Research needs and interests on biodiversity have drastically increased since the Rio Conference (1992). The main conclusions from the Millennium Ecosystem Assessment (MEA, 2001) carried out by the UN and the demonstration of the critical role of biodiversity in maintaining ecosystems services have strengthened research interests on biodiversity. Moreover, the systemic approach generalization, complex system modeling, confluence of thematic prompting new scientific concepts, and multi-scalar multifunctional approach have induced significant changes to the scientific context. A review of major advances on biodiversity monitoring and research resulting from Ifremer programs will be presented considering deep sea as well as coastal ecosystems and associated technologies. Development of benthic habitat mapping (e.g., REBENT), and data platforms and information systems on marine biodiversity (SINP, SIH, BIOCEAN) are all contributing to an improved spatial and temporal biodiversity observatory. Ifremer has already demonstrated its main interest in an active scientific strategy of cooperation through national research groups such as the IFB then FRB, ECCHIS GDR, European projects (HERMES), scientific coordination (REX MARBEF, Marine Genomics) as well as the European ERANETs (Biodiversa, Marinera, Marifish), and its involvement in the 'Census of Marine Life' international program. Beyond the next European Sea ERANET, an increased cooperation among scientific partners appears critical to address the three major scientific challenges regarding marine biodiversity: 1. explore and characterize marine biodiversity at various scales (landscapes, habitats, communities), 2. operational monitoring, and 3. development of functional biodiversity modeling to assess ecosystem resilience to the main trend changes of impact vectors., Les besoins en recherches dans le domaine de la biodiversité se sont accrus depuis la Conférence de Rio (1992) et les conclusions portées par le bilan mondial des Nations Unies concernant l'évaluation des services des écosystèmes et du rôle essentiel de la biodiversité dans leur maintien (MEA, 2001). La généralisation de l'approche systémique, la modélisation de systèmes complexes, la convergence de disciplines vers de nouveaux concepts et les approches multi-échelles et multi-fonctionnelles sont autant d'éléments d'évolution du contexte scientifique et technique dans ce domaine. Une revue des avancées de l'Ifremer dans le domaine de l'observation et de la recherche en biodiversité sera présentée depuis les travaux sur les écosystèmes des grands fonds jusqu'au domaine côtier tout en considérant les technologies associées. La réalisation de la cartographie des habitats benthiques (e.g., REBENT), le développement de plate-formes et de systèmes d'information sur la biodiversité marine (SINP, SIH, BIOCEAN) contribuent à une meilleure observation spatio-temporelle de celle-ci. La participation de l'Ifremer aux groupements de recherche nationaux (IFB puis FRB, GDR ECCHIS), aux projets européens (HERMES) et coordinations scientifiques (REX MARBEF, Marine Genomics), ainsi qu'aux ERANET (Biodiversa, Marinera, Marifish) et le rôle joué dans le programme international « Census of Marine Life » démontre l'importance que l'Institut accorde à une stratégie active de coopération scientifique en matière de biodiversité marine. Au delà du prochain ERANET « SEANET », l'amélioration de la coordination pluri-organismes de la recherche en biodiversité marine apparaît essentielle à court terme pour répondre aux trois enjeux de recherche que sont 1. l'exploration et la caractérisation de la biodiversité marine à différentes échelles (paysages, habitats, communautés), 2. la surveillance opérationnelle, 3. le développement de la modélisation fonctionnelle de la biodiversité pour l'étude de