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Ce projet INPOLAG (2019-2023) s’inscrit dans le contexte réglementaire de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) et vise à développer un indicateur "poissons DCE-compatible" adapté au contexte français. Sur la base du travail mené au cours de ce projet, ce rapport présente la méthodologie préconisée pour l’évaluation de ce compartiment dans les masses d’eau lagunaires méditérranéennes françaises. L'interpréation des données collectées entre 2019 et 2021 est présenté dans le rapport final du projet.

Le projet INPOLAG (2019-2023) s’inscrit dans le contexte réglementaire de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) et vise à développer un indicateur "poissons DCE-compatible" adapté au contexte français. Basé sur un échantillonnage à deux saisons (printemps et automne) de 122 stations réparties sur un panel de 8 lagunes, ce travail a permis de décrire les peuplements de poissons, principalement les juvéniles ou les espèces peu mobiles, en parallèle des conditions environnementales. Les données collectées mettent en évidence les variabilités spatiale (entre habitats) et saisonnière (printemps vs. automne) de la densité et de la composition des peuplements. L’analyse spatio-temporelle des communautés bentho-démersales a montré néanmoins une influence relativement limitée de la saison dans nos données (2% de l’effet temporelle pour 18% de l’effet spatial de la lagune) avec cependant des différences marquées dans les captures au printemps avec l’arrivée d’espèces marines migrantes telles que Sparus aurata, Liza ramada et Solea solea. L'occurrence et la diversité des poissons dans les habitats lagunaires seraient donc fortement influencée par la saisonnalité du recrutement, la dynamique des populations et les schémas de migration comme cela a pu être démontré dans des études antérieures. Au terme de ce travail, de nombreuses métriques de diversité ont été calculées mais aujourd'hui il n'est pas possible de définir un indicateur "poissons DCE-compatible" en raison du faible nombre de couple de données Métrique-Pression. Ce travail a permis néanmoins de valider une stratégie d'acquisition et de traitement des données qui pourra être appliquée à large échelle dans les lagunes méditerranéennes françaises.

Dans le cadre du sixième appel d'offres (AO6) pour l'éolien en mer en France, Ifremer réalise l’étude pour identifier les zones de moindre contrainte pour les espèces halieutiques (poissons, mollusques, crustacés, invertébrés benthiques sensibles) dans le Golfe du Lion à la demande de la Direction Générale de l'Energie et du Climat (Ministère de la Transition Ecologique et Solidaire). La méthodologie pour calculer le risque d’effet a été adaptée à partir de la méthode proposée pour l’étude des compartiments granulats et avifaune au sud de la Bretagne afin de maintenir une similitude de concepts et de terminologies entre les différents appels d’offres. Les données des campagnes scientifiques MEDITS et PELMED ont été utilisées dans un premier temps pour créer des cartes de distribution (densité ou biomasse). Les cartes de distribution ont ensuite permis de calculer la représentativité de chaque espèce. Les données de débarquements géolocalisés de pêche ont également été utilisées pour calculer la représentativité des espèces. A partir de ces représentativités, de la vulnérabilité (statut de protection ou état du stock) et de la distribution des espèces, des cartes d’enjeu ont pu être créées. L’enjeu couplé à la sensibilité (effets biologiques potentiels de l’éolien flottant) des espèces a servi à calculer le risque d’effet. Le risque d’effet global (toutes espèces confondues) est très fort dans la partie ouest du Golfe du Lion : dans la macrozone A, en face de Port-la-Nouvelle, dans l’extrémité ouest de la macrozone B ; et dans la partie nord de la macrozone C. Le risque d’effet est faible au sud des macrozones et au large du Golfe du Lion. L’incertitude associée au risque d’effet a été évalué avec une technique de ré-échantillonnage appelée bootstrapping.

Pour mieux gérer les pressions exercées sur les écosystèmes aquatiques et préserver les services que ces derniers fournissent, la Directive-Cadre sur l'Eau requiert l'évaluation de leur état écologique. Le projet INPOLAG vise à à développer un indicateur « poisson » DCE-compatible, adapté au contexte français. Dans ce contexte, ce rapport établit une synthèse bibliographique de l’ensemble des bio-indicateurs « poissons » utilisé dans les eaux de transition dans le contexte DCE. Douze indices « Poissons » ont été développés à ce jour en Europe dans les écosystèmes de transition mais seuls trois d’entre eux sont recencés pour les lagunes (ELFI pour la France, HFI pour l’Italie et LFBI pour la Grèce). Contrairement à l’indice français basé sur des pêches passives, les indices italiens et grecs sont basés sur les captures à la senne de plage dans différents habitats. Aujourd’hui, seul l’indice multimétrique italien (HFI) est opérationnel. Il est composé de quatre métriques (densité totale de la biomasse, nombre d’espèces résidant dans la lagune, poids individuel moyen des espèces benthivores, et indice de richesse des espèces hyperbenthivores / zooplanctivores / piscivores de Margalef, calculé sur la biomasse. Cette analyse exhaustive a permis de proposer une stratégie d’échantillonnage adaptée au contexte français. Celle-ci s’appuie sur un échantillonnage du compartiment « poisson » à la senne de plage dans différents habitats répartis au sein de 8 masses d’eau de transition au printemps et à l’automne.

The AMBIO project conducted a comprehensive video-based baseline assessment of coral reef fish communities and associated habitats in the New Caledonian lagoons. The survey relies on remote unbaited underwater video observations, using the STAVIRO rotating technique. - The study pertains to the reefs of Astrolabe, Pétrie and Walpole Island, located within the Coral Sea Natural Park. The survey conducted in 2014 covers the entire area, and the sampling design was stratified according to reef type. 95 stations were validated. They were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fish communities, based on a list of 565 fish species (cf. AMBIO/A/1). - 28 indicators were computed and mapped (maps available on a Sextant server). Indicators were analyzed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard for each management objective (biodiversity conservation and fisheries management). - 171 fish species (and one turtle species), belonging to 33 families were observed. Two families were observed on more than 95% of stations: surgeonfish and wrasses. Eight other families were observed on 50% to 95% of stations: parrotfish, groupers, triggerfish, snappers, butterflyfish, goatfish, emperors and angelfish. - Coral health status is good with high living coral covers (62% on average), mostly in Astrolabe, but branch coral was scarce. Sharks and giant wrasse were frequently observed, as well as jacks. - Fish communities are diversified and very abundant, particularly in the Living Coral habitat; and generally more abundant than on the rest of the sites, particularly at Astrolabe. All trophic groups were abundant on the area, except for planktivorous species. Piscivorous species were very abundant. - Most fisheries-related metrics indicate highly abundant resources, particularly at Astrolabe. - The health status of coral habitat and associated fish communities appears exceptional at Astrolabe, and generally good at Pétrie and Walpole., Le projet AMBIO a conduit des évaluations des peuplements de poissons et habitats associés aux récifs coralliens sur l’ensemble des lagons de Nouvelle-Calédonie, en s’appuyant sur la technique de vidéo rotative STAVIRO. - Cette campagne a été réalisée en 2014 sur les iles et récifs éloignés d’Astrolabe, Pétrie et Walpole, situés dans le périmètre du Parc Naturel de la Mer de Corail. Le plan d'échantillonnage couvre toute la zone avec une stratification en fonction des structures récifales présentes. 95 stations STAVIRO ont été validées. Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les communautés de poissons sur la base d’une liste de 565 espèces (cf. AMBIO/A/1). - 28 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de carte disponible sur un serveur Sextant. Ces indicateurs ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA. Les résultats sont synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche. - 171 espèces de poissons (et 1 espèce de tortue) appartenant à 33 familles ont été observées. Deux familles sont vues sur plus de 95% de stations : poissons-chirurgiens et labres. Huit autres familles sont vues sur 50 à 95% des stations : poissons-perroquets, loches, balistes, lutjans, poissons-papillons, rougets-barbets, bossus/becs et poissons-ange. - L’état de santé du corail est bon, avec des recouvrements en corail vivant élevés (62% en moyenne sur l’habitat Corail vivant), surtout à Astrolabe, mais quasiment pas de corail branchu. Les requins et le poisson-napoléon sont fréquemment observés, ainsi que les carangues. - Les peuplements de poissons sont diversifiés et très abondants, notamment sur l’habitat Corail vivant. Ils sont très généralement plus abondants que sur le reste de la Grande Terre, particulièrement pour les récifs d’Astrolabe. Tous les groupes trophiques sont abondants sur la zone, à l’exception des espèces

Conducted within the AMBIO project, this work deals with coral reef fish communities and associated habitats, in the New Caledonian lagoons. It relies on remote unbaited underwater video observations, using the STAVIRO rotating technique. The field work was realized in 2013 in and around the Merlet Marine Reserve, in the south of New-Caledonia, and located within the “Grand Lagon Sud” world heritage area. The sampling design covers the entire area, and was stratified according to reef type (outer slope, reef flat, reef shallow terrace, lagoon, and fringing reef). 162 stations were validated within 6 days. They were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fish communities, based on a list of 429 fish species (cf. AMBIO/A/1). 28 indicators were computed and mapped (maps available on a Sextant server). Indicators were analyzed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard for each management objective (biodiversity conservation and fisheries management). 165 fish species (and one turtle species), belonging to 20 families were observed. Two families were observed on more than 80% of stations: surgeonfish and parrotfish. Four other families were observed on 50% to 80% of stations: butterflyfish, wrasses, groupers and goatfish. Living coral habitat display a good ecological status, in particular on external slopes (on average over 35% on this habitat). A large diversity (26 species) and abundance of butterflyfish was observed. 2 shark species, 1 turtle species and 3 ray species were encountered, as well as giant wrasse. Fish communities display a good ecological status, in particular on external slopes in the Living Coral habitat, consistently with an ancient and strong protection. Emblematic species were regularly observed. Most fisheries-related metrics indicate relatively abundant resources, with higher occurrences abundances, and a greater proportion of large individuals. These results indicate lower anthropogenic pr, Cette étude conduite dans le cadre du projet AMBIO concerne les communautés de poissons et habitats associés aux récifs coralliens des lagons de Nouvelle-Calédonie. Elle s’appuie sur des données collectées par STAVIRO, une technique de vidéo rotative. Cette campagne a été réalisée en 2013 dans et autour de la réserve Yves Merlet, située dans le Grand Lagon Sud, bien inscrit au patrimoine mondial. Le plan d'échantillonnage couvre toute la zone avec une stratification en fonction des structures récifales (pente externe, fond lagonaire, récif frangeant, platier, plateau récifal). En 6 jours sur zone, 162 stations STAVIRO ont été validées. Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les communautés de poissons sur la base d’une liste de 429 espèces (cf. AMBIO/A/1). 28 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de carte disponible sur un serveur Sextant. Ces indicateurs ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA. Les résultats sont synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche. 165 espèces de poissons (et 1 espèce de tortue) appartenant à 20 familles ont été observées. Deux familles sont vues sur plus de 80% de stations : poissons chirurgiens et poissons perroquets. Quatre autres familles sont vues sur 50 à 80% des stations : poissons-papillons, labres, loches et rougets-barbets. L’état de santé du corail est bon, avec des recouvrements en corail vivant élevés (plus de 35% en moyenne sur l’habitat Corail vivant). Les poissons-papillons sont diversifiés (26 espèces) et abondants sur la zone. 2 espèces de requins, 1 espèce de tortue et trois espèces de raies sont observées, ainsi que le poisson napoléon. L’état de l’ichtyofaune est satisfaisant, notamment sur la pente externe, et cohérent avec le statut de protection intégrale ancien. Les espèces emblématiques sont régulièrement observées. Les résultats indiqu

The AMBIO project conducted a comprehensive video-based baseline assessment of coral reef fish communities and associated habitats in the New Caledonian lagoons. The survey relies on remote unbaited underwater video observations, using the STAVIRO rotating technique. The present study deals with the Corne Sud area, in the south of New-Caledonia, and located within the “Grand Lagon Sud” World Heritage Property. The survey design covers the entire area. 155 stations were validated within 9 days. They were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fish communities, based on a list of 429 fish species (cf. AMBIO/A/1). 27 indicators were computed and mapped (maps available on a Sextant server). Indicators were analyzed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard for each management objective (biodiversity conservation and fisheries management). 170 fish species (and one turtle species), belonging to 23 families were observed. Surgeonfish and parrotfish were observed on 95% of the stations. Wrasses, butterflyfish, goatfish and groupers were observed on 50% to 80% of the stations. Live coral habitat was dominant (almost 60% of stations). Coral cover status was very good on the external slope, good on fringing reefs. Branch coral cover was high in sheltered locations, islet fringing reefs and coral patches. Butterflyfish diversity was very high (26 species). Fish communities are among the most diversified in New Caledonia, particularly on barrier reef and lagoon coral patches. Fish abundance is heterogenous, high on the barrier reef and coral patches, and medium on islet fringing reefs. Turtles, sharks, rays and giant wrasse are regularly observed on their favorite habitats. Ressource status is good for fished species and species targeted by spearfishing and line. In particular, blue spine unicorn, coral trout and “picot kanak” (Acanthurus blochii, dussumieri and nigricauda) are both more frequent and more abundant than in, Le projet AMBIO a conduit des évaluations des peuplements de poissons et habitats associés aux récifs coralliens sur l’ensemble des lagons de Nouvelle-Calédonie, en s’appuyant sur la technique de vidéo rotative STAVIRO. Cette campagne a été réalisée en 2013 dans la Corne Sud, située dans le Grand Lagon Sud, bien inscrit au Patrimoine Mondial. Le plan d'échantillonnage couvre la totalité de cette vaste zone. En 9 jours sur zone, 155 stations STAVIRO ont été validées. Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les peuplements de poissons sur la base d’une liste de 527 espèces (cf. AMBIO/A/1). 27 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de cartes disponibles sur un serveur Sextant. Ces indicateurs ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA. Les résultats sont synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche. 170 espèces de poissons (et 1 espèce de tortue) appartenant à 23 familles ont été observées. Poissons chirurgiens et poissons perroquets sont observés sur plus de 95% des stations. Labres, poissons-papillons, loches et rougets-barbets sont observés sur 50 à 80% des stations. L’habitat corallien est largement dominant avec presque 60% des stations et un recouvrement en corail vivant très bon sur la pente externe, presque bon sur les frangeants d’îlot et un recouvrement élevé en corail branchu dans les zones lagonaires abritées, frangeantes et patates isolées. La diversité des poissons-papillons est très élevée (26 espèces observées). Le peuplement est un des plus diversifiés autour de la Grande Terre surtout sur le récif barrière et les patates lagonaires isolées. Son abondance est moyenne et hétérogène, élevée sur la barrière et les patates isolées, moyenne sur les frangeants d’îlot. Tortues, requins, raies et poissons-napoléons sont régulièrement observés sur leurs habitats préférés. L’état des resso

The AMBIO project conducted a comprehensive video-based baseline assessment of coral reef fish communities and associated habitats in the New Caledonian lagoons. Observation relies on remote unbaited underwater video, using the STAVIRO rotating technique (Pelletier et al. 2012).  This survey was conducted in 2015 in Entrecasteaux Reefs, both located within the Coral Sea Natural Park, and part of World Heritage site. 109 STAVIRO were validated in 9 days, covering the reefs and geomorphological units in the area. Images were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fishes based on a list of 565 species (Pelletier et al. 2016).  28 indicators were computed and represented on maps (Sextant server). Indicators were analyzed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in dashboards per management objective (biodiversity conservation and fisheries management).  190 fish species (and one snake species), belonging to 32 families were observed. Surgeonfish and wrasses were observed on more than 95% of stations. Parrotfish, snappers, butterflyfish and groupers were observed on more than 77% of stations.  Coral health status is good with high living coral covers on outer slopes and lagoon patches, while branch coral was found in internal slopes. Butterflyfish diversity is high, but not their abundance.  Fish communities are exceptionally diversified in all habitats. Abundance is good, but medium in the Living Coral habitat. Groupers are frequent and abundant. Fish community status appears the best among all surveyed sites, except for parrotfish and butterlfyfish.  Sharks are very frequent, as well as jacks. Giant wrasse is regularly observed.  Resources are rather abundant (commercial, fished and spearfished species), but on sandy bottoms. Jacks and spangled emperor are frequent. Favorite targets of surgeonfish and coral trout are equally or less frequent than on other sites., Cette étude conduite dans le cadre du projet AMBIO concerne les communautés de poissons et habitats associés aux récifs coralliens des lagons de Nouvelle-Calédonie. Elle s’appuie sur des données collectées par STAVIRO, une technique de vidéo rotative.  Cette campagne a été réalisée en 2015 dans les atolls d’Entrecasteaux, bien inscrit au patrimoine mondial et situé dans le périmètre du Parc naturel de la mer de Corail. Le plan d'échantillonnage couvre les différents sites de la zone et les structures récifales présentes. 109 stations STAVIRO ont été validées. L’analyse des images a permis de caractériser l’habitat entourant chaque station, ainsi que les communautés de poissons sur la base d’une liste de 565 espèces (Pelletier et al. 2016).  28 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de cartes en annexe et disponibles sur Sextant. Ils ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA. Les résultats sont sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche.  190 espèces de poissons et une espèce de serpent appartenant à 32 familles ont été observées. Poissons chirurgiens et labres sont observés sur plus de 95% des stations. Poissons-perroquets, lutjans, poissons-papillons et loches sont observés sur plus de 77% des stations.  L’habitat Corail vivant est dominant avec un recouvrement en corail vivant très élevé sur la pente externe, bon sur les patates isolées, et un recouvrement élevé en corail branchu sur les pentes internes abritées. La diversité des poissons-papillons est très élevée, leur abondance est moyenne.  La diversité du peuplement est exceptionnelle sur tous les types géomorphologiques et habitats. Son abondance est bonne sur tous les habitats, sauf l’habitat Corail vivant (moyenne). Les loches sont fréquentes et abondantes. A l’exception de l’abondance des perroquets et poissons-papillons, l’état de l’ichtyofaune est le meilleur de tous les sites visi

The AMBIO project conducted a comprehensive video-based baseline assessment of coral reef fish communities and associated habitats in the New Caledonian lagoons. The surveys rely on remote unbaited underwater video observations, using the STAVIRO rotating technique. Chesterfield and Bellona remote reefs and atolls are located in the Coral Sea Marine Park, northwest of New Caledonia. -This 2013 survey is the first scientific survey covering the entire area, with a sampling design stratified according to reef type. 203 stations were validated within 10 days. They were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fish communities, based on a list of 565 fish species (cf. AMBIO/A/1). - 34 indicators were computed and mapped (maps available on a Sextant server). Indicators were analysed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard for each management objective (biodiversity conservation and fisheries management). - 220 fish species (and one turtle species and two sea snake species), belonging to 36 families were observed. Three families were observed on more than 80% of stations: surgeonfish, wrasses and parrotfish. Three other families were observed on 50% to 80% of stations: butterflyfish, goatfish and serranids. Lethrinids and siganids are relatively less abundant in the area. 25 species were recorded for the first time in the area. - The coral displays an exceptionally good health with high living coral covers, a large diversity (23 species) and relatively high abundance of butterflyfish. Sharks were observed very frequently (43% of stations), as well as jacks (18% of stations). - Fish communities are diversified, particularly in the Living Coral habitat; abundances are generally higher in Chesterfield than in Bellona. Although all trophic groups are abundant, carnivores dominate the assemblage. - Fished species are rather abundant, more in Chesterfield than, Le projet AMBIO a conduit des évaluations des peuplements de poissons et habitats associés aux récifs coralliens sur l’ensemble des lagons de Nouvelle-Calédonie, en s’appuyant sur la technique de vidéo rotative STAVIRO. La zone de Chesterfield et Bellona, des récifs éloignés de la Grande Terre est située dans le Parc Marin de la Mer de Corail. - Cette campagne 2013 est la première campagne scientifique couvrant l’intégralité de la zone, avec un plan d'échantillonnage stratifié en fonction des structures récifales. En 10 jours sur zone, 203 stations STAVIRO ont été validées (profondeurs de 1 à 36 m). Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les communautés de poissons sur la base d’une liste de 565 espèces (cf. AMBIO/A/1). - 34 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de carte disponible sur un serveur Sextant. Ces indicateurs ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA. Les résultats sont synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche. - 220 espèces de poissons (et 1 espèce de tortue et 2 espèces de serpent), appartenant à 36 familles ont été observées. Trois familles sont vues sur plus de 80% des stations : les chirurgiens, les labres et les perroquets. Trois autres familles sont vues sur 50 à 80% des stations : poissons-papillons, barbillons et Serranidae. Les Lethrinidae et Siganidae sont relativement peu abondants sur la zone. 25 espèces ont été observées pour la première fois dans la zone. - L’état de santé du corail est exceptionnel, avec des recouvrements en corail vivant élevés, une forte diversité (23 espèces) et une abondance relativement élevée des poissons-papillons. Les requins sont observés très fréquemment (43% des stations), ainsi que les carangues (18% des stations). - Les peuplements de poissons sont diversifiés notamment sur l’habitat Corail vivant ; et généralement plus abondant