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Droplet Microfluidic and Magnetic Particles Platform for Cancer Typing

Authors :
Bruno Teste
Marco Serra
Laurent Malaquin
Jean-Louis Viovy
Jérôme Champ
Stéphanie Descroix
Davide Ferraro
Patricia de Cremoux
Physico-Chimie-Curie (PCC)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Service de Génétique
Institut Curie-Hôpital
Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Centre de Recherches en Psychologie Cognition et Communication (CRPCC EA 1285)
Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-MEN : EA1285-Université de Rennes 2 (UR2)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)
Université Paris sciences et lettres (PSL)
Équipe Ingénierie pour les sciences du vivant (LAAS-ELIA)
Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS)
Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Pathologie cellulaire : aspects moléculaires et viraux / Pathologie et Virologie Moléculaire
Institut Universitaire d'Hématologie (IUH)
Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Toulouse Capitole (UT Capitole)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)
Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole)
Université de Toulouse (UT)
Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Source :
Microchip Diagnostics, Microchip Diagnostics, pp.113-121, 2017, 978-1-4939-6732-2. ⟨10.1007/978-1-4939-6734-6_9⟩, Methods in Molecular Biology ISBN: 9781493967322
Publication Year :
2017
Publisher :
HAL CCSD, 2017.

Abstract

International audience; Analyses of nucleic acids are routinely performed in hospital laboratories to detect gene alterations for cancer diagnosis and treatment decision. Among the different possible investigations, mRNA analysis provides information on abnormal levels of genes expression. Standard laboratory methods are still not adapted to the isolation and quantitation of low mRNA amounts and new techniques needs to be developed in particular for rare subsets analysis. By reducing the volume involved, time process, and the contamination risks, droplet microfluidics provide numerous advantages to perform analysis down to the single cell level.We report on a droplet microfluidic platform based on the manipulation of magnetic particles that allows the clinical analysis of tumor tissues. In particular, it allows the extraction of mRNA from the total-RNA sample, Reverse Transcription, and cDNA amplification, all in droplets.

Details

Language :
English
ISBN :
978-1-4939-6732-2
ISBNs :
9781493967322
Database :
OpenAIRE
Journal :
Microchip Diagnostics, Microchip Diagnostics, pp.113-121, 2017, 978-1-4939-6732-2. ⟨10.1007/978-1-4939-6734-6_9⟩, Methods in Molecular Biology ISBN: 9781493967322
Accession number :
edsair.doi.dedup.....399d8b17b8cae1292469766cf7005080