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L’objectif de cet article est de définir et illustrer la notion de robustesse telle qu’elle est vue par les généticiens. Pour ces derniers, il existe deux concepts de robustesse. Le premier considère que la robustesse correspond à la capacité de survie de l’animal et au maintien d’un potentiel global de production dans des environnements stressants et fait notamment référence au rôle de l’axe corticotrope. Le second concept définit la robustesse comme le maintien d’un potentiel de production spécifique : dans ce cadre, un animal est dit robuste pour un caractère donné si ce caractère est stable dans des environnements variés, ce qui rejoint la notion d’interaction génotype-milieu et s’explique par différentes hypothèses génétiques (modèle de surdominance, modèle pléiotropique, modèle épistatique). La canalisation d’un caractère correspond alors à l’action de sélectionner pour diminuer la sensibilité aux variations environnementales. Cette canalisation est intéressante pour répondre, par exemple, aux attentes des producteurs (optimum de production), des transformateurs (homogénéité des productions) ou aux nouvelles contraintes environnementales (agriculture durable). La mise en pratique de cette dernière passe par différentes modélisations des interactions génotype-milieu ; la plus novatrice utilise les modèles dits structuraux qui considèrent une variabilité génétique de la variance du caractère considéré et pour lesquels des développements méthodologiques sont encore nécessaires. Différentes expériences de sélection canalisante ont été mises en place sur des animaux de rente avec plus ou moins de succès. A l’heure actuelle, seule la sélection canalisante sur l’homogénéité des poids des lapereaux à la naissance est pratiquée en routine, The objective of this article was to define and illustrate the meaning of robustness in the animal genetic context where this word pointsto two concepts. The first one considers that robustness is the ability to maintain a global production level in stressing environmentsand is mainly related to the role of the corticotrop axis. The second one defines the robustness as the ability to maintain the expressionof a given trait with a low variability in different environments. This concept refers to different genetic hypotheses and to theso-called «overdominance», «pleiotropic» and «epistatic» models, respectively.The canalisation of a trait is the selection to reduce its sensitivity to environmental variations; it is an interesting strategy to reach anoptimum production level, to homogenise production levels, to respond to the relaxation of environmental conditions (low input system)…Different genotype by environment interaction models can be used to canalise a trait. The most recent one is the structural model, which deals with the hypothesis that the expression of a trait is controlled by two sets of genes i. e. one set controlling the meanof the trait and the other set controlling the environmental variability of the trait. Several canalising selection experiments have beenperformed in farm animals but only canalisation for rabbit weight at birth is routinely used at the present time.

Avec l’arrivée de données de génotypage à haut débit, il est maintenant possible d’estimer la valeur génétique d’animaux candidats à la sélection dès leur naissance, sans attendre la collecte de phénotypes. La sélection génomique bouleverse complètement les perspectivesen amélioration génétique. Elle nécessite la constitution d’une population de référence formée d’animaux génotypés (jusqu’à récemment, il s’agissait principalement de mâles) et ayant des performances précises, par exemple la performance moyenne de leurs filles. Les évaluations génomiques consistent à prédire les phénotypes dans cette population de référence comme la somme des effets des marqueurs moléculaires. Le problème méthodologique principal est que le nombre d’effets à estimer est typiquement beaucoup plus élevé que le nombre de phénotypes disponibles. Nous décrivons les idées générales de diverses familles de méthodes proposées : BLUP génomique basé sur une parenté entre individus calculée à partir des marqueurs, méthodes Bayésiennes plus flexibles mais aussi plus coûteuses, méthodes de sélection de variables, méthode en une seule étape qui combine évaluation génétique nationale et évaluation génomique. La précision des évaluations génomiques est faite par validation croisée chez les animaux les plus jeunes de la population de référence. La taille de la population de référence, la manière de prendre en compte les QTL à effet fort et le degré d’apparentement entre candidats à la sélection et animaux de la population de référence ont un impact non négligeable sur l’efficacité desméthodes de sélection génomique., With the advent of high throughput genotyping, it is now possible to estimate breeding values of selection candidates at birthwithout waiting for phenotypic data collection. Genomic selection is deeply changing future prospects in genetic improvement. Itrequires the creation of a reference population made of genotyped animals (generally males) with precise phenotypes, such as averagedaughter performances. Genomic evaluations consist in predicting phenotypes in this reference population as the sum of molecularmarker effects. The main methodological challenge is the large number of effects to estimate, usually much larger than thenumber of available phenotypes. We briefly describe the various families of proposed methods: genomic BLUP based on relationships computed from marker information, Bayesian methods which are more flexible but more tedious, variable selection methods and asingle step method which combines national genetic evaluation and genomic evaluation. The precision of genomic selection is donevia cross validation among the youngest animals of the reference population. The size of the reference population, the way QTL withlarge effects are modeled, the relationship between selection candidates and the reference population have a significant impact on theefficiency of genomic selection methods.

Jusqu’à une date très récente (l’émergence de la sélection génomique), l’essentiel des plans de sélection était basé sur l’évaluation des valeurs génétiques à partir des informations phénotypiques et de pedigree. Cependant, ont aussi été mis en place plusieurs exemples réussis de sélection valorisant la connaissance de gènes à effets importants sur les caractères ou utilisant l’aide de marqueurs moléculaires(la «Sélection Assistée par Marqueurs»). Ces exemples sont riches en enseignements pour l’avenir de la sélection. Les applications furent variées, tant en termes de type de caractères (reproduction, qualité de carcasse, résistance aux maladies...) que d’organisation(éliminations d’allèles défavorables, introgression, accouplements ciblés…). Les limites, qui sont détaillées, de ces plans de sélection sur gènes ou marqueurs, sont autant de contraintes qu’il faudra intégrer dans l’organisation de la sélection génomique., Until recently (when genomic selection started at a large scale), most of the selection plans were based on breeding value estimations from phenotypic and pedigree information. Nevertheless, a number of successful breeding schemes were also organized, using information on genes displaying large effects on the traits or using genomic markers ("Marker Assisted Selection"). These examples carry useful information about the future of selection. Realizations were polymorphic, both in terms of traits (reproduction, carcass quality, disease resistance...) and organization (counter selection of unfavorable alleles, between breeds introgression, mate selection...). Limits of these schemes, which are detailed in this paper, are constraints which will have to be considered in the future genomic selection organization.

Au sein des espéces d’élevage, c’est sans nul doute dans le secteur des bovins latiers que l’expérience de l’usage des outils moléculairesà des fins de sélection est la plus longue. Bien qu’aujourd’hui la plupart des grands pays d’élevage laitier réalisent des évaluationsgénomiques, l’introduction de ces outils ne se fait pas de façon uniforme. Ceci peut s’expliquer par des conditions de mise en oeuvredifférentes entre pays. Nous dressons ici un panorama de l’utilisation qui est faite des outils de la sélection génomique en bovinslaitiers au niveau international., Dairy cattle are undoubtedly the most experienced agricultural species regarding the integration of molecular information for selection purposes. Although most prominent countries run genomic evaluations, these tools are being integrated into selection schemes in various ways depending on the actual constraints of each country. We present a survey of the use of molecular information in dairy cattle throughout the world.