1. Obtaining a specific probe to evaluate STAT5b gene transcription
- Author
-
Díaz, Luis Eduardo, Ortiz, Blanca L., Sánchez de Gómez, Myriam, Díaz, Luis Eduardo, Ortiz, Blanca L., and Sánchez de Gómez, Myriam
- Abstract
The strategy for cloning a 306 bp rat STAT5b fragment, amplified by RT-PCR, into an expression vector is described.The main difference between STAT5a and STAT5b lies within the 3' region of their respective cDNAs, therefore a fragment in this region was amplified. Cloning was achieved by using the new system TOPO-TA recommended, for products difficult to be cloned.The fragment was subcloned into pBlueScript Il SK vector and characterized by sequencing and restriction analysis. Subcloning was done in order to obtain sense and antisense RNA probes by in vitro transcription. This specific probe has been used to quantify STAT5b mRNA levels in liver from male rats, by a soluiiori hybridization RNAase protection assay., Se describe la estrategia empleada para clonar, en un vector de expresión, un fragmento de 306 pb del gen de STAT5b de rata, amplificado por la técnica de RT-PCR. Se amplificó una región en el terminal 3' donde se encuentra la mayor diferencia entre las secuencias del cADN de las isoformas STAT5a y STAT5b de rata. La clonación se logró utilizando el nuevo sistema TOPO-TA recomendado para productos de dificil clonación. El fragmento se subclonó en el vector pBlueScript II SK y se caracterizó mediante secuenciación y análisis de restricción. La subclonación se realizó con el propósito de poder obtener sondas sentido y antisentido de ARN por transcripción in vitro. Esta sonda específica se empleó para cuantificar niveles de mARN de STAT5b en hígado de ratas macho mediante la técnica de hibridización en solución o ensayo de protección de ARNasas.
- Published
- 2001