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Etest ECVs/ECOFFs for detection of resistance in prevalent and three non-prevalent Candida spp. to triazoles and amphotericin B and Aspergillus spp. to caspofungin: Further assessment of modal variability

Authors :
Damien Dupont
John D. Turnidge
J Fuller
Maiken Cavling Arendrup
A Forastiero
M Dehais
Emilia Cantón
Hélène Guegan
Nathalie Bourgeois
Ana Espinel-Ingroff
Guillermo Garcia-Effron
Laurence Delhaes
B. Bouteille
Teresa Peláez
J Garcia
Cornelia Lass-Flörl
Jesús Guinea
Arnaud Fekkar
Nelesh P. Govender
Françoise Botterel
Eric Dannaoui
Gloria M. González
R Magobo
Sophie Cassaing
Michaela Lackner
Milène Sasso
Sandrine Houzé
Virginia Commonwealth University (VCU)
Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (CHU)
University of Adelaide
Statens Serum Institut [Copenhagen]
CHU Henri Mondor
CHU Limoges
CHU Toulouse [Toulouse]
Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)
Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle (ESCAPE)
Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)
CHU Bordeaux [Bordeaux]
Hospices Civils de Lyon, Departement de Neurologie (HCL)
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
University of Western Ontario (UWO)
Universidad Nacional del Litoral [Santa Fe] (UNL)
Hospital Universitario La Paz
Universidad Autonoma de Nuevo Leon [Mexique] (UANL)
National Institute for Communicable Diseases [Johannesburg] (NICD)
Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset)
Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Hospital General Universitario 'Gregorio Marañón' [Madrid]
Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Paris (UP)
Leopold Franzens Universität Innsbruck - University of Innsbruck
Universidad de Oviedo [Oviedo]
CHU Henri Mondor [Créteil]
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)
Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité)
Source :
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2021, pp.AAC0109321. ⟨10.1128/AAC.01093-21⟩, ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY, r-IIS La Fe. Repositorio Institucional de Producción Científica del Instituto de Investigación Sanitaria La Fe, instname, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2021, 65 (11), pp.AAC0109321. ⟨10.1128/AAC.01093-21⟩
Publication Year :
2021
Publisher :
HAL CCSD, 2021.

Abstract

International audience; Susceptibility testing is an important tool in the clinical setting; its utility is based on the availability of categorical endpoints, breakpoints (BPs) or epidemiological cutoff values (ECVs/ECOFFs). CLSI and EUCAST have developed antifungal susceptibility testing, BPs and ECVs for some fungal species. Although the Concentration Gradient Strip BioMerieux Etest is useful for routine testing in the clinical laboratory, ECVs are not available for all agent/species; the lack of clinical data precludes development of BPs. We re-evaluated and consolidated Etest data points from three previous studies, and included new data. We defined ECOFFinder Etest ECVs for three sets of species/agent combinations: fluconazole, posaconazole and voriconazole and 8 Candida spp.; amphotericin B and 3 non-prevalent Candida spp.; and caspofungin and 5 Aspergillus spp. The total of Etest MICs from 23 laboratories (Europe, the Americas, South Africa) included (antifungal agent/dependent): 17,242 Candida albicans, 244 C. dubliniensis, 5,129 C. glabrata species complex (SC), 275 C. guilliermondii (Meyerozyma guilliermondii), 1,133 C. krusei (Pichia kudriavzevii), 933 C. kefyr (Kluyveromyces marxianus), 519 C. lusitaniae (Clavispora lusitaniae), 2,947 C. parapsilosis SC, 2,214 C. tropicalis, 3,212 Aspergillus fumigatus, 232 A. flavus, 181 A. niger, and 267 A. terreus SC isolates. Triazole MICs for 66 confirmed non-wild-type (non-WT) Candida isolates were available (ERG11 point mutations). Distributions fulfilling CLSI ECV criteria were pooled and ECOFFinder Etest ECVs were established for triazoles (9 Candida spp.); amphotericin B (3 less-prevalent Candida spp.) and caspofungin (4 Aspergillus spp.). Etest fluconazole ECVs could be good detectors of Candida non-WT isolates (59/61 Non-WT: 4 of 6 species).

Details

Language :
English
ISSN :
00664804 and 10986596
Database :
OpenAIRE
Journal :
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2021, pp.AAC0109321. ⟨10.1128/AAC.01093-21⟩, ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY, r-IIS La Fe. Repositorio Institucional de Producción Científica del Instituto de Investigación Sanitaria La Fe, instname, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2021, 65 (11), pp.AAC0109321. ⟨10.1128/AAC.01093-21⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....701599d1aaad957f533fd2f731b35463