Development of image analysis software for quantification of viable cells in microchips

Over the past few years, image analysis has emerged as a powerful tool for analyzing various cell biology parameters in an unprecedented and highly specific manner. The amount of data that is generated requires automated methods for the processing and analysis of all the resulting information. The software available so far are suitable for the processing of fluorescence and phase contrast images, but often do not provide good results from transmission light microscopy images, due to the intrinsic variation of the acquisition of images technique itself (adjustment of brightness / contrast, for instance) and the variability between image acquisition introduced by operators / equipment. In this contribution, it has been presented an image processing software, Python based image analysis for cell growth (PIACG), that is able to calculate the total area of the well occupied by cells with fusiform and rounded morphology in response to different concentrations of fetal bovine serum in microfluidic chips, from microscopy images in transmission light, in a highly efficient way. Fil: Georg, Maximilian. University of Freiburg; Alemania Fil: Fernández Cabada, Tamara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ingeniería; Argentina Fil: Bourguignon, Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ingeniería; Argentina Fil: Karp, Paola Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina Fil: Peñaherrera Pazmiño, Ana Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ingeniería; Argentina Fil: Helguera, Gustavo Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina Fil: Lerner, Betiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ingeniería; Argentina Fil: Perez, Maximiliano Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ingeniería; Argentina Fil: Mertelsmann, Roland. University of Freiburg; Alemania