State University of Ghent
J Craig Venter Institute
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE)
Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay
Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI)
Marine Biological Association
Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS)
Département de Biologie - ENS Paris
École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
San Diego State University (SDSU)
Phophorylation de protéines et Pathologies Humaines (P3H)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff (SBR)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Fraunhofer Institute for Cell Therapy and Immunology (IZI)
Diversité et adaptation des plantes cultivées (UMR DIAPC)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)
Charles University [Prague]
Scottish Association for Marine Science (SAMS)
Kobe University
Institute of Algological Research [Muroran]
Hokkaido University
Fakultät für Biologie = Faculty of Biology [Freiburg]
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire de Glycobiologie et Matrice Extracellulaire Végétale (Glyco-MEV)
Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)
Johannes Gutenberg - Universität Mainz (JGU)
École normale supérieure - Paris (ENS Paris)
Institut de biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS)
École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Department of Haematology
University of Cambridge [UK] (CAM)
Mer et santé (MS)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Observatoire océanologique de Banyuls (OOB)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
University of Arizona
The University of Tennessee Health Science Center [Memphis] (UTHSC)
Unité de Recherche Génomique Info (URGI)
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Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines (LBCM)
Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Systemix Institute
Savelli, Bruno
Center for Plant Systems Biology (PSB Center)
Vlaams Instituut voor Biotechnologie [Ghent, Belgique] (VIB)
J. Craig Venter Institute
Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS)
École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Adaptation et diversité en milieu marin (AD2M)
Fraunhofer Institute for Cell Therapy and Immunology (Fraunhofer IZI)
Fraunhofer (Fraunhofer-Gesellschaft)
Charles University [Prague] (CU)
Hokkaido University [Sapporo, Japan]
Johannes Gutenberg - Universität Mainz = Johannes Gutenberg University (JGU)
Université Paris sciences et lettres (PSL)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
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Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)
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Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris
Source :
Nature, Nature, Nature Publishing Group, 2010, 465 (7298), pp.617-621. ⟨10.1038/nature09016⟩, Nature, 2010, 465 (7298), pp.617-621. ⟨10.1038/nature09016⟩
Publication Year :
2010

Abstract

Brown algae (Phaeophyceae) are complex photosynthetic organisms with a very different evolutionary history to green plants, to which they are only distantly related. These seaweeds are the dominant species in rocky coastal ecosystems and they exhibit many interesting adaptations to these, often harsh, environments. Brown algae are also one of only a small number of eukaryotic lineages that have evolved complex multicellularity (Fig. 1). We report the 214 million base pair (Mbp) genome sequence of the filamentous seaweed Ectocarpus siliculosus (Dillwyn) Lyngbye, a model organism for brown algae, closely related to the kelps (Fig. 1). Genome features such as the presence of an extended set of light-harvesting and pigment biosynthesis genes and new metabolic processes such as halide metabolism help explain the ability of this organism to cope with the highly variable tidal environment. The evolution of multicellularity in this lineage is correlated with the presence of a rich array of signal transduction genes. Of particular interest is the presence of a family of receptor kinases, as the independent evolution of related molecules has been linked with the emergence of multicellularity in both the animal and green plant lineages. The Ectocarpus genome sequence represents an important step towards developing this organism as a model species, providing the possibility to combine genomic and genetic approaches to explore these and other aspects of brown algal biology further. © 2010 Macmillan Publishers Limited. All rights reserved.

Details

Language :
English
ISSN :
00280836, 14764679, and 14764687
Database :
OpenAIRE
Journal :
Nature, Nature, Nature Publishing Group, 2010, 465 (7298), pp.617-621. ⟨10.1038/nature09016⟩, Nature, 2010, 465 (7298), pp.617-621. ⟨10.1038/nature09016⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....27488261cc1738bc3b513f9f42e7ac2a
Full Text :
https://doi.org/10.1038/nature09016⟩