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光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用

Authors :
何姝婧
张志强
黄乙涓
徐丽南
陈元球
方丛
任姿
Source :
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, Vol 44, Pp 943-948 (2023)
Publication Year :
2023
Publisher :
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University, 2023.

Abstract

目的探讨光学基因组图谱技术(OGM)在复杂染色体重排中的应用。方法收集2022年1月到2023年6月期间,在中山大学附属第六医院生殖医学中心进行辅助生殖助孕的染色体复杂重排患者5例,对患者进行OGM检测,纳米孔三代测序和胚胎植入前遗传学检测(PGT),并与核型分析、染色体微阵列分析技术(CMA)/基因组拷贝数变异测序(CNV-Seq)的结果分析对比。结果相互易位合并插入,相互易位合并倒位,三联易位均能被OGM成功检测,且与纳米孔测序和CMA/CNV-Seq结果相符。OGM成功定位断裂点位置,并与胚胎检测结果验证相符。OGM无法检测到罗氏易位。结论OGM因其超长读长,实现了跨越重复区域的检测能力,能够准确定位结构重排,可以有效地辅助复杂染色体重排的临床诊断。

Details

Language :
Chinese
ISSN :
16723554
Volume :
44
Database :
Directory of Open Access Journals
Journal :
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Publication Type :
Academic Journal
Accession number :
edsdoj.bf8e8b69ca04eb89b9e06472c313399
Document Type :
article
Full Text :
https://doi.org/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0625