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An Expressed Sequence Tag collection from the male antennae of the Noctuid moth Spodoptera littoralis: a resource for olfactory and pheromone detection research

Authors :
Christelle Monsempes
Fabrice Legeai
Julie Poulain
Marie-Christine François
Christine Merlin
Nicolas Montagné
Frédérick Gavory
Sébastien Malpel
Martine Maïbèche-Coisne
Emmanuelle Jacquin-Joly
François Cousserans
Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes (BIO3P)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
Biological systems and models, bioinformatics and sequences (SYMBIOSE)
Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)
Développement et Communication Chimique chez les Insectes (DCCI)
Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Physiologie de l'Insecte : Signalisation et Communication (PISC)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech
Biologie Intégrative et Virologie des Insectes [Univ. de Montpellier II] (BIVI)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE)
Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
Universite Pierre et Marie Curie (UPMC) ANR-07-NEURO-037-01 ANR-09-BLAN0239-01
Jacquin Joly, Emmanuelle
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST
Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes ( BIO3P )
Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 )
Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -AGROCAMPUS OUEST
Biological systems and models, bioinformatics and sequences ( SYMBIOSE )
Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA )
Université de Rennes 1 ( UR1 )
Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 )
Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria )
Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA )
Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Développement et Communication Chimique chez les Insectes ( DCCI )
Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Physiologie de l'Insecte : Signalisation et Communication ( PISC )
Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech
Biologie Intégrative et Virologie des Insectes [Univ. de Montpellier II] ( BIVI )
Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 )
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] ( GENOSCOPE )
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA )
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Source :
BMC Genomics, BMC Genomics, 2011, 12 (86), pp.86. ⟨10.1186/1471-2164-12-86⟩, BMC Genomics 86 (12), 1-18. (2011), BMC Genomics, BioMed Central, 2011, 12, pp.86. ⟨10.1186/1471-2164-12-86⟩, BMC Genomics, Vol 12, Iss 1, p 86 (2011), BMC Genomics, BioMed Central, 2011, 12, pp.86. 〈10.1186/1471-2164-12-86〉, BMC Genomics, BioMed Central, 2011, 12 (86), pp.86. ⟨10.1186/1471-2164-12-86⟩
Publication Year :
2011
Publisher :
HAL CCSD, 2011.

Abstract

Background Nocturnal insects such as moths are ideal models to study the molecular bases of olfaction that they use, among examples, for the detection of mating partners and host plants. Knowing how an odour generates a neuronal signal in insect antennae is crucial for understanding the physiological bases of olfaction, and also could lead to the identification of original targets for the development of olfactory-based control strategies against herbivorous moth pests. Here, we describe an Expressed Sequence Tag (EST) project to characterize the antennal transcriptome of the noctuid pest model, Spodoptera littoralis, and to identify candidate genes involved in odour/pheromone detection. Results By targeting cDNAs from male antennae, we biased gene discovery towards genes potentially involved in male olfaction, including pheromone reception. A total of 20760 ESTs were obtained from a normalized library and were assembled in 9033 unigenes. 6530 were annotated based on BLAST analyses and gene prediction software identified 6738 ORFs. The unigenes were compared to the Bombyx mori proteome and to ESTs derived from Lepidoptera transcriptome projects. We identified a large number of candidate genes involved in odour and pheromone detection and turnover, including 31 candidate chemosensory receptor genes, but also genes potentially involved in olfactory modulation. Conclusions Our project has generated a large collection of antennal transcripts from a Lepidoptera. The normalization process, allowing enrichment in low abundant genes, proved to be particularly relevant to identify chemosensory receptors in a species for which no genomic data are available. Our results also suggest that olfactory modulation can take place at the level of the antennae itself. These EST resources will be invaluable for exploring the mechanisms of olfaction and pheromone detection in S. littoralis, and for ultimately identifying original targets to fight against moth herbivorous pests.

Details

Language :
English
ISSN :
14712164
Database :
OpenAIRE
Journal :
BMC Genomics, BMC Genomics, 2011, 12 (86), pp.86. ⟨10.1186/1471-2164-12-86⟩, BMC Genomics 86 (12), 1-18. (2011), BMC Genomics, BioMed Central, 2011, 12, pp.86. ⟨10.1186/1471-2164-12-86⟩, BMC Genomics, Vol 12, Iss 1, p 86 (2011), BMC Genomics, BioMed Central, 2011, 12, pp.86. 〈10.1186/1471-2164-12-86〉, BMC Genomics, BioMed Central, 2011, 12 (86), pp.86. ⟨10.1186/1471-2164-12-86⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....7b69fa13bc91506540a056a8b9f66173
Full Text :
https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-86⟩