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Lesion graph neural networks for 2-year progression free survival classification of Diffuse Large B-Cell Lymphoma patients

Authors :
Aswathi, Aswathi
Rizkallah, Mira
Frecon, Gauthier
Bailly, Clément
Bodet-Milin, Caroline
Casasnovas, Olivier
Le Gouill, Steven
Kraeber-Bodéré, Françoise
Carlier, Thomas
Mateus, Diana
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N)
Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST)
Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)
Signal, IMage et Son (LS2N - équipe SIMS )
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-École Centrale de Nantes (Nantes Univ - ECN)
Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes université - UFR des Sciences et des Techniques (Nantes univ - UFR ST)
Nantes Université - pôle Sciences et technologie
Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Sciences et technologie
Nantes Université (Nantes Univ)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Nantes Université (Nantes Univ)
Source :
International Symposium on Biomedical Imaging, International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2023, Cartagena de Indias, Colombia
Publication Year :
2023
Publisher :
HAL CCSD, 2023.

Abstract

International audience; Survival analysis of DLBCL patients requires the interpretation of PET images characterised by multiple small lesions. Current machine-learning approaches addressing similar problems consider as input the cropped image of a single lesion or the whole volume. In this paper, we incorporate the information of all lesions by modeling their joint survival analysis with a graph learning approach. We propose a compact graph representation of the segmented lesions enriched by radiomics features and edge weights. The representation is fed to a graph attention network to predict the 2-year Progression-Free Survival of a DLBCL patient, formalised as a graph classification problem. Experimental results on a clinical prospective database with 583 patients show that our method improves over three baseline fusion approaches.

Details

Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
International Symposium on Biomedical Imaging, International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2023, Cartagena de Indias, Colombia
Accession number :
edsair.od.......165..f605ed253da8dcf21b52eb9ea0ef97c6