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Detection and mapping of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population
- Source :
- Pesquisa Agropecuária Brasileira v.46 n.9 2011, Pesquisa Agropecuária Brasileira, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), instacron:EMBRAPA, Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA-Alice), Pesquisa Agropecuária Brasileira, Volume: 46, Issue: 9, Pages: 1021-1028, Published: SEP 2011, Pesquisa Agropecuária Brasileira, Vol 46, Iss 9, Pp 1021-1028 (2011), ResearcherID, LOCUS Repositório Institucional da UFV, Universidade Federal de Viçosa (UFV), instacron:UFV
- Publication Year :
- 2011
- Publisher :
- Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento, 2011.
-
Abstract
- O objetivo deste trabalho foi verificar a existência de loco letal, em uma população hibrída de eucalipto, e quantificar a distorção de segregação no grupo de ligação 3 do genoma de Eucalyptus. Uma população híbrida de E. grandis x E. urophylla, que segrega quanto à resistência à ferrugem, foi genotipada com 19 marcadores microssatélites do grupo de ligação 3 do genoma de Eucalyptus. Para quantificar a distorção de segregação, modelos de máxima verossimilhança (ML), específicos para população exogâmica, foram utilizados. Esses modelos consideram os genótipos dos marcadores observados e o loco letal como parâmetros. As soluções ML foram obtidas por meio do algoritmo de esperança e maximização. Um loco letal, no grupo de ligação 3, foi verificado e mapeado com alta confiabilidade entre os microssatélites EMBRA 189 e EMBRA 122. Este loco letal causa intensa seleção gamética no genitor masculino. Nessa população, sua posição é de 25 cM de distância do loco que controla a resistência à ferrugem. The objective of this work was to verify the existence of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population, and to quantify the segregation distortion in the linkage group 3 of the Eucalyptus genome. A E. grandis x E. urophylla hybrid population, which segregates for rust resistance, was genotyped with 19 microsatellite markers belonging to linkage group 3 of the Eucalyptus genome. To quantify the segregation distortion, maximum likelihood (ML) models, specific to outbreeding populations, were used. These models consider the observed marker genotypes and the lethal locus viability as parameters. The ML solutions were obtained using the expectation‑maximization algorithm. A lethal locus in the linkage group 3 was verified and mapped, with high confidence, between the microssatellites EMBRA 189 e EMBRA 122. This lethal locus causes an intense gametic selection from the male side. Its map position is 25 cM from the locus which controls the rust resistance in this population.
- Subjects :
- QTL
Outbreeding depression
Population
seleção gamética
rust resistance
Mapeamento genético
Locus (genetics)
Quantitative trait locus
Biology
Genome
resistência à ferrugem
Distorção de segregação
Gene mapping
gametic selection
Genotype
Resistência à ferrugem
lcsh:Agriculture (General)
education
Genetics
education.field_of_study
Eucalyptus
mapeamento genético
lcsh:S1-972
Microsatellite
distorção de segregação
Animal Science and Zoology
Seleção gamética
genetic mapping
segregation distortion
Agronomy and Crop Science
Subjects
Details
- Language :
- English
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Pesquisa Agropecuária Brasileira v.46 n.9 2011, Pesquisa Agropecuária Brasileira, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), instacron:EMBRAPA, Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA-Alice), Pesquisa Agropecuária Brasileira, Volume: 46, Issue: 9, Pages: 1021-1028, Published: SEP 2011, Pesquisa Agropecuária Brasileira, Vol 46, Iss 9, Pp 1021-1028 (2011), ResearcherID, LOCUS Repositório Institucional da UFV, Universidade Federal de Viçosa (UFV), instacron:UFV
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....8c8df9ef8d6bbeb73ff6d95496105b67