RNA sequencing and data integration in the context of nutrition and weight loss intervention

Overall this thesis presents three studies that highlight the complexity of molecular systems in response to nutritional dysregulation. They accentuate that the sophisticated integration of data from multiple sources such as transcriptome profiles together with quantified DNA adduct levels or metabolome profiles, as performed with our new data integration approach CoNI, is key to predict the cellular influences of potentially harmful substances or to identify new genes that could be used as druggable targets.
Insgesamt präsentiert diese Arbeit drei Studien, die zeigen wie komplex die Reaktion der molekularen Systeme auf eine Ernährungsdysregulation ist. Die Studien legen außerdem dar, dass die hochentwickelte Integration von Daten aus verschiedenen Quellen, zum Beispiel Transkriptionsprofile mit DNS-Adduktkonzentrationen oder Metabolitenprofilen, wie sie mit unserer neuentwickelten Methode zur Datenintegration CoNI durchgeführt wurde, entscheidend für die Vorhersage des Einflusses von möglicherweise schädlichen Substanzen auf die Zelle oder für die Entdeckung von neuen krankheitsrelevanten Zielmolekülen sind.