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Immunoreactive proteins of Saccharopolyspora rectivirgula for farmer's lung serodiagnosis

Authors :
Bénédicte Rognon
Jean-Marc Fellrath
Sandrine Roussel
Isabelle Court-Fortune
Gabriel Reboux
Jean-Charles Dalphin
Manfredo Quadroni
Christophe Zaugg
Coralie Barrera
Michel Monod
Laurence Millon
Stéphane Jouneau
Denis Caillaud
Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Centre Intégratif de Génomique, plateforme de protéomique
Centre Intégratif de Génomique
Service de Pneumologie [Saint-Etienne]
CHU Saint-Etienne
Service de Pneumologie et Allergologie
CHU Clermont-Ferrand
Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset)
Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Technologies et systèmes d'information pour les agrosystèmes (UR TSCF)
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)
Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)
Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA)
Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
Service de Pneumologie et Oncologie thoracique [CHU Saint-Etienne]
Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)
Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Laboratoire Chrono-environnement ( LCE )
Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC )
Institut de recherche, santé, environnement et travail ( Irset )
Université d'Angers ( UA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 )
Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) -Université des Antilles ( UA )
Technologies et systèmes d'information pour les agrosystèmes ( UR TSCF )
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA )
Source :
PROTEOMICS-Clinical Applications, PROTEOMICS-Clinical Applications, Wiley-VCH Verlag, 2014, 8 (11-12), pp.971-81. ⟨10.1002/prca.201400024⟩, PROTEOMICS-Clinical Applications, 2014, 8 (11-12), pp.971-81. ⟨10.1002/prca.201400024⟩, PROTEOMICS-Clinical Applications, Wiley-VCH Verlag, 2014, 8 (11-12), pp.971-81. 〈10.1002/prca.201400024〉
Publication Year :
2014
Publisher :
HAL CCSD, 2014.

Abstract

PURPOSE: Saccharopolyspora rectivirgula is the principal cause of farmer's lung disease (FLD). Serodiagnosis is based on immunoprecipitation techniques or enzyme immunoassays with homemade crude antigens and is not standardized. We aimed to produce specific recombinant antigens for the development of a standardized ELISA. EXPERIMENTAL DESIGN: We recruited 41 patients and 43 healthy exposed controls from five university hospital pneumology departments in France and Switzerland. S. rectivirgula proteins were extracted, separated by 2D electrophoresis, and subjected to Western blotting, with sera from FLD patients or controls. FLD-specific proteins were identified by MS and were produced as recombinant antigens. The diagnostic performance of ELISA tests using the recombinant antigens was assessed with all the sera from FLD patients and controls. RESULTS: We identified 25 FLD-specific proteins, some of which play important roles in transport, nutrition, or virulence. We produced 17 of these proteins as recombinant antigens and assessed their suitability for inclusion in the ELISA test. A combination of three of these proteins (SR1FA, SR17, and SR22) proved remarkably effective at discriminating between patients and controls, with a sensitivity of 83% and a specificity of 77%. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: The recombinant antigens produced in this study constitute a major step toward the improvement of diagnostic performance and the standardization of FLD serodiagnosis.

Details

Language :
English
ISSN :
18628346 and 18628354
Database :
OpenAIRE
Journal :
PROTEOMICS-Clinical Applications, PROTEOMICS-Clinical Applications, Wiley-VCH Verlag, 2014, 8 (11-12), pp.971-81. ⟨10.1002/prca.201400024⟩, PROTEOMICS-Clinical Applications, 2014, 8 (11-12), pp.971-81. ⟨10.1002/prca.201400024⟩, PROTEOMICS-Clinical Applications, Wiley-VCH Verlag, 2014, 8 (11-12), pp.971-81. 〈10.1002/prca.201400024〉
Accession number :
edsair.doi.dedup.....8321c05f5a946a07ca7fdd7594476cfa
Full Text :
https://doi.org/10.1002/prca.201400024⟩