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Validación de QTLs asociados a caracteres de floración y calidad del fruto en Cucurbita pepo

Authors :
Picó Sirvent, María Belén
Roig Montaner, María Cristina
Esteras Gómez, Cristina
Universitat Politècnica de València. Servicio de Alumnado - Servei d'Alumnat
Gracia Martínez, Raúl
Picó Sirvent, María Belén
Roig Montaner, María Cristina
Esteras Gómez, Cristina
Universitat Politècnica de València. Servicio de Alumnado - Servei d'Alumnat
Gracia Martínez, Raúl
Publication Year :
2015

Abstract

[EN] The species Cucurbita pepo, which is the most important within the genus Cucurbita, is one of the least studied species of the Cucurbitaceae family. The development of genomic tools is fairly recent in this species. The use of a new generation of sequencing methods and mass genotyping has made progress in the investigation of gene mapping and development of new genetic maps in this species. A few years ago the first transcriptome was developed in the C. pepo species (Blanca et al., 2011), which allowed the in silico identification of molecular markers of high quality SNP type. Then, the first two SNP genetic maps were constructed by using massive sequencing technology 454/Roche and GoldenGate genotyping platform (Ilumina).The first map, with 304 SNPs mapped, was formed from an F2 population from the cross of two subspecies of C. pepo, the ovifera (texana) subspecies Scallop morphotype and pepo subspecies Zucchini morphotype, of great economic importance. The other genetic map was parallel constructed using an F2 population of crossing of two genetically very distant morphotypes, such as the pepo subspecies Pumpkin morphotype and ovifera (texana) subspecies Scallop morphotype (results not yet published). Both populations were phenotyped for many vegetative, flowering and fruit characters, and with SNP genotyping a study of QTLs was carried out (Quantitative Trait Loci) (Esteras et al., 2012). Since both populations were phenotyped for the same characters and were genotyped with the same set of markers it has been possible to compare the results obtained with both maps. This study aims to validate some of these QTLs, which were found to be of great commercial interest in the genetic map of the cross Pumpkin x Scallop, some of which are also common in the genetic map of the cross Scallop x Zucchini. This has been carried out by phenotyping and genotyping High Resolution Melting of four F3 families Pumpkin x Scallop selected, which started from mother plants with h<br />[ES] La especie Cucurbita pepo, que es la de mayor importancia dentro del género Cucurbita, es una de las especies menos estudiadas de la familia de las Cucurbitáceas. El desarrollo de herramientas genómicas es bastante reciente en esta especie. La utilización de una nueva generación de métodos de secuenciación y genotipado masivo ha permitido avanzar en la investigación de la cartografía de genes y elaboración de nuevos mapas genéticos en esta especie. Hace pocos años se desarrolló el primer transcriptoma en la especie de C. pepo (Blanca et al., 2011), lo cual permitió la identificación in silico de marcadores moleculares de alta calidad de tipo SNP. A continuación se construyeron los dos primeros mapas genéticos mediante SNPs, utilizando la tecnología de secuenciación masiva 454/Roche y la plataforma de genotipado GoldenGate (Ilumina). El primer mapa, con 304 SNPs mapeados, se realizó a partir de una población F2 del cruzamiento de dos subespecies de C. pepo, la subespecie ovifera (texana) morfotipo Scallop y la subespecie pepo morfotipo Zucchini, de gran importancia económica. El otro mapa genético se elaboró paralelamente a partir de una población F2 del cruzamiento de dos morfotipos muy alejados genéticamente, como son la subespecie pepo morfotipo Pumpkin y la subespecie ovifera (texana) morfotipo Scallop (resultados todavía no publicados). Ambas poblaciones se fenotiparon para numerosos caracteres vegetativos, de floración y de fruto, y junto con el genotipado de SNPs se llevó a cabo un estudio de QTLs (Quantitative Trait Loci) (Esteras et al., 2012). Como ambas poblaciones se fenotiparon para los mismos caracteres y se genotiparon con el mismo set de marcadores ha sido posible comparar los resultados obtenidos con ambos mapas. Este trabajo tiene como objetivo validar algunos de estos QTLs de gran interés comercial encontrados en el mapa genético del cruzamiento Pumpkin x Scallop, algunos de los cuales son comunes también en el mapa genético del cruzamiento Sc

Details

Database :
OAIster
Notes :
TEXT, Spanish
Publication Type :
Electronic Resource
Accession number :
edsoai.on1138363470
Document Type :
Electronic Resource