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Liquid chromatography coupled to different atmospheric pressure ionization sources-quadrupole-time-of-flight mass spectrometry and post-column addition of metal salt solutions as a powerful tool for the metabolic profiling of Fusarium oxysporum
- Source :
- Journal of Chromatography A. 1439:97-111
- Publication Year :
- 2016
- Publisher :
- Elsevier BV, 2016.
-
Abstract
- Fusarium oxysporum L11 is a non-pathogenic soil-borne fungal strain that yielded an extract that showed antifungal activity against phytopathogens. In this study, reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC) coupled to different atmospheric pressure ionization sources-quadrupole-time-of-flight mass spectrometry (API-QTOF-MS) was applied for the comprehensive profiling of the metabolites from the extract. The employed sources were electrospray (ESI), atmospheric pressure chemical ionization (APCI) and atmospheric pressure photoionization (APPI). Post-column addition of metal solutions of Ca, Cu and Zn(II) was also tested using ESI. A total of 137 compounds were identified or tentatively identified by matching their accurate mass signals, suggested molecular formulae and MS/MS analysis with previously reported data. Some compounds were isolated and identified by NMR. The extract was rich in cyclic peptides like cyclosporins, diketopiperazines and sansalvamides, most of which were new, and are reported here for the first time. The use of post-column addition of metals resulted in a useful strategy for the discrimination of compound classes since specific adducts were observed for the different compound families. This technique also allowed the screening for compounds with metal binding properties. Thus, the applied methodology is a useful choice for the metabolic profiling of extracts and also for the selection of metabolites with potential biological activities related to interactions with metal ions. Fil: Cirigliano, Adriana Monica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentina Fil: Rodriguez, Maria Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina Fil: Gagliano, M. Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentina Fil: Bertinetti, Brenda Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentina Fil: Godeas, Alicia Margarita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones en Biociencias Agrícolas y Ambientales; Argentina Fil: Cabrera, Gabriela Myriam. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentina
- Subjects :
- Copper Sulfate
Analytical chemistry
Zinc compounds
Cyclosporins
Diketopiperazines
Mass spectrometry
01 natural sciences
Biochemistry
Analytical Chemistry
Calcium Chloride
Chlorides
Fusarium
Tandem Mass Spectrometry
Liquid chromatography–mass spectrometry
Depsipeptides
Cyclosporin a
Fusarium oxysporum
Metabolites
Quadrupole time of flight
Chromatography, High Pressure Liquid
Chromatography, Reverse-Phase
Chromatography
Mycelium
Atmospheric pressure
biology
010405 organic chemistry
Chemistry
Otras Ciencias Naturales y Exactas
010401 analytical chemistry
Organic Chemistry
Copper sulfate
General Medicine
biology.organism_classification
Lipids
RP-HPLC-ESI/APCI/APPI-QTOF-MS and -MS/MS
0104 chemical sciences
Atmospheric Pressure
Zinc Compounds
Fermentation
Steroids
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
Subjects
Details
- ISSN :
- 00219673
- Volume :
- 1439
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Journal of Chromatography A
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....cf6145f9a79d765e5619b48134877582
- Full Text :
- https://doi.org/10.1016/j.chroma.2015.11.073