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Laboratory-based surveillance for Cryptosporidium in France, 2006-2009

Laboratory-based surveillance for Cryptosporidium in France, 2006-2009

Authors :
D. Haouchine
Sandrine Houzé
Didier Basset
Adela Angoulvant
C. Chartier
Eric Dannaoui
Christine Aznar
Francis Derouin
Gabriela Certad
Frédéric Dalle
B. Degeilh
Jean-Marc Dewitte
Françoise Botterel
Marie-Laure Dardé
Chantal Duhamel
A. Berry
Marie-Elisabeth Bougnoux
M. Cambon
Patrice Agnamey
G. Belkadi
B. Couprie
Bernard Carme
Patrice Bourée
Pierre Buffet
Pascal Beaudeau
E. Dei Cas
Thanh Hai Duong
Alain Bonnin
Karine Guyot
Dominique Aubert
Frédéric Grenouillet
Pierre Flori
Jean Dupouy-Camet
Loïc Favennec
Gilles Gargala
N. Desbois
Nausicaa Gantois
Ml Grillot
Alexandra Faussart
Anofel Cryptosporidium National Network
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL)
Institut Pasteur de Lille
Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen]
CHU Rouen
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)
Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie
Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA)
Laboratoire de Parasitologie-Mycologie
Centre Hospitalier Universitaire Lapeyronnie
Département santé environnement
Institut de Veille Sanitaire (INVS)
CHU Dijon
Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)
CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Service de parasitologie
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre
Service de Parasitologie - Mycologie [CHU Pitié-Salpétrière]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Immunité et Infection
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR113-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Epidémiologie des parasitoses et mycoses tropicales
Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Hôpital Européen Georges Pompidou
Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP)
Centre National de Référence (CNR) Toxoplasmose/Toxoplasma Biological Resource Center (BRC) (CNR Toxoplasmose-Toxoplasma BRC)
CHU Limoges
Université de Limoges (UNILIM)
Neuroépidémiologie Tropicale et Comparée (NETEC)
Université de Limoges (UNILIM)-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)
Parasitologie-Mycologie Fort de France
CHU Fort de France
Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes (GIMAP)
Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)
Appareil Digestif Environnement Nutrition (ADEN )
Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)
Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)
Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
The ANOFEL Cryptosporidium National Network (ACNN) is supported by a grant from InVS and ANOFEL. The genotyping was also supported financially by the French Ministry of Research (EA 3609).
We thank Nathalie Lelieur for providing useful assistance in data analysis, Anthony Pinon for his advice on statistics and Annie Sulahian for English revision of the manuscript.
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille
Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)
Service de parasitologie - mycologie [CHU Pitié-Salpétrière]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR113-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 8204 ( CIIL )
Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR142-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN )
Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU )
Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles ( UA )
Institut de Veille Sanitaire
Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon )
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 )
Hôpital Necker
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bicêtre
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IFR113-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Université des Antilles et de la Guyane ( UAG ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Centre National de Référence (CNR) Toxoplasmose/Toxoplasma Biological Resource Center (BRC) ( CNR Toxoplasmose-Toxoplasma BRC )
Université de Limoges ( UNILIM )
Neuroépidémiologie Tropicale et Comparée ( NETEC )
Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST FR CNRS 3503 ) -Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Université de Limoges ( UNILIM )
Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes ( GIMAP )
Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM )
Appareil Digestif Environnement Nutrition ( ADEN )
Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN )
Laboratoire Chrono-environnement ( LCE )
Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC )
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)
Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
Source :
Eurosurveillance, Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2010, 15 (33), pp.19642. ⟨10.2807/ese.15.33.19642-en⟩, Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2010, 15 (33), pp.19642, Eurosurveillance, 2010, 15 (33), pp.19642. ⟨10.2807/ese.15.33.19642-en⟩
Publication Year :
2010
Publisher :
HAL CCSD, 2010.

Abstract

International audience; In 2002, the French Food Safety Agency drew attention to the lack of information on the prevalence of human cryptosporidiosis in the country. Two years later, the ANOFEL Cryptosporidium National Network (ACNN) was set up to provide public health authorities with data on the incidence and epidemiology of human cryptosporidiosis in France. Constituted on a voluntary basis, ACNN includes 38 hospital parasitology laboratories (mainly in university hospitals). Each laboratory is engaged to notify new cases of confirmed human cryptosporidiosis, store specimens (e.g. stools, duodenal aspirates or biopsies) and related clinical and epidemiological data, using data sheet forms. From January 2006 to December 2009, 407 cryptosporidiosis cases were notified in France and 364 specimens were collected. Of the notified cases, 74 were children under four years of age, accounting for 18.2%. HIV-infected and immunocompetent patients represented 38.6% (n=157) and 28% (n=114) of cases, respectively. A marked seasonal pattern was observed each year, with increased number of cases in mid to late summer and the beginning of autumn. Genotyping of 345 isolates from 310 patients identified C. parvumin 168 (54.2%) cases, C. hominis in 113 (36.4%) and other species in 29 (9.4%), including C. felis (n=15), C. meleagridis (n=4), C. canis (n=4), Cryptosporidium chipmunk genotype (n=1), Cryptosporidium rabbit genotype (n=1) and new Cryptosporidium genotypes (n=4). These data represent the first multisite report of laboratory-confirmed cases of cryptosporidiosis in France.

Details

Language :
English
ISSN :
15607917 and 1025496X
Database :
OpenAIRE
Journal :
Eurosurveillance, Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2010, 15 (33), pp.19642. ⟨10.2807/ese.15.33.19642-en⟩, Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2010, 15 (33), pp.19642, Eurosurveillance, 2010, 15 (33), pp.19642. ⟨10.2807/ese.15.33.19642-en⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....f25853f62d0862c8f1bf7c046c61bc05
Full Text :
https://doi.org/10.2807/ese.15.33.19642-en⟩