1. Isolation, characterization and cross-species amplification of polymorphic microsatellite markers for Oxytenanthera abyssinica (A. Rich.) Munro (Poaceae)
- Author
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Thierry Legavre, Yaye Kène Gassama, Dominique Brunel, Ronan Rivallan, A.R. Ndiaye, Ange-Marie Risterucci, Maurice Sagna, Dept Biol Vegetale, Fac Sci & Tech, Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux (EPGV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ctr Natl Genotypage, Inst Genom, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Agence Universitaire de la Francophonie (AUF), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
0106 biological sciences ,Germplasm ,Bamboo ,Oxytenanthera abyssinica ,Polymorphisme génétique ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Biodiversity ,DIVERSITY ,Biology ,01 natural sciences ,Gene flow ,F30 - Génétique et amélioration des plantes ,03 medical and health sciences ,Variation génétique ,Botany ,Genetics ,Polymorphic Microsatellite Marker ,Poaceae ,Ecology, Evolution, Behavior and Systematics ,030304 developmental biology ,0303 health sciences ,Genetic diversity ,Bambou ,Microsatellite marker ,Microsatellite ,010606 plant biology & botany - Abstract
We developed microsatellite to investigate genetic diversity of Oxytenanthera abyssinica (Bindura bamboo) a bamboo species endemic to Senegal. Using the microsatellite-enriched library method, we identified 14 primer pairs. The primers amplified 10 di-nucleotide repeats and 4 composite motifs, the number of alleles ranged from 5 to 28 with an average of 11.9. The results indicate that these primer pairs offer an appropriate amount of variation to address issues of germplasm characterization, patterns of gene flow and conservation studies. Cross amplification has been tested in other bamboo species.
- Published
- 2013
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