Secuenciación de exomas en trastornos do espectro autista, unha entidade de especial dificultade diagnóstica

Traballo Fin de Grao en Medicina. Curso 2020-2021 Los Trastornos del Espectro Autista (TEA) son un grupo heterogéneo de entidades encuadradas en los trastornos de neurodesarrollo (TND) que se caracterizan por alteraciones en la comunicación e interacción social y patrones restringidos y repetitivos. Su etiología es multifactorial, de base predominantemente genética pero modificada por la interacción con el ambiente. La heredabilidad en estos trastornos se estima en torno a un 83%. Entre las variaciones genéticas implicadas hay variación común que contribuye a la enfermedad, pero también variaciones raras funcionales que explican un 40% de los casos. En estas se incluyen CNVs, deleciones y duplicaciones microeestructurales del genoma que explican menos del 10% de los casos, junto a una proporción mayoritaria de mutaciones puntuales. Estas últimas exigen el uso de paneles de genes o el análisis de exomas o genomas completos para su identificación. En este trabajo se analiza un caso clínico de TEA de especial dificultad diagnóstica que requiere el análisis masivo de exomas. La secuenciación del exoma se llevó a cabo con Secuenciación de Nueva Generación (NGS). Sobre las variantes identificadas se llevó a cabo un proceso de filtrado, priorización e interpretación de variantes en función de sus características. El análisis identificó una mutación de novo en el gen MAGEL2 que introduce un codón de parada en la secuencia del gen dando lugar a una proteína truncada. Esta mutación no ha sido descrita previamente, pero dadas sus características puede considerarse patogénica y permite justificar el fenotipo del paciente Os Trastornos do Espectro Autista (TEA) son un grupo heteroxéneo de entidades encadradas nos Trastornos do Neurodesenvolvemento (TND) que se caracterizan por alteracións na comunicación e interacción sociais e patróns restrinxidos e repetitivos. A súa etioloxía é multifactorial, de base predominantemente xenética pero modificada pola interacción co ambiente. A heredabilidade nestes trastornos estímase en torno ao 83%. Entre as variacións xenéticas implicadas hai variación común que contribúe a enfermidade, pero tamén variacións raras funcionais que explican un 40% dos casos. Nestas inclúense CNVs, delecións e duplicacións microestructurais do xenoma que explican menos do 10% dos casos, xunto a unha proporción maioritaria de mutacións puntuais. Estas últimas esixen o uso de paneis de xens ou a análise de exomas ou xenomas completos para a súa identificación. Neste traballo analízase un caso clínico de TEA de especial dificultade diagnóstica que require da análise masiva de exomas. A secuenciación do exoma levouse a cabo con Secuenciación de Nova Xeración (NSG). Sobre as variantes identificadas levouse a cabo un proceso de filtrado, priorización e interpretación de variantes en función das súas características. A análise identificou unha mutación de novo no xen MAGEL2 que introduce un codón de parada na secuencia do xen dando lugar a unha proteína truncada. Esta mutación non foi descrita previamente, pero dadas as súas características pode considerarse patoxénica e permite xustificar o fenotipo do doente Autism Spectrum Disorders (ASD) are a heterogeneous group of entities framed within the Neurodevelopmental Disorders (NDD) that are characterized by alterations in communication and social interaction and restricted and repetitive patterns. This disorders have a multifactorial etiology, with a predominantly genetic basis but modified by interaction with the environment. Heritability in these disorders is estimated at around 83%. Among the genetic variations involved there is common variation that contributes to the disease, but also rare functional variations that explain 40% of the cases. These include CNVs, deletions and microstructural duplications of the genome that explain less than 10% of cases, and a majority proportion of point mutations. The point mutations require the use of gene panels or the analysis of exomes or whole genomes for their identification. In this work we analyze a clinical case of ASD of special diagnostic difficulty that requires massive exome analysis. Exome sequencing was performed with Next Generation Sequencing (NGS). The variants identified were filtered, prioritized and interpreted according to their characteristics. The analysis identified a de novo mutation in the MAGEL2 gene that introduces a stop codon in the gene sequence resulting in a truncated protein. This mutation has not been previously described, but for its characteristics it can be considered pathogenic and allows to justify the patient's phenotype