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The current environmental context results in increasingly important risks concerning crops, whatever their type. From hydric constraints, leading to more frequent and more important periods of drought, to the management of pests that take advantage of global warming to proliferate. The importance of having varieties that are both resistant and guarantee a good yield is becoming essential. The registration of new varieties in the catalog is the last step of a long process in which varietal selection plays a central role. However, this process is still slow, especially with the phenotyping phase, which is still mostly done by hand. Improving phenotyping would mean improving varietal selection and through it, better meeting the challenges already mentioned. It is in this context that Limagrain, an agricultural cooperative and seed company, and INRAE, a research organization, have undertaken the creation of a hyperspectral image acquisition module in order to make the transition to so-called high-throughput phenotyping.; Le contexte environnemental actuel se traduit par des risques plus importants concernant les cultures allant des contraintes hydriques, aboutissant à des périodes de sécheresse à la fois plus fréquentes et plus importantes, jusqu’à la gestion des ravageurs qui profitent du réchauffement climatique pour proliférer. L’importance de disposer de variétés à la fois résistantes et garantes d’un bon rendement devient indispensable. L’inscription de nouvelles variétés au catalogue est la dernière étape d’un long processus dans lequel la sélection variétale tient un rôle central. Cependant, celle-ci se révèle encore lente notamment avec la phase de phénotypage qui est encore faite en majorité « à la main ». Améliorer le phénotypage reviendrait à améliorer la sélection variétale et à travers elle, à mieux répondre aux enjeux déjà évoqués. C’est dans ce contexte que Limagrain, coopérative agricole et entreprise semencière, et l’INRAE, organisme de recherche, ont entrepris la création d’un module d’acquisition d’images hyperspectrales pour effectuer une transition vers un phénotypage dit haut-débit.

Hardware performance has been increasing through the addition of computing cores rather than throughincreasing their frequency since the early 2000s.This means that parallel programming is no longer optional should you need to make the best use ofthe hardware at your disposal.Yet many programs are still written sequentially: parallel programming introduces numerousdifficulties.Amongst these, it is notably hard to determine whether a sequence of a program can be executed inparallel, i.e. preserving its behaviour as well as its overall result.Even knowing that it is possible to parallelise a piece of code, doing it correctly is anotherproblem.In this thesis, we present two approaches to make writing parallel software easier.We present an active library (using C++ template metaprogramming to operate during the compilaéetionprocess) whose purpose is to analyse and parallelise loops.To do so, it builds a representation of each processed loop using expression templates through anembedded language.This allows to know which variables are used and how they are used.For the case of arrays, which are common within loops, it also acquires the index functions.The analysis of this information enables the library to identify which instructions in the loop canbe run in parallel.Interdependent instructions are detected by knowing the variables and their access mode for eachinstruction.Given a group of interdependent instructions and the known index functions, the library decides ifthe instructions can be run in parallel or not.We want this library to help developers writing loops that will be automatically parallelisedwhenever possible and run sequentially as without the library otherwise.Another focus is to provide this to serve as a framework to integrate new methods for parallelisingprograms and extended analysis rules.We introduce another active library that aims to help developers by assisting them in writingparallel software instead of fully automating it.This library uses algorithmic skeletons to let the developer describe its algorithms with both itssequential and parallel parts by assembling atomic execution patterns such as a series of tasks or aparallel execution of a repeated task.This description includes the data flow, that is how parameters and function returns aretransmitted.Usually, this is automatically set by the algorithmic skeleton library, however it gives thedeveloper greater flexibility and it makes it possible, amongst other things, for our library toautomatically transmit special parameters that must not be shared between parallel tasks.One feature that this allows is to ensure repeatability from one execution to another even forstochastic algorithms.Considering the distribution of tasks on the different cores, we even reduce the number of thesenon-shared parameters.Once again, this library provides a framework at several levels.Low-level extensions consist of the implementation of new execution patterns to be used to buildskeletons.Another low-level axis is the integration of new execution policies that decide how tasks aredistributed on the available computing cores.High-level additions will be libraries using ours to offer ready-to-use algorithmic skeletons forvarious fields., L'écriture de programmes parallèles, par opposition aux programmes classiques séquentiels et n'utilisant donc qu'un processeur, est devenue une nécessité. En effet, si jusqu'au début du millénaire la puissance de calcul des ordinateurs dépendait principalement de la fréquence du processeur, elle est maintenant liée au nombre de cœurs de calcul qui sont de plus en plus nombreux. Pourtant, à cause des difficultés introduites par la parallélisation, la plupart des programmes sont toujours écrits de manière classique. En particulier, il peut être compliqué de déterminer, étant donné une sous partie d'un programme, si la parallélisation est possible, c'est-à-dire si elle n'introduira pas un changement de comportement du programme. Cependant, même en sachant précisément ce qui peut être parallélisé, le faire correctement est aussi une tâche difficile. Cette thèse présente deux approches pour simplifier l'écriture de programmes parallèles. Nous proposons une bibliothèque active -- par métaprogrammation template, elle agit durant la compilation -- qui acquiert des informations à propos d'une portion de programme, correspondant à une boucle, au moyen de patrons d'expression. Celles-ci sont utilisées pour analyser les instructions et identifier lesquelles peuvent être exécutées en parallèle. Cette analyse repose sur deux niveaux de connaissance : l'ensemble des variables utilisées en distinguant les accès en lecture de ceux en écriture, et, puisqu'il s'agit souvent de tableaux, des fonctions d'indice. Les variables et leur mode d'accès permettent de savoir quelles instructions sont interdépendantes tandis que les fonctions d'indice nous servent à déterminer, pour un groupe d'instructions, s'il est possible de procéder à une exécution parallèle des itérations de la boucle. L'objectif de cette bibliothèque est de proposer un cadre, à la fois pour les développeurs afin d'écrire des boucles qui seront automatiquement exécutées en parallèle si cela est possible, mais aussi à un niveau plus élevé pour intégrer de nouvelles méthodes de parallélisation ou d'autres règles à utiliser pour l'analyse. Nous proposons également une seconde bibliothèque, active elle aussi, orientée sur la parallélisation assistée en utilisant la technique des squelettes algorithmiques comme interface pour le développeur. Celle-ci permet de représenter des algorithmes complets comme des assemblages de motifs d'exécution : séquence de tâches ; exécution répétée d'une tâche en parallèle ; ... En utilisant cette connaissance, nous pouvons mettre en place des choix dans la manière de répartir les tâches exécutées en parallèle sur les différents processeurs. Par ailleurs, nous avons choisi d'expliciter l'expression de la transmission des données entre les tâches, contrairement à ce qui est habituellement fait.Grâce à cela, la bibliothèque automatise notamment la transmission de paramètres qui ne doivent pas être partagés par des tâches parallèles. Cela nous permet en particulier de garantir la répétabilité des exécutions y compris lorsque, par exemple, les tâches utilisent des nombres pseudo-aléatoires. En tenant compte de la politique d'exécution choisie et des nombres de processeurs possibles, nous réduisons la quantité nécessaire de ces paramètres ne devant pas être partagés. Ainsi, cette seconde bibliothèque propose elle aussi un cadre de programmation à plusieurs niveaux. Celle-ci est extensible au niveau de ses politiques d'exécution ou des motifs pour la construction des squelettes algorithmiques. On peut l'utiliser pour définir une variété de squelettes algorithmiques, lesquels serviront ensuite à un développeur pour écrire des programmes dont la parallélisation sera facilitée.

Nowadays, the questioning of citizens about the welfare of farm animal is growing. Assessment tools have been developed in intensive productions...; Actuellement, le questionnement des citoyens autour du bien-être des animaux d’élevage prend de l’ampleur. Des outils d’évaluation du bien-être des animaux ont été développés dans les filières dites intensives...

Infliximab (IFX) is a chimeric monoclonal antibody which has proven its efficacy in the treatment of inflammatory diseases. However, its efficacy can be limited by the development of anti-IFX antibodies (ATI) resulting in a therapeutic failure of IFX. ATI plasmatic monitoring is then indicated to optimize IFX treatment. The aim of this study was to validate an ELISA (enzyme linked immuno sorbent assay) method of ATI plasmatic monitoring. Methods Assessment of performance was based on the study of correlation and concordance (Bland Altman method) of the absorbances measured by the two readers. ELISA kit validation was made by calculating the accuracy and the exactitude. Results We collected 23 samples. Their mean age was 46 years and sex ratio M/W was 0.92. In nine cases, plasmatic AIT were positive and in 14 cases, they were not detected. Correlation between the two readers showed a correlation coefficient r2 of 99.95%. Concordance limits of the confidence interval 95% were [-112.768%-41.425%] with a bias of -35.671%. Repeatability and reproductibility were checked by a positive control and coefficients of variation were respectively of 5.574% and 14.184%. Limits of detection and quantification were respectively of 0.046 and 0.086. The positive predictive value was 0.5 and the negative predictive value was 1. The sensitivity was 100% and the specificity was 83%. Conclusion The assessment of the performance of the tested microplate reader and the validation of the tested ELISA kit showed good results allowing ATI routine measurement to optimize therapeutic management of patients treated by IFX.

Video summaries construction is a competitive area of research in the content based video retrieval field. The works presented in this thesis lies in this context whose main objective is to describe the videos of the database by a set of representative key frames. This process aims to facilitate the content-based video retrieval, which is composed of three phases: the description, the indexing and the retrieval. Thus, the extraction of certain global and local features is a primary task for description and indexing. Most of the state of the art methods used global features. In this work we used local features based on interest points which represents discontinuities.In a first step, we proposed a matching method based on the local description around interest points using the \LocalBinnaryPattern and the geometric invariants. This method showed its robustness against important interest points matching methods in the literature. It was used to extract features during the indexing process and it served us in the next step, which consists on proposing a new method of video key frames extraction based on local features. This provides the user with a summary containing the most representative objects in the videos in order to facilitate the search in a video database. In this context, we proposed two variants: The first variant is based on the repeatability table. First, a repeatability table was built based on the proposed matching method. This table contains the repeatability values between frames in the video. Subsequently, the classification of the repeatability values based on PCA and HAC allows the selection of the key frames that are the centers of the clusters. In order to improve this method, we proposed a second variant. In this variant, we chose a candidate set frames from the video based on a windowing rule and then a repeatability graph was constructed. This graph describes the relationship between the candidate frames in terms of repeatability. The classification of this graph using the modularity maximizing principle facilitates the process of obtaining the representative key frames of the videos. Finally, we defined an evaluation protocol dedicated to the key frames extraction methods. In addition to the qualitative and quantitative evaluation, this protocol aims to project the results obtained on content based video retrieval system, in order to ensure more the effectiveness of videos description by the keyframes obtained., La construction des résumés de vidéos est un domaine de recherche compétitif pour la recherche de vidéos par le contenu. C'est dans ce cadre que se s'inscrivent nos travaux de thèse dont l'objectif principal est de décrire les vidéos de la base par un ensemble d'images clés, et ce pour faciliter la recherche de vidéos par le contenu dans les bases de vidéos. Ainsi, l'extraction de certaines caractéristiques globales et locales s'avère une tâche primordiale. Une des méthodes les plus courantes pour l'extraction d'informations locales s'appuie sur l'utilisation des points d'intérêts représentant une discontinuité. Dans une première _étape, nous avons proposé une méthode de mise en correspondance de ces points basée sur la description local autour des points d'intérêts par "Local Binard Pattern" et sur les invariants géométriques. Cette méthode va nous servir dans la prochaine _étape qui consiste _à proposer une nouvelle méthode d'extraction des images clés pour chaque vidéo. Ceci permet de fournir _à l'utilisateur un résume contenant les images les plus représentatives dans les vidéos an de lui faciliter la recherche dans une base de vidéos. Dans ce contexte, nous avons proposé deux variantes : La première variante est basée sur la table de répétabilité. Tout d'abord, la table de répétabilité est construite en se basant sur la méthode de mise en correspondance proposée. Cette table contient les valeurs de répétabilité entre les images de la vidéo. Par la suite, la classification des valeurs de répétabilité permet la sélection des images clés qui sont les centres des classes. Dans le but d'améliorer cet algorithme, une deuxième variante a _été proposée. Dans cette variante, des images candidates de la vidéo ont _été choisies _à l'aide d'une technique de fenêtrage puis un graphe de répétabilité a _été construit. Ce graphe décrit la relation entre les images candidates en termes de répétabilité. La classification de ce graphe en utilisant le principe de maximisation de modularité permet l'obtention des images représentatives de la vidéo. Enon, nous avons déni un protocole d'_évaluation dédie aux méthodes d'extraction des images clés. Ce protocole vise en plus de l'_évaluation qualitative et quantitative de projeter les résultats obtenus sur le domaine de recherche de vidéos par le contenu pour s'assurer davantage de l'efficacité de la description des vidéos par les images clés obtenues.

International audience; The recent evolution of processors and hardware accelerators, compilers, compiler options and other elements of the execution context of a simulation, produce a lack of repeatability of computational experiments. This subject is gaining attention in many scientific fields. The search for numerical reproducibility is essential for all scientific experimentations, but it is many times overlooked. In this article we propose an analysis ofthe challenges of numerical reproducibility. Then we identify the main obstacles to its implementation. To overcome these obstacles, we propose, in the case of parallel stochastic simulations, a set of recommendations and a method which helps maintaining repeatability and reproducibility of parallel stochastic simulations.; L’évolution récente des processeurs et accélérateurs de calcul, des compilateurs, des options de compilation et de bien d’autres éléments du contexte d’exécution d’une simulation, produisent une absence de répétabilité des expériences computationnelles. Ce sujet commence à prend une place significative dans bien des domaines scientifiques. La recherche de reproductibilité numérique est essentielle à toute expérimentation scientifique, mais elle est bien des fois négligée. Dans cet article, nous proposons une analyse des enjeux de la reproductibilité numérique. Nous identifions ensuite les principaux obstacles à sa mise en œuvre. Pour pallier ces obstacles, nous proposons, dans le cas des simulations stochastiques parallèles, un ensemble de recommandations et une méthode qui aident à maintenir la répétabilité et la reproductibilité numérique des simulations stochastiquesparallèles.

Congenital cytomegalovirus (CMV) infection is the leading cause of sensoneurinal disability due to infectious congenital disease. The diagnosis of congenital CMV infection is based on the search of CMV in the urine within the first two weeks of life. Viral culture of urine is the gold standard. However, the PCR is highly sensitive and faster. It is becoming an alternative choice. The objective of this study is the validation of real-time PCR by Abbott RealTime CMV with m2000 for the detection of cytomegalovirus in urine. Repeatability, reproducibility, detection limit and inter-sample contamination were evaluated. Urine samples from patients (n=141) were collected and analyzed simultaneously in culture and PCR in order to assess the correlation of these two methods. The sensitivity and specificity of PCR were also calculated. The Abbott RealTime CMV PCR in urine is an automated and sensitive method (detection limit 200 UI/mL). Fidelity is very good (standard deviation of repeatability: 0.08 to 0.15 LogUI/mL and reproducibility 0.18 LogUI/mL). We can note a good correlation between culture and Abbott RealTime CMV PCR (kappa 96%). When considering rapid culture as reference, real-time PCR was highly sensitive (100%) and specific (98.2%). The real-time PCR by Abbott RealTime CMV with m2000 is optimal for CMV detection in urine.

Implement a quality approach for databases based on field surveys is a major issue for scientific community. Data is the support of studies. Hence, implement a quality approach translates into considering both quality issues and data life-cycle. Reliability, transferability, repeatability, sustainability, traceability have to be considered from questionnaire to the database availability. The aim of this charter is to propose a methodology for the scientific community, whatever the discipline. This methodology is based on Human and Social Science. It is there for transferable to any other using databases from field surveys. The originality of the approach is the interaction between quality issues and data-life steps of data collected through field surveys. French abstract: La mise en œuvre d’une démarche qualité pour les bases de données issues d’enquêtes de terrain constitue un enjeu majeur pour la communauté scientifique, les jeux de données étant la base des études réalisées. Dans ce contexte, mettre en œuvre une démarche qualité aux différentes étapes du cycle de vie des données représente des enjeux essentiels. Ces enjeux de fiabilité, traçabilité, reproductibilité, pérennité et transférabilité doivent être pris en compte depuis l’élaboration du questionnaire jusqu’à la mise à disposition des données. L’objectif de cette charte qualité est de proposer une méthodologie à destination de la communauté scientifique toutes disciplines confondues. Cette méthodologie repose sur des travaux menés en Sciences Humaines et Sociales. Elle est cependant transposable à toute autre discipline mobilisant des bases de données issues d’enquêtes de terrain. L’originalité de la démarche réside dans l’articulation entre les enjeux de la démarche qualité et étapes du processus du cycle de vie des données issues d’enquêtes de terrain.

National audience; We report on the accuracy and repeatability tests for near-field scanning microwave microscopy applications by associating a network analyzer and an evanescent microwave probe (EMP). A broadband matching network based on an interferometric technique is used to achieve a strong electromagnetic coupling between the probe tip and the material in the frequency range 1-20 GHz. The electromagnetic coupling between the probe and a planar metallic sample is investigated using numerical simulations based on finite element method (FEM). Experimental validations show that the measurement sensitivity is enhanced in the vicinity of the probe tip. Measurement accuracy and repeatability of the system are provided that are instructive and beneficial to further experiments.

This report presents the industrialization of a drilling-deburring process. The aims of this project is to determine the parameters for the good use the drilling-deburring tool and to define the limitations of the process to meet the customer’s requirements. The drilling-deburring tool is constituted with a twist drill and a tool body containing control bolt, a spring and a blade allowing the blade to be retracted without spoiling the bore. It is this technology that permits a front and back deburring. This report presents the bibliographic review which was essential to apprehend all the parameters related to the burr formation during drilling and to the breaking of corners necessary to remove those burrs. This study led to the solution of the supplier Heule which was implemented. In a second phase are explained the different trials which permitted to define the tool cutting data to launch the first phase of industrialization on the numerically controlled machine CAURALIS. Besides are developed the different technical problems, notably the tool overall size, resulting from these trials and the chosen solution to remedy. Finally, as the cutting data is set up, the parameter to be worked on to qualify the process is the spring pressure. Indeed we had to determine if this pressure had an impact or not on the quality of the final edge breaking, and if it had to be put under surveillance.; Le projet d’industrialisation du procédé présenté dans ce mémoire, a pour objectif de déterminer les paramètres d’utilisation d’un outil de perçage-ébavurage « front and back » et de définir les bornes du procédé pour répondre aux exigences de qualité définies par les clients. L’outil de perçage-ébavurage est constitué d’un insert forêt et corps ébavureur contenant un système pion-ressort-couteau permettant la rétractation du couteau sans abîmer l’intérieur du perçage. C’est cette technologie qui permet d’obtenir un cassage d’angle de part et d’autre du perçage. Ce mémoire présente l’étude bibliographique qui a permis d’appréhender tous les paramètres relatifs à la formation de bavures lors du perçage et au mouchage nécessaire pour les éliminer ces bavures. Cette étude a permis de trouver le fournisseur Heule dont la solution a été mise en place. Dans un second temps, on présente les différents essais qui ont permis de définir les conditions de coupe de l’outil pour lancer la première phase d’industrialisation sur les machines à commande numérique CAURALIS. Par ailleurs, on développe les différentes problématiques techniques, notamment d’encombrement outil, qui ont découlé de ces premiers essais ainsi que les solutions choisies pour y remédier. Enfin, les conditions de coupe étant définies, le paramètre à étudier pour la qualification du procédé a été la pression du ressort. En effet, il a fallu déterminer si cette pression avait un impact un non sur la qualité de cassage d’angle final et s’il fallait la mettre sous surveillance.

The aim of this PhD project was to couple supercritical fluid chromatography (SFC) with a high resolution mass spectrometer for apolar natural compounds analysis. Because mobile phase is principally constituted of CO2, SFC is called “green technic” contrary to normal phase liquid chromatography (NPLC), which uses lot of organic solvents toxic for environment. The CO2 presents a low viscosity, in this way high diffusivity and flow rate, and lower analysis times are obtained. Our work was focused on apolar molecules: the lipids. The aim was to quantify molecules in alimentary and biological matrices and to a lipidomic approach to study Parkinson disease. The first part was to develop the system SFC with a UV detection on a system on loan by Agilent Technologies. This first study was carried out on 6 vitamin A compounds. An optimization of chromatographic parameters has been realized in order to obtain a good separation of the compounds. Then, linearity, repeatability, detection and quantification limits have been determined in order to have a reliable and robust method. A second part concerned the coupling of SFC and a quadrupole time-of-flight mass spectrometer (Q-TOF), in order to improve specificity and sensitivity of analysis. Different ionization sources have been tested: ESI, APCI and APPI. Each ion source presents different ionization mode, which permits to analyze a wide range of polarities of compounds. We have chosen 8 vitamin E derivatives, which are apolar compounds for which SFC seems to be well suited. Separation compounds have been optimized in order to have a good chromatographic resolution and a short analysis time. This compounds ionization is realized with the 3 sources, varying ionization parameters and make-up solvent, to have an optimal sensitivity. The APPI source has been chosen after a performance evaluation method. This source presents a good repeatability, linearity and detection limit in the same order of magnitude than those found in the literature by HPLC-MS. Then we have quantified these compounds in alimentary and biological matrices: a soya oil and plasma rat. A third study has been started on lipid profiling with various polarities by SFC-MS. This technic is well suited because of the low polarity of this molecules and their lack of absorbance in the UV range. The integrity of lipids can be altered with damages caused by free radicals, and are potentially involved in neurodegenerative diseases. It is essential to develop analytical systems with a high sensitivity and resolution and the possibility to access to structural information. The ESI source permits to detect 12 lipids on the 20 sub-classes analyzed in positive ion mode and 8 lipids in negative mode. An application has been realized on human plasma. In the future, it will be interesting to analyze these lipids with the APPI source, which is good choice for structural analysis of lipids, with good sensitivity and repeatability. Studies with this SFC-MS system, presenting good sensitivity and repeatability, will be extended to lipid analysis in biological matrices and could be applied to new biomarkers study and for fast screening of a large number of samples; L’objectif de ce projet doctoral a été de coupler la chromatographie en phase supercritique (SFC) avec un spectromètre de masse haute résolution pour l’analyse de substances naturelles apolaires. La SFC est une technique dite « verte » contrairement à la chromatographie liquide en phase normale (NPLC), très consommatrice de solvants organiques toxiques pour l’environnement, puisque la phase mobile est principalement constituée de CO2. Le CO2 ayant une faible viscosité, cela implique une diffusivité, des débits élevés et des temps d’analyse courts. Notre attention a été focalisée sur des molécules apolaires : les lipides. Le but était de mettre au point des dosages dans des matrices alimentaires et biologiques et de débuter une approche lipidomique d’étude de la maladie de Parkinson. La première partie a été dédiée au développement du système SFC avec une détection UV, prêté par le constructeur Agilent Technologies. La première étude s’est portée sur 6 composés de la famille des vitamines A. Une phase d’optimisation a été réalisée afin d’obtenir une séparation satisfaisante des composés, en testant différents paramètres chromatographiques comme le type de phase stationnaire ou encore la composition de la phase mobile, afin d’obtenir une résolution optimale. Ensuite, des études de linéarité et de répétabilité ont été réalisées et des limites de détection et de quantification ont été déterminées afin d’obtenir une méthode fiable et robuste. Une deuxième partie a concerné la mise en place du couplage entre la SFC et un spectromètre de masse de type quadripôle-temps de vol (Q-TOF), afin d’améliorer la spécificité et la sensibilité des analyses. Différentes sources d’ionisation ont été utilisées : ESI, APCI et APPI. Chacune des sources présente des modes d’ionisation différents, qui permettent de pouvoir balayer une large gamme de polarité des analytes. Nous avons choisi 8 dérivés de la vitamine E, composés apolaires pour lesquels la SFC paraît être la technique d’analyse idéale. La séparation de ces composés a été optimisée de façon à obtenir une bonne résolution chromatographique et un temps d’analyse minimal. L’ionisation des composés est réalisée avec les 3 sources disponibles en faisant varier les paramètres de sources ou encore le solvant « make-up », de façon à obtenir une sensibilité optimale. La source APPI a été finalement choisie après une étude sur les performances de la méthode. Cette source présente une bonne répétabilité, linéarité et des limites de détection de l’ordre de celles retrouvées dans la littérature par HPLC-MS. Nous avons ensuite réalisé la quantification des ces composés dans 2 types de matrices alimentaire et biologique : l’huile de soja et le plasma de rat. Une troisième partie a été débutée sur le profilage de lipides à polarités variées par SFC-MS. Cette technique se révèle idéale de par la faible polarité de ces composés et leur absence d’absorbance dans le domaine UV. En effet, l’intégrité des lipides peut être altérée suite aux dommages causés par les radicaux libres, qui sont potentiellement impliqués dans de nombreuses maladies neurodégénératives. Il parait primordial de développer des outils analytiques présentant une haute sensibilité et résolution et la possibilité d’accéder aux informations structurales. La source d’ionisation ESI nous a permis de détecter 12 lipides sur les 20 sous-classes analysées en mode positif et 8 lipides en mode négatif. Une application a été réalisée sur un échantillon de plasma humain. Il serait intéressant à l’avenir d’effectuer cette étude en utilisant la source APPI, source propice à l’analyse structurale de lipides et présentant une bonne sensibilité et répétabilité. Ce couplage SFC-MS, présentant une bonne sensibilité et répétabilité, sera par la suite étendu à l’analyse de lipides dans diverses matrices biologiques et pourra à l’avenir être appliqué à l’étude de nouveaux biomarqueurs et au screening rapide d’un grand nombre d’échantillons

We evaluated the analytical performances of the SPAPLUS(®) immunoturbidimeter assays manufactured by The Binding Site(®) for the quantification of thirteen immunological parameters in serum: IgG, IgA, IgM and IgD immunoglobulins, IgG subclasses (1 to 4), IgA subclasses (1 and 2), beta-2 microglobulin, free light chains kappa and lambda. The within-day precision (repeatability) and the between-day precision (reproducibility) were obtained for two or three concentration levels depending of the parameter and were below the recommendations of the manufacturer, except for the repeatability of IgG1 (at a level of concentration of 6.7 g/L). An agreement above 90% (with Bland and Altman analysis) was observed between the results obtained with SPAPLUS(®) and those obtained with the nephelometer IMMAGE(®) 800 or radial immunodiffusion. The evaluation confirmed the linearity of the assays and the absence of contamination for all the parameters tested. We also assessed the practicability of the SPAPLUS(®) in terms of maintenance, frequency of calibration and cadence tests. The SPAPLUS(®) immunoturbidimeter displays good analytical performances for the immunological parameters evaluated in the present work.

La mise en œuvre d’une démarche qualité pour les bases de données issues d’enquêtes de terrain constitue un enjeu majeur pour la communauté scientifique, les jeux de données étant la base des études réalisées. Dans ce contexte, mettre en œuvre une démarche qualité aux différentes étapes du cycle de vie des données représente des enjeux essentiels. Ces enjeux de fiabilité, traçabilité, reproductibilité, pérennité et transférabilité doivent être pris en compte depuis l’élaboration du questionnaire jusqu’à la mise à disposition des données. L’objectif de cette charte qualité est de proposer une méthodologie à destination de la communauté scientifique toutes disciplines confondues. Cette méthodologie repose sur des travaux menés en Sciences Humaines et Sociales. Elle est cependant transposable à toute autre discipline mobilisant des bases de données issues d’enquêtes de terrain. L’originalité de la démarche réside dans l’articulation entre les enjeux de la démarche qualité et étapes du processus du cycle de vie des données issues d’enquêtes de terrain., Implement a quality approach for databases based on field surveys is a major issue for scientific community. Data is the support of studies. Hence, implement a quality approach translates into considering both quality issues and data life-cycle. Reliability, transferability, repeatability, sustainability, traceability have to be considered from questionnaire to the database availability. The aim of this charter is to propose a methodology for the scientific community, whatever the discipline. This methodology is based on Human and Social Science. It is there for transferable to any other using databases from field surveys. The originality of the approach is the interaction between quality issues and data-life steps of data collected through field surveys.

Thanks to the technical and technological developments of the last decades, the international cotton trade is moving from a manual and visual classification to one based on instrument results. Now, adopting a technique requires studying its modalities and its conditions of use. In the USA, periodical studies of the variability make it possible to provide trading tolerances together with instrumental test results in order to limit the litigation event frequency. Apply USA rules and measurement methods in Africa would lead to increased litigation risk if production conditions induce more variable cotton quality. For the first time in Africa, we have conducted a study of the variability of the technological characteristics of the fibers in eight countries of Western and Central Africa: Benin, Burkina-Faso, Cameroon, Chad, the Ivory-Coast, Mali, Senegal and Togo. During two seasons of production, we conducted an experiment with three types of fiber sampling: 1) eight samples per bale within 215 bales produced in 27 ginning mills, 2) one sample per bale from 4286 bales organized in lots of 200 consecutive bales during season 1 and of 100 consecutive bales in season 2 in the same ginning mills, 3) two samples per bale (one from the top, one from the bottom) from 817 bales organized in lots of twenty consecutive bales each week in five ginning mills during season 2. Then, samples from the 5318 sampled bales were analysed with Standardized Instruments for Testing Cotton (SITC) in a laboratory which respects international recommendations and required ambient air conditions. The statistical data analysis allowed us to evaluate the level of variability of each of the studied technological characteristics, within the bales and between the bales. A sampling and testing methodology using SITC is being proposed to achieve the classification of the different sorts of cotton produced in Western and Central Africa from precise and repeatable results abidden by the worldwide established trading rules.; Grâce aux développements techniques et technologiques des dernières décennies, le commerce international du coton passe graduellement d’un classement manuel et visuel à un classement à base de résultats de mesures instrumentales. Or adopter une technique requiert d’en étudier ses modalités et ses conditions d’utilisation. Aux USA, des études périodiques de variabilité permettent d’assortir ces résultats d’analyse de tolérances commerciales afin de limiter la fréquence des litiges. Adopter en Afrique les règles et les méthodes de mesure des USA exposerait à un risque de litige accru si les conditions de production déterminent un coton de qualité plus variable. Pour la première fois en Afrique, nous avons mené une étude de la variabilité des caractéristiques technologiques des fibres dans huit pays d’Afrique de l’Ouest et du Centre : Bénin, Burkina-Faso, Cameroun, Côte d’Ivoire, Mali, Sénégal, Tchad et Togo. Pendant deux saisons de production, nous avons réalisé une expérimentation à trois types de prélèvements de fibres : 1) huit échantillons par balle au sein de 215 balles produites dans 27 usines d’égrenage, 2) un échantillon par balle de 4286 balles constituées en séries de 200 balles consécutives en saison 1 et de 100 balles consécutives en saison 2 dans les mêmes usines, 3) deux échantillons par balle (un en haut et un en bas) sur 817 balles constituées en séries de vingt balles consécutives hebdomadairement dans cinq usines au cours de la saison 2. Ensuite, les échantillons des 5318 balles échantillonnées furent analysés sur une Chaîne de Mesures Instrumentales (CMI) dans un laboratoire respectant les recommandations internationales et les conditions d’ambiance contrôlées. L’analyse statistique des données recueillies a permis d’évaluer le niveau de variabilité de chacune des caractéristiques technologiques étudiées, au sein des balles et entre celles-ci. Une méthode d’échantillonnage et de réalisation des analyses sur CMI est proposée pour réaliser le classement des balles de coton d’Afrique de l’Ouest et du Centre à partir de résultats précis et répétables respectant les règles commerciales établies au niveau mondial.

Diversity of some functional characteristics of melted French Emmental-cheese. Four methods were developed or revised to determine the functionality of melted Emmental-cheese (Swiss-cheese). Flowability was measured using a modified Schreiber test. Stretchability was assessed by a new method involving vertical traction. A butyrometric method was applied to quantify oiling-off. Browning of cheese-gratinwas measured objectively with a colour meter (L*, a*, b*). The repeatability and the power of these tests were satisfactory. The functionality of 48 french commercial Emmental-cheeses was determined over one year. Great variations were registered. The flowability index (melted cheese area divided by the initial area) ranged from 1.0 to 2.7. The oilingoff ranged from 7 to 17 g fat per 100 g of cheese (30 to 60 g.100 g–1 fat). The length of the strings of melted cheese (stretchability) ranged from 80 to 950 mm. Ranges of 13 a.u. L*, 9 a.u. a* and 9 a.u. b* were observed for colour measurement. Meltability, stretchability, oiling-off and browning were strongly correlated. Finally, Principal Component Analysis showed the great diversity of the functionality of melted French Emmental-cheese., Quatre techniques de mesure des propriétés fonctionnelles de l’Emmental ont été développées ou adaptées pour la détermination des caractéristiques d’étalement, de filant, d’exsudation d’huile et de couleur de gratin. L’étalement était mesuré par un test de Schreiber modifié, la couleur de gratin par une analyse au chromamètre (L*, a*, b*). Des méthodes originales ont été développées pour l’appréciation du filant (test de traction verticale) et de l’exsudation d’huile (méthode butyrométrique). La répétabilité et le pouvoir discriminant de ces analyses ont été déterminés. Quarante-huit échantillons d’Emmentals du commerce, représentatifs de la production française, ont été prélevés et[br/] caractérisés. Le coefficient d’étalement (rapport des surfaces du fromage fondu et du fromage initial) variait de 1 à 2,7. L’exsudation d’huile variait de 7 à 17 g de matière grasse pour 100 g de fromage soit 30 à 60 g.100 g–1 de matière grasse. La longueur des fils de fromage fondu variait entre 80 et 950 mm. Pour la couleur des gratins, des plages de variation de 13 unités arbitraires (u.a.) de L*, 9 u.a. de a* et 9 u.a. de b* ont été enregistrées. L’intensité du brunissement, de l’étalement, de l’exsudation d’huile et du filant étaient fortement corrélés. Une analyse en composantes principales a révélé une grande diversité de propriétés fonctionnelles à chaud au sein de l’univers de l’Emmental français.

INRA Unité de Biométrie Versailles (FRA) Diffusion du document : INRA Unité de Biométrie Versailles (FRA); Estimation de la répétabilité et de la reproductibilité des mesures expérimentales. Utilisation des procédures VARCOMP et NESTED du logiciel SAS/STAT (version 6.12)

road samples were collected from 4 dairy plants to evaluate the analytical performance of different methods of measurement of A TP content used to assess the bacteriological quality of milk. Ali sampIes were analysed in duplicate by Spiral standard reference method. One hundred and twenty sampIes were analysed in duplicate by rapid methods to determine ATP level by bioluminescence: the ATP platform test (ATP-p) and L1ATP test (L1ATP). Ninety-four other samples were tested by a new method including a filtration step: the A TP-F test (A TP-F). The geometric relative standard deviation of repeatability (in % CFUlml) was 14% for the ATP-p test, 51% for the L1ATP test and 43% for the ATP-F test. The residual standard deviations from the regression of the reference method on the ATP level were 0.637 and 0.623 log CFUlml respectively for the ATP-p and the MTP (not significantly different at the 5% level). The ATP-F test residual standard deviation was much lower (Sy,x = 0.301 log CFUlml), and the slope of the regression line was significantlyabove 1.000 at the 5% level.

RAPID MICROWAVE OVEN DETERMINATION OF THE DRY MATTER CONTENT IN CHEESE An experiment was carried out todetermine the repeatability and accuracy of the dry matter determination of cheese with the microwave aven instrument TMS Checker K 375 A (Anritsu Co. Japon). Sixt Y one samples of various type of cheeses (fresh lactic cheese, soft cheese semi-harâ and hard cheese) ranging from 19.9 % ta 62.8 % dry matter, were analysed with the microwave oven (4 replicates) and with the reference drying aven method (2 replicates). The coefficient of variation of repeatability is on an average 0.26 % for the microwave and varies [rom. 0.28 % for high moisture content cheese ta 0.10 % for low moisture content cheese, for the reference method. The standard deviation of accuracy of the microwave aven, calculated [rom. the algebraic mean differences between the two methods is 0.27 % dry matter content, indicating a 95 % confidence interval of ± 0.54 % for the estimated true value. In a field experiment, it has been demonstrated that the TMS Checker is a useful tool for checking rapidly the variation of soft

This article presents a method for estimating the variability of measurements in radio-immunoassays. Repeated assays are carried out on the same plasma used as a reference. The variances of repeatability (or intraassay) and reproducibility are calculated from the values obtained from the reference. These variances are used to calculate the agreement between two or more values obtained from unknown plasma. Analysis of the values of the plasma reference completes information obtained from standard curves.

The variability in the numerical productivity of the doe is very high (number of rabbits weaned per doe and year). We tried to estimate levels of production under which it is economically interesting to cull a doe in a meat production farm. The levels depend on the repeatability of the components of the numerical productivity. Repeatabilities of « interval between two parturitions n and « litter size at weaning are discussed. Culling thresholds for litter size are given. It depends on mean litter size of the flock, number of order of the litter and cost of replacement. The results are not directly applicable if crossbreeding or « all in-all out » system is realized. If such systems are used the culling thresholds are lower. We do not consider the case of sick females which have to be culled whatever their production level.