Back to Search Start Over

A high-risk retinoblastoma subtype with stemness features, dedifferentiated cone states and neuronal/ganglion cell gene expression

Authors :
André Nicolas
Céline Desbrousses
Mariona Suñol
Sylvain Baulande
Fabiana Lubieniecki
Sandrine Arrufat
David Gentien
Nanor Sirab
Eric Letouzé
Clément Hua
Simon Saule
Elodie Chapeaublanc
Paul Fréneaux
Fariba Nemati
Laurie Tonon
Claude Houdayer
Odette Mariani
Alain Viari
Magalie Larcher
Xavier Sastre-Garau
Sacha Reichman
Daniela Ottaviani
Nathalie Cassoux
Marion Gauthier-Villars
Isabelle Aerts
Céline Vallot
Guillermo Chantada
Aurélien de Reyniès
Genoveva Correa Llano
Liliana Mirabal-Ortega
Livia Lumbroso-Le Rouic
Angel M. Carcaboso
Jérôme Couturier
Dominique Stoppa-Lyonnet
Hervé Brisse
Jaume Català-Mora
Florent Dufour
Isabelle Bernard-Pierrot
François Doz
Meriem Sefta
Paula Schaiquevich
Emmanuel Barillot
Laurence Desjardins
Rosario Aschero
Nabila Elarouci
Celio Pouponnot
Tatiana Popova
F. Radvanyi
Catherine Dehainault
Jing Liu
Gabriela Lamas
Narjesse Karboul
Didier Decaudin
Alexandre Matet
Lisa Golmard
Céline Brulard
Sylvain Guibert
Guillem Pascual-Pasto
Olivier Goureau
Anne Biton
Institut Curie, CNRS, UMR144, Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, PSL Research University, 75005, Paris, France
Sorbonne Université (SU)
Programme Cartes d'Identité des Tumeurs, Ligue Nationale Contre le Cancer, 75013, Paris, France
Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale (ERABLE)
Inria Grenoble - Rhône-Alpes
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)
Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL)
Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Biologie Cellulaire et Cancer
Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
(le programme) Cartes d'identité des tumeurs (CIT)
Ligue Nationales Contre le Cancer (LNCC)
Hospital Nacional de Pediatría J.P. Garrahan
Centre Léon Bérard [Lyon]
Département de Biologie des Tumeurs
Institut Curie [Paris]
Institut de la Vision
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe
Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB
Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)
Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI)
Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Signalisation, radiobiologie et cancer
Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours )
Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Hôpital Bretonneau
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)
Unité de génétique et biologie des cancers (U830)
Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Département de Recherche Translationnelle
Centre de recherche de l'Institut Curie [Paris]
Genomics Consulting (GeCo)
Institut de Recerca Pediàtrica Hospital Sant Joan de Déu [Barcelona, Spain]
Hospital Sant Joan de Déu [Barcelona]
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas [Buenos Aires] (CONICET)
CHU Rouen
Normandie Université (NU)
Département d'Imagerie Médicale [Institut Curie]
Génomique fonctionnelle des tumeurs solides = Functional Genomics of Solid Tumors [CRC] (FunGeST)
Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138))
École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)
CHI Créteil
École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)-École pratique des hautes études (EPHE)
Pouponnot, Celio
Source :
NATURE COMMUNICATIONS, r-FSJD. Repositorio Institucional de Producción Científica de la Fundació Sant Joan de Déu, instname, Nature Communications, Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-25792-0⟩, Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.1-20. ⟨10.1038/s41467-021-25792-0⟩, Nature Communications, Vol 12, Iss 1, Pp 1-20 (2021)
Publication Year :
2021
Publisher :
Springer Science and Business Media LLC, 2021.

Abstract

Retinoblastoma is the most frequent intraocular malignancy in children, originating from a maturing cone precursor in the developing retina. Little is known on the molecular basis underlying the biological and clinical behavior of this cancer. Here, using multi-omics data, we demonstrate the existence of two retinoblastoma subtypes. Subtype 1, of earlier onset, includes most of the heritable forms. It harbors few genetic alterations other than the initiating RB1 inactivation and corresponds to differentiated tumors expressing mature cone markers. By contrast, subtype 2 tumors harbor frequent recurrent genetic alterations including MYCN-amplification. They express markers of less differentiated cone together with neuronal/ganglion cell markers with marked inter- and intra-tumor heterogeneity. The cone dedifferentiation in subtype 2 is associated with stemness features including low immune and interferon response, E2F and MYC/MYCN activation and a higher propensity for metastasis. The recognition of these two subtypes, one maintaining a cone-differentiated state, and the other, more aggressive, associated with cone dedifferentiation and expression of neuronal markers, opens up important biological and clinical perspectives for retinoblastomas.<br />Retinoblastoma is the most frequent intraocular paediatric malignancy whose molecular basis remains poorly understood. Here, the authors perform multi-omic analysis and identify two subtypes; one in a cone differentiated state and one more aggressive showing cone dedifferentiation and expressing neuronal markers.

Details

ISSN :
20411723
Volume :
12
Database :
OpenAIRE
Journal :
Nature Communications
Accession number :
edsair.doi.dedup.....c15156ee6d1c25d62cf1dc1d320277c3
Full Text :
https://doi.org/10.1038/s41467-021-25792-0