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Prospecção de Proteínas do Novo Coronavírus Covid-2019 e Potencial da Bioinformática na Busca de Novas Drogas Promissoras
- Source :
- Cadernos de Prospecção; Vol. 13 No. 2 (2020): Edição Especial-Coronavírus (SARS-COV-2) e COVID-19; 347, Cadernos de Prospecção; v. 13 n. 2 (2020): Edição Especial-Coronavírus (SARS-COV-2) e COVID-19; 347, Cadernos de Prospecção, Universidade Federal da Bahia (UFBA), instacron:UFBA
- Publication Year :
- 2020
- Publisher :
- Universidade Federal da Bahia, 2020.
-
Abstract
- COVID-2019 disease, caused by the 2019-nCOV virus or SARS-Cov-2, adds up to just over 290 thousand cases and 12 thousand deaths worldwide. No clinical studies are indicating effective treatments, and the identification of suitable antiviral agents is a crucial step in combating the pandemic. This research constitutes a survey of SARS-Cov-2 proteins from the Protein Data Bank (PDB), eligible as targets for docking of inhibitory substances. later, in silico tests were performed with two enzymatic targets in interaction with the drugs Ledipasvir and Ombitasvir. Prospecting in the PDB reported 29 proteins. 6vsb and 6m17 were selected for docking with Ledispasvir, resulting in interaction energies equal to -6.88 and -6.25kJ / mol, respectively. For the same targets, the drug Ombitasvir obtained -5.96 and -4.53kJ / mol. The study showed the advances in COVID-19 research, presenting 29 structures. The drugs tested showed favorable parameters for continuing in vitro and clinical studies. O vírus COVID-2019, 2019-nCOV ou SARS-Cov-2 soma pouco mais de 290 mil casos e 12 mil mortes pelo mundo. Não existem estudos clínicos indicando tratamentos eficazes, e a identificação de agentes antivirais adequados constitui-se um passo crucial no combate à pandemia. O presente trabalho constitui o levantamento de proteínas do SARS-Cov-2 a partir do Protein Data Bank (PDB), elegíveis como alvos para docagem de substâncias inibitórias. Posteriormente, foram realizados testes in sílico, com dois alvos enzimáticos em interação com os fármacos Ledipasvir e Ombitasvir. A prospecção no PDB reportou 29 proteínas. Selecionou-se 6vsb e 6m17 para docagem com Ledispasvir, resultando energias de interação iguais a -6.88 e -6.25kJ/mol, respectivamente. Para os mesmos alvos, o fármaco Ombitasvir obteve -5,96 e -4,53kJ/mol. O estudo evidenciou o avanço nas pesquisas relacionadas ao COVID-19, apresentando 29 estruturas enzimáticas. Os fármacos Ledipasvir e Ombitasvir apresentaram parâmetros favoráveis para a continuação de estudos in vitro e clínicos.
Details
- ISSN :
- 23170026 and 19831358
- Volume :
- 13
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Cadernos de Prospecção
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....73e35cb9a0f312a584a3a3a7360c4b39
- Full Text :
- https://doi.org/10.9771/cp.v13i2.36008