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48 results on '"Marie Tremblay‐Franco"'

1. Lactobacillus supports Clostridiales to restrict gut colonization by multidrug-resistant Enterobacteriaceae

Author: Ana Djukovic, María José Garzón, Cécile Canlet, Vitor Cabral, Rym Lalaoui, Marc García-Garcerá, Julia Rechenberger, Marie Tremblay-Franco, Iván Peñaranda, Leonor Puchades-Carrasco, Antonio Pineda-Lucena, Eva María González-Barberá, Miguel Salavert, José Luis López-Hontangas, Miguel Á. Sanz, Jaime Sanz, Bernhard Kuster, Jean-Marc Rolain, Laurent Debrauwer, Karina B. Xavier, Joao B. Xavier, and Carles Ubeda
Subjects: Science
Abstract: Multidrug-resistant Enterobacteriaceae (MRE) represent a major threat for patients’ health. Here, the authors describe how cooperation between gut commensal bacteria (Lactobacillus spp. And Clostridiales) restrict MRE colonization in mice and patients
Published: 2022
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2. Gestational exposure to bisphenol A induces region-specific changes in brain metabolomic fingerprints in sheep

Author: Davy Guignard, Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Elodie Chaillou, Roselyne Gautier, Véronique Gayrard, Nicole Picard-Hagen, Henri Schroeder, Fabien Jourdan, Daniel Zalko, Catherine Viguié, and Nicolas J. Cabaton
Subjects: Environmental contaminants, Bisphenol A, Fetal exposure, Neurodevelopment, Metabolomic, Sheep, Environmental sciences, GE1-350
Abstract: Abstract: Fetal brain development depends on maternofetal thyroid function. In rodents and sheep, perinatal BPA exposure is associated with maternal and/or fetal thyroid disruption and alterations in central nervous system development as demonstrated by metabolic modulations in the encephala of mice. We hypothesized that a gestational exposure to a low dose of BPA affects maternofetal thyroid function and fetal brain development in a region-specific manner. Pregnant ewes, a relevant model for human thyroid and brain development, were exposed to BPA (5 µg/kg bw/d, sc). The thyroid status of ewes during gestation and term fetuses at delivery was monitored. Fetal brain development was assessed by metabolic fingerprints at birth in 10 areas followed by metabolic network-based analysis. BPA treatment was associated with a significant time-dependent decrease in maternal TT4 serum concentrations. For 8 fetal brain regions, statistical models allowed discriminating BPA-treated from control lambs. Metabolic network computational analysis revealed that prenatal exposure to BPA modulated several metabolic pathways, in particular excitatory and inhibitory amino-acid, cholinergic, energy and lipid homeostasis pathways. These pathways might contribute to BPA-related neurobehavioral and cognitive disorders. Discrimination was particularly clear for the dorsal hippocampus, the cerebellar vermis, the dorsal hypothalamus, the caudate nucleus and the lateral part of the frontal cortex. Compared with previous results in rodents, the use of a larger animal model allowed to examine specific brain areas, and generate evidence of the distinct region-specific effects of fetal BPA exposure on the brain metabolome. These modifications occur concomitantly to subtle maternal thyroid function alteration. The functional link between such moderate thyroid changes and fetal brain metabolomic fingerprints remains to be determined as well as the potential implication of other modes of action triggered by BPA such as estrogenic ones. Our results pave the ways for new scientific strategies aiming at linking environmental endocrine disruption and altered neurodevelopment.
Published: 2022
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3. Transgenerational metabolomic fingerprints in mice ancestrally exposed to the obesogen TBT

Author: Raquel Chamorro-García, Nathalie Poupin, Marie Tremblay-Franco, Cécile Canlet, Riann Egusquiza, Roselyne Gautier, Isabelle Jouanin, Bassem M. Shoucri, Bruce Blumberg, and Daniel Zalko
Subjects: Tributyltin, Endocrine disruptor, Metabolic disruptor, Transgenerational effects, Metabolomics, Obesogen, Environmental sciences, GE1-350
Abstract: Background: Endocrine disrupting chemicals (EDCs) contribute to the etiology of metabolic disorders such as obesity, insulin resistance and hepatic dysfunction. Concern is growing about the consequences of perinatal EDC exposure on disease predisposition later in life. Metabolomics are promising approaches for studying long-term consequences of early life EDC exposure. These approaches allow for the identification and characterization of biomarkers of direct or ancestral exposures that could be diagnostic for individual susceptibility to disease and help to understand mechanisms through which EDCs act. Objectives: We sought to identify metabolomic fingerprints in mice ancestrally exposed to the model obesogen tributyltin (TBT), to assess whether metabolomics could discriminate potential trans-generational susceptibility to obesity and recognize metabolic pathways modulated by ancestral TBT exposure. Methods: We used non-targeted 1H NMR metabolomic analyses of plasma and liver samples collected from male and female mice ancestrally exposed to TBT in two independent transgenerational experiments in which F3 and F4 males became obese when challenged with increased dietary fat. Results: Metabolomics confirmed transgenerational obesogenic effects of environmentally relevant doses of TBT in F3 and F4 males, in two independent studies. Although females never became obese, their specific metabolomic fingerprint evidenced distinct transgenerational effects of TBT in female mice consistent with impaired capacity for liver biotransformation. Discussion: This study is the first application of metabolomics to unveil the transgenerational effects of EDC exposure. Very early, significant changes in the plasma metabolome were observed in animals ancestrally exposed to TBT. These changes preceded the onset of obesogenic effects elicited by increased dietary fat in the TBT groups, and which ultimately resulted in significant changes in the liver metabolome. Development of metabolomic fingerprints could facilitate the identification of individuals carrying the signature of ancestral obesogen exposure that might increase their susceptibility to other risk factor such as increased dietary fat.
Published: 2021
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4. Investigating the Postprandial Metabolome after Challenge Tests to Assess Metabolic Flexibility and Dysregulations Associated with Cardiometabolic Diseases

Author: Gaïa Lépine, Marie Tremblay-Franco, Sabrine Bouder, Laurianne Dimina, Hélène Fouillet, François Mariotti, and Sergio Polakof
Subjects: challenge meal, insulin resistance, nutritional phenotypic flexibility, nutrition, omics, oral glucose tolerance test (OGTT), Nutrition. Foods and food supply, TX341-641
Abstract: This review focuses on the added value provided by a research strategy applying metabolomics analyses to assess phenotypic flexibility in response to different nutritional challenge tests in the framework of metabolic clinical studies. We discuss findings related to the Oral Glucose Tolerance Test (OGTT) and to mixed meals with varying fat contents and food matrix complexities. Overall, the use of challenge tests combined with metabolomics revealed subtle metabolic dysregulations exacerbated during the postprandial period when comparing healthy and at cardiometabolic risk subjects. In healthy subjects, consistent postprandial metabolic shifts driven by insulin action were reported (e.g., a switch from lipid to glucose oxidation for energy fueling) with similarities between OGTT and mixed meals, especially during the first hours following meal ingestion while differences appeared in a wider timeframe. In populations with expected reduced phenotypic flexibility, often associated with increased cardiometabolic risk, a blunted response on most key postprandial pathways was reported. We also discuss the most suitable statistical tools to analyze the dynamic alterations of the postprandial metabolome while accounting for complexity in study designs and data structure. Overall, the in-depth characterization of the postprandial metabolism and associated phenotypic flexibility appears highly promising for a better understanding of the onset of cardiometabolic diseases.
Published: 2022
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5. Statistical Integration of ‘Omics Data Increases Biological Knowledge Extracted from Metabolomics Data: Application to Intestinal Exposure to the Mycotoxin Deoxynivalenol

Author: Marie Tremblay-Franco, Cécile Canlet, Philippe Pinton, Yannick Lippi, Roselyne Gautier, Claire Naylies, Manon Neves, Isabelle P. Oswald, Laurent Debrauwer, and Imourana Alassane-Kpembi
Subjects: mycotoxin exposure 1, transcriptomics 2, metabolomics 3, statistical integration 4, Microbiology, QR1-502
Abstract: The effects of low doses of toxicants are often subtle and information extracted from metabolomic data alone may not always be sufficient. As end products of enzymatic reactions, metabolites represent the final phenotypic expression of an organism and can also reflect gene expression changes caused by this exposure. Therefore, the integration of metabolomic and transcriptomic data could improve the extracted biological knowledge on these toxicants induced disruptions. In the present study, we applied statistical integration tools to metabolomic and transcriptomic data obtained from jejunal explants of pigs exposed to the food contaminant, deoxynivalenol (DON). Canonical correlation analysis (CCA) and self-organizing map (SOM) were compared for the identification of correlated transcriptomic and metabolomic features, and O2-PLS was used to model the relationship between exposure and selected features. The integration of both ‘omics data increased the number of discriminant metabolites discovered (39) by about 10 times compared to the analysis of the metabolomic dataset alone (3). Besides the disturbance of energy metabolism previously reported, assessing correlations between both functional levels revealed several other types of damage linked to the intestinal exposure to DON, including the alteration of protein synthesis, oxidative stress, and inflammasome activation. This confirms the added value of integration to enrich the biological knowledge extracted from metabolomics.
Published: 2021
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6. Untargeted Lipidomic Profiling of Dry Blood Spots Using SFC-HRMS

Author: Pauline Le Faouder, Julia Soullier, Marie Tremblay-Franco, Anthony Tournadre, Jean-François Martin, Yann Guitton, Caroline Carlé, Sylvie Caspar-Bauguil, Pierre-Damien Denechaud, and Justine Bertrand-Michel
Subjects: Lipidomic 1, Supercritical Fluids Chromatography 3, Plasma 3, Dry Blood Spot 4, Microbiology, QR1-502
Abstract: Lipids are essential cellular constituents that have many critical roles in physiological functions. They are notably involved in energy storage and cell signaling as second messengers, and they are major constituents of cell membranes, including lipid rafts. As a consequence, they are implicated in a large number of heterogeneous diseases, such as cancer, diabetes, neurological disorders, and inherited metabolic diseases. Due to the high structural diversity and complexity of lipid species, the presence of isomeric and isobaric lipid species, and their occurrence at a large concentration scale, a complete lipidomic profiling of biological matrices remains challenging, especially in clinical contexts. Using supercritical fluid chromatography coupled with high-resolution mass spectrometry, we have developed and validated an untargeted lipidomic approach to the profiling of plasma and blood. Moreover, we have tested the technique using the Dry Blood Spot (DBS) method and found that it allows for the easy collection of blood for analysis. To develop the method, we performed the optimization of the separation and detection of lipid species on pure standards, reference human plasma (SRM1950), whole blood, and DBS. These analyses allowed an in-house lipid data bank to be built. Using the MS-Dial software, we developed an automatic process for the relative quantification of around 500 lipids species belonging to the 6 main classes of lipids (including phospholipids, sphingolipids, free fatty acids, sterols, and fatty acyl-carnitines). Then, we compared the method using the published data for SRM 1950 and a mouse blood sample, along with another sample of the same blood collected using the DBS method. In this study, we provided a method for blood lipidomic profiling that can be used for the easy sampling of dry blood spots.
Published: 2021
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7. Does the Phytochemical Diversity of Wild Plants Like the Erythrophleum genus Correlate with Geographical Origin?

Author: Cédric Delporte, Nausicaa Noret, Cécile Vanhaverbeke, Olivier J. Hardy, Jean-François Martin, Marie Tremblay-Franco, David Touboul, Anais Gorel, Marie Faes, Caroline Stévigny, Pierre Van Antwerpen, and Florence Souard
Subjects: eco-metabolomics, plant-omics, plant fingerprint, metabolomics, natural variation, molecular networks, Organic chemistry, QD241-441
Abstract: Secondary metabolites are essential for plant survival and reproduction. Wild undomesticated and tropical plants are expected to harbor highly diverse metabolomes. We investigated the metabolomic diversity of two morphologically similar trees of tropical Africa, Erythrophleum suaveolens and E. ivorense, known for particular secondary metabolites named the cassaine-type diterpenoids. To assess how the metabolome varies between and within species, we sampled leaves from individuals of different geographic origins but grown from seeds in a common garden in Cameroon. Metabolites were analyzed using reversed phase LC-HRMS(/MS). Data were interpreted by untargeted metabolomics and molecular networks based on MS/MS data. Multivariate analyses enabled us to cluster samples based on species but also on geographic origins. We identified the structures of 28 cassaine-type diterpenoids among which 19 were new, 10 were largely specific to E. ivorense and five to E. suaveolens. Our results showed that the metabolome allows an unequivocal distinction of morphologically-close species, suggesting the potential of metabolite fingerprinting for these species. Plant geographic origin had a significant influence on relative concentrations of metabolites with variations up to eight (suaveolens) and 30 times (ivorense) between origins of the same species. This shows that the metabolome is strongly influenced by the geographical origin of plants (i.e., genetic factors).
Published: 2021
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8. Postprandial NMR-Based Metabolic Exchanges Reflect Impaired Phenotypic Flexibility across Splanchnic Organs in the Obese Yucatan Mini-Pig

Author: Marie Tremblay-Franco, Nathalie Poupin, Aurélien Amiel, Cécile Canlet, Didier Rémond, Laurent Debrauwer, Dominique Dardevet, Fabien Jourdan, Isabelle Savary-Auzeloux, and Sergio Polakof
Subjects: arteriovenous differences, postprandial, high fat-high sucrose diet, mini-pigs, energy metabolism, metabolomics, Nutrition. Foods and food supply, TX341-641
Abstract: The postprandial period represents one of the most challenging phenomena in whole-body metabolism, and it can be used as a unique window to evaluate the phenotypic flexibility of an individual in response to a given meal, which can be done by measuring the resilience of the metabolome. However, this exploration of the metabolism has never been applied to the arteriovenous (AV) exploration of organs metabolism. Here, we applied an AV metabolomics strategy to evaluate the postprandial flexibility across the liver and the intestine of mini-pigs subjected to a high fat–high sucrose (HFHS) diet for 2 months. We identified for the first time a postprandial signature associated to the insulin resistance and obesity outcomes, and we showed that the splanchnic postprandial metabolome was considerably affected by the meal and the obesity condition. Most of the changes induced by obesity were observed in the exchanges across the liver, where the metabolism was reorganized to maintain whole body glucose homeostasis by routing glucose formed de novo from a large variety of substrates into glycogen. Furthermore, metabolites related to lipid handling and energy metabolism showed a blunted postprandial response in the obese animals across organs. Finally, some of our results reflect a loss of flexibility in response to the HFHS meal challenge in unsuspected metabolic pathways that must be further explored as potential new events involved in early obesity and the onset of insulin resistance.
Published: 2020
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9. An Untargeted Metabolomics Approach to Investigate the Metabolic Modulations of HepG2 Cells Exposed to Low Doses of Bisphenol A and 17β-Estradiol

Author: Nicolas J. Cabaton, Nathalie Poupin, Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Marc Audebert, Jean-Pierre Cravedi, Anne Riu, Fabien Jourdan, and Daniel Zalko
Subjects: HepG2, metabolomics, BPA, 17β-estradiol, endocrine disruption, metabolic network, Diseases of the endocrine glands. Clinical endocrinology, RC648-665
Abstract: The model xeno-estrogen bisphenol A (BPA) has been extensively studied over the past two decades, contributing to major advances in the field of endocrine disrupting chemicals research. Besides its well documented adverse effects on reproduction and development observed in rodents, latest studies strongly suggest that BPA disrupts several endogenous metabolic pathways, with suspected steatogenic and obesogenic effects. BPA's adverse effects on reproduction are attributed to its ability to activate estrogen receptors (ERs), but its effects on metabolism and its mechanism(s) of action at low doses are so far only marginally understood. Metabolomics based approaches are increasingly used in toxicology to investigate the biological changes induced by model toxicants and chemical mixtures, to identify markers of toxicity and biological effects. In this study, we used proton nuclear magnetic resonance (1H-NMR) based untargeted metabolite profiling, followed by multivariate statistics and computational analysis of metabolic networks to examine the metabolic modulation induced in human hepatic cells (HepG2) by an exposure to low and very low doses of BPA (10−6M, 10−9M, and 10−12M), vs. the female reference hormone 17β-estradiol (E2, 10−9M, 10−12M, and 10−15M). Metabolomic analysis combined to metabolic network reconstruction highlighted different mechanisms at lower doses of exposure. At the highest dose, our results evidence that BPA shares with E2 the capability to modulate several major metabolic routes that ensure cellular functions and detoxification processes, although the effects of the model xeno-estrogen and of the natural hormone can still be distinguished.
Published: 2018
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10. Metabolome disruption of pregnant rats and their offspring resulting from repeated exposure to a pesticide mixture representative of environmental contamination in Brittany.

Author: Nathalie Bonvallot, Cécile Canlet, Florence Blas-Y-Estrada, Roselyne Gautier, Marie Tremblay-Franco, Sylvie Chevolleau, Sylvaine Cordier, and Jean-Pierre Cravedi
Subjects: Medicine, Science
Abstract: The use of pesticides exposes humans to numerous harmful molecules. Exposure in early-life may be responsible for adverse effects in later life. This study aimed to assess the metabolic modifications induced in pregnant rats and their offspring by a pesticide mixture representative of human exposure. Ten pregnant rats were exposed to a mixture of eight pesticides: acetochlor (246 μg/kg bw/d) + bromoxynil (12 μg/kg bw/d) + carbofuran (22.5 μg/kg bw/d) + chlormequat (35 μg/kg bw/d) + ethephon (22.5 μg/kg bw/d) + fenpropimorph (15.5 μg/kg bw/d) + glyphosate (12 μg/kg bw/d) + imidacloprid (12.5 μg/kg bw/d) representing the main environmental pesticide exposure in Brittany (France) in 2004. Another group of 10 pregnant rats served as controls. Females were fed ad libitum from early pregnancy, which is from gestational day (GD) 4 to GD 21. Urine samples were collected at GD 15. At the end of the exposure, mothers and pups were euthanized and blood, liver, and brain samples collected. 1H NMR-based metabolomics and GC-FID analyses were performed and PCA and PLS-DA used to discriminate between control and exposed groups. Metabolites for which the levels were significantly modified were then identified using the Kruskal-Wallis test, and p-values were adjusted for multiple testing correction using the False Discovery Rate. The metabolomics analysis revealed many differences between dams of the two groups, especially in the plasma, liver and brain. The modified metabolites are involved in TCA cycle, energy production and storage, lipid and carbohydrate metabolism, and amino-acid metabolism. These modifications suggest that the pesticide mixture may induce oxidative stress associated with mitochondrial dysfunction and the impairment of glucose and lipid metabolism. These observations may reflect liver dysfunction with increased relative liver weight and total lipid content. Similar findings were observed for glucose and energy metabolism in the liver of the offspring, and oxidative stress was also suggested in the brains of male offspring.
Published: 2018
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11. Dynamic Metabolic Disruption in Rats Perinatally Exposed to Low Doses of Bisphenol-A.

Author: Marie Tremblay-Franco, Nicolas J Cabaton, Cécile Canlet, Roselyne Gautier, Cheryl M Schaeberle, Fabien Jourdan, Carlos Sonnenschein, Florence Vinson, Ana M Soto, and Daniel Zalko
Subjects: Medicine, Science
Abstract: Along with the well-established effects on fertility and fecundity, perinatal exposure to endocrine disrupting chemicals, and notably to xeno-estrogens, is strongly suspected of modulating general metabolism. The metabolism of a perinatally exposed individual may be durably altered leading to a higher susceptibility of developing metabolic disorders such as obesity and diabetes; however, experimental designs involving the long term study of these dynamic changes in the metabolome raise novel challenges. 1H-NMR-based metabolomics was applied to study the effects of bisphenol-A (BPA, 0; 0.25; 2.5, 25 and 250 μg/kg BW/day) in rats exposed perinatally. Serum and liver samples of exposed animals were analyzed on days 21, 50, 90, 140 and 200 in order to explore whether maternal exposure to BPA alters metabolism. Partial Least Squares-Discriminant Analysis (PLS-DA) was independently applied to each time point, demonstrating a significant pair-wise discrimination for liver as well as serum samples at all time-points, and highlighting unequivocal metabolic shifts in rats perinatally exposed to BPA, including those exposed to lower doses. In BPA exposed animals, metabolism of glucose, lactate and fatty acids was modified over time. To further explore dynamic variation, ANOVA-Simultaneous Component Analysis (A-SCA) was used to separate data into blocks corresponding to the different sources of variation (Time, Dose and Time*Dose interaction). A-SCA enabled the demonstration of a dynamic, time/age dependent shift of serum metabolome throughout the rats' lifetimes. Variables responsible for the discrimination between groups clearly indicate that BPA modulates energy metabolism, and suggest alterations of neurotransmitter signaling, the latter finding being compatible with the neurodevelopmental effect of this xenoestrogen. In conclusion, long lasting metabolic effects of BPA could be characterized over 200 days, despite physiological (and thus metabolic) changes connected with sexual maturation and aging.
Published: 2015
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12. Specific Metabolic Fingerprint of a Dietary Exposure to a Very Low Dose of Endosulfan

Author: Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Roselyne Gautier, Jérôme Molina, Benjamin Métais, Florence Blas-Y Estrada, and Laurence Gamet-Payrastre
Subjects: Toxicology. Poisons, RA1190-1270
Abstract: Like other persistent organochlorine pesticides, endosulfan residues have been detected in foods including fruit, vegetables, and fish. The aim of our study was to assess the impact of a dietary exposure to low doses of endosulfan from foetal development until adult age on metabolic homeostasis in mice and to identify biomarkers of exposure using an 1H-NMR-based metabonomic approach in various tissues and biofluids. We report in both genders an increase in plasma glucose as well as changes in levels of factors involved in the regulation of liver oxidative stress, confirming the prooxidant activities of this compound. Some metabolic changes were distinct in males and females. For example in plasma, a decrease in lipid LDL and choline content was only observed in female. Lactate levels in males were significantly increased. In conclusion, our results show that metabolic changes in liver could be linked to the onset of pathologies like diabetes and insulin resistance. Moreover from our results it appears that the NMR-based metabonomic approach could be useful for the characterization in plasma of a dietary exposure to low dose of pesticide in human.
Published: 2013
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13. Metabolomics tools for describing complex pesticide exposure in pregnant women in Brittany (France).

Author: Nathalie Bonvallot, Marie Tremblay-Franco, Cécile Chevrier, Cécile Canlet, Charline Warembourg, Jean-Pierre Cravedi, and Sylvaine Cordier
Subjects: Medicine, Science
Abstract: BACKGROUND: The use of pesticides and the related environmental contaminations can lead to human exposure to various molecules. In early-life, such exposures could be responsible for adverse developmental effects. However, human health risks associated with exposure to complex mixtures are currently under-explored. OBJECTIVE: THIS PROJECT AIMS AT ANSWERING THE FOLLOWING QUESTIONS: What is the influence of exposures to multiple pesticides on the metabolome? What mechanistic pathways could be involved in the metabolic changes observed? METHODS: Based on the PELAGIE cohort (Brittany, France), 83 pregnant women who provided a urine sample in early pregnancy, were classified in 3 groups according to the surface of land dedicated to agricultural cereal activities in their town of residence. Nuclear magnetic resonance-based metabolomics analyses were performed on urine samples. Partial Least Squares Regression-Discriminant Analysis (PLS-DA) and polytomous regressions were used to separate the urinary metabolic profiles from the 3 exposure groups after adjusting for potential confounders. RESULTS: The 3 groups of exposure were correctly separated with a PLS-DA model after implementing an orthogonal signal correction with pareto standardizations (R2 = 90.7% and Q2 = 0.53). After adjusting for maternal age, parity, body mass index and smoking habits, the most statistically significant changes were observed for glycine, threonine, lactate and glycerophosphocholine (upward trend), and for citrate (downward trend). CONCLUSION: This work suggests that an exposure to complex pesticide mixtures induces modifications of metabolic fingerprints. It can be hypothesized from identified discriminating metabolites that the pesticide mixtures could increase oxidative stress and disturb energy metabolism.
Published: 2013
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14. Urinary Metabolome Analysis Reveals Potential Microbiota Alteration and Electrophilic Burden Induced by High Red Meat Diet: Results from the French NutriNet‐Santé Cohort and an in vivo Intervention Study in Rats

Author: Loïc Mervant, Marie Tremblay‐Franco, Maïwenn Olier, Emilien Jamin, Jean‐Francois Martin, Lidwine Trouilh, Charline Buisson, Nathalie Naud, Claire Maslo, Cécile Héliès‐Toussaint, Edwin Fouché, Emmanuelle Kesse‐Guyot, Serge Hercberg, Pilar Galan, Mélanie Deschasaux‐Tanguy, Mathilde Touvier, Fabrice Pierre, Laurent Debrauwer, Francoise Guéraud, Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Réseau National Alimentation Cancer Recherche (réseau NACRe), Génome et Transcriptome (GeT) - Biopuces (TBI-GeT), Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), In the context of NutriNet-Santé study, we especially thank Younes Esseddik andNathalie Arnault. We are also grateful to the Genotoul bioinformatics platform Toulouse Occitanieand Sigenae group for providing help and storage resources thanks to Galaxy instance (https://vmgalaxy-prod.toulouse.inra.fr). Sources of support for the work: PhD doctoral fellowship of LM wasco-funded by INRAE (Nutrition, Chemical Food Safety and Consumer Behaviour Scientific Division)and French region Occitanie. All MS experiments were performed on the instruments of theMetaToul-AXIOM platform, partner of the national infrastructure of metabolomics and fluxomics:MetaboHUB [MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010, 2011]. This work has been funded by the 'InstitutNational du Cancer' (INCA_12705)-Project PLBIO18-130 and approved by the 'Réseau NACRe'.Graphical abstract was created with Biorender., and ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011)
Subjects: Red meat, Microbiota, [SDV]Life Sciences [q-bio], Lipid peroxidation, Metabolomics, Mercapturic acids, Food Science, Biotechnology
Abstract: International audience; Scope: High red and processed meat consumption is associated with several adverse outcomes such as colorectal cancer and overall global mortality. However, the underlying mechanisms remain debated and need to be elucidated.Methods and results: Urinary untargeted LC-MS metabolomics data from 240 subjects from the French cohort NutriNet-Santé were analysed. Individuals were matched and divided into 3 groups according to their consumption of red and processed meat: high red and processed meat consumers, non-red and processed meat consumers and an at random group. Results were supported by a preclinical experiment where rats were fed either a high red meat or a control diet. Microbiota derived metabolites, in particular indoxyl sulfate and cinnamoylglycine, were found impacted by the high red meat diet in both studies, suggesting a modification of microbiota by the high red/processed meat diet. Rat microbiota sequencing analysis strengthened this observation. Although not evidenced in the human study, rat mercapturic acid profile concomitantly revealed an increased lipid peroxidation induced by high red meat diet.Conclusion: Novel microbiota metabolites were identified as red meat consumption potential biomarkers, suggesting a deleterious effect, which could partly explain the adverse effects associated with high red and processed meat consumption.
Published: 2023

15. NMR-based metabolic profiling and discrimination of wild tropical tunas by species, size category, geographic origin, and on-board storage condition

Author: Fany Sardenne, Aurélien Amiel, Hervé Guillou, Emmanuel Chassot, Marie Tremblay-Franco, Nathalie Bodin, Edwin Fouché, Cécile Canlet, Laurent Debrauwer, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Prévention et promotion de la cancérogénèse par les aliments (ToxAlim-PPCA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), This work is a contribution to the project 'CANAL: Influence of environmental and biological factors on tuna meat quality' with the financial support of Thai Union Europe Group (ex-MWBrands Ltd) . All NMR experiments were performed on the instruments of the MetaToul-AXIOM platform, partner of the national infrastructure of metabolomics and fluxomics: MetaboHUB (MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010, 2011), ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Subjects: Skipjack tuna, Yellowfin tuna, Magnetic Resonance Spectroscopy, [SDV]Life Sciences [q-bio], Anserine, Carnosine, Bigeye tuna, Purse seine tuna fisheries, Fish measurement, Analytical Chemistry, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0404 agricultural biotechnology, Animals, Metabolomics, High-resolution 1H NMR, 14. Life underwater, Food science, Indian Ocean, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, biology, Tuna, Fishes, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, biology.organism_classification, Highly migratory large pelagic fish, 040401 food science, chemistry, Raw white and red muscles, Western Indian Ocean, human activities, Thunnus, Food Science
Abstract: International audience; Tunas are among the most traded and valued fish species, and good traceability of tuna products in the world market is needed to protect both consumers and tuna stocks. To that purpose, high-resolution proton nuclear magnetic resonance (1H NMR) spectroscopy combined with multivariate data analysis was used to investigate the molecular components of the aqueous extract of white and red muscles in three species of wild tropical tuna species, namely yellowfin tuna (Thunnus albacares), skipjack tuna (Katsuwonus pelamis) and bigeye tuna (T. obesus). Principal component analysis (PCA) and partial least squares-discriminant analysis (PLS-DA) applied to the processed 1H NMR spectra showed significant separation according to the species and size category (i.e., small tunas < 80 cm fork length vs large tunas > 80 cm fork length), the storage conditions on-board the purse-seine vessels (i.e., brine- vs deep-freezing), and the geographical origin (i.e., where the tuna was caught: Mozambique Channel vs western-central Indian Ocean). The major groups of metabolites responsible for differentiation in PLS-DA score plots were the dipeptides (anserine, carnosine) and organic acids (lactate, creatine/phosphocreatine) in the white muscle, and the free amino acids, essential nutrients (choline and its derivatives, phosphatidylethanolamine), dipeptides and organic acids in the red muscle. Our results showed that NMR-based metabolomics is a powerful tool to efficiently discriminate specific profiles among wild tuna species, raw muscle tissues, fish storage conditions and tuna geographical origin.
Published: 2022

16. Identification of bacterial lipopeptides as key players in IBS

Author: Camille Petitfils, Sarah Maurel, Gaelle Payros, Amandine Hueber, Bahija Agaiz, Géraldine Gazzo, Rémi Marrocco, Frédéric Auvray, Geoffrey Langevin, Jean-Paul Motta, Pauline Floch, Marie Tremblay-Franco, Jean-Marie Galano, Alexandre Guy, Thierry Durand, Simon Lachambre, Anaëlle Durbec, Hind Hussein, Lisse Decraecker, Justine Bertrand-Michel, Abdelhadi Saoudi, Eric Oswald, Pierrick Poisbeau, Gilles Dietrich, Chloe Melchior, Guy Boeckxstaens, Matteo Serino, Pauline Le Faouder, Nicolas Cenac, SEGUIN, Nathalie, APPEL À PROJETS GÉNÉRIQUE 2018 - Les lipopeptides produits par le microbiote : de l'hypersensibilité à la thérapie dans le syndrome de l'intestin irritable - - LiBacPain2018 - ANR-18-CE14-0039 - AAPG2018 - VALID, Signalisation des lipides du microbiote sur l'hôte - - MILI2020 - ANR-20-CE14-0011 - AAPG2020 - VALID, Ecole Universitaire de Recherche Interdisciplinaire sur la Douleur - - EURIDOL2017 - ANR-17-EURE-0022 - EURE - VALID, Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation - - METABOHUB2011 - ANR-11-INBS-0010 - INBS - VALID, Equipements plateforme animalerie infectieuse de haute-sécurité de Midi Pyrénées - - ANINFIMIP2011 - ANR-11-EQPX-0003 - EQPX - VALID, Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul Lipidomics, MetaboHUB-MetaToul, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut des Maladies Métaboliques et Casdiovasculaires (UPS/Inserm U1297 - I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Casdiovasculaires (UPS/Inserm U1297 - I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] (IBMM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM), Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), University of Gothenburg (GU), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Centre d'Investigation Clinique [CHU Rouen] (CIC Rouen), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Federation pour la Recherche sur le Cerveau (FRC) FRC20200411001, Centre National de la Recherche Scientifique. PP and GG received support from CNRS and University of Strasbourg. GG, CP and SM received a scholarship from Ministere de l'Enseignement Superieur, de la YRecherche et de l'Innovation., ANR-18-CE14-0039,LiBacPain,Les lipopeptides produits par le microbiote : de l'hypersensibilité à la thérapie dans le syndrome de l'intestin irritable(2018), ANR-20-CE14-0011,MILI,Signalisation des lipides du microbiote sur l'hôte(2020), ANR-17-EURE-0022,EURIDOL,Ecole Universitaire de Recherche Interdisciplinaire sur la Douleur(2017), ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), and ANR-11-EQPX-0003,ANINFIMIP,Equipements plateforme animalerie infectieuse de haute-sécurité de Midi Pyrénées(2011)
Subjects: VISCERAL HYPERSENSITIVITY, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, IRRITABLE-BOWEL-SYNDROME, IRRITABLE BOWEL SYNDROME, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, ENTERIC BACTERIAL MICROFLORA, PRENATAL STRESS, INTESTINAL MICROBIOTA, LACTIC ACID BACTERIA, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, CLOSTRIDIUM-CLOSTRIDIOFORME, RISK, Science & Technology, Gastroenterology & Hepatology, Gastroenterology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, SEVERITY, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, Life Sciences & Biomedicine, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, LIPIDS
Abstract: ObjectivesClinical studies revealed that early-life adverse events contribute to the development of IBS in adulthood. The aim of our study was to investigate the relationship between prenatal stress (PS), gut microbiota and visceral hypersensitivity with a focus on bacterial lipopeptides containing γ-aminobutyric acid (GABA).DesignWe developed a model of PS in mice and evaluated, in adult offspring, visceral hypersensitivity to colorectal distension (CRD), colon inflammation, barrier function and gut microbiota taxonomy. We quantified the production of lipopeptides containing GABA by mass spectrometry in a specific strain of bacteria decreased in PS, in PS mouse colons, and in faeces of patients with IBS and healthy volunteers (HVs). Finally, we assessed their effect on PS-induced visceral hypersensitivity.ResultsPrenatally stressed mice of both sexes presented visceral hypersensitivity, no overt colon inflammation or barrier dysfunction but a gut microbiota dysbiosis. The dysbiosis was distinguished by a decreased abundance ofLigilactobacillus murinus, in both sexes, inversely correlated with visceral hypersensitivity to CRD in mice. An isolate from this bacterial species produced several lipopeptides containing GABA including C14AsnGABA. Interestingly, intracolonic treatment with C14AsnGABA decreased the visceral sensitivity of PS mice to CRD. The concentration of C16LeuGABA, a lipopeptide which inhibited sensory neurons activation, was decreased in faeces of patients with IBS compared with HVs.ConclusionPS impacts the gut microbiota composition and metabolic function in adulthood. The reduced capacity of the gut microbiota to produce GABA lipopeptides could be one of the mechanisms linking PS and visceral hypersensitivity in adulthood.
Published: 2022

17. Multi-omics phenotyping highlights organ-specific metabolic and inflammatory shifts associated with differential plant and animal protein intake in high fat fed rats

Author: Gaïa Lépine, Hélène Fouillet, Marie Tremblay-Franco, Didier Remond, Nathalie Poupin, Veronique Mathe, Jérémie David, Dominique Hermier, Laetitia Guérin-Deremaux, Catherine Lefranc-Millot, Jean-François Huneau, François Mariotti, Sergio Polakof, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire (PNCA (UMR 0914)), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Roquette Frères, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), and Lépine, Gaïa
Subjects: [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, transcriptomics, plant protein, cardiometabolic risk, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Metabolomics, animal protein, fluxomics, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2021

18. Study Protocol: A 2-Month Cross-Over Controlled Feeding Trial Investigating the Effect of Animal and Plant Protein Intake on the Metabolome and Cardiometabolic Health

Author: Gaïa Lépine, Laetitia Guérin-Deremaux, Sergio Polakof, Marie Tremblay-Franco, Nicolas Macian, Marion Courrent, François Mariotti, Jean-François Huneau, Marie-Anne Verny, Catherine Lefranc-Millot, Hélène Fouillet, Nathalie Poupin, Didier Rémond, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire (PNCA (UMR 0914)), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), CIC Clermont Ferrand, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-Centre de Pharmacologie Clinique, Roquette Frères, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Lépine, Gaïa, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Subjects: 2. Zero hunger, Meal, education.field_of_study, Nutrition and Dietetics, business.industry, Population, Medicine (miscellaneous), Physiology, Urine, Overweight, Omics, medicine.disease, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Plant protein, Diabetes mellitus, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Metabolome, medicine, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], medicine.symptom, business, education, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Protocols, Food Science
Abstract: Visioconférence; International audience; Objectives: A dietary shift in favor of plant protein (PP) sources over animal protein (AP) sources has been advocated for both sustainability and health reasons, this dietary transition being noticeably associated to decreased cardiovascular and diabetes risks. The differences in amino acid composition between PP and AP may have several effects on the metabolic pathways, and in turn health impacts, which are still poorly characterized. This project aims at characterizing, with a combination of “omics” approaches, the metabolic reorientations induced by a dietary shift from AP to PP sources and understanding their health effects in a population at cardiometabolic risk. Methods: We will conduct a cross-over randomized feeding trial (NCT04236518) in 20 healthy overweight males (BMI 25–35), aged 25–55, with an enlarged waist circumference (> 94cm) and high plasma triglycerides (>1.5g/L). Participants will be assigned for 1 month each to 2 diets containing predominantly either AP (65% AP:35% PP) or PP (35% AP:65% PP) in a randomized order, separated by a 2-week wash-out period. Lunch and diner will be directly provided while dietary guidelines will be given for breakfast and snacks. Blood, urine and stool samples will be collected at the fasted state every 2 weeks. At the end of each dietary intervention, blood and urine will be collected following a high fat meal, which challenges metabolism and vascular homeostasis. Plasma and urine non-targeted metabolomics analyses (LC-MS) will be combined with Peripheral Blood Mononuclear Cell (PBMC) transcriptomics and fluxomics analyses (D2O tracer) to get a comprehensive overview of the metabolic phenotype associated with AP or PP intake. Flow-Mediated Dilatation (FMD) and Flow Laser Doppler (FLD) will be used to measure respectively macrovascular endothelial function and microvascular skin blood flow at the fasted state and after the high-fat meal. We will also measure anthropometric parameters and analyze biochemistry and inflammatory markers. Results: Not applicable (protocols abstract). Conclusions: We expect the multi-omics fingerprinting to reveal subtle metabolic differences associated to AP or PP intake, with a positive effect of PP intake. Improved inflammatory status and endothelial function are also expected to be associated to PP intake. Funding Sources INRAE and Roquette Frères.
Published: 2021

19. L-Arginine Supplementation Significantly Affects Plasma Metabolome in Healthy Adults with Cardiometabolic Risk Irrespectively of Their Response to a Challenge Meal

Author: Ambre Deveaux, Marie Tremblay-Franco, Hélène Fouillet, François Mariotti, Jean-Charles Martin, Sergio Polakof, Laurianne Dimina, Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire (PNCA (UMR 0914)), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Supported by a grant from Pierre Fabre Research Institute, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and RANCHON, GUILLAUME
Subjects: Cardiometabolic risk, medicine.medical_specialty, Meal, Nutrition and Dietetics, Calorie, Arginine, business.industry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Medicine (miscellaneous), Overweight, Allostatic load, [SDV] Life Sciences [q-bio], Endocrinology, Internal medicine, medicine, Metabolome, Energy and Macronutrient Metabolism, medicine.symptom, business, Food Science
Abstract: International audience; Abstract Objectives We aimed to characterize the effects of a low dose of a sustained-release L-arginine (L-ARG) supplementation on plasma metabolome in healthy overweight adults with cardiometabolic risk factors, and study if its effect could improve the capacity to handle a high fat-high sugar meal, that deeply and acutely challenge metabolic capacities. Methods In a randomized, double-blind, controlled trial, 33 healthy overweight adults (BMI > 25kg/m²) with cardiometabolic risk (plasma triglycerides > 150 mg/dL; waist circumference > 94 cm (men) or > 80 cm (women)) were treated with 1.5 g L-ARG 3 times/d (4.5 g/d) or placebo for 4 weeks. On the last day of treatment, the volunteers consumed a high fat, high sugar meal challenge (900 kcal). Plasma was collected at fasting and 2, 4 and 6 h after the meal. Metabolites were analyzed by high-resolution mass spectrometry hyphenated to liquid chromatography, using reversed and normal phase columns, and operated in both positive and negative ionization modes. Annotation was performed using an in-house database referencing more than 1300 metabolites. Metabolic profiles were analyzed using Linear Mixed Models-PCA (LiMM-PCA), which enables to analyze repeated multivariate data. LiMM-PCA combines linear mixed models and PCA to assess the effects of both fixed factors (Treatment, Time before and after meal, interaction Treatment x Time, Order of treatment administration and Period of the study) and random factors (Individual). Results 521 metabolic features were identified in the plasma. Time accounted for most part of the variance in dataset (30.0%, P 0.10). The analysis of the metabolites contributing the most to these effects is under progress. Conclusions L-ARG supplementation has a significant effect on the metabolome in a situation where the metabolome is heavily impacted by a large allostatic load, and these two effects are independent of each other. Funding Sources Supported by a grant from Pierre Fabre Research Institute.
Published: 2021

20. Does the Phytochemical Diversity of Wild Plants Like the Erythrophleum genus Correlate with Geographical Origin?

Author: David Touboul, Olivier J. Hardy, Nausicaa Noret, Marie Faes, Pierre Van Antwerpen, Caroline Stevigny, Florence Souard, Marie Tremblay-Franco, Cédric Delporte, Cécile Vanhaverbeke, Jean-François Martin, Anaïs Pasiphaé Gorel, Faculté de Pharmacie [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB), Faculté des Sciences [Bruxelles] (ULB), Département de pharmacochimie moléculaire (DPM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Plant Ecology, Department of Plants and Crops, Faculty of Bioscience Engineering, Ghent University, Ghent, Belgium, LC-MS platform was supported by the Belgian National Fund for Scientific Research (FRS, Nffi 3.4553.08 and T.0136.13 PDR) and the Universite libre de Bruxelles (FER-2007)., Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Subjects: 0106 biological sciences, eco-metabolomics, cassane-type diterpenes, Metabolite, [SDV]Life Sciences [q-bio], Chimie analytique, Pharmaceutical Science, Sciences biomédicales en général, phytochemical, Biology, plant fingerprint, geographic variation, 01 natural sciences, Analytical Chemistry, lcsh:QD241-441, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Metabolomics, lcsh:Organic chemistry, Genus, Drug Discovery, Botany, Metabolome, molecular networks, natural variation, Physical and Theoretical Chemistry, Chimie pharmaceutique, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Erythrophleum, specialized metabolites, Organic Chemistry, 15. Life on land, plant-omics, biology.organism_classification, metabolomics, Molecular network, chemistry, Phytochemical, Chemistry (miscellaneous), Erythrophleum suaveolens, Molecular Medicine, Sciences pharmaceutiques, Biologie, 010606 plant biology & botany
Abstract: Secondary metabolites are essential for plant survival and reproduction. Wild undomesticated and tropical plants are expected to harbor highly diverse metabolomes. We investigated the metabolomic diversity of two morphologically similar trees of tropical Africa, Erythrophleum suaveolens and E. ivorense, known for particular secondary metabolites named the cassaine-type diterpenoids. To assess how the metabolome varies between and within species, we sampled leaves from individuals of different geographic origins but grown from seeds in a common garden in Cameroon. Metabolites were analyzed using reversed phase LC-HRMS(/MS). Data were interpreted by untargeted metabolomics and molecular networks based on MS/MS data. Multivariate analyses enabled us to cluster samples based on species but also on geographic origins. We identified the structures of 28 cassaine-type diterpenoids among which 19 were new, 10 were largely specific to E. ivorense and five to E. suaveolens. Our results showed that the metabolome allows an unequivocal distinction of morphologically-close species, suggesting the potential of metabolite fingerprinting for these species. Plant geographic origin had a significant influence on relative concentrations of metabolites with variations up to eight (suaveolens) and 30 times (ivorense) between origins of the same species. This shows that the metabolome is strongly influenced by the geographical origin of plants (i.e. genetic factors)., info:eu-repo/semantics/published
Published: 2021

21. Safety assessment of cosmetics by read across applied to metabolomics data of in vitro skin and liver models

Author: Sandrine Bessou-Touya, Marie Tremblay-Franco, Yves Brunel, Hélène Duplan, Cécile Canlet, Emilien L. Jamin, Daniel Zalko, Carine Jacques, Jean-François Martin, Laurent Debrauwer, Pierre-Jacques Ferret, Isabelle Jouanin, Centre de Recherche Pierre Fabre (Centre de R&D Pierre Fabre), PIERRE FABRE, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Subjects: Swine, Health, Toxicology and Mutagenesis, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], Skin mode, Cosmetics, Pharmacology, Toxicology, Cell Line, 03 medical and health sciences, Animal data, 0302 clinical medicine, Metabolomics, In vivo, Toxicity Tests, Metabolome, Animals, Humans, Cells, Cultured, 030304 developmental biology, media_common, Skin, Skin metabolism, 0303 health sciences, Chemistry, In vitro toxicology, Lipid metabolism, General Medicine, 3. Good health, Liver, Consumer Product Safety, 030220 oncology & carcinogenesis, Toxicity, Read-across, Female, Decanoic Acids
Abstract: International audience; As a result of the cosmetics testing ban, safety evaluations of cosmetics ingredients must now be conducted using animal-free methods. A common approach is read across, which is mainly based on structural similarities but can also be conducted using biological endpoints. Here, metabolomics was used to assess biological effects to enable a read across between a candidate cosmetic ingredient, DIV665, only studied using in vitro assays, and a structurally similar reference compound, PA102, previously investigated using traditional in vivo toxicity methods. The (1) cutaneous distribution after topical application, (2) skin metabolism, (3) liver metabolism and (4) effect on the intracellular metabolomic profiles of in vitro skin and hepatic models, SkinEthic®RHE model and HepaRG® cells were investigated. The compounds exhibited similar skin penetration and skin and liver metabolism, with small differences attributed to their physicochemical properties. The effects of both compounds on the metabolome of RHE and HepaRG® cells were similarly small, both in terms of the metabolites modulated and the magnitude of changes. The patterns of metabolome changes did not fit with any known signature relating to a mode of action known to be linked to liver toxicity e.g. modification of the Krebs cycle, urea synthesis and lipid metabolism, were more reflective of transient adaptive responses. Overall, these studies indicate that PA102 is biologically similar to DIV665, allowing read across of safety endpoints, such as in vivo sub-chronic (but not reproduction toxicity) studies, for the former to be applied to DIV665. Based on this, in the absence of animal data (which is prohibited for new chemicals), it could be concluded that DIV665 applied according to the consumer topical use scenario, is similar to PA102, and is predicted to exhibit low local skin and systemic toxicity
Published: 2021

22. The food contaminant, deoxynivalenol, modulates the Thelper-Treg balance and increases inflammatory bowel diseases

Author: Edwin Fouché, Marie Tremblay-Franco, Delphine Payros, Philippe Pinton, Joëlle Laffitte, Manon Neves, Isabelle P. Oswald, Su Luo, Sandrine Ménard, Vassilia Theodorou, Selma P. Snini, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Neuro-Gastroentérologie & Nutrition (ToxAlim-NGN), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Prévention et promotion de la cancérogénèse par les aliments (ToxAlim-PPCA), ANR-15-CE21-0001,CaDON,Cadmium et Deoxynivalenol dans les récoltes de blé dur: comprendre les évènements de contamination croisée et évaluer la toxicité du mélange.(2015), ANR-19-CE34-0014,Genofood,Exacerbation de la génotoxicité du microbiote intestinal par un contaminant alimentaire(2019), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, OSWALD, Isabelle, Cadmium et Deoxynivalenol dans les récoltes de blé dur: comprendre les évènements de contamination croisée et évaluer la toxicité du mélange. - - CaDON2015 - ANR-15-CE21-0001 - AAPG2015 - VALID, Exacerbation de la génotoxicité du microbiote intestinal par un contaminant alimentaire - - Genofood2019 - ANR-19-CE34-0014 - AAPG2019 - VALID, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim), and This work was supported by grants from the French National Research Agency (projects CaDON 15-CE21-0001 and Genofood 19-CE34).
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Health, Toxicology and Mutagenesis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Stimulation, 010501 environmental sciences, Toxicology, 01 natural sciences, T-Lymphocytes, Regulatory, Mycotoxin, biology, Dextran Sulfate, General Medicine, Colitis, 3. Good health, Intestine, Intestines, [SDV.TOX] Life Sciences [q-bio]/Toxicology, medicine.anatomical_structure, [SDV.TOX.TVM] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Vegetal toxicology and mycotoxicology, Myeloperoxidase, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, [SDV.TOX.TVM]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Vegetal toxicology and mycotoxicology, Spleen, Food Contamination, [SDV.TOX.TCA]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, 03 medical and health sciences, Immune system, medicine, Animals, Secretion, Immune response, 0105 earth and related environmental sciences, Lamina propria, Innate immune system, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, business.industry, [SDV.BA.MVSA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, Mycotoxins, medicine.disease, Inflammatory Bowel Diseases, Diet, Rats, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, De-epoxy-DON: DOM-1, [SDV.TOX.TCA] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Toxicology and food chain, Immunology, biology.protein, business, Trichothecenes, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: International audience; The incidence of inflammatory bowel diseases (IBD) is increasing in both Western and developing countries. IBD are multifactorial disorders involving complex interactions between genetic, immune, and environmental factors such as exposure to food contaminants. Deoxynivalenol (DON) is the most prevalent mycotoxin that contaminates staple food and induces intestinal breakdown and inflammatory response. To delineate the role of DON oral exposure in IBD, we used a Dextran sulfate sodium (DSS) colitis model in rats fed with a DON-contaminated diet or a control diet for 4 weeks. Colitis was induced in the 4th week by increasing concentrations of DSS in the drinking water (0, 2, 3 or 5%). DON exacerbated body weight loss and accelerated the appearance of symptoms in animals treated with DSS. DON increased morphological damage, pro-inflammatory markers (myeloperoxidase, CXCL-1 and IL-1β) and immune cell responses. In lamina propria of the rat with colitis, DON increased adaptive and innate immune responses after anti-CD3/28 or LPS stimulation, respectively. In the spleen, DON increased IFNγ secretion and reduced Treg populations. Interestingly, De-epoxy-DON (DOM-1) a detoxified form of DON did not have any consequences on colitis. These results suggest that DON is a risk factor in the onset of IBD.
Published: 2020

23. Postprandial NMR-Based Metabolic Exchanges Reflect Impaired Phenotypic Flexibility across Splanchnic Organs in the Obese Yucatan Mini-Pig

Author: Isabelle Savary-Auzeloux, Cécile Canlet, Nathalie Poupin, Dominique Dardevet, Marie Tremblay-Franco, Aurélien Amiel, Fabien Jourdan, Sergio Polakof, Laurent Debrauwer, Didier Rémond, Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul FluxoMet (TBI-MetaToul), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), INRAE AlimH department funding French Infrastructure for Metabolomics and Fluxomics MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolomique et Fluxomique (MetaToul) (TBI-MetaToul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: 0301 basic medicine, Blood Glucose, Magnetic Resonance Spectroscopy, Swine, high fat-high sucrose diet, [SDV]Life Sciences [q-bio], postprandial, mini-pigs, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Dietary Sucrose, energy metabolism, Glucose homeostasis, Homeostasis, Intestinal Mucosa, Nutrition and Dietetics, Glycogen, Postprandial Period, metabolomics, Postprandial, Swine, Miniature, Animal Nutritional Physiological Phenomena, Female, Splanchnic, lcsh:Nutrition. Foods and food supply, arteriovenous differences, medicine.medical_specialty, 030209 endocrinology & metabolism, lcsh:TX341-641, Biology, Diet, High-Fat, liver, Article, 03 medical and health sciences, Metabolomics, Insulin resistance, Internal medicine, medicine, Metabolome, Animals, Obesity, intestine, phenotypic flexibility, medicine.disease, 030104 developmental biology, Endocrinology, chemistry, Insulin Resistance, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Food Science
Abstract: The postprandial period represents one of the most challenging phenomena in whole-body metabolism, and it can be used as a unique window to evaluate the phenotypic flexibility of an individual in response to a given meal, which can be done by measuring the resilience of the metabolome. However, this exploration of the metabolism has never been applied to the arteriovenous (AV) exploration of organs metabolism. Here, we applied an AV metabolomics strategy to evaluate the postprandial flexibility across the liver and the intestine of mini-pigs subjected to a high fat&ndash, high sucrose (HFHS) diet for 2 months. We identified for the first time a postprandial signature associated to the insulin resistance and obesity outcomes, and we showed that the splanchnic postprandial metabolome was considerably affected by the meal and the obesity condition. Most of the changes induced by obesity were observed in the exchanges across the liver, where the metabolism was reorganized to maintain whole body glucose homeostasis by routing glucose formed de novo from a large variety of substrates into glycogen. Furthermore, metabolites related to lipid handling and energy metabolism showed a blunted postprandial response in the obese animals across organs. Finally, some of our results reflect a loss of flexibility in response to the HFHS meal challenge in unsuspected metabolic pathways that must be further explored as potential new events involved in early obesity and the onset of insulin resistance.
Published: 2020

24. Modelling intrahepatic metabolic rewiring during the onset of obesity using arterio- venous blood metabolomics profiles

Author: Nathalie Poupin, Marie Tremblay-Franco, Cécile Canlet, Aurélien Amiel, Didier Rémond, Laurent Debrauwer, Dominique Dardevet, Fabien Jourdan, Isabelle Savary-Auzeloux, Sergio Polakof, Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolomique et Fluxomique (MetaToul) (TBI-MetaToul), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul FluxoMet (TBI-MetaToul), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Metatoul AXIOM (E20 ), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université
Subjects: [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2020

25. 1H-NMR metabolomics response to a realistic diet contamination with the mycotoxin deoxynivalenol: Effect of probiotics supplementation

Author: Mathieu Castex, Marie Tremblay-Franco, Caroline Achard, Philippe Pinton, Ana Paula Frederico Rodrigues Loureiro Bracarense, Fabien Jourdan, Anne Marie Cossalter, Cécile Canlet, Imourana Alassane-Kpembi, Maxime Chalzaviel, Sylvie Combes, Isabelle P. Oswald, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université d'Abomey-Calavi, University of Abomey Calavi (UAC), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), MedDay Pharmaceuticals, Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), Plateforme Ezop (Ezop), Lallemand S.A.S., Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Lab. Patologia Animal, and State University of Londrina = Universidade Estadual de Londrina
Subjects: pig, Biology, Toxicology, law.invention, histology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Probiotic, 0404 agricultural biotechnology, Metabolomics, law, mycotoxins, Metabolome, Food science, Mycotoxin, intestine, 030304 developmental biology, Subclinical infection, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Saccharomyces cerevisiae boulardii, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, Metabolism, 040401 food science, metabolomics, Yeast, 3. Good health, chemistry, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Toxicity, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Food Science
Abstract: International audience; Low-level contamination of food and feed by deoxynivalenol (DON) is unavoidable. We investigated the effects of subclinical treatment with DON, and supplementation with probiotic yeast Saccharomyces cerevisiae boulardii I1079 as a preventive strategy in piglets. Thirty-six animals were randomly assigned to either a control diet, a diet contaminated with DON (3 mg/kg), a diet supplemented with yeast (4 × 109 CFU/kg), or a DON-contaminated diet supplemented with yeast, for four weeks. Plasma and tissue samples were collected for biochemical analysis, 1H-NMR untargeted metabolomics, and histology. DON induced no significant modifications in biochemical parameters. However, lesion scores were higher and metabolomics highlighted alterations of amino acid and 2-oxocarboxylic acid metabolism. Administering yeast affected aminoacyl-tRNA synthesis and amino acid and glycerophospholipid metabolism. Yeast supplementation of piglets exposed to DON prevented histological alterations, and partial least square discriminant analysis emphasised similarity between the metabolic profiles of their plasma and that of the control group. The effect on liver metabolome remained marginal, indicating that the toxicity of the mycotoxin was not eliminated. These findings show that the 1H-NMR metabolomics profile is a reliable biomarker to assess subclinical exposure to DON, and that supplementation with S. cerevisiae boulardii increases the resilience of piglets to this mycotoxin.
Published: 2020

26. Proton NMR enables the absolute quantification of aqueous metabolites and lipid classes in unique mouse liver samples

Author: Aurélien Amiel, Hervé Guillou, Marie Tremblay-Franco, Simon Ducheix, Roselyne Gautier, Alexandra Montagner, Laurent Debrauwer, Arnaud Polizzi, Justine Bertrand-Michel, Cécile Canlet, ProdInra, Migration, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), National Infrastructure for Metabolomics and Fluxomics, Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateau MetaToul-LIPIDOMIQUE = MetaToul-Lipidomics, Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-MetaboHUB-MetaToul, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Région Occitanie (H.G., A.P., A.M., S.D.), ANR Hepadialogue ANR-17-CE14-0015 (H.G., A.P., A.M., S.D.), and the French National Infrastructure for Metabolomics and Fluxomics MetaboHUB ANR-11-INBS-010 (C.C., A.A., L.D., M.T.-F., R.G., J.B.-M.), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Canlet, Cécile
Subjects: 0301 basic medicine, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Metabolite, 1H-NMR spectroscopy, Toxicology, liver, 01 natural sciences, Biochemistry, Article, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Lipidomics, medicine, steatosis, Food and Nutrition, Molecular Biology, Toxicologie, Alanine, Aqueous solution, Chromatography, Cholesterol, 010401 analytical chemistry, Extraction (chemistry), metabolomics quantitative profiling, medicine.disease, 0104 chemical sciences, [SDV.TOX] Life Sciences [q-bio]/Toxicology, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, 030104 developmental biology, chemistry, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Alimentation et Nutrition, Proton NMR, lipidomics, Steatosis, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: International audience; Hepatic metabolites provide valuable information on the physiological state of an organism, and thus, they are monitored in many clinical situations. Typically, monitoring requires several analyses for each class of targeted metabolite, which is time consuming. The present study aimed to evaluate a proton nuclear magnetic resonance (1H-NMR) method for obtaining quantitative measurements of aqueous and lipidic metabolites. We optimized the extraction protocol, the standard samples, and the organic solvents for the absolute quantification of lipid species. To validate the method, we analyzed metabolic profiles in livers of mice fed three different diets. We compared our results with values obtained with conventional methods and found strong correlations. The 1H-NMR protocol enabled the absolute quantification of 29 aqueous metabolites and eight lipid classes. Results showed that mice fed a diet enriched in saturated fatty acids had higher levels of triglycerides, cholesterol ester, monounsaturated fatty acids, lactate, 3-hydroxy-butyrate, and alanine and lower levels of glucose, compared to mice fed a control diet. In conclusion, proton NMR provided a rapid overview of the main lipid classes (triglycerides, cholesterol, phospholipids, fatty acids) and the most abundant aqueous metabolites in liver.
Published: 2020

27. Workflow4Metabolomics: an international computing infrastructure for Metabolomics

Author: Mélanie Pétéra, Romain Dallet, Christophe Dupérier, Franck Giacomoni, Yann GUITTON, Jean-François Martin, Pierrick Roger-Mele, Julien Saint-Vanne, Etienne Thévenot, Marie Tremblay Franco, Gildas Le Corguillé, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), UMS 3601, Institut Français de Bioinformatique (IFB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Université Nantes Angers Le Mans (LUNAM), Ecole Nationale Vétérinaire Agroalimentaire et de l'Alimentation Nantes Atlantique (ONIRIS), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), LIST/LADIS, Laboratoire d'Intégration de Systèmes et des technologies, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), MetaboHUB, FR2424, ABiMS Station Biologique, Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut Français de Bioinformatique - UMS CNRS 3601 (IFB-CORE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LUNAM Université [Nantes Angers Le Mans], Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire Sciences des Données et de la Décision (LS2D), Département Métrologie Instrumentation & Information (DM2I), Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (FR2424), Station biologique de Roscoff (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST (CEA)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Fédération de recherche de Roscoff (FR2424), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (ABIMS), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff (SBR), and Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan)
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], bioinformatics, spectrum analysis, artificial intelligence, metabolomics, spectrum, machine learning, classification, annotations, [INFO.INFO-OS]Computer Science [cs]/Operating Systems [cs.OS], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], signal processing, data processing, mass spectrometry
Abstract: Thursday 4th July - Talks I & Trainings Proteomics & Metabolomics. Moderator: P. Jagtap Thursday 4th July - Talks I & Trainings Proteomics & Metabolomics. Moderator: P. JagtapThursday 4th July - Talks I & TrainingsProteomics & Metabolomics. Moderator: P. Jagtap; The Workflow4Metabolomics (W4M) project aims to develop full LC/MS, GC/MS, FIA/MS and NMR pipelines using Galaxy framework for dataanalysis including preprocessing, normalization, quality control, statistical analysis and annotation steps. Our current developments aim to provide a set of interactive visualization tools in order to make ease the results interpretations. The development of Shiny applications will allows interactions from graphical features and dataset filters with graphical outputs like chromatograms, RMN spectra, heatmaps or PCA. In parallel, one of the major issue of the metabolomic approach is the compounds identification. To facilitate this annotation step, tandem mass spectrometry (MS/MS) is able to provide informations about the compounds structure. For that reason, an MS/MS data processing workflow based on msPurity, and two identification tools, metFrag and Sirius-CSI: FingerID, will be available in W4M.
Published: 2019

28. Insights from metabolomic and molecular signatures to detect, in a blood sample, muscle anabolic resistance associated with catabolic situation. Case model of glucocorticoids effect in mini-pigs

Author: Sergio Polakof, Marie Tremblay-Franco, Nathalie Poupin, Florence Castelli, Jérémie David, Marianne Jarzaguet, Didier Rémond, Francois Fenaille, Dominique Dardevet, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), LEMM, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), MetaToul AXIOM (E20), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments (LEMM), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: ICTRHN Nutrition, Physical activity and health Oral communication SESSION 2: MUSCLE WASTING AND ORGAN FAILURE ICTRHN Nutrition, Physical activity and health Oral communication SESSION 2: MUSCLE WASTING AND ORGAN FAILUREICTRNH Nutrition, Physical activity and healthOral communication SESSION 2: MUSCLE WASTING AND ORGAN FAILURE; Insights from metabolomic and molecular signatures to detect, in a blood sample, muscle anabolic resistance associated with catabolic situation. Case model of glucocorticoids effect in mini-pigs . Fifth International Congress of Translational Research in Human Nutrition (ICTRHN)
Published: 2019

29. Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigs

Author: Gaëlle Lefort, Laurence Liaubet, Patrick Tardivel, Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Laurent Debrauwer, Nathalie Villa-Vialaneix, Rémi Servien, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes), DigitAG, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2018

30. ASICS: an automatic method for identification andquantification of metabolites in complex 1D 1HNMR spectra

Author: Patrick Tardivel, Cécile Canlet, Gaëlle Lefort, Laurent Debrauwer, Marie Tremblay Franco, Didier Concordet, Rémi Servien, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Quantification of metabolites, NIST plasma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Metabolomics, Identification of metabolites, [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math], Nuclear magnetic resonance
Abstract: National audience; One of the major challenges in NMR/mass spectrometry analysis of metabolic profiles relies onthe identification and quantification of metabolites in complex biological mixtures. These features aremandatory to make metabolomics asserting a general approach to test a priori formulated hypotheseson the basis of exhaustive metabolome characterization rather than an exploratory tool dealing with un-known metabolic features. In this communication we propose a method, named ASICS, based on astrong statistical theory that handles automatically the metabolites identification and quantification inproton NMR spectra. A statistical linear model is built to explain a complex spectrum using a librarycontaining pure metabolite spectra. This model can handle local or global chemical shift variations dueto experimental conditions using a warping function. A statistical lasso-type estimator identifies andquantifies the metabolites in the complex spectrum. This estimator shows good statistical properties andhandles peak overlapping issues. The performances of the method were investigated on known mixtures(such as synthetic urine) and on plasma datasets from duck and human (plasma NIST SRM1950) using alibrary of 175 pure metabolites. Results show noteworthy performances, outperforming current existingmethods (namely MetaboHunter, BATMAN, Bayesil or Chenomx) for the identification and the quan-tification of metabolites. Furthermore, ASICS could easily be used routinely according to its reasonablecomputational time (no more than 3 minutes for the whole analysis of a complex spectrum). In conclu-sion, ASICS is a completely automated procedure for metabolites identification and quantification in 1HNMR spectra of biological mixtures. It will enable empowering NMR-based metabolomics by quicklyand accurately helping experts to obtain metabolic profiles. ASICS is already available as a R function orwithin the more user-friendly Galaxy/W4M interface developed by the MetaboHUB infrastructure andIFB (French Institute of Bioinformatics).
Published: 2017

31. Early modulation of gut digestion and microbiota in piglets by the addition of dairy lipids and probiotic L. fermentum in infant formula(s)

Author: Marion Lemaire, Samir Dou, Cecile Canlet, Marie Tremblay Franco, Michele Formal, Olivia Ménard, Isabelle Nogret, Isabelle Cuinet, Pascale Le Ruyet, Charlotte Baudry, Didier Dupont, Philippe Gerard, Amélie Deglaire, Sophie Blat, Isabelle Luron, Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Lactalis, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: fluids and secretions, health care facilities, manpower, and services, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, digestive system, health care economics and organizations
Abstract: International audience; Early modulation of gut digestion and microbiota in piglets by the addition of dairy lipids and probiotic L. fermentum in infant formula(s). 3. International Neonatology Association Conference (INAC)
Published: 2017

32. Adaptive response under multiple stress exposure in fish: From the molecular to individual level

Author: Laure Gress, Annie Perrault, Pierre Mormède, Hélène Budzinski, Séverine Jean, Nathalie Tapie, Pascal Laffaille, Roselyne Gautier, Allison Gandar, Marie Tremblay-Franco, Cécile Canlet, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Molecular Sciences Institute (ISM), CNRS, Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0301 basic medicine, Pollution, Environmental Engineering, Health, Toxicology and Mutagenesis, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], 010501 environmental sciences, Biology, 01 natural sciences, Toxicology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Metabolomics, Stress, Physiological, Biologie animale, Animals, Environmental Chemistry, oxidative stress, 14. Life underwater, Pesticides, goldfish, 0105 earth and related environmental sciences, media_common, Tebuconazole, Animal biology, Aquatic ecosystem, Stressor, Public Health, Environmental and Occupational Health, temperature, General Medicine, General Chemistry, Adaptive response, Pesticide, Adaptation, Physiological, Pendimethalin, Médecine vétérinaire et santé animal, 030104 developmental biology, climate change, chemistry, pesticide mixture, metabolomic, nuclear magnetic resonance NMR, 13. Climate action, Veterinary medicine and animal Health, Water Pollutants, Chemical
Abstract: Notice à reprendre pas de clé UT au 9 Octobre 2017; Aquatic systems are subjected to various sources of stress due to global changes, such as increasingtemperature and pollution. A major challenge for the next decade will be to evaluate the combinedeffects of these multiple stressors on organisms and ecosystems. For organisms submitted to chemical,biological or physical stressors, the capacity to set up an efficient adaptive response is a fundamentalprerequisite for their long-term survival and performance. In this study, goldfish (Carassius auratus) weresubjected to individual and combined pesticide mixtures and increased temperatures to evaluate theiradaptive response in multistress conditions from the molecular to the individual level. Fish were exposedfor 16 days to a mixture of pesticides at environmental relevant concentrations (S-metolachlor, isoproturon,linuron, atrazine-desethyl, aclonifen, pendimethalin and tebuconazole) and at two temperatures(22 C and 32 C). Three major physiological traits of the stress response were measured: thehormonal response (i.e. plasma cortisol), the metabolic balance from molecular to individuals' levels(metabolomics, cellular energy allocation, energy reserves and global condition indexes), and the cellulardefense system induction (SOD, CAT and GST). Results show that (1) environmentally relevant concentrationsof pesticides lead to significant responses in fish at all biological levels; (2) the metabolicresponse depends on the nature of stress (thermal vs. chemical); and (3) fish may be unable to set up anefficient adaptive response when chemical and thermal stresses were combined, with adverse outcomesat the individuals’ level.
Published: 2017

33. ASICS: an automatic method for identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Author: Patrick Tardivel, Didier Concordet, Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Gaëlle Lefort, Rémi Servien, Laurent Debrauwer, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul-AXIOM, Plateforme de Métabolomique et de Chimie Analytique en Toxicologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0301 basic medicine, Quantification of metabolites, Computer science, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Analytical chemistry, 01 natural sciences, Biochemistry, Nuclear magnetic resonance, NIST Plasma, 03 medical and health sciences, Metabolomics, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Metabolome, Identification of metabolites, Statistical theory, 010401 analytical chemistry, Linear model, Estimator, 0104 chemical sciences, Identification (information), 030104 developmental biology, Proton NMR, A priori and a posteriori, Biological system
Abstract: International audience; Introduction : Experiments in metabolomics rely on the identification and quantification of metabolites in complex biological mixtures. This remains one of the major challenges in NMR/mass spectrometry analysis of metabolic profiles. These features are mandatory to make metabolomics asserting a general approach to test a priori formulated hypotheses on the basis of exhaustive metabolome characterization rather than an exploratory tool dealing with unknown metabolic features. Objectives : In this article we propose a method, named ASICS, based on a strong statistical theory that handles automatically the metabolites identification and quantification in proton NMR spectra. Methods : A statistical linear model is built to explain a complex spectrum using a library containing pure metabolite spectra. This model can handle local or global chemical shift variations due to experimental conditions using a warping function. A statistical lasso-type estimator identifies and quantifies the metabolites in the complex spectrum. This estimator shows good statistical properties and handles peak overlapping issues. Results : The performances of the method were investigated on known mixtures (such as synthetic urine) and on plasma datasets from duck and human. Results show noteworthy performances, outperforming current existing methods. Conclusion : ASICS is a completely automated procedure to identify and quantify metabolites in 1H NMR spectra of biological mixtures. It will enable empowering NMR-based metabolomics by quickly and accurately helping experts to obtain metabolic profiles.
Published: 2017

34. Children with eating disorders secondarily to artificial nutrition in the neonatal period have specific food preferences and saliva composition

Author: Martine Morzel, Eric Neyraud, Géraldine Lucchi, Hélène Brignot, Patrick Ducoroy, Aline Jeannin, Caroline Truntzer, Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Christophe Hirtz, Ségolène Gaillard, Gilles Feron, Noël Peretti, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme Protéomique CLIPP - Clinical and Innovation Proteomic Platform [Dijon] (CLIPP), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) (FEMTO-ST), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Comité Lapin Interprofessionnel pour la Promotion des Produits Français (CLIPP), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier ), Hospices Civils de Lyon (HCL), Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), French National Research Agency (grant ANR-10-ALIA-001 ORALISENS)., European Society for Paediatric Gastroenterology, Hepatology and Nutrition (ESPGHAN). USA., Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Plate-forme Protéomique CLIPP - Clinical and Innovation Proteomic Platform [Dijon] ( CLIPP ), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies ( FEMTO-ST ), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] ( ICMUB ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Comité Lapin Interprofessionnel pour la Promotion des Produits Français ( CLIPP ), ToxAlim ( ToxAlim ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse, Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier ( CHU Montpellier ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition ( CarMeN ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, saliva, children, oral disorder, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: Objectives and studyIn the neonatal period, some severe digestive diseases require the cessation of oral feeding and the use of enteral or parenteral nutrition for prolonged periods. In some cases, this by-pass of the oral cavity during the early stages of feeding results in the development of so-called oral disorders (OD). Oral disorders may persist for years after healing of the causal disease, and are expressed for example by an exacerbated gag reflex, difficulties in chewing and swallowing and high food selectivity.The aim of this study were to describe the consequences on oral physiology of oral by-pass and enteral nutrition in a population of 21 children who suffered oral disorder (OD) compared to a healthy control population (NOD, n=23). - MethodsThe two populations were followed during one year with three saplings and compared regarding 1) their food sensitivity (consisting to measured feeding difficulties, food preferences and food habits with a questionnaire approach); and 2) their salivary composition .Proteome analyses were performed with different methods. First, spots of interest on 2D gel electrophoresis were manually excised and after tryptic digestion, MALDI-TOF/TOF acquisitions lead to identifications. SELDI-TOF MS profiling with ProteinChips arrays was also carried out.Peptidome profiling by label-free MALDI-TOF allows to detect potential markers, identification of discriminant peaks was attempted by MALDI-TOF-TOF and nanoLC-ESI MS-MS.Metabolome analyses were performed by 1H NMR. Following statistical analysis, discriminant buckets were assigned to metabolites using reference spectra from reference databases.- ResultsWe included 21 children who suffered oral disorder (OD) and 23 age- and sex-matched healthy controls 1) On feeding difficulty aspects, OD children were separated significantly on 6 dimensions reflecting eating difficulties (oral tactile sensitivity, appetite and interest for food, sensitivity to food texture, sensitivity to the tastes, sensitivity to temperature). Moreover, consumption frequency, number of consumed foods and liking were lower for the OD compared to the controls children for specific food groups.2) On salivary composition, despite heterogeneity within the groups (age, pathology, medication, etc.), the three spectral methods (MALDI-TOF, SELDI-TOF, 1H NMR) allowed discriminating OD and controls, confirming that oral stimulation by food intake plays a role in shaping the composition of saliva. Saliva of OD patients exhibited a lower antioxidant status and lower levels of the salivary protease inhibitors cystatins. Other discriminant features (IgA1, dimethylamine) may relate to modified oral and/or intestinal microbial ecology. Finally, salivary profiles of OD patients were partly comparable to those of subjects with exacerbated gustatory sensitivities, in particular with reduced abundance of cystatin SN and higher abundance of zinc-alpha-glycoprotein. - ConclusionDespite heterogeneity within the groups in terms of age/developmental stage and initial pathology in the patients group, feeding preferences such as salivary profiles specifically associated to oral disorders were identified. Whether this translates taste hypersensitivity and contributes to the eating difficulties deserves further attention.
Published: 2016

35. Hepatic circadian clock oscillators and nuclear receptors integrate microbiome-derived signals

Author: Yi-Chun Yen, Arnaud Polizzi, Yuna Blum, Hervé Guillou, Marie Tremblay-Franco, Gilles Mithieux, Alexandra Montagner, Agata Korecka, Rémy Burcelin, Amandine Gautier-Stein, Sven Pettersson, Walter Wahli, Maha Al-Asmakh, Cécile Canlet, Hyunsoo Shawn Je, Sandrine Lagarrigue, Velmurugesan Arulampalam, Yannick Lippi, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology (MTC), Stockholm University, Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Transcriptomic impact of Xenobiotics (E23 TRiX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Medicine, Division of Cardiology, University of California [Los Angeles] (UCLA), University of California (UC)-University of California (UC), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaboHUB-MetaToul, U855, Nutrition et cerveau, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Physiology, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore (NUS), Molecular Neurophysiology Laboratory, Signature Program in Neuroscience and Behavioral Disorders, Duke-NUS Medical School [Singapore], Karolinska Institute, Department of Health Sciences, College of Arts and Sciences, Qatar University, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Université Européenne de Bretagne (UEB), Lee Kong Chian School of Medicine, Nanyang Technological University [Singapour], SCELSE microbiome centre, Center for Integrative Genomics - Institute of Bioinformatics, Génopode (CIG), Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL)-Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), Region Midi-Pyrenees, Swiss National Science Foundation, Bonizzi-Theler-Stiftung, 7th EU program TORNADO, Etat de Vaud, Nanyang Technological University Start-Up Grants, Merieux Foundation, Swedish Medical Research Council, SCELCE Microbiome Centre at NTU, Singapore, CIFAR Institute, Canada, ProdInra, Archive Ouverte, Lee Kong Chian School of Medicine (LKCMedicine), Singapore Centre for Environmental Life Sciences Engineering, University of California-University of California, Duke-NUS Graduate Medical School, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Center for Integrative Genomics, Université de Lausanne, Guillou, Hervé, Pettersson, Sven, Wahli, Walter, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université de Lausanne (UNIL)-Université de Lausanne (UNIL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Nanyang Technological University (NTU)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Gut microbiota, Intestinal, microbiota, Liver-disease, Ppar-alpha, Metabolism, Homeostasis, Modulation, Components, Expression, Health, [SDV]Life Sciences [q-bio], Circadian clock, Receptors, Cytoplasmic and Nuclear, Mice, 0302 clinical medicine, 2. Zero hunger, Regulation of gene expression, Multidisciplinary, Gastrointestinal Microbiome, 3. Good health, CLOCK, [SDV] Life Sciences [q-bio], Liver, Organ Specificity, Inactivation, Metabolic, Medicine, Female, Signal transduction, Erratum, Signal Transduction, medicine.medical_specialty, Cell biology, Animals, Biomarkers, Circadian Clocks/genetics, Gastrointestinal Tract/metabolism, Gastrointestinal Tract/microbiology, Gene Expression Profiling, Gene Expression Regulation, Gluconeogenesis/genetics, Inactivation, Metabolic/genetics, Liver/metabolism, Microbiota, Receptors, Cytoplasmic and Nuclear/genetics, Receptors, Cytoplasmic and Nuclear/metabolism, Transcriptome, Biology, Microbiology, Article, 03 medical and health sciences, Internal medicine, Circadian Clocks, medicine, Genetics, Microbiome, Gluconeogenesis, Gene expression profiling, Gastrointestinal Tract, 030104 developmental biology, Endocrinology, Liver function, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: The liver is a key organ of metabolic homeostasis with functions that oscillate in response to food intake. Although liver and gut microbiome crosstalk has been reported, microbiome-mediated effects on peripheral circadian clocks and their output genes are less well known. Here, we report that germ-free (GF) mice display altered daily oscillation of clock gene expression with a concomitant change in the expression of clock output regulators. Mice exposed to microbes typically exhibit characterized activities of nuclear receptors, some of which (PPARα, LXRβ) regulate specific liver gene expression networks, but these activities are profoundly changed in GF mice. These alterations in microbiome-sensitive gene expression patterns are associated with daily alterations in lipid, glucose, and xenobiotic metabolism, protein turnover, and redox balance, as revealed by hepatic metabolome analyses. Moreover, at the systemic level, daily changes in the abundance of biomarkers such as HDL cholesterol, free fatty acids, FGF21, bilirubin, and lactate depend on the microbiome. Altogether, our results indicate that the microbiome is required for integration of liver clock oscillations that tune output activators and their effectors, thereby regulating metabolic gene expression for optimal liver function. Région Midi-Pyrénées to HG (Mathusalem) and to WW (Chaire d’Excellence Pierre de Fermat). This work was also supported by grants from the Swiss National Science Foundation (individual grants to WW), the Bonizzi-Theler-Stiftung (WW), the 7th EU program TORNADO (WW, SP), and by the Etat de Vaud and the Lee Kong Chian School of Medicine, Nanyang Technological University Start-Up Grants. SP is also supported by grants from the Merieux Foundation, Swedish Medical Research Council, the SCELCE Microbiome Centre at NTU, Singapore, and CIFAR Institute, Canada.
Published: 2016

36. Bisphenol A exposure disrupts neurotransmitters through modulation of transaminase activity in the brain of rodents

Author: Ana M. Soto, Nicolas J. Cabaton, Marie Tremblay-Franco, Daniel Zalko, Fabien Jourdan, Cécile Canlet, Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Tufts University School of Medicine, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Tufts University School of Medicine [Boston], Centre Cavaillès, La République des savoirs : Lettres, Sciences, Philosophie, Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0301 basic medicine, endocrine system, medicine.medical_specialty, bisphenol A, [SDV]Life Sciences [q-bio], Rodentia, Biology, Neurotransmission, Inhibitory postsynaptic potential, gamma-Aminobutyric acid, Transaminase, Postnatal day, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, body weight, GABA, 0302 clinical medicine, Endocrinology, Phenols, Internal medicine, medicine, Animals, Humans, Benzhydryl compounds, MICE, BPA, NMR, nuclear magnetic resonance, PND, Benzhydryl Compounds, Transaminases, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Neurotransmitter Agents, Perinatal Exposure, Brain, 030104 developmental biology, chemistry, Gestation, GABAergic, 030217 neurology & neurosurgery, medicine.drug
Abstract: An increasing body of literature suggests that perinatal exposure to low doses of bisphenol A (BPA) has lasting effects on brain development and/or behavior in rodents (1, 2). Concerns about the occurrence of similar effects in humans are based on the parallel increase of neurobehavioral conditions in humans that appear in rodents exposed to BPA (3), and on epidemiological studies (4). In their recent article, Franssen et al (5) demonstrated opposite dose-dependent effects of BPA on the neuroendocrine maturation of female rats exposed during early life from postnatal day (PND)1 to PND15. In animals exposed to a 0.025g BPA/kg bw (body weight)/d dose, neuroendocrine maturation related to puberty was found to be delayed, with opposite effects observed in animals exposed to a 5000g BPA/kg bw/d dose. Modulation of inhibitory -aminobutiric acid (GABA)ergic neurotransmission was found to be associated with the delayed maturation of GnRH secretion through increased GABAergic tone for the 0.025g BPA/kg bw/d dose; opposite effects were observed for the higher dose. These new findings prompted us to reexamine in more detail our results obtained for male mice exposed to very low doses of BPA from gestational day 8 to PND16 (maternal exposure to 0-, 0.025-, 0.25-, or 25g BPA/kg bw/d) (6). In this 2013 study, we used untargeted H-nuclear magnetic resonance (NMR) metabolomics to explore the metabolites present in a set of tissues, including male brains at PND21. All brain metabolites were included in a partial least square-discriminant analysis model, which demonstrated extremely significant differences between the 4 groups. GABA was one of the major metabolites responsible for intergroup differences. To better understand the mechanisms by which BPA disrupts brain development, we reanalyzed our raw data from 2013 with the purpose of 1) challenging the hypotheses by Franssen et al, and 2) seeking additional hypotheses that could explain the disruption of GABAergic pathways. We addressed the former by means of a 2 by 2 group comparison and the latter by analyzing the genome-scale metabolic net
Published: 2016

37. Dynamic metabolic disruption in rats perinatally exposed to low doses of bisphenol-A

Author: Ana M. Soto, Fabien Jourdan, Marie Tremblay-Franco, Nicolas J. Cabaton, Daniel Zalko, Florence Vinson, Carlos Sonnenschein, Cécile Canlet, Cheryl M. Schaeberle, Roselyne Gautier, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Tufts University School of Medicine, National Institute of Environmental Health Sciences [R01ES08314], [RC2ES018822], Zalko, Daniel, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Tufts University School of Medicine [Boston], Centre Cavaillès, La République des savoirs : Lettres, Sciences, Philosophie, Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, Proton Magnetic Resonance Spectroscopy, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:Medicine, 010501 environmental sciences, Biology, Carbohydrate metabolism, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Metabolomics, Phenols, Pregnancy, Internal medicine, medicine, Metabolome, Endocrine system, Animals, Benzhydryl compounds, Estrogens, Non-Steroidal, Benzhydryl Compounds, lcsh:Science, Toxicologie, 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences, 0303 health sciences, Chemicals, Multidisciplinary, Perinatal Exposure, lcsh:R, Metabolism, Rats, Xenoestrogen, Endocrinology, chemistry, Liver, lcsh:Q, Female, Energy Metabolism, Research Article
Abstract: International audience; Along with the well-established effects on fertility and fecundity, perinatal exposure to endocrine disrupting chemicals, and notably to xeno-estrogens, is strongly suspected of modulating general metabolism. The metabolism of a perinatally exposed individual may be durably altered leading to a higher susceptibility of developing metabolic disorders such as obesity and diabetes; however, experimental designs involving the long term study of these dynamic changes in the metabolome raise novel challenges. H-1-NMR-based metabolomics was applied to study the effects of bisphenol-A (BPA, 0; 0.25; 2.5, 25 and 250 mu g/kg BW/day) in rats exposed perinatally. Serum and liver samples of exposed animals were analyzed on days 21, 50, 90, 140 and 200 in order to explore whether maternal exposure to BPA alters metabolism. Partial Least Squares-Discriminant Analysis (PLS-DA) was independently applied to each time point, demonstrating a significant pair-wise discrimination for liver as well as serum samples at all time-points, and highlighting unequivocal metabolic shifts in rats perinatally exposed to BPA, including those exposed to lower doses. In BPA exposed animals, metabolism of glucose, lactate and fatty acids was modified over time. To further explore dynamic variation, ANOVA-Simultaneous Component Analysis (A-SCA) was used to separate data into blocks corresponding to the different sources of variation (Time, Dose and Time*Dose interaction). A-SCA enabled the demonstration of a dynamic, time/age dependent shift of serum metabolome throughout the rats' lifetimes. Variables responsible for the discrimination between groups clearly indicate that BPA modulates energy metabolism, and suggest alterations of neurotransmitter signaling, the latter finding being compatible with the neurodevelopmental effect of this xenoestrogen. In conclusion, long lasting metabolic effects of BPA could be characterized over 200 days, despite physiological (and thus metabolic) changes connected with sexual maturation and aging.
Published: 2015

38. Identification and Quantification of metabolites in NMR spectrum

Author: Patrick Tardivel, Rémi Servien, Cécile Canlet, Laurent Debrauwer, Marie Tremblay Franco, Didier Concordet, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2015

39. Potential input from metabolomics for exploring and understanding the links between environment and health

Author: Jean Pierre Cravedi, Marie Tremblay-Franco, Nathalie Bonvallot, Cécile Chevrier, Sylvaine Cordier, Laurent Debrauwer, Cécile Canlet, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), EHESP School of Public Health, France, Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Urine samples, Subchronic exposure, Chromatography-mass spectrometry, Health, Toxicology and Mutagenesis, Systems biology, Health Status, Biology, Toxicology, Hazardous Substances, Dietary exposure, Biological samples, Chemical mixtures, Metabolomics, Humans, Analytical technologies, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Disease diagnosis, Human saliva, Low-dose exposure, 3. Good health, Exposome, Risk analysis (engineering), Resonance-based metabonomics, Identification (biology), [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Public Health, Environmental Health, Biomarkers
Abstract: International audience; Humans may be exposed via their environment to multiple chemicals as a consequence of human activities and use of synthetic products. Little knowledge is routinely generated on the hazards of these chemical mixtures. The metabolomic approach is widely used to identify metabolic pathways modified by diseases, drugs, or exposures to toxicants. This review, based on the state of the art of the current applications of metabolomics in environmental health, attempts to determine whether metabolomics might constitute an original approach to the study of associations between multiple, low-dose environmental exposures in humans. Studying the biochemical consequences of complex environmental exposures is a challenge demanding the development of careful experimental and epidemiological designs, in order to take into account possible confounders associated with the high level of interindividual variability induced by different lifestyles. The choices of populations studied, sampling and storage procedures, statistical tools used, and system biology need to be considered. Suggestions for improved experimental and epidemiological designs are described. Evidence indicates that metabolomics may be a powerful tool in environmental health in the identification of both complex exposure biomarkers directly in human populations and modified metabolic pathways, in an attempt to improve understanding the underlying environmental causes of diseases. Nevertheless, the validity of biomarkers and relevancy of animal-to-human extrapolation remain key challenges that need to be properly explored.
Published: 2014

40. Nutri-metabolomics applied to taste perception phenotype: Human subjects with high and low sensitivity to taste of fat differ in salivary response to oleic acid

Author: Géraldine Lucchi, Eric Neyraud, Marie Tremblay-Franco, Gilles Feron, Martine Morzel, Cécile Canlet, Hélène Brignot, Patrick Ducoroy, Rana Mounayar, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plate-forme Protéomique CLIPP - Clinical and Innovation Proteomic Platform [Dijon] (CLIPP), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) (FEMTO-ST), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Plate-forme Protéomique CLIPP - Clinical and Innovation Proteomic Platform [Dijon] ( CLIPP ), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies ( FEMTO-ST ), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] ( ICMUB ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaboHUB-MetaToul, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation (CSGA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université de Franche-Comté (UFC), and Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB)
Subjects: Male, EXPRESSION, STIMULATION, Taste, Saliva, HUMAN WHOLE, PROTEIN PROFILES, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, FLOW, HEALTHY-SUBJECTS, Stimulation, Biology, Biochemistry, SERUM, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Eating, 0302 clinical medicine, Metabolomics, MARKERS, PAROTID-SALIVA, Genetics, Metabolome, Humans, Food science, Molecular Biology, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Mouth, Fatty acid, Taste Perception, [ SDV.BIO ] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Phenotype, Dietary Fats, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Oleic acid, [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, Molecular Medicine, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Biotechnology, Oleic Acid
Abstract: Saliva has different functions in the mouth and is involved, for example, in taste perception. Saliva composition can also be modified rapidly by taste stimulation. It remains unclear, however, whether the perceived intensity of a tastant may modulate this response. Based on increasing evidence that fat can be perceived by the taste system and that fat taste perception may be associated with fat intake, the aim of this work was to study if stimulation by a fatty acid (oleic acid) modifies saliva composition differently in subjects highly (sensitive+) or weakly (sensitive-) sensitive to that taste. For that purpose, saliva of two groups of subjects was collected after stimulation by either a control emulsion or an emulsion containing 5.61 mM oleic acid. Saliva was analyzed by 2D electrophoresis and (1)H NMR spectroscopy. The results show that sensitive+ and sensitive- subjects differ in their salivary response in terms of proteome and metabolome composition. Oppositely to sensitive- subjects, sensitive+ subjects responded to oleic acid by increased abundance of polymeric immunoglobulin receptor, rab GDP dissociation inhibitor beta, and organic acids, and decreased abundance of metabolites characteristic of mucins. The results highlight that modification of saliva composition by taste stimulation may be modulated by taste perception.
Published: 2014

41. Salivary markers of taste sensitivity to oleic acid: a combined proteomics and metabolomics approach

Author: Hélène Brignot, Marie Tremblay-Franco, Rana Mounayar, Patrick Ducoroy, Martine Morzel, Cécile Canlet, Géraldine Lucchi, Eric Neyraud, Gilles Feron, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Plate-forme Protéomique CLIPP - Clinical and Innovation Proteomic Platform [Dijon] (CLIPP), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) (FEMTO-ST), Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Burgundy Regional Council, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Plate-forme Protéomique CLIPP - Clinical and Innovation Proteomic Platform [Dijon] ( CLIPP ), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies ( FEMTO-ST ), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] ( ICMUB ), and Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Bourgogne ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: Taste, Saliva, Proteome, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Clinical Biochemistry, [ SDV.IDA ] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Butyrate, Biology, Biochemistry, Oleic acid, Metabolomics, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Metabolome, Isoleucine, Leucine, Fat taste, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: International audience; Saliva is a biological fluid playing numerous roles in the oral cavity and increasingly considered as a source of markers. The role of saliva in sensory perception has been known for years but it is only recently that its potential role in oral fatty acids (FA) perception has been suggested. The aim of the present work was to study the relationships between taste sensitivity to oleic acid and the salivary proteome (2D electrophoresis) and metabolome (H-1 NMR). This was achieved by comparing saliva from two groups of subjects, highly (sensitive+) and weakly sensitive (sensitive-) to the taste of oleic acid. Partial least squares-discriminant analyses (PLS-DA) were used to model the relationship between sensitivity to C18:1, and the proteome and metabolome data. The two groups could be discriminated by ten spots. In particular, cystatin SN, cystatin D, zinc-alpha-2-glycoprotein and carbonic anhydrase 6 were overexpressed in the sensitive+ group. The latter result was confirmed by ELISA. The overexpression of these proteins, which have been associated to taste perception, supports the argument that C18: 1 is perceived by the taste system. The two groups could also be discriminated on the basis of eight metabolites, with FA, FA/proline, lysine and FA/pyruvate overexpressed in the sensitive+ group and acetate, leucine/isoleucine and butyrate overexpressed in the sensitive-group. The overexpression of these metabolites suggests a higher bacterial load in this group which could be implicated in perception of FAs.
Published: 2014

42. Untargeted profiling of pesticide metabolites by LC-HRMS: an exposomics tool for human exposure evaluation

Author: Cécile Chevrier, Marie Tremblay-Franco, Jean Pierre Cravedi, Emilien L. Jamin, Nathalie Bonvallot, Laurent Debrauwer, Sylvaine Cordier, ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), INRA-AlimH research division, the French Ministry of Environment in a national program Grenelle de l'Environnement programme LOLF 189 funding (EXPiOmark)., Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Population exposée risque, Epidemiology, Biochimie, Chimie analytique, Tandem mass spectrometry, Mass spectrometry, Biochemistry, Analytical Chemistry, Santé environnementale, Exposure, Cohort Studies, chemistry.chemical_compound, Métabolisme, Pregnancy, Biomonitoring, Metabolites, Animals, Humans, Surveillance épidémiologique, Rats, Wistar, Pesticides, Evaluation, Structure chimique, Chromatography, High Pressure Liquid, 2. Zero hunger, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Fenpropimorph, Chromatography, Chemistry, Exposition, Environmental Exposure, Pesticide, Epidémiologie, Rats, Human exposure, Environmental chemistry, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Xenobiotic, Molécule
Abstract: International audience; : Human exposure to xenobiotics is usually estimated by indirect methods. Biological monitoring has emerged during the last decade to improve assessment of exposure. However, biomonitoring is still an analytical challenge, because the amounts of sample available are often very small yet analysis must be as thorough and sensitive as possible. The purpose of this work was to develop an untargeted "exposomics" approach by using ultra-high-performance liquid chromatography coupled to high-resolution mass spectrometry (UHPLC-HRMS), which was applied to the characterization of pesticide metabolites in urine from pregnant women from a French epidemiological cohort. An upgradable list of pesticides commonly used on different crops, with their metabolites (more than 400 substances) was produced. Raw MS data were then processed to extract signals from these substances. Metabolites were identified by tandem mass spectrometry; putative identifications were validated by comparison with standards and metabolites generated by experiments on animals. Finally, signals of identified compounds were statistically analyzed by use of multivariate methods. This enabled discrimination of exposure groups, defined by indirect methods, on the basis of four metabolites from two fungicides (azoxystrobin, fenpropimorph) used in cereal production. This original approach applied to pesticide exposure can be extended to a variety of contaminant families for upstream evaluation of exposure from food and the environment.
Published: 2013

43. Relationships between the metabolome and the fatty acid composition of human saliva; effects of stimulation

Author: Marie Tremblay-Franco, Cécile Canlet, Eric Neyraud, Stéphane Grégoire, Olivier Berdeaux, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), xénobiotiques, ToxAlim ( ToxAlim ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse-Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Taurine, Saliva, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Clinical Biochemistry, mastication, Biology, Biochemistry, fatty acids, nmr, Palmitic acid, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Metabolomics, stomatognathic system, Metabolome, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, saliva, Fatty acid, 030206 dentistry, metabolomics, Amino acid, chemistry, Propionate, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: http://link.springer.com/ ; WOS: 000313736700018; International audience; Saliva is a biological fluid that is easy to collect and is of considerable interest as a source of biomarkers. To date, its protein composition has been the most extensively studied but its metabolic composition is also of real interest. However, the composition of saliva is complex and dependent on numerous factors, among which stimulation is source of many variations. The aim of this work was to study the effects of a stimulating condition (chewing) versus a resting condition on the human salivary metabolome. Saliva from 16 subjects was collected on three occasions and studied using nuclear magnetic resonance. The two conditions could be separated by PLS-DA analysis. Fatty acids, some organic acids and amino acids, probably arising from the degradation of prolin-rich proteins, were over-represented in stimulated saliva, whereas taurine, and propionate were over-represented in resting saliva. To clarify further the identification of fatty acids, the free and total fatty acid contents were studied by gas chromatography. The principal fatty acids identified were oleic, stearic and palmitic acids. It was also possible to separate the two conditions of stimulation by PLS-DA. These results show that the regulation of saliva and sampling conditions must be taken into account when studying markers in saliva.
Published: 2013

44. Specific metabolic fingerprint of a dietary exposure to a very low dose of endosulfan

Author: Marie Tremblay-Franco, Benjamin Metais, Laurence Gamet-Payrastre, Florence Blas Y. Estrada, Cécile Canlet, Roselyne Gautier, Jérôme Molina, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Ezop (Ezop), Toxicologie Intégrative & Métabolisme (ToxAlim-TIM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Canlet, Cecile, TREMBLAY FRANCO, Marie, Molina, Jerome, Blas-Y-Estrada, Florence, and Payrastre, Laurence
Subjects: medicine.medical_specialty, Article Subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], 010501 environmental sciences, Toxicology, medicine.disease_cause, Bioinformatics, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Insulin resistance, lcsh:RA1190-1270, Diabetes mellitus, Internal medicine, medicine, Choline, Endosulfan, lcsh:Toxicology. Poisons, 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences, Pharmacology, 0303 health sciences, Dietary exposure, business.industry, Low dose, Pesticide, medicine.disease, 3. Good health, Endocrinology, chemistry, business, Oxidative stress, Research Article
Abstract: Like other persistent organochlorine pesticides, endosulfan residues have been detected in foods including fruit, vegetables, and fish. The aim of our study was to assess the impact of a dietary exposure to low doses of endosulfan from foetal development until adult age on metabolic homeostasis in mice and to identify biomarkers of exposure using an1H-NMR-based metabonomic approach in various tissues and biofluids. We report in both genders an increase in plasma glucose as well as changes in levels of factors involved in the regulation of liver oxidative stress, confirming the prooxidant activities of this compound. Some metabolic changes were distinct in males and females. For example in plasma, a decrease in lipid LDL and choline content was only observed in female. Lactate levels in males were significantly increased. In conclusion, our results show that metabolic changes in liver could be linked to the onset of pathologies like diabetes and insulin resistance. Moreover from our results it appears that the NMR-based metabonomic approach could be useful for the characterization in plasma of a dietary exposure to low dose of pesticide in human.
Published: 2013

45. Effects of low doses of bisphenol A on the metabolome of perinatally exposed CD-1 mice

Author: Jérôme Molina, Beverly S. Rubin, Marie Tremblay-Franco, Jean-Pierre Cravedi, Ana M. Soto, Carlos Sonnenschein, Roselyne Gautier, Perinaaz R. Wadia, Nicolas J. Cabaton, Cécile Canlet, Daniel Zalko, Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Anatomy and Cellular Biology, Tufts University [Medford], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Male, Health, Toxicology and Mutagenesis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Endocrine Disruptors, 010501 environmental sciences, souris, 01 natural sciences, Mice, Pregnancy, Lactation, endocrine disruptor, 0303 health sciences, Perinatal Exposure, metabolomics, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Liver, Endocrine disruptor, partial least-squares discriminant analysis (PLS-DA), Metabolome, Female, faible dose, toxicology, medicine.medical_specialty, bisphenol a, fetal origins of adult disease, low dose, metabonomics, nmr fingerprints, partial least squares discriminant analysis, perinatal exposure, Offspring, Biology, 03 medical and health sciences, Fetus, Phenols, In vivo, Internal medicine, medicine, Animals, Endocrine system, bisphénol a, Lactic Acid, Benzhydryl Compounds, 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences, métabolome, Research, Public Health, Environmental and Occupational Health, Metabolism, Endocrinology
Abstract: International audience; BACKGROUND: Bisphenol A (BPA) is a well-known endocrine disruptor used to manufacture polycarbonate plastics and epoxy resins. Exposure of pregnant rodents to low doses of BPA results in pleiotropic effects in their offspring. OBJECTIVE: We used metabolomics-a method for determining metabolic changes in response to nutritional, pharmacological, or toxic stimuli-to examine metabolic shifts induced in vivo by perinatal exposure to low doses of BPA in CD-1 mice. METHODS: Male offspring born to pregnant CD-1 mice that were exposed to vehicle or to 0.025, 0.25, or 25 mu g BPA/kg body weight/day, from gestation day 8 through day 16 of lactation, were examined on postnatal day (PND) 2 or PND21. Aqueous extracts of newborns (PND2, whole animal) and of livers, brains, and serum samples from PND21 pups were submitted to H-1 nuclear magnetic resonance spectroscopy. Data were analyzed using partial least squares discriminant analysis. RESULTS: Examination of endogenous metabolic fingerprints revealed remarkable discrimination in whole extracts of the four PND2 newborn treatment groups, strongly suggesting changes in the global metabolism. Furthermore, statistical analyses of liver, serum, and brain samples collected on PND21 successfully discriminated among treatment groups. Variations in glucose, pyruvate, some amino acids, and neuro-transmitters (gamma-aminobutyric acid and glutamate) were identified. CONCLUSIONS: Low doses of BPA disrupt global metabolism, including energy metabolism and brain function, in perinatally exposed CD-1 mouse pups. Metabolomics can be used to highlight the effects of low doses of endocrine disruptors by linking perinatal exposure to changes in global metabolism.
Published: 2013

46. Metabolomics tools for describing complex pesticide exposure in pregnant women in Brittany (france)

Author: Cécile Canlet, Marie Tremblay-Franco, Sylvaine Cordier, Cécile Chevrier, Charline Warembourg, Jean Pierre Cravedi, Nathalie Bonvallot, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This work was supported by grants from the EHESP-School of Public Health (Young researchers, www.ehesp.fr) and the French Ministry for Environment and sustainable development (Antiopes, INERIS), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Coval, Nathalie, Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaboHUB-MetaToul, xénobiotiques, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Magnetic Resonance Spectroscopy, Anatomy and Physiology, Epidemiology, lcsh:Medicine, Urine, 010501 environmental sciences, Physical Chemistry, 01 natural sciences, Toxicology, Pregnancy, lcsh:Science, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Confounding, Applied Chemistry, Discriminant Analysis, Agriculture, 3. Good health, Chemistry, Maternal Exposure, Cohort, RESONANCE-BASED METABONOMICS, PRENATAL EXPOSURE, URINE SAMPLES, BIRTH-WEIGHT, AMINO-ACIDS, METABOLISM, DISEASE, BLOOD, ORGANOPHOSPHORUS, TECHNOLOGIES, Medicine, Female, Public Health, France, Agrochemicals, Environmental Health, Research Article, Adult, Nuclear Magnetic Resonance, Biology, [SDV.MHEP.GEO]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Gynecology and obstetrics, Environmental Epidemiology, Pesticide exposure, 03 medical and health sciences, Metabolomics, Environmental health, Brittany, medicine, Metabolome, Humans, Least-Squares Analysis, Pesticides, 030304 developmental biology, 0105 earth and related environmental sciences, Population Biology, Pregnant women, lcsh:R, Pesticide, medicine.disease, Biomarker Epidemiology, [SDV.MHEP.GEO] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Gynecology and obstetrics, Chemical Properties, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, lcsh:Q, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Pest Control, Physiological Processes, Energy Metabolism, Body mass index
Abstract: International audience; BACKGROUND: The use of pesticides and the related environmental contaminations can lead to human exposure to various molecules. In early-life, such exposures could be responsible for adverse developmental effects. However, human health risks associated with exposure to complex mixtures are currently under-explored. OBJECTIVE: THIS PROJECT AIMS AT ANSWERING THE FOLLOWING QUESTIONS: What is the influence of exposures to multiple pesticides on the metabolome? What mechanistic pathways could be involved in the metabolic changes observed? METHODS: Based on the PELAGIE cohort (Brittany, France), 83 pregnant women who provided a urine sample in early pregnancy, were classified in 3 groups according to the surface of land dedicated to agricultural cereal activities in their town of residence. Nuclear magnetic resonance-based metabolomics analyses were performed on urine samples. Partial Least Squares Regression-Discriminant Analysis (PLS-DA) and polytomous regressions were used to separate the urinary metabolic profiles from the 3 exposure groups after adjusting for potential confounders. RESULTS: The 3 groups of exposure were correctly separated with a PLS-DA model after implementing an orthogonal signal correction with pareto standardizations (R2 = 90.7% and Q2 = 0.53). After adjusting for maternal age, parity, body mass index and smoking habits, the most statistically significant changes were observed for glycine, threonine, lactate and glycerophosphocholine (upward trend), and for citrate (downward trend). CONCLUSION: This work suggests that an exposure to complex pesticide mixtures induces modifications of metabolic fingerprints. It can be hypothesized from identified discriminating metabolites that the pesticide mixtures could increase oxidative stress and disturb energy metabolism.
Published: 2013

47. Development of metabolomics method associating NMR and UPLC-HRMS

Author: Emilien Jamin, Cecile Canlet, Maria-Helena Meireles, Marc Dubois, Marie Tremblay Franco, Cabaton, Nicolas J., Fabien Jourdan, Pierre Millard, Fabien Létisse, Daniel Zalko, Laurent Debrauwer, MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service., Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2011

48. Approche métabonomique pour l'étude in vivo, in vitro et in silico de la toxicologie des faibles doses

Author: Daniel Zalko, Cabaton, Nicolas J., Cecile Canlet, Marie Tremblay Franco, Fabien Jourdan, ProdInra, Migration, Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ville service., Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2011

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