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[ES] Las plantas están bajo el ataque continuo de múltiples patógenos, pero solo los que tienen éxito logran causar infecciones. Los patógenos exitosos hacen uso de un armamento diverso que puede interferir o manipular el sistema inmunológico de la planta. En los últimos años, los RNA pequeños (sRNA) se han indicado como una nueva clase de efectores. Los sRNA son RNA reguladores no codificantes que inducen el silenciamiento génico mediante la carga en proteínas Argonaute (AGO)/complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC). Los patógenos y parásitos son capaces de traficar estos efectores de ARNs hacia sus huéspedes, provocando el silenciamiento de genes en un fenómeno conocido como "interferencia de ARN entre reinos", RNAi CROSS-KINGDOM, (ckRNAi). Curiosamente, este fenómeno puede ser bidireccional. A pesar de la creciente evidencia de ckRNAi en una amplia variedad de interacciones, la dinámica coevolutiva entre los loci productores de sRNA y los sitios objetivo de sRNA en los huéspedes está poco estudiada. Una pregunta clave que surge con respecto a la evolución de los efectores de sRNA en un contexto de ckRNAi es si esas secuencias son el resultado de la presión de selección. Debido a que la eficiencia de ckRNAi depende de la complementariedad entre los efectores de sRNA y sus sitios objetivo, durante la carrera armamentista se esperaría que las mutaciones en los sitios objetivo se seleccionen para evitar la complementariedad. Por otro lado, también se esperaría una diversificación de las secuencias efectoras de sRNA para que el patógeno siga el ritmo de las variaciones del sitio objetivo del huésped. Sin embargo, este tipo de dinámica coevolutiva no está clara para los parásitos con una coevolución menos estricta, es decir, los patógenos generalistas. Por lo tanto, surge otra pregunta: ¿cómo se puede mantener este tipo de interacción a lo largo del tiempo evolutivo en patógenos con una amplia gama de huéspedes? Una hipótesis alternativa es que los organismos, [EN] Plants are under the continuous attack of multiple pathogens, but only successful ones manage to cause infections. Successful pathogens make use of a diverse armament that can interfere with or manipulate the plant immune system. In recent years, small RNAs (sRNAs) have been indicated as a new class of effectors. sRNAs are non-coding regulatory RNAs that induce gene silencing by loading into Argonaute (AGO)/RNA-induced silencing complex (RISC) proteins. Pathogens and parasites are capable of trafficking these sRNA effectors into their hosts, causing gene silencing in a phenomenon known as "Cross-kingdom RNA interference" (ckRNAi). Interestingly, this phenomenon can be bidirectional. Despite increasing evidence for ckRNAi in a wide variety of interactions, the coevolutionary dynamics between the sRNA-producing loci and the sRNA target sites in the hosts is poorly studied. One key question that arises regarding the evolution of sRNA effectors in a context of ckRNAi is whether those sequences are the result of selection pressure. Because ckRNAi efficiency depends on the complementarity between the sRNA effectors and their target sites, during arms race it would be expected that mutations in the target sites are selected to avoid complementarity. On the other hand, a diversification of the sRNA effector sequences would also be expected for the pathogen to keep pace with the host's target site variations. Nevertheless, this kind of co-evolutionary dynamic is unclear for parasites with a less stringent co-evolution, i.e., generalist pathogens. Hence, another question arises: how can this kind of interaction be maintained throughout evolutionary time in pathogens with a broad range of hosts. An alternative hypothesis is that the sRNA effector-producing organisms deploy a plethora of sRNA sequences of which some are able to hit host transcript by chance. The latter is known as a "shotgun strategy". In order to shed light on the co-evolutionary dynamics between sRNA eff

[ES] Las plantas están bajo el ataque continuo de múltiples patógenos, pero solo los que tienen éxito logran causar infecciones. Los patógenos exitosos hacen uso de un armamento diverso que puede interferir o manipular el sistema inmunológico de la planta. En los últimos años, los RNA pequeños (sRNA) se han indicado como una nueva clase de efectores. Los sRNA son RNA reguladores no codificantes que inducen el silenciamiento génico mediante la carga en proteínas Argonaute (AGO)/complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC). Los patógenos y parásitos son capaces de traficar estos efectores de ARNs hacia sus huéspedes, provocando el silenciamiento de genes en un fenómeno conocido como "interferencia de ARN entre reinos", RNAi CROSS-KINGDOM, (ckRNAi). Curiosamente, este fenómeno puede ser bidireccional. A pesar de la creciente evidencia de ckRNAi en una amplia variedad de interacciones, la dinámica coevolutiva entre los loci productores de sRNA y los sitios objetivo de sRNA en los huéspedes está poco estudiada. Una pregunta clave que surge con respecto a la evolución de los efectores de sRNA en un contexto de ckRNAi es si esas secuencias son el resultado de la presión de selección. Debido a que la eficiencia de ckRNAi depende de la complementariedad entre los efectores de sRNA y sus sitios objetivo, durante la carrera armamentista se esperaría que las mutaciones en los sitios objetivo se seleccionen para evitar la complementariedad. Por otro lado, también se esperaría una diversificación de las secuencias efectoras de sRNA para que el patógeno siga el ritmo de las variaciones del sitio objetivo del huésped. Sin embargo, este tipo de dinámica coevolutiva no está clara para los parásitos con una coevolución menos estricta, es decir, los patógenos generalistas. Por lo tanto, surge otra pregunta: ¿cómo se puede mantener este tipo de interacción a lo largo del tiempo evolutivo en patógenos con una amplia gama de huéspedes? Una hipótesis alternativa es que los organismos, [EN] Plants are under the continuous attack of multiple pathogens, but only successful ones manage to cause infections. Successful pathogens make use of a diverse armament that can interfere with or manipulate the plant immune system. In recent years, small RNAs (sRNAs) have been indicated as a new class of effectors. sRNAs are non-coding regulatory RNAs that induce gene silencing by loading into Argonaute (AGO)/RNA-induced silencing complex (RISC) proteins. Pathogens and parasites are capable of trafficking these sRNA effectors into their hosts, causing gene silencing in a phenomenon known as "Cross-kingdom RNA interference" (ckRNAi). Interestingly, this phenomenon can be bidirectional. Despite increasing evidence for ckRNAi in a wide variety of interactions, the coevolutionary dynamics between the sRNA-producing loci and the sRNA target sites in the hosts is poorly studied. One key question that arises regarding the evolution of sRNA effectors in a context of ckRNAi is whether those sequences are the result of selection pressure. Because ckRNAi efficiency depends on the complementarity between the sRNA effectors and their target sites, during arms race it would be expected that mutations in the target sites are selected to avoid complementarity. On the other hand, a diversification of the sRNA effector sequences would also be expected for the pathogen to keep pace with the host's target site variations. Nevertheless, this kind of co-evolutionary dynamic is unclear for parasites with a less stringent co-evolution, i.e., generalist pathogens. Hence, another question arises: how can this kind of interaction be maintained throughout evolutionary time in pathogens with a broad range of hosts. An alternative hypothesis is that the sRNA effector-producing organisms deploy a plethora of sRNA sequences of which some are able to hit host transcript by chance. The latter is known as a "shotgun strategy". In order to shed light on the co-evolutionary dynamics between sRNA eff

[ES] Las plantas están bajo el ataque continuo de múltiples patógenos, pero solo los que tienen éxito logran causar infecciones. Los patógenos exitosos hacen uso de un armamento diverso que puede interferir o manipular el sistema inmunológico de la planta. En los últimos años, los RNA pequeños (sRNA) se han indicado como una nueva clase de efectores. Los sRNA son RNA reguladores no codificantes que inducen el silenciamiento génico mediante la carga en proteínas Argonaute (AGO)/complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC). Los patógenos y parásitos son capaces de traficar estos efectores de ARNs hacia sus huéspedes, provocando el silenciamiento de genes en un fenómeno conocido como "interferencia de ARN entre reinos", RNAi CROSS-KINGDOM, (ckRNAi). Curiosamente, este fenómeno puede ser bidireccional. A pesar de la creciente evidencia de ckRNAi en una amplia variedad de interacciones, la dinámica coevolutiva entre los loci productores de sRNA y los sitios objetivo de sRNA en los huéspedes está poco estudiada. Una pregunta clave que surge con respecto a la evolución de los efectores de sRNA en un contexto de ckRNAi es si esas secuencias son el resultado de la presión de selección. Debido a que la eficiencia de ckRNAi depende de la complementariedad entre los efectores de sRNA y sus sitios objetivo, durante la carrera armamentista se esperaría que las mutaciones en los sitios objetivo se seleccionen para evitar la complementariedad. Por otro lado, también se esperaría una diversificación de las secuencias efectoras de sRNA para que el patógeno siga el ritmo de las variaciones del sitio objetivo del huésped. Sin embargo, este tipo de dinámica coevolutiva no está clara para los parásitos con una coevolución menos estricta, es decir, los patógenos generalistas. Por lo tanto, surge otra pregunta: ¿cómo se puede mantener este tipo de interacción a lo largo del tiempo evolutivo en patógenos con una amplia gama de huéspedes? Una hipótesis alternativa es que los organismos, [EN] Plants are under the continuous attack of multiple pathogens, but only successful ones manage to cause infections. Successful pathogens make use of a diverse armament that can interfere with or manipulate the plant immune system. In recent years, small RNAs (sRNAs) have been indicated as a new class of effectors. sRNAs are non-coding regulatory RNAs that induce gene silencing by loading into Argonaute (AGO)/RNA-induced silencing complex (RISC) proteins. Pathogens and parasites are capable of trafficking these sRNA effectors into their hosts, causing gene silencing in a phenomenon known as "Cross-kingdom RNA interference" (ckRNAi). Interestingly, this phenomenon can be bidirectional. Despite increasing evidence for ckRNAi in a wide variety of interactions, the coevolutionary dynamics between the sRNA-producing loci and the sRNA target sites in the hosts is poorly studied. One key question that arises regarding the evolution of sRNA effectors in a context of ckRNAi is whether those sequences are the result of selection pressure. Because ckRNAi efficiency depends on the complementarity between the sRNA effectors and their target sites, during arms race it would be expected that mutations in the target sites are selected to avoid complementarity. On the other hand, a diversification of the sRNA effector sequences would also be expected for the pathogen to keep pace with the host's target site variations. Nevertheless, this kind of co-evolutionary dynamic is unclear for parasites with a less stringent co-evolution, i.e., generalist pathogens. Hence, another question arises: how can this kind of interaction be maintained throughout evolutionary time in pathogens with a broad range of hosts. An alternative hypothesis is that the sRNA effector-producing organisms deploy a plethora of sRNA sequences of which some are able to hit host transcript by chance. The latter is known as a "shotgun strategy". In order to shed light on the co-evolutionary dynamics between sRNA eff

[ES] El presente trabajo de investigación estudia de la trayectoria tecnológica y científica de los compresores scroll para refrigeración y bombas de calor. La metodología utilizada es el análisis de conectividad de citas tanto de patentes como de artículos científicos utilizando las bases de datos de la USPTO y de la Web of Science, respectivamente. Las trayectorias de patentes y de artículos científicos fueron generadas con el uso de los programas Citnet Explorer y Pajek. La trayectoria científica resultante consta de quince artículos científicos, identificándose cinco líneas de investigación que incluyen el estudio de conformidades axial y radial del compresor utilizando modelos geométricos; rendimiento de compresores scroll con inyección de vapor, utilizando modelos geométricos detallados de las espirales del compresor; uso de modelos semi-empíricos para el análisis del uso de refrigerantes naturales, mejoras del rendimiento del sistema con inyección de vapor, velocidad variable; aplicaciones en expansores para ciclos orgánicos Rankine y base para el modelado de otras tecnologías de compresor como compresores de tornillo y rotativo de pistones y uso de modelos empíricos de compresores scroll. La trayectoria tecnológica consta de trece patentes, las cuales fueron agrupadas en tres grupos de invenciones relacionadas con dispositivos scroll con diferentes espesores en las volutas, con sistemas de sellado entre scrolles, nervaduras de refuerzo y disipación de calor, acoplamientos, uso de manivelas locas; dispositivos scroll para aplicaciones de compresores, bombas de vacío y expansores; dispositivos scroll para ciclos compactos de energía. Desde la aparición de la primera patente de compresor scroll en 1905, esta tecnología tuvo que superar el desafío de contar con un mecanizado de los scrolles con tolerancias estrechas en su fabricación, razón por la cual, tanto para la trayectoria tecnológica como para la trayectoria científica, la red principal de patentes y artí, [EN] This research work studies the technological and scientific trajectory of scroll compressors for refrigeration and heat pumps. The methodology used is the citation connectivity analysis of both patents and scientific papers using the USPTO and Web of Science databases, respectively. The patent and scientific papers trajectories were generated with the use of the Citnet Explorer and Pajek programs. The resulting scientific trajectory consists of fifteen scientific papers, identifying five lines of research that include the study of axial and radial conformities of the compressor using geometric models; performance of vapor injection scroll compressors, using detailed geometric models of the compressor coils; use of semi-empirical models for the analysis of the use of natural refrigerants, system performance improvements with vapor injection, variable speed; applications in expanders for organic Rankine cycles and base for the modeling of other compressor technologies such as screw and rotary piston compressors, and the use of empirical models of scroll compressors. The technological trajectory consists of thirteen patents, which were grouped into three groups of inventions related to scroll devices with different thicknesses in the volutes, with sealing systems between scrolls, reinforcement ribs, and heat dissipation, couplings, use of idler cranks; scroll devices for compressor, vacuum pump, and expander applications; scroll devices for compact power cycles. Since the appearance of the first scroll compressor patent in 1905, this technology had to overcome the challenge of having machining of scrolls with tight tolerances in their manufacture, which is why, both for the technological trajectory and the scientific trajectory, the main network of patents and scientific articles began in the early 1980s. Two parts were identified in the co-evolution of the scientific and technological trajectories. The first part that deals with the modeling of a scroll compresso

[ES] El presente trabajo de investigación estudia de la trayectoria tecnológica y científica de los compresores scroll para refrigeración y bombas de calor. La metodología utilizada es el análisis de conectividad de citas tanto de patentes como de artículos científicos utilizando las bases de datos de la USPTO y de la Web of Science, respectivamente. Las trayectorias de patentes y de artículos científicos fueron generadas con el uso de los programas Citnet Explorer y Pajek. La trayectoria científica resultante consta de quince artículos científicos, identificándose cinco líneas de investigación que incluyen el estudio de conformidades axial y radial del compresor utilizando modelos geométricos; rendimiento de compresores scroll con inyección de vapor, utilizando modelos geométricos detallados de las espirales del compresor; uso de modelos semi-empíricos para el análisis del uso de refrigerantes naturales, mejoras del rendimiento del sistema con inyección de vapor, velocidad variable; aplicaciones en expansores para ciclos orgánicos Rankine y base para el modelado de otras tecnologías de compresor como compresores de tornillo y rotativo de pistones y uso de modelos empíricos de compresores scroll. La trayectoria tecnológica consta de trece patentes, las cuales fueron agrupadas en tres grupos de invenciones relacionadas con dispositivos scroll con diferentes espesores en las volutas, con sistemas de sellado entre scrolles, nervaduras de refuerzo y disipación de calor, acoplamientos, uso de manivelas locas; dispositivos scroll para aplicaciones de compresores, bombas de vacío y expansores; dispositivos scroll para ciclos compactos de energía. Desde la aparición de la primera patente de compresor scroll en 1905, esta tecnología tuvo que superar el desafío de contar con un mecanizado de los scrolles con tolerancias estrechas en su fabricación, razón por la cual, tanto para la trayectoria tecnológica como para la trayectoria científica, la red principal de patentes y artí, [EN] This research work studies the technological and scientific trajectory of scroll compressors for refrigeration and heat pumps. The methodology used is the citation connectivity analysis of both patents and scientific papers using the USPTO and Web of Science databases, respectively. The patent and scientific papers trajectories were generated with the use of the Citnet Explorer and Pajek programs. The resulting scientific trajectory consists of fifteen scientific papers, identifying five lines of research that include the study of axial and radial conformities of the compressor using geometric models; performance of vapor injection scroll compressors, using detailed geometric models of the compressor coils; use of semi-empirical models for the analysis of the use of natural refrigerants, system performance improvements with vapor injection, variable speed; applications in expanders for organic Rankine cycles and base for the modeling of other compressor technologies such as screw and rotary piston compressors, and the use of empirical models of scroll compressors. The technological trajectory consists of thirteen patents, which were grouped into three groups of inventions related to scroll devices with different thicknesses in the volutes, with sealing systems between scrolls, reinforcement ribs, and heat dissipation, couplings, use of idler cranks; scroll devices for compressor, vacuum pump, and expander applications; scroll devices for compact power cycles. Since the appearance of the first scroll compressor patent in 1905, this technology had to overcome the challenge of having machining of scrolls with tight tolerances in their manufacture, which is why, both for the technological trajectory and the scientific trajectory, the main network of patents and scientific articles began in the early 1980s. Two parts were identified in the co-evolution of the scientific and technological trajectories. The first part that deals with the modeling of a scroll compresso

[ES] El presente trabajo de investigación estudia de la trayectoria tecnológica y científica de los compresores scroll para refrigeración y bombas de calor. La metodología utilizada es el análisis de conectividad de citas tanto de patentes como de artículos científicos utilizando las bases de datos de la USPTO y de la Web of Science, respectivamente. Las trayectorias de patentes y de artículos científicos fueron generadas con el uso de los programas Citnet Explorer y Pajek. La trayectoria científica resultante consta de quince artículos científicos, identificándose cinco líneas de investigación que incluyen el estudio de conformidades axial y radial del compresor utilizando modelos geométricos; rendimiento de compresores scroll con inyección de vapor, utilizando modelos geométricos detallados de las espirales del compresor; uso de modelos semi-empíricos para el análisis del uso de refrigerantes naturales, mejoras del rendimiento del sistema con inyección de vapor, velocidad variable; aplicaciones en expansores para ciclos orgánicos Rankine y base para el modelado de otras tecnologías de compresor como compresores de tornillo y rotativo de pistones y uso de modelos empíricos de compresores scroll. La trayectoria tecnológica consta de trece patentes, las cuales fueron agrupadas en tres grupos de invenciones relacionadas con dispositivos scroll con diferentes espesores en las volutas, con sistemas de sellado entre scrolles, nervaduras de refuerzo y disipación de calor, acoplamientos, uso de manivelas locas; dispositivos scroll para aplicaciones de compresores, bombas de vacío y expansores; dispositivos scroll para ciclos compactos de energía. Desde la aparición de la primera patente de compresor scroll en 1905, esta tecnología tuvo que superar el desafío de contar con un mecanizado de los scrolles con tolerancias estrechas en su fabricación, razón por la cual, tanto para la trayectoria tecnológica como para la trayectoria científica, la red principal de patentes y artí, [EN] This research work studies the technological and scientific trajectory of scroll compressors for refrigeration and heat pumps. The methodology used is the citation connectivity analysis of both patents and scientific papers using the USPTO and Web of Science databases, respectively. The patent and scientific papers trajectories were generated with the use of the Citnet Explorer and Pajek programs. The resulting scientific trajectory consists of fifteen scientific papers, identifying five lines of research that include the study of axial and radial conformities of the compressor using geometric models; performance of vapor injection scroll compressors, using detailed geometric models of the compressor coils; use of semi-empirical models for the analysis of the use of natural refrigerants, system performance improvements with vapor injection, variable speed; applications in expanders for organic Rankine cycles and base for the modeling of other compressor technologies such as screw and rotary piston compressors, and the use of empirical models of scroll compressors. The technological trajectory consists of thirteen patents, which were grouped into three groups of inventions related to scroll devices with different thicknesses in the volutes, with sealing systems between scrolls, reinforcement ribs, and heat dissipation, couplings, use of idler cranks; scroll devices for compressor, vacuum pump, and expander applications; scroll devices for compact power cycles. Since the appearance of the first scroll compressor patent in 1905, this technology had to overcome the challenge of having machining of scrolls with tight tolerances in their manufacture, which is why, both for the technological trajectory and the scientific trajectory, the main network of patents and scientific articles began in the early 1980s. Two parts were identified in the co-evolution of the scientific and technological trajectories. The first part that deals with the modeling of a scroll compresso

[ES] El presente trabajo de investigación estudia de la trayectoria tecnológica y científica de los compresores scroll para refrigeración y bombas de calor. La metodología utilizada es el análisis de conectividad de citas tanto de patentes como de artículos científicos utilizando las bases de datos de la USPTO y de la Web of Science, respectivamente. Las trayectorias de patentes y de artículos científicos fueron generadas con el uso de los programas Citnet Explorer y Pajek. La trayectoria científica resultante consta de quince artículos científicos, identificándose cinco líneas de investigación que incluyen el estudio de conformidades axial y radial del compresor utilizando modelos geométricos; rendimiento de compresores scroll con inyección de vapor, utilizando modelos geométricos detallados de las espirales del compresor; uso de modelos semi-empíricos para el análisis del uso de refrigerantes naturales, mejoras del rendimiento del sistema con inyección de vapor, velocidad variable; aplicaciones en expansores para ciclos orgánicos Rankine y base para el modelado de otras tecnologías de compresor como compresores de tornillo y rotativo de pistones y uso de modelos empíricos de compresores scroll. La trayectoria tecnológica consta de trece patentes, las cuales fueron agrupadas en tres grupos de invenciones relacionadas con dispositivos scroll con diferentes espesores en las volutas, con sistemas de sellado entre scrolles, nervaduras de refuerzo y disipación de calor, acoplamientos, uso de manivelas locas; dispositivos scroll para aplicaciones de compresores, bombas de vacío y expansores; dispositivos scroll para ciclos compactos de energía. Desde la aparición de la primera patente de compresor scroll en 1905, esta tecnología tuvo que superar el desafío de contar con un mecanizado de los scrolles con tolerancias estrechas en su fabricación, razón por la cual, tanto para la trayectoria tecnológica como para la trayectoria científica, la red principal de patentes y artí, [EN] This research work studies the technological and scientific trajectory of scroll compressors for refrigeration and heat pumps. The methodology used is the citation connectivity analysis of both patents and scientific papers using the USPTO and Web of Science databases, respectively. The patent and scientific papers trajectories were generated with the use of the Citnet Explorer and Pajek programs. The resulting scientific trajectory consists of fifteen scientific papers, identifying five lines of research that include the study of axial and radial conformities of the compressor using geometric models; performance of vapor injection scroll compressors, using detailed geometric models of the compressor coils; use of semi-empirical models for the analysis of the use of natural refrigerants, system performance improvements with vapor injection, variable speed; applications in expanders for organic Rankine cycles and base for the modeling of other compressor technologies such as screw and rotary piston compressors, and the use of empirical models of scroll compressors. The technological trajectory consists of thirteen patents, which were grouped into three groups of inventions related to scroll devices with different thicknesses in the volutes, with sealing systems between scrolls, reinforcement ribs, and heat dissipation, couplings, use of idler cranks; scroll devices for compressor, vacuum pump, and expander applications; scroll devices for compact power cycles. Since the appearance of the first scroll compressor patent in 1905, this technology had to overcome the challenge of having machining of scrolls with tight tolerances in their manufacture, which is why, both for the technological trajectory and the scientific trajectory, the main network of patents and scientific articles began in the early 1980s. Two parts were identified in the co-evolution of the scientific and technological trajectories. The first part that deals with the modeling of a scroll compresso

[ES] Los micovirus son virus que infectan a hongos y son una de las clases menos conocidas de virus hasta la fecha. La gran mayoría de los micovirus identificados son virus de RNA y dentro de estos predominan aquellos de clase III, con un genoma dsRNA. El interés de conocer los micovirus radica en su uso como agentes de biocontrol de plagas fúngicas que pueden afectar a los cultivos o precisamente para mantener buenas medidas de higiene en cultivos de champiñones y otros hongos comestibles. A nivel básico, el estudio filogenético de los micovirus, como del resto de virus, nos permite hacernos una idea de su ecología y de cómo han coevolucionado con sus huéspedes. Este estudio persigue comprobar la hipótesis de que el genoma de los micovirus es un mosaico compuesto de una región propiamente viral, donde se encuentra el gen de la RNA replicasa dependiente de RNA (RdRP), y otra de origen eucariota, que contendría el gen de la proteína de la envuelta (CP), que en algún momento de la evolución pudo haberse transferido horizontalmente desde un hospedador fúngico a un virus ancestral. Para ello, se reconstruyeron árboles filogenéticos con las secuencias proteicas RdRP y CP de distintos grupos de micovirus de dsRNA, haciendo coincidir las especies de RdRP y CP para poder hacer una evaluación de la cofilogenia, es decir, en qué medida ambos loci explican la misma historia evolutiva. Los árboles separaban los mismos grupos, pero en el árbol de CP no se consiguen establecer relaciones entre grupos que sí se observan con RdRP. La búsqueda PSI-BLAST de la CP de un grupo de micovirus no clasificados de dsRNA reveló una gran similitud de secuencia con una proteína hipotética de hongos presente en numerosas especies, mayor a la que presenta la CP de este grupo con la de otros micovirus. La comparación entre las estructuras simuladas in silico de estas proteínas fúngicas y la CP de este grupo de virus no clasificados mostró una importante homología. Estos datos, en conjunto, sugiere, [EN] Viruses that infect fungi are known as mycovirus. Recently, more and more mycovirus species are being identified and having their genomes sequenced. Nevertheless, the majority of mycoviruses are yet to be discovered. By now, most of known mycoviruses have RNA-based genomes, being most of these dsRNA viruses or class III viruses, according to the Baltimore classification. Main applications of having an integrated knowledge of mycoviruses and their environment comprehend their use as biocontrol agents against crop¿s fungal pathogens and their exclusion from edible mushroom cultivations. A phylogenetic approach to mycoviruses would yield many information at a fundamental level involving mycoviral evolution and their relation to eukaryotic species ecologically related i.e. mainly the fungi that serve them as hosts. This study¿s main hypothesis is that of the mycoviral genome having a mosaic structure, this means the genome having two origins, one viral and other eukaryotic, the viral part comprising the RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) gene and the eukaryotic part being composed of the coat protein (CP) gene, which might have been transferred to an ancestral virus from its fungal host. For this purpose, two phylogenetic trees were reconstructed for RdRP and CP, using sequences of the same virus species on each side to compare the results and address the question of both loci explaining the same evolutionary history. The CP tree was not able to find relationships between virus groups as the RdRP tree did, although the same final groups were segregated with both trees. A PSI-BLAST search with the CP sequence of the different mycovirus groups included in the study was able to find an hypothetical protein with many orthologues in fungal genomes which showed a very significant sequence homology with the CP of a unclassified dsRNA mycovirus group. Some structures of different gruoups¿ CP and this hypothetical protein were predicted in silico to establish relationships

[ES] Los micovirus son virus que infectan a hongos y son una de las clases menos conocidas de virus hasta la fecha. La gran mayoría de los micovirus identificados son virus de RNA y dentro de estos predominan aquellos de clase III, con un genoma dsRNA. El interés de conocer los micovirus radica en su uso como agentes de biocontrol de plagas fúngicas que pueden afectar a los cultivos o precisamente para mantener buenas medidas de higiene en cultivos de champiñones y otros hongos comestibles. A nivel básico, el estudio filogenético de los micovirus, como del resto de virus, nos permite hacernos una idea de su ecología y de cómo han coevolucionado con sus huéspedes. Este estudio persigue comprobar la hipótesis de que el genoma de los micovirus es un mosaico compuesto de una región propiamente viral, donde se encuentra el gen de la RNA replicasa dependiente de RNA (RdRP), y otra de origen eucariota, que contendría el gen de la proteína de la envuelta (CP), que en algún momento de la evolución pudo haberse transferido horizontalmente desde un hospedador fúngico a un virus ancestral. Para ello, se reconstruyeron árboles filogenéticos con las secuencias proteicas RdRP y CP de distintos grupos de micovirus de dsRNA, haciendo coincidir las especies de RdRP y CP para poder hacer una evaluación de la cofilogenia, es decir, en qué medida ambos loci explican la misma historia evolutiva. Los árboles separaban los mismos grupos, pero en el árbol de CP no se consiguen establecer relaciones entre grupos que sí se observan con RdRP. La búsqueda PSI-BLAST de la CP de un grupo de micovirus no clasificados de dsRNA reveló una gran similitud de secuencia con una proteína hipotética de hongos presente en numerosas especies, mayor a la que presenta la CP de este grupo con la de otros micovirus. La comparación entre las estructuras simuladas in silico de estas proteínas fúngicas y la CP de este grupo de virus no clasificados mostró una importante homología. Estos datos, en conjunto, sugiere, [EN] Viruses that infect fungi are known as mycovirus. Recently, more and more mycovirus species are being identified and having their genomes sequenced. Nevertheless, the majority of mycoviruses are yet to be discovered. By now, most of known mycoviruses have RNA-based genomes, being most of these dsRNA viruses or class III viruses, according to the Baltimore classification. Main applications of having an integrated knowledge of mycoviruses and their environment comprehend their use as biocontrol agents against crop¿s fungal pathogens and their exclusion from edible mushroom cultivations. A phylogenetic approach to mycoviruses would yield many information at a fundamental level involving mycoviral evolution and their relation to eukaryotic species ecologically related i.e. mainly the fungi that serve them as hosts. This study¿s main hypothesis is that of the mycoviral genome having a mosaic structure, this means the genome having two origins, one viral and other eukaryotic, the viral part comprising the RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) gene and the eukaryotic part being composed of the coat protein (CP) gene, which might have been transferred to an ancestral virus from its fungal host. For this purpose, two phylogenetic trees were reconstructed for RdRP and CP, using sequences of the same virus species on each side to compare the results and address the question of both loci explaining the same evolutionary history. The CP tree was not able to find relationships between virus groups as the RdRP tree did, although the same final groups were segregated with both trees. A PSI-BLAST search with the CP sequence of the different mycovirus groups included in the study was able to find an hypothetical protein with many orthologues in fungal genomes which showed a very significant sequence homology with the CP of a unclassified dsRNA mycovirus group. Some structures of different gruoups¿ CP and this hypothetical protein were predicted in silico to establish relationships

[ES] Los micovirus son virus que infectan a hongos y son una de las clases menos conocidas de virus hasta la fecha. La gran mayoría de los micovirus identificados son virus de RNA y dentro de estos predominan aquellos de clase III, con un genoma dsRNA. El interés de conocer los micovirus radica en su uso como agentes de biocontrol de plagas fúngicas que pueden afectar a los cultivos o precisamente para mantener buenas medidas de higiene en cultivos de champiñones y otros hongos comestibles. A nivel básico, el estudio filogenético de los micovirus, como del resto de virus, nos permite hacernos una idea de su ecología y de cómo han coevolucionado con sus huéspedes. Este estudio persigue comprobar la hipótesis de que el genoma de los micovirus es un mosaico compuesto de una región propiamente viral, donde se encuentra el gen de la RNA replicasa dependiente de RNA (RdRP), y otra de origen eucariota, que contendría el gen de la proteína de la envuelta (CP), que en algún momento de la evolución pudo haberse transferido horizontalmente desde un hospedador fúngico a un virus ancestral. Para ello, se reconstruyeron árboles filogenéticos con las secuencias proteicas RdRP y CP de distintos grupos de micovirus de dsRNA, haciendo coincidir las especies de RdRP y CP para poder hacer una evaluación de la cofilogenia, es decir, en qué medida ambos loci explican la misma historia evolutiva. Los árboles separaban los mismos grupos, pero en el árbol de CP no se consiguen establecer relaciones entre grupos que sí se observan con RdRP. La búsqueda PSI-BLAST de la CP de un grupo de micovirus no clasificados de dsRNA reveló una gran similitud de secuencia con una proteína hipotética de hongos presente en numerosas especies, mayor a la que presenta la CP de este grupo con la de otros micovirus. La comparación entre las estructuras simuladas in silico de estas proteínas fúngicas y la CP de este grupo de virus no clasificados mostró una importante homología. Estos datos, en conjunto, sugiere, [EN] Viruses that infect fungi are known as mycovirus. Recently, more and more mycovirus species are being identified and having their genomes sequenced. Nevertheless, the majority of mycoviruses are yet to be discovered. By now, most of known mycoviruses have RNA-based genomes, being most of these dsRNA viruses or class III viruses, according to the Baltimore classification. Main applications of having an integrated knowledge of mycoviruses and their environment comprehend their use as biocontrol agents against crop¿s fungal pathogens and their exclusion from edible mushroom cultivations. A phylogenetic approach to mycoviruses would yield many information at a fundamental level involving mycoviral evolution and their relation to eukaryotic species ecologically related i.e. mainly the fungi that serve them as hosts. This study¿s main hypothesis is that of the mycoviral genome having a mosaic structure, this means the genome having two origins, one viral and other eukaryotic, the viral part comprising the RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) gene and the eukaryotic part being composed of the coat protein (CP) gene, which might have been transferred to an ancestral virus from its fungal host. For this purpose, two phylogenetic trees were reconstructed for RdRP and CP, using sequences of the same virus species on each side to compare the results and address the question of both loci explaining the same evolutionary history. The CP tree was not able to find relationships between virus groups as the RdRP tree did, although the same final groups were segregated with both trees. A PSI-BLAST search with the CP sequence of the different mycovirus groups included in the study was able to find an hypothetical protein with many orthologues in fungal genomes which showed a very significant sequence homology with the CP of a unclassified dsRNA mycovirus group. Some structures of different gruoups¿ CP and this hypothetical protein were predicted in silico to establish relationships

[ES] Los micovirus son virus que infectan a hongos y son una de las clases menos conocidas de virus hasta la fecha. La gran mayoría de los micovirus identificados son virus de RNA y dentro de estos predominan aquellos de clase III, con un genoma dsRNA. El interés de conocer los micovirus radica en su uso como agentes de biocontrol de plagas fúngicas que pueden afectar a los cultivos o precisamente para mantener buenas medidas de higiene en cultivos de champiñones y otros hongos comestibles. A nivel básico, el estudio filogenético de los micovirus, como del resto de virus, nos permite hacernos una idea de su ecología y de cómo han coevolucionado con sus huéspedes. Este estudio persigue comprobar la hipótesis de que el genoma de los micovirus es un mosaico compuesto de una región propiamente viral, donde se encuentra el gen de la RNA replicasa dependiente de RNA (RdRP), y otra de origen eucariota, que contendría el gen de la proteína de la envuelta (CP), que en algún momento de la evolución pudo haberse transferido horizontalmente desde un hospedador fúngico a un virus ancestral. Para ello, se reconstruyeron árboles filogenéticos con las secuencias proteicas RdRP y CP de distintos grupos de micovirus de dsRNA, haciendo coincidir las especies de RdRP y CP para poder hacer una evaluación de la cofilogenia, es decir, en qué medida ambos loci explican la misma historia evolutiva. Los árboles separaban los mismos grupos, pero en el árbol de CP no se consiguen establecer relaciones entre grupos que sí se observan con RdRP. La búsqueda PSI-BLAST de la CP de un grupo de micovirus no clasificados de dsRNA reveló una gran similitud de secuencia con una proteína hipotética de hongos presente en numerosas especies, mayor a la que presenta la CP de este grupo con la de otros micovirus. La comparación entre las estructuras simuladas in silico de estas proteínas fúngicas y la CP de este grupo de virus no clasificados mostró una importante homología. Estos datos, en conjunto, sugiere, [EN] Viruses that infect fungi are known as mycovirus. Recently, more and more mycovirus species are being identified and having their genomes sequenced. Nevertheless, the majority of mycoviruses are yet to be discovered. By now, most of known mycoviruses have RNA-based genomes, being most of these dsRNA viruses or class III viruses, according to the Baltimore classification. Main applications of having an integrated knowledge of mycoviruses and their environment comprehend their use as biocontrol agents against crop¿s fungal pathogens and their exclusion from edible mushroom cultivations. A phylogenetic approach to mycoviruses would yield many information at a fundamental level involving mycoviral evolution and their relation to eukaryotic species ecologically related i.e. mainly the fungi that serve them as hosts. This study¿s main hypothesis is that of the mycoviral genome having a mosaic structure, this means the genome having two origins, one viral and other eukaryotic, the viral part comprising the RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) gene and the eukaryotic part being composed of the coat protein (CP) gene, which might have been transferred to an ancestral virus from its fungal host. For this purpose, two phylogenetic trees were reconstructed for RdRP and CP, using sequences of the same virus species on each side to compare the results and address the question of both loci explaining the same evolutionary history. The CP tree was not able to find relationships between virus groups as the RdRP tree did, although the same final groups were segregated with both trees. A PSI-BLAST search with the CP sequence of the different mycovirus groups included in the study was able to find an hypothetical protein with many orthologues in fungal genomes which showed a very significant sequence homology with the CP of a unclassified dsRNA mycovirus group. Some structures of different gruoups¿ CP and this hypothetical protein were predicted in silico to establish relationships